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6 results on '"Geoffroy, Véronique"'

1. Mutations in TUBGCP4 Alter Microtubule Organization via the γ-Tubulin Ring Complex in Autosomal-Recessive Microcephaly with Chorioretinopathy

Author

Scheidecker, Sophie, Etard, Christelle, Haren, Laurence, Stoetzel, Corinne, Hull, Sarah, Arno, Gavin, Plagnol, Vincent, Drunat, Séverine, Passemard, Sandrine, Toutain, Annick, Obringer, Cathy, Koob, Mériam, Geoffroy, Véronique, Marion, Vincent, Strähle, Uwe, Ostergaard, Pia, Verloes, Alain, Merdes, Andreas, Moore, Anthony T, and Dollfus, Hélène

Subjects
Intellectual and Developmental Disabilities (IDD), Congenital Structural Anomalies, Rare Diseases, Brain Disorders, Neurosciences, Genetics, Clinical Research, Eye Disease and Disorders of Vision, Pediatric, 2.1 Biological and endogenous factors, Aetiology, Eye, Base Sequence, Choroid Diseases, Exome, Eye Diseases, Hereditary, Frameshift Mutation, France, Gene Components, Humans, Microcephaly, Microtubule-Associated Proteins, Microtubules, Molecular Sequence Data, Pedigree, Retinal Diseases, Sequence Analysis, DNA, Tubulin, Biological Sciences, Medical and Health Sciences, Genetics & Heredity
Abstract

We have identified TUBGCP4 variants in individuals with autosomal-recessive microcephaly and chorioretinopathy. Whole-exome sequencing performed on one family with two affected siblings and independently on another family with one affected child revealed compound-heterozygous mutations in TUBGCP4. Subsequent Sanger sequencing was performed on a panel of individuals from 12 French families affected by microcephaly and ophthalmic manifestations, and one other individual was identified with compound-heterozygous mutations in TUBGCP4. One synonymous variant was common to all three families and was shown to induce exon skipping; the other mutations were frameshift mutations and a deletion. TUBGCP4 encodes γ-tubulin complex protein 4, a component belonging to the γ-tubulin ring complex (γ-TuRC) and known to regulate the nucleation and organization of microtubules. Functional analysis of individual fibroblasts disclosed reduced levels of the γ-TuRC, altered nucleation and organization of microtubules, abnormal nuclear shape, and aneuploidy. Moreover, zebrafish treated with morpholinos against tubgcp4 were found to have reduced head volume and eye developmental anomalies with chorioretinal dysplasia. In summary, the identification of TUBGCP4 mutations in individuals with microcephaly and a spectrum of anomalies in eye development, particularly photoreceptor anomalies, provides evidence of an important role for the γ-TuRC in brain and eye development.

Published
2015

2. Exome sequencing of Bardet–Biedl syndrome patient identifies a null mutation in the BBSome subunit BBIP1 (BBS18)

Author

Scheidecker, Sophie, Etard, Christelle, Pierce, Nathan W, Geoffroy, Véronique, Schaefer, Elise, Muller, Jean, Chennen, Kirsley, Flori, Elisabeth, Pelletier, Valérie, Poch, Olivier, Marion, Vincent, Stoetzel, Corinne, Strähle, Uwe, Nachury, Maxence V, and Dollfus, Hélène

Subjects
Biological Sciences, Bioinformatics and Computational Biology, Biomedical and Clinical Sciences, Genetics, Rare Diseases, Clinical Research, Congenital Structural Anomalies, Neurodegenerative, Intellectual and Developmental Disabilities (IDD), Pediatric, Brain Disorders, 2.1 Biological and endogenous factors, Aetiology, Animals, Bardet-Biedl Syndrome, Base Sequence, Carrier Proteins, Codon, Nonsense, Consanguinity, DNA Mutational Analysis, Exome, Fibroblasts, Genetic Association Studies, Genetic Linkage, HEK293 Cells, Humans, Male, Middle Aged, Molecular Sequence Annotation, Pedigree, Phenotype, Polymorphism, Single Nucleotide, Zebrafish, Clinical Genetics, Diagnostics Tests, Genetic Screening, Counselling, Molecular Genetics, Ophthalmology, Genetic Screening/Counselling, Medical and Health Sciences, Genetics & Heredity, Clinical sciences
Abstract

