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Estudos a partir de dados genéticos são importantes para o conhecimento da variabilidade genética das populações, além de fornecer parâmetros para escolha de progenitores. Nos estudos para analisar o quão distante geneticamente um genótipo é de outro são utilizados métodos da estatística multivariada, permitindo unificar múltiplas informações de um conjunto de caracteres. Assim, o presente trabalho tem como objetivo utilizar dados de caracteres agronômicos de milho na aplicação do algoritmo de agrupamento fuzzy c-means, a fim de auxiliar na caracterização dos grupos obtidos, observando por meio do grau de relação do indivíduo com o grupo, qual tipo de indivíduo se agrega a um certo grupo. Foram identificados três agrupamentos com características específicas e os indivíduos do agrupamento 1 apresentaram desempenho agronômico superior quando comparados com os indivíduos dos outros agrupamentos., Revista de Ciências Agrárias, Vol 42 No 3 (2019)

Submitted by ARIADNE FARES SABBAG (ariadne.sabbag@gmail.com) on 2019-09-09T20:28:59Z No. of bitstreams: 1 Tese_AriadneFaresSabbag_jul2019.pdf: 17377456 bytes, checksum: 8e198d1e44f71c23adc853312d2a0cb5 (MD5) Rejected by Adriana Ap. Puerta Buzzá (dripuerta@rc.unesp.br), reason: Prezada Ariadne, O documento enviado para a coleção Campus Unesp Rio Claro foi recusado pelo(s) seguinte(s) motivo(s): - Há 2 folhas de aprovação. Deixar somente o Certificação de Aprovação (que consta as assinaturas) e excluir a página sem assinaturas e que constam o nome dos membros da banca e seus suplentes (folha sem assinatura) - Colocar no formulário de preenchimento o financiador Fapesp, além do CNPq. - Se o financiamento da FAPESP estiver vinculado algum processo, favor incluir o número do processo nos agradecimentos, pois isso é uma exigência da FAPESP, além de incluir o nome FAPESP por extenso, conforme o seguinte modelo: processo nº aaaa/nnnnn-d, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) - Resumo e Abstract: faltam as palavras-chave em português e inglês Maiores informações: http://ib.rc.unesp.br/Home/Biblioteca37/repositorio_fluxograma_unesp_rioclaro.jpg Agradecemos a compreensão e aguardamos o envio do novo arquivo. Atenciosamente, Biblioteca Campus Rio Claro Repositório Institucional UNESP https://repositorio.unesp.br on 2019-09-12T11:29:20Z (GMT) Submitted by ARIADNE FARES SABBAG (ariadne.sabbag@gmail.com) on 2019-09-13T19:32:06Z No. of bitstreams: 1 Tese_AriadneFaresSabbag_jul2019.pdf: 17339177 bytes, checksum: 09e33f97b4cc66101f7da0f3db4880c8 (MD5) Rejected by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: - Agradecimento FAPESP: no capítulo “Agradecimentos” é necessário colocar o nome completo da agência de fomento, a sigla e o número do processo: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo – FAPESP, número do processo: - Agradecimento CNPq: no capítulo “Agradecimentos” é necessário colocar o nome completo da agência de fomento e a sigla: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq. Agradecemos a compreensão. on 2019-09-16T13:16:05Z (GMT) Submitted by ARIADNE FARES SABBAG (ariadne.sabbag@gmail.com) on 2019-09-16T15:46:13Z No. of bitstreams: 1 Tese_AriadneFaresSabbag_jul2019.pdf: 17203555 bytes, checksum: 44c72c24f804f629cbe03c6ae2443495 (MD5) Approved for entry into archive by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br) on 2019-09-16T19:24:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 sabbag_af_dr_rcla_par.pdf: 3183107 bytes, checksum: 5f4b27fb68b2c469927e7b8e909f8658 (MD5) Made available in DSpace on 2019-09-16T19:24:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 sabbag_af_dr_rcla_par.pdf: 3183107 bytes, checksum: 5f4b27fb68b2c469927e7b8e909f8658 (MD5) Previous issue date: 2019-07-19 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Thoropa Cope, 1865 (Anura: Cycloramphidae) é um gênero de rãs endêmicas do domínio Mata Atlântica e de ecótonos associados. Possui atualmente seis espécies (T. miliaris, T. petropolitana, T. taophora, T. lutzi, T. megatympanum e T. saxatilis), divididas em dois grupos morfológicos: grupo petropolitana (T. petropolitana e T. lutzi) e grupo miliaris (T. miliaris, T. taophora, T. megatympanum e T. saxatilis). Todas as espécies se reproduzem e se desenvolvem em rochas molhadas de água doce, encontradas em afloramentos rochosos, cachoeiras e riachos. Um estudo recente sobre a filogenia molecular mostrou que T. miliaris é parafilética a T. taophora, e que T. taophora, T. megatympanum e T. saxatilis são monofiléticas com alto suporte (Sabbag et al. 2018). Esse estudo também encontrou diversos clados dentro de cada uma das espécies, especialmente em T. miliaris. Porém, não foi possível estudarem molecularmente as espécies do grupo petropolitana porque existe apenas uma amostra de DNA disponível para o grupo. No presente trabalho, estudamos aspectos genéticos e morfológicos das seis espécies do gênero a fim de investigar a diversidade molecular previamente encontrada, a parafilia de T. miliaris e as características morfológicas das espécies que coincidam com a diversidade genética conhecida. Encontramos que os clados conhecidos de T. miliaris são linhagens evoluindo separadamente e que os clados conhecidos de T. taophora fazem parte de uma linhagem única. Thoropa miliaris e T. taophora são reciprocamente monofiléticas. Também encontramos que a diversificação desse complexo de espécies parece ter ocorrido muito mais tarde do que havia sido publicado. As espécies do grupo petropolitana possuem algumas diferenças morfológicas externas em adultos e larvas que permite distingui-las do grupo miliaris. Dentro do grupo miliaris é possível distinguir T. megatympanum e T. saxatilis, embora com poucas características diagnósticas. Dentro do complexo T. miliaris + T. taophora, entretanto, não encontramos características morfológicas que coincidam com a diversidade genética conhecida e tampouco pudemos diferenciar as duas espécies válidas. Fizemos também uma revisão taxonômica de T. petropolitana com a designação de um neótipo. Thoropa Cope, 1865 (Anura: Cycloramphidae) is a frog genus endemic to theAtlantic forest domain and associated ecotones. It comprises six species (T. miliaris, T. petropolitana, T. taophora, T. lutzi, T. megatympanum and T. saxatilis), divided in two morphological groups: petropolitana group (T. petropolitana and T. lutzi) and miliaris group (T. miliaris, T. taophora, T. megatympanum and T. saxatilis). All the species reproduce and develop in freshwater wet rocks that can be found in rock outcrops, waterfalls and streams. A recent study on molecular phylogeny has shown that T. miliaris is paraphyletic in respect to T. taophora and that T. taophora, T. megatympanum and T. saxatilis are monophyletic with high support. This study also found many clades inside each of those species, especially within T. miliaris. Nevertheless, it was not possible to study molecular aspects of the petropolitana group because there is only one DNA sample available for the group. In this work, we studied genetic and morphological aspects of all six species of the genus in order to investigate the molecular diversity found previously, the paraphyly found for T. miliaris, and the species morphological characteristics that coincide with the known genetic diversity. We found that the known clades of T. miliaris are separately evolving lineages and that the clades of T. taophora are part of a whole lineage. Thoropa miliaris and T. taophora are reciprocally monophyletic. We also found that the diversification of this species complex seems to have happened much later than previously known. The species of petropolitana group possesses some external morphological differences in adults and larvae that allow them to be separated from species of the miliaris group. Within miliaris group it is possible to distinguish T. megatympanum and T. saxatilis although with few diagnostic characteristics. Inside the complex T. miliaris + T. taophora, however, we could not find morphological characteristics that coincide with the known genetic diversity, neither we could differentiate the two valid species. We also did a taxonomic review of T. petropolitana with a neotype designation. CNPq: 141454/2015-6

Ao longo dos anos os ecólogos tentam entender a diversidade de atributos em comunidades e como isso reflete na maneira como as espécies respondem ao gradiente ambiental. Sabe-se que diferentes condições ambientais como a temperatura, precipitação e produtividade são capazes de selecionar atributos e resultar em diferentes configurações de padrões de diversidade funcional. Essas respostas ao gradiente podem estar estruturadas na filogenia, onde linhagens mais próximas filogeneticamente deveriam responder de maneira mais similar quando comparadas a linhagens menos aparentadas. Além disso, dadas as diferentes histórias e origens evolutivas das linhagens (por exemplo, famílias), as mesmas podem responder de maneiras diferentes quando comparadas com grupos inteiros (por exemplo, ordens). Assim sendo, tivemos como objetivo entender se o clima atual e o gradiente de produtividade são capazes de explicar a diversidade de atributos das linhagens de aves e mamíferos no continente americano. Além disso, queríamos compreender se essas respostas ao gradiente ambiental possuíam um sinal filogenético. Para isso, nós calculamos a diversidade funcional para aves e mamíferos (e suas famílias) em Unidades de Conservação no continente americano. Realizamos regressões múltiplas entre os valores de diversidade e variáveis de temperatura, precipitação, sazonalidade e produtividade (para as classes e suas respectivas famílias). Ainda, realizamos uma análise de sinal filogenético nos valores de inclinação (betas) resultantes das análises de regressão múltipla. Encontramos que o gradiente de produtividade explicou a maior parte dos valores de diversidade funcional para as famílias de aves e mamíferos. Além disso, as respostas ao gradiente ambiental foram bastante diferentes para as famílias quando comparado o grupo como o um todo. Também, não encontramos sinal filogenético na resposta das famílias de aves e mamíferos. Tais resultados nos leva a concluir que estudar grupos inteiros ao invés de escalas taxonômicas mais finas pode mascarar diferentes respostas a fatores ecológicos e evolutivos de estruturação de comunidades, uma vez que as linhagens possuem histórias evolutivas diferentes e respondem de forma diferente a fatores ambientais. Além disso, nossos resultados mostram que linhagens com respostas ao gradiente ambiental parecidas não são necessariamente aparentadas (convergência evolutiva) e que, portanto, não há evidências para conservação de nicho. Over the years, ecologists have tried to understand the diversity of attributes in communities and how this reflects how species respond to the environmental gradient. It is known that different environmental conditions such as temperature, precipitation and productivity are able to select attributes and result in different configurations of functional diversity patterns. These gradient responses may or may not be structured in phylogeny, which argues that phylogenetically closest lines will respond in a similar manner. Moreover, given the different histories and evolutionary origins, lineages (e.g. families) may respond differently when compared to whole groups (e.g. orders). Thus, we aimed to understand if climatic variables and productivity gradient are able to explain the diversity of attributes of groups and families of birds and mammals in the American continent. In addition, we wanted to understand if these responses to environmental gradients had a phylogenetic signal. For this, we calculated the functional diversity for the group and bird and mammal and their families in Protected Areas of the American continent, and performed a multiple regression analysis between the values of diversity and variables of temperature, precipitation, seasonality and productivity gradient (for the classes and their respective families). Afterwards, we performed a variation partitioning analysis to understand the contribution of each variable to the values of functional diversity. We then performed a phylogenetic signal analysis on the slope values (beta) resulted from multiple regression analyzes. We found that productivity explained most of the values of functional diversity for the families of birds and mammals. In addition, the responses to the environmental gradient were quite different for the families when compared to the group as a whole. We also did not find a phylogenetic signal in the response of bird and mammal’s families. These results lead us to conclude that studying whole groups rather than finer taxonomic scales can mask different responses to ecological and evolutionary factors of community structuring, once lineages have different evolutionary histories and respond differently to environmental factors. Furthermore, our results show that lineages with similar environmental gradient responses are not necessarily related (evolutionary convergence) and, therefore, there is no evidence for niche conservation. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

