18 results on '"Sica Centrex"'
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2. Mise au point de stratégies innovantes pour diminuer fortement l’utilisation des pesticides en maraîchage de plein champ (Artichaut, Chicorée scarole)
- Author
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Lusetti, A., Leroy, Cindy, and Sica Centrex
- Subjects
Désherbage alternatif ,Chicorée scarole ,Artichaut ,Alternative weed control ,Goutte à goutte ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Artichoke ,Drip irrigation system ,Biodegradable mulching ,Paillage ,Réduction des intrants ,Chicory escarole ,Zero herbicide - Abstract
Ce numéro est constitué d’articles de synthèse des projets DEPHY EXPE publiés à l’occasion du colloque national DEPHY, qui s’est déroulé les 13 et 14 novembre 2018 à la Cité des Sciences et de l'Industrie (Paris). Nous vous invitons à découvrir le bilan et les enseignements des 21 projets conduits sur la période 2012-2017.; Chicory escarole and artichoke are the main open fields cultivated species in Roussillon. Theirsuccession in rotation has greatly decreased in recent years in favor of a specialization of farms. TheECOLEG project aims to design an innovative system based on rotation chicory escarole / artichoke,including a green manure and solarization to reduce by 50% the use of plant protection products. Themain levers studied are crop rotation, replacement of traditional gravity-fed irrigation with drip irrigationsystem, biodegradable mulching and weekly observation of plots to limit systematic treatments. The useof early-stage biocontrol products was also expected to reduce FTIs. Five years of experimentation ledto a total reduction in the use of chemical herbicides, the cessation of systematic treatments againstaphids and cryptogamic diseases, making it possible to reduce the use of plant protection products bymore than 70%. The results obtained could be partially transferred to the producers of the DEPHYFARM network.; La chicorée scarole et l'artichaut sont les principales espèces cultivées en plein champ en Roussillonmais leur succession en assolement a fortement diminué ces dernières années au profit d'unespécialisation des exploitations sur l’une ou l’autre des cultures. Le projet ECOLEG vise à concevoir unsystème maraicher innovant utilisant peu de produits phytopharmaceutiques. L'objectif est de mettre enplace un système de culture intégrant une rotation chicorée scarole/artichaut, en redéfinissant lesitinéraires techniques, et en y incluant un engrais vert et une solarisation afin de réduire de 50 %l'utilisation des produits phytosanitaires. Les principaux leviers étudiés sont la rotation des cultures, leremplacement de l’irrigation gravitaire traditionnelle par un système de goutte à goutte avec paillagebiodégradable, l’observation hebdomadaire des parcelles pour limiter les traitements systématiques, lerecours aux produits de biocontrôle utilisés préventivement dans la lutte contre le mildiou et ensubstitution des herbicides chimiques. Cinq années d’expérimentation ont été conduites et ont mené àune très forte réduction, voire un arrêt certaines années, de l’utilisation des herbicides chimiques et àl’arrêt des traitements systématiques contre pucerons et maladies cryptogamiques. Ainsi, l’utilisation deproduits phytopharmaceutiques a était réduite de plus de 70 %. Les résultats obtenus ont pu êtrepartiellement transférés chez les producteurs au travers du réseau DEPHY FERME.
