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104 results on '"Azam, Didier"'

3. Optimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis

Author

Charles, Sandrine, Ducrot, Virginie, Azam, Didier, Benstead, Rachel, Brettschneider, Denise, De Schamphelaere, Karel, Filipe Goncalves, Sandra, Green, John W., Holbech, Henrik, Hutchinson, Thomas H., Faber, Daniel, Laranjeiro, Filipe, Matthiessen, Peter, Norrgren, Leif, Oehlmann, Jörg, Reategui-Zirena, Evelyn, Seeland-Fremer, Anne, Teigeler, Matthias, Thome, Jean-Pierre, Tobor Kaplon, Marysia, Weltje, Lennart, and Lagadic, Laurent

Published
2016
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4. Inventaire de biodiversité des poissons et crustacés d’eau douce par pêche à l’électricité en petits cours d’eau tropicaux : réglages, efficacité et recommandations

Author

ROUSSEL, Jean-Marc, primary, POTTIER, Gaétan, additional, AZAM, Didier, additional, VIGOUROUX, Régis, additional, MARCHAND, Frédéric, additional, BARGIER, Nicolas, additional, NEVOUX, Marie, additional, RAITIF, Julien, additional, PENIL, Caroline, additional, COSSON, Eddy, additional, and BEAULATON, Laurent, additional

Published
2023
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5. Contrasting trends between species and catchments in diadromous fish counts over the last 30 years in France

Author

Legrand Marion, Briand Cédric, Buisson Laëtitia, Artur Gwenaël, Azam Didier, Baisez Aurore, Barracou David, Bourré Nicolas, Carry Laurent, Caudal Anne-Laure, Charrier Fabien, Corre Jérémie, Croguennec Eric, Der Mikaélian Sophie, Josset Quentin, Le Gurun Laëtitia, Schaeffer Frédéric, and Laffaille Pascal

Subjects
diadromous fish, anadromous migration, monitoring, long-term study, Aquaculture. Fisheries. Angling, SH1-691
Abstract

The decline and collapse of populations have been reported for a large range of taxa. Diadromous fishes migrate between fresh water and the sea and encounter many anthropogenic pressures during their complex life cycle. In spite of being of ecological, cultural and economic interest, diadromous fishes have been in decline for decades in many parts across the world. In this study, we investigated the change in five diadromous fish counts in France over a 30-year period using 43 monitoring stations located in 29 rivers across 18 catchments. Our hypothesis was that the counts of these species evolved in a contrasting way between catchments. We also tested the effect of five drivers potentially contributing to the observed trends: catchment, latitude, presence of commercial fisheries, improvement of ecological continuity and salmon stocking. We found contrasting trends in fish counts between species at the national scale, with some taxa increasing (Anguilla anguilla and Salmo trutta), some showing a slight increase (Salmo salar) and some decreasing (Alosa spp. and Petromyzon marinus). For each taxon, except Anguilla anguilla, we highlighted a significant catchment effect indicating contrasting trends between catchments and stations. However, we found no significant effect of catchment characteristics for any of the studied taxa.

Published
2020
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6. Development and validation of an OECD reproductive toxicity test guideline with the pond snail Lymnaea stagnalis (Mollusca, Gastropoda)

Author

Ducrot, Virginie, Askem, Clare, Azam, Didier, Brettschneider, Denise, Brown, Rebecca, Charles, Sandrine, Coke, Maïra, Collinet, Marc, Delignette-Muller, Marie-Laure, Forfait-Dubuc, Carole, Holbech, Henrik, Hutchinson, Thomas, Jach, Arne, Kinnberg, Karin L., Lacoste, Cédric, Le Page, Gareth, Matthiessen, Peter, Oehlmann, Jörg, Rice, Lynsey, Roberts, Edward, Ruppert, Katharina, Davis, Jessica Elphinstone, Veauvy, Clemence, Weltje, Lennart, Wortham, Ruth, and Lagadic, Laurent

Published
2014
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7. La pêche scientifique à l'électricité dans les milieux aquatiques continentaux

Author

Pottier, Gaëtan, Azam, Didier, Beaulaton, Laurent, Vigneron, Thibault, Rives, Jacques, Marchand, Frédéric, Pénil, Caroline, and Beaulaton, Laurent

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Indices d’abondance, Protocoles, Pêche à l’électricité, Champ électrique, Réglages, Poissons, Gradient de tension, Fréquence
Abstract

La pêche scientifique à l’électricité est une méthode largement utilisée pour les échantillonnages piscicoles en cours d’eau (suivis annuels des populations et des communautés de poissons, approche de types « indices poissons rivière [IPR] » ou indicateurs mono spécifiques saumon, anguille, truite). Cependant l’évolution des matériels, de leurs caractéristiques et des réglages possibles ainsi que la formation des personnels utilisant cette technique nécessitent que soient décrits les principaux facteurs influençant la qualité de ces échantillonnages. Ce nouveau guide vise à fournir les éléments de compréhension des phénomènes électriques et de la réaction des poissons soumis à un champ électrique. Il synthétise également un ensemble de conseils pour la mise en œuvre de la pêche à l’électricité : configuration des engins de pêche, moyens de prospection, bien-être animal et sécurité/réglementation. Cet ouvrage est destiné à toutes les personnes souhaitant connaître le fonctionnement de la pêche scientifique à l’électricité ou mettre en œuvre cette méthode de manière adéquate.

Published
2022

9. Rapport final des travaux liés à la convention 1078068

Author

Druet, Morgan, Rault, Pablo, Acou, Antony, Azam, Didier, Bardonnet, Agnes, Lasne, Emilien, Evanno, Guillaume, Feunteun, Eric, LAUNEY, Sophie, Lizé, Anne, Martignac, François, Nevoux, Marie, Prod’homme, Jordane, Emma, Robin, TEICHERT, Nils, Petit, Eric, Marchand, Frédéric, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Patrimoine naturel (PatriNat), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Office français de la biodiversité (OFB), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Agence de l'Eau Seine-Normandie (AESN), dans le cadre du Programme Sélune, Agence de l'Eau Seine-Normandie, Pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)

Subjects
Sélune, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment
Published
2021

11. Dispersion et (re)colonisation du cours de la Sélune et de ses affluents : terminer un état de référence pour les poissons migrateurs amphihalins et anticiper l’expansion spatiale de l’écrevisse de Californie

Author

Druet, Morgan, Rault, Pablo, Acou, Antony, Azam, Didier, Bardonnet, Agnes, Lasne, Emilien, Evanno, Guillaume, Feunteun, Eric, Launey, Sophie, Lizé, Anne, Martignac, François, Nevoux, Marie, Prod’homme, Jordane, Emma, Robin, Teichert, Nils, Petit, Eric, Marchand, Frédéric, and NICOL, Clotilde

Subjects
Sélune, [SDV.EE] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment
Published
2021

13. From wood protection to health protection: larvicidal potential of formulations containing Sextonia rubra wood residues extract against Aedes aegypti mosquitoes

Author

Clervil, Emmanuelle, Amusant, Nadine, Wozniak, Edmond, Dusfour, I., Duchemin, Jean-Bernard, Azam, Didier, Coke, Maïra, Houël, Emeline, Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Ecologie des forêts de Guyane (UMR ECOFOG), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Entomologie médicale, Laboratoire de Parasitologie [Cayenne, Guyane française], Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Institut Pasteur de Madagascar, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), The International Research Group on Wood Protection (IRG-WP), and European Project: FEDER/2017/N°65,SextoniAedes

Subjects
Bio-refinery, Natural durability, [SDE]Environmental Sciences, Heartwood extractives, Human health, [CHIM]Chemical Sciences, Valorization, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Wood protection, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity, Botanical insecticides
Abstract