Portugal não cultivou mitos de origem troianos, nem bíblicos. O reino legitimou-se com base, sobretudo, na ação bélica e conquistadora do seu primeiro rei, Afonso Henriques. A força da glorificação, quase mitificação desta figura terá abafado outras possibilidades alternativas de justificação fundacional. A análise de algumas passagens presentes em crónicas e em livros de linhagens, permite-nos verificar que terão existido outros potenciais relatos de origem, frequentemente assentes em linhagens parcialmente imaginadas. Com base nos testemunhos que veiculam estas narrativas, são debatidas algumas razões que poderão ter estado subjacentes, quer à formação, quer ao esquecimento destes relatos. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Submitted by CAMILA ANGELICA GONÇALVES null (camilaangelicagoncalves@gmail.com) on 2017-08-04T21:05:23Z No. of bitstreams: 1 TESE_CAMILA_FINAL.pdf: 1785990 bytes, checksum: 5a2f8aa284630e47e5fda759221287c1 (MD5) Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-08-07T20:19:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 goncalves_ca_dr_jabo_parc.pdf: 646454 bytes, checksum: 56ef8dc5250b7a8f3571f9e3d4337582 (MD5) Made available in DSpace on 2017-08-07T20:19:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 goncalves_ca_dr_jabo_parc.pdf: 646454 bytes, checksum: 56ef8dc5250b7a8f3571f9e3d4337582 (MD5) Previous issue date: 2017-06-07 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) O escâner absorciometria de raios-X de dupla energia (DXA) consiste em uma técnica não invasiva para obter informações sobre a composição corporal dos animais, que permite avaliar a dinâmica de crescimento dos mesmos sem que haja a necessidade de abate. Foram conduzidos três experimentos com frangos de corte, realizados com os objetivos de determinar equações que predizem a composição corporal in vivo das aves no equipamento DXA (experimento I), e estimar o potencial genético de três linhagens comerciais (experimentos II e III). No experimento I foram utilizados 720 frangos de corte Cobb (360 machos e 360 fêmeas) distribuídos em delineamento inteiramente casualizado (DIC), dividido em esquema de parcelas subdivididas 3×2×2 (três níveis de proteína bruta nas dietas, dois sexos e duas técnicas nas sub-parcelas) com seis repetições de 20 aves cada. As dietas foram formuladas com o objetivo de alterar a composição corporal das aves, variando a proteína bruta em 70, 100, e 130% da exigência de cada fase avaliada, mas mantendo a relação entre os aminoácidos. Ao todo 216 aves foram digitalizadas no DXA para quantificação dos dados fornecidos pelo equipamento: massa magra, massa gorda, conteúdo mineral ósseo e massa total. Em seguida, as mesmas aves foram mantidas em jejum alimentar de 24h e depois, abatidas e depenadas. Foi realizada a análise química do corpo livre de penas (FFB) das aves para os conteúdos de proteína, água, lipídeos e matéria mineral. Os dados foram submetidos à análise de variância (ANOVA), sendo constatadas diferenças na quantificação da composição corporal pelas diferentes técnicas. Devido à essas diferenças, foram ajustadas regressões para cada componente químico do corpo. Todas as equações estabelecidas apresentaram alta correlação e podem ser utilizadas na avaliação da composição corporal por DXA, de forma direta, em ensaios futuros envolvendo diferenças entre grupos de frangos de corte e de indivíduos ao longo da vida. Através da condução dos experimentos II e III as equações DXA foram validadas e objetivou-se estimar os parâmetros da função Gompertz para avaliar o potencial genético de crescimento do peso vivo, dos constituintes químicos do FFB e das penas para as linhagens comerciais de frangos de corte Cobb, Hubbard e Ross, machos e fêmeas. Em ambos os ensaios, 336 frangos de corte de cada linhagem e sexo foram distribuídos em delineamento inteiramente casualizado, distribuído em esquema fatorial de 3 linhagens × 2 sexos, com quatro repetições (totalizando 24 unidades experimentais). As aves foram alojadas em ambiente termoneutro de 1 a 105 dias de idade e alimentadas com dieta única para machos e fêmeas divididas em quatro fases, contendo 3100 kcal EMAn/kg, formuladas acima das outras exigências nutricionais. As avaliações envolveram 12 aves por linhagem e sexo ao longo do crescimento para obtenção dos dados de composição do corpo livre de penas determinados in vivo por DXA (experimento II) e abate comparativo realizado em 48 aves por linhagem e por sexo ao longo de todo período experimental para a composição química das penas (experimento III). Os dados foram ajustados à curva de crescimento Gompertz e as taxas de deposição calculadas pela equação derivada. Relações alométricas entre os pesos dos componentes químicos do corpo livre de penas e das penas com o peso proteico dos mesmos foram determinadas para descrever as taxas de crescimento dos componentes nos diferentes genótipos. Os resultados evidenciaram o potencial dos machos em atingir maior peso na maturidade, maior crescimento e deposição proteica em comparação às fêmeas. Constatou-se que as linhagens comerciais atuais apresentam maior peso corporal na maturidade e consequentemente taxas de deposição dos componentes em relação a estudos prévios encontrados na literatura. Por alometria, observou que a gordura corporal foi depositada a uma taxa de 22% e 15% superior nas fêmeas e nos machos, respectivamente, em relação à deposição proteica no corpo. Esses resultados mostram as diferenças no potencial de crescimento das linhagens envolvidas e atualizam as curvas de crescimento para cada linhagem de frangos de corte. The dual-energy X-ray absorptiometry (DXA) consists of a noninvasive technique to obtain information about the body composition of the animals, which allows evaluating the growth dynamics of the animals without the need for slaughter. Three experiments were carried out with broilers, with the objective of determining predictive equations for the in vivo body composition of birds in the DXA equipment (experiment I), and to estimate the genetic potential of three commercial strains (experiments II and III). In the experiment I, 720 Cobb broilers (360 males and 360 females) were distributed in a completely randomized design (DIC), divided into split plot design 3 × 2 × 2 (three crude protein levels in the diets, two sexes and two methods of body evaluation at sub parcels) with six replicates of 20 birds each. The diets were formulated with the objective of altering the body composition of the birds, varying the crude protein in 70, 100, and 130% of the requirement of each evaluated phase, but maintaining the relation between the amino acids. A total of 216 birds were digitized in the DXA to quantify the data provided by the equipment: lean mass, fat mass, bone mineral content and total mass. Then, the same birds were kept in a 24-hour fasting meal, slaughtered and plucked. The chemical analysis of the feather free body (FFB) of birds was carried out for protein, water, lipids and mineral matter content. The data were submitted to analysis of variance (ANOVA), being observed differences between diets, sexes and in the quantification of body composition by the different techniques. Due to the differences between the techniques, regressions were adjusted for each chemical component of the body and for each sex. All the established equations presented an R2

Submitted by Tássia Souza Bertipaglia null (tassia_bertipaglia@hotmail.com) on 2017-06-12T13:57:02Z No. of bitstreams: 1 Tese_Tassia_Souza_Bertipaglia.pdf: 2409571 bytes, checksum: 27fecd26e89e2d444846f64ecf29e744 (MD5) Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-06-12T14:21:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 bertipaglia_ts_dr_jabo_parc.pdf: 1003965 bytes, checksum: 92f196a7bb0b6cc5e385594fc1368a46 (MD5) Made available in DSpace on 2017-06-12T14:21:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bertipaglia_ts_dr_jabo_parc.pdf: 1003965 bytes, checksum: 92f196a7bb0b6cc5e385594fc1368a46 (MD5) Previous issue date: 2017-05-08 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Considerando painéis de SNP (do inglês Single Nucleotide Polymorphism, polimorfismo de nucleotídeo único) objetivou-se descrever o perfil genômico populacional de bovinos leiteiros da raça Gir por meio da caracterização de linhagens desta população e inferir sobre a variabilidade genética utilizando informações de animais provenientes de diversas fazendas do Brasil. Após o controle de qualidade de genótipos e amostras, foram obtidos 1987 SNP bialélicos em cromossomos autossomos presentes nos painéis HD e 50K SNP, em um painel resultante de SNP em comum dos dois painéis, 21K SNP. Distâncias genéticas entre os marcadores foram obtidas e, por meio da decomposição espectral, foram gerados os componentes principais. A análise multivariada de componentes principais, em um contexto de estrutura populacional, permite inferir sobre a variabilidade genética utilizando informações de parentesco entre os animais. A determinação do número de agrupamentos foi realizada com o procedimento k-means, utilizando a distância genética entre os animais, que permite identificar subgrupos genéticos na população, com moderada-alta qualidade de agrupamento, com coeficiente correlação cofenética equivalente a 0,66. O parentesco, heterozigosidade esperada (He) e observada (Ho), coeficientes de endogamia, desequilíbrio de ligação (LD) e tamanho efetivo populacional, baseados exclusivamente em informações genômicas também foram obtidos. Os resultados evidenciaram quatro diferentes agrupamentos genéticos, definidos como linhagens da raça Gir leiteira do Brasil, indicando que o uso de poucos reprodutores ou de seus descendentes com maior intensidade e também devido a diferentes origens dos ancestrais, formou os diferentes agrupamentos genéticos, os quais são compostos por animais de várias fazendas. Há pouco parentesco entre os animais e isso se refletiu na média do coeficiente de endogamia, sendo que a média da endogamia obtida para todos os indivíduos foi de 0,017, evidenciando o fluxo gênico nas diferentes fazendas, o que evitou o acasalamento entre animais aparentados, ou ainda devido à escolha dos animais para genotipagem. O valor médio de He foi 0,25, próximo a média de Ho, revelando que não houve perda e nem fixação de alelos com efeitos indesejáveis. O LD foi obtido para todos os pares de SNP adjacentes com janelas de 50 Mb, revelando que o LD é maior em menores distâncias entre os marcadores, com valor médio de LD de 0,17 ± 0,26 para até 200 Kb, sendo assim, o LD estimado para espaçamento até 40 Kb seria suficiente para se obter associação com Quantitative Trait Loci. O tamanho efetivo populacional (Ne) foi 92,84 animais, sendo assim, cerca de 93 indivíduos nesta população contribuirão em termos de variância genética para a próxima geração desta população. Portanto, concluiu-se que o fluxo gênico nas propriedades mantém a variabilidade genética dos rebanhos. Esses parâmetros populacionais poderão auxiliar nas decisões de acasalamentos dos programas de melhoramento genético da raça a fim de aumentar ou manter a variabilidade genética dos rebanhos. The objective was to describe the genomic structure of Gir dairy cattle population through the characterization of lineages of this population and infer about the genetic variability considering information from animals from several farms in Brazil using panels of SNP (Single Nucleotide Polymorphism). After quality control of genotypes and samples, we obtained 1987 biallelic SNPs on autosomal chromosomes present in the HD panels and 50K SNP, in a resultant panel of SNPs in common from to two panels, 21K SNP. Genetic distances between the markers were obtained and, through spectral decomposition, the principal components were generated. Multivariate analysis of principal components, in a context of population structure, allows inferring about genetic variability using relatedness information between animals. The determination of the number of clusters was performed using the k-means procedure, using the genetic distance between the animals, which allows the identification of genetic subgroups in the population, with moderate-high quality of grouping, with a coefficient correlation coefficient equivalent to 0.66. Expected heterozygosity (He) and observed (Ho), coefficients of inbreeding, linkage disequilibrium (LD) and effective population size (Ne) based exclusively on genomic information were also obtained. The results evidenced four different genetic groups, defined as breeding lineages of the Gir dairy breed of Brazil, indicating that the use of a few breeders or their descendants with greater intensity and also due to the different origins of the ancestors, formed the different genetic groups, which are composed of animals from various farms. There was little relationship between the animals and this was reflected in the average inbreeding coefficient, and the average inbreeding obtained for all the individuals was 0.017, evidencing the gene flow in the different farms, which avoided the mating between related animals, or due to the choice of animals for genotyping. The mean value of He was 0.25, close to the mean of Ho, revealing that there is no loss or fixation of alleles with undesirable effects. The LD was obtained for all adjacent SNP pairs with 50 Mb windows, revealing that the LD is larger at smaller distances between the markers, with a mean LD value of 0.17 ± 0.26 for up to 200 Kb, therefore, the estimated LD for spacing up to 40 Kb would be sufficient to obtain association with quantitative trait loci (QTL). The effective population size was 92.84 animals, thus, about 93 individuals in this population will contribute in terms of genetic variance for the next generation of this population. Therefore, it was concluded that the gene flow in the properties maintains the genetic variability of the herds. These population parameters may aid in the breeding decisions of breed breeding programs in order to increase or maintain the genetic variability of the herds.

Machos suínos reprodutores de diferentes linhagens são classificados andrologicamente pelo mesmo sistema, embora apresente diferentes taxas de crescimento e deposição de tecido muscular. Assim, o conhecimento das particularidades entre linhagens é fundamental para se elaborar um perfil de classificação andrológica para cada linhagem, tornando o processo de seleção genética mais eficiente e adequado. Dessa forma, o presente trabalho foi realizado com o objetivo de comparar o desenvolvimento corporal e testicular durante a fase pré-púbere, as características reprodutivas, como precocidade e facilidade de treinamento, e as características seminais durante a puberdade entre linhagens puras e cruzadas. Para tanto, foram analisadas duas raças de animais puros destinados ao cruzamento das linhas fêmeas, denominados grupo de animais puros linha materna (LM), e duas linhagens de machos terminadores que foram denominados de animais cruzados linha terminadora (LT). Os animais foram avaliados quanto ao peso e medidas testiculares nas primeira, terceira e décima quinta semanas de vida, quanto às características reprodutivas a partir de 21 semanas de idade, e parâmetros seminais entre a 24a e 30ª semanas. Os animais cruzados LT apresentaram maiores pesos e medidas testiculares (P < 0,01) nas idades avaliadas quando comparados aos animais puros LM. Houve uma tendência (P = 0,07) para a facilidade de treinamentos dos animais cruzados LT, sendo que 97% desses machos foram bem sucedidos no treinamento, enquanto 83% dos machos puros LM conseguiram saltar no manequim. A linhagem não afetou as características seminais avaliadas: volume, concentração, número de espermatozoides totais, número de espermatozoides viáveis e motilidade. Houve diferença na porcentagem de espermatozoides normais no exame morfológico, sendo maior para os machos LT. Assim, machos cruzados LT foram mais precoces ao apresentarem parâmetros seminais como motilidade, concentração e porcentagem de espermatozoides normais superiores a 75%, 200x106/mL e 75% respectivamente na 26a semana de vida (185,5 dias) quando comparado aos machos puros LM, aprovados em idade superior a 29 semana (201,5 dias) (P < 0,01). Parâmetros da cinética do movimento, como DSL, VSL e STR, foram superiores pata LM quando comparados aos LT (P < 0,05), embora não tenham atingido valores mínimos para a espécie. Foram encontradas correlações entre peso corporal na primeira (r = 0,58; P < 0,001) e 15a (r = 0,39; P

