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Wild rocket (Diplotaxis tenuifolia (L.) DC) is a species known for its growing consumption as “baby leaf” crop. Downy mildew, a disease caused by the pathogen Hyaloperonospora sp., is one cause of production losses in D. tenuifolia cultivation. To preserve elevated quality standards and sustainable production of wild rocket, the characterization of genetic diversity present in a germplasm collection is an important step towards the identification of genetic resources, fundamental to plant breeding. The objectives of this work encompass the characterization of the genetic diversity within a germplasm collection of D. tenuifolia, including a set of E. sativa samples, and the unequivocal identification of a group of selected accessions, using molecular markers. Genetic diversity analysis, performed using 5 Inter Simple-Sequence Repeats (ISSR) and 7 Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) primers, resulted in 110 scorable polymorphisms. Wild rocket accessions exhibited intraspecific genetic similarity with values ranging between 0.697 and 0.994. Tighter clusters aggregate accessions with greater genetic similarity provided by the same producing company. The unequivocal identification of 90 accessions was performed using Simple-Sequence Repeats (SSR) and Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) markers, the latter analyzed as Cleaved Amplified Polymorphic Sequences (CAPS). These loci were mined from the D. tenuifolia genomic assembly (UAlgDiploT.01), uploaded to the genomic databases. Twenty SSR and 19 SNP loci (selected by the presence of a TaqI restriction region in the SNP site), were retrieved for analysis. From this, five SSR and nine SNP loci were selected, giving rise to 70 SSR alleles analyzed by capillary gel electrophoresis and 36 CAPS polymorphisms. The molecular characterization of selected accessions resulted in the identification of specific fingerprints for the accessions, excluding 1 trio and 6 pairs of wild rocket accessions, exhibiting full similarity (100%). Thus, confirming the presence of duplicate accessions provided by different breeding and commercial companies. Rúcula selvagem (Diplotaxis tenuifolia (L.) DC) é uma espécie conhecida pelo seu crescente consumo como cultura “baby leaf”. O míldio, doença causada pelo patógeno Hyaloperonospora sp., é uma causa para as perdas de produção no cultivo de D. tenuifolia. Para preservar elevados padrões de qualidade e produção sustentável de rúcula selvagem, a caracterização da diversidade genética presente numa coleção de germoplasma é um passo importante na identificação de recursos genéticos, fundamentais para o melhoramento de plantas. Os objetivos deste trabalho englobam a caracterização da diversidade genética de uma coleção de germoplasma de D. tenuifolia, incluindo amostras de E. sativa e, a identificação inequívoca de um grupo de acessos selecionados, utilizando marcadores moleculares. A análise da diversidade genética, realizada utilizando 5 primers Inter Simple-Sequence Repeats (ISSR) e 7 Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD), resultou em 110 polimorfismos contabilizados. Os acessos de rúcula selvagem exibiram elevada similaridade genética intraespecífica com valores entre 0.697 e 0.994. Grupos mais compactos agregam acessos com maior similaridade genética fornecidos pela mesma empresa produtora. A identificação inequívoca de acessos foi realizada utilizando marcadores Simple-Sequence Repeats (SSR) e Single Nucleotide Polymorphisms (SNP), estes últimos analisados como Cleaved Amplified Polymorphic Sequences (CAPS). Estes loci, extraídos do conjunto genómico D. tenuifolia (UAlgDiploT.01), foram carregados em bases de dados genómicas. Vinte loci SSR e 19 loci SNP (selecionados pela presença de uma região de restrição TaqI no sítio SNP) foram recuperados para análise. Destes, cinco loci SSR e nove SNP foram selecionados, dando origem a 70 alelos SSR analisados por eletroforese em gel capilar e 36 polimorfismos CAPS contabilizados. A caracterização molecular dos acessos selecionados resultou na identificação de “fingerprints” específicos para os acessos, excluindo 1 trio e 6 pares de acessos de rúcula selvagem, apresentando similaridade total (100%), confirmando a presença de acessos duplicados fornecidos por diferentes empresas produtoras.

Background: Two biotypes of Aberdeen Angus cattle breed, known as Old Type and New Type, that differ in their origin and beef production are formally recognized. In Colombia, this breed has been commercialized for approximately 80 years. Studies on the origin, kinship and levels of genetic diversity of this breed in Colombian herds are scarce, yet important for planning crossing and management strategies. Objective: To measure the genetic diversity and structure of two Colombian herds of Old Type and New Type biotypes of Aberdeen Angus from Huila and Cundinamarca provinces and assess mitochondrial introgression with other breeds. Methods: A set of ten microsatellites and sequences of the Mitochondrial Control Region were characterized. Estimators of genetic diversity and population differentiation along with tests of population assignment were applied. Results: Nuclear loci were highly polymorphic as shown by the Polymorphic Information Content (0.599) and the Probability of Identity (1.896 10-08). Both populations were highly diverse and clearly differentiated into two groups corresponding to the Old Type and New Type phenotypes. In contrast, mitochondrial data failed to distinguish these two groups and showed extensive admixture. Conclusions: This study optimized a set of ten highly polymorphic nuclear markers that may be used for parentage and population genetic studies of Aberdeen Angus. Genetic differentiation in these loci agreed with phenotypic differences of the Old and New Types. However, mitochondrial data indicated ancestry of multiple European breeds in the origin of Colombian Aberdeen Angus. Resumen Antecedentes: Dentro de la raza Aberdeen Angus existen dos biotipos conocidos como Old Type y New Type, las cuales difieren en su origen y producción de carne. En Colombia, esta raza se ha venido comercializando desde hace aproximadamente 80 años. No obstante, aún no se han realizado estudios sobre su origen, parentesco y niveles de diversidad genética de esta raza en hatos colombianos, lo cual es importante para planear estrategias de cruce y manejo. Objetivo: Medir la diversidad y estructura genética de dos hatos colombianos de Aberdeen Angus Old Type y New Type de Huila y Cundinamarca y evaluar la introgresión mitocondrial con otras razas. Métodos: Se caracterizó un grupo de diez loci microsatélite y se secuenció la Región Control Mitocondrial. Se aplicaron estimadores de diversidad genética y diferenciación poblacional, junto con pruebas de asignación poblacional. Resultados: Los loci microsatélite fueron altamente polimórficos, tal como lo indicaron el Contenido de Información Polimórfica (0,599) y la Probabilidad de Identidad (1,896 10-08). Las poblaciones evaluadas de Aberdeen Angus en Colombia fueron altamente diversas y se diferenciaron claramente en dos grupos correspondientes a los fenotipos Old Type y New Type. En contraste, los datos mitocondriales no recobraron estos dos grupos y mostraron una amplia mezcla genética. Conclusiones: Este estudio optimizó un grupo de diez marcadores altamente polimórficos que pueden ser usados para estudios de parentesco y genética poblacional de Aberdeen Angus. La diferenciación genética en loci nucleares concordó con las diferencias fenotípicas entre Old y New Types, pero los datos mitocondriales indicaron ancestría de múltiples razas europeas en el origen del Aberdeen Angus colombiano. Resumo Antecedentes: Dentro da raça Aberdeen Angus há dois biótipos conhecidos como Old Type e New Type, que diferem em sua origem e produção de carne. Na Colômbia, esta raça é comercializada há aproximadamente 80 anos. Entretanto, estudos sobre a origem, o parentesco e os níveis de diversidade genética desta raça em rebanhos colombianos ainda não foram realizados, o que é importante para o planejamento de cruzamentos e estratégias de manejo. Objetivo: Medir a diversidade genética e a estrutura de dois rebanhos colombianos de biótipos de Old Type e New Type de Aberdeen Angus de Huila e Cundinamarca e avaliar a introgressão mitocondrial com outras raças. Métodos: Um grupo de dez loci de microssatélites foi caracterizado e a Região de Controle Mitocondrial foi sequenciada. As estimativas de diversidade genética e diferenciação populacional foram aplicadas, juntamente com testes de designação populacional. Resultados: Os locus microssatélites foram altamente polimórficos, conforme indicado pelo Conteúdo de Infomação Polimórfica (0,599) e Probabilidade de Identidade (1,896 10-08). As populações avaliadas de Aberden Angus na Colômbia eram altamente diversificadas e claramente diferenciadas em dois grupos correspondentes aos fenótipos do Old Type e New Type. Em contraste, os dados mitocondriais não recuperaram esses dois grupos e mostraram um amplo mix genético. Conclusões: Este estudo otimizou um grupo de dez marcadores altamente polimórficos que podem ser usados para estudos genéticos de parentesco e população de Aberdeen Angus. A diferenciação genética nos loci nucleares concordou com as diferenças fenotípicas entre os Old e New Types, mas os dados mitocondriais indicam ancestralidade de várias raças européias na origem do Aberdeen Angus colombiano.

Mangaba tree is a fruit tree species whose natural populations are fragmented by anthropic actions. For this reason, studies assessing the impact of fragmentation on the diversity and genetic structure of these populations are required in order to establish suitable conservation strategies. In our study, we used data from analyzes through microsatellite markers in computer simulations to estimate the rates of migration and selfing of six mangaba populations. The studied populations are located in the northeastern states of Ceará, Pernambuco and Sergipe. We tested different selfing and migration rates and selected the combination that showed values of observed and expected heterozygosity closest to those previously obtained with microsatellite markers. According to our simulations, selfing and migration were moderate. This may have led to an increase in inbreeding and genetic drift, resulting in low genetic diversity. We recommend expanding the area and reducing disturbance to promote the occurrence of pollinators, which play an important role in increasing genetic diversity. RESUMO: A mangabeira é uma espécie frutífera cujas populações naturais se encontram fragmentadas por ações antrópicas. Desse modo, são necessários estudos sobre a avaliação do impacto da fragmentação sobre a diversidade e estrutura genética dessas populações para o estabelecimento de estratégias de conservação adequadas. No presente estudo, foram utilizados dados de análises com marcadores microssatélites em simulações computacionais para estimar as taxas de migração e autofecundação de seis populações de mangaba. As populações estudadas estão localizadas nos estados nordestinos do Ceará, Pernambuco e Sergipe. Foram testadas diferentes taxas de autofecundação e migração, e selecionada a combinação que apresentou valores de heterozigosidade observada e esperada mais próximos dos obtidos com marcadores microssatélites. Com base nas simulações, a autofecundação foi de 0,3 e a taxa de migração variou de 0,5 a 0,6, valores que podem ter conduzido ao aumento da endogamia e deriva genética, resultando em baixa diversidade genética. Recomenda-se a expansão da área e a redução de perturbações para promover a ocorrência de polinizadores, que desempenham um papel importante no aumento da diversidade genética.

Prochilodus lineatus is a species of migratory fish widely distributed in the Paraná River basin, found mainly in the Grande, Pardo and Mogi-Guaçu rivers located in a well-developed region of the state of São Paulo. This study analyzes the genetic diversity and population structure in shoals of P. lineatus based on temporal analysis of specimens sampled over the years 2003, 2005, 2006, 2009, 2010, and 2015 in the Mogi-Guaçu River, São Paulo, at the region of Cachoeira de Emas. Genetic analysis performed using the D-Loop and seven microsatellite marker revealed significant genetic variability in all sampled groups. Moderate levels of structuring between groups were identified with the microsatellite markers (Fst = 0.14), while the mitochondrial marker did not reveal patterns of genetic structuring (Fst = 0.01). The genetic variability fluctuated over time, characterizing patterns of structuring among the analyzed samples. The occurrence of environmental alterations resulting in increased mortality rates, as well as changes in the water level in the ecosystem, among other factors, could determine changes in the reproductive behavior of species. The lack of favorable environmental conditions for reproduction in the basin, as reflected by tests of population bottlenecks, could have resulted in the differentiation of populations of P. lineatus over time. Resumo Prochilodus lineatus é uma espécie de peixe migratório amplamente distribuído na bacia do rio Paraná, principalmente nos rios Grande, Pardo e Mogi-Guaçu localizados em uma região bem desenvolvida do estado de São Paulo. Este estudo analisou a diversidade genética e a estrutura populacional em cardumes de P. lineatus com base na análise temporal de espécimes amostrados ao longo dos anos de 2003, 2005, 2006, 2009, 2010 e 2015 na Cachoeira de Emas no rio Mogi-Guaçu, São Paulo, Brasil. A análise genética realizada com o marcador D-Loop e sete microssatélites revelou variabilidade genética significativa em todos os grupos amostrados. Níveis moderados de estruturação entre os grupos foram identificados com os marcadores microssatélites (Fst = 0.14), enquanto o marcador mitocondrial não revelou padrões de estruturação genética (Fst = 0.01). A variabilidade genética identificada no estoque oscilou ao longo do tempo, caracterizando padrões de estruturação entre as amostras analisadas. A ocorrência de alterações ambientais resultando em aumento das taxas de mortalidade, bem como mudanças no nível de água no ecossistema, entre outros fatores, podem determinar mudanças no comportamento reprodutivo das espécies. A falta de condições ambientais favoráveis para a reprodução na bacia, pode ter resultado na diferenciação das populações de P. lineatus ao longo do tempo.

