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Depuis la commercialisation du coton Bt, la question de la pureté des semences utilisées par les producteurs est peu abordée, encore moins en relation avec l’analyse du système semencier dans le pays concerné. Cet article étudie le cas du Burkina Faso en 2015, pays où la couverture des surfaces en coton transgénique avec deux gènes Bt est restée partielle, jusqu’à sa suspension décidée la même année. En se basant sur les seuils de présence de gènes Bt retenus dans l’étude pour déclarer la nature conventionnelle ou transgénique des parcelles échantillonnées, 29,3 % des parcelles supposées conventionnelles l’étaient effectivement, alors que 92,6 % des parcelles supposées transgéniques l’étaient effectivement. Par contre, seulement 40 % des parcelles supposées transgéniques l’étaient bien si l’on se base sur le seuil de présence de gènes Bt attendu dans des parcelles transgéniques effectivement installées avec des semences Bollgard II suffisamment pures. L’examen du système semencier permet de lui attribuer une partie des défauts de pureté observés. Par ailleurs, si l’on considère la chronologie des événements jusqu’à la livraison des semences transgéniques par Monsanto, ces semences ne pouvaient pas contenir systématiquement les deux gènes Bt. Un tel défaut initial s’est maintenu, voire accentué par la suite. Il a certainement réduit dès le départ l’efficacité du coton Bt et, pis encore, la durabilité de son utilisation en facilitant la sélection de ravageurs résistants à chacun des deux gènes utilisés, voire simultanément aux deux. Le cas étudié souligne l’importance, pour l’efficacité et la durabilité de l’utilisation des semences transgéniques, d’avoir un système semencier qui assure et préserve la pureté des semences produites. Il révèle aussi, indépendamment de l’utilisation de ces semences, le besoin d’ajuster le système internalisé de production de semences cotonnières en Afrique francophone.

Background Since the commercial release of Bt cotton in Burkina Faso in 2009, the issue of seed purity in producers’ fields has rarely been addressed in an unbiased and objective manner. The potential for contamination of conventional seed varieties with Bt traits and the consequent threat to the continuation of organic cotton production has been documented. However, studies are rare on the varietal purity of Bt cotton seeds, despite the implications for the effectiveness and sustainability of their use. This paper compensates for the lack of research on the varietal purity of cotton seeds in Burkina Faso by reporting the results of Enzyme linked immunosorbent assay tests collected in 2015 on samples of both conventional and Bt varieties from 646 fields. Results According to the conservative criteria used to declare the presence of a Bt gene in a given variety (more than 10% of seeds of conventional variety exhibit Bt traits, and at least 90% of seeds of Bt variety exhibit Bt traits), seed purity was very questionable for both types of variety. For the supposedly conventional variety, the Cry1Ac gene was observed in 63.6% of samples, the Cry2Ab gene was observed in 59.3% of samples, and both genes were detected in 52.2% of the seed samples. Only 29.3% of the seeds that were supposed to be of conventional type contained no Bt genes. Conversely, for the labeled Bt variety, the Cry1Ac gene was found in only 59.6% of samples, the Cry2Ab gene was found in 53.6% of the samples, and both genes were found in 40.4% of the samples. Finally, for the seeds that were supposed to contain both genes (Bollguard 2), both Cry1Ac and Cry2Ab genes were found in only 40.4% of the samples, only one of the genes was found in 32.4% of the samples, and 27.2% of the seeds in the samples contained neither. Two factors are responsible for the severe lack of seed purity. First, conventional varieties are being contaminated with Bt traits because of a failure to revise the seed production scheme in Burkina Faso to prevent cross-pollination. Second, the original Bt seeds provided to Burkina Faso lacked varietal purity. The organic sector plays a very minor role in the cotton sector of Burkina Faso (production of organic cotton totaled 453 t in 2018/2019, out of national cotton production of 183 000 t). Nevertheless, the lack of purity in conventional seed varieties is a threat to efforts to expand certified organic cotton production. The poor presence of Bt proteins in supposed Bt varieties undermines their effectiveness in controlling pests and increases the likelihood of the development of resistance among pest populations. Conclusion Our results show the extent of purity loss when inadequate attention is paid to the preservation of seed purity. Pure conventional seeds could vanish in Burkina Faso, while Bt seeds do not carry the combination of the expected Bt traits. Any country wishing to embark on the use of Bt cotton, or to resume its use, as in the case of Burkina Faso, must first adjust its national seed production scheme to ensure that procedures to preserve varietal purity are enforced. The preservation of varietal purity is necessary to enable the launch or the continuation of identity-cotton production. In addition, the preservation of varietal purity is necessary to ensure the sustainable effectiveness of Bt cotton. In order to ensure that procedures to preserve varietal purity are observed, seed purity must be tested regularly, and test results must be published.

Background Locating the optimal varieties for coffee cultivation is increasingly considered a key condition for sustainable production and marketing. Variety performance varies when it comes to susceptibility to coffee leaf rust and other diseases, adaptation to climate change and high cup quality for specialty markets. But because of poor organization and the lack of a professional coffee seed sector, most existing coffee farms (and even seed lots and nurseries) do not know which varieties they are using. DNA fingerprinting of coffee planting material will contribute to professionalize the coffee seed sector. Objective The objective of this paper is i) to check in a large scale the robustness of the existing coffee DNA fingerprinting method based on eight Single Sequence Repeats markers (SRR) and ii) to describe how it can help in moving the needle towards a more professional seed sector. Method 2533 samples representing all possible genetic background of Arabica varieties were DNA fingerprinted with 8 SRR markers. The genetic diversity was analyzed and the genetic conformity to varietal references was assessed. Results The DNA fingerprinting method proved to be robust in authenticating varieties and trace back the history of C. arabica breeding and of the movement of C. arabica varieties. The genetic conformity of two important coffee varieties, Marseillesa and Gesha, proved to be 91% and 39% respectively. Conclusions DNA fingerprinting provides different actors in the coffee sector with a powerful new tool—farmers can verify the identity of their cultivated varieties, coffee roasters can be assured that marketing claims related to varieties are correct, and most of all, those looking to establish the a more professional and reliable coffee seed sector have a reliable new monitoring tool to establish and check genetic purity of seed stock and nursery plants. Highlights While C. arabica is primarily self-pollinating, even fixed line varieties appear to be drifting away from their original genetic reference due to uncontrolled cross pollination. A set of 8 SSR markers applied to the largest possible genetically diverse set of samples prove to discriminate between a wide range of varieties Figures confirm that genetic non conformity of coffee varieties can represent up to 61% of checked samples.

This paper analyses the extent to which farmers in northern China actually benefit from market development for biotech cultivars and seeds, and how they interact with that development. It firstly appraises similarities and discrepancies observed in this development in China when compared to India, for which the experience has been more widely reported to the international community. It then examines the data obtained in Hebei Province. The results reveal strong competition with a large number of cultivars, including a substantial share of illegal cultivars, and, paradoxically, show high seed prices. In return, this competition is heightened by growers' strategies for adapting to uncertainty when buying seeds. The future of commercial seeds and the use of biotech cultivars are at stake. Competition without some form of control and regulation could be detrimental to both growers and operators in the cultivar and seed sector and could jeopardise investment in breeding and biotechnology.

[object Object]Chenopodium quinoa Willd., a high quality grain crop, is resistant to abiotic stresses (drought, cold, and salt) and offers an optimal source of protein. Quinoa represents a symbol of crop genetic diversity across the Andean region. In recent years, this crop has undergone a major expansion outside its countries of origin. The activities carried out within the framework of the International Year of Quinoa provided a great contribution to raise awareness on the multiple benefits of quinoa as well as to its wider cultivation at the global level. FAO is actively involved in promoting and evaluating the cultivation of quinoa in 26 countries outside the Andean region with the aim to strengthen food and nutrition security. The main goal of this research is to evaluate the adaptability of selected quinoa genotypes under different environments outside the Andean region. This paper presents the preliminary results from nine countries. Field evaluations were conducted during 2013/2014 and 2014/2015 in Asia (Kyrgyzstan and Tajikistan), and the Near East and North African countries (Algeria, Egypt, Iraq, Iran, Lebanon, Mauritania, and Yemen). In each country, the trials were carried out in different locations that globally represent the diversity of 19 agrarian systems under different agro-ecological conditions. Twenty-one genotypes of quinoa were tested using the same experimental protocol in all locations consisting in a randomized complete block design (RCBD) with three replicates. Some genotypes showed higher yields and the Q18 and Q12 landraces displayed greater adaptation than others to new environmental conditions. The Q21 and Q26 landraces were evaluated with stable and satisfactory levels of yield (> 1 t.ha-1) in each of the different trial sites. This production stability is of considerable importance especially under climate change uncertainty. While these results suggest that this Andean crop is able to grow in many different environments, social, and cultural considerations remain crucial regarding its possible introduction as a staple food in new cropping systems around the world.

Quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) was first domesticated in Andean countries over 7000 years ago. Following the Spanish conquest, quinoa was rejected as "Indian food." After centuries of neglect, the potential of quinoa was rediscovered during the second half of the 20th century. Since then, the number of countries importing quinoa increased, with new producers appearing on the map and quinoa now being cultivated in areas outside the Andean countries. The geographical increase in distribution of quinoa has highlighted the difficulty of access to quality seed, which is a key factor for testing the crop outside the Andes. In this context, research partnerships have helped promote the exchange of quinoa germplasm and have allowed trials to be undertaken in non-traditional areas of cultivation. The number of countries growing the crop has increased rapidly from eight in 1980, to 40 in 2010, and to 75 in 2014. A further 20 countries have sown quinoa for the first time in 2015. In this paper, we analyze this trend and discuss the limits of quinoa's expansion. As commercial production of quinoa is expected to develop, changes in international regulatory frameworks on genetic resources are needed in order to facilitate plant breeding for the most adaptive varieties for each region.

SUMMARYQuinoa cultivation in Chile presents an ancient and active complex of geographic, climatic, social and cultural interactions that has determined its current biodiversity in the three main growing zones (north, central and south). Importantly, these interactions involve the participation of farmers, whose activities are at the base of seed exchange networks due to their knowledge andin situconservation of genetic diversity. The present study reports how a better understanding of farmers’ seed exchanges and local production practices could impact the genetic structure and diversity of quinoa at national scale in Chile. Using field interviews and characterization of 20 microsatellite genetic markers in a multi-origin set of 34 quinoa accessions representative of Chile and the South American region, the phenetic analysis of germplasm was consistent with the current classification of quinoa ecotypes present in Chile and Andean zone. This allowed the identification of five populations, which were represented by quinoa of Salares (northern Chile), Coastal/Lowlands (central and southern Chile), Highlands (Peru, Bolivia and Argentina) and Inter-Andean Valleys (Ecuador and Colombia). The highly informative quality of the markers used revealed a wide genetic diversity among main growing areas in Chile, which correlated well with natural geographical–edaphic–climatic and social–linguistic context to the expansion of quinoa biodiversity. Additionally, in addition to ancient seed exchanges, this process is still governed by the diverse agricultural practices of Andean farmers. Genetic erosion is considered an imminent risk due to small-scale farming, where the influence of increased migration of people to urban systems and export-driven changes to the agro-ecosystems may further reduce the diversity of quinoa plants in cultivation.

A better knowledge of factors organizing crop genetic diversity in situ increases the efficiency of diversity analyses and conservation strategies, and requires collaboration between social and biological disciplines. Four areas of anthropology may contribute to our understanding of the impact of social factors on crop diversity: ethnobotany, cultural, cognitive and social anthropology. So far, most collaborative studies have been based on ethnobotanical methods, focusing on farmers’ individual motivations and actions, and overlooking the effects of farmer’s social organization per se. After reviewing common shortcomings in studies on sorghum and maize, this article analyzes how social anthropology, through the analysis of intermarriage, residence and seed inheritance practices, can contribute to studies on crop genetic diversity in situ. Crop varieties are thus considered social objects and socially based sampling strategies can be developed. Such an approach is justified because seed exchange is built upon trust and as such seed systems are embedded in a pre-existing social structure and centripetally oriented as a function of farmers’ social identity. The strong analogy between farmers’ cultural differentiation and crop genetic differentiation, both submitted to the same vertical transmission processes, allows proposing a common methodological framework for social anthropology and crop population genetics, where the classical interaction between genetic and environmental factors, G × E, is replaced by a three-way interaction G × E × S, where “S” stands for the social differentiation factors.

In plants, polyglutamylated folate forms account for a significant proportion of the total folate pool. Polyglutamylated folate forms are produced by the enzyme folylpolyglutamate synthetase (FPGS). The FPGS enzyme is encoded by two genes in rice, Os03g02030 and Os10g35940. Os03g02030 represents the major expressed form in developing seed. To determine the function of this FPGS gene in rice, a T-DNA knockout line was characterised. Disrupting Os03g02030 gene expression resulted in delayed seed filling. LC-MS/MS-based metabolite profiling revealed that the abundance of mono- and polyglutamylated folate forms was significantly decreased in seeds of the knockout line. RT-qPCR detected an increase in the transcript abundance of folate biosynthesis genes in seed of the knockout plant, whereas the folate deglutamating enzyme γ-glutamyl hydrolase mRNA level was reduced. Our study has uncovered a novel role for folate polyglutamylation during rice seed development and a potential feedback mechanism to maintain folate abundance.

Le système de diffusion des semences a un impact direct sur la structure génétique des populations de plantes domestiquées et sur son évolution. Ce système peut être caractérisé par ses acteurs, mais aussi par la nature, le sens et l'intensité des échanges. En décrivant les pratiques de sélection et la circulation des semences de sorgho dans la société duupa au Nord Cameroun, notre étude vise à comprendre la dynamique de la diversité génétique. Les agriculteurs duupa maintiennent une importante diversité variétale (40 variétés) qu'ils cultivent en mélange polyvariétal. Chaque année, ils sélectionnent des panicules pour reconduire leur culture, mais peuvent également utiliser des graines non sélectionnées. Les échanges de semences sont importants, et 56 % des agriculteurs se pourvoient auprès de leur famille ou de leurs voisins. Le battage est le moment privilégié des échanges de semences en panicules, mais les agriculteurs duupa introduisent également dans leurs semences des graines à vocation alimentaire échangées à l'occasion de visites et de cérémonies. Les liens sociaux qu'entretiennent les Duupa influencent directement la circulation des semences et sont au coeur de la dynamique de la diversité génétique.

International audience; Recent studies investigating the relationship between crop genetic diversity and human cultural diversity patterns showed that seed exchanges are embedded in farmers' social organization. However, our understanding of the social processes involved remains limited. We investigated how farmers' membership in three major social groups interacts in shaping sorghum seed exchange networks in a cultural contact zone on Mount Kenya. Farmers are members of residence groups at the local scale and of dialect groups clustered within larger ethnolinguistic units at a wider scale. The Chuka and Tharaka, who are allied in the same ethnolinguistic unit, coexist with the Mbeere dialect group in the study area. We assessed farmers' homophily, propensity to exchange seeds with members of the same group, using exponential random graph models. We showed that homophily is significant within both residence and ethnolinguistic groups. At these two levels, homophily is driven by the kinship system, particularly by the combination of patrilocal residence and ethnolinguistic endogamy, because most seeds are exchanged among relatives. Indeed, residential homophily in seed exchanges results from local interactions between women and their in-law family, whereas at a higher level, ethnolinguistic homophily is driven by marriage endogamy. Seed exchanges and marriage ties are interrelated, and both are limited between the Mbeere and the other groups, although frequent between the Chuka and Tharaka. The impact of these social homophily processes on crop diversity is discussed.

The recent boom in quinoa cultivation provides many lessons for an agroecological transition that enhances agricultural biodiversity. Looking at the effects of quinoa expansion, this article analyses how to protect peasant varieties, support free and fair flow of germplasm and engage in new ways of doing research.