The great commercial potential of Nile tilapia is due to features such as its high production performance, its adaptability to different farming systems, and the development of genetic varieties with superior performance. Therefore, the objective of this study was to evaluate the performance of two varieties, GIFT (Genetic Improvement of Farmed Tilapia) and Supreme, grown in hapas in concrete tanks and grown in excavated ponds. Were used 200 and 1234 fingerlings of both varieties, GIFT and Supreme (average initial weight of 0.83 g), for farming in hapas and ponds, respectively. Biometric measurements were taken at four farming stages (fingerling, juvenile, growth, and fattening). Were measured weight (g), total length (cm), standard length (cm), trunk length (cm), head length (cm), head height (cm), body height (cm), weight gain (g) and head/edible-part ratio. For all parameters and in all stages, superior results were observed for tilapia reared in excavated ponds. When the varieties were compared, GIFT had the best performance for most parameters in the fingerling stage, and for weight, total length, and body height in the juvenile stage. Both varieties grew better in excavated ponds. Moreover, GIFT showed higher growth than Supreme during all stages when grown in excavated ponds. Supreme showed higher growth than GIFT in hapas only in the growth stage. Thus, it is concluded that the rearing in excavated ponds provided better results, with superiority of the GIFT variety, which was more able to take advantage of the favorable conditions of this system. O grande potencial comercial da Tilápia-do-Nilo se deve a características como o alto desempenho produtivo, adaptabilidade a diferentes sistemas de criação e o desenvolvimento de variedades genéticas com desempenho superior. Portanto, o objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho de duas variedades, GIFT (Genetic Improvement of Farmed Tilapia) e Supreme, cultivadas em hapas em tanques de concreto e em viveiros escavados. Foram utilizados 200 e 1234 alevinos de ambas as variedades, GIFT e Supreme (peso médio inicial de 0,83 g), para cultivo em hapas e viveiros escavados, respectivamente. As medidas biométricas foram realizadas em quatro etapas de cultivo (alevinos, juvenis, crescimento e engorda). Foram mensurados peso (g), comprimento total (cm), comprimento padrão (cm), comprimento do tronco (cm), comprimento da cabeça (cm), altura da cabeça (cm), altura corporal (cm), ganho de peso (g) e cabeça proporção de parte comestível. Para todos os parâmetros e em todas as etapas, resultados superiores foram observados para tilápias criadas em viveiros escavados. Quando as variedades foram comparadas, a GIFT obteve o melhor desempenho para a maioria dos parâmetros no estágio de alevino, e para peso, comprimento total e altura do corpo no estágio juvenil. Ambas as variedades obtiveram maior crescimento em viveiros escavados. Além disso, o GIFT apresentou maior crescimento que a Supreme durante todos os estágios quando cultivado em viveiros escavados. A Supreme apresentou maior crescimento que o GIFT em hapas apenas no estágio de crescimento. Assim, conclui-se que a criação em viveiros escavados proporcionou melhores resultados, com superioridade da variedade GIFT, que foi mais capaz de aproveitar as condições favoráveis deste sistema.

Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV) is one of the most common viruses of grapevine. It is involved in the graft-transmissible disease rupestris stem pitting of the rugose wood complex. The objective of the research was to perform the molecular characterization of the coat protein (CP) gene of sixteen Brazilian GRSPaV isolates aiming to determine the occurrence of molecular variants (strains) of this virus. Nine grapevine samples were evaluated, from which dsRNA was extracted. Nucleotide sequences were generated by Next generation sequencing (NGS). Fifteen complete sequences of the GRSPaV CP gene were obtained and phylogenetically analyzed. Multiple alignments of the sequences showed identities of nucleotides ranging from 82% to 99%, suggesting high variability among the CPs of Brazilian isolates. The study revealed that genetic variability of GRSPaV comprising three molecular variants is also present in Brazilian grapevine genotypes.Key words: GRSPaV, Foveavirus, strains, lineages, genetic variability. O GRSPaV é um dos vírus mais comuns da videira. Está associado à doença transmissível por enxertia denominada caneluras de rupestris que compõe o complexo do lenho rugoso. O objetivo do trabalho foi realizar a caracterização molecular do gene da proteína capsidial (CP) de 16 isolados brasileiros de GRSPaV visando determinar a ocorrência de variantes moleculares desse vírus. Nove amostras de videira foram avaliadas das quais foi extraído dsRNA. As sequências de nucleotídeos foram geradas pelo sequenciamento de nova geração (NGS). Quinze sequências completas do gene CP de GRSPaV foram obtidas e filogeneticamente analisadas. Os alinhamentos múltiplos entre as sequências mostraram identidades de nucleotídeos variando de 82% a 99%, sugerindo alta variabilidade entre as CPs de isolados brasileiros. O estudo revelou que a variabilidade genética de GRSPaV compreendendo três variantes moleculares também está presente nos genótipos de videira no Brasil. Palavras-chave: GRSPaV, Foveavirus, estirpes, linhagens, variabilidade genética. Made available in DSpace on 2017-10-28T23:13:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 16784596cr4711e20161113.pdf: 850698 bytes, checksum: c3c963f54cf326087b2b441ff1d8b3f0 (MD5) Previous issue date: 2017-10-27

RESUMO Estudos precoces com relação à seleção de linhagens de milho, com base em características de qualidade de sementes, podem ser explorados em programas de melhoramento nas primeiras etapas da obtenção de híbridos. O objetivo deste estudo foi analisar a divergência genética e a heterose associadas à qualidade fisiológica de sementes, em função do vigor, para a composição bioquímica na obtenção de milho híbrido. No experimento, foram utilizadas sementes de 8 linhagens e 3 híbridos de milho (híbrido simples, triplo e triplo modificado). Avaliaram-se os componentes bioquímicos nas sementes por meio dos teores de amido, proteína total, fósforo total, ferro e zinco. Com base no método de Singh, observou-se que a variável que mais contribuiu para a divergência genética quanto à composição bioquímica das sementes foi o teor de amido, com 46,47%. Constatou-se divergência genética e heterose para a composição bioquímica das sementes, indicando que essa característica pode ser explorada em programas de melhoramento visando à qualidade das sementes. O híbrido simples, composto pelas linhagens 2 e 4, foi indicado como a melhor combinação para a composição bioquímica nas sementes, com as maiores heteroses para os teores de amido, fósforo, ferro e zinco. ABSTRACT Early studies with regard to the selection of maize lines based on seed quality characteristics can be exploited in breeding programs in the early stages of hybrids achievement. The objective of this study was to analyze the genetic diversity and the heterosis associated with physiological quality of seeds, in function of the force, for biochemical composition in the achievement of hybrid corn. In the experiment, seeds from 8 lines and 3 maize hybrids (single hybrid, triple and modified triple) were used. Biochemical components in the seeds were evaluated by means of starch content, total protein, total phosphorus, iron and zinc. Based on Singh’s method, it was observed that the variable which most contributed to genetic divergence on the biochemical composition of the seeds was the starch content, with 46.47%. Genetic diversity and heterosis were found for the biochemical composition of the seeds, indicating that this feature can be exploited in breeding programs aiming at the quality of the seeds. The simple hybrid, composed of the strains 2 and 4, was indicated as the best match for the biochemical composition in seeds, with the highest heterosis for starch content, phosphorus, iron and zinc.

Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2016-11-28T15:31:27Z No. of bitstreams: 1 ChristianeNGSO_DISSERT.pdf: 1139473 bytes, checksum: 48a32aaf5ee4fdeb90ab8e38a6495a3c (MD5) Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-03-21T14:38:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ChristianeNGSO_DISSERT.pdf: 1139473 bytes, checksum: 48a32aaf5ee4fdeb90ab8e38a6495a3c (MD5) Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-03-21T15:04:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ChristianeNGSO_DISSERT.pdf: 1139473 bytes, checksum: 48a32aaf5ee4fdeb90ab8e38a6495a3c (MD5) Made available in DSpace on 2017-03-21T15:04:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ChristianeNGSO_DISSERT.pdf: 1139473 bytes, checksum: 48a32aaf5ee4fdeb90ab8e38a6495a3c (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 This work aims to select cowpea genotypes, green grain, which they must have characteristics that meet local consumer demands, as their agronomic performance, quality and genetic diversity. Two trials using cowpea genotypes were conducted in two seasons of 2014 at the Federal Rural University of Semi-Arid (UFERSA) in the city of Mossoro-RN. The experimental was arranged in a randomized block design with 23 genotypes e 4 replications, being twenty genotypes from Embrapa Meio-Norte and three local witnesses. The characteristics evaluated were: lodging, Number of Grains per Pod, Length of Green Pods, Mass of Green Pods, Plant Size, Number of Days to start Flowering, Number of Days for the Maturing of green pod, Green Grain Mass, Green Pod Productivity, Green Grain productivity, Grain Index; as well as the physical and chemical analysis: Soluble Solids, hydrogen potential, Chlorophyll Total, Carotenoids and Total Protein. From the mixed model methodology (REML / BLUP), by which it was made the joint analysis of the two seasons could be estimated the variance components and genetic parameters, in addition to the contribution to the genetic diversity of each feature evaluated. The MNC05-835B-15 genotypes, MNC05-841B-49 and to cultivate BRS Chiquichique had better values for the yield of green pods at both times of the experiment. For the Green Grain Productivity, the genotypes that had better performances were MNC00-595F-2, MNC-595F-27 MNC05-835B-15 and BRS Chiquichique. The MNC99-510F-16-1 and MNC02-701F-2 genotypes have better averages for the quality of Total Protein, and the best average to cultivate the EverGreen-EC-1. The MNC02-701F-2 genotypes, MNC05-841B-49, MNC05-847B-123, BRS-Aracê showed the best results in relation to the characters Soluble Solids, Total Chlorophyll and Carotenoids Total. Through UPGMA it was generated four distinct groups among the 23 genotypes of genetic dissimilarity. The variables Grain Number, Mass of Green Pods, Grains Index and Soluble Solids were those that most contributed to the diversity of genotypes O trabalho visa selecionar genótipos de feijão-caupi, para grãos verdes, que tenham características que atendam às exigências do consumidor local, quanto ao seu desempenho agronômico, qualidade e diversidade genética. Foram conduzidos dois ensaios utilizando genótipos de feijão-caupi em duas épocas do ano de 2014 na Horta Experimental do Departamento de Ciências Vegetais da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA), na cidade de Mossoró-RN. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso com 23 genótipos e 4 repetições, sendo vinte genótipos provenientes da Embrapa Meio-Norte e três testemunhas locais. As características avaliadas foram: Acamamento, Número de Grãos por Vagem, Comprimento de Vagens Verdes, Massa de Vagens Verdes, Porte de Planta, Número de Dias para início de Floração, Número de Dias para a Maturação da vagem verde, Massa de Grãos Verdes, Produtividade de Vagem Verde, Produtividade de Grãos Verdes, Índice de Grãos; bem como as análises físico-químicas: Sólidos Solúveis, potencial Hidrogeniônico, Clorofila Total, Carotenoides e Proteína Total. A partir da metodologia modelos mistos (REML/BLUP), através da qual foi feita a análise conjunta das duas épocas, puderam ser estimados os componentes de variância e os parâmetros genéticos, além da contribuição relativa para a diversidade genética de cada caráter avaliado. Os genótipos MNC05-835B-15, MNC05-841B-49 e a cultivar BRS Xiquexique tiveram melhores valores para a produtividade de vagens verdes nas duas épocas do experimento. Para a Produtividade de Grãos Verdes, os genótipos que obtiveram melhores desempenhos foram MNC00-595F-2, MNC-595F-27, MNC05-835B-15 e a cultivar BRS Xiquexique. Os genótipos MNC99-510F-16-1 e MNC02-701F-2 deram melhores médias para o caráter de qualidade Proteína Total, sendo a cultivar de melhor média a Sempre-Verde-CE-1. Os genótipos MNC02-701F-2, MNC05-841B-49, MNC05-847B-123, BRS-Aracê apresentaram os melhores resultados em relação aos caracteres Sólidos Solúveis, Clorofila Total e Carotenoides Totais. Através do agrupamento UPGMA, foram gerados quatro grupos distintos entre os 23 genótipos avaliados de dissimilaridade genética. As variáveis Número de Grãos, Massa de Vagens Verdes, Índice de Grãos e Sólidos Solúveis foram as que mais contribuíram para a diversidade dos genótipos avaliados 2016-11-28

Yolk color and egg white (albumen) cleanliness and viscosity are important parameters by which consumers judge the quality of eggs. This study aimed to investigate changes in albumen viscosity during storage of eggs for up to 36 days from two different commercial laying hen strains (Carijo Barbada and Isa Brown) fed a diet containing annatto (1.5 and 2.0%) or a synthetic additive without synthetic colorants (control). Analyses of humidity, albumen height, pH, viscosity, foam formation, and stability were carried out on eggs. Carijo Barbada strain had smaller albumen, lower humidity and higher egg white viscosity than Isa Brown strain; however, with storage, viscosity lowered significantly on both strains. Initially, the addition of 2.0% of annatto or a synthetic additive increased viscosity in both strains, but with storage only the control maintained longer viscosity. Lower viscosity did not change foam density and stability.A coloração da gema, transparência e viscosidade da clara (albúmen) são parâmetros importantes que os consumidores consideram na avaliação dos ovos. O objetivo do estudo foi verificar as trocas que ocorrem na armazenagem por 36 dias em relação à viscosidade da clara de ovos produzidos por poedeiras de duas diferentes linhagens (Carijo Barbada eIsa Brown ), as quais receberam dietas contendo urucum (1,5 e 2,0%) ou aditivo sintético. Foram realizadas as análises de umidade, altura do albúmen, pH, viscosidade, formação e estabilidade da espuma. A linhagem Carijó Barbada apresentou menor quantidade de albúmen, menor umidade e maior viscosidade que a linhagem Isa Brown, entretanto, com a estocagem, a viscosidade diminuiu significativamente para ambas as linhagens. Inicialmente, a adição de 2,0% de urucum ou aditivo sintético foi suficiente para aumentar a viscosidade em ovos obtidos de ambas as linhagens, mas com a estocagem, somente o controle manteve maior viscosidade. A baixa viscosidade não interferiu na densidade e estabilidade da espuma.