Submitted by Caio Felipe da Silva (caio_nardo@hotmail.com) on 2020-02-03T18:58:08Z No. of bitstreams: 1 Mestrado_CaioFelipe.pdf: 1180676 bytes, checksum: 5994e2746ec7f291d5622d8f0d87a903 (MD5) Approved for entry into archive by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br) on 2020-02-05T13:23:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_cf_me_bot.pdf: 1180676 bytes, checksum: 5994e2746ec7f291d5622d8f0d87a903 (MD5) Made available in DSpace on 2020-02-05T13:23:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_cf_me_bot.pdf: 1180676 bytes, checksum: 5994e2746ec7f291d5622d8f0d87a903 (MD5) Previous issue date: 2020-02-16 O rio Sapucaí-mirim está localizado na bacia do alto rio Paraná e apresenta uma grande diversidade de peixes neotropicais. Dentre eles, encontra-se a espécie Astyanax lacustris, popularmente conhecida como “lambari-do-rabo-amarelo”, abundante na região. A bacia do alto rio Paraná vêm enfrentando construções de inúmeras Pequenas Centrais Hidrelétricas (PCHs) e pouco se sabe a respeito do seu impacto nas populações naturais. Marcadores moleculares microssatélites são amplamente utilizados em estudos de diversidade e estruturação genética, principalmente devido a sua codomiância, abundância no genoma dos eucariotos e polimorfismo. Dado o exposto, o presente estudo analisou a diversidade e estrutura genética de populações naturais de A. lacustris coletadas a montante (reservatório da PCH de Palmeiras) e a jusante (escada da PCH de Retiro) nos anos de 2018 e 2019 utilizando marcadores microssatélites, afim de se ter mais dados a respeito do impacto dos barramentos nessas populações naturais de peixes. Sete loci microssatélites foram aplicados e programas computacionais foram utilizados para as análises. Os resultados mostraram, que de maneira geral, os quatro estoques amostrados apresentaram uma alta diversidade genética e afirmou-se a eficiência desses marcadores. No que se diz respeito a estruturação genética, foram detectados três grupos diferenciados entre si: um grupo à montante (reservatório da PCH de Palmeiras) e dois grupos amostrados a jusante, nos anos de 2018 e 2019, respectivamente. A alta diversidade genética pode ser explicada, além da capacidade dessa espécie de se adaptar a condições ambientais hostis, a práticas de repovoamento por técnicas de supportive breeding. Um outro fator que pode ter levado a esse resultado é que ambas PCHs foram contruídas recentemente. O fato das escadas das PCHs brasileiras apenas permitiram a passagem no sentido jusante-montante, pode explicar o fato da diferença populacional encontrada entre os estoques das escada da PCH de Retiro (jusante) entre os anos e a diferença da mesma com o grupo identificado a montante. Por fim, este trabalho ressalta a importância da implamentação de medidas mitigadoras, além de servir como base para futuros trabalhos, uma vez que os estudos de monitoramento inicial e contínuo de diversidade e estrutura de peixes são escassos no Brasil. Introduction: Sepsis is among the most common reasons for hospitalization in intensive care units (ICUs) around the world, with Sepsis-induced acute kidney injury (SAKI) being considered one of the most serious and frequent complications of this condition. The assessment of nutritional needs, including resting energy expenditure (REE), as well as the monitoring of nutritional therapy in relation to the adequacy of protein caloric intake is a crucial point in critical patient care and is related to better outcomes. Objectives: To describe and compare REE estimated by the Harris Benedict formula and measured by indirect calorimetry of septic patients without associated AKI, with AKI without the need of dialysis and with dialytic AKI, and to evaluate the adequacy of the caloric intake and its association with the outcome of death. Methods: Prospective observational cross-sectional study evaluating patients with a diagnosis of sepsis admitted to an ICU of HCFMB-UNESP, aged> 18 years old, use of mechanical ventilation, with FiO2 80% of the needs. Results: A total of 125 patients with a diagnosis of sepsis were evaluated. Of these, 67.2% (n = 84) were of the male gender, with age of 62.53 ± 16.55 years old, presence of septic shock in 58.4%, pulmonary focus as the main infection site (67.2%) and AKI present in 80% of the septic population, with 49.6% with dialytic need. No statistically significant difference was observed between the groups without and with AKI, on dialysis or not, in relation to the REE measured (p = 0.33) and estimated (p = 0.88). Sepsis without AKI (n = 25), sepsis with AKI (n = 43), and sepsis with dialytic AKI (n = 57) presented medium REE statistically higher than estimated (1855.0 (1636.75 - 2052.75) vs. 1551.0 (1349.0-1719.25), p = 0.007, 1868.0 (1219.5- 2344.75) vs.1388.0 (1254.0-1665.5), p = 0, 02 and 1986 (1477-2419) vs. 1426 (1270-1715), p

This study aimed to evaluate the genetic dissimilarity among sweet potato genotypes using morphological and molecular descriptors. The experiment was conducted in the Olericulture Sector at Federal University of Jequitinhonha and Mucuri Valleys (UFVJM) and evaluated 60 sweet potato genotypes. For morphological characterization, 24 descriptors were used. For molecular characterization, 11 microsatellite primers specific for sweet potatoes were used, obtaining 210 polymorphic bands. Morphological and molecular diversity was obtained by dissimilarity matrices based on the coefficient of simple matching and the Jaccard index for morphological and molecular data, respectively. From these matrices, dendrograms were built. There is a large amount of genetic variability among sweet potato genotypes of the germplasm bank at UFVJM based on morphological and molecular characterizations. There was no duplicate suspicion or strong association between morphological and molecular analyses. Divergent accessions have been identified by molecular and morphological analyses, which can be used as parents in breeding programmes to produce progenies with high genetic variability. RESUMO. Objetivou-se avaliar a dissimilaridade genética entre genótipos de batata-doce por meio de descritores morfológicas e moleculares. O experimento foi conduzido no Setor de Olericultura da Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM) avaliando-se 60 genótipos de batata-doce. Na caracterização morfológica, utilizaram-se 24 descritores. Na caracterização molecular, utilizaram-se onze primers microssatélites específicos para batata-doce, obtendo-se 210 bandas polimórficas. A diversidade morfológica e molecular foi obtida por matrizes de dissimilaridade baseando-se no coeficiente de coincidência simples e índice de Jaccard, para dados morfológicos e moleculares, respectivamente. A partir destas matrizes foram construídos dendrogramas. Houve grande variabilidade genética entre os genótipos de batata doce do banco de germoplasma da UFVJM, tanto pela caracterização molecular como morfológica. Não houve suspeita de duplicata nem associação entre a análise molécular e morfológica. Foram identificados acessos divergentes pelas análises moleculares e morfológicas, os quais são indicados como genitores para compor programas de melhoramento a fim de obter progênies com alta variabilidade genética.

Submitted by JOÃO RICARDO VIEIRA MANECHINI null (jon2502@gmail.com) on 2017-08-17T15:14:39Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Joao_Ricardo_Vieira_Manechini.pdf: 3399060 bytes, checksum: 952bfa9a183cdacca5c9fd424062ab28 (MD5) Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-08-25T20:25:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RESSALVA.pdf: 23627 bytes, checksum: a9a607389a139d91bc4e5f09d86dc85a (MD5) Made available in DSpace on 2017-08-25T20:25:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RESSALVA.pdf: 23627 bytes, checksum: a9a607389a139d91bc4e5f09d86dc85a (MD5) Previous issue date: 2017-06-20 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A cana-de-açúcar figura mundialmente como uma importante cultura econômica, com grande participação no suprimento da demanda global por energia e açúcar. Bancos ativos de germoplasma são repositórios in vivo de variabilidade genética para os programas de melhoramento, estando diretamente relacionados ao sucesso do programa. Para uma gestão adequada e eficiente do banco é necessário conhecer a magnitude e distribuição da variabilidade genética dentro e entre os grupos de acessos das respectivas espécies que o compõe bem como identificar os acessos duplicados ou erroneamente identificados. Marcadores moleculares microssatélites são adequados para tal finalidade. O presente trabalho teve como objetivo principal avaliar a estrutura genética de um grupo de 593 genótipos, constituído por germoplasma básico e melhorado, disponíveis no banco de germoplasma do Programa Cana – IAC. Além disso, a magnitude da diferenciação genética entre as principais cultivares brasileiras e o germoplasma básico de cana-de-açúcar também foi investigada. Para tanto, 12 pares de primers SSR de alto poder discriminatório foram utilizados. A análise da estrutura genética separou os genótipos em dois grupos principais, um constituído por germoplasma básico e o outro por genótipos melhorados. A partição da variabilidade genética mostrou que 14,44% (P

Este trabalho objetivou caracterizar acessos de C. canephora oriundos de cultivos comerciais e bancos de germoplasma brasileiros. Um total de 130 acessos das coleções do IAC (São Paulo), UFV (Minas Gerais) e coletados em plantios comerciais no Espírito Santo e Rondônia foram genotipados com 20 novos microssatélites. Métodos multivariados foram utilizados para estimar a relação entre os acessos. Foi observado alto nível de polimorfismo e dois grupos foram identificados: o primeiro foi constituído pelos genótipos conservados nas coleções de germoplasma do IAC e UFV e o segundo foi composto pelos acessos coletados em plantios comerciais. Os acessos do Espírito Santo e de Rondônia formaram dois subgrupos distintos. Apesar do grande polimorfismo encontrado nas lavouras brasileiras de café canéfora, incrementar essa diversidade é necessário, pois um novo limiar de ganhos genéticos é esperado nos programas de melhoramento com a intensificação do uso do germoplasma conservado. This work aimed to characterize accessions that represent the C. canephora germplasm conserved and cultivated in Brazil. A total of 130 accessions from germplasm banks of IAC (São Paulo), UFV (Minas Gerais) and also collected in plantations of the State of Espírito Santo and Rondônia were evaluated with a set of 20 new microsatellite primers. Multivariate methods were used to estimate the relationship among the accessions. High level of polymorphism and two major diversity clusters were identified. First cluster was composed by the accessions conserved in the IAC and UFV collections and the second was formed by accessions collected in areas under cultivation. Accessions from Espírito Santo and Rondônia were clear separated, composing two subclusters. Despite the great polymorphism found in Brazilian plantations, the diversity may be increased, because a new threshold in the genetic gains is expected on breeding programs with the intensification of the use of conserved germplasm.

The objective of this work was to characterize morphologically and molecularly the genetic diversity of cassava accessions, collected from different regions in Brazil. A descriptive analysis was made for 12 morphological traits in 419 accessions. Data was transformed into binary data for cluster analysis and analysis of molecular variance. A higher proportion of white or cream (71%) root cortex color was found, while flesh colors were predominantly white (49%) and cream (42%). Four accession groups were classified by the cluster analysis, but they were not grouped according to their origin, which indicates that diversity is not structured in space. The variation was greater within regions (95.6%). Sixty genotypes were also evaluated using 14 polymorphic microsatellite markers. Molecular results corroborated the morphological ones, showing the same random distribution of genotypes, with no grouping according to origin. Diversity indices were high for each region, and a greater diversity was found within regions, with: a mean number of alleles per locus of 3.530; observed and expected heterozygosity of 0.499 and 0.642, respectively; and Shannon index of 1.03. The absence of spatial structure among cassava genotypes according to their origins shows the anthropic influence in the distribution and movement of germplasm, both within and among regions. O objetivo deste trabalho foi caracterizar, morfológica e molecularmente, a diversidade genética de acessos de mandioca de diferentes regiões do Brasil. Realizou-se a análise descritiva de 12 características morfológicas em 419 acessos. Os dados foram transformados em dados binários para análise de agrupamento e análise de variância molecular. Observou-se maior proporção (71%) de cor branca ou creme do córtex da raiz, enquanto as cores da polpa foram predominantemente branca (49%) e creme (42%). Quatro grupos de acessos foram classificados pela análise de agrupamento, mas não foram agrupados de acordo com sua origem, o que indica que a diversidade não está estruturada no espaço. A maior parte da variação ocorreu dentro das populações (95,6%). Sessenta genótipos também foram avaliados com o uso de 14 marcadores microssatélites polimórficos. Os resultados moleculares corroboraram os morfológicos e mostraram a mesma distribuição aleatória dos genótipos, com ausência de agrupamento quanto ao local de origem. Os índices de diversidade foram elevados para cada região e a maior parte da diversidade foi observada dentro de regiões, com: número médio de alelos por loco de 3,530; heterozigosidade média observada de 0,499 e esperada de 0,642; e índice de Shannon de 1,03. A ausência de estrutura espacial entre os genótipos de mandioca de acordo com suas origens mostra a influência antrópica na distribuição e movimentação de germoplasma, tanto entre como dentro de regiões.

