46 results on '"Burdychová, Radka"'
Search Results
2. Some factors influencing biogenic amines and polyamines content in Dutch-type semi-hard cheese
- Author
-
Komprda, Tomas, Burdychová, Radka, Dohnal, Vlastimil, Cwiková, Olga, and Sládková, Pavla
- Published
- 2008
- Full Text
- View/download PDF
3. Quality determination of vegetable oils used as an addition to fermented meat products with different starter cultures
- Author
-
Šulcerová, Hana, primary, Gregor, Tomáš, additional, and Burdychová, Radka, additional
- Published
- 2017
- Full Text
- View/download PDF
4. Screening of selected starter cultures for the presence of DNA sequences coding for tyrosine decarboxylase
- Author
-
Burdychová, Radka, primary
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
5. QUALITY DETERMINATION OF VEGETABLE OILS USED AS AN ADDITION TO FERMENTED MEAT PRODUCTS WITH DIFFERENT STARTER CULTURES.
- Author
-
Šulcerová, Hana, Gregor, Tomáš, and Burdychová, Radka
- Abstract
There were developed samples of fermented meat products of „Mettwurst“ with an addition of a starter culture pentosacceus AS-3/100 or probiotic culture Lactobacillus casei Lc-01 and its combinations for this thesis. A part of animal fat was replaced with vegetable oils-sunflower oil and rapeseed oil. For comparison, there was also used a sample without an addition of vegetable oil. There were determined the characteristics of fats in samples: saponification value, acidity value, esteric, iodine and peroxide value. The samples were determined on the day of production and always once a week in a period of three following weeks. Every single sample was hereby determined 3 times. According to the results, it is more advantageous to use the samples with sunflower oil with an addition of specific cultures Lactobacillus casei Lc-01 and Pediococcus pentosaceus AS-3/100. The saponification value when adding sunflower oil detects that the quality of fat remains stable till the 14
th day of storage (p <0.05). The comparison of acid value detects that a sample with sunflower oil and culture Pediococcus pentosaceus AS-3/100 is more advantageous due to fast acidification in the first half of storage period. Good results of iodine and peroxide value had the variation of a sample with sunflower oil and a combination of both cultures. The variation of peroxide value maintained the lowest values. By using the samples with sunflower oil and unispecific cultures L. casei Lc-01 and P. pentosaceus AS-3/100, the culture P. pentosaceus AS-3/100, which remained stable till the 14th day of production, reached the best values of peroxide value. The sunflower oil is in spite of high content of PUFA more stable to which also contributes the increased content of vitamin E that works as an antioxidant here. The disadvantage of rapeseed oil is its higher susceptibility to oxidation. For reasons of faster decomposition of vegetable oils would be essential to cut down on the minimum durability. From the 14th day of storage, the content of free FA increases and the fat is still considerably quickly oxidized. The content of unsaturated FA, of which the vegetable fat is a source, quickly decreases. The sensory quality simultaneously decreases, too. [ABSTRACT FROM AUTHOR]- Published
- 2017
- Full Text
- View/download PDF
6. Identification and typization of bacteria of the genus Enterococcus supposed to be used for the production of functional foods
- Author
-
Burdychová, Radka, primary
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
7. Breaking of cooling chain influencing microbial quality of pasteurized milk
- Author
-
Sládková, Pavla, primary, Šustová, Květoslava, additional, and Burdychová, Radka, additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
8. Microbiological detection of probiotic microorganisms in fermented milk products
- Author
-
Burdychová, Radka, primary
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
9. Detection of Clostridium tyrobutyricum using cultivation and biochemical methods and polymerase chain reaction
- Author
-
Burdychová, Radka, primary and Sládková, Pavla, additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
10. Screening of probiotic cultures intended for processing of fermented foods for their ability to produce biogenic amines
- Author
-
Burdychová, Radka, primary and Dohnal, V., additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
11. Monitoring of probiotic bacterial cells Lactobacillus casei in dry fermented sausages
- Author
-
Burdychová, Radka, primary and Hoferková, P., additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
12. Monitoring of psychrotrophic microorganisms in raw milk
- Author
-
Burdychová, Radka, primary and Hoferková, Petra, additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
13. Optimalization of frozing period of pork and beef for processing of fermented "Mettwurst"
- Author
-
Šulcerová, Hana, primary and Burdychová, Radka, additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
14. Study of enterococci during cheese manufacture and ripening and evaluation of their role in tyramine production
- Author
-
Burdychová, Radka, primary
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
15. The sensory evaluation of fermented sausages Herkules with probiotic strain Lactobacillus casei 01
- Author
-
Burdychová, Radka, primary and Šulcerová, Hana, additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
16. Influence of lactic acid bacteria, probiotic cultures and pH value in fermented yoghurt drink to sensory quality
- Author
-
Šulcerová, Hana, primary and Burdychová, Radka, additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
17. The influence of probiotic strain L. casei 01 on biogenic amines concentrations in fermented sausages Herkules
- Author
-
Burdychová, Radka, primary
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
18. Some factors influencing biogenic amines and polyamines content in Dutch-type semi-hard cheese
- Author
-
Komprda, Tomas, primary, Burdychová, Radka, additional, Dohnal, Vlastimil, additional, Cwiková, Olga, additional, and Sládková, Pavla, additional
- Published
- 2007
- Full Text
- View/download PDF
19. Aplikace baktérie Agrobacterium tumefaciens
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Kováčová, Viera, Babák, Libor, Burdychová, Radka, and Kováčová, Viera
- Abstract
Táto práca sa zaoberá biotechnologickými aplikáciami baktérie Agrobacterium tumefaciens, ktorá je schopná sprostredkovávať genetickú transformáciu nie len rastlín. Medzi hlavné body projektu patrí popis základných vlastností a cytológia A. tumefaciens s následným prehžadom využitia danej baktérie v modifikačných metódach rôznych organizmov. Ciežom state o biotechnologickom využití A. tumafaciens je porovnanie účinnosti tejto metódy modifikácie s inými, zhrnutie pozitív jej používania pre budúci vývoj žudstva a predstavenie základných transformačných metód modifikácie najdôležitejších úžitkových plodín. Poslednou časťou projektu je stručné zhrnutie základných štatistických a legislatívnych údajov z oblasti týkajúcej sa geneticky modifikovaných plodín., This project focus on biotechnologic applications of bacterium named Agrobacterium tumefaciens, which is capable to mediate genetic transformation not only for plants. Main points of project are divided between description of basic natures and cytology of A. tumafaciens following by overview of usage A. tumefaciens in methods of modifications of diffrent cells. Target of paper about biotechnologic use of A. tumefaciens is confrontation of effectivity of this method of modification with else, summary of positiv benefits of its using for future development of human population and introduction of fundamental transformation methods of modification most important crop plants. Final part of project is brief summation of basic statement from statistics and legislature of genetic modified crops.
