Search

Supplementary Material 6

Philippe Gonzalo,1 Sylvie Radenne,2 Sylvie Gonzalo31Laboratoire de Biochimie, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne, Saint-Etienne, France; 2Service d'Hépatologie-Gastroentérologie, Hôpital de la Croix Rousse, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France; 3Laboratoire Biomnis, Lyon, FranceAbstract: Biological markers of chronic alcoholism can be divided into two groups: direct and indirect markers. Direct markers (mainly blood or serum and urine ethanol, ethylglucuronide, ethyl sulfate, and phosphatidylethanol) directly track the intake of alcohol and vary in their sensitivity and kinetics of appearance and clearance. Indirect markers (mean corpuscular volume,γ-glutamyl transferase, alanine aminotransferase and aspartate aminotransferase, and carbohydrate-deficient transferrin) are biological parameters that are influenced by a steady and significant alcohol intake. We discuss the values of these tests and the relevance of their prescriptions for the clinical evaluation of heavy drinking. We indicate, when known, the pathophysiological mechanism of their elevations. We also discuss the amount and time of alcohol consumption required to give a positive result and the duration of abstinence required for the return to normal values. The forensic use of these biomarkers will not be considered in this review.Keywords: alcoholism, biomarker, CDT, relapse, alcohol-induced liver disease

Cet article de synthèse se penche sur une nouvelle discipline biologique et médicale, la « protéomique clinique ». Cette approche « postgénomique » vise à utiliser l’étude du protéome, c’est-à-dire de l’ensemble des peptides et protéines présents dans un échantillon biologique, pour donner une information diagnostique, pronostique ou de suivi thérapeutique des pathologies humaines. Cette nouvelle discipline est en plein développement car elle présente d’importantes perspectives pour les pathologies complexes ou pour la détection précoce de pathologies telles que les cancers. Les éléments de cette revue résultent du travail d’un groupe thématique de la SFBC (Société française de biologie clinique) de 2004 à 2006 dont l’objectif était d’évaluer l’état actuel de la « protéomique clinique » et de s’interroger sur son développement et son application future pour les biologistes. Il s’agit donc d’un état des lieux assez large décrivant les approches déjà accessibles dans les laboratoires d’analyses biologiques (dosages multiplex...) et les outils disponibles en recherche clinique et en protéomique « fondamentale », sans oublier les aspects bioinformatiques nécessaires à l’utilisation des données générées., This review focuses on “clinical proteomics” which represents an emerging discipline in biomedical research. “Clinical proteomics” relies on the analysis of the proteome, i.e. the entire set of peptides and proteins present in a biological sample, to provide relevant data for diagnosis, prognosis or therapeutic strategies of human pathologies. This new type of approach has tremendous potential for the diagnosis of complex pathologies or for the early detection of cancers. This article reports the conclusions of a workgroup of the French Society for Clinical Biology (SFBC) 2004-2006 which evaluated the status, the impact and the future development of proteomics in the clinical field. It provides therefore a broad view going from the methods already present in the clinical laboratories (multiplex technologies...), to the tools for clinical and basis research including bioinformatics.

The SARS-CoV-2 virus is responsible for an epidemic disease called COVID-19, which was initially evidenced in Wuhan, China, and spread very rapidly in China and around the world. In France, the first isolated case seems now to be reported in December 2019, stage 3 of the COVID-19 epidemic was triggered on March 14(th), the start of the planned containment exit from May 11(th). Healthcare services have faced a large influx of patients who may be beyond their capacity to receive and care, particularly in the Large-East and Ile-de-France regions. Some patients show an evolution of the disease never observed before with other coronaviruses and develop in a few days a very important inflammatory reaction, which can lead to death of patients. A working group of the French Society of Clinical Biology (SFBC) was set up with the objective of providing updated information on the current status of the biological prescriptions (focusing on biochemistry ones) and their evolution during the epidemic, and of analyzing the biological parameters associated with comorbidities and patient evolution in order to link biological results with medical events. The expanded working group covers all sectors of medical biology in France and extends to the French-speaking world: hospital sectors (CHU and CH, Army Training Hospitals) and the private sector opening a field of view on the biological situation in establishments for dependent elderly, social establishments and clinical medical institutions. The purpose of this article is the presentation of this working group and its immediate and future actions., Le virus SARS-CoV-2 est responsable d’une maladie épidémique dénommée COVID-19 initialement mise en évidence à Wuhan (Chine) et qui s’est propagée très rapidement en Chine puis dans le monde entier. En France, le premier cas isolé semble être signalé dès la fin du mois de décembre2019, le stade 3 de l’épidémie a été déclenché le 14 mars 2020 et la sortie progressive du confinement est prévue à partir du 11 mai 2020. Les services de soins ont fait face à un afflux massif de patients pouvant déborder leurs capacités d’accueil et de prise en charge, notamment dans les régions Grand-Est et Ile-de-France. Certains patients présentent une évolution de la maladie encore jamais observée avec les coronavirus et développent en quelques jours une réaction inflammatoire très importante, pouvant mener au décès. Un groupe de travail de la Société française de biologie clinique (SFBC) s’est constitué, ayant pour objectif de faire le point sur les prescriptions biologiques et leur évolution au cours de l’épidémie, d’analyser les paramètres biologiques, avec un focus biochimique, associés aux comorbidités et à l’évolution du patient, dans le but de relier les résultats biologiques avec des évènements du parcours de soins du patient. Ce groupe de travail recouvre tous les secteurs publics (CHU, CH, Hôpitaux d’instruction des armées) et privés de la biologie médicale en France métropolitaine et ultra-marine ; il s’étend également à la francophonie. Il permet une vision large sur la situation biologique en milieu hospitalier, établissements d’hébergements de personnes âgées dépendantes (Ehpad), établissements médicaux sociaux (EMS) et en cliniques. Le but de cet article est la présentation de ce groupe de travail et ses actions immédiates et à venir.