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L'ostréiculture en baie de Morlaix demeure une activité emblématique du territoire qui contribue à sa notoriété ainsi qu'à son attractivité. Cette activité du secteur primaire, qui emploie 107 peronnes en Equivalent Temps Plein (ETP), produit annuellement environ 7000 tonnes d'huîtres creuses et environ 90 tonnes d'huîtres plates ce qui représentent indéniablement un poids socio-économique significatif à l'échelon local. Dans la perspective de faire évoluer les limites des zones conchylicoles existantes sur l'estuaire de la Penzé, les professionnels ont sollicité l'élaboration d'une étude de zone pour en déterminer l'opportunité. Cette demande ayant fait l'objet d'une acceptation par l'administration, le laboratoire Environnement Ressources Finistère Bretagne Nord de Concarneau a été désigné pour réaliser cette étude sanitaire. Les résultats obtenus au cours de cette année d'étude ont permis d'évaluer les qualités bactériologique et chimique sur les 2 points de suivi, le point "Pont de la corde" d'une part, traditionnellement retenu dans le cadre du réseau de surveillance microbiologique et le nouveau point "Passe aux moutons". L'analyse de ceux-ci conclut au classement en salubrité B des deux points échantillonnés et conduit ainsi à maintenir la limite de la zone A dans sa configuration actuelle pour les coquillages du groupe 3. Dans le cadre de la surveillance ultérieure de la zone conchylicole, nous avons maintenu le point "Pont de la corde" comme point de référence du réseau REMI en raison de l'importante série temporelle des données disponibles. La réglementation européenne ne se borne pas à fixer des normes pour la production et la mise sur le marché des coquillages vivants. Désormais, le guide des bonnes pratiques préconise une démarche préventive du risque sanitaire. Pour ce faire, elle suggère d'oeuvrer à l'élaboration d'une étude sanitaire incluant l'identification des sources potentielles de contamination d'origine humaine et animale, la détermination des variations intra-annuelles de ces contaminations ou encore la modélisation de la circulation de ces polluants biologiques et chimiques. Dans le cadre de cette nouvelle approche méthodologique, nous avons engagé l'étude sanitaire à l'échelle du bassin versant de la Penzé, afin d'identifier les sources potentielles de contamination microbiologique des eaux. Pour y parvenir, nous avons synthétisé de multiples informations obtenues aurpès de diverses administrations et collectivités territoriales (inspection du littoral) ayant pour objectif de recenser les rejets, connus ou sauvages, sur le territoire étudié. Les données acquises accréditent l'idée dune contamination concomitante des eaux littorales, l'une générée préférentiellement par l'assainissement collectif et l'autre d'origine agricole, en lien avec les rejets ponctuels et diffus. Les programmes de bassin versant et la création d'un SAGE sur le bassin versant de la Penzé, prenant en compte les enjeux de la restauration de la qualité de l'eau, de la protection et du développement de la conchyliculture, offre donc une perspective rassurante sur la pérennisation de cette activité traditionnelle, très dépendante de son environnement.

Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez l'huître plate Ostrea edulis et les moules Mytilus edulis et M. galloprovincialis. Le secteur en attente d'agrément vis à vis de ces deux maladies est la zone X. En accord avec l'autorité compétente, il a été décidé de suspendre cette surveillance depuis 2007 (difficulté d'accès à la ressource et très faible densité en huîtres plates en zone X). L'étude des cas des hausses de mortalités a été poursuivie; le nombre d'évènements en 2008 est supérieur à celui de 2007 (57 évènements, 75 lots analysés, 28 constats rédigés). Des hausses de mortalités d'huîtres creuses (Crassostrea gigas) ont été recensées dans l'ensemble des bassins de production, principalement en période estivale. Au sein de cette espèce, le naissain et les huîtres juvéniles ont été principalement atteints, avec des taux de mortalité calculés pour ces catégories d'animaux particulièrement élevés (80 % à 100 % pour de nombreux lots). Des agents viraux (Herpès virus OsHV-1) et bactériens (Vibrio splendidus, V. aestuarianus, bactéries du groupe de V. harveyi) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité en 2008. Des hausses de mortalités ont également affecté d'autres espèces de mollusques (huîtres plates, moules, coques, palourdes, flions tronqués), marquées par la détection du parasite protozoaire Marteilia refringens de type M dans des échantillons de moules et du protozoaire à déclaration obligatoire Bonamia exitiosa dans un échantillon d'huîtres plates en mer Méditerranée. En 2008, la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques a visé à caractériser les espèces des parasites Bonamia chez l'huître plate Ostrea edulis dans les principaux sites français de captage et de production. Il ressort que le parasite Bonamia ostreae est présent sur tous les secteurs conchylicoles échantillonnés, en baie de Cancale, en rade de Brest et en baie de Quiberon. Le parasite Bonamia exitiosa n'a pas été détecté dans ces secteurs dans le cadre de la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques menée en 2008. Les trois protocoles d'épidémiosurveillance ont été complétés par une étude particulière avec l'accord de l'autorité compétente. En 2007, faisant suite à la déclaration par l'Espagne et l'Irlande de cas d'infections à Candidatus Xenohaliotis californiensis chez des ormeaux d'élevage, il a été décidé d'effectuer une recherche de cet organisme à déclaration obligatoire (Organisation Mondiale de la Santé Animale) dans les ormeaux, Haliotis tuberculata, produits en France.