20. Biodegradace organických látek aplikací termofilní kultury
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Piechová, Jana, Babák, Libor, Burdychová, Radka, and Piechová, Jana
- Abstract
Cílem práce je studium biodegradability modifikovaných polyuretanových materiálů (pěn a folií) v glukosovém mediu a biodegadability syrovátky pomocí směsné aerobní termofilní bakteriální kultury rodů Bacillus a Thermus. Kultivace probíhaly ve fermentoru a v Erlenmayerových baňkách na temperované třepačce. Nejlépe probíhala degradace polyuretanů při odbourávání ve fermentoru. Docházelo zde k nejvýraznějšímu nárůstu biomasy i poklesu CHSK. Hlavní vliv na degradaci měl abiotický rozpad materiálu a až následně se mohla projevit utilizace štěpných produktů mikrobiálními kulturami. Z dosažených výsledků se jako nejvhodnější modifikační činidlo jeví 10 % karboxymethyl celulóza. Srovnáním polyuretanových pěn a folií jsou lépe odbouratelné polyuretany ve formě pěn. Odbouráváním syrovátky ve fermentoru, která byla zbavena bílkovin, bylo dosaženo 50% poklesu CHSK a laktosy v prvních 20 hodinách. Optimální pH pro biodegradaci syrovátky pro kultivace směsnou termofilní bakteriální kulturu se jeví hodnota 6,5., The aim of this work is focused on biodegradability study of modified polyurethane materials (foams and foils) in glukose medium and biodegradation of whey. The biodegradability was tested with using mixed thermophilic aerobic bacterial culture of the Bacillus and Thermus genera. The cultivations were practised in the fermentor and in Erlenmayer flasks in a heated shaker. Maximal reduction of COD and culture growth has been achieved by biodegradation of polyuretane in the fermentor. Main effect of degradation was abiotic destruction of PUR materials and consequent utilization of degradation products by bacterial culture. These tests indicated that the best modification agent for biodegradation was 10% carboxymethyl cellulose. The polyurethane foam was more decomposed then the polyurethane foil. Biodegradation of whey without proteins in the fermentor was detected decrease of CHSK and lactose concentration about 50 % in 20th hour. Optimal conditions for whey biodegradation with the thermophilic bacterial culture were pH 6,5 and temperature 60 °C.
21. Studium podmínek aerobní kultivace vybraných kmenů rodu Lactobacillus
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Šupinová, Petra, Babák, Libor, Burdychová, Radka, and Šupinová, Petra
- Abstract
Cíl práce byl zaměřen na studium podmínek růstu kmenů Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 a Lbc. salivarius CCDM 216 v médiích s různým obsahem zdroje uhlíku (glukóza, laktóza a syrovátka). Další část experimentu se zabývala studiem podmínek růstu bakterií při stresových podmínkách (nízké pH). Kontrola čistoty bakteriální kultury byla ověřena křížovým roztěrem. Čistota DNA izolované z bakterií byla ověřena agarózovou gelovou elektroforézou, koncentrace DNA byla stanovena spektrofotometricky. Přítomnost bakterií rodu Lactobacillus byla ověřena pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) s rodově specifickými primery., The aim of this study was focused on the study of conditions of growth of strains Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 and Lbc. salivarius CCDM 216 in media with different amount of carbon-source (glucose, lactose and whey). Next part of the experiment was dealed with study of conditions of bacteria growth at stress conditions (lower pH). The purity od bacterial culture was verified with help of streaking. Purity DNA isolated from bacteria was tested using agarose gel electrophoresis, DNA concentration was estimated spectrophotometricaly. The presence of bacteria of genus Lactobacillus was proved using polymerase chain reaction (PCR) with genus specific primers.