BackgroundBardet-Biedl syndrome (BBS) is a recessive and genetically heterogeneous ciliopathy characterised by retinitis pigmentosa, obesity, kidney dysfunction, postaxial polydactyly, behavioural dysfunction and hypogonadism. 7 of the 17 BBS gene products identified to date assemble together with the protein BBIP1/BBIP10 into the BBSome, a protein complex that ferries signalling receptors to and from cilia.Methods and resultsExome sequencing performed on a sporadic BBS case revealed for the first time a homozygous stop mutation (NM_001195306: c.173T>G, p.Leu58*) in the BBIP1 gene. This mutation is pathogenic since no BBIP1 protein could be detected in fibroblasts from the patient, and BBIP1[Leu58*] is unable to associate with the BBSome subunit BBS4.ConclusionsThese findings identify BBIP1 as the 18th BBS gene (BBS18) and suggest that BBSome assembly may represent a unifying pathomechanism for BBS.

Published
2014

3. Proteasome subunit PSMC3 variants cause neurosensory syndrome combining deafness and cataract due to proteotoxic stress

Author

Kröll-Hermi, Ariane, Ebstein, Frédéric, Stoetzel, Corinne, Geoffroy, Véronique, Schaefer, Elise, Scheidecker, Sophie, Bär, Séverine, Takamiya, Masanari, Kawakami, Koichi, Zieba, Barbara, Studer, Fouzia, Pelletier, Valérie, Eyermann, Carine, Speeg‐schatz, Claude, Laugel, Vincent, Lipsker, Dan, Sandron, Florian, Mcginn, Steven, Boland, Anne, Deleuze, Jean‐françois, Kuhn, Lauriane, Chicher, Johana, Hammann, Philippe, Friant, Sylvie, Etard, Christelle, Krüger, Elke, Muller, Jean, Strähle, Uwe, Dollfus, Hélène, Friant, Sylvie, Laboratoire de Génétique Médicale (LGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Karlsruher Institut für Technologie (KIT), Institut für Medizinische Biochemie und Molekularbiologie (IMBM), Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Toxicology and Genetics (ITG), Karlsruhe Institute of Technology (KIT), National Institute of Genetics (NIG), Centre de référence pour les affections ophtalmologiques héréditaires (CARGO), Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Les Hôptaux universitaires de Strasbourg (HUS), CHU Strasbourg, Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), and Institute of Toxicology and Genetics [Karlsruhe] (ITG)

Subjects
Male, Medicine (General), Proteasome Endopeptidase Complex, Adolescent, [SDV]Life Sciences [q-bio], Gene Therapy & Genetic Disease, QH426-470, Deafness, Article, Cataract, Consanguinity, R5-920, Stress, Physiological, Genetics, Animals, Humans, Child, Zebrafish, Nuclear Respiratory Factor 1, Ubiquitin, Infant, Articles, Syndrome, Zebrafish Proteins, PSMC3, Pedigree, [SDV] Life Sciences [q-bio], proteasome, Phenotype, Child, Preschool, Mutation, Proteolysis, ATPases Associated with Diverse Cellular Activities, Female, PSMC3 Subject Categories Genetics, Genetics, Gene Therapy & Genetic Disease, Proteasome Inhibitors, neurosensory disease, Neuroscience
Abstract

The ubiquitin–proteasome system degrades ubiquitin‐modified proteins to maintain protein homeostasis and to control signalling. Whole‐genome sequencing of patients with severe deafness and early‐onset cataracts as part of a neurological, sensorial and cutaneous novel syndrome identified a unique deep intronic homozygous variant in the PSMC3 gene, encoding the proteasome ATPase subunit Rpt5, which lead to the transcription of a cryptic exon. The proteasome content and activity in patient's fibroblasts was however unaffected. Nevertheless, patient's cells exhibited impaired protein homeostasis characterized by accumulation of ubiquitinated proteins suggesting severe proteotoxic stress. Indeed, the TCF11/Nrf1 transcriptional pathway allowing proteasome recovery after proteasome inhibition is permanently activated in the patient's fibroblasts. Upon chemical proteasome inhibition, this pathway was however impaired in patient's cells, which were unable to compensate for proteotoxic stress although a higher proteasome content and activity. Zebrafish modelling for knockout in PSMC3 remarkably reproduced the human phenotype with inner ear development anomalies as well as cataracts, suggesting that Rpt5 plays a major role in inner ear, lens and central nervous system development., Whole genome sequencing in a large consanguineous family with neurosensory syndrome revealed a unique homozygous deep intronic pathogenic variant in PSMC3, encoding one of the proteasome subunit. Further in vitro and in vivo analyses confirmed the pathogenicity of the PSMC3 mutation.

