1. Molecular findings and clinical data in a cohort of 150 patients with anophthalmia/microphthalmia
- Author
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Chassaing, N., Causse, A., Vigouroux, A., Delahayes, A., Alessandri, J.-L., Boespflug-Tanguy, O., Boute-Benejean, O., Dollfus, H., Duban-Bedu, B., Gilbert-Dussardier, B., Giuliano, F., Gonzales, M., Holder-Espinasse, M., Isidor, B., Jacquemont, M.-L., Lacombe, D., Martin-Coignard, D., Mathieu-Dramard, M., Odent, S., Picone, O., Pinson, L., Quelin, C., Sigaudy, Sabine, Toutain, A., Thauvin-Robinet, C., Kaplan, Josseline, Calvas, Patrick, CHU Toulouse [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UFR Santé, Médecine et Biologie Humaine (UFR SMBH), Université Sorbonne Paris Nord, Physiopathologie et neuroprotection des atteintes du cerveau en développement, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de génétique médicale, CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Groupe Hospitalier de l'Institut Catholique de Lille (GHICL), Hôpital de la Milétrie, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Hôpital Archet 2 [Nice] (CHU), Universidad Politécnica de Madrid (UPM), CHU Trousseau [APHP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 - UFR de Médecine Pierre et Marie Curie (UPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Bordeaux [Bordeaux], Laboratoire Maladies Rares: Génétique et Métabolisme (Bordeaux) (U1211 INSERM/MRGM), Université de Bordeaux (UB)-Groupe hospitalier Pellegrin-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), CHU Amiens-Picardie, Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS), Faculté des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques / Laboratoire d'Hygiène et de Santé Publique, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Génie des procédés frigorifiques (UR GPAN), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Service de génétique clinique, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Production du lait (PL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Service de Génétique et de Diagnostic Prénatal, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], Université catholique de Lille (UCL), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Toulouse (UT), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques ( INERIS ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Génie des procédés frigorifiques ( UR GPAN ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Universidad Politécnica de Madrid ( UPM ), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Production du lait ( PL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
Male ,PAX6 Transcription Factor ,RAX ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,SOX2 ,Growth Differentiation Factor 6 ,anophthalmia ,MESH: Anophthalmos / genetics ,MESH: Forkhead Transcription Factors / genetics ,MESH: Child ,Microphthalmos ,Paired Box Transcription Factors ,Child ,MESH: Anophthalmos / pathology ,MESH: Microphthalmos / pathology ,Otx Transcription Factors ,GDF6 ,MESH: Genetic Heterogeneity ,Forkhead Transcription Factors ,MESH: Infant ,MESH: PAX6 Transcription Factor ,Child, Preschool ,Female ,MESH: SOXB1 Transcription Factors / genetics ,Adult ,MESH: Otx Transcription Factors / genetics ,Adolescent ,MESH: Eye Proteins / genetics ,MESH: Anophthalmos / diagnosis ,MESH: Transcription Factors / genetics ,MESH: Microphthalmos / diagnosis ,Genetic Heterogeneity ,MESH: Point Mutation / genetics ,Humans ,Point Mutation ,VSX2 ,Eye Proteins ,MESH: Homeodomain Proteins / genetics ,Homeodomain Proteins ,MESH: Adolescent ,MESH: Humans ,[ SDV ] Life Sciences [q-bio] ,SOXB1 Transcription Factors ,MESH: Child, Preschool ,MESH: Microphthalmos / genetics ,Anophthalmos ,Infant ,MESH: Adult ,MESH: Paired Box Transcription Factors / genetics ,MESH: Growth Differentiation Factor 6 / genetics ,eye diseases ,MESH: Repressor Proteins / genetics ,MESH: Male ,PAX6 ,Repressor Proteins ,microphthalmia ,FOXE3 ,sense organs ,MESH: Female ,Transcription Factors ,OTX2 - Abstract
International audience; Anophthalmia and microphthalmia (AM) are the most severe malformations of the eye, corresponding respectively to reduced size or absent ocular globe. Wide genetic heterogeneity has been reported and different genes have been demonstrated to be causative of syndromic and non-syndromic forms of AM. We screened seven AM genes [GDF6 (growth differentiation factor 6), FOXE3 (forkhead box E3), OTX2 (orthodenticle protein homolog 2), PAX6 (paired box 6), RAX (retina and anterior neural fold homeobox), SOX2 (SRY sex determining region Y-box 2), and VSX2 (visual system homeobox 2 gene)] in a cohort of 150 patients with isolated or syndromic AM. The causative genetic defect was identified in 21% of the patients (32/150). Point mutations were identified by direct sequencing of these genes in 25 patients (13 in SOX2, 4 in RAX, 3 in OTX2, 2 in FOXE3, 1 in VSX2, 1 in PAX6, and 1 in GDF6). In addition eight gene deletions (five SOX2, two OTX2 and one RAX) were identified using a semi-quantitative multiplex polymerase chain reaction (PCR) [quantitative multiplex PCR amplification of short fluorescent fragments (QMPSF)]. The causative genetic defect was identified in 21% of the patients. This result contributes to our knowledge of the molecular basis of AM, and will facilitate accurate genetic counselling.
- Published
- 2014
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