Tese de Doutoramento em Genética Molecular, Comparativa e Tecnológica A Gralha-de-bico-vermelho (Pyrrhocorax pyrrhocorax) tem sofrido uma regressão das suas populações no último século praticamente por toda a sua área de distribuição; tendo mesmo ocorrido a extinção local em muitas regiões onde outrora era comum. A ocorrência desta espécie representa um excelente indicador da qualidade ecológico-ambiental, por ser especializada, alimentando-se sobretudo de insetos ativos no solo, e muito exigente a nível das características dos habitats, muito conotados com a agricultura e pastorícia tradicional. A Península Ibérica é uma das áreas periféricas de distribuição, onde se verifica uma elevada fragmentação das populações potencialmente associada a fatores antropogénicos, não se conhecendo o seu efeito na diversidade genética e dinâmica populacional da espécie. O estudo da estrutura genética das populações de gralha-de-bico-vermelho é de extrema importância considerando a tendência geral de declínio e fragmentação. O desenvolvimento e aplicação de ferramentas de modelação ecológica podem ser fundamentais para propor novas estratégias de gestão e conservação, nomeadamente através da antecipação de futuras consequências ecológicas associadas com alterações antropogénicas no seu habitat. Neste contexto, este trabalho pretende contribuir para a caracterização da diversidade e estrutura genética das populações Ibéricas de Gralha-de-bico-vermelho, assim como analisar e prever a influência de fatores antropogénicos na dinâmica populacional em dois casos de estudo em Portugal (Serra de Aire e Candeeiros e Sagres) via modelação ecológica dinâmico-espacial. A monitorização de 25 núcleos populacionais Ibéricos proporcionou, ao longo dos últimos 30 anos, a recolha de material biológico usado para a genotipagem de 642 indivíduos utilizando marcadores nucleares (microssatélites) e mitocondriais. Em 12 destes núcleos foram anilhadas 8989 aves de forma a monitorizar a dispersão dos indivíduos. Em Portugal as populações de Sagres e da Serra de Aire e Candeeiros foram monitorizadas sazonalmente, acompanhando os bandos nos locais de alimentação, com a caracterização dos habitats preferenciais considerando a sua integração na conceção de um modelo ecológico. Os resultados deste projeto multidisciplinar sugerem uma elevada e inesperada estrutura genética entre as populações Ibéricas, com uma reduzida diversidade genética mais acentuada nas populações periféricas. Considerando a elevada capacidade de dispersão da espécie, a diferenciação genética complexa e extrema observada nestas populações de gralha-de-bico-vermelho é única entre as aves, e apenas comparável a alguns casos reportados para os humanos, primatas selvagens e cetáceos. Este estudo também evidencia uma elevada suscetibilidade da gralha-de-bico-vermelho a alterações antropogénicas (abandono e/ou reconversão da agricultura e pastorícia tradicionais) indicando uma tendência populacional negativa num cenário de abandono em ambas as regiões estudadas. Contudo, quando se simularam medidas de mitigação num cenário de gestão do habitat em áreas importantes de alimentação, verificou-se a minimização do declínio da espécie num contexto generalizado de abandono das práticas tradicionais.Os dados obtidos neste estudo sugerem que a implementação de medidas de gestão/restauração de habitat são prioritárias e urgentes para a conservação das diferentes populações de gralha-de-bico-vermelho, em especial no caso das mais periféricas e fragmentadas. In the last century, the red-billed chough (Pyrrhocorax pyrrhocorax) populations has declined throughout its distribution area, with local extinction in many regions where once was common. The occurrence of this species is an excellent indicator of the ecological and environmental quality because it is a specialized corvid, feeding mainly on active insects in the soil, and very demanding in terms of habitat characteristics, generally connoted with traditional agriculture and pastoralism. Iberian Peninsula is one of the peripheral distribution areas of the species, where there are high levels of population fragmentation potentially associated with anthropogenic factors, being unknown its effect on the genetic diversity and population dynamics. The understanding of chough populations’ genetic structure is of crucial importance given their general declining trends and fragmentation, and the development of predictive ecological modelling tools are of great value to improve management and conservation recommendations, namely by anticipating future ecological consequences associated with anthropogenic habitat changes. In this context, this work aims to contribute to the characterization of the genetic structure and diversity of Iberian chough populations, as well as to analyse and to predict the influence of land use/land cover (LULC) changes on the choughs foraging habitat suitability in two case studies in Portugal (Serra de Aire e Candeeiros and Sagres) using a spatially-dynamic ecological modelling approach (StDM).The monitoring of 25 Iberian chough nuclei over the past 30 years allowed the collection of the biological samples used for genotyping of 642 individuals with nuclear (microsatellites) and mitochondrial markers. A total of 8989 birds of 12 nuclei were ringed in order to monitoring the dispersion patterns. Portuguese populations of Serra de Aire e Candeeiros and Sagres were seasonally monitored, following the flocks in feeding sites, being recorded the preferred habitat characteristics considering its integration in the development of an ecological model. The results of this multidisciplinary project suggest a high and unexpected genetic differentiation between the Iberian chough populations, with a reduced genetic diversity, mainly in the peripheral populations. Considering the high dispersal capacity of the species, the extreme and complex genetic differentiation observed between Iberian choughs is unique among birds, and only comparable to a few cases reported for humans, wild primates and cetaceans. Our study also evidences a high susceptibility of the choughs to anthropogenic changes (abandonment and/or reconversion of traditional agriculture and pastoralism), indicating a negative population trends in an abandonment scenario. However, when mitigation measures were simulated in a habitat management scenario of important foraging areas, it was observed the minimization of species decline in a generalized context of abandonment of traditional practises. Therefore, our findings indicate that the implementation of urgent habitat management/restoration actions is a conservation priority for the chough populations, especially in the most peripheral and fragmented distribution areas. Portuguese Foundation for Science and Technology (FCT) through the POPH/FSE program (Programa Operacional Potencial Humano/Fundo Social Europeu)

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2016. Os hábitats naturais estão cada vez mais fragmentados e sujeitos a queimadas, derrubada de árvores e presença de gado. Esta redução populacional leva a gargalos genéticos, efeito fundador, deriva genética e redução no fluxo gênico. O Cerrado brasileiro é a mais rica savana do mundo mas já perdeu metade da sua vegetação original. Dentre as espécies endêmicas do Cerrado, encontram-se o araticum (Annona crassiflora Mart.) e cagaita (Eugenia dysenterica DC.). Tais espécies se destacam pelo seu potencial de exploração econômica através do extrativismo de seus frutos. O objetivo dessa tese foi determinar os efeitos da fragmentação e distúrbios antrópicos na diversidade genética, estrutura espacial genética e endogamia em A. crassiflora e E. dysenterica. Para isso coletamos folhas de 30 indivíduos adultos em seis populações de cada espécie. Três populações eram localizadas em áreas grandes e protegidas sem histórico recente de distúrbios e outras três populações em áreas pequenas, isoladas e com sinais de distúrbios antrópicos. Para a diferenciação dos indivíduos utilizamos 10 marcadores SSR já desenvolvidos para araticum e 13 para cagaita desenvolvidos na tese. Com os dados da genotipagem determinamos o polimorfismo, heterozigosidade e estrutura genética espacial. Todas as populações apresentaram alto polimorfismo e diversidade genética. Contudo, não houve diferenças significativas entre as áreas controle e degradadas, além de não ter sido observada uma forte estrutura genética nessas áreas. Populações degradadas podem não ter sido afetadas devido à já alta diversidade genética natural encontrada em todas as populações estudadas ou que ainda há fluxo gênico entre populações degradadas. Além disso, é possível que tenham sido estudadas árvores que existiam antes da redução populacional, refletindo assim uma diversidade genética pré-degradação. Nossos resultados mostram que áreas pequenas e fragmentadas podem manter a diversidade genética in situ de A. crassiflora e E. dysenterica. Natural habitats are increasingly fragmented and subject to burning, cutting trees and cattle. This population reduction leads to genetic bottlenecks, founding effect, genetic drift and reduction in gene flow. The Brazilian Cerrado is the richest savannah in the world but has lost half of its original vegetation. Among the endemic species of the Cerrado, are araticum (Annona crassiflora Mart.) and cagaita (Eugenia dysenterica DC.). Such species stand out for their potential for economic exploitation through the extraction of their fruits. The aim of this thesis was to determine the effects of fragmentation and anthropic disturbances on genetic diversity, genetic spatial structure and inbreeding in A. crassiflora and E. dysenterica. We collected leaves of 30 adult individuals in six populations of each species. Three populations were located in large, protected areas with no recent history of disturbances and three other populations in small, isolated areas with signs of anthropogenic disturbances. For the differentiation of the individuals we used 10 SSR markers already developed for araticum and 13 for cagaita developed in the thesis. With the genotyping data, we determined the polymorphism, heterozygosity and spatial genetic structure. All populations showed high polymorphism and genetic diversity. However, there were no significant differences between the control and degraded areas, nor was there a strong genetic structure in these areas. Degraded populations may not been affected due to the already high natural genetic diversity found in all populations studied or that there is still gene flow among degraded populations. In addition, it is possible that trees that existed prior to population reduction have been studied, thus reflecting a pre-degraded genetic diversity. Our results show that small and fragmented areas can maintain the in situ genetic diversity of A. crassiflora and E. dysenterica.

A família Euphorbiaceae é uma das maiores e mais diversificadas dentre as Angiospermas, predominam árvores e arbustos e está presente na maior parte do mundo. O gênero Manihot pertence à família Euphorbiaceae e sua origem é recente provavelmente data do mioceno e possível no sul do México. É um grupo que apresenta conjunto de cromossomos numericamente estável (2n=36). M. irwinii é uma espécie endêmica do estado de Goiás de distribuição disjunta e restrita ao cerrado rupestre e M. violacea pode ser encontrada nos estados de Goiás, Minas Gerais, Distrito Federal e Mato Grosso ocorrendo em cerrado rupestre e em outros tipos de formações campestres. A maioria dos estudos de diversidade genética no gênero são com a espécie Manihot esculenta (mandioca). Por isso é importante estudar a distribuição da variabilidade genética em populações de Manihot irwinii e Manihot violacea. Foram amostradas folhas de indivíduos de três localidades da espécie M. irwinii e outros três de M. violacea. Para a obtenção dos genótipos foram utilizados sete marcadores microssatélites desenvolvidos para Manihot esculenta e transferidos para M. irwinii e M. violacea. As seis populações foram genotipadas em analisador automático de DNA em dois sistemas multiplex. A espécie M. irwinii apresentou uma média 5,5 alelos por loco e uma diversidade moderada (He=0,446) e os valores de θ=0,241 e F=0,207 indicam alta estruturação genética entre as populações. Foi detectado para M. violacea média de 8,5 alelos por loco e uma diversidade moderada (He=0,478) e elevada divergência entre as populações de M. violacea (θ=0,420 e F=0,441). Para ambas as espécies o resultado do programa Structure contribui com esse resultado mostrando que há pouca mistura entre as populações que pode ser resultado de fluxo gênico restrito e possível atuação da deriva genética, já que os valores f global não foram significativos indicando que o sistema de cruzamento não é responsável pela alta estruturação das populações. As duas espécies que ocorrem no Parque Estadual da Serra dos Pireneus compartilham 23 alelos (M. irwinii: 76% e M. violacea: 79%), sendo que cinco alelos são exclusivos do Parque. A divergência entre as duas foi alta (θ=0,298) e menor do que encontrado entre as populações de M. violacea. É possivel que a alta porcentagem de alelos compartilhados seja vestígio de um fluxo histórico e que no presente exista uma barreira entre as espécies. The Euphorbiaceae family is one of the largest and most diverse of the Angiosperms, predominating trees and shrubs and is present in most of the world. The genus Manihot belongs to the family Euphorbiaceae and its origin is recent probably dates from the Miocene and possible in the south of Mexico. It is a group that presents a numerically stable set of chromosomes (2n=36). M. irwinii is an endemic species from the state of Goiás with a disjunct and restricted distribution to the rupestrian cerrado and M. violacea can be found in the states of Goiás, Minas Gerais, Distrito Federal and Mato Grosso occurring in cerrado rock and in other types of formations. Most studies of genetic diversity in the genus are with the species Manihot esculenta (cassava). That is why it is important to study the distribution of genetic variability in populations of two species Manihot irwinii and Manihot violacea. Leaves of individuals from three localities of the species M. irwinii and three others of M. violacea were sampled. To obtain the genotypes, seven microsatellite markers developed for Manihot esculenta and transferred to M. irwinii and M. violacea were used. The six populations were genotyped in an automatic DNA analyzer in two multiplex systems. The M. irwinii species presented a mean of 5,5 alleles per locus and a moderate diversity (He=0,446) and the values of θ=0.241 and F=0.207 indicated a high genetic structure among the populations. It was detected for M. violacea a mean of 8,5 alleles per locus and a moderate diversity (He=0,478) and high divergence among populations of M. violacea (θ=0.420 and F=0.441). For both species the result of the Structure program contributes with this result showing that there is little mixture between the populations that can be result of restricted genetic flow and possible action of the genetic drift, since the global f values were not significant indicating that the system of Is not responsible for the high structuring of populations. The two species that occur in the Serra dos Pireneus State Park share 23 alleles (M. irwinii: 76% and M. violacea: 79%), with five alleles being exclusive to the Park. The divergence between the two was high (θ=0.298) and lower than that found among populations of M. violacea. It is possible that the high percentage of shared alleles is trace of a historical flow and that at present there is a barrier between species. Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The main goal of any captive breeding program consists is maximizing the conservation of genetic diversity. Groups kept in captivity are particularly susceptible to the loss of genetic diversity, inbreeding depression and adaptation to captivity, due to their small size. The genetic characterization of wild and captive populations is an important tool both to minimize these impacts and for the conservation of these species, since it enables the development of management strategies aimed at maintenance of genetic diversity. In this context, the main objective of the study was to evaluate genetic variability and paternity for animals of black lion tamarin from Centro de Primatología do Rio de Janeiro, Fundacão Parque Zoológico de Sao Paulo, Parque Ecológico de Sao Carlos and 14 specimen belonging to the Durrell Conservation Trust in England using 15 microsatellite loci. The results of the allelic richness and expected heterozygosity showed similar values of alleles numbers and heterozygosity when compared with other species of Callitrichidae. Factorial correspondence analysis (FCA) showed greater homogeneity among captive animals than wild animals from Capão Bonito. The captive groups showed no differentiation among them and high differentiation from the wild Capão Bonito population. The data obtained herein are fundamental to increase the knowledge in genetic aspects of tamarins and support breeding programs to prevent loss of genetic diversity and inbreeding. Maximizar a conservação da diversidade genética é um dos principais objetivos de qualquer programa de reprodução em cativeiro. Por serem de pequeno tamanho, grupos mantidos em cativeiro são particularmente suscetíveis à perda de diversidade genética, depressão endogâmica e adaptação ao cativeiro. Na tentativa de minimizar tais impactos, a caracterização genética de populações de vida livre e de cativeiro, torna-se uma importante ferramenta para a conservação destas espécies, uma vez que possibilita o desenvolvimento de estratégias de manejo que visem à manutenção de níveis adequados de diversidade genética. Neste contexto o objetivo principal deste trabalho foi avaliar através de 15 loci microssatélites, os níveis de variabilidade genética e paternidade dos animais mantidos em cativeiro no Brasil, no Centro de Primatologia do Rio de Janeiro, Fundação Parque Zoológico de São Paulo, Parque Ecológico de São Carlos e 14 espécimenes que faziam parte do Durrell Conservation Trust na Inglaterra. Os resultados referentes à riqueza alélica e heterozigosidade esperada mostraram que há uma representação similar nos valores de alelos e heterozigosidade quando comparado com outras espécies de Calitriquídeos. A análise de correspondência fatorial (FCA) mostrou que os grupos em cativeiro do Brasil apresentaram maior homogeneidade, quando comparados a um grupo de vida livre proveniente da região de Capão Bonito (São Paulo) e aos 14 indivíduos que representam ao grupo em cativeiro do zoológico de Durrell. O alto grau de parentesco entre os animais em cativeiro evidencia baixa diferenciação entre os grupos pertencentes às diferentes instituições brasileiras estudadas. Os grupos de cativeiro do Brasil, no entanto, mostraram-se divergentes dos animais de Capão Bonito. As informações obtidas neste trabalho são fundamentais para aumentar o conhecimento sob aspectos genéticos dos micos-leões-pretos e subsidiar planos de reprodução assistida que visem minimizar a perda de diversidade genética e a endogamia.

