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Your search keyword '"Muller, Nicolas"' showing total 4 results
Start Over Author "Muller, Nicolas" Topic [math.math-ap]mathematics [math]/analysis of pdes [math.ap]
4 results on '"Muller, Nicolas"'

1. Two models for yeast cell communication

Author

Calvez, Vincent, Lepoutre, Thomas, Meunier, Nicolas, Muller, Nicolas, École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon), Institut Camille Jordan (ICJ), École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Multi-scale modelling of cell dynamics : application to hematopoiesis (DRACULA), Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire (CGPhiMC), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut Camille Jordan (ICJ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Modélisation mathématique, calcul scientifique (MMCS), Mathématiques Appliquées Paris 5 (MAP5 - UMR 8145), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions (INSMI)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Institut Camille Jordan [Villeurbanne] (ICJ), Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire (CGPhiMC), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ), Institut Camille Jordan [Villeurbanne] ( ICJ ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -École Centrale de Lyon ( ECL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon, Multi-scale modelling of cell dynamics : application to hematopoiesis ( DRACULA ), Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire ( CGPhiMC ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut Camille Jordan [Villeurbanne] ( ICJ ), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -École Centrale de Lyon ( ECL ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), Mathématiques Appliquées à Paris 5 ( MAP5 - UMR 8145 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut Camille Jordan [Villeurbanne] (ICJ), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL)

Subjects
[ MATH.MATH-AP ] Mathematics [math]/Analysis of PDEs [math.AP], non-linear stability, Blow-up, asymptotic convergence, [MATH.MATH-AP]Mathematics [math]/Analysis of PDEs [math.AP], HWI inequality, logarithmic Sobolev inequality, Quantitative Biology::Cell Behavior
Abstract

We study two separate models for yeast cell-cell communication. Each model consists of a coupled system of two non-linear, non-local equations in one dimension of space. The first model describes the two cells in the transversal direction, orthogonal to the membrane, whereas the second model describes the two cells in the tangential direction, along the membrane. We study long time dynamics for each model, ranging from convergence to stable steady states (bistability in model 1), to possible finite time blow-up (formation of singularity in model 2). The biological interpretation of the mathematical results is discussed.

Published
2017

2. Modelling the inflammatory process in atherosclerosis: a nonlinear renewal equation

Author

Meunier , Nicolas, Muller , Nicolas, Mathématiques Appliquées Paris 5 (MAP5 - UMR 8145), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions (INSMI)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mathématiques Appliquées à Paris 5 ( MAP5 - UMR 8145 ), and Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )

Subjects
structured popula- tions, long-time asymptotic, [ MATH.MATH-AP ] Mathematics [math]/Analysis of PDEs [math.AP], Mathematics - Analysis of PDEs, Renewal equation, existence theory, FOS: Mathematics, [MATH.MATH-AP]Mathematics [math]/Analysis of PDEs [math.AP], Quantitative Biology::Genomics, Analysis of PDEs (math.AP), Quantitative Biology::Cell Behavior
Abstract

We present here a population structured model to describe the dynamics of macrophage cells. The model involves the interactions between modified LDL, monocytes/macrophages, cytokines and foam cells. The key assumption is that the individual macrophage dynamics depends on the amount of lipoproteins it has internalized. The obtained renewal equation is coupled with an ODE describing the lipoprotein dynamics. We first prove global existence and uniqueness for the nonlinear and nonlocal system. We then study long time asymp-totics in a particular case describing silent plaques which undergo periodic rupture and repair. Finally we study long time asymptotics for the nonlinear renewal equation obtained when considering the steady state of the ODE. and we prove that ....