Published
2020
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4. Whole-genome sequencing in patients with ciliopathies uncovers a novel recurrent tandem duplication in IFT140

Author

Geoffroy, Véronique, Stoetzel, Corinne, Scheidecker, Sophie, Schaefer, Elise, Perrault, Isabelle, Bär, Séverine, Kröll, Ariane, Delbarre, Marion, Antin, Manuela, Leuvrey, Anne-Sophie, Henry, Charline, Blanché, Hélène, Decker, Eva, Kloth, Katja, Klaus, Günter, Mache, Christoph, Martin-Coignard, Dominique, McGinn, Steven, Boland, Anne, Deleuze, Jean-François, Friant, Sylvie, Saunier, Sophie, Rozet, Jean-Michel, Bergmann, Carsten, Dollfus, Hélène, Muller, Jean, Laboratoire de Génétique Médicale (LGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Néphropathies héréditaires et rein en développement (UMR_S 983), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Fondation Jean Dausset - Centre d’Etudes du Polymorphisme Humain [Paris] (CEPH), Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg] (UKE), Philipps Universität Marburg = Philipps University of Marburg, Medical University of Graz, Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire des Maladies Rénales Héréditaires = Laboratory of Hereditary Kidney Diseases (Equipe Inserm U1163 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), University Hospital Freiburg, Centre de Référence pour les Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO) et Service de Génétique Médicale, and Hôpitaux Universitaires de Strasbourg

Subjects
Male, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Heterozygote, Cerebellar Ataxia, Whole Genome Sequencing, [SDV]Life Sciences [q-bio], Homozygote, copy number variation, structural variation, Exons, Alu-mediated recombination, Ciliopathies, Pedigree, Phenotype, whole-genome sequencing, Alu Elements, IFT140, Mainzer-Saldino syndrome, Databases, Genetic, Mutation, tandem duplication, Humans, Female, Carrier Proteins, Retinitis Pigmentosa
Abstract

International audience; Ciliopathies represent a wide spectrum of rare diseases with overlapping phenotypes and a high genetic heterogeneity. Among those, IFT140 is implicated in a variety of phenotypes ranging from isolated retinis pigmentosa to more syndromic cases. Using whole-genome sequencing in patients with uncharacterized ciliopathies, we identified a novel recurrent tandem duplication of exon 27-30 (6.7 kb) in IFT140, c.3454-488_4182+2588dup p.(Tyr1152_Thr1394dup), missed by whole-exome sequencing. Pathogenicity of the mutation was assessed on the patients' skin fibroblasts. Several hundreds of patients with a ciliopathy phenotype were screened and biallelic mutations were identified in 11 families representing 12 pathogenic variants of which seven are novel. Among those unrelated families especially with a Mainzer-Saldino syndrome, eight carried the same tandem duplication (two at the homozygous state and six at the heterozygous state). In conclusion, we demonstrated the implication of structural variations in IFT140-related diseases expanding its mutation spectrum. We also provide evidences for a unique genomic event mediated by an Alu-Alu recombination occurring on a shared haplotype. We confirm that whole-genome sequencing can be instrumental in the ability to detect structural variants for genomic disorders.

