Search

Background: DNA barcoding depend on a piece of the cytochrome C oxidase subunit I (COI) gene in the mitochondrial genome is broadly useful in species ID and biodiversity studies. The aim of this study is to create a complete barcoding reference database of some fishes in the Mediterranean Sea fall under the family Sparidae. . Materials and methods: Mitochondrial COI barcode sequences were demonstrated from 8 species of family Sparidae in the order Perciformes, the mean length of Mitochondrial COI sequences was 650 base pairs. Results: The results of the phylogenetic tree presented that monophyly of Sparidae species. The studied species displayed clades of conspecific sequences and showed a match between the present study and the GenBank (NCBI) database. All groups clustered with high bootstrap value, that showed next to each branch and the tree was rooted based on the out group of Rhincodon typus. Conclusion: We achieve that COI sequencing can be used to recognize different fish species, and also it is used to obtain high competence of species reorganization by DNA barcoding. We underline the power of DNA barcode and its tools to identify different species from Mediterranean Sea. Results give Species ID for each species under study by using DNA barcoding.

El código de barras de ADN es una técnica molecular que emplea secuencias cortas y estanda rizadas de ADN, actualmente es ampliamente utilizada para la identificación de nuevas especies así como para resolver los grandes misterios de especies cripticas en grande poblaciones en el mundo entero. Atrina maura “Concha Pala” es un molusco bivalvo cuya importancia económica ha motivado el desarrollo de tecnologías de reproducción con la finalidad de potencializar la industria acuícola sin tener que ejercer presión de pesca sobre los bancos naturales. A. maura se encuentra distribuida desde México hasta el Perú, en todo el mundo 13 especies correspon dientes al género Atrina han sido identificadas basadas en el código de barras de ADN, en el estudio se aplicó el código de barras para la identificación de A. maura “concha pala”, obteniendo como resultado una secuencia parcial del gen Citocromo Oxidasa I de 732 pb, así mismo se construyó un árbol filogenético teniendo en cuenta la secuencias de las 13 especies de Atrina disponibles en el Genbank y 2 especies de Pinna demostrando que A. maura presenta un 99% de parentesco con A. rigida, y que estas corresponden a un segundo clado de la familia Pinnidae. A través de este trabajo se reporta por primera vez el código de barras de ADN para esta importante especie acuática y reafirma la eficiencia de esta técnica para la evaluación de la biodiversidad de especies en el mundo.

The genus Muticaria Lindholm, 1925, is currently distributed either in Southeastern Sicily or in the Malteseislands and comprises the species M. syracusana (Philippi, 1836), M. neuteboomi Beckmann, 1990 and M.macrostoma (Cantraine, 1835). For the first time, we report a molecular study on the topotypicous populationsof M. syracusana and M. neuteboomi carried out on fragments of the ribosomal 16S rDNA subunit and thecytochrome oxydase I (COI) mitochondrial genes by Neighbour Joining, Maximum Likelihood, MaximumParsimony and Bayesian Inference algorithms. Our results revealed the existence of nucleotide-sequencedivergence (Dxy: 5% for 16S rDNA and 12% for COI sequences) between the two taxa.