This study analyzed the reproductive system and the pollen dispersion pattern of Qualea grandiflora progenies. This is a typical species from the Brazilian Cerrado about which there are not too many studies from the genetics point of view. The study was conducted in an area of 2.2 hectares located in the Conservation Unit managed by the Forest Institute of the state of São Paulo, Brazil (Assis State Forest). Total genomic DNA of 300 seeds from 25 plants (12 seeds from each plant) was extracted and amplified using specific primers to obtain microsatellite markers. Results showed that selfing is frequent among adults and progenies, and the species reproduces by outcrossing between related and unrelated individuals (0.913). The single-locus outcrossing rate was 0.632, which indicates that mating between unrelated individuals is more frequent than between related plants. The selfing rate was low (0.087), that is, the species is allogamous and self-fertilization is reduced. About 35% of the plants in the progenies were full-sibs, and about 57%, half-sibs. Besides, about 8% of the progenies were selfing siblings. The genetic differentiation coefficient within progenies was 0.139, whereas the fixation rate was about 27%. The estimate of the effective size revealed that the genetic representativeness of descent was lower than expected in random mating progenies: The analyzed samples corresponded to only 13.2 individuals of an ideal panmictic population. In environmental recovery programs, seeds, preferably from different fruits, should be collected from 95 trees to preserve the genetic diversity of the species. Este trabalho analisou o sistema reprodutivo e o padrão de dispersão de pólen em progênies de Qualea grandiflora Mart. É uma espécie típica do Cerrado brasileiro ainda pouco analisada do ponto de vista genético. A área de estudo possui 2,2 hectares e localiza-se em Unidade de Conservação administrada pelo Instituto Florestal do Estado de São Paulo (Floresta Estadual de Assis). Foram extraídas amostras de DNA genômico total de 300 sementes provenientes de 25 matrizes (12 sementes de cada matriz), as quais foram amplificadas utilizando iniciadores específicos para obtenção de marcadores microssatélites. Os resultados indicaram que adultos e progênies possuem taxa de endogamia elevada e a espécie se reproduz por cruzamentos entre indivíduos parentes e não aparentados (0,913). A taxa uniloco foi de 0,632, indicando que há mais cruzamentos entre não parentes do que entre parentes. A taxa de autofecundação foi baixa (0,087), ou seja, a espécie é alógama, com pouca pré-disposição para autofecundação. Aproximadamente, 35% das plantas dentro de progênies eram parentes no grau de irmãos-completos e cerca de 57%, de meios-irmãos. Além disso, aproximadamente 8% das progênies eram irmãos de autofecundação. O coeficiente de coancestria estimado nas progênies foi 0,139, enquanto o índice de fixação, de aproximadamente 27%. A estimativa do tamanho efetivo indicou que a representatividade genética da descendência é inferior à esperada em progênies de cruzamentos aleatórios: as amostras analisadas correspondem a apenas 13,2 indivíduos de uma população panmítica ideal. A coleta de sementes para uso em programas de recuperação ambiental precisa ser realizada em 95 árvores e, de preferência, de frutos distintos, para manter a diversidade genética da espécie.

A Floresta Atlântica vem sendo afetada por ações antrópicas ao longo no tempo e ainda continua sofrendo com essas ameaças. A fragmentação florestal ocasionada pelo desmatamento e o corte seletivo de espécies arbóreas contribui significativamente para a perda de diversidade genética nas populações naturais. Anadenanthera peregrina é uma espécie arbórea de grande porte e está sob efeito da fragmentação e corte seletivo. Análises genéticas a nível populacional são importantes para direcionar estratégias conservacionistas. Neste trabalho foi avaliada a diversidade genética de uma amostra populacional de trinta e cinco indivíduos de A. peregrina utilizando marcadores SSR. As análises permitiram dizer que a população não é endogâmica, provavelmente pelo fato da espécie ser predominantemente auto incompatível predominando a fecundação cruzada. A diversidade genética foi inferior a outros trabalhos com a mesma espécie, possivelmente pelo histórico da área. As árvores amostradas podem servir como fonte de sementes para produção de mudas destinadas ao reflorestamento.

A abelha sem ferrão Melipona subnitida atualmente está presente em quase toda a região nordeste, em função da boa adaptabilidade ao semiárido nordestino e do potencial econômico-ecológico proporcionado pela produção de mel e pela polinização de cultivos em condições de confinamento. Apesar disso, é uma espécie ameaçada devido a processos de degradação ambiental, dentre os quais estão o desmatamento, o uso indiscriminado de agrotóxicos e o extrativismo. Tais interferências tendem a isolar as populações de Jandaíra, provocando uma queda na variabilidade genética e, consequentemente, uma redução na capacidade adaptativa da espécie. Porém, técnicas de biologia molecular estão sendo implementadas, possibilitando que populações desse tipo sejam avaliadas quanto ao seu grau de variabilidade genética. Marcadores moleculares do tipo microssatélites de DNA vêm sendo bastante usados, porém, em função do alto custo exigido para seu desenvolvimento, diversos estudos vêm empregando microssatélites transferidos de táxons próximos com amplo sucesso em estudos voltados à caracterização e à diversidade genética. Dessa forma, a presente revisão objetivou avaliar os mais relevantes aspectos bioecológicos e genético-comportamentais envolvidos na conservação da abelha Jandaíra, a fim de auxiliar na avaliação do grau de diversidade genética da espécie, bem como da sua distribuição entre indivíduos e populações da abelha sem ferrão M. subnitida.

A abelha sem ferrão Melipona subnitida atualmente está presente em quase toda a região nordeste, em função da boa adaptabilidade ao semiárido nordestino e do potencial econômico-ecológico proporcionado pela produção de mel e pela polinização de cultivos em condições de confinamento. Apesar disso, é uma espécie ameaçada devido a processos de degradação ambiental, dentre os quais estão o desmatamento, o uso indiscriminado de agrotóxicos e o extrativismo. Tais interferências tendem a isolar as populações de Jandaíra, provocando uma queda na variabilidade genética e, consequentemente, uma redução na capacidade adaptativa da espécie. Porém, técnicas de biologia molecular estão sendo implementadas, possibilitando que populações desse tipo sejam avaliadas quanto ao seu grau de variabilidade genética. Marcadores moleculares do tipo microssatélites de DNA vêm sendo bastante usados, porém, em função do alto custo exigido para seu desenvolvimento, diversos estudos vêm empregando microssatélites transferidos de táxons próximos com amplo sucesso em estudos voltados à caracterização e à diversidade genética. Dessa forma, a presente revisão objetivou avaliar os mais relevantes aspectos bioecológicos e genético-comportamentais envolvidos na conservação da abelha Jandaíra, a fim de auxiliar na avaliação do grau de diversidade genética da espécie, bem como da sua distribuição entre indivíduos e populações da abelha sem ferrão M. subnitida. The stingless bee Melipona subnitida is now present almost everywhere in the Brazilian Northeastern, as a consequence of its good adaptability to the semiarid and economic and ecological potential offered by the honey production and pollination of commercial crops under confined conditions. Nevertheless, it is an endangered species due to environmental degradation processes, among which are: deforestation, indiscriminate use of pesticides and honey extraction. Such interference tends to isolate populations of Jandaíra causing a decrease in genetic variability, and therefore a reduction in the adaptive capacity of the species. However, advanced Molecular Biology techniques have been used allowing such populations to be assessed for their degree of genetic variability. Molecular markers such as microsatellite DNA are widely applied to genetic diversity studies. However, due to the high costs required for their development, several studies have been focused on the use of microsatellites transferred from closely related taxa with much success in studies on the genetic characterization of species and their populations. Therefore, this review aimed to evaluate the most relevant ecological and behavioral aspects in order to assist the population genetic studies of the stingless bee M. subnitida.

A forte demanda por madeira nobre impulsiona o corte seletivo de árvores e a degradação das florestas brasileiras. Devido ao extrativismo predatório, o mogno brasileiro (Swietenia macrophylla) encontra-se em risco de extinção e proibido de corte pelo IBAMA. Uma alternativa ao extrativismo e às tentativas fracassadas de plantios do mogno brasileiro é o mogno africano (Khaya ivorensis). A Universidade Federal Goiás em parceria com a empresa Mudas Nobres iniciaram pesquisas para melhoramento genético do K. ivorensis. O objetivo do presente trabalho foi estimar a diversidade e a divergência genética em 53 árvores superiores selecionada no âmbito desse programa de melhoramento. Os clones foram selecionados em três populações diferentes, plantadas em fazendas no estado do Pará a partir de populações da Costa do Marfim e Tanzânia na Africa. Foram utilizadas 12 árvores de Khaya senegalensis como um grupo controle nas análises de divergência genética. Os genótipos dos indivíduos foram obtidos com oito locos microssatélites, desenvolvidos para K. senegalensis, através de eletroforese capilar na plataforma ABI- 3100 (Applied Biosystems). O programa GeneMapper (Applied Biosystems) foi utilizado para determinar os alelos. Todos os locos foram 100% polimórficos, com número médio de alelos por loco de 5,875. A heterozigosidade esperada média foi menor (HE = 0,563) que a heterozigosidade observada média (HO = 0,738). Com isso, o índice de fixação médio intrapopulacional foi estimado em f = -0,314, indicando que a depressão por endogamia pode estar diminuindo a frequência de homozigotos quando comparado com o que seria esperado sob Equilíbrio de Hardy-Weinberg. Já o índice de fixação médio entre as populações foi estimado em θ = 0,008, indicando que somente 0,8% da variabilidade genética está estruturada entre as populações. O dendograma gerado a partir da matriz de distância genética de Rogers demonstrou dois grupos bem distintos, separando o grupo controle com K. senegalensis do restante das árvores de K. ivorensis. O grupo composto pelos K. ivorensis apresentou fraca consistência entre os nós, nos bootstraps, evidenciando a pequena diferenciação genética entre as árvores selecionadas. A falta de estruturação foi confirmada por uma abordagem Bayesiana com o programa Structure. A população de melhoramento possui diversidade genética comparável com a de populações naturais de mogno africano e mogno brasileiro. Os resultados de distância genética entre os clones, estimados neste trabalho, serão utilizados para escolha de genitores divergentes em futuros cruzamentos. The strong demand for hardwood drives selective logging and degradation of forests ecossystems in Brazil. Due to its wood value and predatory logging, Brazilian mahogany (Swietenia macrophylla) is at risk of extinction. Currently, its trees are protected and banned from logging by the Brazilian Institute of Environment (IBAMA). Monoculture of the Brazilian mahogany is proven unsuccessful due to the attack of the Hypsipyla grandella larvae. An alternative to Brazilian mahogany plantation is the African mahogany (Khaya ivorensis), a species with similar high valued wood properties. The Universidade Federal de Goiás in partnership with Mudas Nobres Company started a breeding program with Khaya ivorensis. The objective of this study was to evaluate the genetic diversity and divergence among 53 superior trees selected and cloned as part of the breeding strategies. Clones were selected from three different populations, planted in two farms in Pará state and originating from Ivory Coast and Tanzania populations. Twelve seedlings of Khaya senegalensis were also used as a control group in the analyses of genetic divergence. The individuals were genotyped with eight microsatellite loci developed for K. senegalensis, by capillary electrophoresis on the ABI-3100 (Applied Biosystems) platform. The software GeneMapper (Applied Biosystems) was used to genotype the alleles. The average number of alleles per locus was 5.875. The average expected heterozygosity was lower (HE = 0.563) than the average observed heterozygosity (HO = 0.738). Therefore, the average intrapopulation fixation index was negative (f = - 0.314) indicating that high inbreeding depression is decreasing the frequency of homozygous when compared to what would be expected under Hardy-Weinberg Equilibrium. The average fixation index between populations was estimated at θ = 0.008, indicating that only 0.8% of the genetic variability is due to differences between populations. The dendrogram generated from the matrix of Rogers’ genetic distance showed two distinct groups, separating the control group with K. senegalensis from the K. ivorensis selected trees. The group composed of K. ivorensis had nodes with weak bootstrap consistency indicating weak genetic structure among selected trees. The lack of genetic structure was confirmed by a Bayesian approach on the Structure (version 2.3.4) program. The genetic diversity observed within the selected breeding population is comparable to that of natural populations of African and Brazilian mahoganies. The genetic distance estimated with this work will guide the selection of divergent progenitors to be crossed. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

