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Successive ecological filtering processes including dispersal limitation (species ability to reach an environment), environmental filtering (local abiotic constraints to species settlement) and biotic interactions among plants (competition, facilitation) and across trophic levels act upon regional species pools to form dynamic and transient plant assemblages. Native herbivorous ungulates regularly disperse numerous diaspores (zoochory), create local chemical and physical heterogeneity through small scale soil disturbance (ecosystem engineering) and also selectively consume plants (herbivory), whereby they shape plant assemblages by intervening in the different ecological filtering processes. The ecological processes through which large ungulates locally affect both abiotic and biotic conditions make plant communities more susceptible to invasion by non-resident species (both native colonizers and exotic invaders); I therefore discuss ungulates' role in shaping plant assemblages within the framework of the theory of invasibility proposed by Davis et al. (2000). Here, I specifically highlight how complementary zoochorous processes in a guild of large ungulates affect the composition and spatial distribution patterns of plant assemblages. In this manuscript, I present different results addressing the different filtering effects. For instance, results from a trait-based meta-analysis show how endozoochory, hoof- and hair-epizoochory differentially filter the regional species pool. Interactions among vectors, seeds and plant traits also intervene in the seed dispersal cycle (emigration, transfer and settlement) and seed dispersal effectiveness. I also highlight how closely ungulates may combine seed dispersal with abiotic filtering. My colleagues and I show that herbivorous ungulates, as selective and daily long-distance seed dispersal vectors, play a role in determining the spatial and temporal dynamics of meta-communities. These animals are likely to affect plant responses to global changes such as habitat fragmentation, land use changes and climate warming, and may have contributed to plant migration patterns since the last glaciation. As primary consumers they also occupy an in-between position within the food web and may thus compete for feeding resources with other groups such as insects with potential trophic cascading effects on bird communities. Through the many interactions ungulates are involved in, we have to consider their global role as dynamic actors in ecosystem functioning and potential tools to rehabilitate degraded habitats via seed dispersal and associated engineering effects. / Les processus successifs de filtrage écologique dont le frein à la dispersion (la capacité des plantes à atteindre un environnement), le filtre environnemental (contraintes abiotiques locales à l'installation des plantes), et les interactions biotiques entre plantes (compétition, facilitation) et avec d'autres niveaux trophiques agissent sur le pool régional de plantes pour créer localement des assemblages de plantes dynamiques et transitoires. Les ongulés herbivores autochtones dispersent régulièrement de nombreuses diaspores (zoochorie), créent localement de l'hétérogénéité chimique et physique par des perturbations du sol de faible surface (effets d'ingénierie) et consomment sélectivement les plantes (herbivorie), façonnant ainsi les assemblages de plantes en intervenant à chaque niveau de filtrage écologique. Les processus écologiques par lesquels les grands ongulés affectent localement les conditions abiotiques et biotiques rendent les communautés de plantes plus sujettes à l'invasion par des espèces non résidentes (à la fois colonisatrices autochtones et invasives exotiques) ; je discute ainsi du rôle des ongulés sauvages dans la fluctuation des ressources disponibles pour l'assemblage des communautés végétales dans le cadre de la théorie de l'invasibilité proposée par Davis et al. (2000). En particulier, j'illustre comment les mécanismes complémentaires de dispersion zoochore par une guilde de grands ongulés modulent la composition et les patrons de distribution spatiale des assemblages de plantes. Je présente dans ce manuscrit différents résultats traitant des effets des ongulés sauvages comme filtre écologique. Par exemple, une méta-analyse européenne basée sur les traits des plantes montre comment l'endozoochorie, l'épizoochorie sous les sabots et dans le pelage filtrent différentiellement le pool régional de plantes. Les interactions entre traits des vecteurs, des diaspores et des plantes interviennent dans les trois phases de la dispersion (émigration, transfert et immigration) et l'efficacité de la dispersion. Je mets aussi en évidence comment les ongulés combinent étroitement zoochorie et effets d'ingénierie physique et chimique. Ainsi, mes collègues et moi suggérons que les ongulés herbivores, en tant que vecteurs quotidiens, sélectifs et à longue distance des diaspores peuvent jouer un rôle déterminant dans les dynamiques spatiales et temporelles des méta-communautés. Ces animaux sont susceptibles de moduler la réponse des plantes aux changements globaux contemporains : fragmentation des habitats, changement d'utilisation des terres et réchauffement climatique, et ont probablement contribué aux patrons passés de migration post-glaciaire. En tant que consommateurs primaires, ils occupent une position clé au sein de la chaîne alimentaire et peuvent ainsi concurrencer d'autres groupes, comme l'entomofaune, dans l'accès aux ressources avec de potentiels effets de cascades trophiques sur les communautés d'oiseaux. Au travers des multiples interactions dans lesquelles sont impliqués les ongulés sauvages, nous avons à les considérer plus généralement comme des acteurs dynamiques dans les assemblages de plantes, le fonctionnement des écosystèmes et des agents potentiels de restauration d'habitats dégradés via la zoochorie et les effets associés d'ingénierie.