- Published
- 2018
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3. EcoPêche - Conception et évaluation multisite de vergers de pêche – nectarine économes en produits phytosanitaires et en intrants. Rapport technique de la campagne 2016
- Author
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Plénet, Daniel, Hilaire, Christian, blanc, philippe, Borne, S., Bussi, Claude, Gallia, Valérie, Greil, Marie-Laure, Hostalnou, Eric, Labeyrie, Baptiste, Mercier, Vincent, Montrognon, Yannick, Monty, Dominique, Pinet, Christian, Rouet, Pierre, Ruesch, Julien, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes (CTIFL), Station d'Expérimentation Régionale sur les Fruits et Légumes (SERFEL), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Unité d'arboriculture (BORDX ARBORI UE), Chambre d'Agriculture des Pyrénées Orientales (CA 66), Chambre Régionale d'Agriculture de Midi Pyrénées, Chambre Régionale d'Agriculture d'Occitanie (CRA Occitanie)-Chambre Régionale d'Agriculture d'Occitanie (CRA Occitanie), Station d’Expérimentation Fruits Rhône-Alpes (SEFRA), INRA, CTIFL, SEFRA, Sica CENTREX, and SERFEL
- Subjects
expérimentation système ,indice fréquence de traitements ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,agroécologie ,nectarine ,pêche ,pesticides ,évaluation de la multiperformance - Published
- 2017
4. AN INTEGRATED APRICOT BREEDING PROGRAM IN FRANCE JOINING CEP INNOVATION - CENTREX AND INRA
- Author
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M. Reich, G. Fremondiere, M. Grotte, Guy Clauzel, J.M. Broquaire, A. Blanc, Sylvie Bureau, Barbara Gouble, F. Gilles, Jean-Marc Audergon, C. Pitiot, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Sica Centrex, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and CEP Innovation
- Subjects
0106 biological sciences ,Centrex ,Mediterranean climate ,Engineering ,fermeté du fruit ,Breeding program ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,abricot ,Horticulture ,Continental climate ,01 natural sciences ,Mediterranean sea ,[SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering ,[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology ,[SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering ,National level ,Cultivar ,caractérisation variétale ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,couleur ,Hybrid ,2. Zero hunger ,Agroforestry ,business.industry ,04 agricultural and veterinary sciences ,040103 agronomy & agriculture ,0401 agriculture, forestry, and fisheries ,business ,010606 plant biology & botany - Abstract
The French apricot production is located in the South-Eastern part of the country and focused both in the Rhone valley and close to the Mediterranean Sea. The north of the Rhone valley is characterized by a continental climate while the southern region (Rhone valley and Mediterranean area) is under warm typical Mediterranean climate. Obviously apricot fruit production depends on a specific panel of cultivars in each area of cultivation due to economic and adaptation constraints. In order to enlarge the panel of cultivars to be developed by the growers in each region an integrated breeding program is developed at a national level in France with the participation of INRA, CENTREX and CEP INNOVATION. The main goals of the breeding program are: the elaboration of cultivars suitable for a durable production (including resistance to pests and disease), production regularity (including self-fertility and quality of the flowers), and fruit quality (including taste, attractiveness, and suitability for the transport). The evaluation phase is organized in the 3 main areas of production (Perpignan, Nimes, Valence) and follows 3 complementary evaluation stages (i) observation of the hybrid on its own roots; (ii) evaluation of the best hybrids after grafting in the 3 main areas; (iii) assessment of the agronomic and commercial interest of the 'elite' accessions in small orchards. The main results issued from this program are presented: 8 registered cultivars, 4 new selections under registration, and the first PPV resistant cultivar 'Aramis' ® 'Shamade'.
- Published
- 2012
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5. NEW RECENT SELECTIONS ISSUED FROM INRA'S APRICOT BREEDING PROGRAM
- Author
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J.M. Audergon, A. Blanc, F. Gilles, B. Gouble, M. Grotte, M. Reich, S. Bureau, G. Clauzel, C. Pitiot, S. Lafond, J.M. Broquaire, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Sica Centrex, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and CEP Innovation
- Subjects
0106 biological sciences ,2. Zero hunger ,Attractiveness ,biology ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,04 agricultural and veterinary sciences ,Horticulture ,PRODUCTION REGULARITY ,biology.organism_classification ,01 natural sciences ,Prunus armeniaca ,Agricultural science ,Geography ,[SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering ,040103 agronomy & agriculture ,0401 agriculture, forestry, and fisheries ,Crop quality ,Cultural practice ,[SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering ,FRUIT QUALITY ,Cultivar ,Fruit tree ,010606 plant biology & botany - Abstract
INRA, CENTREX and CEP INNOVATION are developing new apricot cultivars for French growers with particular attention paid to consumer's expectations. The main objectives of the related breeding programme are: production regularity, fruit quality and attractiveness. Their evaluation is based on a multilocal and pluri-annual set of trials located in the three major French areas of cultivation and organised as a 3-stage-evaluation: (i) observation of the seedlings on their own roots (ii) evaluation of the best grafted selections in the 3 main areas, (iii) assessment of the agronomic and commercial interest of the 'elite' accessions in small commercial orchards. At the end of the selection process two recent main types of cultivars have been introduced: - Ten new cultivars able to enlarge the harvesting season by 'conventional' type of fruit ('Soledane', 'Solimar'@, 'Candide', 'Bergerval'@, 'Bergarouge'®, 'Royal Roussillon', 'Vertige', 'Fantasme'@, 'Helena du Roussillon'®, 'Frisson'); - Three new fruit-type apricots characterized by a stark red blush covering 80% of the fruit shape, developed under the same trademark, 'Rubisco'@ (Ravival, Ravilong and Ravicile).