A sound understanding of crop history can provide the basis for deriving novel genetic information through admixture mapping. We confirmed this, by using characterization data from an international collection of cocoa, collected 25 years ago, and from a contemporary plantation. We focus on the trees derived from three centuries of admixture between Meso-American Criollo and South American Forastero genomes. In both cacao sets of individuals, linkage disequilibrium extended over long genetic distances along chromosome regions, as expected in populations derived from recent admixture. Based on loose genome scans, genomic regions involved in useful traits were identified. Fifteen genomic regions involved in seed and fruit weight variation were highlighted. They correspond to ten previously identified QTLs and five novel ones. Admixture mapping can help to add value to genetic resources and thus, help to encourage investment in their conservation.

Pearl millet [Pennisetum glaucum (L.) R. Br.] landraces provide nutritional quality and security under the harsh environmental conditions of Rajasthan, India. Using amplified fragment length polymorphism (AFLP), this study investigated pearl millet genetic diversity patterns and related the results to farmers' local knowledge and seed systems. Thirty-nine cultivars were assessed: 14 farmer landraces from western Rajasthan, 13 farmer landraces from eastern Rajasthan, and 12 control cultivars. Shannons' information index for western (H = 0.34) and eastern (H = 0.32) Rajasthan landraces was up to 14% higher than in composite-based improved cultivars. Analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that variation within landrace populations was much higher than between regional samples. In the west, intra-village variation was higher than inter-village variation. In the east, variation between landrace groups bearing a specific name was higher than intra-group variation. Gene flow, inferred from genetic distances between populations, was used as an indicator for seed exchange between farmers. In western Rajasthan, seed exchange appears to be especially dynamic, as gene flow was greater than N,m = 25 among most of its populations. Farmers' knowledge of local cultivars and seed systems was, for the most part, supported by the AFLP analysis. These results are relevant for in situ maintenance and breeding strategies with a view to improving traditional cultivars, specifically performance and yielding stability.

The importance of seed provisioning in food security and nutrition, agricultural development and rural livelihoods, and agrobiodiversity and germplasm conservation is well accepted by policy makers, practitioners and researchers. The role of farmer seed networks is less well understood and yet is central to debates on current issues ranging from seed sovereignty and rights for farmers to GMOs and the conservation of crop germplasm. In this paper we identify four common misconceptions regarding the nature and importance of farmer seed networks today. (1) Farmer seed networks are inefficient for seed dissemination. (2) Farmer seed networks are closed, conservative systems. (3) Farmer seed networks provide ready, egalitarian access to seed. (4) Farmer seed networks are destined to weaken and disappear. We challenge these misconceptions by drawing upon recent research findings and the authors’ collective field experience in studying farmer seed systems in Africa, Europe, Latin America and Oceania. Priorities for future research are suggested that would advance our understanding of seed networks and better inform agricultural and food policy., Food Policy, 56, ISSN:0306-9192, ISSN:1873-5657

Si le climat et le sol ont depuis longtemps été étudiés pour leur effet structurant sur les agro-écosystèmes et la diversité des plantes cultivées, il est moins courant d'étudier l'action de facteurs anthropologiques comme l'organisation et la différenciation sociale des agriculteurs. Mon parcours académique et professionnel, hybride en conciliant d'une part un Docto¬rat en ethnologie et sociologie comparative, et d'autre part l'encadrement de thèses en biologie en étroite interaction avec mes collègues généticiens de l'UMR Agap, m'a convaincu que la diversité des plantes cultivées ré¬sulte non seulement de facteurs biologiques et environnementaux, mais également de facteurs historiques et sociaux. Ce mémoire compte trois parties complémentaires. La première aborde les barrières sociales qui accompagnent l'organi¬sation de la vie en société. Les agriculteurs ne partagent pas leur savoir et n'échangent pas leurs semences ou leurs variétés aléatoirement avec les autres agriculteurs. L'absence de relation et d'échange avec certains, et des échanges privilégiés avec d'autres, sont une caractéristique de la vie en société. Les barrières sociales définissent ainsi des unités sociales au sein desquelles le savoir, les pratiques ou les variétés sont transmis ou échangés. L'interaction usuelle génétique x environnement, G x E, a été décomposée en trois termes, G x E x S, afin de rendre explicite, avec le terme S, la société comme facteur d'organisation de la diversité génétique et morphologique des plantes cultivées. La deuxième partie montre com¬ment l'orientation centripète des systèmes d'échanges — flux de gènes via les semences dirigés vers l'intérieur de groupes sociaux — contribue au Kenya et ailleurs à l'organisation de cette diversité. La troisième partie propose une approche dynamique de la diversité des plantes cultivées en s'appuyant sur la mémoire et le savoir des agriculteurs sur le versant Est du Mont Kenya. Les agriculteurs se rappellent les années où ils ont adopté ou abandonné les espèces ou variétés qu'ils cultivent. Ces biographies végétales permettent une analyse rétrospective de la diversité et de sa dynamique. L'interdépendance des facteurs biologiques, environnementaux et sociaux incite à conclure à la nécessité d'un langage d'interface entre sciences biologiques et sociales pour étudier la diversité des plantes cultivées. De portée générale, une approche comparative des agriculteurs et une stratégie d'échantillonnage, également comparative, des plantes apparaissent comme le point focal de cette interdisciplinarité.

Climate variability directly affects traditional low input and rain-fed farming systems, but few studies have paid attention retrospectively to the cropping system’s ability to mitigate climate risk. This study analyzes the impacts of rainfall variability on farmers’ seed variety losses over time, considering changes in smallholder farming systems. The cropping system dynamics, in favoring maize at the expense of sorghum and pearl millet, have induced an increasing risk of seed loss during drought. Combining ecological anthropology and climatology, a retrospective survey asking farmers about the period 1961–2006 was carried out at three altitudinal levels (750, 950, and 1100 m) on the eastern slope of Mount Kenya. Over that period, based on 3204 seed loss events reported orally and independently by 208 farmers, the probability to lose sorghum seed (0.056–0.065) was significantly lower than the probability to lose maize seed (0.071–0.087). All crops were more impacted by droughts than by very wet years. Seed loss probability increased for rainy seasons shorter than 50 days, with less than 28 rain days, and with a precipitation amount under 400 mm. Losses are almost linearly related to the frequency of rain days. Logistic regression confirmed that a change in cropping systems, favoring maize at the expense of sorghum and pearl millet, increased the risk of seed losses due to drought over the 46-yr period.

