Zooplankton community structure was investigated in the estuarine complex of Paranaguá (Southern Brazil) during July 1993 (winter) and February-March 1994 (summer). Copepods belonging to the genera Acartia, Paracalanus, Parvocalanus, Pseudodiaptomus, Temora, Oithona and Euterpina dominated the zooplankton associations, attaining up to 90% of total densities. Pseudodiaptomus richardi was the dominant estuarine copepod in oligohaline stretches with salinities below 15. Estuarine marine species such as Acartia tonsa, Oithona hebes and Oithona oswaldocruzi reached high densities in salinities ranging from 17 to 25. Other abundant estuarine marine species including Acartia lilljeborgi and Pseudodiaptomus acutus occurred in a broader salinity range. Marine euryhaline copepods were found in salinities as low as 15, but were usually more abundant in areas under the influence of coastal waters. Several marine stenohaline species associated with the warm waters of the Brazil Current were recorded in the euhaline areas. Other important zooplanktonic groups in this estuarine complex were tintinnids, appendicularians, cladocerans and meroplanktonic larvae of polychaetes and decapods. Density maxima (up to 82400 org.m-³) were found in the intermediate stretches - in salinities varying from 15 to 30 - corresponding approximately to the distributional pattern of phytoplankton biomass. A estrutura das associações zooplanctônicas do complexo estuarino de Paranaguá foi estudada no inverno de 1993 e no verão de 1994. Copépodes dos gêneros Acartia, Paracalanus, Parvocalanus, Temora, Pseudodiaptomus, Oithona e Euterpina foram dominantes, atingindo até cerca de 90% da densidade total. A única espécie que ocorreu preferencialmente em salinidades inferiores a 15 foi o calanóide Pseudodiaptomus richardi, que representa o principal componente do holoplncton nos setores oligohalinos. Acartia tonsa e Oithona oswaldocruzi predominaram nos trechos intermediários, associadas a outras espécies estuarino-marinhas que suportam maiores variações de salinidade, como Acartia lilljeborgi, Pseudodiaptomus acutus e Oithona hebes. Espécies marinho-eurihalinas como Temora turbinata, Paraca/anus quasimodo, Oithona simplex e Euterpina acutifrons ocorreram em salinidades tão baixas quanto 15, mas foram mais abundantes na área externa influenciada pela água costeira. Várias espécies marinho-estenohalinas, associadas principalmente às águas quentes da Corrente do Brasil, foram registradas no setor euhalino. Outros grupos zooplanctônicos numericamente importantes foram os tintinineos, apendiculárias, cladóceros e alguns representantes do meroplncton, como as larvas de poliquetas e decápodes. Os máximos de abundncia do zooplncton (até cerca de 82000 org.m-3) ocorreram nos setores intermediários, em salinidades variando entre 15 e 30, coincidindo aproximadamente com o padrão de distribuição da biomassa fitoplanctônica.