22. Aplikace baktérie Agrobacterium tumefaciens
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Kováčová, Viera, Babák, Libor, Burdychová, Radka, and Kováčová, Viera
- Abstract
Táto práca sa zaoberá biotechnologickými aplikáciami baktérie Agrobacterium tumefaciens, ktorá je schopná sprostredkovávať genetickú transformáciu nie len rastlín. Medzi hlavné body projektu patrí popis základných vlastností a cytológia A. tumefaciens s následným prehžadom využitia danej baktérie v modifikačných metódach rôznych organizmov. Ciežom state o biotechnologickom využití A. tumafaciens je porovnanie účinnosti tejto metódy modifikácie s inými, zhrnutie pozitív jej používania pre budúci vývoj žudstva a predstavenie základných transformačných metód modifikácie najdôležitejších úžitkových plodín. Poslednou časťou projektu je stručné zhrnutie základných štatistických a legislatívnych údajov z oblasti týkajúcej sa geneticky modifikovaných plodín., This project focus on biotechnologic applications of bacterium named Agrobacterium tumefaciens, which is capable to mediate genetic transformation not only for plants. Main points of project are divided between description of basic natures and cytology of A. tumafaciens following by overview of usage A. tumefaciens in methods of modifications of diffrent cells. Target of paper about biotechnologic use of A. tumefaciens is confrontation of effectivity of this method of modification with else, summary of positiv benefits of its using for future development of human population and introduction of fundamental transformation methods of modification most important crop plants. Final part of project is brief summation of basic statement from statistics and legislature of genetic modified crops.
23. Charakterizace mikroorganismů v jogurtech a probiotických výrobcích
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Kocourková, Hana, Španová, Alena, Burdychová, Radka, and Kocourková, Hana
- Abstract
Zvýšená konzumace fermentovaných mléčných výrobků v posledních letech vede k zavádění nových výrobků na trh. Funkční a probiotické produkty jsou v dnešní době také hojně rozšířeny. Cílem diplomové práce bylo posoudit mikrobiální kvalitu komerčních jogurtů a nefarmakologických probiotických výrobků. Bylo zkoumáno 24 vzorků jogurtů a 8 vzorků probiotických mléčných výrobků. Pozornornost byla zaměřena zvláště na kvantifikaci mikroorganismů v jednotlivých výrobcích a na sledování viability buněk. Většina mléčných produktů obsahovala počty odpovídající minimální požadované hodnotě 1x107cfu/ml. Nicméně byly objeveny produkty, které neobsahovaly živé bakterie nebo obsahovaly jen jejich menší množství. To platí zejména pro běžné jogurty. Probiotické mléčné výrobky v zásadě obsahovaly větší množství bakterií než jogurty, protože je u nich navíc požadováno 1x106cfu/ml minimálního množství specifických bakterií jiných než jogurtových startovacích kultur. Isoláty z fermentovaných mléčných výrobků byly identifikovány jako Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. Isoláty byly poté rozlišeny na jednotlivé kmeny pomocí RAPD použitím tří různých primerů. Byla zjištěna velká různorodost mezi kmeny rodu Lactobacillus spp. používaných různými podniky., The increased consuming of milk fermented products in the last years led to the raising of new trademarks. In fact functional and probiotic foods are at this moment widely diffused too. The aim of the thesis was to evaluate the microbial quality of commercial yoghurts and non-pharmacological probiotic products. It was examined 24 samples of yogurts and 8 samples of probiotic milk products. Investigated was the load of microbial population of each product as well as the viability of the cells. Most of milk products contained viable counts corresponded to minimum required level of 1x107 cfu/ml. However, there were found products which did not contain viable bacteria or contained only its fewer amounts. This holds mainly for some conventional yogurts. Probiotic milk products basically showed larger amount of enumerated bacteria then yogurts as they are required to contain minimum of 1x106cfu/ml of specific microorganisms others than normal starter cultures. The isolates from fermented milk products were identified to belong to species Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. The isolates were then strain-typed by RAPD using three different primers. It was found out rich variations among strains of Lactobacillus spp. used by different companies.
24. Identifikace vybraných bakterií v sýrech pomocí PCR
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Gregušová, Barbora, Španová, Alena, Burdychová, Radka, and Gregušová, Barbora
- Abstract
Táto práca je zameraná na identifikáciu a druhovú špecifikáciu 44 kmeňov klostridií s využitím molekulárne-genetických metód. Bola použitá DNA z baktérií vyizolovaných zo syrov s defektom neskorého durenia. Amplifikovatežnosť prečistenej DNA nariedenej na 10 ng/µl bola overená pomocou PCR s univerzálnymi primermi. Rodová PCR využívajúca primery špecifické pre rod Clostridium potvrdila, že všetky vzorky patria práve do tohto rodu. Na základe druhovo špecifických PCR metód sa jednoznačne určila príslušnosť 7 kmeňov k druhu Clostridium butyricum a 12 kmeňov k druhu Clostridium tyrobutyricum. 15 vzoriek DNA bolo identifikovaných ako zmiešané kultúry, zvyšných 10 kmeňov nebolo zaradených do druhu. Pomocou PCR boli hžadané kmene, ktoré nesú gén kódujúci hydrogenázu hydA. Z identifikovaného súboru boli špecifické PCR produkty pre tento gén detekované u 30 kmeňov. Intenzívny amplikon dávali všetky kmene druhu C. butyricum., This work is focused on identification and species specification of a collection of 44 clostridial strains using molecular-genetic methods. DNA of bacteria isolated from late-blowing defected cheeses was used. The purified DNA was diluted to 10 ng/µl and its ability to be amplified was verified by PCR with universal primers. By genus-specific PCR was proved that DNA of all samples belongs to Clostridium genus. Based on species-specific PCR reactions, it was determined that 7 strains belong to C. butyricum and 12 strains belong to C. tyrobutyricum. 15 strains were positively detected in both species-specific PCRs and therefore identified as mixed cultures. Another 10 strains were not classified into tested species. Strains with the gene encoding the enzyme hydrogenase hydA were searched using PCR. Specific PCR products for this gene were detected in 30 strains of the analysed collection. Especially intense were the amplicons by all strains belonging to C. butyricum species.