Le but de cette étude est de comprendre la dynamique de ces apports en mer, dont le rythme est commandé par l’ouverture et la fermeture des portes à marées. Cela nécessite de connaître l’évolution des teneurs des produits recherchés et des débits au cours d’un cycle d’ouverture des portes à marée et d’évaluer si les profils de flux sont constants ou soumis à des phénomènes aléatoires plus ou moins contrôlables.

Les coquillages mis dans les circuits normaux de commercialisation font l'objet d'une surveillance de leur qualité bactériologique : - de la part de l'IFREMER, sur les lieux de production ; - de la part de la Direction des Services Vétérinaires (DSV), ensuite, tout au long de la chaîne de commercialisation. A côté des zones de production concédées à des professionnels, il existe des gisements naturels exploités, en pêche à pied de loisir (ou pêche récréative), avec des fréquentations très variables suivant l'amplitude des marées et les saisons. Pendant longtemps ces gisements ont été exploités sans aucune surveillance de la qualité bactériologique des coquillages. C'est la Direction Départementale de l'Action Sanitaire et Sociale de Loire-Atlantique (DDASS 44) qui, la première dans notre région dès 1986, a mis en oeuvre un réseau de surveillance. D'empirique à ses débuts, ce réseau a été amélioré, avec une meilleure connaissance des gisements, par des enquêtes de terrain, puis par des recensements à partir de prises de vues aériennes.

The gulf of Morbihan, without manifesting any pronounced signs of eutrophication, has, in 1995, three sites of green algae proliferation: the Auray river estuary, the branches of the Vannes and Séné estuary, as well as the outlet of the Noyalo's estuary. They are also the three sectors of the gulf that receive the most nutrient salts, in particular, nitrogen, which is a determining factor in the development of nitrophilic green algae (Ménesguen and Piriou 1995). During spring the nitrogen seems to come as much from urban sources (Vannes, Auray) as from agricultural sources coming from the northern catchment areas of the gulf., Le golfe du Morbihan, sans manifester de signes d'eutrophisation marqués,possède, en 1995, trois sites de prolifération d'algues vertes : l'estuaire de la rivière d'Auray, les bras de l'estuaire de Vannes et Séné, ainsi que le débouché de l'estuaire de Noyalo. Il s'agit également des trois secteurs du golfe,qui reçoivent le plus de sels nutritifs, en particulier, l'azote qui est un facteur déterminant dans le développement des algues vertes nitrophi]es.(Ménesguen et Piriou 1995). Les apports d'azote en période printanière paraissent être autant d'origine urbaine (Vannes, Auray) qu'agricole en provenance des bassins versants du nord du golfe.

During June 1994, 44 beaches with "green-tides" were identified along the coasts of Brittany. Compared to previous years, seaweed amounts accumulated on beaches receiving nitrogen inputs from granitic catchments can be considered stable, contrary to beaches exposed to nutrient fluxes originating from schistous catchments, where an increase of accumulations is observed. This late process can be explained by an increase of nitrogen loadings during periods of heavy rain (late spring 1994) on impervious basement rocks., En juin 1994, 44 sites de proliférations d'algues vertes ont été répertoriés sur le littoral breton. Par rapport aux années antérieures, il est constaté une stabilité quantitative sur les sites littoraux alimentés par les bassins versants de type granitique, mais par contre une forte poussée de biomasse au devant des bassins versants de type schisteux. Ce dernier élément s'explique par les écoulements accentués d'azote sur les substrats imperméables, lors des fortes pluies de la fin du printemps 1994.