- Published
- 2009
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6. La mécanisation de la récolte d’abricots : faisabilité technique, conduite des vergers et comportements des variétés
- Author
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Gouble, Barbara, Broquaire, Jean Michel, Chamet, Christophe, Hostanou, Eric, Reling, Patrice, Bureau, Sylvie, Boge, Marielle, Samper, Adrienne, Ayour, Jamal, Renard, Catherine, Audergon, Jean Marc, ProdInra, Migration, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Sica Centrex, Station d’Expérimentation Fruits Rhône-Alpes (SEFRA), Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes (CTIFL), Station d'Expérimentation Régionale sur les Fruits et Légumes (SERFEL), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ANR-11-ALID-0006
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering ,[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology ,[SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering ,[SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology ,[SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2016
7. ´SOLÉDANE´, ´FLORILÈGE´ AND ´BERGAROUGE ®´AVIRINE: THREE NEW APRICOT CULTIVARS FOR FRENCH COUNTRY
- Author
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B. Moulon, J.M. Broquaire, G. Clauzel, A. Giard, F. Gilles, J.M. Duffillol, D. Chauffour, A. Blanc, Jean-Marc Audergon, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), and Sica Centrex
- Subjects
0106 biological sciences ,PERIODE DE PRODUCTION ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,04 agricultural and veterinary sciences ,Horticulture ,Biology ,biology.organism_classification ,01 natural sciences ,Prunus armeniaca ,040103 agronomy & agriculture ,0401 agriculture, forestry, and fisheries ,Cultivar ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,010606 plant biology & botany - Abstract
National audience
- Published
- 2006
- Full Text
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8. Sensibilité variétale aux maladies et ravageurs. Fiche n° 5: la tavelure: Abricot variétés classiques
- Author
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Brun, Laurent, Guillermin, Armand, Clauzel, Guy, Mercier, Vincent, Broquaire, JM, Audergon, Jean Marc, Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sica Centrex, and Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL)
- Subjects
DISPOSITIF EXPERIMENTAL ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Venturia carpophila - Abstract
National audience; - Maladie observée lors de printemps humide. - dispositif expérimental abricotier sans protection fongicide. - De très fortes différences de sensibilité à la tavelure. - Tavelure, une maladie à ne pas négliger. - Contournement du gène de résistance Vf
- Published
- 2012
9. Sensibilité variétale aux maladies et ravageurs - Fiche n° 3 Monilioses sur fleur: Abricot variétés classiques
- Author
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Parveaud, Claude-Eric, Gomez, Christelle, Mercier, Vincent, Brun, Laurent, Guillermin, Armand, Clauzel, Guy, Broquaire, JM, Audergon, Jean Marc, GRAB, Groupe de Recherche en Agriculture Biologique (GRAB), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sica Centrex, and Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL)
- Subjects
MONILIOSE ,MONILIA FRUCTIGENA ,MONILIA FRUCTICOLA ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,SENSIBILITE VARIETALE ,MONILIA LAXA - Abstract
National audience; Les monilioses sur fleur sont une des principales causes d'irrégularité de production en verger d'abricotier. Plusieurs espèces du champignon Monilia sont pathogènes. M. laxa et M. fructigena peuvent infecter les fleurs, les fruits et les pousses des arbres de fruits à noyaux et à pépins. M. furcicola a été observé dans la Vallée du Rhône pour la première fois en 2001.