25. Biodegradace organických látek aplikací termofilní kultury
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Piechová, Jana, Babák, Libor, Burdychová, Radka, and Piechová, Jana
- Abstract
Cílem práce je studium biodegradability modifikovaných polyuretanových materiálů (pěn a folií) v glukosovém mediu a biodegadability syrovátky pomocí směsné aerobní termofilní bakteriální kultury rodů Bacillus a Thermus. Kultivace probíhaly ve fermentoru a v Erlenmayerových baňkách na temperované třepačce. Nejlépe probíhala degradace polyuretanů při odbourávání ve fermentoru. Docházelo zde k nejvýraznějšímu nárůstu biomasy i poklesu CHSK. Hlavní vliv na degradaci měl abiotický rozpad materiálu a až následně se mohla projevit utilizace štěpných produktů mikrobiálními kulturami. Z dosažených výsledků se jako nejvhodnější modifikační činidlo jeví 10 % karboxymethyl celulóza. Srovnáním polyuretanových pěn a folií jsou lépe odbouratelné polyuretany ve formě pěn. Odbouráváním syrovátky ve fermentoru, která byla zbavena bílkovin, bylo dosaženo 50% poklesu CHSK a laktosy v prvních 20 hodinách. Optimální pH pro biodegradaci syrovátky pro kultivace směsnou termofilní bakteriální kulturu se jeví hodnota 6,5., The aim of this work is focused on biodegradability study of modified polyurethane materials (foams and foils) in glukose medium and biodegradation of whey. The biodegradability was tested with using mixed thermophilic aerobic bacterial culture of the Bacillus and Thermus genera. The cultivations were practised in the fermentor and in Erlenmayer flasks in a heated shaker. Maximal reduction of COD and culture growth has been achieved by biodegradation of polyuretane in the fermentor. Main effect of degradation was abiotic destruction of PUR materials and consequent utilization of degradation products by bacterial culture. These tests indicated that the best modification agent for biodegradation was 10% carboxymethyl cellulose. The polyurethane foam was more decomposed then the polyurethane foil. Biodegradation of whey without proteins in the fermentor was detected decrease of CHSK and lactose concentration about 50 % in 20th hour. Optimal conditions for whey biodegradation with the thermophilic bacterial culture were pH 6,5 and temperature 60 °C.
26. Studium podmínek aerobní kultivace vybraných kmenů rodu Lactobacillus
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Šupinová, Petra, Babák, Libor, Burdychová, Radka, and Šupinová, Petra
- Abstract
Cíl práce byl zaměřen na studium podmínek růstu kmenů Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 a Lbc. salivarius CCDM 216 v médiích s různým obsahem zdroje uhlíku (glukóza, laktóza a syrovátka). Další část experimentu se zabývala studiem podmínek růstu bakterií při stresových podmínkách (nízké pH). Kontrola čistoty bakteriální kultury byla ověřena křížovým roztěrem. Čistota DNA izolované z bakterií byla ověřena agarózovou gelovou elektroforézou, koncentrace DNA byla stanovena spektrofotometricky. Přítomnost bakterií rodu Lactobacillus byla ověřena pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) s rodově specifickými primery., The aim of this study was focused on the study of conditions of growth of strains Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 and Lbc. salivarius CCDM 216 in media with different amount of carbon-source (glucose, lactose and whey). Next part of the experiment was dealed with study of conditions of bacteria growth at stress conditions (lower pH). The purity od bacterial culture was verified with help of streaking. Purity DNA isolated from bacteria was tested using agarose gel electrophoresis, DNA concentration was estimated spectrophotometricaly. The presence of bacteria of genus Lactobacillus was proved using polymerase chain reaction (PCR) with genus specific primers.