The object of this report is to provide an estimation, on an annual basis, of the macrozoobenthic biomass consumed by the major wading birds staying in the bay of Saint-Brieuc (Brittany, Western Channel). Historical information was first reviewed and then updated throughout the winter 1987-88, by field observations (counts of birds, birds activities ... ). Six species account for most of the predation on macrofauna, and are thus studied with more detail. A specific survey is devoted to oystercatcher (Haematopus ostralegus), because of its feeding on an exploited stock of the edible cockle (Cerastoderma edule)., Cette étude conduit à l'estimation de la biomasse macrozoobenthique consommée annuellement par les principales espèces de Limicoles séjournant dans la baie de Saint-Brieuc (Manche-Ouest). L'analyse préalable des données historiques, complétées par une série d'observations (recensements, activité alimentaire...) lors de la saison 1987-88, situe les Limicoles dans le paysage ornithologique de la baie. L'essentiel de la prédation est imputable à six espèces, qui font l'objet d'une présentation détaillée. Une étude particulière est consacrée à l'Huîtrier pie (Haematopus ostralegus), qui s'alimente sur un gisement de Coques (Cerastoderma edule) exploité.

Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Banamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez l'huître plate Ostrea edulis et les moules Mytilus edulis et M. galloprovincialis. Le secteur en attente d'agrément vis à vis de ces deux maladies est la zone X. En accord avec l'autorité compétente, il a été décidé de suspendre cette surveillance depuis 2007 (difficulté d'accès à la ressource et très faible densité en huîtres plates en zone X). L'étude des cas des hausses de mortalités a été poursuivie avec 69 évènements recensés, 69 lots prélevés et analysés, 22 constats rédigés). Comme en 2008, des hausses de mortalités d'huîtres creuses (Crassostrea gigas) ont été recensées dans l'ensemble des bassins de production principalement en période estivale (60 évènements, 63 lots prélevés et analysés, 18 constats). Le naissain d'huîtres creuses (50/63 lots) a été principalement atteint avec des taux de mortalité calculés particulièrement élevés. Aucun agent à déclaration obligatoire n'a été détecté dans les lots d'huîtres creuses analysés. Des agents viraux (herpèsvirus OsHV -1) et bactériens (bactéries du groupe de Vibrio splendidus, principalement) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité 2009 aussi bien chez les huîtres creuses prélevées chez les producteurs que sur les animaux de l'observatoire conchylicole Ifremer ; Il est à noter que les analyses en biologie moléculaire pour la recherche de l'herpès virus OsHV-1 et des bactéries Vibrio aestuarianus et V. splendidus sur les échantillons d'huîtres creuses prélevés au cours des épisodes de mortalité 2009 ont été réalisés par la cellule analytique du Laboratoire de Génétiques et de Pathologie (LGP) et par des laboratoires d'analyses externes, pour lesquels deux sessions de transfert de méthodes diagnostiques ont été réalisées en 2009. Des hausses de mortalités ont également affecté d'autres espèces de mollusques en élevage (moules de bouchot sur la côte Ouest du Cotentin et en baie de Somme) et en gisement (moules en baie de Seine; palourdes dans le pertuis d'Antioche et dans l'estuaire de la Gironde; coquilles Saint-Jacques dans le pertuis breton et la baie de Quiberon; coques près du Conquet; flions tronqués en baie de Quiberon). L'agent Marteilia refringens a été détecté dans un échantillon de moules prélevé en baie de Seine avec une localisation atypique dans les tissus de l'hôte (présence de M. refringens dans le tissu conjonctif du manteau, des palpes labiaux et des branchies de la moule M. edulis). L'agent Perkinsus olseni a été détecté dans un échantillon de palourdes prélevé en estuaire de la Gironde. La surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques visant à caractériser les espèces de parasites Bonamia chez l'huître plate Ostrea edulis a été poursuivie en 2009. Les nouveaux sites échantillonnés ont été la rivière de la Rance (dept. 35), le pertuis d'Antioche (dept. 17), le golfe de Fos (dept. 13) et le golfe du Morbihan (dept.56), complétant l'échantillonnage réalisé en 2008 à l' issu duquel Bonamia ostreae avait été détecté en baie de Cancale, en rade de Brest et en baie de Quiberon. Enfin, un projet de recherche visant à étudier le cycle du parasite Marteilia refringens a contribué à mettre en évidence l'agent Bonamia exitiosa en co-détection avec Bonamia ostreae dans un échantillon d'huîtres plates Ostrea edulis prélevé dans l'étang de Diana en Corse.