- Published
- 2011
10. Sensibilité au Monilia sur fleur de 16 variétés d'abricot : 4 années d'observation
- Author
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Mercier, Vincent, Brun, Laurent, Clauzel, Guy, Guillermin, Armand, Audergon, Jean Marc, Broquaire, J.M., Parveaud, Claude-Eric, Gomez, Christelle, Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Sica Centrex, and Groupe de Recherche en Agriculture Biologique (GRAB)
- Subjects
MONILIOSE ,VARIETE ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,REDUCTION D'INTRANT ,SENSIBILITE VARIETALE ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2011
11. An integrated apricot breeding program in France joining CEP Innovation - Centrex and INRA
- Author
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Audergon, Jean Marc, Blanc, Alain, Fréderic, Gilles, Clauzel, Guy, Broquaire, M., Gouble, Barbara, Grotte, Marie, Reich, Maryse, Bureau, Sylvie, Pitiot, C., Unité de recherche Génétique et amélioration des fruits et légumes (GALF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF), Unité de Recherches Intégrées - Gotheron (GOTH RI UERI), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Sica Centrex, and CEP Innovation
- Subjects
résistance aux maladies ,virus phytopathogène ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,fruit quality ,selection ,prunus armeniaca ,virus ,qualité organoleptique ,production regularity ,applied breeding ,[SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering ,abricotier ,[SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering ,origine géographique ,résistance durable ,sharka ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,arbre fruitier ,sélection végétale - Abstract
International audience
- Published
- 2011
12. New recent selections issued from INRA's apricot breeding program
- Author
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Audergon, Jean Marc, Blanc, Alain, Gilles, Frederic, Clauzel, Guy, Broquaire, J.M., Gouble, Barbara, Grotte, Marie, Reich, Maryse, Bureau, Sylvie, Pitiot, C., Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Sica Centrex, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and CEP Innovation
- Subjects
COMMERCIAL INTEREST ,QUALITY TRAITS ,ESSAIS MULTILOCAUX ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering ,[SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2008
13. Gamme variétale d'abricotiers : évaluation de la sensibilité au monilia
- Author
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Mercier, Vincent, Gomez, Christelle, Warlop, François, Clauzel, Guy, Brun, Laurent, Broquaire, JM, Gilles, F., Audergon, Jean Marc, Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Groupe de Recherche en Agriculture Biologique (GRAB), Sica Centrex, and Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL)
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,MONILIA LAXA - Abstract
National audience; L ’abricotier est une des espèces fruitières les plus aisées à conduire en agriculture biologique, étant donné le faible nombre de bioagresseurs à maîtriser dans les conditions de production. Mais le principal d ’entre eux reste le monilia (Monilinia laxa essentiellement)qui constitue une impasse technique majeure,de par la sensibilité de l’espèce aux attaques sur fleurs,rameaux et fruits. Les conditions climatiques à la floraison peuvent entraîner une contamination primaire importante et des pertes de récolte considérables. La levée d ’un tel verrou,tout comme l’analyse objective des risques encourus,permettraient un développement de la production d’abricots biologiques en France, mais les pistes de lutte sont encore limitées.La sensibilité variétale reste l’alternative la plus pertinente à long terme.
- Published
- 2008
14. Impacts du réchauffement climatique sur la phénologie et le potentiel de floraison des arbres fruitiers. Texte + diaporama
- Author
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Legave, Jean-Michel, Brisson, Nadine, Domergue, Marjorie, Liennard, M.E., Baculat, Bernard, Seguin, Bernard, Belouin, André, Richard, Jean-Claude, Blanc, Alain, Clauzel, Guy, Lafarge, B., Claverie, Jacques, Hilaire, C., Mathieu, V., Pinet, Caroline, Moulon, B., Biologie du développement des espèces pérennes cultivées (UMR BEPC), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2), Agroclim (AGROCLIM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité mixte de recherche génétique et horticulture Genhort, Institut National d'Horticulture-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Angers (UA), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Unité Expérimentale Recherches Intégrées - Gotheron (UERI), Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne (UMR EGFV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Victor Segalen - Bordeaux 2-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes (CTIFL), Station d'Expérimentation Fruits à Noyau de la Façade Méditerranéenne (SERFEL), Sica Centrex, and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDE] Environmental Sciences ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,PRUNIER ,[SDE]Environmental Sciences ,OLIVIER ,OLEA EUROPEA ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2006