Published
2016

3. Numerical simulation of the dynamics of molecular markers involved in cell polarisation

Author

Calvez , Vincent, Meunier , Nicolas, Muller , Nicolas, Voituriez , Raphael, Unité de Mathématiques Pures et Appliquées (UMPA-ENSL), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Numerical Medicine (NUMED), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Mathématiques Appliquées Paris 5 (MAP5 - UMR 8145), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions (INSMI)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), ANR-11-JS01-0003,MODPOL,Modèles mathématiques pour la polarisation cellulaire(2011), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Unité de Mathématiques Pures et Appliquées (UMPA-ENSL), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Mathématiques Pures et Appliquées ( UMPA-ENSL ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Numerical Medicine ( NUMED ), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Unité de Mathématiques Pures et Appliquées ( UMPA-ENSL ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Mathématiques Appliquées à Paris 5 ( MAP5 - UMR 8145 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée ( LPTMC ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), and ANR-11-JS01-0003,MODPOL,Modèles mathématiques pour la polarisation cellulaire ( 2011 )

Subjects
global existence, Keller-Segel system, 65M08, 92B05, 92C17, 35B44, 35Q92, Quantitative Biology::Cell Behavior, numerical simulations, Quantitative Biology::Subcellular Processes, [ MATH.MATH-AP ] Mathematics [math]/Analysis of PDEs [math.AP], Mathematics - Analysis of PDEs, FOS: Mathematics, [MATH.MATH-AP]Mathematics [math]/Analysis of PDEs [math.AP], Cell polarisation, blow-up, Analysis of PDEs (math.AP)
Abstract

A cell is polarised when it has developed a main axis of organisation through the reorganisation of its cytosqueleton and its intracellular organelles. Polarisation can occur spontaneously or be triggered by external signals, like gradients of signaling molecules ... In this work, we study mathematical models for cell polarisation. These models are based on nonlinear convection-diffusion equations. The nonlinearity in the transport term expresses the positive loop between the level of protein concentration localised in a small area of the cell membrane and the number of new proteins that will be convected to the same area. We perform numerical simulations and we illustrate that these models are rich enough to describe the apparition of a polarisome., Comment: 15 pages

Published
2013
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4. Numerical simulation on a cell polarisation model: the polar case

Author

Calvez, Vincent, Meunier, Nicolas, Muller, Nicolas, Voituriez, Raphael, Unité de Mathématiques Pures et Appliquées (UMPA-ENSL), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Numerical Medicine (NUMED), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Mathématiques Appliquées Paris 5 (MAP5 - UMR 8145), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions (INSMI)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), ANR-11-JS01-0003,MODPOL,Modèles mathématiques pour la polarisation cellulaire(2011), Unité de Mathématiques Pures et Appliquées ( UMPA-ENSL ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Numerical Medicine ( NUMED ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Unité de Mathématiques Pures et Appliquées ( UMPA-ENSL ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Mathématiques Appliquées à Paris 5 ( MAP5 - UMR 8145 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée ( LPTMC ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), ANR-11-JS01-0003,MODPOL,Modèles mathématiques pour la polarisation cellulaire ( 2011 ), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Unité de Mathématiques Pures et Appliquées (UMPA-ENSL), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
numerical simulations, global existence, Mathematics - Analysis of PDEs, [ MATH.MATH-AP ] Mathematics [math]/Analysis of PDEs [math.AP], FOS: Mathematics, [MATH.MATH-AP]Mathematics [math]/Analysis of PDEs [math.AP], Keller-Segel system, 65M08, 92B05, 92C17, 35B44, 35Q92, Cell polarisation, blow-up, Analysis of PDEs (math.AP), Quantitative Biology::Cell Behavior
Abstract

When it is polarised, a cell develops an asymmetric distribution of specific molecular markers, cytoskeleton and cell membrane shape. Polarisation can occur spontaneously or be triggered by external signals, like gradients of signalling molecules... In this work, we use the published models of cell polarisation and we set a numerical analysis for these models. They are based on nonlinear convection-diffusion equations and the nonlinearity in the transport term expresses the positive loop between the level of protein concentration localised in a small area of the cell membrane and the number of new proteins that will be convected to the same area. We perform numerical simulations and we illustrate that these models are rich enough to describe the apparition of a polarisome., 20 pages. arXiv admin note: substantial text overlap with arXiv:1301.3807

Published
2012

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