International audience; French Guiana is a French overseas territory almost entirely covered by Amazonian rainforest and characterized by its incredible biodiversity. Several woody species harboured by this tropical forest are exploited sustainably for timber industry. They are commercialized notably for carpentry and outdoor applications because of their remarkable natural durability. Among them, stand Dicorynia guianensis Amshoff (Angélique), Qualea rosea Aubl. (Gonfolo rose), Ruizterania albiflora (Warm.) Marc.-Berti (Gonfolo gris) and Sextonia rubra Mez. Van der Werff (Grignon franc), representing around 80% of the global exploitation volume.This industry however generates large volumes of wastes, in particular because more than 50% of the ligneous material are lost between cutting down and sawing. Moreover, the strong demographic growth (around 2.5% per year) in French Guiana will lead to a notable increase of the need for timber, in construction as well as for energy, and the amount of induced wood wastes will increase concurrently. Sawdust residues are used currently only for biomass energy factories, but owing to the presence of molecules displaying interesting biological properties, wood residues and sawdust definitively deserve more attention. In recent years, a rising interest in value-added forest products, and in particular wood extractives, has indeed been observed, with the aim of reducing the lost generated by the forest industry due to undervalorized biomass components (Royer et al., 2013a; Khan et al., 2014; Borges et al., 2019). It is therefore relevant to integrate a new step in forest resources valorisation, putting the bio-refinery concept into practice (Royer et al., 2013b). In fact, regarding their longevity, trees have developed a wide range of chemical defense mechanisms in several organs (leaves, roots, bark, stem) in response to biotic and abiotic stress. The study of these particular traits alongside with morphological and physiological traits and life history parameters is crucial to understand the mechanisms that support numerous ecological processes (Chave et al., 2009). Wood notably provides the tree mechanical strength as well as storage and conduction capacity, alongside with resistance to decay and pathogens or insects attacks. Compounds produced during heartwood formation, a complex process characterized by the programmed death of parenchyma cells in the transition zone and accompanied by high enzymatic activities generating many specialized metabolites from carbohydrate sources stored in the sapwood, are indeed widely acknowledged as one of the most important passive defense mechanisms of the tree. As they are therefore fundamental for species ecological success, but also present the greatest interest for manhood, wood specialized metabolites extensive study should be clearly promoted. They could in particular inspire the search for novel botanical insecticides (Miresmailli and Isman, 2014). As French Guiana faces severe issues linked to insects, notably the strong incidence of vector-borne infectious diseases such as dengue, zika virus or chikungunya, and as vector control remains an important, if not the sole tool to fight diseases spread, we decided to intensify our research on wood extractives and their ability to control the mosquito Aedes aegypti. In previous studies, we identified Sextonia rubra (Mez) Van der Werff (Lauraceae) as a species of particular interest (Falkowski et al. 2016; 2020). This tropical tree is a rather frequent species in the Guyanas, Venezuela and Amazonian Brazil from the Atlantic coast to Manaus and the featured long lasting heartwood drives the wide exploitation of this species in French Guiana forest industry. S. rubra heartwood is indeed known to possess strongly defensive compounds, the two γ-lactones rubrenolide and rubrynolide, exhibiting activities against lignivorous fungi and termites and representing around 50% of heartwood extractives (Rodrigues et al., 2011; Houël et al., 2017). Interestingly, S. rubra wood extract and molecules were also strongly insecticidal when tested against mosquito larvae of the vector Ae. aegypti. Considering this strong bioactivity, some members of our group (WO2016046489A1) filed a patent and a new research project entitled “SextoniAedes” and funded by the European Regional Development (ERDF) is currently ongoing to build upon this discovery.In this project, we aim at gaining inspiration from wood protection on a wide meaning to develop innovative solutions to protect human health. On the one side, we will investigate S. rubra wood extractives, naturally protecting the tree tissue against insects and pathogens attacks, to develop novel botanical insecticides to fight against the mosquito Ae. aegypti, responsible for the spread of numerous pathogens. On the other side, we will propose aqueous-based formulations of S. rubra extract, influenced by the wood protection industry and more particularly the advances observed in green chemistry. We will test these formulations in semi-operational conditions to evaluate their larvicidal activity and remanence under tropical conditions. Moreover, we will concurrently evaluate eco- and cytotoxity of the extract and formulation in accordance to current regulations. Indeed heartwood metabolites, acting as defensive compounds, can be highly toxic molecules. Therefore, its safety for potential users and selectivity against non-targeted organisms has to be carefully tested.In this context, the “SextoniAedes” project aims to study S. rubra defensive heartwood molecules to inspire economically valuable and environmentally friendly solutions for vector control, and set up the valorization of forest extractives from durable wood species in a circular economy approach. This valorization would constitute a link between the wood industry and the biomass energy sector, with the aim of reducing the environmental impact of wastage products from forest industry. At the same time, this project wants to promote opportunities related to green technology or green innovation. Through concepts such as bio-inspiration or bio-refinery, durable trees give us the potential to inspire scientific innovation and stimulate economic sectors, in a sustainable development context, supporting the ambition to strive for a development model that is fair, and respectful of people and natural resources.

Published
2020

14. ORE sur les poissons diadromes dans les fleuves côtiers (ORE DiaPFC). Bresle - Oir - Scorff - Nivelle. Trois décennies d’observations et de recherche sur les poissons migrateurs

Author

Azam, Didier, Basilico, Laurent, Beaulaton, Laurent, Marchand, Frédéric, Prévost, Etienne, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Chercheur indépendant, Office français de la biodiversité (OFB), Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), and Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Subjects
[SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Nivelle, Observatoire, Migrateur, Saumon, Oir, Bresle, Truite de mer, Anguille, ORE DiaPFC, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Amphihalin, Alose, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Scorff, Lamproie
Abstract

International audience; Depuis les années 1970 sur les berges de la Bresle, de l'Oir, du Scorff et de la Nivelle, chercheurs et techniciens poursuivent une action scientifique sans équivalent en Europe au service de la connaissance, de la conservation et de la gestion des poissons migrateurs : le Saumon atlantique, la Truite de mer, l’Anguille européenne, les aloses et les lamproies. Fédérée sous l’enseigne de l’ORE DiaPFC (Observatoire de recherche en environnement sur les poissonsdiadromes dans les fleuves côtiers), cette aventure au long cours s’appuie sur une collecte de données systématique : année après année, les stations de contrôle implantées sur l’aval des cours d’eau permettent d’évaluer les effectifs de migrateurs qu’ils accueillent et d’étudier leurs rythmes de migration, en lien avec différentes variables environnementales ; des opérations de pêche électrique régulières renseignent sur la distribution des poissons dans ces rivières ; la constitution de banques d’échantillons biologiques, prélevés sur certains individus, ouvre des possibilités d’analyse complémentaire sur leur régimes alimentaires, leur histoire de vie, leur origine, etc.Cette collecte ininterrompue de données constitue la matière première de dizaines de projets de recherche partenariaux, apportant des éléments de compréhension inédits sur ces espèces, des subtilités de leur reproduction à leurs réponses aux pressions anthropiques. Elle a occasionné de nombreux développements méthodologiques et livre des éléments utiles à la bonne gestion des populations de migrateurs et des cours d’eau en général, bien au-delà des limites des quatre bassins qui constituent l’Observatoire. Cet ouvrage collectif, nourri d’échanges et d’entretiens avec plus de 50 chercheurs, techniciens et gestionnaires impliqués dans l’ORE DiaPFC, donne à voir les fruits de ces travaux. Destiné à un large public, il comporte cinq grandes parties qui proposent successivement : -une présentation générale de l’ORE DiaPFC, de son histoire, de ses installations et des espèces qui y sont étudiées ;-un inventaire de la « boîte à outils » de l’ORE DiaPFC, méthodes d’observation dont certaines ont été développéesou perfectionnées sur place ;-un ensemble de connaissances nouvelles en écologie aquatique issues des travaux menés à l’ORE DiaPF(du rôle des « mâles précoces » dans la reproduction du saumon à la spéciation des lamproies, du sexe des anguilles aux « bulls » d’aloses) ;-des exemples d’utilisation des travaux de l’ORE DiaPFC par les gestionnaires des milieux aquatiques ;-des éléments de conclusion et de perspectives.