A coloracao da gema, transparencia e viscosidade da clara (albumen) sao parâmetros importantes que os consumidores consideram na avaliacao dos ovos. O objetivo do estudo foi verificar as trocas que ocorrem na armazenagem por 36 dias em relacao a viscosidade da clara de ovos produzidos por poedeiras de duas diferentes linhagens (Carijo Barbada eIsa Brown ), as quais receberam dietas contendo urucum (1,5 e 2,0%) ou aditivo sintetico. Foram realizadas as analises de umidade, altura do albumen, pH, viscosidade, formacao e estabilidade da espuma. A linhagem Carijo Barbada apresentou menor quantidade de albumen, menor umidade e maior viscosidade que a linhagem Isa Brown, entretanto, com a estocagem, a viscosidade diminuiu significativamente para ambas as linhagens. Inicialmente, a adicao de 2,0% de urucum ou aditivo sintetico foi suficiente para aumentar a viscosidade em ovos obtidos de ambas as linhagens, mas com a estocagem, somente o controle manteve maior viscosidade. A baixa viscosidade nao interferiu na densidade e estabilidade da espuma.

Objetivou-se avaliar o desempenho de dez linhagens de soja-hortaliça, em campo. O delineamento experimental adotado foi blocos ao acaso, com dez tratamentos (linhagens) e cinco repetições. Cada parcela experimental foi constituída por quatro linhas de plantio, com cinco metros de comprimento. Utilizou-se irrigação por aspersão. As linhagens avaliadas foram: JLM003; JLM004; JLM010; JLM018; JLM019; JLM024; JLM030; BR36; BR155 e BRS216. Avaliaram-se a precocidade média, altura de inserção da primeira vagem, número de vagens chochas, número de vagens com um grão, número de vagens com dois grãos, número de vagens com três grãos, massa fresca de vagens com um, dois e três grãos, massa fresca de 100 sementes, provenientes de vagens com um, dois e três grãos, massa de vagens não comerciais e produção de vagens comerciais por planta. Com base nos resultados obtidos, a linhagem JLM010 foi a mais indicada para a produção de soja-hortaliça por apresentar produção de grãos imaturos de 12,53 t ha-1 e maior massa fresca de 100 sementes.The objective was to evaluate the performance of ten vegetable soybean strains, in field. The experiment was arranged in randomized blocks with ten treatments (strain) and five replications. Plots comprised four rows measuring five meters in length. Sprinkle irrigation was used. The following strains were used: JLM003; JLM004; JLM010; JLM018; JLM019; JLM024; JLM030; BR36; BR155 and BRS216. The average earliness, insertion height of first pod, number of pods without grain, number of pods with one grain, number of pods with two grains, number of pods with three grains, fresh weight of pods with one, two and three grains, fresh weight of 100 seeds from pods with one, two and three grains, weight of no marketable pods and marketable production of pods per plant were evaluated. Results showed that the strain JLM010 is the best for vegetable soybean production, with total yield of immature grains of 12.53 t ha-1 and higher fresh weight of 100 seeds.

O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética de três gerações da tilápia GIFT do Programa de Melhoramento Genético da Universidade Estadual de Maringá, utilizando o marcador RAPD. Foram utilizadas 180 amostras de nadadeira. Os sete primers utilizados produziram 91 fragmentos, dos quais 98,9% foram polimórficos. Observaram-se diferenças (p < 0,05) na frequência de 64 fragmentos, dos quais dez foram excluídos na G2. Os resultados de variabilidade genética estimados pelo índice de Shannon (G0: 0,430; G1: 0,469 e G2: 0,420) e pela porcentagem de fragmentos polimórficos (G0: 90,1%; G1: 94,5% e G2: 86,8%) indicaram alta variabilidade genética intrapopulacional. Resultados esses que corroborando com os preceitos de diversidade genética de Nei mostraram a G1 com os maiores valores (G0: 0,281; G1: 0,307 e G2: 0,277). Também foi constatada maior distância genética entre as gerações G0 e G1 (0,108) e maior identidade genética entre G0 e G2 (0,909). Há alta diversidade genética intrapopulacional nas três gerações, com valores maiores na G1, como observado nas analises.The aim of this work was to analyze the genetic diversity in three GIFT tilapia generations from the Genetic Improvement Program of State University of Maringá, using the RAPD marker. One hundred eighty fin samples were used. The seven primers used produced 91 fragments, of which 98.9% were polymorphic. Differences (p < 0.05) were observed in the frequency of 64 fragments, of which ten were excluded in G2. The results of genetic variability estimated by the Shannon index (G0: 0.430, G1: 0.469 and G2: 0.420) and by the percentage of polymorphic fragments (G0: 90.1%, G1: 94.5% and G2: 86.8%) indicated a high intrapopulation genetic variability, corroborated by the Nei genetic diversity results that showed G1 with the highest values (G0: 0.281, G1: 0.307 and G2: 0.277). A greater genetic distance between the G0 and G1 generations (0.108) and a greater genetic identity between G0 and G2 (0.909) were verified. Intrapopulation genetic diversity was high in the three generations, with highest values in G1.

The objective of the present study was to evaluate the performance of broiler strains (Cobb 500, Ross 308, and Hubbard Flex) in hot weather. Environmental temperatures above thermal comfort trigger responses of the animals to maintain homeothermia, which negatively affects productive performance. A total of 2,160 chicks of both sexes, were distributed in an experimental design that was completely randomized in a factorial arrangement of 3 × 2 (strains and sexes) with six replicates of 60 birds each. Feed intake (FI), live weight (LW), weight gain (WG), and feed conversion (FC) were analyzed at periods of 1–7, 1–21, 1–28, 1–42, and 1–49 days old. At 42 and 49 days old, the carcass weight (CW), carcass yield (CY), breast yield (BY), thigh yield (TY), and drumstick yield (DY) were analyzed. The strains differed in LW and WG in most periods, especially for Cobb broilers in the pre-start period (1–7 days) and Hubbard broilers in the last two periods (1–42 and 1–49 days). Except for the pre-initial stage, which there was no influence of the strains on FC, the Hubbard broilers showed the best FC, at 1–49 d, similarly to Cobb broilers. Regardless of strain, the males showed superior performance to that of females. At 42 d, the Cobb broilers showed a superior BY to that of the other strains, presenting better TY than did the Ross and Hubbard strains. At 49 d, the Cobb and Ross strains showed the best BY, with the Hubbard strain having the greatest DY. Males showed higher values in cut yields, except in the BY in which females showed better results.

O Lentinula edodes é um alimento de qualidade elevada, sendo rico em proteínas, vitaminas e sais minerais e pobre em calorias e gorduras. No entanto, seu valor nutricional varia em função da linhagem cultivada, do processamento após a colheita, do estágio de desenvolvimento do basidioma e do substrato utilizado. Assim, este trabalho teve como objetivo caracterizar bromatologicamente os basidiomas de oito linhagens de L. edodes (LE-95/01, LE-95/02, LE-95/07, LE-96/17, LE-96/18, LE-98/47, LE-98/55 e LE-96/13), inteiros ou em partes (estípete e píleo), produzidos em toras de E. grandis. Verificou-se que tanto as linhagens de L. edodes como as partes dos basidiomas analisados influenciaram nas respostas nutricionais das amostras. O estípete apresentou as maiores médias de fibra bruta e as menores médias de proteína bruta. O píleo, por sua vez, apresentou as maiores médias de cinzas. Nas avaliações de basidiomas inteiros, as maiores médias, quanto ao teor de proteína bruta, foram obtidas nas linhagens LE-95/07, LE-96/17 e LE-96/18. Já a maior média de fibra bruta foi obtida pela linhagem LE-96/13 de L. edodes. O conteúdo de lipídios do píleo e do estípete não variaram entre as linhagens de L. edodes.Lentinula edodes is high quality food which is rich in proteins, vitamins, and minerals and poor in calories and fat. However, its nutritional value is variable according to the strain grown, processing after harvest, development stage of basidiomata, and substrate used. Thus, the objective of this paper was to carry out the bromatological characterization of basidiomatas from eight (LE-95/01, LE-95/02, LE-95/07, LE-96/17, LE-96/18, LE-98/47, LE-98/55 e LE-96/13) L. edodes strains, whole or in parts (stalk and pileus), produced in E. grandis logs. We verified that both the L. edodes strains and parts of basidiomatas analyzed influenced nutritional responses of the samples. The stalk presented the highest raw fiber averages and the lowest raw protein averages. The pileus presented the highest ash averages. For all basidiomatas evaluations, the highest averages concerning raw protein contents were obtained for the strains LE-95/07, LE-96/17 and LE-96/18. The highest raw fiber average was obtained for the L. edodes strain LE-96/13. The lipids content of the pileus and the stalk did not vary among L. edodes strains.

Three compost formulations, consisting of two varieties of Cynodom dactylon (L.) Pers. (Coast-cross and Tyfton) and oat (Avena sativa) straw were tested for the cultivation of A. bisporus strains ABI-01/01, ABI-04/02, ABI-05/03, and ABI-06/04. A completely randomized experimental design in a factorial scheme was adopted, with 12 treatments (4 A. bisporus strains × 3 types of compost) and 8 replicates. Each experimental unit corresponded to one box containing 12 12.5 kg fresh wet compost. The data were submitted to analysis of variance and the means were compared by Tukey test. According to the results, productivity of mushrooms was influenced by strain and/or compost type. It was also verified that crude protein, ash, and crude fiber contents in the mushroom varied with A. bisporus strain and straw used in the formulation of the compost.Três formulações de composto, à base de palhas de Cynodom dactylon (L.) Pers. (cultivares Coast-cross e Tyfton) e Aveia-Avena sativa, foram testadas no cultivo das linhagens ABI-01/01, ABI-04/02, ABI-05/03 e ABI-06/04 de A. bisporus. O delineamento experimental foi em esquema fatorial, inteiramente casualizado com 12 tratamentos (4 linhagens de A. bisporus x 3 tipos de composto) e 8 repetições. Cada unidade experimental constou de uma caixa com 1212,5 kg de composto fresco úmido. Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias foram comparadas pelo teste de Tukey. De acordo com os resultados obtidos verificou-se que a produção de cogumelos foi influenciada pela linhagem e/ou pelo tipo de composto. Também verificou-se que o teor de proteína bruta, cinzas e fibra bruta de basidiomas variou com a linhagem de A. bisporus e com o tipo de palha utilizada na formulação do composto.

Os vírus dengue (DENV) sorotipos 1, 2, 3 e 4 tem causado surtos anuais no Brasil. No entanto, a estrutura populacional dos vírus transmitidos em Goiás não é bem compreendida. Neste estudo, investigamos o padrão filogenético de amostras do DENV identificadas em Goiânia, Goiás, Brasil, durante a epidemia de 2012/2013. Para isso, a região completa do gene codificante da proteína do envelope (E) (1485pb) de 16 amostras DENV-1 assim como a região parcial deste gene (363pb) de sete amostras DENV-4, foram sequenciadas. A análise filogenética mostrou que o DENV-1 pertence ao genótipo V e apresenta-se dividido em dois clados, sugerindo a cocirculação de duas linhagens distintas na região. Ainda, as análises moleculares indicaram uma alteração significativa na posição do aminoácido E348. Para DENV-4, as sequências segregaram em um grupo monofilético, sendo classificadas como genótipo II subclado americano. As análises moleculares e filogenéticas indicaram que a região sofreu múltiplas introduções pelo DENV. Este é o primeiro relato de cocirculação de duas linhagens de DENV-1, assim como circulação do DENV-4 no estado de Goiás. Dengue viruses (DENV) serotypes 1, 2, 3, and 4 have been causing yearly outbreaks in Brazil. Nevertheless, the population structure of the viruses transmitted in Goiás state is not well understood. In this study, we investigated the phylogenetic pattern of DENV samples identified in Goiânia, Goiás, Brazil during the 2012/2013 epidemic. Therefore, the entire region of the gene of the envelope (E) protein (1485bp) of 16 DENV-1 samples as well as partial region of this gene (363bp) of seven DENV-4 samples were sequenced. Phylogenetic analysis showed that DENV-1 belongs to the genotype V and presents itself divided into two clades, suggesting co-circulation of two distinct lineages in this region. Still, the molecular analyzes indicated a significant change in the amino acid level E348 position. For DENV-4, the sequences were segregate in a monophyletic group and are classified as genotype II American subclade. The molecular and phylogenetic analysis showed that the region suffered multiple introductions by dengue virus. This is the first report of co-circulation of two lineages of DENV-1, and the circulation of DENV-4 in Goiás state. Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG

The mycelium growth kinetics and vigor of shiitake (Lentinula edodes (Berk.) Pegler) strains LE 96/17, LE 98/51, LE 98/53, and LE 98/56 were studied under different agar medium compositions. The strains were from the mycological collection of the Módulo de Cogumelos, Faculdade de Ciências Agronômicas, Unesp-Botucatu, Brazil. Mycelium fragments from stock cultures were transferred to Petri dishes with Sawdust extract-Dextrose-Agar medium. The area of growth and vigor (density) of the mycelia were daily recorded with a digital camera, during incubation, until the complete colonization of the Petri dish. The images were analyzed by the freeware UTHSCSA ImageTool, v. 2.0, developed by the University of Texas Health Science Center, San Antonio. The kinetics of mycelium growth, as measured by the mycelium area (mm²), has as a deterministic component an exponential function of Gompertz. The vigor, as evaluated by mycelium color in gray scale, was similar for all strains, reached a maximal value between the 4th and 5th day of incubation and decreased further on. The velocity of growth of L. edodes strains was lower in enriched culture media, while vigor was higher. Digital monitoring permits a objective evaluation of the growth kinetics of L. edodes in vitro.Avaliou-se o crescimento e vigor das linhagens LE 96/17, LE 98/51, LE 98/53 e LE 98/56 de Lentinula edodes (Berk) Pegler em diferentes composições de meio de cultura. As linhagens foram provenientes da Micoteca do Módulo de Cogumelos da Faculdade de Ciências Agronômicas, Unesp, Campus de Botucatu. Os isolados foram obtidos por propagação vegetativa, pela transferência asséptica do micélio para o meio de cultura de extrato de serragem-dextrose-ágar. O crescimento e vigor do micélio foi fotografado diariamente com uma câmera digital, durante a incubação, até a colonização total da placa de Petri. As imagens foram analisadas pelo programa UTHSCSA ImageTool (freeware), versão 2.0, desenvolvido pela University of Texas Health Science Center, San Antonio, Texas. O modelo estatístico que melhor explicou a cinética de crescimento miceliano em área (mm²), das linhagens de cogumelos L. edodes, tem como componente determinístico a exponencial de uma função Gompertz. O vigor, avaliado através da cor do micélio (em escala de tons do cinza), revelou um comportamento similar entre as linhagens, com valor máximo entre o 4º e 5º dia e, em seguida apresentou declínio. Em meios de cultura mais enriquecidos, a velocidade de crescimento das linhagens de L. edodes foi menor e o vigor maior. O monitoramento digital permite uma avaliação objetiva do crescimento e vigor do L. edodes in vitro.

