Background: Post-operative pain is the major consequence of Kṣārasūtra, Seton technique employed in Ayurvedic management of Low anal fistula. Surgeons are forced to prescribe Opioids and NSAIDs with pronounced untoward effects. Non pharmacological measures like Balneotherapy are used to improve circulation and relieve spasm in contemporary sciences. Aim: To compare the efficacy of Khadira (Acacia catechu) and Sphaṭika (Potash alum) hot sitzbath with plain hot sitzbath in patients of low anal fistula treated with Kṣārasūtra. Method: The study was single blind, double armed; prospective, randomized control clinical trial in which 30 patients were randomly allocated into two groups of 15 each on the basis of inclusion and exclusion criteria. Group A received hot sitzbath using Acacia catechu and alum infusion twice daily for 21 days. Group B received hot sitzbath using warm water for 21 days. The assessments were made on pain, post-surgical satisfaction burning sensation, tenderness, discharge, constipation, itching and incontinence. Result: The disease was prevalent in the 4th decade of life, more in males (86.67%) involved in sedentary work (53.33%) residing in urban domicile, consuming mixed diet (100%). Both groups showed statistically significant improvement in outcome measures like pain, burning sensation, tenderness, discharge, constipation and itching. Conclusion: On comparative analysis Acacia and Alum hot sitzbath was more effective in outcomes like pain, surgical satisfaction, burning sensation and discharge. There was no difference in the effect of both interventions with respect to outcome measures like constipation, itching and incontinence. Resumo: Justificativa: A dor pós-operatória é a principal consequência da técnica que utiliza seton de Kṣārasūtra no tratamento ayurvédico de fístula anal baixa. Os cirurgiões são impelidos a prescrever opiáceos e AINEs que possuem efeitos indesejáveis pronunciados. Medidas não farmacológicas como a balneoterapia são usadas nas ciências contemporâneas para melhorar a circulação e aliviar o espasmo. Objetivo: Comparar a eficácia do banho quente de assento com Khadira (Acacia catechu) e Sphaṭika (Potash alum) com apenas banho de assento em pacientes com fístula anal baixa tratados com Kṣārasūtra. Método: Estudo clínico prospectivo, cego e controlado de dois braços randomizados, no qual 30 pacientes foram alocados aleatoriamente em dois grupos de 15 pacientes cada com base nos critérios de inclusão e exclusão. O Grupo A recebeu banho de assento com Acacia catechu e infusão de alume duas vezes ao dia por 21 dias. O Grupo B recebeu banho de assento com água morna por 21 dias. Os desfechos avaliados foram dor, satisfação pós-cirúrgica, sensação de queimação, sensibilidade, corrimento, constipação, prurido e incontinência. Resultado: A doença foi prevalente na 4ª década de vida, mais frequente no sexo masculino (86,67%), nos envolvidos em trabalho sedentário (53,33%), nos residentes em domicílios urbanos e nos que consumiam dieta mista (100%). Ambos os grupos apresentaram melhora estatisticamente significativa na avaliação dos resultados, tais como dor, sensação de queimação, sensibilidade, corrimento, constipação e prurido. Conclusão: Na análise comparativa, o banho quente de assento com acácia e alume foi mais eficaz nos desfechos de dor, satisfação cirúrgica, sensação de queimação e corrimento. Não houve diferença em relação ao efeito de ambas as intervenções sobre os desfechos de constipação, prurido e incontinência.