O Cerrado apresenta uma grande diversidade e possui a mais rica e endêmica flora do mundo, abrigando cerca de 12.000 espécies de plantas nativas. A família Myrtaceae está entre as 10 famílias representativas deste bioma, composta por 14 gêneros. Dentre estes, o gênero Campomanesia apresenta várias espécies frutíferas, conhecidas popularmente como gabiroba. As espécies Campomanesia adamantium e Campomanesia pubescens apresentam ampla ocorrência no Bioma Cerrado. Os seus frutos podem ser consumidos “in natura”, na forma de doces, sorvetes, refrescos e como flavorizantes em destilados alcoólicos, além de possuírem propriedades antidiarréicas, suas cascas e suas folhas são usadas sob a forma de chás. Sua exploração ocorre por extrativismo e, também, pode ser cultivada em pequenos pomares familiares, sendo uma fonte de renda extra para algumas famílias. Desta forma o estudo da diversidade genética e estrutura genética de populações aliados com outras áreas do conhecimento, pode fornecer informações importantes para o planejamento e execução de programas de conservação de espécies nativas. Atualmente, os marcadores moleculares têm ampla aplicação para estudos referentes à genética de populações. Dentre os tipos de marcadores utilizados, os microssatélites têm sido amplamente utilizados nos últimos anos, pelo alto poder de detecção da variabilidade genética. Estudos genéticos-populacionais com espécies do gênero Campomanesia sp. são escassos e não foram encontrados marcadores microssatélites disponíveis na literatura para nenhuma espécie do Cerrado. Nesse contexto, a proposta deste trabalho foi testar o potencial de tranferibilidade de marcadores microssatélites provinientes de regiões gênicas (EST) desenvolvidos para Eucalyptus sp., em duas espécies de Campomanesia (C. adamantium e C. pubescens), disponibilizando um painel de marcadores polimórficos para as espécies. Para tanto, foram amostradas duas populações de cada espécie e o DNA foi extraído a partir de tecido foliar. Foi avaliado o potencial de transferibilidade de 120 pares primers. Os produtos de PCR derivados dos marcadores microssatélites transferidos foram avaliados em analisador automático de DNA. A matriz de genótipos foi utilizada para estimar os parâmetros de variabilidade genética para o painel de marcadores. Dos 120 primers testados, 87 foram descartados por não apresentarem produtos de amplificação, 22 amplificaram muitos fragmentos inespecíficos e 12 foram considerados transferidos com sucesso para as duas espécies. Os 12 marcadores transferidos apresentaram bom poder de discriminação individual, com alta probabilidade de exclusão de paternidade (0,99939 para C. adamantium e 0,99982 para C. pubescens) e baixa probabilidade de identidade (5,718 x 10-10 para C. adamantium e 1,182 x 10-11 para C. pubescens). O número médio de alelos nos locos polimórficos foi igual a 6,8 para C. adamantium, variando entre 2 (EMBRA 1335 e EMBRA 1811) a 16 (EMBRA 1364) e em C. pubescens foi de 7,8 variando entre 2 (EMBRA 1811 e EMBRA 1076) a 16 (EMBRA 2011) alelos por loco. A média da diversidade genética de Nei (1973) nas populações foi igual a 0,517 (C. adamantium) e 0,579 (C. pubescens). A heterozigosidade média observada (Ho) para as populações foi igual a 0,505 (C. adamantium) e 0,503 (C. pubescens). Para alguns marcadores foi observado desvios para as proporções esperados para o equilíbrio Hardy-Weinberg. As estimativas de endogamia intrapopulacional (f) não foram significativas para nenhuma das populações. A endogamia total (F) foi significativamente diferentes de zero, sugerindo certa estruturação da variabilidade genética das populações. A estruturação da variabilidade genética no componente entre populações (θp) foi igual a 0,105 (C. adamantium) e 0,249 (C. pubescens). The Savanna is highly diverse and has the richest flora and endemic in the world, comprising about 12,000 species of native plants. The family Myrtaceae is among the 10 families representative of this biome, comprising 14 genera. Among these, gender Campomanesia has several fruit species, known popularly as gabiroba. The species Campomanesia adamantium and Campomanesia pubescens have widespread occurrence in the Savanna. Its fruits can be consumed " in nature ", in the form of candy, ice cream , soft drinks and as flavoring in alcoholic distillates, besides having antidiarrheal properties, its bark and leaves are used in the form of teas. His exploration is by extractivism and can also be grown in small family orchards, being a source of extra income for some families. Thus, the study of genetic diversity and genetic structure of populations’ allies with other areas of knowledge can provide important information for planning and execution of native species conservation programs information. Currently, molecular markers have wide application for studies on the genetics of populations, among the types of markers used; microsatellites have been widely used in recent years by high power to detect genetic variability. Population - genetic studies of the genus Campomanesia sp. are scarce and so not found microsatellite markers available in the literature for any species of the Savanna o. In this context, the aim of this study was to test the potential for transferability of microsatellite markers derived gene regions (EST) developed for Eucalyptus sp., Campomanesia in two species (C. adamantium and C. pubescens), providing a panel of polymorphic markers for the species. To do so, we sampled two populations of each species and DNA was extracted from leaf tissue. The potential for transferability of 120 primers pairs were evaluated. The PCR products derived from the microsatellite markers were assessed in automatic transferred DNA analyzer. The array of genotypes was used to estimate the parameters of genetic variability for the panel of marker. Of the 120 primers tested, 87 were discarded for not having amplification products, many nonspecific fragments amplified 22 and 12 were considered successfully transferred the two species. The 12 markers transferred showed good discrimination power of the individual , with high probability of paternity exclusion (0,99939 to C. adamantium and 0,99982 for C. pubescens) and low probability of identity (5,718 x 10-10 for C. adamantium and 1,182 x 10-11 to C. pubescens). The average number of alleles at polymorphic loci was equal to 6,8 to C. adamantium, ranging from 2 (EMBRA1335 and EMBRA 1811) 16 (EMBRA 1364) and C. pubescens was 7,8 ranging from 2 (EMBRA1811 and EMBRA 1076) to 16 (EMBRA 2011) alleles per locus. Mean genetic diversity of Nei (1973) in populations was equal to 0,517 (C. adamantium) and 0,579 (C. pubescens). Mean observed heterozygosity (Ho) for the populations was equal to 0,505 (C. adamantium) and 0,503 (C. pubescens). For some markers for deviations expected for the Hardy-Weinberg equilibrium was observed due proportion’s estimates of intrapopulation inbreeding (f) were not significant for any population. Inbreeding full level (F) was significantly different from zero, suggesting some genetic variability structure populations. The structure of genetic variability in component among populations (θp) was equal to 0,105 (C. adamantium) and 0,249 (C. pubescens).

Os padrões de distribuição da variabilidade genética dentro e entre subpopulações são importantes a fim de conhecer a atuação dos processos evolutivos, para a adoção de estratégias eficazes de conservação e uso de recursos genéticos vegetais. A estrutura genética populacional está relacionada com a forma como a variabilidade genética está distribuída dentro e entre as subpopulações. Os marcadores microssatélites são especialmente úteis para tais análises por serem altamente informativos. O Baru (Dipteryx alata Vogel), pertence à família Fabaceae e apresenta ampla distribuição no bioma Cerrado e um grande potencial para o uso na culinária local, ornamental e medicinal, sendo um importante recurso genético vegetal. Este estudo teve como objetivo avaliar a estrutura genética entre subpopulações de D. alata que constituem uma coleção de germoplasma, mantida pela Escola de Agronomia da Universidade Federal de Goiás. A coleção consiste de 600 indivíduos de 150 progênies de 25 subpopulações provenientes de diferentes regiões do bioma Cerrado. Foram utilizados nove pares de primers, oito desenvolvidos para a espécie D. alata e um desenvolvido e transferido de Phaseolus vulgaris para a análise molecular. Foram observados entre 2 e 14 alelos, com média de 5,5 alelo por loco. O valor médio de heterozigosidade observada foi igual a 0,340 e variou de 0,102 (DaE06) a 0,711 (DaE41). A heterozigosidade esperada, sob a condição de equilíbrio de Hardy-Weinberg, foi igual a 0,383, variando entre 0,162 (DaE06) e 0,809 (DaE41). A analise de estrutura genética populacional apresentou um nível de parentesco médio entre indivíduos de uma mesma progênie (θs) de 0,169, o que equivale ao parentesco esperado para uma mistura de meio-irmãos e irmãos completos. A partir do valor de θs, pode-se concluir que há uma alta diferenciação genética entre as progênies. Quando avaliadas as subpopulações, foi encontrado um valor estimado de θp igual a 0,097, sugerindo que existe uma moderada estruturação genética. O valor do índice de fixação intrapopulacional global (f=0,122) indicou a presença de baixa endogamia nas subpopulações que compõem a coleção de germoplasma. A estimativa da taxa de fecundação cruzada aparente (ta) teve valor igual a 0,78. O valor global de F foi significativo e igual a 0,27. A análise de estrutura genética populacional revelou presença de estruturação genética entre subpopulações e entre progênies dentro de subpopulações. Isso revela que a coleção de germoplasma de baru apresenta diversidade genética entre e dentro de populações, indicando que as estratégias de conservação devem considerar os dois níveis. The distribution patterns of genetic variability within and among subpopulations are important to know the performance of evolutionary processes, to adopt effective conservation strategies and to use genetic plant resources. The population genetic structure is focused on how the genetic variability is distributed within and between subpopulations. Microsatellite markers are especially useful for such analyzes because are highly informative. The Baru (Dipteryx alata Vogel), belongs to the Fabaceae family and is widely distributed in the Cerrado biome, also has a great potential for use in local cooking, as ornamental plant and in popular medicine, so being an important genetic resource plant. This study aimed to evaluate the genetic structure among subpopulations of D. alata which constitute a germplasm collection, maintained by the Escola de Agronomia, of the Universidade Federal de Goiás. The collection consists of 600 individuals from 150 progenies of 25 subpopulations from different regions of Cerrado biome. Nine pairs of primers were used, eight developed for the species D. alata and one developed and transferred from Phaseolus vulgaris for molecular analysis. The number of alleles ranged from 2 to 14 alleles, with an average of 5.5 allele per locus. The average of observed heterozygosity was equal to 0.340 and ranged from 0.102 (DaE06) to 0.711 (DaE41). The expected heterozygosity, under the condition of Hardy-Weinberg equilibrium was equal to 0.383, ranging from 0.162 (DaE06) and 0.809 (DaE41). The analysis of population genetic structure showed a level of medium relatedness between individuals of the same progeny (θs) of 0.169, which is equivalent to that kinship expected for a mixture of half-sibs and full sibs. From the value θs, it can be concluded that there is a high genetic differentiation between the progenies. When evaluated the subpopulations was found an estimated θp equal to 0.097, suggesting that there is a moderate genetic structure. The value of overall intrapopulation fixation index (f=0.122) indicated the presence of low inbreeding in subpopulations that composes the collection of germplasm. The estimated apparent outcrossing rate (ta) value was equal to 0.78. The overall F value was significant and equal to 0.27. The analysis of population genetic structure revealed the presence of genetic structure among subpopulations and among progenies within of the subpopulations. This reveals that the germplasm collection of D. alata presents genetic diversity within and among populations, indicating that the conservation strategies should consider both levels. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

CAPES Culex quinquefasciatus é vetor de muitos agentes etiológicos de doenças humanas, incluindo Wuchereria bancrofti, o parasita que causa a filariose linfática, uma doença endêmica no Estado de Pernambuco (PE), Brasil. A elevada densidade deste mosquito pode causar problemas secundários que têm impacto na saúde e qualidade de vida das pessoas expostas; por isso, o controle desta espécie é importante. O objetivo do trabalho foi identificar se existem e quais são os mecanismos de resistência a inseticidas químicos e a diversidade genética de populações naturais de Culex quinquefasciatus coletadas em PE. As avaliações foram feitas por meio de bioensaios, ensaios bioquímicos para mensurar a atividade das enzimas de detoxificação e ensaios moleculares para estimar a frequência da mutação presente no gene da acetilcolinesterase (ace-1), associada à resistência a organofosforados (OPs) e carbamatos (CMs). A diversidade genética das populações foi avaliada utilizando 16 marcadores microssatélites. Ovos de Culex foram coletados em seis municípios de PE: Olinda (Peixinhos e Alto da Conquista), Recife (Água Fria), Jaboatão dos Guararapes, Ipojuca, Glória do Goitá e Santa Cruz do Capibaribe. Os resultados mostraram que apenas a população proveniente de Santa Cruz do Capibaribe (SC) apresentou alteração na susceptibilidade (RR = 7,2 vezes), com nível de resistência moderado ao temephos, enquanto as outras populações analisadas não mostraram alteração na susceptibilidade ao inseticida. Quanto aos testes bioquímicos, apenas em SC foi observado um aumento na atividade de todas as esterases estudadas e indícios de insensibilidade da acetilcolinesterase. A frequência da mutação G119S no alelo de resistência ace-1 (G119S) foi de 0,11 em SC e zero nas outras populações. O número de alelos por locus variou entre 2 e 15. Alguns desses alelos foram exclusivos de algumas localidades. O percentual de variabilidade genética encontrado foi maior dentro das populações do que entre as populações e os resultados indicam excesso de heterozigotos. Estes dados mostram que embora não haja programas nacionais para o controle de Culex, esta espécie apresenta mecanismos de resistência que estão sendo mantidos em populações naturais como um resultado da exposição acidental ao inseticida, o que poderia prejudicar as ações de controle que podem ser implantadas no futuro.