Published
2020

15. Diadromous fish modified timing of upstream migration over the last 30 years in France

Author

Legrand, Marion, primary, Briand, Cédric, additional, Buisson, Laëtitia, additional, Besse, Timothée, additional, Artur, Gwenaël, additional, Azam, Didier, additional, Baisez, Aurore, additional, Barracou, David, additional, Bourré, Nicolas, additional, Carry, Laurent, additional, Caudal, Anne‐Laure, additional, Corre, Jérémie, additional, Croguennec, Eric, additional, Der Mikaélian, Sophie, additional, Josset, Quentin, additional, Le Gurun, Laëtitia, additional, Schaeffer, Frédéric, additional, Toussaint, Romuald, additional, and Laffaille, Pascal, additional

Published
2020
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16. Towards the optimization of botanical insecticides research: Aedes aegypti larvicidal natural products in French Guiana

Author

Falkowski, Michaël, primary, Jahn-Oyac, Arnaud, additional, Odonne, Guillaume, additional, Flora, Claudiane, additional, Estevez, Yannick, additional, Touré, Seindé, additional, Boulogne, Isabelle, additional, Robinson, Jean-Charles, additional, Béreau, Didier, additional, Petit, Philippe, additional, Azam, Didier, additional, Coke, Maïra, additional, Issaly, Jean, additional, Gaborit, Pascal, additional, Stien, Didier, additional, Eparvier, Véronique, additional, Dusfour, Isabelle, additional, and Houël, Emeline, additional

Published
2020
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17. Brucella microti‐ like prevalence in French farms producing frogs

Author

Jaÿ, Maryne, primary, Freddi, Luca, additional, Mick, Virginie, additional, Durand, Benoit, additional, Girault, Guillaume, additional, Perrot, Ludivine, additional, Taunay, Benoit, additional, Vuilmet, Thomas, additional, Azam, Didier, additional, Ponsart, Claire, additional, and Zanella, Gina, additional

Published
2019
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18. Évaluation des populations et des captures de poissons migrateurs. Rapport d’étape CNICS 2019. Rapport d’étape CNICS 2019. OFB, INRAE, Agrocampus Ouest, UPPA

Author

Koubaa, Adly, André, Guirec, Azam, Didier, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), and INRAE

Subjects
[SDE]Environmental Sciences
Published
2019

20. ACOR -Apport de Connaissances aux Opérations de Repeuplement en anguille. Expérimentation in situ et ex situ

Author

Delage, Nicolas, Azam, Didier, Beaulaton, Laurent, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Agence Française pour la Biodiversité (AFB), AFB, and Inra

Subjects
[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

L’anguille européenne (Anguilla anguilla) est un poisson migrateur catadrome. Il colonise les rivières européennes au stade civelle avant sa métamorphose en anguille jaune. Depuis le début des années 1980, un déclin important de l’abondance de l’espèce a été observé dans l’ensemble de son aire de répartition, en particulier une chute du recrutement en civelle. Le repeuplement est envisagé comme solution dans un certain nombre de pays afin de pallier à cette disparition. Cette méthode implique que les civelles soient capturées par des pêcheurs professionnels, stockées chez des mareyeurs pour une durée variable, déplacées et subissent, dans certains cas, un marquage de masse (à l’alizarine en France). Chacune de ces étapes représentent un stress potentiel pour les civelles pouvant altérer leurs performances en termes de croissance et de survie.Le programme ACOR (apport de connaissances aux opérations de repeuplement en anguille) a, entre autre, étudié l’impact du repeuplement sur la survie et la croissance des civelles jusqu’au stade anguillette, soit pendant environ trois mois, dans l’Oir, affluent de la Sélune. Pour ce faire des civelles naturelles, c’est-à-dire ayant subi le moins de manipulation possible, et des civelles repeuplées, ayant subi l’ensemble des étapes relative aux opérations de repeuplement, ont été suivies. En 2017 et 2018, un échantillon de 8 085 individus d’origine naturelle a été capturé au tamis sur la Sélune (méthode douce) et marqué au VIE (visible implant elastomer) ; à cela s’ajoute 320 civelles capturées en 2017 directement dans l’Oir lors des suivis. Un échantillon de 15 870 civelles a été acheté à un mareyeur et marqué à l’alizarine. Parmi ces dernières, 12 235 individus ont été marqués au VIE. Au total, 24 275 civelles ont été relâchées et suivies dans l’Oir, affluent de la Sélune. Trois mois après les lâchers, deux séries de pêches électriques ont été effectuées et ont permis de capturées 865 anguillettes, dont 192 marquées au VIE. Le suivi s’est également effectué à l’aide de dispositifs de captures passifs (les flottangs), disposés sur dix secteurs en amont et en aval de la zone de lâcher. Ceux-ci ont été relevés une à deux fois par semaine pendant six mois en 2017 et en 2018 afin d’observer la dispersion et la colonisation des civelles. Les flottangs ont permis de capturer au total 1 970 civelles et anguillettes, dont 283 marquées VIE. En parallèle, des expérimentations en milieu contrôlé ont été effectuées pendant 43 jours sur 240 civelles issues du repeuplement et 2 lots (58 et 160) de civelles pêchées dans la Sélune pour mesurer leur survie dans ces conditionsL’analyse des différentes expérimentations montre que, malgré la variabilité des lots, la survie des civelles de repeuplement est significativement réduite, d’environ 50 %, par rapport aux civelles directement issues du milieu naturel. Les civelles des différentes origines ne montrent en revanche aucune différence en terme de dispersion. Enfin la croissance a été trop faible pour mettre en évidence de quelconques différences.Ce rapport donne également les résultats de la mise au point d’un marquage interne avec la calcéine sans choc osmotique. Une concentration de 5 000 mg/L pendant 3 heures permet d’avoir un bon marquage sans impacter la survie. Le coût plus élevé de ce marquage le limite néanmoins à des expérimentations particulières.

Published
2019

21. ACOR -Apport De Connaissances Aux Opérations De Repeuplement En Anguille. Synthèse Bibliographique

Author

Beaulaton, Laurent, Azam, Didier, Agence Française pour la Biodiversité (AFB), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), AFB, INRA, and Beaulaton, Laurent

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

Depuis les années 1980, un fort déclin des populations d’anguilles européennes a été observé (Anonyme, 2018a). Ce déclin concerne non seulement le recrutement (civelles et anguillettes), mais aussi les stades anguilles jaunes et argentées. Le règlement UE 1100/2007 (Anonyme, 2007), dit "règlement anguille", oblige chaque État Membre à constituer un plan de gestion de l'anguille européenne en vue de la restauration des stocks de cette espèce.Le repeuplement est une mesure de gestion qui trouve ses origines en France en 1840. Elle est désormais très utilisée par les États Membres européens dans le cadre de leur plan de gestion anguille. Cette mesure nécessite actuellement la capture et le transport d’environ 15 t de civelles par an. Elle mobilise des financements publics européens et nationaux, mais aussi des financements privés.La mise en œuvre de cette mesure varie de manière importante d’un pays à l’autre. Certains pays ont un fonctionnement très centralisé et reposant majoritairement sur des organismes publiques, alors que d’autres ont une fonctionnement très décentralisé, reposant sur des acteurs privés (pêcheurs en général). Le repeuplement peut se faire à tous les stades : civelles, anguille jaunes (civelle après quarantaine, anguilles pré-grossies en aquaculture, anguilles naturelles) ou anguilles argentées.Le choix des sites de déversement se fait en général de manière à maximiser la production d’anguilles et à assurer l’échappement des anguilles argentées. Les critères précis varient néanmoins d’un pays à l’autre, voire à l’intérieur de certains pays. Les densités au déversement varie de 40 g/ha à 3,6 kg/ha.Le suivi des opérations de repeuplement s’effectue en général par marquage-recapture. Le marquage s’effectue avec de l’alizarine, du strontium ou du baryum. La recapture mobilise soit des moyens scientifiques type pêche électrique soit les pêcheries professionnelles.Peu de pays évalue l’efficacité de cette mesure et la plupart de ceux qui le font se contentent d’un calcul théorique prenant en compte la mortalité naturelle supposée et la croissance. La contribution à l’échappement est estimée entre 20g et 150g par anguilles repeuplées.Compte tenu de l’enjeu de gestion et financier, de nombreuses publications scientifiques sont disponibles sur les différents aspects du repeuplement : protocole de marquage, comparaison de différentes stratégies de repeuplement, suivi de l’efficacité, conséquences sanitaires, comportement des anguilles argentées issues du repeuplement.