Esta tesis plantea la necesidad de comprender a la conservación desde un enfoque interdisciplinario. Cuestioné los marcos conceptuales y referenciales actuales propuestos desde diferentes disciplinas y corrientes sociales que la han dado sentido al conservacionismo biológico. Posteriormente expuse un marco teórico que permite sistematizar la información empírica a fin de poder conjuntar una serie de elementos dispersos en los análisis sociológicos y que según mi perspectiva están implícitos en las nociones teóricas de conservación de la biodiversidad, en los paradigmas de intervención técnica que aplica el estado y los actores privados que intervienen en el desarrollo rural en las sociedades campesinas. El enfoque teórico expuesto en el capítulo I y II, se refiere a una propuesta de ordenamiento de ciertas ideas, que no pretende ser extensiva ni mucho menos ambiciona explicar la realidad rural universal. Fue en todo caso la forma que encontré para exponer mis hallazgos tomados por tres caminos diferentes: Un andar positivista, propio del enfoque del diagnóstico agrario para el que me prepararon en la escuela agronómica del Imstitut de Régions Chaudes de Montpellier, y que se propone a partir de un determinismo ambiental, y socio-económico. Este enfoque me permitió escoger y delimitar los territorios y nichos ecológicos, asimismo comprender los sistemas productivos y plantear en general una forma de homogenización de lo tseltal en el municipio alteño de Tenejapa. La homogenización se planteó en las zonas donde no existe otra opción de cultivo central para la economía familiar que el maíz. Esto se hizo con el objetivo de evitar la interferencia que tienen los sistemas productivos cafetaleros como principal fuente económica y mediador de las relaciones sociales entre las comunidades agrícolas que han optado por este modelo de desarrollo. En el apartado cuarto, se analiza una política pública. Al tomar como parte del análisis una intervención técnica fomentada por el estado se establece la posibilidad de analizar los planteamientos con los que el estado comprende un problema determinado, y la forma e interacciones en los intereses de los actores que intervienen con la realidad agrícola que afecta la forma en que los productores alteños manejan sus territorios y sus espacios productivos. Asimismo este capítulo me permitió comprender más a fondo cómo es que se plantean los actores del desarrollo la conservación del maíz, y cual es desde su perspectiva el papel de los campesinos. En el capítulo V, se analiza desde una perspectiva más bien constructivista basado en la idea de que las estructuras sociales en la comunidad contienen reglas, pero fundamentalmente contienen valores que son difíciles de comprender y de explicar. Se recurre al análisis estadístico, a las entrevistas y a la observación participativa para comprender mejor los intercambios de maíz y su sentido dentro de las familias. El capítulo VI asimismo contiene una interpretación más bien antropológica, que pretende aportar elementos no analizados en los anteriores capítulos. Al enfocarme a las cuestiones simbólicas del maíz tuve que entrar en los relatos, mitos de origen, y rituales ceremoniales de los tseltales. Esta posibilidad me obligó a alejarme un poco de las comunidades de mi análisis, para entender de mejor forma la estructura del pensamiento cosmológico presente en la cabecera municipal. Las dificultades lingüísticas implícitas en la realización de una investigación en una sociedad cuya lengua de origen no es el español, no ha sido uno de los principales obstáculos, esta experiencia. El problema principal fue el acoso social, político, económico, cultural y militar al que están expuestos los campesinos indígenas de la región, mismo que se hizo más evidente durante el año 2013 cuando el gobierno estatal impuso un proyecto carretero que atraviesa el municipio de Tenejapa justo en medio de dos de las comunidades con las que participé. Las manifestaciones más críticas de este acoso son perceptibles en las zonas zapatistas por donde planifican el paso de la carretera: El resultado de esta resistencia solo en este año, es media docena de secuestrados, cuatro líderes indígenas asesinados impunemente y decenas de retenidos, encarcelados y torturados. Por el contrario en la zona de mi investigación la violencia social a la que están expuestos los indígenas se ejerce a través de la desconfianza y en contra del mestizo. Además de los problemas interétnicos entre los mestizos chiapanecos y los tseltales, hay problemas interreligiosos que comienzan a mostrar signos de intolerancia. En el año 2013, existieron varios linchamientos a personas que delinquieron o fueron considerados como culpables de actos graves (violaciones, asesinatos), la tensión para poder moverme libremente entre las seis comunidades seleccionadas implicaba un extremo cuidado y una planeación no prevista al comienzo de la investigación y poco común para los campesinos quienes además de manejar un horario diferente (hora de dios). No fueron pocas las situaciones de malos entendidos por estar recorriendo el territorio, tomar fotos, o asistir a rituales sin el acuerdo de todos los presentes. Con lo anterior quiero decir, que estamos en un territorio geográfico y cultural en plena desposesión y en pleno cambio. Muchas veces sentí que en estas condiciones una investigación sobre el maíz era infructuosa. Ya finalizada la redacción, reconozco que el maíz es el centro de la vida campesina indígena de los mexicanos y de los tseltales de Tenejapa, que es una vía directa para comprender sus actividades políticas, económicas, culturales, religiosas, y sociales y por la tanto es un objeto de mediación que requiere ser mejor comprendido. Gracias a que mi estudio se enfoca en la conservación del maíz nativo pude conocer gente muy interesante dentro y fuera de las comunidades y acceder a rincones muy íntimos que los campesinos indígenas usualmente cierran a los foráneos y especialmente a los mestizos. Considero que la tesis contribuye a seguir abriendo ventanas de entendimiento más que a cerrarlas. Efectivamente, las interpretaciones de este trabajo pueden ser discutibles, pero nunca mal intencionadas. La necesidad de continuar realizando estudios desde diferentes perspectivas en las comunidades alteñas es crucial para poder entender el rol determinante del maíz nativo en México y poder defenderlo del esquema de despojo al que está, al igual que las comunidades indígenas, constantemente expuesto.

Au sein du système coton, les interactions entre les acteurs concernent la coordination au niveau de la production dans les pays concernés, mais aussi à celui des transactions du coton fibre dans le marché mondial. La dimension historique des travaux menés permet d'identifier les facteurs d'efficacité des arrangements institutionnels dans la production de coton dans les pays de l'Afrique Zone Franc. Elle conduit à expliquer la dynamique de cette production en faisant appel au corpus de l'économie industrielle des réseaux de service. Elle met en évidence que l'entrée des négociants multinationaux –à la faveur de la libéralisation en Afrique– a influé l'application des règlements entourant les transactions de coton à l'exportation, au détriment des pays producteurs. Le système d'utilisation des variétés transgéniques de coton, mais aussi du soja, est appréhendé à travers les interactions entre les sous-systèmes relatifs à la production par les paysans, aux firmes multinationales fournissant gènes, variétés et/ou semences, et aux institutions de régulation. Le sous-système de production est un sous-ensemble complexe, intégrant les interactions entre les pratiques des paysans producteurs et les réactions de la faune et de la flore de l'écosystème. Le caractère oligopolistique des marchés de variétés et de semences transgéniques est seulement manifeste dans les pays à recherche nationale peu développée. Ailleurs, la concurrence du marché peut être très forte, au point de nuire paradoxalement à sa durabilité, comme en Chine. L'approche historico-économique débouche sur une grille d'analyse de la gouvernance des règles d'utilisation des semences transgéniques, mettant en exergue la démission des instances de régulation dans la fixation des conditions économiques d'utilisation. L'option d'un recours quasi systématique aux variétés transgéniques, sans raisonnement de l'utilisation dans le temps et l'espace, est porteuse de risque de réduction d'efficacité et de rentabilité de ces variétés. Les activités de recherche en cours, ainsi que les perspectives d'activités à venir, restent ancrés dans les deux systèmes précédents. Elles visent d'une part à comprendre et à tirer des enseignements des acquis et limites du processus associatif et interprofessionnel de la production en Afrique cotonnière, et d'autre part à étudier l'efficacité des adaptations des acteurs en réponse aux réactions des écosystèmes face à l'utilisation peu raisonnée des variétés transgéniques. Une extension vers le sous-système familial dans la production, déjà amorcée, sera renforcée par la prise en compte du rôle des acteurs peu visibles, notamment les femmes.

La diversité des ressources génétiques est façonnée par de multiples facteurs in situ, parmi lesquels l'action anthropique joue un rôle majeur. La diffusion et la sélection des semences sont les principales pratiques humaines qui influencent l'évolution des plantes cultivées. Au sein des systèmes agricoles familiaux, les pratiques individuelles d'échange et de sélection ne sont pas indépendantes entre elles. En effet, l'organisation des sociétés a un impact considérable sur les pratiques individuelles des agriculteurs car elle influence la diffusion des semences et du savoir qui y est associé. L'objectif de cette thèse est d'améliorer notre compréhension des mécanismes par lesquels l'organisation des sociétés humaines influence l'organisation de la diversité des plantes cultivées in situ. Cette étude combine pour cela des approches de biologie des populations et d'anthropologie sociale et culturelle pour analyser la relation entre l'organisation des sociétés Chuka, Tharaka et Mbeere et l'organisation de la diversité du sorgho (Sorghum bicolor [L.] Moench) sur le versant est du mont Kenya. Dans un premier temps, cette étude décrit la distribution de la diversité du sorgho au regard de l'organisation des sociétés. Nous montrons que l'organisation ethnolinguistique structure la distribution de la diversité telle qu'elle est perçue par les agriculteurs (les variétés nommées), et telle que nous l'avons caractérisée à l'aide de marqueurs génétiques et phénotypiques. Cependant, ces deux approches de la diversité ne coïncident pas parfaitement, notamment car certaines variétés locales distinguées par les agriculteurs ne correspondent pas à des unités génétiques distinctes et homogènes. Ces résultats nous amènent à nous interroger sur la cohérence des taxonomies locales vis-à-vis de la structure de la diversité génétique et phénotypique. Dans un second temps, nous testons donc si les agriculteurs appartenant à un même groupe ethnolinguistique identifient, nomment et classent les variétés de manière similaire au regard de leurs caractéristiques phénotypiques, et si les taxonomies paysannes diffèrent entre les groupes. Ces analyses montrent que l'organisation des sociétés a un impact sur la diffusion des systèmes de taxonomies locaux. L'examen des réseaux d'échanges de semences permet de comprendre cette relation en montrant que les échanges de semences, et vraisemblablement du savoir qui y est associé, se font principalement entre personnes de même groupe ethnique. L'effet des différences de représentations, traduites par les taxonomies, sur les pratiques de sélection des semences est enfin discuté. Cette thèse montre donc que l'organisation des sociétés structure la diffusion des semences et du savoir, et qu'elle influence ainsi les pratiques individuelles de gestion de la diversité des agriculteurs. Cette approche pluridisciplinaire ouvre de nouvelles perspectives pour la caractérisation, la conservation et l'amélioration des ressources génétiques.