27. Charakterizace mikroorganismů v jogurtech a probiotických výrobcích
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Kocourková, Hana, Španová, Alena, Burdychová, Radka, and Kocourková, Hana
- Abstract
Zvýšená konzumace fermentovaných mléčných výrobků v posledních letech vede k zavádění nových výrobků na trh. Funkční a probiotické produkty jsou v dnešní době také hojně rozšířeny. Cílem diplomové práce bylo posoudit mikrobiální kvalitu komerčních jogurtů a nefarmakologických probiotických výrobků. Bylo zkoumáno 24 vzorků jogurtů a 8 vzorků probiotických mléčných výrobků. Pozornornost byla zaměřena zvláště na kvantifikaci mikroorganismů v jednotlivých výrobcích a na sledování viability buněk. Většina mléčných produktů obsahovala počty odpovídající minimální požadované hodnotě 1x107cfu/ml. Nicméně byly objeveny produkty, které neobsahovaly živé bakterie nebo obsahovaly jen jejich menší množství. To platí zejména pro běžné jogurty. Probiotické mléčné výrobky v zásadě obsahovaly větší množství bakterií než jogurty, protože je u nich navíc požadováno 1x106cfu/ml minimálního množství specifických bakterií jiných než jogurtových startovacích kultur. Isoláty z fermentovaných mléčných výrobků byly identifikovány jako Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. Isoláty byly poté rozlišeny na jednotlivé kmeny pomocí RAPD použitím tří různých primerů. Byla zjištěna velká různorodost mezi kmeny rodu Lactobacillus spp. používaných různými podniky., The increased consuming of milk fermented products in the last years led to the raising of new trademarks. In fact functional and probiotic foods are at this moment widely diffused too. The aim of the thesis was to evaluate the microbial quality of commercial yoghurts and non-pharmacological probiotic products. It was examined 24 samples of yogurts and 8 samples of probiotic milk products. Investigated was the load of microbial population of each product as well as the viability of the cells. Most of milk products contained viable counts corresponded to minimum required level of 1x107 cfu/ml. However, there were found products which did not contain viable bacteria or contained only its fewer amounts. This holds mainly for some conventional yogurts. Probiotic milk products basically showed larger amount of enumerated bacteria then yogurts as they are required to contain minimum of 1x106cfu/ml of specific microorganisms others than normal starter cultures. The isolates from fermented milk products were identified to belong to species Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. The isolates were then strain-typed by RAPD using three different primers. It was found out rich variations among strains of Lactobacillus spp. used by different companies.
28. Identifikace vybraných bakterií v sýrech pomocí PCR
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Gregušová, Barbora, Španová, Alena, Burdychová, Radka, and Gregušová, Barbora
- Abstract
Táto práca je zameraná na identifikáciu a druhovú špecifikáciu 44 kmeňov klostridií s využitím molekulárne-genetických metód. Bola použitá DNA z baktérií vyizolovaných zo syrov s defektom neskorého durenia. Amplifikovatežnosť prečistenej DNA nariedenej na 10 ng/µl bola overená pomocou PCR s univerzálnymi primermi. Rodová PCR využívajúca primery špecifické pre rod Clostridium potvrdila, že všetky vzorky patria práve do tohto rodu. Na základe druhovo špecifických PCR metód sa jednoznačne určila príslušnosť 7 kmeňov k druhu Clostridium butyricum a 12 kmeňov k druhu Clostridium tyrobutyricum. 15 vzoriek DNA bolo identifikovaných ako zmiešané kultúry, zvyšných 10 kmeňov nebolo zaradených do druhu. Pomocou PCR boli hžadané kmene, ktoré nesú gén kódujúci hydrogenázu hydA. Z identifikovaného súboru boli špecifické PCR produkty pre tento gén detekované u 30 kmeňov. Intenzívny amplikon dávali všetky kmene druhu C. butyricum., This work is focused on identification and species specification of a collection of 44 clostridial strains using molecular-genetic methods. DNA of bacteria isolated from late-blowing defected cheeses was used. The purified DNA was diluted to 10 ng/µl and its ability to be amplified was verified by PCR with universal primers. By genus-specific PCR was proved that DNA of all samples belongs to Clostridium genus. Based on species-specific PCR reactions, it was determined that 7 strains belong to C. butyricum and 12 strains belong to C. tyrobutyricum. 15 strains were positively detected in both species-specific PCRs and therefore identified as mixed cultures. Another 10 strains were not classified into tested species. Strains with the gene encoding the enzyme hydrogenase hydA were searched using PCR. Specific PCR products for this gene were detected in 30 strains of the analysed collection. Especially intense were the amplicons by all strains belonging to C. butyricum species.
29. Aplikace baktérie Agrobacterium tumefaciens
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Táto práca sa zaoberá biotechnologickými aplikáciami baktérie Agrobacterium tumefaciens, ktorá je schopná sprostredkovávať genetickú transformáciu nie len rastlín. Medzi hlavné body projektu patrí popis základných vlastností a cytológia A. tumefaciens s následným prehžadom využitia danej baktérie v modifikačných metódach rôznych organizmov. Ciežom state o biotechnologickom využití A. tumafaciens je porovnanie účinnosti tejto metódy modifikácie s inými, zhrnutie pozitív jej používania pre budúci vývoj žudstva a predstavenie základných transformačných metód modifikácie najdôležitejších úžitkových plodín. Poslednou časťou projektu je stručné zhrnutie základných štatistických a legislatívnych údajov z oblasti týkajúcej sa geneticky modifikovaných plodín., This project focus on biotechnologic applications of bacterium named Agrobacterium tumefaciens, which is capable to mediate genetic transformation not only for plants. Main points of project are divided between description of basic natures and cytology of A. tumafaciens following by overview of usage A. tumefaciens in methods of modifications of diffrent cells. Target of paper about biotechnologic use of A. tumefaciens is confrontation of effectivity of this method of modification with else, summary of positiv benefits of its using for future development of human population and introduction of fundamental transformation methods of modification most important crop plants. Final part of project is brief summation of basic statement from statistics and legislature of genetic modified crops.
