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Coffee, Coffea arabica L., is planted in diverse agro-ecological environments in the mountains of Puerto Rico (PR). The pathogen, Xylella fastidiosa Wells et al., is a xylem-limited phytopathogenic bacterium transmitted by insects that causes coffee leaf scorch, citrus-variegated chlorosis and vascular diseases of many other plant species. The objective of this study was to characterize the fastidious endophytes occupying a similar niche as X. fastidiosa in the vascular system of Citrus sinensis and Inga vera trees in low diversity and high diversity shade environments where coffee is grown In PR. Sampling was conducted over two years in four localities: Adjuntas, Jayuya, Las Marías and Yauco during the dry and rainy seasons. Citrus sinensis and Inga vera were generally the only shade treesin coffee plantations described as "low diversity"; in "high diversity" plantations these same species were present along with Pithocellobium carbonarium, Gliricidia sepium and Andira inermis. Endophyte population (EP) and endophyte diversity (ED) were contrasted using factorial arrangements of shade, locality, season and year. Endophytes were clustered using multivariate analysis. Neither shade nor season had an effect on EP in Citrus. In Inga vera, EP was about three times higher in the second year compared to the first year regardless of season, location or shade. In both Citrus and Inga, ED was low. The highest ED was detected in Jayuya and the lowest in Las Marías. Ward's algorithm combined Citrus and Inga fastidious strains into four and five clusters for Gram-negative and Gram-positive bacteria, respectively. Endophyte diversity of Citrus and Inga was determined by the plant species, not by location or shade. However, ED was higher in shaded coffee with low diversity of tree species. Thus, effects of shade (low versus high diversity) altered the community structure of endophytes prevalent in the vascular tissue and may impact host plant resistance to pathogens such as X. fastidiosa.

El café (Coffea arabica L.) es un cultivo de importancia económica y social. En Puerto Rico en el año 2012 la producción de café tuvo su nivel más bajo en toda la historia de la isla, tanto por los problemas de crisis económica como por los problemas fitosanitarios. Entre las principales enfermedades que afectan al cultivo está el encorchamiento de la hoja ('coffee leaf scorch', CLS) o crespera, causada por la bacteria Xylella fastidiosa (Xf) que ocasiona pérdidas económicas importantes en varios países. En la Cuenca del Caribe, Xf se encuentra en cafetos de Costa Rica, mientras que en Brasil la bacteria causa serias epidemias. Para determinar la distribución espacial de los cafetos posiblemente infectados con Xf, se muestrearon cafetos con síntomas similares a los de CLS. Para detectar a la bacteria en los árboles muestreados se realizó una prueba serológica comercial (DAS-ELISA) específica para Xf. Con datos de los árboles potencialmente infectados se realizaron conglomerados espaciales usando el programa SatScan. Muy pocos (< 5%) de los cafetos dieron lecturas de absorbancia dentro de los valores aceptados como positivos para Xf (a 0.7). Hubo una diferencia (p

El café, Coffea arábica, es un cultivo de i mportancia económica mundial. En la zona montañosa de Puerto Rico se siembra solo o formando un agroecosistema importante desde el punto de vista económico y ecológico. Xylella fastidiosa Wells et al., una bacteria endófita limitada al xilema y que produce el encorchamiento de la hoja del cafeto, representa una seria amenaza para este cultivo. La gran mayoría de las bacterias endófitas colonizan un nicho ecológico similar al de los organismos fitopatógenos; por lo tanto, algunas cepas son potenciales agentes de control biológico. El presente estudio buscó aislar y caracterizar las bacterias de colonización endofítica en hojas y ramas de cafetos bajo sombra y a sol, durante la época seca y la época lluviosa. Durante dos años, en fincas de café de los pueblos de Adjuntas, Jayuya, Las Marías y Yauco, se determinó el efecto de época, localidad, tipo de sombra y año sobre la cantidad y diversidad de bacterias endófitas asociadas al café. Para contrastar las poblaciones de bacterias endófitas, se analizaron las poblaciones y la diversidad de cepas bacterianas, esto es, unidades formadoras de colonias (UFC/mL), y el número de cepas fenotípicamente distintas (diversidad de cepas) aisladas de hojas y ramas de los cafetos. Se obtuvieron poblaciones bacterianas más altas en las ramas versus las nervaduras de hojas (P menor que 0.0001), por lo que, para obtener mayor representatividad de la diversidad bacteriana, los aislamientos deben realizarse de las ramas y no de las hojas. La interacción tipo de sombra por época fue la que mostró significación estadística en mayor número de veces, indicativo de que el efecto de época dependerá del tipo de sombra utilizado. Durante la época seca se detectaron diferencias estadísticas (P menor que 0.05) en el factor tipo de sombra y localidad en los aislamientos realizados a partir de muestras de ramas y hojas. En la época lluviosa se detectaron diferencias para diversidad de bacterias por árbol para el factor tipo de sombra en muestras de hoja y rama. En general, un número alto de bacterias en una localidad, época o tipo de sombra fue asociado con un alto nivel de diversidad de cepas. Existe la posibilidad de que ciertas cepas endófitas interactúen de forma antagonista con X. fastidiosa, siendo esto una alternativa con potencial para el manejo de la enfermedad.