Um experimento foi realizado com o objetivo de estudar a digestibilidade aparente da dieta e o balanço do nitrogênio em suínos de diferentes grupos genéticos com ou sem restrição alimentar. Foram utilizados 24 suínos machos castrados de três linhagens híbridas comerciais (Agroceres, Dalland e Embrapa), com peso vivo médio inicial de 47,95kg e final de 52,11kg. Os animais foram alojados em gaiolas metabólicas mantidas em ambiente semi-climatizado. Foi utilizado um fatorial 3 x 2 (três linhagens híbridas comerciais com ou sem restrição alimentar), com quatro repetições cada, sendo o animal a unidade experimental. Os grupos genéticos e a restrição alimentar não influenciaram (P>0,05) a digestibilidade aparente da matéria seca, da proteína bruta, do extrato etéreo e a metabolizibilidade da energia. No entanto, a restrição de 20% em relação à alimentação à vontade reduziu (P0.05) dry matter digestibility, crude protein, ether extract and metabolizable energy. On the nitrogen balance, restriction feed decrease (P

No presente trabalho avaliou-se e selecionou-se plantas resistentes aos nematóides das galhas (Meloidogyne spp) e tolerantes ao calor quanto ao florescimento, a partir de oito populações F2 de alface. Em um primeiro experimento, fez-se a avaliação para nematóides das galhas. Além das oito populações F2, utilizaram-se como testemunhas as cultivares Regina 71 (suscetível) e Grand Rapids (resistente). De acordo com uma escala de notas de 1 a 5, referentes à incidência de galhas nas raízes de cada planta, estabeleceu-se um ponto de truncagem baseado no número de plantas das cultivares Regina 71 e Grand Rapids para cada nota, que no caso foi a nota 2. Plantas das populações F2 com notas 1 e 2 foram consideradas resistentes, sendo selecionadas. Tomaram-se aleatoriamente 80 plantas de cada população, entre as selecionadas, e das cultivares Regina 71 e Grand Rapids, as quais foram transplantadas para estufa. Avaliou-se nesta etapa, o número de dias decorridos da semeadura até a primeira antese em cada planta, obtendo-se a distribuição de freqüência das plantas da cultivar Regina 71 (tolerante ao florescimento precoce) e Grand Rapids (suscetível ao florescimento precoce). Estabeleceu-se da mesma forma que no experimento anterior, um ponto de truncagem, que neste caso foi de 111 dias. Este número foi utilizado como limite mínimo para seleção de plantas tolerantes ao florescimento precoce. Foi possível selecionar 13,46% das plantas, que floresceram a partir dos 111 dias, as quais já haviam sido selecionadas para resistência a nematóides. O efeito aditivo e a herdabilidade alta para o caráter de resistência a nematóides, assim como para a tolerância ao pendoamento precoce, permitem antever a possibilidade de obtenção de linhagens superiores, a partir de plantas selecionadas para estas características.Plants resistant to the southern root knot nematodes (Meloidogyne spp.) and tolerant to the early bolting were evaluated and selected, starting from eight F2 generations. In the first experiment, these F2 generations, Regina 71 (nematode-susceptible) and Grand Rapids (nematode-resistant) cultivars were evaluated for the southern root knot nematodes. A truncation point was established with base in a scale of notes from 1 to 5, referring to the galls incidence in the root system of each plant of the Regina 71 and Grand Rapids cultivars. This truncation point corresponded to note 2. Plants of the F2 generation with notes 1 and 2 were selected. Eighty plants of each F2 generation, Regina 71 and Grand Rapids cultivars were transplanted in a greenhouse. Bolting tendency of each of the plants was recorded as the number of days from sowing to the first anthesis. Plant frequency distribution of the Regina 71 (late-bolting) and Grand Rapids (early-bolting) were obtained. A truncation point was established. This truncation point corresponded to 111 days. This number was used as the minimum limit for selection of the tolerance to early flowering of plants. It was possible to select 13,46% of the plants, which bloomed starting from the 111 days and which had already been selected for the southern root knot nematodes resistance. The addictive effect and the high heritability for the characteristics, permit to foresee the possibility of obtaining lines selected for these characteristics.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a viabilidade de se produzir híbridos inter e intrapopulacionais a partir de populações S0 de híbridos simples comerciais. Foram utilizadas três populações S0 oriundas dos híbridos simples comerciais P30F45, Dow657 e DKB333B, sendo obtidos 163 híbridos (110 interpopulacionais e 53 intrapopulacionais). A avaliação dos híbridos, em relação à produtividade de grãos, foi realizada no ano agrícola 2003/2004, nos municípios de Lavras e Lambari (MG), em delineamento látice simples 13 x 13, utilizando-se como testemunhas os três híbridos comerciais e suas populações S0. Os dados foram submetidos à análise de variância individual e conjunta. A partir das esperanças dos quadrados médios foram estimados alguns parâmetros genéticos e fenotípicos. A depressão por endogamia dos híbridos comerciais também foi estimada. Foram identificados híbridos S0 interpopulacionais superiores, tanto aos híbridos simples comerciais quanto a suas gerações S0, em ambos os locais. Por outro lado, não se identificou nenhum híbrido intrapopulacional superior à média dos híbridos comerciais, devido, em parte, ao número de híbridos intrapopulacionais avaliados, 53 contra 110 híbridos S0 interpopulacionais. No entanto, foram identificados híbridos S0 intrapopulacionais com produtividade média de grãos superior a 10 t ha-1. De acordo com os resultados é possível obter híbridos, a partir de populações S0 de híbridos simples comerciais, com maior produtividade de grãos. Verificou-se também, que híbridos simples comerciais são excelente alternativa para a extração de linhagens, já que, em gerações iniciais de endogamia, a obtenção de híbridos superiores já é viável.This work was carried out with the objective of evaluating inter and intrapopulation maize hybrids from S0 progenies of commercial single cross hybrids. Three S0 populations from single cross hybrids (P30F45, Dow657 and DKB333B) were used, and 163 hybrids (110 inter and 53 intrapopulational crosses) were obtained. Hybrids were evaluated in Lavras and Lambari (MG), Brazil in relation to the grain yield, using the commercial hybrids and their S0 as checks in two replicate lattice design (13 x 13). Data were submitted to individual and combined ANOVA. Genotypic and phenotypic parameters were estimated from expected mean squares. Inbreeding depression in the commercial hybrids were estimated. Some interpopulational hybrids outyielded both commercial hybrids they originated from and their S0 used as checks, in the two locations. However, yields of all intrapopulation hybrids were lower than the hybrid checks, probably due to the lower number of intrapopulational hybrids (53) as compared to interpopulation hybrids (110). Intrapopulation hybrids of high productivity with average yield of 10 t ha-1 were identified, this demonstrating the possibility of obtaining high yielding hybrids from S0 populations of single cross hybrids. Single cross hybrids are an excellent alternative for developing inbreds, provide it is possible to obtain superior hybrids from early inbreeding generations.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a viabilidade de se produzir híbridos inter e intrapopulacionais a partir de populações S0 de híbridos simples comerciais. Foram utilizadas três populações S0 oriundas dos híbridos simples comerciais P30F45, Dow657 e DKB333B, sendo obtidos 163 híbridos (110 interpopulacionais e 53 intrapopulacionais). A avaliação dos híbridos, em relação à produtividade de grãos, foi realizada no ano agrícola 2003/2004, nos municípios de Lavras e Lambari (MG), em delineamento látice simples 13 x 13, utilizando-se como testemunhas os três híbridos comerciais e suas populações S0. Os dados foram submetidos à análise de variância individual e conjunta. A partir das esperanças dos quadrados médios foram estimados alguns parâmetros genéticos e fenotípicos. A depressão por endogamia dos híbridos comerciais também foi estimada. Foram identificados híbridos S0 interpopulacionais superiores, tanto aos híbridos simples comerciais quanto a suas gerações S0, em ambos os locais. Por outro lado, não se identificou nenhum híbrido intrapopulacional superior à média dos híbridos comerciais, devido, em parte, ao número de híbridos intrapopulacionais avaliados, 53 contra 110 híbridos S0 interpopulacionais. No entanto, foram identificados híbridos S0 intrapopulacionais com produtividade média de grãos superior a 10 t ha-1. De acordo com os resultados é possível obter híbridos, a partir de populações S0 de híbridos simples comerciais, com maior produtividade de grãos. Verificou-se também, que híbridos simples comerciais são excelente alternativa para a extração de linhagens, já que, em gerações iniciais de endogamia, a obtenção de híbridos superiores já é viável. This work was carried out with the objective of evaluating inter and intrapopulation maize hybrids from S0 progenies of commercial single cross hybrids. Three S0 populations from single cross hybrids (P30F45, Dow657 and DKB333B) were used, and 163 hybrids (110 inter and 53 intrapopulational crosses) were obtained. Hybrids were evaluated in Lavras and Lambari (MG), Brazil in relation to the grain yield, using the commercial hybrids and their S0 as checks in two replicate lattice design (13 x 13). Data were submitted to individual and combined ANOVA. Genotypic and phenotypic parameters were estimated from expected mean squares. Inbreeding depression in the commercial hybrids were estimated. Some interpopulational hybrids outyielded both commercial hybrids they originated from and their S0 used as checks, in the two locations. However, yields of all intrapopulation hybrids were lower than the hybrid checks, probably due to the lower number of intrapopulational hybrids (53) as compared to interpopulation hybrids (110). Intrapopulation hybrids of high productivity with average yield of 10 t ha-1 were identified, this demonstrating the possibility of obtaining high yielding hybrids from S0 populations of single cross hybrids. Single cross hybrids are an excellent alternative for developing inbreds, provide it is possible to obtain superior hybrids from early inbreeding generations.

Dois experimentos foram conduzidos com o objetivo de avaliar o desempenho e analisar a viabilidade econômica comparativa entre dois conceitos protéicos e duas linhagens de frangos de corte (Hybro G e Hybro PG), criados no período de inverno, com temperatura média de 16°C e UR média de 72%. As aves foram alimentadas com dietas formuladas pelo conceito de Proteína Bruta (PB) sem suplementação de aminoácidos e Proteína Ideal (PI), de 1 a 42 dias de idade nos dois sexos. O delineamento utilizado nos dois experimentos foi inteiramente casualizado num esquema fatorial 2 x 2 (2 conceitos protéicos e 2 linhagens) com 6 repetições de 20 aves para cada sexo. Machos não mostraram interação entre proteína x linhagens para as variáveis estudadas; entretanto, machos do conceito PB consumiram mais ração, porém ganharam menos peso e converteram pior que os PI. Para fêmeas, houve interação para a variável conversão alimentar, sendo que as aves do conceito PI da linhagem PG, foram mais eficientes que as aves do conceito PB. Para a mesma categoria, na análise dos efeitos isolados, não houve diferença significativa para consumo, entretanto, as fêmeas PI ganharam mais peso que as fêmeas PB. Na análise econômica dos resultados, foi observado que a formulação de dietas PI para ambos os sexos é mais rentável. Two experiments were conducted to evaluate the performance of broilers and analyze the comparative economical effects of two concepts of protein given to two lines of broilers (Hybro G and Hybro PG) reared during cold weather, average of 16 C and RH of 72%. The broilers were fed to diets formulated based on the concept of crude protein (PB) with addition of aminoacids or on the ideal protein (PI), from 1 to 42 days of age for both sexes. The experimental design in both experiments was entirely randomized in a factorial 2 x 2 (2 protein concept vs 2 lines). The males did not show evidence and the interaction between protein vs lines for all variables studied, however, males receiving crude protein had higher fed consumption, but, had a lower weight gain and worse fed conversion compared to ideal protein, For females there was an interaction for fed conversion, where broilers of the line PG receiving PI were more efficient than those of the concept PB. For the same category, analyzing the isolated effects, there was no significant difference for feed consumption, but females of PI were heavier than those of PB. The economical analysis of the results showed that the formulation of the PI concept for both sexes is worth.