Published
2019

23. Étude de la qualité des milieux aquatiques : caractérisation des impacts écotoxiques

Author

Burgeot, Thierry, Bustamante, P., Fort, J., Coutellec, Marie-Agnès, Azam, Didier, Olivier, Geffard, Chaumot, Arnaud, Armengaud, J., Maltby, L., Minier, C., Sanchez, W., Porcher, J.M., Bado Nilles, A., Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHAMBRE REGIONALE D'AGRICULTURE POITOU CHARENTES FRA, Partenaires IRSTEA, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), RiverLy (UR Riverly), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), UNIVERSITY OF SHEFFIELD GBR, Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU), and Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS)

Subjects
ORGANISMES MODÈLES, BIOMARQUEURS, RISQUE ÉCOLOGIQUE, DÉFI D'ÉCHELLE EN ÉCOTOXICOLOGIE, BIOESSAIS, SURVEILLANCE EAU DOUCE ET EAU MARINE, [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2018

24. Mise au point d'une méthode de quantification des anguilles en milieu profond

Author

Allou, Sabine, Rault, Pablo, Tréguier, Anne, Marchand, Frédéric, Azam, Didier, Beaulaton, Laurent, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pôle Gest'Aqua, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie-Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, Agence Française pour la Biodiversité (AFB), AFB, and INRA

Subjects
[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Published
2018

27. Diadromous fish modified timing of upstream migration over the last 30 years in France.

Author

Legrand, Marion, Briand, Cédric, Buisson, Laëtitia, Besse, Timothée, Artur, Gwenaël, Azam, Didier, Baisez, Aurore, Barracou, David, Bourré, Nicolas, Carry, Laurent, Caudal, Anne‐Laure, Corre, Jérémie, Croguennec, Eric, Der Mikaélian, Sophie, Josset, Quentin, Le Gurun, Laëtitia, Schaeffer, Frédéric, Toussaint, Romuald, and Laffaille, Pascal

Subjects
SCIENTIFIC literature, GLASS eels, PLANT phenology, FISH migration, NORTH Atlantic oscillation, OCEAN temperature, ADAPTIVE natural resource management, SCIAENIDAE
Abstract

Numerous studies have documented a change in the phenology of migration of diadromous fish in response to climate change. Only few studies have, however, been conducted simultaneously for multiple species and at a large spatial scale.We investigated the change in the timing of upstream migration of diadromous fish species in France. We used an original dataset collected from 40 fish‐counting devices in 28 French rivers over 10–30 years for five diadromous taxa: Alosa spp., Anguilla anguilla (with a distinction between glass eel and yellow eel), Petromyzon marinus, Salmo salar, and Salmo trutta.Except for glass eel, we found that taxa shifted their migration for earlier arrival dates. This result is consistent with numerous studies reporting advancement of the phenology of species life‐events. On average, we highlighted a phenological change of −2.3 days per decade (min = −0.2, max = −3.7). Moreover, the North Atlantic Oscillation Index, sea surface temperature, air temperature, and river discharge were found to explain the timing of upstream migration of diadromous fish taxa, highlighting the importance of factors acting at different spatial scales.Given the important phenological changes observed in our study and more widely in the scientific literature, we recommend that managers incorporate these changes into the management rules; in particular, in the case of dams whose migratory transparency (i.e. the possibility for the fishes to cross the dam) is ensured by adaptive water management and gate operations.This study benefited from large‐scale monitoring of migratory phenology of multiple species and environmental variables. These monitoring data are valuable and could allow better predictive modelling of the response of species to climate change. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2021
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28. Abundance indices and biological traits of juvenile salmon (Salmo salar) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France)

Author

Beaulaton, Laurent, Prévost, Etienne, Delanoë, Richard, Destouches, Jean-Pierre, Gueraud, François, Guilloux, Yoann, Jeannot, Nicolas, Huchet, Emmanuel, Lange, Frédéric, Rives, Jacques, Tremblay, Julien, Herrard, Nadine, Azam, Didier, and Marchand, Frédéric

Subjects
Animal biology, Biologie animale, abundance, biological traits, juvenile, coastal river, Salmo salar, salmon
Abstract

BACKGROUND Atlantic Salmon (Salmo salar) is an anadromous migratory species adapted to cool temperatures. It is protected by the Bern convention and by the European Habitats Directive. It has been listed as vulnerable by the French IUCN Red List. Salmon decline is the result of combined and cumulated, mainly anthropic, causes: climate change, increasingly high number of impoundments, degradation of water quality and habitat and over-exploitation by fisheries. Monitoring of this species has been carried out on three rivers in France (Southern part of the distribution area) to produce data and knowledge (growth, precocious maturity, survival) for stock management. For 24 years, a specific and standardised electric fishing protocol has been used to target young-of-the-year (0+ parr) Atlantic salmon. Sampling was restricted to areas with shallow running water that flows over a coarse bottom substrate, i.e. the preferred habitat of young salmon. This monitoring and inventory of growing areas thus allows assessment of juvenile recruitment and provides baseline data required to calculate total allowable catches (TACs). NEW INFORMATION The dataset currently consists of 47,077 occurrence data points from 105 sites spanning up to 24 years in three different watersheds in France. Beyond our project, this dataset has a clear utility to research since it associates abundance measurements with the measurement of biological traits and the collection of tissue samples. It allows for current and retrospective characterisation of individuals or populations, according to life history traits and genetic features in relation to changes in environmental conditions. The fact that the monitoring takes place in France, the southern part of the distribution area, over 24 years, makes the dataset particularly relevant for climate change studies.

