Search

Laktik asit bakterileri genelde besin değeri yüksek olan et, sebze ve süt ürünlerinde bulunan ve çevrelerin mevcut karbohidratları kullanarak fermente ürünlerin oluşmasını sağlayan önemli mikroorganizmalardır. Bu mikroorganizmalar laktik, asetik ve sitrik asit gibi özel bileşikler üreterek hem fermente ürünleri korur hem de daha sağlıklı ve uzun ömürlü olmasını sağlar. Bu bilgiler ışığında, bu çalışmada Ağrı İli'ni temsil eden 7 farklı bölgeden toplanan 14 yerel beyaz peynir örneğinden 55 bakteri izolatı elde edilmiştir. Bu izolatların tanımlanması için morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal testlerin yanı sıra, safra tuzu toleransı, antibiyotik duyarlılık ve antagonistik aktivite parametreleri de yapılmıştır. Moleküler testler kapsamında 55 izolatın DNA izolasyonu, 16S rDNA gen bölgesinin amplifikasyonu ve 16S rDNA gen bölgesinin dizi analizi yapılmıştır. 16S rDNA gen bölgesinin dizi analizine göre beş farklı cinse (Streptococcus, Enterococcus, Lactococcus, Leuconostoc ve Lactobacillus) ait izolatlar LAB olarak tanımlandı. Ayrıca peynir yapım süreçlerinden geçebilecek on farklı bakteri cinsi de (Staphylococcus, Microbacterium, Phyllobacterium, Micrococcus, Hafnia, Shigella, Serratia, Leifsonia, Stenotrophomonas ve Paenibacillus) belirlenmiştir.

Amaç: Kandidemi, hastane infeksiyonları arasında sıklığı artan; Candida albicans ve nonalbicans Candida (NAC) türleri ile gelişen ciddi bir infeksiyondur. Çalışmamızda, yatan hastalarda kandidemi etkenlerine göre klinik ve laboratuvar verilerin irdelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Hastanemiz laboratuvarında 2017-2019 yıllarında kan kültüründe maya üremesi olan 31 hasta retrospektik olarak incelendi. Hastaların klinik ve laboratuvar verileri incelendi. C.albicans ve NAC türü maya üremesine göre gruplar arasında farklılıklar değerlendirildi. Bulgular: Olguların %58’i kadın ve % 52’sinde malignite saptandı. %48’inde kandidemi etkeni olarak C.albicans saptanırken, %52’sinde NAC üredi. Santral venöz kateter varlığı, total parenteral nutrisyon varlığı ve erken üreme oranı (, Purpose: Candidemia, a serious infection caused by Candida albicans and non-albicans Candida (NAC) species, is an increasing cause of nosocomial infections, We aimed to determine clinical and laboratory features for the patients with candidemia in this study. Materials and Methods: 31 patients with candidemia, between 2017-2019 were retrospectively analyzed. Clinical and laboratory data of the patients were examined. Differences between groups were evaluated according to the growth of C.albicans and NAC. Results: 58% of the cases were women and 52% of the cases had malignancy. C.albicans was detected as the cause of candidemia in 48%, while NAC was produced in 52%. Central venous catheter and total parenteral nutrition and early growth rate (

Bu çalışmada, Ağrı ilinde bazı yöresel yoğurt örneklerindeki çeşitli bakterinin izolasyonu, kültüre alınması ve tanımlanması yapılmıştır. Ağrı ilini temsil edecek şekilde 5 farklı köyden 11 numune alınmış ve bu örneklerden 28 izolat elde edilmiştir. 28 izolatın ilk olarak morfolojik testleri (gram, hareketlilik ve morfoloji), fizyolojik testleri ( tuz, pH ve sıcaklık), biyokimyasal testleri (oksidaz, katalaz, arjinin, eskulin kullanma ve glukozdan gaz üretimi) ve antibiyotiğe direnç testleri (neomisin ve tetrasiklin) yapılmıştır. Moleküler testler kapsamında 28 izolatın DNA izolasyonu ve 16S rDNA gen bölgesi PCR ile çoğaltılmıştır. 24 izolatın sekans verileri alınmış ve sekans verisi alınamayan 4 izolat ise VİTEK yöntemiyle çalışılmış fakat VİTEK yöntemiyle karakterize edilmiştir. LAB'lerin NCBI'daki nükleotit blastlama verilerine göre % 99 ile 89 benzerlik oranları tespit edilmiştir. %99 benzerlik tespit edilen izolatlardan 4 tanesi Sphingonomas sp. ve Lactococcus lactis subsp. lactis, Lactobacillus casei ve Lactobacillus paracasei türelerinin her birinden birer izolat %99 benzerlik göstermiştir., In this study, various Bacteria of some local yoghurt samples in Ağrı province have been isolated and cultured and characterized. In order to represent the Ağrı province, 11 yoghurt samples were taken from 5 different villages and 28 isolates were obtained from these yoghurt samples. In the first step, morphological tests (Gram, mobility and morphology), the physiological tests (salt, pH and temperature tolerances), biochemical tests (oxidase, catalase, utilization of arginine and esculine, gas production from glucose) and antibiotic susceptibility (neomycin and tetracycline) of these 28 isolates have been performed. Within the molecular tests scope, DNA extraction and pcr amplification of 16S rDNA region of these 28 isolates have been performed. Among these 28 isolates, the 16S rDNA sequence of 24 isolates has been obtained and the rest 4 isolates have been characterised with WITEK 2 method, yet, no identification data was obtained. According to nucleotide blast data obtained from NCBI, the similarity of the isolates ranged between 99 and 89 %. 99% similarities were obtained from 4 isolates of Sphingonomas sp and each of the Lactococcus lactis subsp. lactis, Lactobacillus casei ve Lactobacillus paracasei strains.

