Предметом исследования данной статьи является один из механизмов обеспечения прав субъектов предпринимательства при осуществлении в отношении них государственного и муниципального контроля и надзора, а именно - институт возражений на акт проверки или предписание об устранении выявленного нарушения. Автор подробно рассматривает такие аспекты, как значение и место возражений подконтрольного субъекта в системе контрольно-надзорных правоотношений, его правовая природа. Особое внимание уделяется рассмотрению принципа объективности при осуществлении контрольно-надзорной деятельности. Методологическую основу научной статьи составляют такие общенаучные методы, как системный, сравнительный, статистический метод, метод анализа и синтеза. Для осуществления научного исследования использовались такие частноправовые методы, как формально-юридический, сравнительно-правовой метод. Новизна научного исследования заключается в том, что в статье с учетом реализуемой административной реформы подробно раскрывается сущность института возражений подконтрольного субъекта, анализируется его правовая природа с точки зрения общей теории права и с точки зрения отраслевого регулирования. В заключении автором предлагаются необходимые на его взгляд изменения в действующем законодательстве для повышения гарантированности прав подконтрольных субъектов и придания системе контрольно-надзорных отношений большей эффективности.