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La sélection d’animaux efficaces est un enjeu majeur pour les filières animales, que ce soit pour des raisons économiques, mais aussi agro-environnementales. En effet, sélectionner des animaux efficaces permet de limiter les quantités ingérées et les émissions de polluants (gaz à effet de serre et résidus azotés). Chez les ovins allaitants, nous avons montré que la consommation résiduelle (CR) est un critère de sélection héritable (h²=0,41) corrélé génétiquement à la quantité de concentré ingérée par jour (rg=+0,73). La mise en place de lignées divergentes sur la CR (mesurée avec une alimentation concentrée) en race Romane permet 1) de mieux comprendre les mécanismes biologiques impliqués dans l’efficacité alimentaire et 2) d’évaluer les conséquences de la sélection génétique de ce critère d’efficacité alimentaire sur une diversité d’autres caractères (croissance, engraissement, développement musculaire, …) mais aussi lorsque les animaux ont une ration fourragère. Après deux générations de sélection, la divergence est marquée puisqu’elle s’élève à 1,9 écart-type génétique. Nous avons montré que les animaux efficaces (CR-) avec une ration concentrée mangent également moins de fourrage (103 g en moins par jour par animal) que les animaux peu efficaces (CR+) tout en ayant des niveaux de croissance équivalents. Des différences significatives entre CR- et CR+ se retrouvent au niveau du microbiote ruminal, Selecting efficient animals is a major concern for livestock production, not only for economic but also for agro-environmental purposes. The selection of efficient animals leads to a decrease of feed intakes and limits pollutant emissions (greenhouse gases and nitrogen). In meat sheep, we demonstrated that Residual Feed Intake (CR) is a heritable selection criteria (h²=0.41) which is genetically correlated to average daily feed intake (rg=+0.73) under a concentrated diet. We setup a divergent selection experiment on CR (under a concentrated diet) in the Romane breed in order to 1) have a better understanding of biological processes underlying feed efficiency and 2) to evaluate the consequences of the genetic divergence on feed efficiency over a panel of traits (growth, fattening, muscular development,…), also when animals are fed with forages. After two generations of selection, the divergence is marked since it reaches 1.9 genetic standard deviations. Efficient animals (CR-) under a concentrated diet also have a lower daily feed intake with a forage-based diet (103 g less) than less efficient animals (CR+) while displaying similar growth. Significant differences between CR- and CR+ animals were also described at the level of the rumen microbiota.

National audience; Roussin de la Hague sheep society select young rams at the Breeding Centre from May to July every year. The first selection step is based on prolificacy and maternal estimated breeding values. Since 2010, the Cotentin-Avranchin- Roussin breeding organism has initiated a phenotyping action on genetic resistance to internal parasitism following natural infestation when rams pasture beside the Breeding Centre. From 2010 to 2012, fecal egg counts (FEC) sampled at entrance (end of May), after 1 month (end of June) and after 2 months (end of July) showed weak infestations that made selection of rams on the resistance trait impossible. In 2013, the pasture was previously grazed by outdoor ewes in order to contaminate the pasture. In 2013 results were similar to those of 2012. In 2014 the infectious power of the ewes was controlled by individual FEC. At the end of June the level of infection allowed the ranking of rams. In 2015, FEC at the end of June allowed little differentiation however, that at the end of July allowed ranking of a new batch of young rams.; La race ovine Roussin de la Hague sélectionne ses béliers dans un centre d’Elevage entre mai et juillet de chaque année sur des index sur ascendance de prolificité et de valeur laitière. Depuis 2010, l’Organisme de Sélection Cotentin-Avranchin-Roussin (OSCAR) a initié une action de phénotypage de la résistance au parasitisme gastrointestinal en infestation naturelle à l’aide d’une pâture attenante au Centre d’Elevage. De 2010 à 2012, les coproscopies réalisées à l’entrée (fin mai), à 1 mois (fin juin) et à 2 mois (fin juillet) ont montré des infestations notables mais insuffisantes pour pratiquer une sélection sur la résistance des béliers. A partir de 2013, la prairie a été au préalable pâturée par des brebis d’herbage et ainsi rendue contaminante. En 2013 les résultats ont été semblables à 2012. En 2014 le pouvoir contaminateur des brebis a été contrôlé par des coproscopies individuelles. La coproscopie de fin juin a permis un classement des béliers. En 2015, la coproscopie de fin juin était peu discriminante mais celle de fin juillet l’était beaucoup plus et a permis un classement des béliers.

National audience; La sélection génétique des petits ruminants est une stratégie d’intérêt pour limiter les infestations par les nématodes gastro-intestinaux. La résistance à ces parasites peut être utilisée en sélection puisqu’elle est mesurable par le comptage d’œufs dans les fèces, héritable et génétiquement peu ou pas corrélée aux autres critères en sélection. Les évaluations génétiques de la résistance menées dans quelques races ont permis de montrer l’efficacité de la sélection. La mise en place de la sélection sur la résistance au parasitisme dans les schémas de sélection nécessitera la création de plateformes permettant de faire face au nombre de mesures à réaliser et le suivi de l’évolution de la population parasitaire afin de prévenir un potentiel contournement de la résistance de l’hôte par les parasites. Enfin la résistance est un levier d’action à intégrer avec d’autres (la nutrition, la gestion des prairies et les traitements anthelminthiques). Des modèles sont développés pour conseiller les éleveurs dans le choix d’une stratégie intégrée et optimale pour leur système d’élevage.