Pilosocereus gounellei is common in Semiarid region, which is under the dominion geoecológico Caatinga biome, where it is popularly known as xiquexique. The objective of the present study was to evaluate the genetic diversity and similarity at the DNA level of P. gounellei among samples from the Piauí, Bahia e Rio Grande do Norte States. For the characterization of microsatellite markers were assessed 33 pairs of microsatellite primers developed for different species of cactaceae. Five pairs of microsatellite primers developed for Astrophytum asterias, Polaskia chichipe and Echinocactus grusonii, were selected resulting a 24.24% transferability of these primers for P. gounellei. The polymorphism to average of samples of P. gounellei was 73.05%, the evaluated loci showed 18 alleles, with an average of 3.6 alleles per locus. Seven primer pairs used amplified 703 AFLP markers, of which 700 (99.21%) were polymorphic. The percentage of polymorphic fragments ranged from 95.3% for the primer combination E-AAG/M-CTT to 100% for E-ACC/M-CAT, E-ACC/M-CAA, EAGC/M-CAG, E-ACT/M-CTA, E-ACT/M-CTA e E-AGG/M-CTG. The largest number of informative markers (126) was detected using the primer combination E-AAC/M-CTA, while the E-AAG/M-CTT combination revealed the lowest number of polymorphic fragments (48). Nei's gene diversity was 0.3064. The low value of GST (0.1353) and high amount of gene flow (3.1968) indicate that the genetic differentiation within populations of the three states is higher than among the populations of the three states. In the dendrogram based on the Jaccard similarity coefficient, the samples were divided into two groups. Our results demonstrated that AFLP markers were efficient to genetic characterization in the samples P. gounellei. SSR and AFLP techniques can be applied to estimate the genetic diversity and genetic structure this species. A espécie Pilosocereus gounellei é comum no semiárido nordestino, região sob domínio geoecológico do bioma Caatinga, onde ela é popularmente conhecida como xiquexique. O objetivo do presente trabalho foi estimar a diversidade e similaridade genética em amostras de populações de P. gounellei dos estados do Piauí, Bahia e Rio Grande do Norte, usando as técnicas de marcadores moleculares SSR e AFLP. Para a seleção de marcadores microssatélites, foram avaliados 33 pares de primers microssatélites desenvolvidos para diferentes espécies de cactáceas. Desta avaliação, foram selecionados oito loci microssatélites desenvolvidos para Astrophytum asterias, Polaskia chichipe e Echinocactus grusonii, conferindo uma transferibilidade de 24,24% destes primers para P. gounellei. O polimorfismo médio para as 17 amostras de P. gounellei foi de 73,05%; os loci avaliados apresentaram 18 alelos, com uma média de 3,6 alelos por locus. As sete combinações de primers AFLP geraram 703 fragmentos, dos quais 700 (99,21%) foram polimórficos entre as 21 amostras analisadas. A porcentagem média de loci polimórficos entre as combinações utilizadas variou de 95,3%, para a combinação E-AAG/M-CTT, a 100% para as combinações E-ACC/M-CAT, E-ACC/M-CAA, EAGC/M-CAG, E-ACT/M-CTA, E-ACT/M-CTA e E-AGG/M-CTG. O maior número de loci informativos (126) foi detectado com a combinação E-AAC/M-CTA, enquanto a combinação E-AAG/M-CTT revelou o menor número de bandas informativas (48). O baixo valor do GST (0,1353) e o alto valor de fluxo gênico (3,1968) indicam que a diferenciação gênica dentro das populações dos três estados é maior do que entre as populações dos três Estados. No dendrograma baseado no coeficiente de similaridade de Jaccard, as amostras foram distribuídas em dois grupos. O estudo demonstrou que as técnicas SSR e AFLP podem ser aplicadas para estimar a diversidade genética e verificar como as populações da referida espécie estão geneticamente estruturadas. xvi, 107 f

Financiadora de Estudos e Projetos The destruction of ecosystems and their fragmentation are major environmental problems, being biodiversity conservation one of biggest challenges today .These processes result in the reduction and isolation of populations, threatening the fauna and flora, since in this situation as their populations become more susceptible to negative effects caused by a series of environmental, demographic and genetic factors. Therefore, is necessary to consider the biodiversity in all its levels, from the genetic level, to the species and ecosystem for effective actions in conservation. To assist in conservation programs, conservation genetics uses molecular methods in studies of patterns of genetic variation, indicating not only which species deserve greater efforts in conservation, but also contributing to the assessment of the variability of a population. This study evaluated the genetic diversity and structure of the marsupial Didelphis albiventris at the Morro do Diabo State Park and six adjacent forest fragments. We utilize a set of eight polymorphic microsatellite loci developed for the specie D. virginiana, for a total of 120 individuals sampled. The results indicated high levels of genetic diversity, with values equal to 10,87 alleles per locus, observed heterozygosity of 0,823 and heterozygosity expected of 0,798. We did not detect presence of null alleles. The average value of Fis was -0,033 and all loci were in Hardy-Weinberg equilibrium. Analyses on the population structure through calculations of FST indicated a slight structure in the populations sampled, which was corroborated by the program STRUCTURE, which indicated the existence of four populations. Given these results, we believe that in the area sampled, D. albiventris constitutes a metapopulation. A destruição dos ecossistemas e sua fragmentação representam grandes problemas ambientais, sendo a conservação da biodiversidade um dos maiores desafios da atualidade. Tais processos resultam na redução e isolamento das populações, podendo colocar em risco a fauna e a flora, já que nesta situação suas populações tornam-se mais suscetíveis aos efeitos negativos de uma série de fenômenos ambientais, demográficos e genéticos. Diante disso, para que ações efetivas de conservação sejam realizadas é necessário considerar a biodiversidade em todos os seus níveis, desde o nível genético, até o de espécies e de ecossistema. Para auxiliar nos programas de conservação, a Genética da Conservação utiliza métodos moleculares em estudos de padrões de variação genética, indicando não apenas quais espécies merecem maiores esforços de preservação, mas também contribuindo para a avaliação da viabilidade de uma população. Este estudo avaliou a diversidade e estrutura genética do marsupial Didelphis albiventris no Parque Estadual do Morro do Diabo e em fragmentos de Mata Atlântica adjacentes. Para isso, utilizamos um conjunto de oito locos microssatélites polimórficos desenvolvidos para a espécie D. virginiana, em um total de 120 indivíduos amostrados. Os resultados indicaram altos índices de diversidade genética, com valores médios iguais à 10,87 alelos por loco, heterozigosidade observada de 0,823 e esperada de 0,798. Não foi detectada a presença de alelos nulos. O valor médio de FIS foi -0,033, e todos os locos estavam em equilíbrio de Hardy-Weinberg. Análises sobre a estruturação populacional através dos cálculos de FST indicaram uma leve estruturação entre a maioria das populações amostradas, o que foi corroborado através da utilização do programa STRUCTURE, o qual apontou a existência de 4 agrupamentos genéticos. Diante destes resultados, acreditamos que na área amostrada, D. albiventris constitui uma metapopulação.

The potato crop has a very narrow genetic base, so the use of molecular markers is a very important tool in the characterization of germplasm banks and evaluation of genetic divergence. The objective of this study was to identify, using microsatellite or simple sequence repeat (SSR) markers, 38 accessions of potato from two collections of commercial cultivars. For the molecular characterization 10 loci were used, generating a total of 46 alleles, which were analyzed as binary data. A cluster analysis was performed with the Jaccard´s similarity coefficient and the UPGMA method, using the software NTSYSpc. On average, the number of alleles per locus was 4.6, ranging from two alleles for primers STM1049, STM 1053 and STM 1104 to 12 alleles per locus for primer STM0019a. Of the 46 alleles, only five were monomorphic, therefore presenting 89.1% polymorphism. The polymorphism information content (PIC) varied from 0.13 to 0.86, with an average of 0.54. The Jaccard´s coefficient varied from 0.41 to 0.93, showing high genetic variability among accessions. Two possible duplicates [Atlantic (Canada) and Atlantic (Chile), and Colorado and Ágata (EPAMIG) (duplicates with these SSRs, which did not separate them)] were identified. High similarity was also shown by cultivars Chipie and Melodie (EPAMIG), Voyager and Gourmandine (EPAMIG), Eole and Caesar (EPAMIG), and Cupido and Santé (Pirassu). The most genetically divergent accessions (Lady Rosetta and HPC-7B) were also identified. A batata possui uma base genética estreita, sendo assim a utilização de marcadores moleculares é uma ferramenta muito importante no processo de caracterização de bancos de germoplasma e avaliação de divergência genética. O objetivo deste trabalho foi avaliar por meio de marcadores microssatélites ou Simple Sequence Repeats (SSR), 38 acessos de batata de duas coleções distintas contendo cultivares comerciais. Para a caracterização molecular foram analisados 10 loci, gerando um total de 46 alelos, os quais foram analisados como dados binários. Foi obtida uma matriz de similaridade utilizando o coeficiente de Jaccard e com o método aglomerativo UPGMA foi realizada uma análise de agrupamento pelo software NTSYSpc. Em média, o número de alelos por loco foi 4,6, variando de dois alelos para os iniciadores STM1049, STM1053 e STM1104 até 12 alelos por loco para o iniciador STM0019a. Dos 46 alelos identificados, apenas cinco foram monomórficos, observando-se, portanto, 89,1% de polimorfismo. O conteúdo de informação de polimorfismo (PIC) variou de 0,13 a 0,86, com média de 0,54. O coeficiente de similaridade de Jaccard variou de 0,41 a 0,93, mostrando a grande variabilidade genética entre os acessos. Observaram-se duas possíveis duplicatas [Atlantic (Canadá) e Atlantic (Chile), e Colorado e Ágata (EPAMIG) (duplicatas com estes SSRs, que não as separaram)]. Elevada similaridade foi também observada pelas cultivares Chipie e Melodie (EPAMIG), Voyager e Gourmandine (EPAMIG), Eole e Caesar (EPAMIG), e Cupido e Santé (Pirassu). Foram identificados também os acessos mais distantes geneticamente (Lady Rosetta e HPC-7B).

Molecular markers are powerful tools for analyzing genome diversity within a species, and to evaluate genetic relationships between individuals and populations. Among them, microsatellites (SSRs) are one of the most important polymorphic markers that can be used effectively to distinguish germplasm accessions. These markers present high informative content due to their codominant inheritance, multiallelism, mendelian pattern and good genome coverage. The enrichment methodology for microsatellite development has a superior efficiency in plants, especially when performed using biotin-labeled microsatellite oligoprobes and streptavidin-coated magnetic beads. The development of EST-SSR markers has become a fast and relatively inexpensive way but it is limited to species for which this type of database exists. Given the high polymorphism level of microsatellites when compared to other markers, SSRs have been used to study population structure, for genetic diversity analysis, genetic mapping and marker assisted selection. Marcadores moleculares são ferramentas auxiliares nas análises da diversidade genômica dentro de uma espécie e para avaliar os relacionamentos entre indivíduos e populações. Dentre eles, os microssatélites (SSRs) é uma das classes de marcadores mais importante que pode ser usada com eficiência para distinguir acessos provenientes de um banco de germoplasma. Estes marcadores apresentam elevado grau de informação devido a sua herança co-dominante, multialelismo, padrão mendeliano e boa cobertura do genoma. A metodologia de enriquecimento para o desenvolvimento de microssatélites apresenta uma eficiência superior em plantas, especialmente quando se utiliza sondas marcadas com biotina e esferas magnéticas revestidas com estreptavidina. O desenvolvimento de EST-SSRs tem se tornado uma forma rápida para obtenção de marcadores moleculares, porém limitada a espécies para as quais existam bancos de sequências. Dado o elevado nível de polimorfismo dos microssatélites quando comparados com outros marcadores, estes têm sido utilizados em estudos da estrutura genética de populações, em análises de diversidade genética, em mapeamento genético e em seleção assistida por marcadores.

This study was carried out in order to assess the genetic diversity of 20 cassava (Manihot esculenta Crantz) genotypes with high phenotypic performance using microsatellite markers. Two groups were considered for this study: eleven varieties for industrial uses and nine for household consumption. By using nine microsatellite primers, high polymorphism was identified in all the loci analyzed, with values reaching 100%. On average, 3.4 alleles per locus were found, with 0.371 the value estimated for the observed heterozygosity and 0.555 for gene diversity for the entire set of varieties. The genetic variability found in both varieties, cultivated on a large-scale in the South Center region of Brazil, is wide enough to allow the choice of divergent parental genotypes to be used in crosses to obtain new recombinant genotypes. Furthermore, the analyses indicated a high genetic variability within the two groups (I: varieties for industrial uses; II: varieties for household consumption). However, varieties for household consumption attain higher genetic variability, probably due to high priority placed on selection of different sensorial traits. In the cluster analysis, a tendency for separation of varieties for industrial use and household consumption was verified. Our results represent an important source of information to the cassava breeding program in Brazil. Este estudo teve como objetivo avaliar a diversidade genética de 20 genótipos de mandioca (Manihot esculenta Crantz) com alto desempenho fenotípico, utilizando marcadores microssatélites. Foram considerados dois grupos: onze variedades para fins industriais e nove variedades de mesa. A partir de nove iniciadores foi identificado alto polimorfismo para todos os locos analisados, atingindo valores de 100%. Em média, foram encontrados 3,4 alelos por loco, sendo 0,371 o valor estimado para a heterozigosidade observada e 0,555 para a diversidade gênica, no conjunto total de variedades comerciais avaliadas. A variabilidade genética observada em ambos os grupos de variedades, cultivadas em larga escala na Região Centro-Sul do Brasil, é ampla o suficiente para permitir a escolha de genótipos parentais divergentes para serem utilizados em cruzamentos para obter novos genótipos recombinantes. Além disso, as análises revelaram alta variabilidade genética dentro dos dois grupos (I: variedades industriais; II variedades de mesa). Contudo, nas variedades de mesa houve maior diversidade genética, provavelmente devido à alta prioridade dada às características sensoriais. Pela análise de agrupamento, verificamos uma tendência para a separação das variedades industriais das de mesa. Os resultados representam importante fonte de informação para programas de melhoramento de mandioca no Brasil.