Mieux connaître les dynamiques de l'agrobiodiversité est nécessaire pour intégrer sa préservation et sa valorisation dans les stratégies d'augmentation de la productivité agricole. La dynamique de la diversité variétale du riz a été analysée dans la région de Vakinankaratra, Madagascar, en 2006, à travers des enquêtes collectives et individuelles auprès d'un échantillon de 1 050 exploitations réparties dans 32 villages, et par la collecte et la caractérisation des variétés de riz utilisées dans ces villages. La richesse variétale moyenne des villages (10,9) et des exploitations (2,2) est comparable à celle qui est observée dans d'autres agrosystèmes traditionnels, mais on observe une grande variabilité régionale dont les déterminants sont l'altitude, les systèmes agraires, les rizicultures pratiquées et la richesse des exploitations. Il existe une grande disparité dans la fréquence d'utilisation des variétés, un grand nombre de variétés " mineures " étant utilisées par moins de 10 % des exploitations. La gestion des semences se caractérise par l'absence de sélection pour la pureté variétale mais aussi par l'élimination des grains mal remplis. L'adoption de nouvelles pratiques de gestion des variétés et des semences, associée au développement récent de la riziculture pluviale, montre l'ouverture de ces agriculteurs aux innovations. Les perspectives du maintien de la diversité génétique in situ sont discutées.

National audience

Le Mali, pays sahélien est situé dans un centre de diversité d'espèces parmi lesquelles figurent les mils et sorghos. Ces deux espèces constituent la base de l'alimentation des populations rurales. La reproduction à la ferme représente la principale source d'approvisionnement en semences du paysan. Diverses raisons (sécheresse, mauvaise production, etc.), font que les paysans sont en permanence à la recherche de nouvelles variétés plus performantes. Pour cela ils ont recours à deux systèmes semenciers qui coexistent sur le même espace : le SSP, informel et le SSE formel. En général, aucun de ces systèmes ne couvre efficacement et complètement les besoins des paysans en semences de mil et sorgho. C'est ainsi que l'association des organisations professionnelles paysannes du Mali, après participation à des projets de recherche en sélection variétale a initié son propre programme de production/diffusion de semences certifiées par des coopératives (SS/Aopp). Le résultat de ce travail a mis en exergue la multiplicité des acteurs des réseaux de semenciers avec des ressources,, des approches et des moyens différents. Dans le SSE, le choix des variétés est fait par le SSN et les DRA. Du fait de la grande diversité des environnements et des préférences des producteurs, du nombre restreint de variétés et de centres de multiplication, il ne répond qu'à une minorité de situations. Le SS/Aopp diffuse des variétés améliorées à la satisfaction de ses adhérents. La qualité de ce réseau montre que le paysan n'est pas hostile aux variétés améliorées. Les différentes entités des réseaux en jeu avec leur articulation ont été formalisées pour produire un schéma générique d'analyse de la gestion des variétés de mils et sorghos dans un cadre de conservation in situ.

Available at http://www.agbioforum.org/v14n2/v14n2a02-fok.htm; International audience; In China, Bt-cotton varieties have been marketed since 1997 to help control attacks of some cotton pests, notably Helicoverpa armigera. It is estimated that Bt-cotton is currently grown on about 70% of the total Chinese cotton-growing area. Most studies have explained this broad distribution by the specific advantages of Bt-cotton, particularly the reduction in pesticide use but this has been put into question in more recent papers, which also raised the issue of seed prices. In our study based on datasets seldom used in earlier analyses, we argue that Bt-cotton use in China is related to the development of the cotton variety market through a two-phase phenomenon. Bt-cotton use has resulted from the development of the variety market facilitated by a favourable legal framework since the mid-1990s, but the current stiff competition is responsible for quality uncertainty and possibly for high seed pricing, thereby threatening the profitability and continued use of Bt-cotton, in addition to the development of the variety market. The quality seed subsidy policy was launched in 2007 to rectify the disorder in the variety and seed market, but the effectiveness of this regulation measure is debatable.

This paper presents a participatory modeling for multi-points of view description of a system from scientists' knowledge. The method is applied in the development of a generic model for agro-biodiversity dynamics in developing countries with a focus on crop genetics diversities evolution through the stakeholders' management at different scales. The model description is based on the knowledge of scientists from different disciplines and has been validated using role playing game with stakeholders in order to verify its relevance and coherencies. The model has been used to analyze the evolution of crops varietal diversity under two interventions scenarios: agricultural intervention and seeds intervention. The results show that agricultural interventions increase crop varietal diversity at global level more than the direct seeds interventions.

Quinoa cultivation in Chile presents an ancient and active complex of geographic, climatic, social and cultural interactions that has determined its current biodiversity in the three main growing zones (north, centre and south). These interactions consider a central issue viz. the participation of farmers, whose activities are at the base of seed exchanges networks due to their knowledge and in situ conservation of genetic diversity. In this study we report antecedents that contribute to a better understanding of seed exchanges through the analysis of field works assessing the key roles of farmers involved in the biodiversity dynamics and characterization of 20 microsatellites genetic markers in a multi-origin set of 34 representative quinoa accessions of Chile and South American region. The phenetic analysis of germplasm (UPGMA) was consistent with the current classification of quinoa ecotypes present in Chile and Andean zone. This allowed the identification of five population, which were represented by quinoa of Salares (northern Chile), Coastal/Lowlands (central and southern Chile), Highlands (Peru, Bolivia and Argentina) and Inter-Andean Valleys (Ecuador and Colombia). The good informative quality of the markers used revealed a wide genetic diversity among main growing areas in Chile, which correlates well with natural geographical-edaphic-climatic and social-linguistic context to the expansion of quinoa biodiversity. Additionally, the ancient seed exchanges reveals this process is still governed by an array of diverse agricultural practices of Andean farmers. Genetic erosion is considered a imminent risk due to small scale farming, where the increased migration of people to urban systems and exportation-driven influence can further reduce the cultivated diversity.

This article analyses the process of liberalisation and regulation of variety and seed markets in China through the specific case of Bt-cotton. The development of the markets addressed is linked to the intellectual property protection specified at the establishment of WTO that China joined in 2001. The Chinese institutional framework is studied here with the purpose of assessing the extent of its specificity relatively to other emerging countries, WTO member countries, and which also have adopted Bt-cotton (namely South Africa, India and Brazil). The Chinese case explored reveals a case of excessive competition that no emerging countries had thought about preventing in their sui generis systems. China has opted recently for an administrative approach to cope with the variety and seed "markets disorder", resulting from an excessive competition. By doing so, China violates a few measures of its sui generis system while the regulation modalities could hardly be effective., Cet article a pour objet d'examiner les processus de libéralisation et de régulation dans le développement des marchés de variétés et de semences en Chine, à partir du cas du coton-Bt. Ce développement est lié aux dispositions concernant la protection de la propriété intellectuelle, notamment spécifiée par l'OMC depuis sa création et dont la Chine est membre depuis fin 2001. Le cadre institutionnel chinois est étudié ici pour cerner son degré de spécificité, par comparaison avec celui d'autres pays émergeants, membres de l'OMC et ayant adopté le coton-Bt, parmi lesquels l'Afrique du Sud, l'Inde et le Brésil. L'analyse du cas chinois montre l'émergence d'une situation d'excès de concurrence que nul pays n'avait pensé à réguler dans son système de protection sui generis. L'option récente de la Chine de chercher à résoudre le problème de ‘désordre dans le marché', consécutif au développement d'une concurrence excessive, par une implication croissante de l'administration, transgresse plusieurs des dispositions légales qu'elle avait mises en place antérieurement. Ses modalités de mise en œuvre rendent son efficacité fort douteuse.