Published
2017

29. Abundance indices and biological traits of juvenile salmon (Salmo salar) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France)

Author

Marchand, Frédéric, Beaulaton, Laurent, Prévost, Etienne, Delanoë, Richard, Destouches, Jean-Pierre, Gueraud, François, Guilloux, Yoann, Jeannot, Nicolas, Huchet, Emmanuel, Lange, Frédéric, Rives, Jacques, Tremblay, Julien, Herrard, Nadine, Azam, Didier, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle Gest'Aqua, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie-Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), Fédération du Morbihan pour la Pêche et la Protection du Milieu Aquatique (FDPPMA 56), Pôle Gest’Aqua, and Agence Française pour la Biodiversité (AFB)

Subjects
Salmoniformes, abundance, Actinopterygii, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Salmo salar, coastal, salmon, biological traits, juvenile, lcsh:Biology (General), Animalia, Salmo, coastal river, Chordata, lcsh:QH301-705.5, Salmonidae, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience; BACKGROUND Atlantic Salmon (Salmo salar) is an anadromous migratory species adapted to cool temperatures. It is protected by the Bern convention and by the European Habitats Directive. It has been listed as vulnerable by the French IUCN Red List. Salmon decline is the result of combined and cumulated, mainly anthropic, causes: climate change, increasingly high number of impoundments, degradation of water quality and habitat and over-exploitation by fisheries. Monitoring of this species has been carried out on three rivers in France (Southern part of the distribution area) to produce data and knowledge (growth, precocious maturity, survival) for stock management. For 24 years, a specific and standardised electric fishing protocol has been used to target young-of-the-year (0+ parr) Atlantic salmon. Sampling was restricted to areas with shallow running water that flows over a coarse bottom substrate, i.e. the preferred habitat of young salmon. This monitoring and inventory of growing areas thus allows assessment of juvenile recruitment and provides baseline data required to calculate total allowable catches (TACs). NEW INFORMATION The dataset currently consists of 47,077 occurrence data points from 105 sites spanning up to 24 years in three different watersheds in France. Beyond our project, this dataset has a clear utility to research since it associates abundance measurements with the measurement of biological traits and the collection of tissue samples. It allows for current and retrospective characterisation of individuals or populations, according to life history traits and genetic features in relation to changes in environmental conditions. The fact that the monitoring takes place in France, the southern part of the distribution area, over 24 years, makes the dataset particularly relevant for climate change studies.

Published
2017

30. Rapport d'étape 2015

Author

Petit, Eric, Acou, Anthony, Azam, Didier, Bardonnet, Agnes, Barloy, Dominique, Benneveault, Yoann, Besnard, Anne-Laure, Bolliet, Valérie, Boulenger, Clarisse, Coste-Heinrich, Pascale, Coudreuse, Julie, Daroux, Aurélie, Evanno, Guillaume, Feunteun, Eric, Forget, Guillaume, Guillard, Jean, Huchet, Emmanuel, Prévost, Etienne, Lepais, Olivier, Huteau, Dominique, Launey, Sophie, Le Quilliec, Patricia, Marchand, Frédéric, Martignac, François, Nevoux, Marie, Oger, Adrien, Ombredane, Dominique, Paillisson, J.M., Poupelin, Maxime, Réveillac, Elodie, Rault, Pablo, Rives, Jacques, Baglinière, Jean-Luc, Écologie et santé des écosystèmes (ESE), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Agence de l'Eau Seine-Normandie (AESN), dans le cadre du Programme Sélune, Agence de l'Eau Seine-Normandie, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Unité Experimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), and Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Sélune, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment
Abstract

Ce rapport reprend les principaux objectifs du projet d'étude de la recolonisation de la Sélune et de ses affluents. Ces rappels sont suivis d'une synthèse des résultats obtenus en 2015, année qui a été écourtée du fait de la signature tardive de la convention de recherche entre l'INRA et l'AESN : il s'agit de ce fait d'un rapport d'étape sur les actions prévues pour 2015, et non d'un rapport final.

Published
2016

31. Brucella microti‐like prevalence in French farms producing frogs.

Author

Jaÿ, Maryne, Freddi, Luca, Mick, Virginie, Durand, Benoit, Girault, Guillaume, Perrot, Ludivine, Taunay, Benoit, Vuilmet, Thomas, Azam, Didier, Ponsart, Claire, and Zanella, Gina

Subjects
FARM produce, BRUCELLA, FROGS, ENVIRONMENTAL sampling, ANIMAL feeds, AMPHIBIANS
Abstract

In the last 10 years, many atypical novel members of Brucella species have been reported, including several Brucella inopinata‐like strains in wild‐caught and "exotic" amphibians from various continents. In 2017, a strain of Brucella was isolated for the first time in animals from a French farm producing frogs—Pelophylax ridibundus—for human consumption and identified as B. microti‐like. Following this first isolation, investigations were performed in this farm as well as in the farm of the research unit that provided the domestic frog strain to estimate the prevalence of B. microti‐like infection and its presence in the surrounding environment. Farming practices were investigated and samples including frogs at different development stages, surface tank swabs, water, feed and soil were analysed by real‐time PCR and bacteriological methods. High B. microti‐like prevalence values (higher than 90%) were obtained in frog samples in the commercial farm, and its presence was highlighted in the environmental samples except feed. In the research unit farm, B. microti‐like species was also isolated and detected in frog and environmental samples. These results show that B. microti‐like organisms are able to colonize amphibians and persist in their environment. Its presence could constitute a possible risk for consumers and workers proving the importance of assessing the zoonotic and pathogenic potentials of these new and atypical Brucella species. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2020
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32. Electrofishing in streams of low water conductivity but high biodiversity value: Challenges, limits and perspectives.

Author

Pottier, Gaetan, Beaumont, William R., Marchand, Frédéric, Le Bail, Pierre‐Yves, Azam, Didier, Rives, Jacques, Vigouroux, Régis, and Roussel, Jean‐Marc

Subjects
ELECTRIC fishing, ENDANGERED species, SPECIES diversity, RIVERS, BIODIVERSITY
Abstract

Electrofishing in streams of low water conductivity has technical limitations leading to the widespread use of poison fishing. In theory, provided a high enough voltage gradient can be created in water, electrofishing should be possible in all but the lowest of conductivities (<10 µS/cm). Using custom‐made equipment delivering up to 1,500 V DC, tests were carried out in French Guiana on 27 streams with water conductivity as low as 16 µS/cm. Approximately 5,800 fish of 93 species were captured, with an electrofishing mortality rate of 1.83%. Poison treatments were used within enclosed sections to assess how efficient multiple pass electrofishing removal is when assessing species richness and population number. The Chao II estimator on 2 electrofishing passes gave the best results for species richness, but rare species can elude electrofishing. Estimates of total fish abundance (i.e. all species pooled) were possible with the use of depletion models. Capture efficiencies by species were highly biased, however, and abundance could be underestimated for the most difficult species to catch. These results show that with the right equipment and settings, electrofishing can be an efficient alternative to poison fishing surveys in small tropical streams of low water conductivity but high biodiversity value. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2020
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33. Supplementary material 1 from: Marchand F, Beaulaton L, Prévost E, Delanoë R, Destouches J, Gueraud F, Guilloux Y, Jeannot N, Huchet E, Lange F, Rives J, Tremblay J, Herrard N, Azam D (2017) Abundance indices and biological traits of juvenile salmon (Salmo salar) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France). Biodiversity Data Journal 5: e15125. https://doi.org/10.3897/BDJ.5.e15125

Author

Marchand, Frédéric, primary, Beaulaton, Laurent, additional, Prévost, Etienne, additional, Delanoë, Richard, additional, Destouches, Jean-Pierre, additional, Gueraud, François, additional, Guilloux, Yoann, additional, Jeannot, Nicolas, additional, Huchet, Emmanuel, additional, Lange, Frédéric, additional, Rives, Jacques, additional, Tremblay, Julien, additional, Herrard, Nadine, additional, and Azam, Didier, additional

Published
2017
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34. Figure 1 from: Marchand F, Beaulaton L, Prévost E, Delanoë R, Destouches J, Gueraud F, Guilloux Y, Jeannot N, Huchet E, Lange F, Rives J, Tremblay J, Herrard N, Azam D (2017) Abundance indices and biological traits of juvenile salmon (Salmo salar) sampled in three rivers on the Atlantic and Channel coasts (France). Biodiversity Data Journal 5: e15125. https://doi.org/10.3897/BDJ.5.e15125

Author

Marchand, Frédéric, primary, Beaulaton, Laurent, additional, Prévost, Etienne, additional, Delanoë, Richard, additional, Destouches, Jean-Pierre, additional, Gueraud, François, additional, Guilloux, Yoann, additional, Jeannot, Nicolas, additional, Huchet, Emmanuel, additional, Lange, Frédéric, additional, Rives, Jacques, additional, Tremblay, Julien, additional, Herrard, Nadine, additional, and Azam, Didier, additional