National audience; La sélection génétique des petits ruminants est une stratégie d’intérêt pour limiter les infestations par les nématodes gastro-intestinaux. La résistance à ces parasites peut être utilisée en sélection puisqu’elle est mesurable par le comptage d’œufs dans les fèces, héritable et génétiquement peu ou pas corrélée aux autres critères en sélection. Les évaluations génétiques de la résistance menées dans quelques races ont permis de montrer l’efficacité de la sélection. La mise en place de la sélection sur la résistance au parasitisme dans les schémas de sélection nécessitera la création de plateformes permettant de faire face au nombre de mesures à réaliser et le suivi de l’évolution de la population parasitaire afin de prévenir un potentiel contournement de la résistance de l’hôte par les parasites. Enfin la résistance est un levier d’action à intégrer avec d’autres (la nutrition, la gestion des prairies et les traitements anthelminthiques). Des modèles sont développés pour conseiller les éleveurs dans le choix d’une stratégie intégrée et optimale pour leur système d’élevage.

La race ovine Roussin de la Hague sélectionne ses béliers dans un centre d’Elevage entre mai et juillet de chaque année sur des index sur ascendance de prolificité et de valeur laitière. Depuis 2010, l’Organisme de Sélection Cotentin-Avranchin-Roussin (OSCAR) a initié une action de phénotypage de la résistance au parasitisme gastrointestinal en infestation naturelle à l’aide d’une pâture attenante au Centre d’Elevage. De 2010 à 2012, les coproscopies réalisées à l’entrée (fin mai), à 1 mois (fin juin) et à 2 mois (fin juillet) ont montré des infestations notables mais insuffisantes pour pratiquer une sélection sur la résistance des béliers. A partir de 2013, la prairie a été au préalable pâturée par des brebis d’herbage et ainsi rendue contaminante. En 2013 les résultats ont été semblables à 2012. En 2014 le pouvoir contaminateur des brebis a été contrôlé par des coproscopies individuelles. La coproscopie de fin juin a permis un classement des béliers. En 2015, la coproscopie de fin juin était peu discriminante mais celle de fin juillet l’était beaucoup plus et a permis un classement des béliers., Roussin de la Hague sheep society select young rams at the Breeding Centre from May to July every year. The first selection step is based on prolificacy and maternal estimated breeding values. Since 2010, the Cotentin-Avranchin- Roussin breeding organism has initiated a phenotyping action on genetic resistance to internal parasitism following natural infestation when rams pasture beside the Breeding Centre. From 2010 to 2012, fecal egg counts (FEC) sampled at entrance (end of May), after 1 month (end of June) and after 2 months (end of July) showed weak infestations that made selection of rams on the resistance trait impossible. In 2013, the pasture was previously grazed by outdoor ewes in order to contaminate the pasture. In 2013 results were similar to those of 2012. In 2014 the infectious power of the ewes was controlled by individual FEC. At the end of June the level of infection allowed the ranking of rams. In 2015, FEC at the end of June allowed little differentiation however, that at the end of July allowed ranking of a new batch of young rams.

Chapitre 6; National audience

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"Chantier qualité spécifique "Auteurs Externes" département de Génétique animale : uniquement liaison auteur au référentiel HR-Access "; International audience; In this study, the potential association of PrP genotypes with ewe reproductive traits and lamb growth traits was investigated. Data were included on ewes and lambs of the INRA 401 breed from the Bourges-La Sapinie`re INRA experimental farm. This breed was chosen because of good breeding (prolificacy and maternal abilities) and carcass qualities, and the large number of available animals with performance records and PrP genotypes. Ewes were categorized into 3 PrP genotype classes: ARR homozygous, ARR heterozygous, and animals without any ARR haplotype. Two analyses differing in the traits considered were carried out. Firstly, the potential association of the PrP genotype of ewes with their reproduction traits (fertility, litter size, and ovulation rate) was studied. The data included 801, 779, and 587 genotyped ewes for fertility, litter size, and ovulation rate, respectively. Secondly, the association of the PrP genotype of the ewes with growth traits of their lambs (birth weight, ADG between 10 and 30 d of age) was investigated. The data included 3,749 and 3,512 lambs for birth weight and ADG, respectively. The different traits were analyzed using an animal model, where the PrP genotype effect was included as a fixed effect. The reproductive traits were modeled under a probit or a threshold approach. The results of this study indicate no evidence of an association between PrP genotypes and reproductive and growth traits. It is unlikely that selection for scrapie resistance will have an effect on the reproductive or performance traits studied in the INRA 401 breed.

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Stratégies pour l'amélioration génétique des ovins et caprins; International audience

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