Published
2018
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5. A targeted next-generation sequencing assay for the molecular diagnosis of genetic disorders with orodental involvement

Author

Prasad, Megana K., Geoffroy, Véronique, Vicaire, Serge, Jost, Bernard, Dumas, Michael, Le Gras, Stéphanie, Switala, Marzena, Gasse, Barbara, Laugel-Haushalter, Virginie, Paschaki, Marie, Leheup, Bruno, Droz, Dominique, Dalstein, Amelie, Loing, Adeline, Grollemund, Bruno, Muller-Bolla, Michèle, Lopez-Cazaux, Serena, Minoux, Maryline, Jung, Sophie, Obry, Frédéric, Vogt, Vincent, Davideau, Jean-Luc, Davit-Béal, Tiphaine, Kaiser, Anne-Sophie, Moog, Ute, Richard, Béatrice, Morrier, Jean-Jacques, Duprez, Jean-Pierre, Odent, Sylvie, Bailleul-Forestier, Isabelle, Rousset, Monique Marie, Merametdijan, Laure, Toutain, Annick, Joseph, Clara, Giuliano, Fabienne, Dahlet, Jean-Christophe, Courval, Aymeric, Alloussi, Mustapha El, Laouina, Samir, Soskin, Sylvie, Guffon, Nathalie, Dieux, Anne, Doray, Bérénice, Feierabend, Stephanie, Ginglinger, Emmanuelle, Fournier, Benjamin, De la Dure Molla, Muriel, Alembik, Yves, Tardieu, Corinne, Clauss, François, Berdal, Ariane, Stoetzel, Corinne, Manière, Marie Cécile, Dollfus, Hélène, Bloch-Zupan, Agnès, Laboratoire de Génétique Médicale (LGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Evolution Paris Seine, Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire (CGPhiMC), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Génétique Médicale Pédiatrique [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service d'anatomo-pathologie [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Institut de recherches interdisciplinaires sur les sciences et la technologie (IRIST), Université de Strasbourg (UNISTRA), Université Nice Sophia Antipolis - Faculté de Chirurgie Dentaire (UNS UFR Odontologie), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Service d’Odontologie Conservatrice et Pédiatrique [CHU Nantes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre de compétences Malformations orales et dentaires rares [CHU Nantes], Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Immuno-Rhumatologie Moléculaire, Evolution et développement du squelette (EDS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Systématique, adaptation, évolution (SAE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institute of Human Genetics, Universität Heidelberg [Heidelberg], Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service de génétique [Tours], Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Dpt génétique médicale [CHU Nice], Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de Génétique clinique, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de Génétique Médicale, Hôpital Civil, Strasbourg, Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] (CH E.Muller Mulhouse), Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace (GHTHA), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Medical Genetics, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Chirurgie orthopédique et pédiatrique [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Hôpitaux universitaires, Département Odontologie Pédiatrique, Centre de Référence National pour les maladies génétiques à expression odontologique, Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche Biomatériaux Innovants et Interfaces (URB2i (URP_4462)), Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Heidelberg University, Université de Lyon, Service de génétique clinique [Rennes], Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Lille, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Nantes Université (Nantes Univ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Université de Nice Sophia-Antipolis (UNSA), Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg, Les Hôptaux universitaires de Strasbourg (HUS), CHU Strasbourg, Université Mohammed V de Rabat [Agdal] (UM5), CHU Lyon, Universitäts Klinikum Freiburg = University Medical Center Freiburg (Uniklinik), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Rothschild [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Anthropologie bio-culturelle, Droit, Ethique et Santé (ADES), Aix Marseille Université (AMU)-EFS ALPES MEDITERRANEE-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre de Référence pour les Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO) et Service de Génétique Médicale, Faculté de chirurgie dentaire - Strasbourg, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Evolution Paris-Seine, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Service de Consultations et de Traitements Dentaires [HCL, Lyon], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire ( IGBMC ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), DNA Microarrays and Sequencing Platform, Université des Antilles et de la Guyane ( UAG ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Médecine Infantile III et Génétique Clinique [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux ( NGERE ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Lorraine ( UL ), Service d'Odontologie [CHRU Nancy], Faculté de Chirurgie Dentaire, Human Genetics Institute, Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -CHU Pontchaillou [Rennes]-Hôpital Sud, CHU Pontchaillou [Rennes], Hôpital Bretonneau-CHRU Tours, Service de génétique médicale, Hôpital l'Archet, Centre de Référence des Maladies Héréditaires du Métabolisme, Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] ( HFME ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Service de Génétique, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre de Recherche des Cordeliers ( CRC ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de cytogénétique, CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Anthropologie bio-culturelle, Droit, Ethique et Santé ( ADES ), Aix Marseille Université ( AMU ) -EFS ALPES MEDITERRANEE-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Faculté dentaire, Université de Strasbourg, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de Référence des Maladies Rares de la Face et de la Cavité Buccale ( MAFACE ), Laboratoire de Génétique Médicale, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg]-AVENIR-Inserm, Faculté de Chirurgie Dentaire de Strasbourg, Reference Centre for Oro-dental Manifestations of Rare Diseases, Pôle de Médecine et Chirurgie Bucco-Dentaires-Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service de Génétique Médicale [CHRU Nancy], COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - 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Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Référence des Maladies Rares de la Face et de la Cavité Buccale (MAFACE), Hôpital Rothschild [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-INSERM U 132, Hôpital Necker - Enfants Malades, Paris, France, Université Paris Cité (UPC)-Université Sorbonne Paris Nord, CHU Toulouse [Toulouse], University of Mohammed V, École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPC), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), INSERM U 132, Hôpital Necker - Enfants Malades, Paris, France-Hôpital Rothschild [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)