30. Biodegradace organických látek aplikací termofilní kultury
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Cílem práce je studium biodegradability modifikovaných polyuretanových materiálů (pěn a folií) v glukosovém mediu a biodegadability syrovátky pomocí směsné aerobní termofilní bakteriální kultury rodů Bacillus a Thermus. Kultivace probíhaly ve fermentoru a v Erlenmayerových baňkách na temperované třepačce. Nejlépe probíhala degradace polyuretanů při odbourávání ve fermentoru. Docházelo zde k nejvýraznějšímu nárůstu biomasy i poklesu CHSK. Hlavní vliv na degradaci měl abiotický rozpad materiálu a až následně se mohla projevit utilizace štěpných produktů mikrobiálními kulturami. Z dosažených výsledků se jako nejvhodnější modifikační činidlo jeví 10 % karboxymethyl celulóza. Srovnáním polyuretanových pěn a folií jsou lépe odbouratelné polyuretany ve formě pěn. Odbouráváním syrovátky ve fermentoru, která byla zbavena bílkovin, bylo dosaženo 50% poklesu CHSK a laktosy v prvních 20 hodinách. Optimální pH pro biodegradaci syrovátky pro kultivace směsnou termofilní bakteriální kulturu se jeví hodnota 6,5., The aim of this work is focused on biodegradability study of modified polyurethane materials (foams and foils) in glukose medium and biodegradation of whey. The biodegradability was tested with using mixed thermophilic aerobic bacterial culture of the Bacillus and Thermus genera. The cultivations were practised in the fermentor and in Erlenmayer flasks in a heated shaker. Maximal reduction of COD and culture growth has been achieved by biodegradation of polyuretane in the fermentor. Main effect of degradation was abiotic destruction of PUR materials and consequent utilization of degradation products by bacterial culture. These tests indicated that the best modification agent for biodegradation was 10% carboxymethyl cellulose. The polyurethane foam was more decomposed then the polyurethane foil. Biodegradation of whey without proteins in the fermentor was detected decrease of CHSK and lactose concentration about 50 % in 20th hour. Optimal conditions for whey biodegradation with the thermophilic bacterial culture were pH 6,5 and temperature 60 °C.
31. Studium podmínek aerobní kultivace vybraných kmenů rodu Lactobacillus
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Cíl práce byl zaměřen na studium podmínek růstu kmenů Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 a Lbc. salivarius CCDM 216 v médiích s různým obsahem zdroje uhlíku (glukóza, laktóza a syrovátka). Další část experimentu se zabývala studiem podmínek růstu bakterií při stresových podmínkách (nízké pH). Kontrola čistoty bakteriální kultury byla ověřena křížovým roztěrem. Čistota DNA izolované z bakterií byla ověřena agarózovou gelovou elektroforézou, koncentrace DNA byla stanovena spektrofotometricky. Přítomnost bakterií rodu Lactobacillus byla ověřena pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) s rodově specifickými primery., The aim of this study was focused on the study of conditions of growth of strains Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 and Lbc. salivarius CCDM 216 in media with different amount of carbon-source (glucose, lactose and whey). Next part of the experiment was dealed with study of conditions of bacteria growth at stress conditions (lower pH). The purity od bacterial culture was verified with help of streaking. Purity DNA isolated from bacteria was tested using agarose gel electrophoresis, DNA concentration was estimated spectrophotometricaly. The presence of bacteria of genus Lactobacillus was proved using polymerase chain reaction (PCR) with genus specific primers.
32. Charakterizace mikroorganismů v jogurtech a probiotických výrobcích
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Španová, Alena, and Burdychová, Radka
- Abstract
Zvýšená konzumace fermentovaných mléčných výrobků v posledních letech vede k zavádění nových výrobků na trh. Funkční a probiotické produkty jsou v dnešní době také hojně rozšířeny. Cílem diplomové práce bylo posoudit mikrobiální kvalitu komerčních jogurtů a nefarmakologických probiotických výrobků. Bylo zkoumáno 24 vzorků jogurtů a 8 vzorků probiotických mléčných výrobků. Pozornornost byla zaměřena zvláště na kvantifikaci mikroorganismů v jednotlivých výrobcích a na sledování viability buněk. Většina mléčných produktů obsahovala počty odpovídající minimální požadované hodnotě 1x107cfu/ml. Nicméně byly objeveny produkty, které neobsahovaly živé bakterie nebo obsahovaly jen jejich menší množství. To platí zejména pro běžné jogurty. Probiotické mléčné výrobky v zásadě obsahovaly větší množství bakterií než jogurty, protože je u nich navíc požadováno 1x106cfu/ml minimálního množství specifických bakterií jiných než jogurtových startovacích kultur. Isoláty z fermentovaných mléčných výrobků byly identifikovány jako Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. Isoláty byly poté rozlišeny na jednotlivé kmeny pomocí RAPD použitím tří různých primerů. Byla zjištěna velká různorodost mezi kmeny rodu Lactobacillus spp. používaných různými podniky., The increased consuming of milk fermented products in the last years led to the raising of new trademarks. In fact functional and probiotic foods are at this moment widely diffused too. The aim of the thesis was to evaluate the microbial quality of commercial yoghurts and non-pharmacological probiotic products. It was examined 24 samples of yogurts and 8 samples of probiotic milk products. Investigated was the load of microbial population of each product as well as the viability of the cells. Most of milk products contained viable counts corresponded to minimum required level of 1x107 cfu/ml. However, there were found products which did not contain viable bacteria or contained only its fewer amounts. This holds mainly for some conventional yogurts. Probiotic milk products basically showed larger amount of enumerated bacteria then yogurts as they are required to contain minimum of 1x106cfu/ml of specific microorganisms others than normal starter cultures. The isolates from fermented milk products were identified to belong to species Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. The isolates were then strain-typed by RAPD using three different primers. It was found out rich variations among strains of Lactobacillus spp. used by different companies.