Published
2017
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35. Un ensemble coordonné de plateformes ouvertes la recherche internationale en écotoxicologie : Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes – France

Author

Mougin, Christian, Azam, Didier, Caquet, Thierry, Cheviron, Nathalie, Dequiedt, Samuel, Le Galliard, Jean-François, Guillaume, Olivier, Houot, Sabine, Lacroix, Gérard, Lafolie, Francois, Maron, Pierre-Alain, Michniewicz, Radika, Pichot, Christian, Ranjard, Lionel, Roy, Jacques, Zeller, Bernhard, Clobert, Jean, Chanzy, Andre, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (DEPT EFPA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Écotron Européen de Montpellier, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions Sol Plante Atmosphère (UMR ISPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Station d'écologie théorique et expérimentale (SETE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques ( UEEA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques ( DEPT EFPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Interactions plantes-microorganismes et santé végétale, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales ( UMR AGAP ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris ( IEES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes ( EMMAH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ), Ecologie des Forêts Méditerranéennes ( URFM 629 ), UPS 3248, Écotron Européen de Montpellier - Baillarguet, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Interactions Sol Plante Atmosphère ( ISPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine ( Bordeaux Sciences Agro ), CNRS, Centre National de la Recherche Scientifique - MNHN - CNRS - USR 2936, Station d’Ecologie Expérimentale, Moulis, France, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Ecologie des Forêts Méditerranéennes [Avignon] (URFM 629), Écotron Européen de Montpellier - UPS 3248, Interactions Sol Plante Atmosphère (ISPA), Station d’Ecologie Expérimentale du CNRS à Moulis (SEEM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Un ensemble coordonné de plateformes ouvertes la recherche internationale en écotoxicologie : Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes – France. Colloque « Construire le réseau ANTIOPES 2.0 - La toxicologie et l’écotoxicologie prédictives : de l’appliqué à l’opérationnel »

Published
2016

36. Aedes aegypti Larvicidal Sesquiterpene Alkaloids from Maytenus oblongata

Author

Touré, Seindé, primary, Nirma, Charlotte, additional, Falkowski, Michael, additional, Dusfour, Isabelle, additional, Boulogne, Isabelle, additional, Jahn-Oyac, Arnaud, additional, Coke, Maïra, additional, Azam, Didier, additional, Girod, Romain, additional, Moriou, Céline, additional, Odonne, Guillaume, additional, Stien, Didier, additional, Houël, Emeline, additional, and Eparvier, Véronique, additional

Published
2017
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37. L’Oir, territoire de sciences. 30 ans de recherche sur une petite rivière normande

Author

Azam, Didier, Beaulaton, Laurent, Marchand, Frédéric, Marhin, Patricia, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pôle Gest'Aqua, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie-Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, and Marchand, Frédéric

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDE.MCG] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Published
2015

38. Du prélèvement à l’archivage des écailles

Author

Marchand, Frédéric, Azam, Didier, Baglinière, Jean-Luc, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Marchand, Frédéric

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDE.MCG] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2013

39. Bilan des données de l'observatoire sur le bassin versant de l'Oir (Basse Normandie) depuis 1983

Author

Marchand, Frédéric, Tremblay, Julien, Azam, Didier, Baglinière, Jean-Luc, Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), pôle OFB-INRAE- Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), INRAE, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and STARCK, Agnès

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Published
2013

40. Permanent Genetic Resources added to Molecular Ecology Resources Database 1 August 2012-30 September 2012

Author

Ahanchede , Adam, Alfay , José E. F., Andersen , L. W., Azam , Didier, Bautista , Ma. Anita M., Besnard , Anne-Laure, Bigatti , Gregorio, Bouetard , Anthony, Coutellec , Marie-Agnès, Ewedje , Eben-Ezer B. K, Fuseya , Reiko, Garcia-Jimenez , Ricardo, Haratian , M., Hardy , Olivier J., Holm , L. E., Hoy , Casey W., Koshimizu , Eriko, Loeschcke , V., Lopez-Marquez , Violeta, Machado , Carlos A, Machordom , Annie, Marchi , C., Michel , Andrew P., Micheneau , Claire, Mittapalli , Omprakash, Nagai , Takahiro, Okamoto , Nobuaki, Pan , Ying, Panitz , F., Safaie , N., Sakamoto , Takashi, Sharifnabi , B., Tian , En-Wei, Yu , Hui, Mol Ecology Resources Primer , Development Consortium, Université d'Abomey Calavi, Laboratorio de Reproducción y Biología Integrativa de Invertebrados Marinos ( LARBIM ), Centro Nacional Patagónico ( CENPAT-CONICET ), Aarhus University [Aarhus], Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques ( UEEA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ohio Agricultural Research and Developmhio Agricultural Research and Development Centeent Center, The Ohio State University, Wooster, OH, USA, Ohio State University [Columbus] ( OSU ), Écologie et santé des écosystèmes ( ESE ), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), LARBIM, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas ( CONICET ), Evolutionary Biology and Ecology Unit CP 160/12, Faculté des Sciences, National Research Institute of Fisheries Engineering, Museo Nacional de Ciencias Naturales, College of Agriculture, Tarbiat Modares University, Université Libre de Bruxelles [Bruxelles] ( ULB ), Department of Molecular Biology and Genetics, Ohio Agricultural Research and Development Center, Tokyo University of Marine Science and Technology, Integrative Ecology and Evolution, Department of Biology, University of Maryland [College Park], Department of Entomology, Ohio Agricultural Research and Development Center, The Ohio State University, OH, Faculté des Sciences ( Université Libre de Bruxelles ), James Cook University ( JCU ), The Ohio State University, Ohio Agricultural Research and Development Center ( Department of Entomology ), Hiroshima Prefectural Technology Research Institute ( Fisheries and Marine Technology Center ), Graduate School of Marine Science and Technology, College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Guangxi University, Department of Plant Protection, College of Agriculture, Isfahan, Iran, Isfahan University of Technology, South China Botanical Garden, Key Laboratory of Plant Resources Conservation and Sustainable Utilization ( Chinese Academy of Sciences ), Chinese Academy of Sciences [Beijing] ( CAS ), Molecular Ecology Resources Editorial Office, University of Abomey Calavi (UAC), Laboratorio de Reproducción y Biología Integrativa de Invertebrados Marinos (LARBIM), Centro Nacional Patagónico (CENPAT), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ohio State University [Columbus] (OSU), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Museo Nacional de Ciencias Naturales (MNCN), Tarbiat Modares University [Tehran], Université libre de Bruxelles (ULB), Tokyo University of Marine Science and Technology (TUMSAT), University of Maryland System-University of Maryland System, James Cook University (JCU), Hiroshima Prefectural Technology Research Institute (Fisheries and Marine Technology Center), Guangxi University [Nanning], University of Maryland System, Key Laboratory of Plant Resources Conservation and Sustainable Utilization (Chinese Academy of Sciences), Chinese Academy of Sciences [Beijing] (CAS), and Université Libre de Bruxelles [Bruxelles] (ULB)

Subjects
0106 biological sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], Molecular Sequence Data, MathematicsofComputing_GENERAL, Panopea abbreviata, computer.software_genre, Polymorphism, Single Nucleotide, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Molecular ecology, Rhizoctonia solani, InformationSystems_GENERAL, 03 medical and health sciences, Species Specificity, Genetic resources, Databases, Genetic, Genetics, Animals, Pentadesma, Molecular Biology, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Inimicus japonicus, DNA Primers, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Base Sequence, Ecology, biology, Database, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], TheoryofComputation_GENERAL, Plutella, Sequence Analysis, DNA, 15. Life on land, biology.organism_classification, Geography, Microsatellite, computer, Microsatellite Repeats, Biotechnology
Abstract

Molecular Ecology Resources Primer Development Consortium [et al.], Isolation and characterisation of microsatellite loci for the 1 southern geoduck Panopea abbreviata (Valenciennes, 1839) through 454 pyrosequencing. This article documents the addition of 83 microsatellite marker loci and 96 pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) sequencing primers to the Molecular Ecology Resources Database. Loci were developed for the following species: Bembidion lampros, Inimicus japonicus, Lymnaea stagnalis, Panopea abbreviata, Pentadesma butyracea, Sycoscapter hirticola and Thanatephorus cucumeris (anamorph: Rhizoctonia solani). These loci were cross-tested on the following species: Pentadesma grandifolia and Pentadesma reyndersii. This article also documents the addition of 96 sequencing primer pairs and 88 allele-specific primers or probes for Plutella xylostella.