Cereus peruvianus is an ornamental cactus, popularly called "mandacaru" in Brazil, cultivated in gardens and in biological preservation areas. The species is ecologically, economically and industrially important due to the large number of compounds it can produce. Current research estimates the transferability of microsatellite markers of other cactus species to Cereus peruvianus and analyzes the species's genetic diversity. Genetic diversity/similarity has been estimated by Amplified Fragments Length Polymorphism (AFLP) markers in seedlings originated from seeds of different accesses collected at different locations in the states of Paraná, Piauí and São Paulo, Brazil. Thirty-three pairs of microsatellite primers developed from different cactus species were evaluated so that microsatellite markers could be characterized. Five pairs of microsatellite primers developed from Polaskia chichipe, Ariocarpus bravoanus and Echinocactus grusonii were chosen, giving a 15.15% transferability of these primers to C. peruvianus. One of the microsatellites (Pchi47) provided information for 2 loci in the genome and thus 6 microsatellite heterologous loci were evaluated in 13 C. peruvianus accesses. Mean polymorphism for the 13 accesses reached 62.82% and evaluated loci showed 17 alleles at an average of 2.83 alleles per locus. Analysis of genotype frequency suggests a segregation distortion for several loci in which their frequency failed to present a Hardy-Weinberg equilibrium distribution. Fis mean rate (0.4466) indicated a deficit of heterozygotes for the loci under analysis. Differential frequency of certain alleles in the different accesses produced high genetic differentiation (Fst = 0.4260) among them. Genetic diversity analysis of descendents seedlings of 17 C. peruvianus accesses collected at different sites in the state of Paraná, in Picos (in the state of Piauí) and Peruíbe (in the state of São Paulo) was undertaken with six AFLP primers combinations. This analysis showed 348 loci where 282 (81%) polymorphs were. Polymorphism reached 10.42% within the accesses. Nei's genetic differentiation coefficient (Gst=0.7938) and the coefficient from microsatellites showed a higher genetic diversity among the accesses than that withing themselves. This information corroborated the low gene flow (Nm=0.1299). The similarity between the 17 descendants of evaluated seedlings ranged between 0.6193 and 0.9494 and produced a three-group dendrogram, or rather, two groups were made up from different accesses collected in the state of Paraná, whereas the third one was formed by accesses collected in the state of Piauí. The access from the state of São Paulo did not belong to the above groups. Microsatellite and AFLP results suggest a speciation process of the genus Cereus. Consequently, plants that grow in the states of Piauí (Picos), São Paulo (Peruíbe) and Paraná may either be different species of the genus Cereus or a species undergoing a speciation process. Cereus peruvianus é uma espécie de cacto ornamental popularmente conhecida no Brasil como mandacaru. Cultivada em jardins e reservas, esta espécie apresenta importância ecológica, econômica e industrial, devido à grande diversidade de compostos que produzem. Em razão de sua importância, os objetivos do presente trabalho foram estimar a transferibilidade de marcadores microssatélites de outras espécies de cactáceas para Cereus peruvianus e com eles analisar a diversidade genética desta espécie. Estimar a diversidade/similaridade genética utilizando marcadores AFLP (Amplified Fragments Length Polymorphism) em plântulas obtidas a partir de sementes de acessos de diferentes municípios nos estados do Paraná, Piauí e São Paulo, Brasil. Para a caracterização de marcadores microssatélites, foram avaliados 33 pares de primers microssatélites desenvolvidos para diferentes espécies de cactáceas. Desta avaliação, foram selecionados cinco pares de primers microssatélites desenvolvidos para Polaskia chichipe, Ariocarpus bravoanus e Echinocactus grusonii conferindo uma transferibilidade de 15,15% destes primers para C. peruvianus. O microssatélite Pchi47 forneceu informação para dois loci no genoma, desta maneira foram avaliados seis loci heterólogos de microssatélites nas plântulas de C. peruvianus. O polimorfismo médio para as plântulas descendentes dos 13 acessos foi de 62,82%; os loci avaliados apresentaram 17 alelos, com uma média de 2,83 alelos por locus. A análise das freqüências genotípicas indica distorção na segregação para vários loci onde as freqüências destes não apresentam uma distribuição de acordo com o equilíbrio de Hardy-Weinberg. O valor médio de Fis (0, 4466) indica déficit de heterozigotos para os loci estudados. A freqüência diferencial de determinados alelos nas diferentes plântulas obtidas dos acessos demonstrou uma grande diferenciação genética (Fst = 0, 4260) entre os mesmos. A análise da diversidade genética em plântulas descendentes dos 17 acessos de C. peruvianus de diferentes localidades do Paraná, de Picos - PI e de Peruíbe-SP foi realizada com seis combinações de primers AFLP. Este estudo gerou 348 loci, dos quais 282 (81%) foram polimórficos, revelando um polimorfismo médio dentro dos acessos de 10,42%. O coeficiente de diferenciação genética de Nei (Gst=0, 7938), assim como o obtido com microssatélites, revelou maior diversidade genética entre os acessos do que dentro dos mesmos, corroborando o baixo fluxo gênico (Nm=0, 1299). A similaridade entre as plântulas descendentes dos 17 acessos analisados variou de 0, 6193 a 0, 9494 e esses foram organizados em um dendrograma com três grupos, sendo que dois grupos foram formados por diferentes acessos coletados no estado do Paraná e o terceiro grupo constituído por acessos coletados no estado do Piauí. O acesso obtido a partir do estado de São Paulo ficou isolado dos demais grupos. Os resultados obtidos neste trabalho, tanto com microssatélites como com AFLP, sugerem um processo de especiação do gênero Cereus. Portanto, as plantas que crescem nos estados do Piauí (Picos), de São Paulo (Peruíbe) e do Paraná podem corresponder a plantas de espécies diferentes do gênero Cereus, ou pode se tratar de uma espécie em processo de especiação. xi, 129 f

This study aimed to evaluate the genetic diversity and identify potato cultivars by RAPD and SSR markers. The genomic DNA of 16 potato cultivars was amplified with 25 RAPD primers that generated 92 polymorphic bands and 20 SSR primer pairs that produced 136 polymorphic bands. The dendrograms generated by cluster analysis distinguished the cultivars genetically although the dendrograms were not correlated in the comparison of the two markers used. The PIC values demonstrated the high information content of the primers used and 16 potato varieties were identified based on six RAPD primers and three SSR primer pairs. Thus, by means of RAPD and SSR markers the genetic diversity was assessed and the 16 commercial potato cultivars analyzed in this study were identified. Este trabalho teve como objetivo avaliar a divergência genética e identificar cultivares de batata por meio de marcadores RAPD e SSR. O DNA genômico de 16 cultivares de batata foi amplificado com primers RAPD e com pares de primers SSR. Os 25 primers RAPD geraram 92 bandas polimórficas e os 20 pares de primers SSR produziram 136 bandas polimórficas. Os dendrogramas gerados pela análise de agrupamento permitiram uma distinção genética das cultivares, entretanto não houve uma correlaçao entre os dendrogramas ao comparar os dois marcadores utilizados. Os valores de PIC demonstraram o alto conteúdo informativo dos primers utilizados e, com a utilização de 6 primers RAPD e de 3 pares de primers SSR, identificou-se as 16 cultivares de batatas. Dessa forma, por meio de marcadores moleculares RAPD e SSR foi possível avaliar a divergência genética e identificar as 16 cultivares comerciais de batata analisadas neste estudo.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-10-30Bitstream added on 2014-06-13T20:06:58Z : No. of bitstreams: 1 gaino_apsc_dr_ilha.pdf: 1851631 bytes, checksum: 30c3df7caf28f5a913484aa675c16225 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Os objetivos deste estudo foram investigar por locos microssatélites, a diversidade genética, o sistema de reprodução, a distribuição espacial de genótipos, a distância e os padrões de dispersão de pólen e sementes, e a dinâmica da endogamia entre gerações, em uma população fragmentada da espécie arbórea dióica Myracrodruon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão). O estudo foi conduzido na Estação Ecológica de Paulo de Faria (435,73 ha), onde a população da espécie em estudo ocupa uma área aproximada de 142 ha. Todas as 467 árvores adultas encontradas foram amostradas, tiveram o diâmetro à altura do peito (DAP a 1,3 m) medido e foram mapeadas. Adicionalmente amostraram-se 149 regenerantes e 514 progênies de polinização aberta, coletadas de 30 árvores matrizes da população. Sobre a amostra total de cinco locos em 1130 genótipos (adultos + regeneração + progênies) foram observados 60 alelos, o que sugere um nível de polimorfismo relativamente alto. O número de alelos por loco variou de 7 a 25, com média de 12 alelos por loco. A heterozigosidade esperada média em equilíbrio de Hardy-Weinberg foi de 0,662, enquanto que a heterozigosidade observada foi de 0,713. O índice de fixação variou de -0,348 a 0,215 entre locos, com média de -0,076, sugerindo excesso de heterozigotos. A análise da distribuição espacial dos genótipos indicou a presença de estrutura genética espacial (EGE) na população adulta até aproximadamente 40 m e nos regenerantes até aproximadamente 30 m. Foram detectados cruzamentos entre parentes, pela diferença entre a unidade e a taxa de cruzamento uniloco (st1=0,019, P

O camu-camu (Myrciaria dubia (H.B.K.) McVaugh) é um arbusto endêmico da Amazônia que se desenvolve em áreas periodicamente alagadas. Seus frutos possuem o maior conteúdo de ácido ascórbico conhecido, sendo por isso utilizado na fabricação de diversos produtos. O Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia mantém um Banco Ativo de Germoplasma (BAG) de camu-camu com plantas desenvolvidas a partir de sementes coletadas em diversas localidades. A utilização de marcadores moleculares microssatélites permite a caracterização dos exemplares existentes no BAG, demonstrando a estruturação e a variabilidade genética existentes, o que possibilita a orientação na seleção de matrizes e na manutenção da diversidade genética. Para tanto, foram desenvolvidos 12 primers microssatélites a partir de uma biblioteca genômica enriquecida, sendo nove polimórficos. O número de alelos por locus variou de 3 a 10, com uma média de 6,89 alelos por locus. A heterozigosidade observada (HO) apresentou uma média de 0,531, enquanto a heterozigosidade esperada (HE), 0,679. Os valores de poder de discriminação estimado DL foram maiores que 0,75 em seis loci, estando próximo a este valor em um locus. Os valores de D foram superiores em sete loci, sendo estes considerados mais informativos e utilizados para as análises das populações. Para auxiliar programas de melhoramento, foram avaliadas a diversidade, a estrutura e as relações genéticas de 17 populações do Banco de Germoplasma do INPA. Sete loci microssatélites continham um total de 135 alelos, com média de 19,3 alelos por locus. Os resultados dos parâmetros de diversidade genética sugerem a existência de um excesso de homozigotos. A análise de variância molecular (AMOVA) mostrou que 79,39% do total da variação genética foi encontrada dentro dos acessos e 20,61% entre as populações, demonstrando a existência de estruturação genética. Não houve correlação entre distâncias genéticas e geográficas (r = 0,23), indicando que as populações não se encontram estruturadas no espaço. Essas informações poderão oferecer apoio na organização do BAG e na orientação de cruzamentos, definindo os acessos/populações mais divergentes geneticamente. The camu-camu (Myrciaria dubia (HBK) McVaugh) is an Amazonian endemic shrub that develops in periodically flooded areas. Its fruits have the highest content of ascorbic acid known and is therefore used in the manufacture of various products. The Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia maintains an active germplasm collection (BAG) of camu-camu with plants grown from seeds collected in several localities. The use of microsatellite molecular markers allows the characterization of acessions in the BAG, showing the existing structure and genetic variability, which provides guidance in the selection of matrices and the maintenance of genetic diversity. Thus, were developed 12 microsatellite primers from a genomic enriched library, nine polymorphic. The number of alleles per locus ranged from 3 to 10, with a mean of 6.89 alleles per locus. The observed heterozygosity (HO) had an average of 0.531 and the expected heterozygosity (He) had an average of 0.679. The discrimination power values DL were higher than 0.75 in six loci, close to this value at a locus. The D values were higher in seven loci, wich are considered more informative and used for analysis of populations. To help programs for improvement, were evaluated diversity, structure and genetic relationships of 17 populations of the INPA active germplasm collection. Seven microsatellite loci contained a total of 135 alleles, with an average of 19.3 alleles per locus. The results of the parameters of genetic diversity suggest the existence of an excess of homozygotes. The analysis of molecular variance (AMOVA) showed that 79.39% of the total genetic variation was found within the accessions and 20.61% among populations, demonstrating the existence of genetic structuring. There was no correlation between genetic and geographical distances (r = 0.23) indicating that populations are not structured in space. Such information can support the organization of the BAG and the direction of crosses, defining the access/ populations genetically divergent.