Ce document présente une partie des résultats d'une étude concernant le quinoa (Chenopodium quinoa willd.) effectuée auprès des communautés Mapuche de la région Araucanía au sud du Chili. L'objectif était d'évaluer les éléments de l'histoire du quinoa de cette région et le rôle des différents acteurs (agriculteurs et intitutions) impliqués dans la dynamique de biodiversité de cette plante. Tout d'abord, après que la conquête espagnole sa culture a quasi disparu, pour être remplacée par le riz et le blé dans le régime alimentaire des Mapuche. Néanmoins, quelques familles n'ont jamais cessé de cultiver le quinoa et ont conservé leurs variétés de famille. En 1996, une O.N.G. locale a commencé à développer des projets sur le quinoa, avec la constitution d'une première collection " landraces ", accompagné d'une récupération des savoirs locaux sur sa culture et ses usages, puis la réalisation d'ateliers sur les pratiques et des utilisations agricoles. Afin de recueillir toutes les informations concernant le quinoa, les systèmes de culture, la gestion des semences et les échanges, nous avons réalisé des enquêtes semi-structurées et qualitatives avec des paysans et des institutions de 4 villages représentant les deux zones agro-écologiques principales de la région. Le premier résultat est le fait que quoique plusieurs projets se soient développés il est clair que les paysans eux-mêmes sont les acteurs principaux de la conservation de biodiversité. Le deuxième résultat démontre qu'il y a deux types d'échanges dans les communautés et ils représentent l'accès principal aux semences. Le premier type est un échange " individuel " (entre personnes ou familles) à l'intérieur de la communauté. Le deuxième type est une sorte de marché traditionnel qui est organisé comme grand événement avec une cérémonie d'ouverture et la présentation de chaque participant. Dans chaque type d'échanges, nous pouvons noter les mêmes noms des participants principaux, appelés " Curadoras ". Ces agriculteurs semblent être particuliers et peuvent être comme " noeud de réseaux " parce qu'ils jouent un rôle essentiel dans des échanges et la circulation des semences (en cultivant un niveau élevé de la diversité, par la connaissance concernant les variétés et leur adaptation et les modes de gestion). En conclusion, ces fermiers nodaux participent à quasi tous les Trafkintüs (échanges) organisés dans la région, donnant une dynamique aux échanges et la confiance aux divers fermiers auxquels ils fournissent les semences. Le dernier et troisième résultat de cette étude est le fait que la même O.N.G. s'appuie sur la connaissance des systèmes semenciers locaux pour la conservation de diversité en organisant des ateliers entre les agriculteurs en mobilisant les " Curadoras ", qui participent activement comme formateurs.

Mieux connaître les dynamiques de l'agrobiodiversité est indispensable pour détecter les évolutions défavorables et élaborer des stratégies de conservation, en particulier dans les agrosystèmes traditionnels, encore peu affectés par l'intensification agricole. Une étude de la dynamique de la diversité et de la gestion des variétés et semences de riz a été entreprise dans la région de Vakinankaratra. Celle-ci, située au centre des hauts plateaux de Madagascar, se caractérise par une grande diversité agroécologique, des systèmes de production et des systèmes de culture du riz liée, notamment, aux variations de l'altitude (750-1950m). L'étude s'est appuyée, d'une part, sur des enquêtes (collectives et individuelles) auprès de 1050 exploitations réparties dans 32 villages, d'autre part, sur la collecte systématique et la caractérisation des variétés de riz maintenues dans ces villages, au moyen de descripteurs agro-morphologiques et moléculaires. La région héberge non seulement les 3 groupes majeurs d'O. sativa (indica, japonica tropical et japonica tempéré) mais aussi un groupe atypique, non répertorié ailleurs dans le monde. Ces derniers sont des riz irrigués plus proches des indica que des japonica ; leur habitat préférentiel est l'intervalle d'altitude 1250-1750m. La distribution éco-géographique de la diversité est façonnée par, respectivement, l'altitude, les systèmes de production et la richesse des exploitations. Elle est organisée en 4 strates : intervalle d'altitude, village, exploitation et parcelle. A chaque strate, la différentiation génétique entre les sous-ensembles représente jusqu'à 70% de la diversité totale. Les variétés locales ont une structure multi-lignées ; la fréquence des lignées constituantes varie entre exploitations et entre villages. Leurs distributions régionales peuvent être assimilées à des métapopulations fragmentées. Les variétés locales de riz sont des biens communautaires quasi sacrées. Les variétés améliorées cohabitent avec elles sans constituer de véritables menaces. Il existe une grande disparité dans la fréquence d'utilisation des variétés. Dans chaque village, 1-2 " variétés majeures " sont utilisées par plus de 50% des agriculteurs et plusieurs " variétés mineures " par moins de 10% d'entre eux. Les échanges de variétés et de semences sont limités entre villages, plus intenses à l'intérieur de chaque village. Les semences ne se vendent pas mais s'échangent. Un système de valeurs culturelles incite à la sélection pour l'homogénéité. Le système de constitution des lots de semences conduit à une sélection involontaire d'adaptation GxE. Le système vernaculaire de nomination, assez sophistiqué, n'est plus opérationnel qu'à l'échelle village ; il en résulte une faible consistance des noms de variétés entre villages ; et le nombre de variétés n'est plus un bon indicateur de la diversité régionale. L'introduction récente de la riziculture pluviale a engendré une nouvelle dynamique qui bouscule les pratiques traditionnelles de gestion des variétés et des semences. Les signes d'érosion observés parmi les variétés locales, incitent à l'analyse de l'évolution récente (4-5 dernières décennies) de la diversité et à la mise en place d'un observatoire pour le suivi des évolutions à venir. La conservation in-situ de la diversité doit s'inscrire dans des actions intégrées de développement rural. La recherche peut y contribuer par la valorisation des variétés locales dans des schémas de sélection participative et par une conservation dynamique de ces ressources sous forme de populations à large base génétique.

Quínoa (Chenopodium quinoa Willd.) is a crop that is distributed from Colombia to the south of Chile. His early presence in the Mapuche territory is described from the first moments that the white man income to the territory. The seed exchange systems represent one of the principal accesses to the seed for the Mapuche people. The aim of this study is to analyze the impacts of the forms of exchange (trafkintu) on the diversity of varieties by Mapuche farmers n the Araucania region. By means of a qualitative research developed across constructed and semi-constructed interview in Mapuche communities. A result identifies two modalities of seed exchange: (a) A public exchange that assembles farmers from diverse localities to exchange their seeds. (B) A traditional exchanges among neighbors or inside the widespread family. The majority of the interviewed peasants realize both modalities of exchange. The reactivation of the seeds flow across the seeds exchange or Trafkintu as public event, it has allowed to strengthen a spread and social practice that allows to generate an amplifier for the local agrobiodiversity and to allow spaces of agriculture knowledge exchange.

