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Objectifs: Étudier l’évolution de l’incidence et les modalités de prise en charge des MICI dans la région de Franche-Comté. Matériels et Méthodes: Étude rétrospective incluant tous les enfants de 15 ans ou moins résidant dans la région et ayant eu un diagnostic de MICI entre janvier 2000 et janvier 2010. Résultats: 70 enfants ont développé une MICI. L’incidence annuelle globale était de 3 pour 100 000 enfants, 1,83 pour la maladie de Crohn, 1 pour la RCH et 0,17 pour les colites inclassées. L’incidence a augmenté pour la maladie de Crohn de 1,7 à 1,9. Les principaux signes cliniques étaient les rectorragies (96 %) et les diarrhées (75 %) pour la RCH et les diarrhées (79 %) et les douleurs abdominales (79 %) pour la maladie de Crohn. Tous les patients avaient eu une coloscopie et 77 % une fibroscopie haute. La localisation était iléo-colique (63 %) dans la maladie de Crohn et pancolique (68 %) dans la RCH. Le suivi a évolué : de 2000 à 2005 un suivi par les gastro-entérologues (72 % des patients) et de 2005 à 2010 un suivi par un gastro-pédiatre (73 %). Conclusion: L’incidence des MICI en Franche-Comté est proche de celle des études antérieures. Cette étude rapporte de manière originale l’effet d’un suivi gastropédiatrique sur les modalités diagnostiques et la prise en charge. [ABSTRACT FROM AUTHOR]