Bu çalışma 2-5 Ekim 2011 tarihinde Amsterdam’da düzenlenen VI. Uluslararası Moleküler Böcek Bilimi Sempozyumu’nda poster olarak sunulmuş ve özet olarak basılmıştır. Bu çalışmada Stethorus gilvifrons (Muls.) (Col.:Coccinellidae)un bir hassas (SSS) ve bir de daha az duyarlı (RSS) popülasyonunda bazı insektisitlere ve akarisitlere duyarlılıklarının saptanması yanında, bu popülasyonların duyarlılıklarıyla ilişkili karboksilesteraz (CarE), sitokrom P450 monooksigenaz (P450) and glutatyon S-transferaz (GST) aktiviteleri değerlendirilmiştir. Ayrıca, herbir ilacın bir sublethal ayırıcı dozu (~LD20) ile sinerjist maddeler olan S,S,S-tributilfosforotrithioate (DEF), piperonil butoksit (PBO) ve dietil maleyat (DEM) ile karıştırılarak, muhtemel fizyolojik tolerans mekanizmaları test edilmiştir. Bu popülasyonlarda paraoxon ve pirimicarb inhibitörleri kullanılarak, asetilkolinesteraz (AchE)ın duyarsızlığı saptanmıştır. SSS popülasyonunun LC50 değerleri ile karşılaştırıldığında, RSS popülasyonu abamectin, bifenazate, chlorpyrifos, cyhexatin, hexythiazox ve λ-cyhalothrine sırasıyla 2.1, 11.2, 6.7, 1.7, 1.6 ve 2.3-kat daha az duyarlı bulunmuştur. Sonuçta, S. gilvifronsun dirençli bahçe popülasyonu 4 ilaca orta düzeyde bir duyarlılık kaybı göstermiştir. Substrat ortamı olarak α-naftil asetat ve β- naftil asetat kullanıldığında, CarE aktivitesi RSSde SSSye oranla sırasıyla 1.5 ve 4.3 kat fazla olmuştur. Ayrıca, 1-chloro-2,4- dinitrobenzene ve 2,4- dinitro-1-iodobenzene substarları kullanıldığında GSTlerin aktivitesi RSS popülasyonunda önemli olarak sırasıyla 4.3 ve 1.4 kat daha fazla bulunmuştur. İnhibasyon kinetiklerine göre, 1mM primicarb kullanıldığında RSSnin AchEi SSSye göre 2.5 kat daha duyarsız olmuştur. Sonuç olarak, popülasyonların pestisitlere karşı duyarlılık farkları artan CarE, GST ve P-450 enzim aktivitelerini içeren çoklu fizyolojik mekanizmalarından kaynaklanmıştır. The susceptibilities to insecticides and acaricides, as well as carboxylesterase (CarE), cytochrome P450 monooxygenase (P450) and glutathione S-transferases (GSTs) activities were evaluated in a susceptible (SSS) and an unsusceptible strain (RSS) of Stethorus gilvifrons (Muls.) (Col.: Coccinellidae). Synergism studies using S, S, S-tributylphosphorotrithioate (DEF), piperonyl butoxide (PBO) and diethyl maleate (DEM) in combination with at a discrimination dose (similar to LD20) of selected pesticides were also conducted to test for possible physiological mechanisms. In addition, the insensitivity of acetylcholinesterase (AchE) to the inhibitors, paraoxon and pirimicarb, is also determined. Compared with SSS, tolerance ratios of RSS, as indicated by LC50 values, was calculated 2.1, 11.2, 6.7, 1.7, 1.6 and 2.3-fold, respectively, for abamectin, bifenazate, chlorpyrifos, cyhexatin, hexythiazox and lambda-cyhalothrin. Thus, the field collected resistant S. gilvifrons population were tolerant at medium level to four compounds. CarE activity was significantly higher in RSS than in SSS, 1.5-fold for alpha-naphthyl acetate and 4.3-fold for beta- naphthyl acetate. Also significant enhanced GSTs activity were determined in RSS using two substrates, 1-chloro-2,4-dinitrobenzene (4.3-fold) and 2,4-dinitro-1-iodobenzene (1.4-fold), compared with SSS. Inhibition kinetics revealed that AchE from RSS was 2.5-fold more insensitive to inhibition by 1mM primicarb than AchE from SSS. The disparity in susceptibility to these pesticides in the predator populations were due to the responsibility of multiple physiological mechanisms, including elevated CarE, GSTs and P-450 enzymes activities.