Published
2013

41. Permanent Genetic Resources added to Molecular Ecology Resources Database

Author

Molecular Ecology Resources Primer Development Consortium, Ahanchede, Adam, Fernandez Alfaya, Jose Elias, Andersen, L. W., Azam, Didier, Bautista, Ma. Anita M., Besnard, Anne Laure, Bigatti, Gregorio, Bouetard, Anthony, Coutellec, Marie Agnes, Ewedjè, Eben Ezer B. K., Fuseyo, Reiko, García Jimenez, Ricardo, Haratian, M., Hardy, Olivier J., Holm, L. E., Hoy, Casei W., Koshimizu, Eriko, Loeschcke, V., López Marquez, Violeta, Machado, Carlos, Machordom, Annie, Marchi, C., Michel, Andrew P., Micheneau, Claire, Mittapalli, Omprakash, Nagai, Takahiro, Okamoto, Nobuaki, Pan, Ying, Panitz, F., Safaie, N., Sakamoto, Takashi, Sharifnabi, B., Tian, En Wei, and Yu, Hui

Subjects
Ciencias Biológicas, PATAGONIA, Genética y Herencia, PANOPEA ABBREVITA, MOLECULAR RESOURCES, MICROSATELLITES, CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
Abstract

This article documents the addition of 83 microsatellite marker loci and 96 pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) sequencing primers to the Molecular Ecology Resources Database. Loci were developed for the following species: Bembidion lampros, Inimicus japonicus, Lymnaea stagnalis, Panopea abbreviata, Pentadesma butyracea, Sycoscapter hirticola and Thanatephorus cucumeris (anamorph: Rhizoctonia solani). These loci were cross-tested on the following species: Pentadesma grandifolia and Pentadesma reyndersii. This article also documents the addition of 96 sequencing primer pairs and 88 allele-specific primers or probes for Plutella xylostella. Fil: Molecular Ecology Resources Primer Development Consortium. Molecular Ecology Resources Editorial Office; Canadá Fil: Ahanchede, Adam. Universite d’Abomey-Calavi. Faculty of Agronomic Sciences; Benín Fil: Fernandez Alfaya, Jose Elias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Nacional Patagónico; Argentina Fil: Andersen, L. W.. University Aarhus; Dinamarca Fil: Azam, Didier. Institut Nationale de Recherches Agronomiques. Unite Experimentale d’Ecologie et Ecotoxicologie Aquatique; Francia Fil: Bautista, Ma. Anita M.. The Ohio State University. College Of Biological Sciences. Departament Of Entomology; Estados Unidos Fil: Besnard, Anne Laure. Institut National de la Recherche Agronomique; Francia Fil: Bigatti, Gregorio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Nacional Patagónico; Argentina Fil: Bouetard, Anthony. Institut National de la Recherche Agronomique; Francia Fil: Coutellec, Marie Agnes. Institut National de la Recherche Agronomique; Francia Fil: Ewedjè, Eben Ezer B. K.. Universite Libre de Bruxelles; Bélgica. Universite d’Abomey-Calavi; Benín Fil: Fuseyo, Reiko. National Research Institute of Fisheries Engineering. Fisheries Research Agency; Japón Fil: García Jimenez, Ricardo. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Museo Nacional de Cs. Naturales; España Fil: Haratian, M.. Tarbiat Modares University. College of Agriculture; Irán Fil: Hardy, Olivier J.. Universite Libre de Bruxelles; Bélgica Fil: Holm, L. E.. Department of Molecular Biology and Genetics; Dinamarca Fil: Hoy, Casei W.. Ohio State University; Estados Unidos Fil: Koshimizu, Eriko. Tokyo University of Marine Science and Technology; Japón Fil: Loeschcke, V.. Aharhus University; Dinamarca Fil: López Marquez, Violeta. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Museo Nacional de Cs. Naturales; España Fil: Machado, Carlos. University of Maryland; Estados Unidos Fil: Machordom, Annie. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Museo Nacional de Cs. Naturales; España Fil: Marchi, C.. Aarhus University; Dinamarca Fil: Michel, Andrew P.. Ohio State University; Estados Unidos Fil: Micheneau, Claire. Universite Libre de Bruxelles; Bélgica. James Cook University; Australia Fil: Mittapalli, Omprakash. Ohio State University; Estados Unidos Fil: Nagai, Takahiro. Hiroshima Prefectural Technology Research Institute; Japón Fil: Okamoto, Nobuaki. Tokyo University of Marine Science and Technology; Japón Fil: Pan, Ying. Guangxi University; China Fil: Panitz, F.. Department of Molecular Biology and Genetics; Dinamarca Fil: Safaie, N.. Tarbiat Modares University,; Irán Fil: Sakamoto, Takashi. Tokyo University of Marine Science and Technology; Japón Fil: Sharifnabi, B.. Isfahan University of Technology; Irán Fil: Tian, En Wei. Chinese Academy of Sciences. South China Botanical Garden; China Fil: Yu, Hui. Chinese Academy of Sciences. South China Botanical Garden; China

Published
2013

42. Bilan et perspectives des deux écoles techniques « notions et techniques en écologie » organisées par le Département EFPA

Author

Burnel, Laurent, Angibault, Jean-Marc, Azam, Didier, Bernier, Frédéric, Carrère, Pascal, Courdier, Florence, Fontaine, Sébastien, Gaudin, Philippe, Gigleux, Jean-Michel, Marchand, Frédéric, Verger, Michel, Hoch, Dany, Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de recherche Comportement et Ecologie de la Faune Sauvage (CEFS), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), UE 0570 - Unité Expérimentale Forêt Pierroton, UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Ecologie des Forêts Méditerranéennes [Avignon] (URFM 629), Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (DEPT EFPA), Génétique et Biomasse Forestières Orléans (GBFOR), Service formation permanente nationale, Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)

Subjects
école technique, écologie, communauté de pratique, liste de diffusion, efpa, Ecologie, Biodiversité et Ecologie, [SDV]Life Sciences [q-bio], Liste de diffusion, Efpa, Communauté de pratique, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Ecole technique, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract

National audience; La création du Département «Écologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques» a suscité de la part des personnels techniques concernés une volonté d’intégration collective sous le concept fédérateur de l’écologie. Pour cela deux écoles techniques ont été organisées sur des notions et méthodes d’écologie par un Comité de pilotage composé de techniciens et de scientifiques. L’objectif visait à familiariser les techniciens aux concepts de l’écologie et à les aider à se situer dans les thématiques de recherche du Département EFPA. Enfin, il s’agissait d’instaurer une communauté de pratique autour de l’écologie. Ces écoles ont rassemblé 79 personnes, en proposant visites sur le terrain et séances en salle. Deux animations ont particulièrement été appréciées, l’une sous forme d’un jeu en préambule, l’autre sous forme de présentations par des binômes techniciens/chercheurs. Les participants sont plutôt convaincus d’avoir progressé sur les notions en écologie et ils ont la volonté d’aller plus loin avec la création d’un Réseau de Technicien en Ecologie (RTE), la mise en place d’une liste de diffusion et l’organisation régulière de rencontres entre membres du réseau.