Le Mali, pays sahelien, est situe dans un centre de diversite d’especes parmi lesquelles figurent les mils et sorghos. Ces deux especes constituent la base de l’alimentation des populations rurales. La reproduction a la ferme represente la principale source d’approvisionnement en semences du paysan. Diverses raisons - secheresse, ou mauvaise production - font que les agriculteurs sont en permanence a la recherche de nouvelles varietes plus performantes. Le systeme semencier paysan (SSP), informel, est le principal fournisseur de semences pour le paysan, loin devant le systeme semencier formel (SSF), etatique. Cette note de recherche presente le cadre de diffusion des varietes ameliorees du SSF et le compare avec les mecanismes d’echanges de semences entre paysans dans le cadre du SSP. La discussion porte sur la capacite des deux systemes a assurer, d’une part, la diffusion de materiel genetique adapte aux besoins des paysans, et, d’autre part, la conservation des varietes traditionnelles. L’emergence d’organisations paysannes (OP) souhaitant jouer un role actif dans la multiplication des semences certifiees pour ameliorer l’approvisionnement de leurs membres en materiel ameliore pose la question de l’impact de ce role d’interface entre ces deux systemes semenciers. L’analyse s’appuie sur differents rapports et interviews des responsables des antennes regionales du SSF et divers travaux de Bazile et al. sur le SSP. L’utilisation de diagrammes en langage UML (Unified Modeling Language) permet de formaliser un modele conceptuel des deux systemes avec leurs interactions. En general, aucun de ces systemes ne couvre efficacement et completement les besoins des paysans en semences de mil et sorgho.

International audience; Due to its economic importance, Coffea arabica is becoming the subject of increasing genomic research and, in particular, the genes involved in the final chemical composition of the bean and the sensorial quality of the coffee beverage. The aim of the present study was to decipher the transcriptional networks that govern the development of the C. arabica seed, a model for nonorthodox albuminous seeds of tropical origin. For this purpose, we developed a transcriptomic approach combining two techniques: targeted cDNA arrays, containing 266 selected candidate gene sequences, and real-time RTPCR on a large subset of 111 genes. The combination of the two techniques allowed us to limit detection of false positives and to reveal the advantages of using large realtime RT-PCR screening. Multivariate analysis was conducted on both datasets and results were broadly convergent. First, principle component analysis (PCA) revealed a dramatic re-programming of the transcriptional machinery between early cell division and elongation, storage and maturation phases. Second, hierarchical clustering analysis (HCA) led to the identification of 11 distinct patterns of gene expression during seed development as well as to the detection of genes expressed at specific developmental stages that can be used as functional markers of phenological changes. In addition, this study led to the description of gene expression profiles for qualityrelated genes, most of them formerly uncharacterised in Coffea. Their involvement in storage compound synthesis and accumulation during endosperm development and final metabolic re-adjustments during maturation is discussed. (Résumé d'auteur)

We studied the regional genetic diversity and seed exchange dynamics of pearl millet landraces in south-western Niger. The genetic study was based on AFLP markers. We found significant genetic differentiation between landraces in different geographical areas of south-western Niger. However, the degree of differentiation was low insofar as only 1.9% of the total molecular diversity was due to regional differentiation, suggesting a relatively high gene flow. Anthropologic studies on farming practices have suggested that seed exchanges between farmers on a large geographical scale probably make a considerable contribution to this result. In order to test this hypothesis, the effects of seed exchange on the genetic diversity of landraces was analyzed on seed samples from two distant villages in contrasting areas of south-western Niger. Seeds imported by farmers into the southern village of Sina Koara did not differ significantly from locally grown landraces. By contrast, in the northern village of Alzou, several samples were genetically different from locally grown landraces and closer to southern accessions. These data suggest that the seed flow is preferentially from south to north, i.e. from an area with more favorable rainfall conditions. The potential consequences for the genetic diversity and adaptation of northern pearl millet landraces are discussed.

Notre étude traite de la gestion locale des variétés de céréales au Mali dans un objectif de conservation de la biodiversité. Pour pallier aux insuffisances de l'Etat, un système informel basé sur les réseaux sociaux existants s'est développé pour approvisionner les paysans en semences. Il permet la gestion collective d'un grand nombre de variétés traditionnelles. Notre recherche cherche à améliorer les connaissances sur ce système semencier traditionnel et notamment sur le rôle des différents acteurs en jeu dans le maintien de la biodiversité. La méthodologie repose sur les concepts de la modélisation d'accompagnement. Sur la base d'hypothèses initiales issues d'un travail d'enquête sur la gestion paysanne des variétés, nous avons produit une série de modèles remis en question au cours d'ateliers successifs utilisant les jeux de rôles et les systèmes multi-agents. Le résultat de ce travail est un modèle qui servira à simuler, avec l'ensemble des acteurs, de nouvelles régulations dans le cadre de la gestion collective de la biodiversité des céréales.

Cette étude décrit un projet de sélection participative de sorgho au Mali, dont l'objectif est d'abord de faciliter l'accès à des variétés améliorées et performantes pour un plus grand nombre de producteurs. Le projet s'intéresse à la phase de transition entre les tests d'évaluation des variétés, la production et la diffusion de semences. Le secteur semencier privé étant absent du Mali, le projet a mis l'accent sur la formation d'associations et d'organisations paysannes en renforçant leur capacité à conduire des évaluations à grande échelle, et à organiser la production et la commercialisation de la semence. Notre approche s'est centrée sur une collaboration étroite entre les producteurs, les services techniques et la recherche. Un diagnostic des forces et des compétences existant au sein du système semencier local a permis d'identifier des opportunités et le développement de plans d'action. Ces plans d'action ont servi de base à la conduite des activités et à l'élaboration des budgets. Des contrats ont été établis avec toutes les partenaires du projet pour faciliter le transfert des fonds et démarrer les activités de terrain.

En zone sud du Mali, l'augmentation de la fertilité des sols, conséquence de la fertilisation apportée sur le cotonnier, entraîne une demande importante pour l'intensification des cultures céréalières. Comme les performances des céréales locales sont faibles, les agriculteurs se tournent vers le maïs qui valorise mieux les intrants. Les céréales traditionnelles sont en voie de marginalisation sur les sols les plus pauvres. Pour enrayer l'érosion génétique des céréales locales, le défi à relever consiste donc à remonter leur productivité pour en faire une alternative plausible dans un système de culture intensifié. De nouveaux critères de sélection ont été définis alliant la qualité et la rusticité des variétés locales (photopériodisme, tallage, vitrosité du grain) avec la productivité du matériel moderne (réduction de taille des tiges, poids des grains). La méthodologie proposée combine des méthodes de sélection récurrente et de sélection participative directement dans le milieu cible. Le processus de sélection participative est abordé à travers les phases de diagnostic, brassage génétique, création participative et sélection participative. Notre définition de l'approche participative intègre à égalité, les avis des paysans, l'analyse de leurs pratiques et savoirs traditionnels et les contraintes environnementales propres à la zone. Nous montrons la part croissante du rôle du paysan au cours de ce processus. L'environnement et les pratiques traditionnelles jouent un rôle déterminant dans la phase de création variétale et de travail sur des populations recombinantes. Le rôle des paysans est accru lors de la phase de sélection participative quand les descendances sont suffisamment homogènes pour être traitées comme des variétés. II est risqué de rechercher à améliorer la précocité d'une culture en modifiant une seule composante de l'itinéraire technique. Donner une priorité exclusive aux affirmations des paysans amène à produire un matériel correspondant à leurs paradigmes ou à ceux des chercheurs mais pas nécessairement à leurs besoins. La sélection participative est un outil important pour l'amélioration du sorgho au Mali. Toutefois, cette démarche demande une approche pluridisciplinaire qui ne peut se contenter de la juxtaposition des domaines scientifiques (génétique, agronomie, sociologie etc.).

A cDNA-AFLP approach on Linum usitatissimum (flax) was used to identify genes specifically expressed during the seed maturation process. Among the 20 000 cDNA-AFLP tags produced, 486 were selected for their seed-specific expression during maturation. When compared with the publicly available databases, half of them presented some significant similarity with known plant sequences. The results obtained confirmed the accuracy of the approach as numerous genes previously described as being expressed exclusively in plant seeds were identified in this screen. The focus was on sequences similar to plant regulators involved in the control of gene expression, either at the transcriptional, post-transcriptional, or post-translational levels. Using a real-time RT-PCR approach, seed-specific expression kinetics were confirmed for 13 of these regulators that were never characterized for being expressed during seed maturation. Among these, a flax gene of the non-LEC1-like HAP3 family and a flax MYB factor were shown to be expressed in specialized tissues of flax embryo using an in situ hybridization approach. By expression kinetic comparison between these flax genes and their Arabidopsis counterparts, it was found that the new HAP3 gene should be related to a ubiquitous seed maturation mechanism, while a new MYB factor appears to be related to a more seed-specific maturation mechanism. These results demonstrate the utility of the flax database in not only identifying new genes expressed during seed maturation but also in being able to highlight the distinction between conserved and non-conserved seed maturation mechanisms.