Depuis 2009, l'Observatoire Conchylicole assure le suivi, sur des sites ateliers disposés sur l'ensemble du littoral français, de lots sentinelles d'huîtres creuses Crassostrea gigas représentatifs de la production française. Leur suivi permet d'acquérir des données nationales de croissance et de mortalité, de traduire la dynamique spatio-temporelle des performances d’élevage et ainsi de participer à la compréhension des phénomènes observés. Pour ce faire, des lots sentinelles d’huîtres correspondant à différentes origines (captage ou écloserie, diploïdes ou triploïdes) et à différents stades d’élevage (naissain ou adultes 18 mois) sont déployés simultanément sur 13 sites ateliers représentant les grandes régions conchylicoles du littoral français. En parallèle des suivis de croissance et de mortalité, des données associées à la présence d’agents infectieux dans ces huîtres, ainsi que des variables environnementales (température, salinité, flores sur certains sites) sont acquises. L’ensemble des données acquises par l’Observatoire Conchylicole est diffusé en temps quasiréel, par l’intermédiaire d’un site internet dédié affichant les courbes de mortalité, de croissance et de température sur chaque site (actualisé tous les 15 jours). Des bulletins résumant les évolutions des divers paramètres sont également téléchargeables sur le site. Enfin, les mesures haute fréquence de température, pression et salinité des différents sites sont accessibles en temps réel sur un serveur spécifique. Les résultats des suivis réalisés en 2011 mettent en évidence des différences significatives entre les taux de mortalité cumulée sur les lots de naissains diploïdes (moyenne nationale 73 % ± 11%), de naissain triploïde (moyenne nationale 44.4 % ± 20%) et d’huîtres de 18 mois (moyenne nationale 3.1 % ± 4%). Certains sites apparaissent fortement touchés quel que soit le lot de naissain (tels que l’étang de Thau ou Loix en Ré), en opposition à certains autres pour lesquels les taux de mortalité cumulée sont plus faibles (Morlaix, Géfosse). La cinétique d’apparition des mortalités diffère selon les sites, et semble suivre un gradient sud-nord, fortement corrélé à la date du passage d’une température seuil (16° C). Ainsi, la première vague de mortalité est observée sur l’étang de Thau dès la mi-avril, alors qu’elle n’apparaît qu’à partir du mois de juin sur les sites de Normandie, Blainville ou Géfosse. Les analyses pathologiques réalisées lors des premiers constats de mortalité sur chaque type de lots de naissain, et pour chaque site, montrent une présence quasi-permanente de l'herpes virus OsHV-1 μvar (détecté dans 81 % des échantillons analysés), associée à la présence de Vibrio splendidus (détecté dans 92 % des échantillons analysés) : une corrélation est observée entre le nombre d’individus porteurs du virus OsHV-1 μvar et les taux de mortalité. Parallèlement à cela, la bactérie Vibrio aesturianus n’a été détectée que dans 4 % des échantillons analysés, sa présence restant donc anecdotique. Les données de croissance des lots étudiés mettent en évidence des performances globalement bonnes pour l’année 2011, aussi bien sur le naissain que sur le 18 mois. En effet, après des taux de croissance comparables aux moyennes décennales 2001-2010 jusqu’au mois de juin, on observe des gains de poids nettement plus élevés de septembre à décembre (environ 50% supérieur pour les sites situés plus au Nord tels que Blainville, Géfosse, Cancale et Brest).

Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de deux Directives Européennes, les Directives 91 /67/CEE et 95/70/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae et la Marteiliose à Marteilia refringens chez l'huître plate Ostrea edulis Les deux secteurs en attente d'agrément vis à vis de ces deux maladies sont la zone X et le banc de Granville situé dans la zone IX. En accord avec la DPMA, il a été décidé de suspendre cette surveillance en 2007 (difficulté d'accès à la ressource et très faible densité en huîtres plates en zone X, détection de Bonamia ostreae sur le banc de Granville en 2006). L'étude des cas de mortalités anormales a été poursuivie; le nombre d'évènements en 2007 est supérieur à celui de 2006 (38 évènements, 78 lots analysés, 12 constats rédigés), ils ont principalement eu lieu en période estivale et ont touché la majorité des bassins de production. Comme les années précédentes, OsHV -1 a été détecté par PCR dans de nombreux cas de mortalités de jeunes huîtres creuses (larves, naissain et juvéniles). De nouvelles méthodes diagnostiques reposant sur des techniques biomoléculaires spécifiques ont été développées en 2007 et sont désormais employées pour la recherche de bactéries Vibrionacées connues pour être impliquées dans des mortalités de mollusques (Vibrio splendidus, V. aestuarianus et V. coralliilyticus). Des cas de co·infections OsHV-1 et bactéries Vibrionacées ont été mis en évidence. Dans une moindre mesure, des mortalités ont également affecté des moules de différentes classes d'âge en Méditerranée et en baie de Vilaine ainsi que des ormeaux dans le Cotentin. Pour les années 2006·2007, la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques a ciblé les deux espèces de moules, Mytilus edulis et Mytilus galloprovincialis et leur infection par le parasite Marteilia refringens. En 2007, 6 secteurs de captage et/ou de production mytilicoles ont été suivis (8 en 2006). Il en resort que Marteilia refringens est présent dans les sites mytilicoles de la Baie des Veys (14), de la Rade de Brest (29) et de l'étang de Thau (34) avec une faible prévalence (10% maximum) et affecte principalement des moules cultivées adultes, sauf dans l'étang de Thau où les moules sauvages comme les moules cultivées, naissain comme adultes sont touchées. Les trois protocoles d'épidémiosurveillance ont été complétés par une étude particulière avec l'accord de l'autorité compétente. En 2007, faisant suite à la déclaration par l'Espagne et l'Irlande de cas d'infections à Candidatus Xenohaliotis califomiensis chez des ormeaux d'élevage, il a été décidé d'effectuer une recherche de cet organisme à déclaration obligatoire (Office International des Epizooties) dans les ormeaux produits en France.

Créé en 1992, le réseau Repamo (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à réglementés et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font partie des missions institutionnelles de l’IFREMER. L’étude des hausses de mortalités (protocole II) a été poursuivie avec 52 interventions complètes ayant conduit au recueil de commémoratifs et à la réalisation d’échantillons de mollusques marins pour analyses en pathologie. Des hausses de mortalités d’huîtres creuses (Crassostrea gigas) (47 interventions) ont été recensées dans la majorité des bassins de production principalement au printemps et en été pour le naissain, en été et en automne pour les huîtres creuses adultes. Le naissain d’huîtres creuses a été atteint comme les années précédentes et a fait l’objet de 26 interventions. Il est également à noter que l’année 2012 a été marquée par des demandes d’interventions sur des huîtres creuses adultes de taille marchande (16 interventions). Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les lots d’huîtres creuses prélevés et analysés. Des agents viraux (herpès virus OsHV-1 dans 72 % des lots analysés) et bactériens (Vibrio aestuarianus dans 64 % des lots analysés) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité 2012 aussi bien chez les huîtres creuses prélevées chez les producteurs (42 échantillons) que sur les animaux du réseau d’Observations Conchylicoles (RESCO) (5 échantillons). Il est à noter que les analyses en biologie moléculaire pour la recherche de l’herpès virus OsHV-1 et de la bactérie Vibrio aestuarianus sur les échantillons d’huîtres creuses prélevés au cours des épisodes de mortalité 2012 ont été réalisées par 8 laboratoires agréés et par l’unité technique du Laboratoire de Génétique et de Pathologie des Mollusques Marins (LGP2M). Des hausses de mortalités ont également affecté d’autres espèces de mollusques : moules d’élevage (Mytilus edulis) à Oye-Plage [ZIR 001] ; coques sauvages (Cerastoderma edule) en baie des Veys, Brévands [ZIR 014] et en baie de Somme, gisement Nord [ZIR 007] ; palourdes sauvages (Ruditapes philippinarum) dans le Golfe du Morbihan sur les gisements de Truscat et Noyalo [ZIR020]. Les organismes pathogènes détectés sur ces espèces sont des parasites protozoaires du genre Perkinsus sp. chez des palourdes du gisement naturel de Noyalo dans le Golfe du Morbihan [ZIR 061] en octobre 2012 et la bactérie Vibrio aestuarianus chez des coques d’un gisement en baie de Somme [ZIR 007] en août 2012. Le couple organisme pathogène / espèce hôte de mollusque (protocole III) étudié en 2011-2012 est le couple Mikrocytos sp. chez les flions tronqués Donax trunculus. Un protozoaire du genre Mikrocytos a en effet été détecté à plusieurs reprises lors de mortalité de flions tronqués en 2008 (baie de Quiberon ZIR055), en 2010 (baie de Quiberon ZIR055, baie d’Audierne ZIR042, côte ouest de l’île d’Oléron ZIR075) et en 2011 (baie d’Audierne ZIR042, baie de Douarnenez ZIR040). Il a été décidé de réaliser un suivi d’un an (avril 2011-avril 2012) des flions tronqués sur un gisement naturel où cet agent avait été détecté (Vert Bois sur la côte Ouest de l’île d’Oléron) pour essayer de déterminer une période propice à la détection de cet agent et caractériser l’espèce. Les résultats démontrent qu’il ne s’agit pas de l’espèce Mikrocytos mackini et suggèrent que cet agent est détectable surtout pendant les épisodes de mortalité. La Direction Générale de l’Alimentation (DGAl) a demandé à la plateforme de surveillance épidémiologique en santé animale de considérer le ‘dispositif de surveillance de la pathologie des mollusques Repamo’ dans son programme 2012 d’évaluation des dispositifs de surveillance. Cette évaluation a été menée au cours du premier trimestre 2012 et a fait l’objet d’un rapport d’évaluation. Les points soulevés et les pistes d’amélioration suggérées à l’issue de l’évaluation sont repris pour information en annexe 5 du présent bilan 2012 du réseau Repamo.

Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l’IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae chez l’huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez l’huître plate Ostrea edulis et les moules Mytilus edulis et M. galloprovincialis. Le secteur en attente d’agrément vis-à-vis de ces deux maladies est la zone X. En accord avec l’autorité compétente, il a été décidé de suspendre cette surveillance depuis 2007 (difficulté d’accès à la ressource et très faible densité en huîtres plates en zone X). L’étude des cas des hausses de mortalités a été poursuivie avec 81 lots prélevés et analysés et 42 constats rédigés pour les huîtres creuses. Comme en 2009, des hausses de mortalités d’huîtres creuses (Crassostrea gigas) ont été recensées dans l’ensemble des bassins de production principalement en période estivale. Le naissain d’huîtres creuses a été principalement atteint (89 % des lots analysés), avec des taux de mortalité calculés particulièrement élevés. Aucun agent à déclaration obligatoire n’a été détecté dans les lots d’huîtres creuses analysés. Des agents viraux (herpèsvirus OsHV-1) et bactériens (bactéries du groupe de Vibrio splendidus, principalement) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité 2010 aussi bien chez les huîtres creuses prélevées chez les producteurs que sur les animaux de l’observatoire conchylicole Ifremer. Il est à noter que les analyses en biologie moléculaire pour la recherche de l’herpès virus OsHV-1 et des bactéries Vibrio aestuarianus et V. splendidus sur les échantillons d’huîtres creuses prélevés au cours des épisodes de mortalité 2010 ont été réalisés par la cellule analytique du Laboratoire de Génétiques et de Pathologie (LGP) et par des laboratoires d’analyses externes agréés, pour lesquels deux sessions de transfert de méthodes diagnostiques ont été réalisées en 2009 et une en 2010. Des mortalités ont également affecté d’autres espèces de mollusques en élevage (moules, Mytilus edulis, dans le Nord-Pas-de-Calais, la Picardie, le Finistère et la Charente-Maritime) et en gisements naturels (flions tronqués, Donax trunculus, à Oléron, Quiberon, en baie d’Audierne et de Douarnenez). Un protozoaire du genre Mikrocytos, distinct des espèces connues chez d’autres mollusques bivalves a été détecté dans trois prélèvements de flions tronqués. Ce parasite a également été retrouvé dans un prélèvement de flions tronqués réalisé en 2008 dans le cadre de mortalités anormales, et fera l’objet d’une étude particulière en 2011. Pour les années 2008- 2010, la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques visait à caractériser les espèces des parasites Bonamia chez l’huître plate Ostrea edulis dans les principaux sites français de captage, de production et les gisements naturels. Les parasites Bonamia ostreae et Bonamia exitiosa ont été détectés en 2009 dans l’étang de Diana en Corse. En 2010, les recherches se sont focalisées sur l’étang de Diane, avec trois prélèvements de 150 individus en mai, août et novembre. Des Bonamia sp. ont été détectés dans chaque prélèvement et sont en cours de caractérisation pour en déterminer l’espèce.