Published
2012

43. A coordinated set of ecosystem research platforms open to international research in ecotoxicology, AnaEE-France

Author

Mougin, Christian, primary, Azam, Didier, additional, Caquet, Thierry, additional, Cheviron, Nathalie, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Le Galliard, Jean-François, additional, Guillaume, Olivier, additional, Houot, Sabine, additional, Lacroix, Gérard, additional, Lafolie, François, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Michniewicz, Radika, additional, Pichot, Christian, additional, Ranjard, Lionel, additional, Roy, Jacques, additional, Zeller, Bernd, additional, Clobert, Jean, additional, and Chanzy, André, additional

Published
2015
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44. Sunlight nitrate-induced photodegradation of chlorotoluron: evidence of the process in aquatic mesocosms

Author

Nelieu, Sylvie, Perreau, Francois, Bonnemoy, Frédérique, Bohatier, Jacques, Azam, Didier, Lagadic, Laurent, Einhorn, Jacques, UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ProdInra, Archive Ouverte, and Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2009

45. Nitrate-induced photodegradation of chlorotoluron: ecotoxicological effects in aquatic mesocosms

Author

Nelieu, Sylvie, Bonnemoy, F., Bohatier, J, Azam, Didier, Baudiffier, Damien, Lagadic, Laurent, Einhorn, Jacques, Unité de recherche Science du Sol (USS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, LIMNEE, ECOTOXICOLOGIE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, MESECOSME, BIOTEST, PHOTODEGRADATION
Abstract

Dimensions du poster : 119 x 83 cm Collation : Inconnue; National audience

Published
2009

46. Les mésocosmes : des outils pour les gestionnaires de la qualité des milieux aquatiques?

Author

Lagadic, Laurent, Caquet, Thierry, Azam, Didier, Perceval, Olivier, Bassères, Anne, Thybaud, Eric, Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Office national de l'eau et des milieux aquatiques (ONEMA), Ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, Pôle de Rechercheet Développement, TOTAL SA, and Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques

Subjects
ECOTOXICOLOGIE, [SDV]Life Sciences [q-bio], QUALITE DES EAUX, mésocosme, MILIEUX AQUATIQUES
Abstract

Les mésocosmes : des outils pour les gestionnaires de la qualité des milieux aquatiques?. Les mésocosmes : des outils pour les gestionnaires de la qualité des milieux aquatiques

Published
2009

47. Research infrastructures for long term experiments and monitoring in freshwater ecosystems facing anthropogenic and natural pressures

Author

Domaizon, Isabelle, Azam, Didier, Baglinière, Jean-Luc, Gaudin, Philippe, Caquet, Thierry, Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], OBSERVATOIRE, INFRASTRUCTURE DE RECHERCHES, ENVIRONNEMENT, EXPERIMENTATION A LONG TERME, ECOSYSTEMES AQUATIQUES
Abstract

Diffusion du document : Internationale; International audience; In the general context of local anthropogenic pressures and global change, a major challenge is to maintain the long-term ecological integrity of freshwater ecosystems (lakes, rivers and streams, floodplains, marshes). The understanding of the evolution of ecological functioning of these complex ecosystems under the pressure of external forces is now a central focus. To progress on this knowledge we need adequate data, and especially long term datasets (both monitoring and experimental), but also cross-site experiences and monitoring, and multidisciplinary approaches to (1) define trends and dynamics in the evolution of the systems, (2) identify the regulatory factors and processes involved in this evolution, (3) construct and test conceptual and forecasting models of functioning. We present in this talk two types of research infrastructures managed by INRA ; these tools are dedicated to long term experiments and monitoring : (1) mesocosms facilities for ecotoxicological research used to acquire elements of knowledge and understanding on the effects induced by the exposure to xenobiotics (pesticides); (2) two Environmental Research Observatories (Small Coastal Rivers ERO and Great Alpine Lakes ERO) organized to study the long term evolution and the functioning of these complex ecosystems under the influence of local and global changes. The small coastal rivers ERO concerns 3 hydrologic networks in which are studied the responses of various diadromous fish species (and their habitat) to changes in water temperature and suspended solid/sediment fluxes. The Great Alpine Lakes ERO monitoring of three deep Alpine lakes (Bourget, Léman, Annecy) is organized to follow the evolution of ecosystems indicators and to observe the structuring impacts of various factors among which : warming, fish introductions, fishing management, changes in nutrients inputs. The cognitive and operational objectives, the organization, the sites characteristics and networking are presented for each of these three research infrastructures. Among the perspectives, we highlight two main points: - the development of sites-network at an international level to improve the relevance of findings and observations, - the identification of relevant shared research questions to structure this networking.

Published
2008

48. Réponses des jeunes stades de truite (Salmo trutta) aux flux de M.E.S., au colmatage du substrat et à l'hypoxie

Author

Acolas, Marie-Laure, Azam, Didier, Bardonnet, Agnes, Beaufour, Antoine, Bolliet, Valérie, Gaudin, Philippe, Guerrin, M., Huteau, Dominique, Jegousse, Ludovic, Marchand, Frédéric, Marmonier, Pierre, Ombredane, Dominique, Roussel, Jean-Marc, Sarriquet, P.E., Tremblay, Julien, Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie Comportementale et Biologie des Populations de Poissons (ECOBIOP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)

Subjects
[SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

Rapport d'activité Programme ECOGER PAPIER

Published
2008

49. Nitrate Induced Photodegradation of Chlorotoluron: Chemical Evidence and Ecotoxicological Effects

Author

Nelieu, Sylvie, Perreau, Francois, Bonnemoy, Frédérique, Baudiffier, Damien, Azam, Didier, Bohatier, Jacques, Lagadic, Laurent, Einhorn, Jacques, Unité de recherche Science du Sol (USS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie des Semences (LBS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Agronomique Paris-Grignon (INA P-G), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecobiologie et qualité des hydrosystèmes continentaux (EQHC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Laboratoire de biologie cellulaire et moléculaire, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, INDUCED PHOTODEGRADATION, CHIMIE ANALYTIQUE, AQUATIC MESOCOSM, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, CHLOROTOLURON, ECOTOXICOLOGIE, ECOTOXICOLOGY, NITRATES
Abstract

International audience; Surface waters are frequently contaminated by nitrates and pesticides due to agricultural activities. As nitrates constitute a major source of radicals through photochemical reactions, they might induce pesticide phototransformation and such process could lead to noxious derivatives constituting a potential risk for aquatic biota [1]. Such reactivity was shown to occur on phenylurea herbicides in conditions simulating solar irradiation [2]. The present study aimed at assessing the photoprocess and evaluating its ecotoxicological impact under real solar light. For this purpose, experiments were carried out in Rennes, France, using 24 3-m diameter aquatic mesocosms that included sediments and organisms representative of pond biotopes. These were contaminated with chlorotoluron in the presence or not of nitrate at various concentrations. Monitoring of the herbicide disappearance and by-product formation by LC-MS-MS led us to demonstrate the existence of the photodegradation process. Some of the biological effects regarding organisms representing three trophic levels will be presented.

Published
2007

50. Nitrate induced photodegradation of chlorotoluron characterization and impact in aquatic mésocosmes

Author

Nelieu, Sylvie, Perreau, Francois, Bonnemoy, Frédérique, Baudiffier, Damien, Azam, Didier, Bohatier, Jacques, Lagadic, Laurent, Einhorn, Jacques, Cuart, Mylene, Unité de recherche Science du Sol (USS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de phytopharmacie et médiateurs chimiques, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecobiologie et qualité des hydrosystèmes continentaux (EQHC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2007

Catalog

Books, media, physical & digital resources
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