O experimento utilizou 4 linhagens de tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) chamadas de CESP, Pernambuco, Santa Catarina e Tailandesa. O objetivo do projeto foi comparar o desempenho e a sobrevivência dessas diferentes linhagens de tilápia do Nilo na fase de reversão sexual. As pós-larvas foram estocadas em aquários de 4,5L em sistema de recirculação e com temperatura constante. Os peixes foram alimentados com ração contendo 60mg/kg de 17 alfa-metiltestosterona, fornecida 6 vezes ao dia, por período de 30 dias. O delineamento foi inteiramente casualizado com 4 tratamentos (linhagens) e 7 repetições. Os parâmetros avaliados foram: comprimento total, ganho de peso, taxa de crescimento específico, taxa de sobrevivência e eficiência de reversão sexual. Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey. A análise de reversão foi submetida ao teste de qui-quadrado. O resultado demonstra que houve maior eficiência na taxa de reversão sexual nas linhagens Santa Catarina e Pernambuco quando comparados com a CESP e a Tailandesa. As linhagens Tailandesa e Santa Catarina obtiveram maior taxa de sobrevivência e desempenho satisfatório durante a fase de reversão sexual, portanto, apresentam-se como as mais propícias para a criação em sistema de recirculação na fase de reversão sexual.This experiment aimed at comparing growth performance and survival of four Nile tilapia (Oreochromis niloticus) strains called CESP, Pernambuco, Santa Catarina and Thailand in sex reversal phase. Thirty Nile tilapia fries were stocked in 4.5L aquaria (6.66 fries/L) with recirculation system and water temperature control. The fishes were fed with ration containing 60mg/kg of 17 alpha-methyltestosterone, six times a day during 30 days. The experimental design was randomized with four treatments (strains) and seven replications. Total length, weight gain, specific growth rate, survival rate and sexual reversion efficiency were submitted to Anova, means compared by Tukey test and sex reversion by qui-square means. Santa Catarina and Pernambuco strains demonstrated better sex reversion efficiency when compared with CESP and Thailand. Thailand and Santa Catarina strains showed better values of survival, growth performance and specific growth rate than CESP and Pernambuco strains. Thus, Thailand and Santa Catarina strains are more indicated to rear in recirculation system during sex reversal phase.

O presente trabalho teve como objetivo avaliar o desempenho produtivo durante a fase inicial, de crescimento e o rendimento de filé na fase de engorda de diferentes linhagens de tilápia do Nilo existentes no Brasil. As linhagens estudadas foram: o híbrido intra-específico (HIB), cruzamento entre o macho Chitralada (tailandês) e a fêmea Bouaké (brasileira); a Bouaké (BOK), conhecida popularmente como Nilótica; a Chitralada, primeira geração da tailandesa (CHI1); a Chitralada, segunda geração da tailandesa (CHI2). Este experimento foi conduzido em quatro fases, no período de dezembro de 2000 a agosto de 2001. Durante as três primeiras fases foi utilizada uma instalação do tipo estufa, com 24 caixas, com capacidade de 250L, nas quais foram testados os quatro tratamentos com seis repetições. Na quarta fase, os peixes foram marcados individualmente e colocados dentro de um mesmo viveiro de terra de 300m². Para a fase de crescimento (terceira fase), os valores médios de peso final obtidos foram 93,66g (HIB); 71,79g (BOK); 108,17g (CHI1) e 114,31g (CHI2), de conversão alimentar aparente 1,77 (HIB); 1,98 (BOK); 1,46 (CHI1) e 1,45 (CHI2); para ganho de peso houve um aumento de 47% a 49% (CHI1 e CHI2, respectivamente) e 17% (HIB) em relação a Bouaké. A linhagem Chitralada (1ª e 2ª geração) e o híbrido mostraram maior tolerância a maior densidade de estocagem e biomassa final do que a linhagem Bouaké. Os valores médios de peso de carcaça obtidos na fase de engorda (quarta fase) foram: 261,99g (HIB); 177,98g (BOK); 292,75g (CHI1) e 307,82g (CHI2); sendo as diferenças significativas entre a Chitralada e o híbrido da Bouaké; para o rendimento de filé não houve diferença significativa. Estes resultados demonstraram que a linhagem de melhor desempenho foi a Chitralada (CHI1 e CHI2), seguida da linhagem híbrida (HIB) e da linhagem Bouaké (BOK).The present research had as objectives to evaluate the productive performance during the initial phase and growing and the fillet yield obtained in the fatten phase of different strains of Nile tilapia existents in Brazil. The studied strains were: the intraspecific hybrid (HIB), resulting from crossing between the male Chitralada (Thailand), and the female Bouaké (Brazilian); the Bouaké (BOK) popularly known like Nile tilapia; the Chitralada, first Thailand generation (CHI1); the Chitralada, second Thailand generation (CHI2). This experiment was carried out in the period from December 2000 to August 2001 and had four phases as characteristic. To the three first phases was used an installation type greenhouse, with 24 boxes, with capacity to 250L, where were tested the four treatments, with six replicates. To the fourth phase, the fishes were individually marked and put in a land tank with 300m². The obtained results to the final weight for the growing phase (3a phase) were: 93,66g (HIB); 71,79g (BOK); 108,17g (CHI1) e 114,31g (CHI2), and for apparent feed conversion ratio 1,77 (HIB); 1,98 (BOK); 1,46 (CHI1) e 1,45 (CHI2) and for weight gain there was the increasing from 47% to 49% (CHI1 and CHI2, respectively) and 17% (HIB) in relation to BOK. The CHI1 and CHI2 and the HIB showed a mayor tolerance and a mayor storage density and final biomass than the BOK. To the average values of carcass weight in the fatten phase (4ª phase) were: 261,99g (HIB); 177,98g (BOK); 292,75g (CHI1) e 307,82g (CHI2); the strains CHI1, CHI2 and the HIB presented the best results, obtaining significative differences of BOK. The results obtained to fillet yield showed that there was no significative difference between the strains. These results showed, that the strains with best general performance, was Chitralada (CHI1 and CHI2), followed by hybrid (HIB) and the Bouaké (BOK) strains.

Oito populações de milho-pipoca (CMS-42, CMS-43, Zélia, RS-20, Catedral, Zaeli, UEM-J1 e UEM-M2) foram avaliadas com o objetivo de obter estimativas de depressão por endogamia, componentes genéticos de média e comparar essas estimativas por grupos de populações. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso em esquema de parcelas subdivididas, cujos tratamentos primários foram os níveis de endogamia (S1 e S0) e os tratamentos secundários, as populações, com três repetições, em dois anos agrícolas (1998/99 e 1999/00). Foram avaliadas várias características, com ênfase no rendimento de grãos (RG) e na capacidade de expansão (CE). O método de GARDNER (1965) foi empregado para obter as estimativas dos componentes genéticos de médias. Observaram-se menores valores de depressão por endogamia e predominância de efeitos gênicos aditivos para CE em relação ao RG. A depressão endogâmica para rendimento de grãos foi maior no grupo dos compostos em relação às populações não melhoradas e à população melhorada. A probabilidade de sucesso na obtenção de linhagens vigorosas e de alta capacidade de expansão é baixa para todas as populações.Eight popcorn populations (CMS-42, CMS-43, Zelia, RS-20, Catedral, Zaeli, UEM-J1 and UEM-M2) were evaluated aiming at obtaintion of estimates of inbreeding depression and average genetic components and to compare these estimates to each genetic group. Each trial was carried out with plots in randomized complete block design with three replications in split-plot experiment, in which the plots were the inbreeding levels (S1 and S0) and in the sub-plots the populations in two years (1998/99 and 1999/00). The characteristics grain yield and popping expansion were evaluated. The GARDNER methodology (1965) was used for obtaining the estimates of average genetic components. It was observed lower values of inbreeding depression and predominance of additive effects for popping expansion in relation to yield. The values of inbreeding depression for grain yield were higher in the composite than in bath, improved and not improved varieties. Using these populations the probability of success in the obtaining vigorous and high popping expansion inbred lines is low.

Conduziu-se este trabalho com os objetivos de avaliar a capacidade combinatória de linhagens-elite de pimentão, identificar combinações híbridas superiores quanto à produtividade e qualidade de frutos, e inferir sobre os modos de ação gênica envolvidos na expressão dos caracteres de importância econômica. Para isso, foram realizados cruzamentos dialélicos para obtenção de híbridos, os quais foram analisados segundo o esquema dialélico parcial tipo North Carolina II, estimando-se as capacidades geral (CGC) de cada genitor dentro de cada grupo, bem como as capacidades específicas (CEC) de combinação para cada combinação de genitores. Os híbridos experimentais apresentaram heterose para produção total e massa média de fruto. A característica produção precoce é condicionada, predominantemente, por alelos recessivos. Os melhores híbridos, com perspectivas para uso comercial, foram F1 (L-3436 x L-004), F1 (L-3513 x L-004) e F1 (L-3509 x L-004). Foram obtidos valores positivos de heterose padrão variando de 7,50 a 49,89% para produção precoce, de 0,45 a 28,55% para produção total, e de 3,07 a 47,37% para massa média de fruto, em relação à cultivar-padrão Magali-R F1.

Submitted by Guilherme Lemeszenski (guilherme@nead.unesp.br) on 2013-08-22T19:08:08Z No. of bitstreams: 1 S1516-635X2002000200003.pdf: 67929 bytes, checksum: 33eda116d520706646e7ca51f7b18097 (MD5) Made available in DSpace on 2013-08-22T19:08:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 S1516-635X2002000200003.pdf: 67929 bytes, checksum: 33eda116d520706646e7ca51f7b18097 (MD5) Previous issue date: 2002-05-01 Made available in DSpace on 2013-09-30T18:02:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S1516-635X2002000200003.pdf: 67929 bytes, checksum: 33eda116d520706646e7ca51f7b18097 (MD5) S1516-635X2002000200003.pdf.txt: 27765 bytes, checksum: 1c6c2866361b2bd46f4d5710e4cf5c17 (MD5) Previous issue date: 2002-05-01 Submitted by Vitor Silverio Rodrigues (vitorsrodrigues@reitoria.unesp.br) on 2014-05-20T13:15:38Z No. of bitstreams: 2 S1516-635X2002000200003.pdf: 67929 bytes, checksum: 33eda116d520706646e7ca51f7b18097 (MD5) S1516-635X2002000200003.pdf.txt: 27765 bytes, checksum: 1c6c2866361b2bd46f4d5710e4cf5c17 (MD5) Made available in DSpace on 2014-05-20T13:15:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S1516-635X2002000200003.pdf: 67929 bytes, checksum: 33eda116d520706646e7ca51f7b18097 (MD5) S1516-635X2002000200003.pdf.txt: 27765 bytes, checksum: 1c6c2866361b2bd46f4d5710e4cf5c17 (MD5) Previous issue date: 2002-05-01 Dois experimentos foram realizados com o objetivo de avaliar os efeitos de diferentes níveis de aminoácidos e de cálcio sobre o desempenho e excreção de cálcio de duas linhagens de frangos de corte (Cobb e Avian Farms) na fase inicial de criação. Foram avaliados os dados de desempenho (consumo de ração, ganho de peso e conversão alimentar) e excreção de cálcio. Foram utilizadas 540 aves, em cada experimento, distribuídas em delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3x2, ou seja, 3 perfis de aminoácidos (metionina, metionina+cistina, lisina e treonina - 100%, 125% e 150% dos níveis do NRC,1994) e 2 níveis de cálcio (75% e 100% dos níveis do NRC,1994), com 30 aves por repetição. Analisou-se o cálcio excretado das aves, e para tanto, utilizou-se 72 aves, em cada experimento, alojadas em gaiolas, seguindo o mesmo delineamento descrito anteriormente. Não houve interação entre os tratamentos estudados. Para a linhagem Avian Farms, o ganho de peso diminuiu com a elevação dos níveis de aminoácidos e ocorreu menor excreção de cálcio com menor nível de cálcio da dieta. A linhagem Cobb não foi influenciada pelos tratamentos em nenhum dos parâmetros estudados. Two experiments were conducted to evaluate the performance and calcium excretion of broilers fed the diets with different amino acids (AA) and calcium (Ca) levels in the initial phase. In each experiments, male broilers, Cobb or Avian Farms, were randomly assigned to six treatments in a three X two factorial arrangement, considering the factors AA (100, 125 and 150% NRC, 1994) and Ca (75 and 100% NRC, 1994), in three replications of 30 birds each. The studied AA were methionine, methionine + cystine, lysine and threonine. The performance of the birds was analyzed according weight gain, feed intake and feed conversion. The lower calcium level reduced calcium excretion and increasing amino acids levels reduced weight gain in Avian Farms strain. The Cobb strain was not affected by treatments. UNESP UNESP FCAV Departamento de Morfologia e Fisiologia Animal UNESP FCAV Departamento de Zootecnia USP FZEA Departamento de Zootecnia UNESP UNESP FCAV Departamento de Morfologia e Fisiologia Animal UNESP FCAV Departamento de Zootecnia