33. Aplikace baktérie Agrobacterium tumefaciens
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Táto práca sa zaoberá biotechnologickými aplikáciami baktérie Agrobacterium tumefaciens, ktorá je schopná sprostredkovávať genetickú transformáciu nie len rastlín. Medzi hlavné body projektu patrí popis základných vlastností a cytológia A. tumefaciens s následným prehžadom využitia danej baktérie v modifikačných metódach rôznych organizmov. Ciežom state o biotechnologickom využití A. tumafaciens je porovnanie účinnosti tejto metódy modifikácie s inými, zhrnutie pozitív jej používania pre budúci vývoj žudstva a predstavenie základných transformačných metód modifikácie najdôležitejších úžitkových plodín. Poslednou časťou projektu je stručné zhrnutie základných štatistických a legislatívnych údajov z oblasti týkajúcej sa geneticky modifikovaných plodín., This project focus on biotechnologic applications of bacterium named Agrobacterium tumefaciens, which is capable to mediate genetic transformation not only for plants. Main points of project are divided between description of basic natures and cytology of A. tumafaciens following by overview of usage A. tumefaciens in methods of modifications of diffrent cells. Target of paper about biotechnologic use of A. tumefaciens is confrontation of effectivity of this method of modification with else, summary of positiv benefits of its using for future development of human population and introduction of fundamental transformation methods of modification most important crop plants. Final part of project is brief summation of basic statement from statistics and legislature of genetic modified crops.
34. Aplikace baktérie Agrobacterium tumefaciens
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Táto práca sa zaoberá biotechnologickými aplikáciami baktérie Agrobacterium tumefaciens, ktorá je schopná sprostredkovávať genetickú transformáciu nie len rastlín. Medzi hlavné body projektu patrí popis základných vlastností a cytológia A. tumefaciens s následným prehžadom využitia danej baktérie v modifikačných metódach rôznych organizmov. Ciežom state o biotechnologickom využití A. tumafaciens je porovnanie účinnosti tejto metódy modifikácie s inými, zhrnutie pozitív jej používania pre budúci vývoj žudstva a predstavenie základných transformačných metód modifikácie najdôležitejších úžitkových plodín. Poslednou časťou projektu je stručné zhrnutie základných štatistických a legislatívnych údajov z oblasti týkajúcej sa geneticky modifikovaných plodín., This project focus on biotechnologic applications of bacterium named Agrobacterium tumefaciens, which is capable to mediate genetic transformation not only for plants. Main points of project are divided between description of basic natures and cytology of A. tumafaciens following by overview of usage A. tumefaciens in methods of modifications of diffrent cells. Target of paper about biotechnologic use of A. tumefaciens is confrontation of effectivity of this method of modification with else, summary of positiv benefits of its using for future development of human population and introduction of fundamental transformation methods of modification most important crop plants. Final part of project is brief summation of basic statement from statistics and legislature of genetic modified crops.
35. Biodegradace organických látek aplikací termofilní kultury
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Cílem práce je studium biodegradability modifikovaných polyuretanových materiálů (pěn a folií) v glukosovém mediu a biodegadability syrovátky pomocí směsné aerobní termofilní bakteriální kultury rodů Bacillus a Thermus. Kultivace probíhaly ve fermentoru a v Erlenmayerových baňkách na temperované třepačce. Nejlépe probíhala degradace polyuretanů při odbourávání ve fermentoru. Docházelo zde k nejvýraznějšímu nárůstu biomasy i poklesu CHSK. Hlavní vliv na degradaci měl abiotický rozpad materiálu a až následně se mohla projevit utilizace štěpných produktů mikrobiálními kulturami. Z dosažených výsledků se jako nejvhodnější modifikační činidlo jeví 10 % karboxymethyl celulóza. Srovnáním polyuretanových pěn a folií jsou lépe odbouratelné polyuretany ve formě pěn. Odbouráváním syrovátky ve fermentoru, která byla zbavena bílkovin, bylo dosaženo 50% poklesu CHSK a laktosy v prvních 20 hodinách. Optimální pH pro biodegradaci syrovátky pro kultivace směsnou termofilní bakteriální kulturu se jeví hodnota 6,5., The aim of this work is focused on biodegradability study of modified polyurethane materials (foams and foils) in glukose medium and biodegradation of whey. The biodegradability was tested with using mixed thermophilic aerobic bacterial culture of the Bacillus and Thermus genera. The cultivations were practised in the fermentor and in Erlenmayer flasks in a heated shaker. Maximal reduction of COD and culture growth has been achieved by biodegradation of polyuretane in the fermentor. Main effect of degradation was abiotic destruction of PUR materials and consequent utilization of degradation products by bacterial culture. These tests indicated that the best modification agent for biodegradation was 10% carboxymethyl cellulose. The polyurethane foam was more decomposed then the polyurethane foil. Biodegradation of whey without proteins in the fermentor was detected decrease of CHSK and lactose concentration about 50 % in 20th hour. Optimal conditions for whey biodegradation with the thermophilic bacterial culture were pH 6,5 and temperature 60 °C.