O Pontal do Paranapanema é a região mais recentemente desflorestada do Estado de São Paulo. Os efeitos da fragmentação florestal na estrutura genética de Copaifera langsdorffii Desf. foram avaliados por meio da genotipagem, com seis locos microssatélites, de pelo menos 30 indivíduos regenerantes e 30 adultos em três áreas do Pontal do Paranapanema. A amostragem compreendeu dois fragmentos localizados em assentamentos rurais, Tucano (800 ha) e Madre Cristina (300 ha); e uma população localizada em floresta contínua, no Parque Estadual do Morro do Diabo (35.000 ha). Níveis elevados de diversidade genética foram detectados tanto nos regenerantes como nos adultos. A diversidade gênica (He) variou de 0,718 a 0,835 e o número médio de alelos por loco (Â) variou de 8,67 a 11,83, mostrando que a fragmentação ainda não causou perda de alelos. As estimativas elevadas dos índices de fixação (0,183 a 0,387) foram conseqüentes da ocorrência de alelos nulos em alguns locos e de endogamia nas populações. A divergência genética foi pequena entre os adultos (R ST = 0,035), mas aumentou entre os regenerantes (R ST = 0,075). Como esperado, a fragmentação florestal está causando redução do fluxo gênico interpopulacional, especialmente em relação ao fragmento mais distante da floresta contínua (Tucano - cerca de 8 km). Uma alternativa para promover o fluxo gênico entre os remanescentes florestais do Pontal do Paranapanema seria o estabelecimento de sistemas agroflorestais pelos agricultores assentados, os quais atuariam como trampolins ecológicos, favorecendo a dispersão de pólen e sementes entre fragmentos. The " Pontal do Paranapanema" is the most recently deforested region of the state of São Paulo in Brazil. The effects of forest fragmentation on the population genetic structure of Copaifera langsdorffii Desf. were evaluated by genotyping with six microsatellite loci at least 30 adult and 30 sapling individuals of three populations in " Pontal do Paranapanema" . The sampling areas comprised two fragments located in the rural settlements Tucano (800 ha) and Madre Cristina (300 ha); and one population located in a continuous forest, the " Parque Estadual do Morro do Diabo" (35,000 ha). High levels of genetic diversity were detected in saplings and adults, gene diversity (He) ranged from 0.718 to 0.835 and average number of alleles per locus (Â) ranged from 8.67 to 11.83, showing that the fragmentation has not caused loss of alleles yet. The high estimated fixation indexes (from 0.183 to 0.387) are due to null alleles in some loci and the occurrence of inbreeding within populations. Genetic divergence was low among adults (R ST = 0.035) but increased among saplings (R ST = 0.075). As expected, forest fragmentation has caused a decrease in gene flow among the populations, especially between the most distant fragment (Tucano - about 8 km from the " Parque Estadual do Morro do Diabo" ). An alternative to promote gene flow among forest fragments of " Pontal do Paranapanema" would be the settle of agroforests, which would act as stepping-stones, favouring pollen and seed dispersion among fragments.

Marcadores microssatélites foram usados para caracterizar a diversidade genética entre e dentro de sete populações naturais de Oryza glumaepaula. Seis dessas populações são originárias da bacia hidrográfica da Amazônia e uma do rio Paraguai no Pantanal Matogrossense. Utilizando sete locos de microssatélites, observou-se diversidade genética intrapopulacional média de 1,98 alelos por loco, 56,2% de locos polimórficos, Ho = 0,026 e He = 0,241. Elevada diferenciação interpopulacional foi observada pelo índice de fixação de Wright e pelo parâmetro de divergência de Slatkin (F ST = 0,715 e R ST = 0,595, respectivamente), bem como elevado nível de endogamia total (F IT = 0,963), em grande parte influenciada pelo sistema reprodutivo (F IS = 0,858). Verificou-se que nenhuma população estava em equilíbrio de Hardy-Weinberg, devido ao predomínio da autofertilização, o que também pôde ser verificado pela taxa média aparente de cruzamentos: t a = 0,055. Consequentemente, o fluxo gênico entre populações foi praticamente nulo o que contribuiu para o elevado nível de divergência interpopulacional. De modo geral, as taxas de cruzamento foram muito baixas ou nulas nas populações da Amazônia. Entretanto, a população PG-3 do Rio Paraguai, originária do Pantanal Matogrossense, apresentou taxa de cruzamento mais elevada (13,2%), indicando sistema reprodutivo misto com predomínio de autogamia. Como a diversidade intrapopulacional foi baixa, os resultados indicam que a amostragem de elevado número de populações é a estratégia mais adequada para a conservação ex situ desta espécie. Para a conservação in situ, com base na riqueza alélica, recomenda-se como prioridade as populações PG-3, TA-3, SO-17 e NE-7, originárias das bacias hidrográficas dos Rios Paraguai, Tapajós, Solimões e Negro, respectivamente.

Marcadores microssatélites foram usados para caracterizar a diversidade genética entre e dentro de sete populações naturais de Oryza glumaepaula. Seis dessas populações são originárias da bacia hidrográfica da Amazônia e uma do rio Paraguai no Pantanal Matogrossense. Utilizando sete locos de microssatélites, observou-se diversidade genética intrapopulacional média de 1,98 alelos por loco, 56,2% de locos polimórficos, Ho = 0,026 e He = 0,241. Elevada diferenciação interpopulacional foi observada pelo índice de fixação de Wright e pelo parâmetro de divergência de Slatkin (F ST = 0,715 e R ST = 0,595, respectivamente), bem como elevado nível de endogamia total (F IT = 0,963), em grande parte influenciada pelo sistema reprodutivo (F IS = 0,858). Verificou-se que nenhuma população estava em equilíbrio de Hardy-Weinberg, devido ao predomínio da autofertilização, o que também pôde ser verificado pela taxa média aparente de cruzamentos: t a = 0,055. Consequentemente, o fluxo gênico entre populações foi praticamente nulo o que contribuiu para o elevado nível de divergência interpopulacional. De modo geral, as taxas de cruzamento foram muito baixas ou nulas nas populações da Amazônia. Entretanto, a população PG-3 do Rio Paraguai, originária do Pantanal Matogrossense, apresentou taxa de cruzamento mais elevada (13,2%), indicando sistema reprodutivo misto com predomínio de autogamia. Como a diversidade intrapopulacional foi baixa, os resultados indicam que a amostragem de elevado número de populações é a estratégia mais adequada para a conservação ex situ desta espécie. Para a conservação in situ, com base na riqueza alélica, recomenda-se como prioridade as populações PG-3, TA-3, SO-17 e NE-7, originárias das bacias hidrográficas dos Rios Paraguai, Tapajós, Solimões e Negro, respectivamente. Microsatellite markers were used to characterize the genetic diversity within and among seven natural populations of Oryza glumaepaula. Six of these populations originated from the hydrographic basin of the Amazon and one from Rio Paraguay in the Pantanal Matogrossense. Using seven microsatellite loci, the following intrapopulation genetic diversity parameters were estimated on average: 1.98 alleles per locus, 56.2% polymorphic loci, Ho = 0.026 and He = 0.241. High interpopulational differentiation was noticed by examining Wright’s fixation index and Slatkin’s divergence parameter (F ST = 0.715 and R ST = 0.595, respectively), as well as a high level of total inbreeding (F IT = 0.963), greatly influenced by the mating system (F IS = 0.858). No population was in Hardy-Weinberg equilibrium, due to the prevailing autogamic mating behavior, as also indicated by the average apparent outcrossing rate observed: t a = 0.055. Consequently, among populations gene flow was practically absent, which has contributed to the high interpopulational genetic divergence. In general, very low or null outcrossing rates were found in the Amazonian populations. However, population PG-3 from Rio Paraguay, originated from Pantanal Matogrossense, showed a higher outcrossing rate (13.2%), indicating a mixed mating system with the predominance of self-fertilization. Since intrapopulation diversity was low, results indicate that sampling a large number of populations is the most appropriate strategy for the ex situ conservation of this species. For in situ conservation, taking in consideration the allelic richness, the following populations are indicated as priority: PG-3, TA-3, SO-17, and NE-7, from the hydrographic basins of the rivers Paraguay, Tapajos, Solimoes and Negro, respectively.

Universidade Federal de Minas Gerais "Curimbatá-pióa ", Prochilodus costatus (Valenciennes, 1850), is an endemic species from São Francisco river basin, with migratory habits, with important ecological role and of fishing importance. The present study aimed to assess the genetic variation in Prochilodus costatus in order to verify the occurrence of population genetic structure and to produce knowledge that contributes to the conservation of the species. Genetic variation was studied at three sites downstream of the Três Marias dam (MG) through six specific microsatellites loci, isolated and characterized in this study. The loci were amplified through PCR (polymerase chain reaction) and the individuals were genotyped in an automated sequencer. The statistical analyses were accomplished through the softwares GENEPOP 3.3 and FSTAT 2.9.3.2. Fish from the three sites had quite similar genetic diversity levels and they did not show genetic differentiation to each other, suggesting that P. costatus might represent a single reproductive unit in the high-middle São Francisco River. These findings are comparable to those previously obtained in the sister-species P. argenteus and should be important for futures management plans that seek the conservation of this species. O curimbatá-pióa , Prochilodus costatus (Valenciennes, 1850), é uma espécie endêmica da bacia do Rio São Francisco, de hábitos migratórios, de importante função ecológica e importância pesqueira. O presente estudo propôs-se a estudar a variação genética em Prochilodus costatus para verificar a ocorrência de estruturação genética populacional e produzir conhecimentos que contribuam para a conservação da espécie. A variação genética foi estudada em três localidades à jusante da barragem de Três Marias (MG), utilizando-se seis loci de microssatélites específicos, isolados e caracterizados neste trabalho. Os loci foram amplificados via PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) e os indivíduos genotipados em seqüenciador automático. As análises estatísticas foram realizadas através dos programas computacionais GENEPOP 3.3 e FSTAT 2.9.3.2. Os peixes das três localidades apresentaram níveis de diversidade genética bastante similares, e não apresentaram diferenciação genética entre si, sugerindo que P. costatus possa representar uma simples unidade reprodutiva na região do alto-médio Rio São Francisco. Esses achados são comparáveis ao observado em estudos prévios na espécie-irmã P. argenteus e devem ser importantes para futuros planos de manejo que visem à conservação dessa espécie.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico A vulnerabilidade genética tornou-se preocupação constante no melhoramento de qualquer espécie vegetal. A manutenção da diversidade genética entre genótipos em uma cultura torna-se medida de proteção contra potenciais perdas devido ao ataque de pragas e doenças. A diversidade genética entre genótipos também facilita a criação de populações segregantes a partir das quais plantas contendo combinações de genes superiores podem ser selecionadas. Com a aprovação da Lei de Proteção de Cultivares no Brasil (1997), a caracterização genética de cultivares tornou-se importante na proteção do direito intelectual do melhorista, bem como para auxiliar os programas de melhoramento dessas cultivares. Os objetivos gerais desse trabalho foram caracterizar e avaliar a diversidade genética de algumas cultivares de importância tanto comercial quanto para os programas de melhoramento do Brasil, bem como de linhagens, por meio de marcadores microssatélites (SSR). Dessa forma, neste trabalho foram utilizadas cultivares de algodoeiro herbáceo indicadas para plantio em diferentes regiões do Brasil, bem como cultivares provenientes da Argentina e Paraguai. Linhagens de algodoeiro, provenientes do programa de melhoramento da COODETEC, também foram utilizadas. Os resultados evidenciaram que o sistema eletroforético com gel desnaturante de poliacrilamida 7% foi o recomendado para realização de caracterização e análise de diversidade genética de cultivares de algodoeiro herbáceo, por apresentar maior poder de resolução. Ademais, constatou-se o potencial dos marcadores microssatélites em estudos de diversidade genética entre indivíduos da espécie Gossypium hirsutum L., uma base genética estreita entre as cultivares e entre as linhagens de algodoeiro e, como conseqüência a necessidade de se introduzir novos alelos no pool gênico dos algodoeiros melhorados. O conjunto de primers SSR selecionados para as cultivares (11 pares de primers SSR) e linhagens (14 pares de primers) poderão ser úteis nos processos de proteção de cultivares, nas análises de pureza genética e nos programas de melhoramento. A correlação entre as distâncias genéticas obtidas pelos coeficientes de parentesco e marcadores microssatélites tanto para as cultivares quanto para as linhagens foi positiva e significativa (P < 0,001). Entretanto, a magnitude das correlações não foi elevada, com valores iguais a 0,25 entre as cultivares e a 0,29 entre as linhagens. A estimativa da diversidade genética com base em marcadores microssatélites forneceu mais informações sobre as relações genéticas entre os indivíduos. A constatação de que poucos ancestrais contribuem para a constituição genética das cultivares de algodoeiro usadas no Brasil, sugere maior preocupação em introgredir novos alelos no pool gênico dessas cultivares e, assim, aumentar sua base genética. The genetic vulnerability is a constant concern breeding of any vegetal species. Maintaining genetic diversity among crop genotypes offers a measure of protection against potential widespread losses from crop pests and facilitates the creation of segregating populations from which plants with superior gene combinations can be selected. Along with the development of new cultivars, there has been a growing interest in the genetic characterization, for commercial protection provided by the Brazilian Cultivar Protection Low and regulations (1997). The general purpose of this work were to characterize and to evaluate the genetic diversity of some important cultivars used in breeding program in Brazil through microsatellites (SSR) markers and genealogy. In this work we used cotton cultivars developed and released by Brazilian public and private institutions and cotton cultivars developed in Argentina and Paraguay. Cotton lines from breeding program developed by COODETEC also were used at present work. In conclusion, was evidenced that the eletrophoretic system with denaturing gel of 7% was recommended for characterization and analyze of genetic diversity of cotton cultivars because they present higher resolution. The results revealed the potential of the markers for genetic diversity studies among Gossypium hirsutum L. genotypes, a narrow genetic base among cultivars and among lines and the necessity to introduce new alleles in improved cotton germplasm. The selected SSR primers for the cultivars (11 primers pairs) and lines (14 primers pairs) will be useful for cultivars protection process, analyzes of genetic purity and in breeding program. The correlation evidenced between the estimation used to calculate the genetic distance among cultivars and among lines was positive and significant. However, the correlations are not so high, with values equal to 0,25 among cultivars and 0,29 among lines. The genetic diversity estimation based in molecular markers provided more information about the genetic relationships among individuals. The evidence that few ancestral contribute to genetic constitution of the cotton cultivars used in Brazil suggest a need of introducing new alleles into the gene pool of these cultivars and in this way to increase the cotton genetic base.