Subjects
Amelogenesis Imperfecta, Hearing Loss, Sensorineural, [SDV]Life Sciences [q-bio], Aucun, Chromosome Disorders, Genetic screening/counselling, Autoantigens, methods, Cohort Studies, Methods, Genetics, Humans, genetics, Genome-wide, Molecular genetics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Tooth Abnormalities, Chromosomes, Human, Pair 11, High-Throughput Nucleotide Sequencing, Reproducibility of Results, Non-Fibrillar Collagens, Coloboma, Dentin Dysplasia, Mutation, France, Chromosome Deletion, Diagnostics tests
Abstract

BACKGROUND: Orodental diseases include several clinically and genetically heterogeneous disorders that can present in isolation or as part of a genetic syndrome. Due to the vast number of genes implicated in these disorders, establishing a molecular diagnosis can be challenging. We aimed to develop a targeted next-generation sequencing (NGS) assay to diagnose mutations and potentially identify novel genes mutated in this group of disorders. METHODS: We designed an NGS gene panel that targets 585 known and candidate genes in orodental disease. We screened a cohort of 101 unrelated patients without a molecular diagnosis referred to the Reference Centre for Oro-Dental Manifestations of Rare Diseases, Strasbourg, France, for a variety of orodental disorders including isolated and syndromic amelogenesis imperfecta (AI), isolated and syndromic selective tooth agenesis (STHAG), isolated and syndromic dentinogenesis imperfecta, isolated dentin dysplasia, otodental dysplasia and primary failure of tooth eruption. RESULTS: We discovered 21 novel pathogenic variants and identified the causative mutation in 39 unrelated patients in known genes (overall diagnostic rate: 39%). Among the largest subcohorts of patients with isolated AI (50 unrelated patients) and isolated STHAG (21 unrelated patients), we had a definitive diagnosis in 14 (27%) and 15 cases (71%), respectively. Surprisingly, COL17A1 mutations accounted for the majority of autosomal-dominant AI cases. CONCLUSIONS: We have developed a novel targeted NGS assay for the efficient molecular diagnosis of a wide variety of orodental diseases. Furthermore, our panel will contribute to better understanding the contribution of these genes to orodental disease. TRIAL REGISTRATION NUMBERS: NCT01746121 and NCT02397824. journal article research support, non-u.s. gov't 2016 Feb 2015 10 26 imported

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2016
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6. Corrigendum: Detection of a Novel DSPP Mutation by NGS in a Population Isolate in Madagascar.

Author

Bloch-Zupan, Agnès, Huckert, Mathilde, Stoetzel, Corinne, Meyer, Julia, Geoffroy, Véronique, Razafindrakoto, Rabisoa W., Ralison, Saholy N., Randrianaivo, Jean-Claude, Ralison, Georgette, Andriamasinoro, Rija O., Ramanampamaharana, Rija H., Randrianazary, Solofomanantsoa E., Ralimanana, Louise H., Richard, Béatrice, Gorry, Philippe, Manière, Marie-Cécile, Rasoamananjara, Jeanne A., Alson, Simone Rakoto, and Dollfus, Hélène

Subjects
ECOLOGICAL carrying capacity, GENETIC mutation
Abstract

A correction to the article "Detection of a Novel DSPP Mutation by NGS in a Population Isolate in Madagascar," by M. Huckert and colleagues that was published in the 2016 issue is presented.

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2016
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