15. Production de tomates sous serres et abris. Compte-rendu des essais effectués en 2002
- Author
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Jeannequin, Benoit, Broquaire, M., Station Expérimentale Horticole, ., Centre Expérimental des Fruits et Légumes du Roussillon, ., ProdInra, Migration, Domaine expérimental horticole du Mas Blanc (MAS BLANC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Sica Centrex
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SHS] Humanities and Social Sciences ,[SHS]Humanities and Social Sciences - Abstract
* INRA, Centre d'Avignon, Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9 Diffusion du document : INRA, Centre d'Avignon, Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9
- Published
- 2003
16. Production de concombres. Compte-rendu des essais effectués en 2000
- Author
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Station Expérimentale Horticole du Mas Blanc,, Station Experimentale Horticole du Mas Blanc, ., Centre Expérimental des Fruits et Légumes du Roussillon, ., ProdInra, Migration, Domaine expérimental horticole du Mas Blanc (MAS BLANC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Sica Centrex
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,VIGUEUR HYBRIDE ,[SHS] Humanities and Social Sciences ,ERYSIPHE CICHORACEARUM ,[SHS]Humanities and Social Sciences - Abstract
* INRA Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9 Diffusion du document : INRA Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9
- Published
- 2001
17. Production de tomates sous serres et abris. Compte-rendu des essais effectués en 2000
- Author
-
Station Expérimentale Horticole du Mas Blanc,, Station Experimentale Horticole du Mas Blanc, ., Centre Expérimental des Fruits et Légumes du Roussillon, ., ProdInra, Migration, Domaine expérimental horticole du Mas Blanc (MAS BLANC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Sica Centrex
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SHS] Humanities and Social Sciences ,[SHS]Humanities and Social Sciences - Abstract
* INRA Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9 Diffusion du document : INRA Documentation, Domaine St Paul, Site Agroparc, 84914 Avignon cedex 9
- Published
- 2001
18. PCR-RFLP and sequence analysis of a non-ribosomal fragment for genetic characterization of European stone fruit yellows phytoplasmas infecting various Prunus species
- Author
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Monique Garnier, F Dosba, Colette Saillard, J. M. Broquaire, W. Jarausch, Unité de recherches Espèces Fruitières et Vigne (UREFV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de biologie cellulaire et moléculaire, Sica Centrex, and ProdInra, Migration
- Subjects
DNA, Bacterial ,0106 biological sciences ,Turkey ,Sequence analysis ,BACTERIOLOGIE ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Molecular Sequence Data ,Sequence Homology ,DNA, Ribosomal ,Polymerase Chain Reaction ,01 natural sciences ,DETECTION PCR-RFLP ,ESFY PHYTOPLASME ,Magnoliopsida ,03 medical and health sciences ,Prunus ,Intergenic region ,Amino Acid Sequence ,Cloning, Molecular ,Codon ,Molecular Biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Plant Diseases ,030304 developmental biology ,Genetics ,Base Composition ,0303 health sciences ,Base Sequence ,biology ,Nucleic acid sequence ,Genetic Variation ,DNA Restriction Enzymes ,Sequence Analysis, DNA ,Cell Biology ,Classification ,biology.organism_classification ,Europe ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,Restriction enzyme ,Restriction site ,Genes, Bacterial ,Phytoplasma ,Fruit ,Restriction fragment length polymorphism ,Oligonucleotide Probes ,Polymorphism, Restriction Fragment Length ,010606 plant biology & botany - Abstract
A 927 bp non-ribosomal fragment was used to assess the genetic variability of the European stone fruit yellows (ESFY) phytoplasma infecting 14 different Prunus species. For this, 175 isolates originating from four different Mediterranean countries were tested by PCR-RFLP analysis with seven restriction enzymes. No polymorphism among the ESFY phytoplasma could be observed but 12 out of 18 restriction sites differed between the homologous fragments of ESFY and apple proliferation (AP) phytoplasmas. An 846 bp fragment of a French ESFY isolate was sequenced, it included the 3'-end of a putative nitroreductase gene, an intergenic region and a truncated open reading frame. This ESFY phytoplasma sequence showed 89.7% identity with the equivalent AP phytoplasma nucleotide sequence (83. 9% identity at the amino acid level). The G+C content of the entire sequence was extremely low (15.4%) and A+T-rich codons were highly preferred in codon usage. In this paper, we report the presence of the ESFY phytoplasma for the first time in Turkey and in five Prunus hosts never reported previously. Our results also indicate that the ESFY phytoplasma isolates affecting various Prunus species are genetically homogenous but can be distinguished from the AP phytoplasma. Therefore, they are likely to represent different taxons.
- Published
- 2000
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