Les structures variétales utilisables en sélection participative sont beaucoup plus variées que celles utilisables en sélection classique. En effet, la sélection participative en partenariat vise une demande très diversifiée qui peut inclure des systèmes de culture et des marchés fortement hétérogènes. Elle peut également aboutir à la création d'un marché semencier dans lequel les obtenteurs souhaitent faire reconnaître leur droit de propriété. Les structures variétales adéquates ne peuvent donc pas être calquées sur les solutions adoptées pour des systèmes relativement bien contrôlés et pour des marchés très standardisés et occupés par des entreprises semencières privées. Au contraire, dans cet article nous passons en revue les différents types variétaux existant suivant les régimes de reproduction des plantes et nous évaluons leurs avantages et leurs inconvénients vis-à-vis de situations particulières de SP.

The weight of the seeds of the cotton or "seed-index" (SI) it varies according to the cultivation conditions and the varieties. The SI it influences on the fiber percentage (%F) in the desmotadoras, besides their importance in connection with the germinative aptitude. The variations, in relation to the variety and the cultivation region, of SI and %F, they are studied with the data of the rehearsals of varieties carried out in different towns of the area of cultivation of the cotton in Paraguay (it was discarded rehearsals with SI inferior to 8 g, associated to fiber percentages also very low and indicating abnormal agronomic conditions). According to the town, the average plurianual of SI it varies of until + / - 0,7 g; for %F the variation is until + / - 2,5 points. The data show a negative relationship among SI and %F: heavier the seed, minor is the %F to the desmote. In consequence, the towns that donate heavier seeds usually give less fiber, but the correlation doesn't appear very strict: the east of the oriental region gives an SI bigger with inferior %F, but the north gives an SI a little inferior with %F also inferior. The data characterize the studied varieties well; Guazuncho 2 and Reba P279 shows an important effect of the variations of the SI on the %F (slopes -0,8 at -1,0), while with IAN 338 and CD 401 the slopes are smaller and he/she gets lost less in %F when the SI it increases.

Publication Inra prise en compte dans l'analyse bibliométrique des publications scientifiques mondiales sur les Fruits, les Légumes et la Pomme de terre. Période 2000-2012. http://prodinra.inra.fr/record/256699; International audience; The seed consists of several layers of specialized cell-types that divide and differentiate following a highly regulated programme in time and space. A cytological approach was undertaken in order to study the histo-differentiation at mid-embryogenesis in Medicago truncatula as a model legume, and in Pisum sativum using serial sections of embedded immature seed. Little published information is available about seed development in Medicago species. The observations from this study revealed a number of distinctive features of Medicago seed development and differentiation. Transfer cells, involved in nutrient transfer to the embryo, were clearly identified in the thin-walled parenchyma of the innermost integument. Histological Schiff–naphthol enabled carbohydrate accumulation to be followed in the different seed compartments, and revealed the storage protein bodies. Non-radioactive mRNA in situ hybridization, was carried out using mRNA probes from two highly expressed genes encoding the major vicilin and legumin A storage protein types. The timing of mRNA expression was related to that of the corresponding proteins already identified.

A partir des variétés locales collectées lors de campagnes de prospections nationales, les centres de recherche agronomique développent des variétés améliorées. Les services de l'Etat se chargent ensuite de la diffusion des semences auprès des paysans. Mais il apparaît d'une part que le budget de l'Etat des pays du Sud ne permet pas ni de conserver dans de bonnes conditions les variétés acquises ni de poursuivre et d'achever ce travail d'inventaire. Et d'autre part, le service semencier national est incapable diffuser l'information en milieu rural sur les nouvelles variétés dans un pays où les moyens de communications sont extrêmement limités. Il en ressort que les variétés améliorées représentent aujourd'hui moins de 5% des surfaces cultivées en sorgho et en mil au Mali. Pour pallier aux insuffisances de l'Etat pour l'approvisionnement en semences de qualité des paysans, un système informel basé sur les réseaux sociaux existants s'est développé. Il permet la gestion collective d'un grand nombre de variétés traditionnelles utilisées ensuite selon les stratégies individuelles propres à chaque exploitation. Le système traditionnel de gestion des semences permet ainsi une utilisation de la biodiversité pour des stratégies individuelles de production sans la contrainte de la gestion en propre d'un grand nombre de variétés. La conservation des écotypes est gérée de façon collective (bien commun) et les systèmes d'échanges non marchands permettent à chaque individu d'accéder aux ressources génétiques. Le fait que ces échanges sont gratuits constitue un des fondements de la solidarité des sociétés traditionnelles face aux difficultés du milieu. La structuration actuelle des organisations paysannes développe maintenant un réseau intermédiaire entre le système formel de l'Etat et le système informel des paysans. Elles constituent désormais un pont entre les deux systèmes en maintenant les réseaux informels et y introduisant des variétés améliorées par un accès à l'information du système semencier national.

Les 16 Etats membres de l'Organisation africaine de la propriété intellectuelle ont établi un régime de protection des variétés végétales en 1999 qui instaure la création d'un Certificat d'Obtention Végétale sur le modèle établi par l'UPOV. Les conditions d'obtention sont la nouveauté, la distinction, l'homogénéité, la stabilité de la variété et une dénomination conforme aux règles. Le COV est valable dans les 16 pays membres durant 25 ans. Cependant, ce système ne devrait être opérationnel qu'en 2006 après l'adoption du règlement technique et des procédures administratives. Le Cameroun, qui a ratifié le Protocole de Carthagène, a promulgué en 2003, une loi définissant le régime de sécurité en matière de biotechnologie moderne. La loi régit la mise au point, le développement, l'usage, la manipulation et le transport des OGM, ainsi que la sécurisation des produits dérivés. Elle n'entrera en vigueur qu'après la signature des décrets d'application, soit pas avant 2005. Cette loi permettra de tester des OGM au Cameroun sous des conditions strictes. Les objectifs du programme d'amélioration variétale du cotonnier de l'Irad sont d'améliorer la productivité, la précocité, le rendement égrenage, la longueur de la fibre et sa ténacité. Les lignées produites ces dernières années combinaient productivité élevée à fort rendement à l'égrenage, mais les niveaux de ténacité ou de micronaire de la fibre avaient baissé et ces lignées ont été refusées. Des croisements ont été entrepris pour corriger ces défauts. Une attention particulière est également portée sur le seed-index qui atteint la limite inférieure à ne pas dépasser. Le programme d'expérimentation et de création variétale est actif. Une simplification des essais variétaux est proposée. Un effort très important a été réalisé pour élargir la variabilité génétique exploitée. Cet effort portera ses fruits à terme. Les lignées BC4 (Guazuncho 2 * VH 8) à fibre longue et tenace, issues de la sélection assistée par marqueurs seront plus spécialement suivies. Un travail de croisement par des variétés locales sera probablement indispensable. Les nouvelles fonctions de Célestin Klassou qui occupent une grande partie de son temps et le fait que le programme est divisé sur deux stations, nécessitent la présence d'un second sélectionneur camerounais. Palaï Oumarou, très motivé, devrait suivre une formation diplômante pour obtenir le statut de chercheur. C'est une priorité pour le programme de sélection. La réception des résultats d'analyse technologique de la fibre avant la mise en place de la nouvelle campagne est primordiale pour l'efficacité du programme de sélection. Pour cela, une meilleure coordination entre le laboratoire du Cirad à Montpellier et la section de génétique de l'Irad est nécessaire. Le montage du laboratoire de technologie et l'installation d'une chaîne Cmi (ex Hvi) qui pourra réaliser des analyses pour la recherche, est une priorité pour le Cameroun. Enfin, des problèmes de pureté variétale sont constatés depuis plusieurs années sur la semence fournie aux agriculteurs. Des améliorations de la filière semencière sont proposées.