The effect of irradiation doses (0, 125, 250 and 500 Gy) on the nutritional quality of A. bisporus mushrooms (strains ABI-07/06, ABI-05/03 and PB-1) cultivated in composts based on oat straw (Avena sativa) and brachiaria (Brachiaria sp.) was evaluated. The experimental design was 4 x 3 x 2 factorial scheme (irradiation doses x strains x composts), with 24 treatments, consisting of two repetitions each, totaling 48 experimental units (samples of mushrooms). The samples were irradiated in Cobalt-60 irradiator, model Gammacell 220 kGy, with dose rate of 0.740 kGy h–1, according to the treatments proposed. Subsequently, the control (unirradiated) and the other treatments were maintained at 4±1°C and 90% RH in a climatic chamber for carrying out the chemical analysis of the mushrooms on the 1st and 14th day of storage. It was found that all A. bisporus strains evaluated were food with excellent nutritional value, because they presented high protein and fiber contents and low ethereal extract content; the chemical characterization of the mushrooms was influenced by the compost type in which they were cultivated; gamma irradiation influenced the chemical composition of mushrooms. O efeito de doses de irradiação (0, 125, 250 e 500 Gy) na qualidade nutricional de cogumelos A. bisporus(linhagens ABI-07/06, ABI-05/03 e PB-1) cultivados em compostos à base de palha de aveia (Avena sativa) e braquiária (Brachiariasp.) foi avaliado. O delineamento experimental foi em esquema fatorial 4 x 3 x 2 (doses de irradiação x linhagens x compostos), com 24 tratamentos, sendo cada qual constituído de 2 repetições, totalizando 48 unidades experimentais (amostras de cogumelos). As amostras de cogumelos foram irradiadas em irradiador de Cobalto-60, tipo Gammacell 220 e taxa de dose 0,740 kGy h–1, de acordo com os tratamentos propostos. Posteriormente, o controle (não irradiado) e demais tratamentos foram mantidos a 4±1°C e 90% UR em câmara climatizada para a realização das análises químicas dos cogumelos no 1° e 14° dia de armazenamento. Verificou-se que: todas as linhagens de A. bisporus avaliadas constituem um alimento com excelente valor nutritivo, pois apresentam alto teor de proteína e fibra bruta, além de conterem baixo teor de extrato etéreo; a caracterização química dos cogumelos foi influenciada pelo tipo de composto em que foram cultivados; a irradiação gama influenciou na composição química dos cogumelos.

Avaliaram-se, quanto à tolerância à toxicidade de alumínio, 18 linhagens de trigo introduzidas do Centro Internacional de Melhoramento de Milho e Trigo (CIMMYT), México; 18 linhagens obtidas do programa de melhoramento do Instituto Agronômico (IAC), Campinas (SP), e as cultivares IAC-24 e IAC-289, em dois experimentos realizados em laboratório, empregando soluções nutritivas, com seis concentrações de alumínio. Nesses experimentos, utilizaram-se as cultivares BH-1146 (tolerante) e Anahuac (sensível) como controles para a tolerância. Os genótipos, exceto BH-1146 e o Anahuac, foram também avaliados em dois experimentos de campo irrigados por aspersão, na Estação Experimental de Agronomia de Tatuí, em 1999. Analisaram-se a produção de grãos, altura das plantas e o número de grãos por espigueta (fertilidade da espiga). As linhagens selecionadas no IAC destacaram-se quanto à tolerância à toxicidade de alumínio em relação às mexicanas, o que demonstra a importância de se verificar a origem dos genótipos quando o objetivo for o cultivo em solo ácido. As linhagens tolerantes a 10 mg.L-1 de Al3+ na solução, tanto as mexicanas como as do IAC, podem ser empregadas como fonte para tolerância ao alumínio, particularmente as linhagens 11 (PVN"S"/3/BB/CNO"S"/ / JAR/4/ORZ/5/IAC-60) e 5 (RAC 649/IAC-120), selecionadas no IAC, que apresentaram, também, porte baixo e grande fertilidade da espiga respectivamente.Eighteen wheat lines introduced from the International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Mexico, and eighteen wheat lines selected at the Instituto Agronômico (IAC) from the wheat breeding program, plus the cultivars IAC-24 and IAC-289 were evaluated in relation to the tolerance to aluminum toxicity, in two experiments, using nutrient solutions with six different aluminum concentrations, in laboratory conditions. The cultivars BH-1146 (tolerant) and Anahuac (sensitive) were also used as tolerance controls. The same genotypes, except BH-1146 and Anahuac, were also evaluated in two trials carried out under sprinkler irrigation, at the Tatuí Agronomic Experimental Station, in 1999. Grain yield, plant height and the number of grain per spikelet (head fertility) were evaluated under field conditions. The IAC selected lines were superior for aluminum tolerance in relation to the CIMMYT lines, demonstrating the importance of genotype origin when the objective is to grow in acid soil. The Mexican and the IAC selected lines showing tolerance to 10 mg.L-1 of Al3+ could be used as aluminum tolerance source, particularly the lines 11 (PVN"S"/3/ BB/CNO"S"//JAR/4/ORZ/5/IAC-60) and 5 (RAC 649/IAC-120), selected at IAC, which showed not only aluminum tolerance but also short stature and high head fertility, respectively.

Avaliaram-se, quanto à tolerância à toxicidade de alumínio, 18 linhagens de trigo introduzidas do Centro Internacional de Melhoramento de Milho e Trigo (CIMMYT), México; 18 linhagens obtidas do programa de melhoramento do Instituto Agronômico (IAC), Campinas (SP), e as cultivares IAC-24 e IAC-289, em dois experimentos realizados em laboratório, empregando soluções nutritivas, com seis concentrações de alumínio. Nesses experimentos, utilizaram-se as cultivares BH-1146 (tolerante) e Anahuac (sensível) como controles para a tolerância. Os genótipos, exceto BH-1146 e o Anahuac, foram também avaliados em dois experimentos de campo irrigados por aspersão, na Estação Experimental de Agronomia de Tatuí, em 1999. Analisaram-se a produção de grãos, altura das plantas e o número de grãos por espigueta (fertilidade da espiga). As linhagens selecionadas no IAC destacaram-se quanto à tolerância à toxicidade de alumínio em relação às mexicanas, o que demonstra a importância de se verificar a origem dos genótipos quando o objetivo for o cultivo em solo ácido. As linhagens tolerantes a 10 mg.L-1 de Al3+ na solução, tanto as mexicanas como as do IAC, podem ser empregadas como fonte para tolerância ao alumínio, particularmente as linhagens 11 (PVN"S"/3/BB/CNO"S"/ / JAR/4/ORZ/5/IAC-60) e 5 (RAC 649/IAC-120), selecionadas no IAC, que apresentaram, também, porte baixo e grande fertilidade da espiga respectivamente. Eighteen wheat lines introduced from the International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Mexico, and eighteen wheat lines selected at the Instituto Agronômico (IAC) from the wheat breeding program, plus the cultivars IAC-24 and IAC-289 were evaluated in relation to the tolerance to aluminum toxicity, in two experiments, using nutrient solutions with six different aluminum concentrations, in laboratory conditions. The cultivars BH-1146 (tolerant) and Anahuac (sensitive) were also used as tolerance controls. The same genotypes, except BH-1146 and Anahuac, were also evaluated in two trials carried out under sprinkler irrigation, at the Tatuí Agronomic Experimental Station, in 1999. Grain yield, plant height and the number of grain per spikelet (head fertility) were evaluated under field conditions. The IAC selected lines were superior for aluminum tolerance in relation to the CIMMYT lines, demonstrating the importance of genotype origin when the objective is to grow in acid soil. The Mexican and the IAC selected lines showing tolerance to 10 mg.L-1 of Al3+ could be used as aluminum tolerance source, particularly the lines 11 (PVN"S"/3/ BB/CNO"S"//JAR/4/ORZ/5/IAC-60) and 5 (RAC 649/IAC-120), selected at IAC, which showed not only aluminum tolerance but also short stature and high head fertility, respectively.

Avaliaram-se o potencial produtivo, o rendimento de grãos após descascamento e a massa de grãos de onze linhagens de amendoim (Arachis hypogaea L.) do programa de melhoramento do Instituto Agronômico e da cultivar IAC-Tatu-ST, com e sem controle de doenças foliares. O material genético classifica-se no grupo ereto precoce (A. hypogaea subsp. fastigiata, Waldron). Seis experimentos foram desenvolvidos na época das águas, no Núcleo de Agronomia da Alta Mogiana e na Estação Experimental de Agronomia de Pindorama, em 1994/95, 1995/96 e 1996/97, em esquema com duas parcelas subdivididas, em blocos ao acaso com quatro repetições, em que as parcelas principais consistiram em tratamentos com e sem o controle químico das doenças. As parcelas tratadas foram pulverizadas periodicamente com 3,0 L.ha-1 do fungicida chlorothalonil para controle da mancha-castanha e da mancha-preta (Cercospora arachidicola e Cercosporidium personatum) e da verrugose (Sphaceloma arachidis). A ausência de controle químico resultou em significativas reduções, até de 60%, na produção de todos os genótipos. Com as doenças controladas, as linhagens IAC 5, IAC 21, IAC 22 e IAC 81-12 apresentaram maior potencial produtivo, atingindo 5.000 kg.ha-1 em dois dos experimentos. As linhagens IAC 81-7 e IAC 88-1 apresentaram os melhores desempenhos relativos entre as médias de ambientes com e sem controle químico. As doenças causaram reduções até de 14% no peso médio dos grãos, sobretudo nas linhagens IAC 5, IAC 21 e IAC 22, cujos grãos são de maior tamanho médio. Não foram observadas diferenças significativas em rendimento de grãos entre os tratamentos, na maioria dos ambientes; essa característica mostrou, também, ser pouco influenciada pela presença das doenças.Eleven peanut lines and the cultivar IAC-Tatu-ST, of the upright early maturing group (Arachis hypogae subsp. fastigiata, Waldron), were evaluated for pod yield, shelling percentage and average kernel weight in six field experiments carried out at the Ribeirão Preto and Pindorama Experiment Stations of Instituto Agronômico, State of São Paulo, Brazil, during the 1994/95, 1995/96 and 1996/97 growing seasons. Experiments used a split plot design where the main plots consisted of spraying and not spraying fungicides to control foliar diseases. Treated plots were periodically sprayed with 3.0 L.ha-1 of chlorothalonil to control early and late leafspots (Cercospora arachidicola and Cercosporidium personatum) and scab (Sphaceloma arachidis). Absence of disease control resulted in significant up to 60% yield reductions in all genotypes. Where diseases were controlled, the lines IAC 5, IAC 21, IAC 22 and IAC 81-12 showed the highest yield potential, reaching 5.000 kg.ha-1 in two experiments. Lines IAC 81-7 and IAC 88-1 presented superior relative performance along the environments with and without disease control. Diseases caused reductions in average kernel weight of up to 14%, especially in lines IAC 5, IAC 21 and IAC 22 whose kernel weights ranked highest. Differences in shelling percentage between genotypes were generally not significant. This character was also showed less influenced by foliar diseases.

O objetivo deste trabalho foi verificar a performance de crescimento de diferentes linhagens de tilápia-do-nilo, Oreochromis niloticus, em gaiolas individuais instaladas em laboratório na Universidade Estadual de Londrina-PR. Foram estudadas linhagem proveniente da Tailândia, linhagem local do norte do Paraná e o seu híbrido (macho tailandês x fêmea local). O experimento foi conduzido em 36 gaiolas individuais com qualidade e temperatura da água controladas. O peso inicial para as tilápias foi de 37,20  4,83; 35,05  3,56 e 35,52  4,19 g para as variedades tailandesa, híbrida e local, respectivamente. Ao final, foram observados pesos de 64,09  12,16; 53,36  10,08 e 52,73  7,92 g para a mesma ordem anteriormente descrita. O fator de condição (Kn) calculado para as diferentes variedades não apresentou diferenças (p>0,05). Foi utilizado o programa Primer para a análise de variância e para o teste de Student Newman Keuls. A linhagem tailandesa apresentou o melhor crescimento (pThe aim of this study was to verify the growth performance of different strains of Nile tilapia, Oreochromis niloticus, in individual cages installed in the laboratory of Universidade Estadual de Londrina (Paraná, Brazil). The strain from Thailand, the local strain of the northern Paraná and their hybrid (Thailand male x local female) were studied. The experiment was carried out in 36 individual cages with controlled water quality and water temperature. The initial weight was 37.20  4.83; 35.05  3.56 and 35.52  4.19g for Thailand, hybrid and local strains respectively. At the end of the experiment the weights were 64.08  12.16; 53.36  10.08 and 52.73  7.92g for the same previous sequence. The condition factor (Kn) estimated for the different strains showed no difference (p>0.05). Primer software was used for variance analysis and for Student Newman Keuls test. The Thailand strain presented the best growth performance (p>0.05), but no significant difference was found between local and hybrid strains.

