Search

Mountain forests suffer from an increase in frequency and severity of summer droughts and infestations of pathogens and insects. Those factors are causing high mortality of some keystone tree species (forest die-offs). Yet, how tree diebacks and associated changes in forest composition will affect local diversity and ecosystem functions remains unknown. Here, we aim at quantifying the impact of climate-induced forest decline on biodiversity by measuring changes in taxonomic structure of invertebrate communities along gradients of silver fir (Abies alba) dieback in the French Pyrenees. We use DNA metabarcoding to analyse 224 samples of Malaise traps placed on 56 silver fir dominated plots in the French Pyrenees from May to September 2017. Samples were sequenced using Illumina MiSeq and analysed using the DAMe twin-tagging pipeline approach. We conducted taxonomic assignment against reference DNA barcode libraries to streamli ne identification and recover biological information for ecological analysis. We discuss the results of our metabarcoding analysis and the utility of our approach to conduct biomonitoring across a large geographical scale.

La maîtrise des conditions de température dans les enceintes (chambres climatiques,étuves...) est un point crucial pour assurer la fiabilité et la reproductibilité des expériences. En effet, le non-respect des consignes de température dans une enceinte peut avoir des conséquences importantes sur les résultats d’essai (détérioration du matériel stocké ou perte d’échantillon, mise en œuvre de conditions de température non optimales pour des réactions enzymatiques ou chimiques, pour des élevages ou pour des cultures végétales). De plus, une hétérogénéité dans une enceinte peut entraîner des variabilités dans les résultats obtenus pour une même expérience et ainsi fausser toutes les comparaisons entre échantillons. Il est donc nécessaire d’effectuer un suivi métrologique des enceintes présentant une régulation en température et ayant un impact sur la fiabilité des résultats. La cartographie des enceintes climatiques permet de connaître les caractéristiques réelles et les performances des enceintes. La température réelle est déterminée et l’absence de dérive dans le temps, ainsi que l’homogénéité dans l’ensemble de l’enceinte, sont vérifiées. La norme NFX 15-140 définit les critères de test de conformité des enceintes. La cartographie d’enceinte permettra de s’assurer de l’adéquation de l’enceinte aux exigences spécifiques des essais ou aux caractéristiques de stockage désirées. L’exemple du système de cartographie de la société Oceasoft, acheté en 2010 par le Centre INRA d’Orléans, est présenté dans ce poster.