National audience; The objective is to study the cross effects of: - stand composition (pure oak, pure pine, mixed pine-oak) and - stand density (number of trees/ha) combined with - presence of wild ungulates (roe deer, wild boar, red deer), on the ecosystem functioning such as tree productivity, resource use and allocation (including water and nutrients), biodiversity and understory vegetation dynamics including regeneration.

/ Le but de cette étude est d'évaluer l'influence respective de l'exploitation forestière, de la structure et du paysage sur les communautés de chiroptères et d'oiseaux en forêt exploitée et non exploitée en France. Nos résultats montrent que la richesse totale de l'avifaune et des chiroptères, la richesse des oiseaux forestiers et des chiroptères de lisière augmente faiblement avec le volume total de bois mort. La richesse des oiseaux généralistes, des omnivores et des cavicoles est légèrement plus élevée dans les forêts non exploitées. Les chiroptères glaneurs sont positivement influencés par la densité de bois mort debout. Par contre, les variables paysagères retenues n'ont que peu d'influence sur la biodiversité. Malgré des effets assez faibles, notre étude confirme l'intérêt du bois mort pour la diversité de ces groupes.

/ Le réseau des réserves forestières (naturelles et biologiques) constitue un formidable support d'étude de la dynamique et de la biodiversité forestière. Néanmoins, et jusque récemment, seuls quelques sites avaient fait l'objet d'une évaluation précise du bois mort, dont l'importance pour la survie de nombreuses espèces forestières n'est plus à démontrer. Dans ce contexte et à la demande des gestionnaires, un protocole de suivi dendrométrique destiné aux réserves forestières (PSDRF) a été élaboré en 2005, sous la conduite de l'ENGREF. Par le biais de placettes permanentes, sa mise en oe½uvre permet non seulement de décrire les peuplements forestiers échantillonnés mais aussi d'approfondir les connaissances sur la dynamique de ces peuplements dans le temps et l'espace. Coordonné depuis 2008 dans le cadre d'un partenariat entre l'ONF et RNF, ce protocole a, à ce jour, été appliqué sur plus de 80 réserves, soit plus de 7000 placettes relevées sur près de 40 000 ha et couvrant ainsi la majorité des grands types d'habitats forestiers français. En moyenne, on observe que les réserves contiennent un volume de bois mort non négligeable (moyenne : 37,1 m3/ha, variant de 5 à 150 m3/ha). A quelques exceptions près, les réserves intégrales contiennent plus de bois mort que les réserves qui font l'objet d'une exploitation.

/ Une sylviculture intensive peut simplifier la structure, la composition et la dynamique forestière, notamment en occultant les vieux peuplements et en réduisant la densité de bois mort et de dendro-microhabitats. Dans ce contexte, soustraire des zones forestières à l'exploitation peut préserver la biodiversité associée. Néanmoins, ces zones représentent un manque à gagner conséquent pour le gestionnaire forestier. Afin de concilier des objectifs de production et de conservation de la biodiversité, des structures de protection temporaires, appelées îlots de vieillissement, ont été proposées et récemment mises en place dans les forêts publiques françaises (Instruction ONF « Biodiversité » 2009). Ces peuplements bénéficient d'un cycle sylvicole prolongé, mais sont exploités avant leur effondrement. L'efficacité de cette mesure pour la biodiversité est controversée. L'objectif de cette étude est d'analyser (i) l'effet de l'extension du cycle sylvicole sur les caractéristiques structurelles de chênaies matures et (ii) l'impact de ces éventuelles modifications sur les assemblages de coléoptères du bois mort (i.e. saproxyliques). En allongeant le cycle de futaie régulière de la chênaie atlantique d'une durée de 2 aménagements (50 ans), les arbres matures grossiront en moyenne en diamètre de 70 à 80 cm (DBH) d'après le taux d'accroissement annuel. La proportion d'arbres de diamètre supérieur à 80cm a été choisie pour traduire l'effet dendrométrique d'un allongement du cycle de 50 ans. Dans 11 massifs du nord de la France, nous avons sélectionné 27 futaies régulières de chêne avec des densités croissantes (0 à 100%) de très gros arbres (DBH > 80cm). La diversité des coléoptères saproxyliques et les caractéristiques environnementales (bois mort, densité et diversité des dendro-microhabitats et ouverture du milieu) de 81 placettes de 1ha ont été mesurées. Nos résultats démontrent qu'une telle extension du cycle sylvicole n'affecte significativement ni les conditions d'habitat, ni la biodiversité des insectes saproxyliques.