Dissertação de Mestrado em Evolução e Biologia Humanas, apresentada ao Departamento de Ciências da Vida da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra Portugal revela um particular interesse na análise genética de populações modernas devido à complexidade da sua história nos últimos dois milénios, que envolveu uma estadia a longo prazo de populações bastante distintas ao nível da sua origem geográfica, religião e cultura. O grande contributo para o legado genético português terá sido o processo de povoamento paleolítico a partir do Médio Oriente (Pré-história), no entanto eventos como a difusão démica da agricultura no Neolítico e, mais tarde, a presença dos celtas na Idade do Ferro, as migrações fenícias e gregas, a ocupação romana, a chegada de Judeus, as invasões germânicas e a presença de ÁrabesBerberes, também parecem ter contribuído para o pool genético. O presente trabalho teve como objetivo principal a caracterização do haplogrupo J-M304 numa amostra populacional portuguesa no sentido de tentar estabelecer uma relação entre a presença deste haplogrupo e seus subtipos com eventos históricos ou demográficos ocorridos no passado. Para este trabalho, uma amostra de 324 indivíduos do sexo masculino de naturalidade Portuguesa, com distribuição por várias regiões de Portugal (maioritariamente zona centro) foi estudada para 12 Y-SNPs (M9, M304, M267, M172, M365, P56, P58, M410, M12, P55, M205, M241) e 7 Y-STRs (DYS19, DYS389I, DYS389II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393). Registaram-se frequências de 9,9% para o haplogrupo J-M304 na amostra total (324 indivíduos), dos quais 1,9% corresponde a J1-M267 e 8,0% a J2-M172. O estudo de um total de 56 indivíduos classificados como J-M304 (32 neste estudo e 24 previamente genotipados) permitiu identificar no sub-haplogrupo J1-M267 pelo menos três subtipos: J1*-M267 (21,1%), J1a1-M365 (5,3%) e J1a2b-P58 (73,6%); e no sub-haplogrupo J2-M172 dois subtipos: J2a-M410 (75,7%) e J2b2-M241 (24,3%). A análise de STRs revelou a presença de sinais de colonização fenícia, previamente descritas na literatura, em três amostras da Beira litoral J1-M267 e J2M172, o que sugere uma possível influência das expansões marítimas na antiguidade provenientes do Médio Oriente nesta região litoral do país. Três amostras J1a2b-P58 revelaram ser compatíveis com um haplótipo modal associado aos Judeus. Uma amostra proveniente do Minho J1a1-M365 revelou um haplótipo que parece estar associado a proveniência germânica ou alana, provavelmente com origem nas invasões bárbaras pós-queda do Império Romano. Em conclusão, este estudo sugere que uma análise mais extensa a nível haplotípico, bem como o aumento de amostragem, poderão ser relevantes no esclarecimento mais aprofundado das diversas linhagens do cromossoma Y em Portugal, e em particular para o haplogrupo J-M304, de modo a confirmar as suas prováveis origens históricas. Portugal shows a particular interest in the genetic analysis of modern populations due to the complexity of its history over the past two millennia, which involved a long-term stay of quite distinct populations in terms of their geographical origin, religion and culture. The major contribution to the Portuguese genetic legacy has been the Paleolithic settlement process from the Middle East (Prehistory), however events such as the demic diffusion of agriculture in the Neolithic and later, the presence of the celts in the Age of Iron, the phoenician and greek migrations, the roman occupation, the arrival of Jews, the germanic invasions and the presence of Arab-Berber, also appear to have contributed to the gene pool. The present study aimed to characterize the haplogroup J-M304 in a portuguese population sample in order to try to establish a relationship between the presence of this haplogroup and its subtypes with historical or demographic events in the past. For this work, a sample of 324 males of portuguese nationality, with distribution through various regions of Portugal (mainly Central Zone) was studied for 12 Y-SNPs (M9, M304, M267, M172, M365, P56, P58, M410, M12, P55, M205, M241) and 7 YSTRs (DYS19, DYS389I, DYS389II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393). A frequency of 9,9% was found for haplogroup J-M304, in the total sample (324 individuals), of which 1,9% corresponds to J1-M267 and 8,0% to J2-M172. The study of a total of 56 individuals classified as J-M304 (32 from this study and 24 previously genotyped) allowed to identify in the sub-haplogroup J1-M267 at least three subtypes: J1*-M267 (21,1%), J1a1-M365 (5,3%) and J1a2b-P58 (73,6%) and in the sub-haplogrupo J2-M172 two subtypes: J2a-M410 (75,7%) and J2b2-M241 (24,3%). The analysis of STRs revealed the presence of Phoenician colonization signals, previously described in the literature, in three samples J1-M267 and J2-M172 from Beira Litoral, suggesting a possible influence of maritime expansions from the Middle East in this coastal region of the country. Three samples J1a2b-P58 showed to be compatible with a modal haplotype associated with Jews. A sample from the Minho J1a1-M365 revealed an haplotype that appears to be associated with Germanic or Alans migrations, probably with origin in the barbaric invasions post-fall of the Roman Empire. In conclusion, this study suggests that a more extensive haplotype analysis, as well as an increase sampling, may be relevant in further clarification of the various lineages of the Y-chromosome in Portugal, and in particular for the haplogroup J-M304, confirming their likely historical origins.

Objetivou-se por este trabalho avaliar a adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos de soja no Estado do Mato Grosso. Foram testados 16 genótipos nas safras 2004/05 e 2005/06, nos municípios de Novo São Joaquim, Porto Alegre do Norte e Sinop, utilizando-se o delineamento de blocos casualizados e três repetições. Os métodos de adaptabilidade e estabilidade avaliados foram: Plaisted e Peterson, Wricke, Annicchiarico, Lin e Binns, Eberhart e Russel, Cruz, Torres e Vencovsky e AMMI. Após as análises dos dados, conclui-se que as metodologias estudadas foram concordantes e complementares quanto aos resultados de análise de adaptabilidade e estabilidade fenotípica. Os ambientes diferiram quanto à favorabilidade em função do ano agrícola. A linhagem UFU 23 apresentou alta adaptabilidade e estabilidade fenotípica em todas as metodologias estudadas.

En Colombia no es obligatoria la notificación de L. monocytogenes en alimentos, pero se vigilan los alimentos de alto riesgo. Clínicamente se reportan como microorganismo Gram-positivo sólo cuando causan meningitis. L. monocytogenes es un patógeno intracelular, transmitido por alimentos, letal para humanos y animales, que causa Listeriosis; enfermedad que genera varios brotes en el mundo, con pérdidas humanas y económicas. Pocos trabajos en Colombia han logrado identificar y serotipificar molecularmente los aislamientos, lo que sólo permite distribuir teóricamente los serotipos en linajes. Esta revisión se limita a mostrar características del patógeno, su importancia en salud pública y en la industria de alimentos, generalidades de la PFGE-CHEF; identificando el protocolo estandarizado de trabajo y las enzimas de restricción adecuadas para cortar el ADN. Se encontró que la combinación de enzimas Xbal-AscI, seguida de ApaI es la que ofrece mejores resultados en la diferenciación de los aislamientos; agrupándolos por linajes; mostrando variaciones intra-serotipo y que en varios países latinoamericanos se analizan los resultados a través de PulseNet, lo que garantiza la comparación de los patrones de PFGE en igualdad de condiciones. The reporting of L monocytogenes in food in Colombia is not a mandatory; however, foods considered high-risk are monitored, and the organism is only reported clinically as Gram-positive when it causes meningitis. L. monocytogenes is a foodborne, intracellular, pathogen which causes listeriosis, a disease lethal to humans and animals. Outbreaks of this disease worldwide can bring about human and economic losses. Only a few studies in Colombia have been able to identify and molecularly serotype isolates allowing only the theoretical distribution of serotypes by lineage. This review explains the characteristics of the pathogen, its importance in public health and in the food industry, and provides an overview of PFGE-CHEF; identifying the standard work protocol and the appropriate restriction enzymes to cut DNA. We found that the enzyme combination, Xbal-AscI, followed by ApaI offers the best results to differentiate isolates, by grouping them by lineages, and displaying intra-serotype variations. Additionally, we found that in several Latin American countries the results are analyzed using PulseNet; this ensures the comparison of PFGE patterns in equivalent conditions. Na Colômbia não há uma notificação compulsória de L. monocytogenes em alimentos, mas alimentos de alto risco são monitorados. Clinicamente, são relatados como organismos Gram-positivos apenas quando eles causam meningite. L. monocytogenes é um patógeno intracelular de origem alimentar, letal para seres humanos e animais, que causa a listeriose, que gera surtos em todo o mundo, com perdas humanas e económicas. Poucos trabalhos na Colômbia identificaram e sorotipificaram molecularmente os isolados, que só permite a distribuição de sorotipos teoricamente em linhagens. Esta avaliação é limitada a mostrar características do patógeno, sua importância na saúde pública e na indústria de alimentos, e uma visão geral do PFGE-CHEF; identificar o protocolo-padrão de trabalho e enzimas de restrição apropriadas para cortar o ADN. Verificou-se que a combinação de enzimas Xbal-AscI, seguido por ApaI representa a combinação de enzimas que ofereceu melhores resultados na diferenciação dos isolados, agrupando-a por linhagens, mostrando a variação intra-serotipo e que, em muitos países da América Latina, os resultados são analisados através PulseNet, que assegura a comparação de padrões de PFGE em igualdade de condições.

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:37:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paulo_Evandro_Jandrey.pdf: 921971 bytes, checksum: d3457f5f5270b5d9b9a7612a24091ca0 (MD5) Previous issue date: 2013-05-17 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Knowledge of the degree of seed germination in the ear is useful both for crop condition as for breeding in wheat. The results of the different tests used to identify cultivars with improved tolerance of sprouting indicate that there is possibility to keep the grains with suitable properties for industry, enabling decrease the amount of losses occurring on the wheat production areas. Accordingly, the aim of this study was to evaluate the tolerance to sprouting and grain yield in wheat grown at two sowing dates. The field experiment was conducted in the area of the Center of Research in COODETEC Palotina-PR using randomized blocks with 15 x 2 factorial arrangement with 3 replications. The first factor refers to genotypes, 3 cultivars (Mirante, CD 150 and Frontana) and 12 lineages resulting from the backcross of cultivars CD 150 with Frontana (CD 12901, CD 12902, CD 12903, CD 12904, CD 12905, CD12906 , CD 12907, CD 12908, CD12 909, CD12 910, CD12 911 and CD 12912). The second factor relates to the two sowing dates (31/03 and 05/03/2012). Plots consisted of 6 rows of 6 meters in length, 0.17 meters spacing between lines, being regarded as one boundary line on each side and 0.50 meters from each end. Evaluations of sprouting, the experiments were conducted in the laboratory, using a randomized block design in 15 x 2 factorial arrangement with 4 replications, each replication was composed of 10 spikes. In the evaluations of sprouting was evaluated for germination in two distinct metologias (immersion in water and rainfall simulator). The variable number of days to silking, plant height, thousand grain weight and number of grains per spike were the characteristics that have greater variability among genotypes, and the sowing in 03/05 was the one that led to the highest for plant height, test weight, number of spikelets per spike and number of grains per spike. The cultivar Frontana showed high resistance to germination of the grain in the ear, regardless of sowing and methodology. Genotypes CD 12901, CD 12905, CD 12907 showed tolerance to the germination of the grain in the ear when evaluated by the method of rainfall simulator in sowing on 31/03. Highest grain yield was obtained for genotypes CD 12902, CD 12905, CD 12909, CD 12910 and CD 12911 in sowing in 03/05. Already Frontana to cultivate, cultivate greater number of days to silking, the highest yield was obtained in sowing on 31/03 O conhecimento do grau de germinação da semente na espiga é de utilidade tanto para condição de lavoura como para trabalhos de melhoramento na cultura do trigo. Resultados de diferentes testes utilizados para identificar as cultivares com melhor tolerância à germinação na espiga indicam que existe possibilidade de manter os grãos com as propriedades adequadas para a indústria, possibilitando diminuir a quantidade de perdas ocorrentes nas regiões produtoras de trigo. Nesse sentido, objetivou-se com este trabalho avaliar a tolerância a germinação na espiga e a produtividade de grãos em genótipos de trigo cultivados em duas épocas de semeadura. O experimento a campo, foi conduzido na área experimental do Centro de Pesquisa da COODETEC em Palotina-PR utilizando o delineamento em blocos ao acaso em esquema fatorial 15 x 2, com 3 repetições. O primeiro fator refere-se aos genótipos, sendo 3 cultivares (Mirante, CD 150 e Frontana) e 12 linhagens resultantes do retrocruzamento das cultivares CD 150 com Frontana (CD 12901, CD 12902, CD 12903, CD 12904, CD 12905, CD 12906, CD 12907, CD 12908, CD 12909, CD 12910, CD 12911 e CD 12912). O segundo fator refere-se as duas épocas de semeadura (31/03 e 03/05/2012). As parcelas foram constituídas de 6 linhas de 6 metros de comprimento, com espaçamento de 0,17 metros entre linhas, sendo considerado como bordadura 1 linha de cada lado e 0,50 metros de cada extremidade. Para as avaliações de germinação na espiga, os experimentos foram conduzidos em laboratório, utilizando o delineamento de blocos ao acaso em esquema fatorial 15 x 2 com 4 repetições, sendo que cada repetição foi composta de 10 espigas. Nas avaliações de germinação na espiga, foi avaliado o índice de germinação em duas metodologias distintas (imersão em água e simulador de chuva). As variáveis número de dias para o espigamento, altura de plantas, massa de mil grãos e numero de grãos por espiga foram as características que apresentaram maior variabilidade entre os genótipos estudados, sendo que a semeadura realizada em 03/05 foi a que proporcionou maiores valores para altura de plantas, peso do hectolitro, número de espiguetas por espiga e número de grãos por espiga. O cultivar Frontana apresentou alta resistência ao processo germinativo do grão na espiga, independente da época de semeadura e metodologia utilizada. Os genótipos CD 12901, CD 12905, CD 12907 apresentaram tolerância ao processo germinativo do grão na espiga quando avaliados pelo método de simulador de chuva em semeadura realizada em 31/03. Maior rendimento de grãos foi obtido para os genótipos CD 12902, CD 12905, CD 12909, CD 12910 e CD 12911 na semeadura realizada em 03/05. Já para o cultivar Frontana, cultivar de maior numero de dias para o espigamento, o maior rendimento foi obtido na semeadura realizada em 31/03