36. Studium podmínek aerobní kultivace vybraných kmenů rodu Lactobacillus
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Cíl práce byl zaměřen na studium podmínek růstu kmenů Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 a Lbc. salivarius CCDM 216 v médiích s různým obsahem zdroje uhlíku (glukóza, laktóza a syrovátka). Další část experimentu se zabývala studiem podmínek růstu bakterií při stresových podmínkách (nízké pH). Kontrola čistoty bakteriální kultury byla ověřena křížovým roztěrem. Čistota DNA izolované z bakterií byla ověřena agarózovou gelovou elektroforézou, koncentrace DNA byla stanovena spektrofotometricky. Přítomnost bakterií rodu Lactobacillus byla ověřena pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) s rodově specifickými primery., The aim of this study was focused on the study of conditions of growth of strains Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 and Lbc. salivarius CCDM 216 in media with different amount of carbon-source (glucose, lactose and whey). Next part of the experiment was dealed with study of conditions of bacteria growth at stress conditions (lower pH). The purity od bacterial culture was verified with help of streaking. Purity DNA isolated from bacteria was tested using agarose gel electrophoresis, DNA concentration was estimated spectrophotometricaly. The presence of bacteria of genus Lactobacillus was proved using polymerase chain reaction (PCR) with genus specific primers.
37. Charakterizace mikroorganismů v jogurtech a probiotických výrobcích
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Španová, Alena, and Burdychová, Radka
- Abstract
Zvýšená konzumace fermentovaných mléčných výrobků v posledních letech vede k zavádění nových výrobků na trh. Funkční a probiotické produkty jsou v dnešní době také hojně rozšířeny. Cílem diplomové práce bylo posoudit mikrobiální kvalitu komerčních jogurtů a nefarmakologických probiotických výrobků. Bylo zkoumáno 24 vzorků jogurtů a 8 vzorků probiotických mléčných výrobků. Pozornornost byla zaměřena zvláště na kvantifikaci mikroorganismů v jednotlivých výrobcích a na sledování viability buněk. Většina mléčných produktů obsahovala počty odpovídající minimální požadované hodnotě 1x107cfu/ml. Nicméně byly objeveny produkty, které neobsahovaly živé bakterie nebo obsahovaly jen jejich menší množství. To platí zejména pro běžné jogurty. Probiotické mléčné výrobky v zásadě obsahovaly větší množství bakterií než jogurty, protože je u nich navíc požadováno 1x106cfu/ml minimálního množství specifických bakterií jiných než jogurtových startovacích kultur. Isoláty z fermentovaných mléčných výrobků byly identifikovány jako Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. Isoláty byly poté rozlišeny na jednotlivé kmeny pomocí RAPD použitím tří různých primerů. Byla zjištěna velká různorodost mezi kmeny rodu Lactobacillus spp. používaných různými podniky., The increased consuming of milk fermented products in the last years led to the raising of new trademarks. In fact functional and probiotic foods are at this moment widely diffused too. The aim of the thesis was to evaluate the microbial quality of commercial yoghurts and non-pharmacological probiotic products. It was examined 24 samples of yogurts and 8 samples of probiotic milk products. Investigated was the load of microbial population of each product as well as the viability of the cells. Most of milk products contained viable counts corresponded to minimum required level of 1x107 cfu/ml. However, there were found products which did not contain viable bacteria or contained only its fewer amounts. This holds mainly for some conventional yogurts. Probiotic milk products basically showed larger amount of enumerated bacteria then yogurts as they are required to contain minimum of 1x106cfu/ml of specific microorganisms others than normal starter cultures. The isolates from fermented milk products were identified to belong to species Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. The isolates were then strain-typed by RAPD using three different primers. It was found out rich variations among strains of Lactobacillus spp. used by different companies.
38. Identifikace vybraných bakterií v sýrech pomocí PCR
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Španová, Alena, and Burdychová, Radka
- Abstract
Táto práca je zameraná na identifikáciu a druhovú špecifikáciu 44 kmeňov klostridií s využitím molekulárne-genetických metód. Bola použitá DNA z baktérií vyizolovaných zo syrov s defektom neskorého durenia. Amplifikovatežnosť prečistenej DNA nariedenej na 10 ng/µl bola overená pomocou PCR s univerzálnymi primermi. Rodová PCR využívajúca primery špecifické pre rod Clostridium potvrdila, že všetky vzorky patria práve do tohto rodu. Na základe druhovo špecifických PCR metód sa jednoznačne určila príslušnosť 7 kmeňov k druhu Clostridium butyricum a 12 kmeňov k druhu Clostridium tyrobutyricum. 15 vzoriek DNA bolo identifikovaných ako zmiešané kultúry, zvyšných 10 kmeňov nebolo zaradených do druhu. Pomocou PCR boli hžadané kmene, ktoré nesú gén kódujúci hydrogenázu hydA. Z identifikovaného súboru boli špecifické PCR produkty pre tento gén detekované u 30 kmeňov. Intenzívny amplikon dávali všetky kmene druhu C. butyricum., This work is focused on identification and species specification of a collection of 44 clostridial strains using molecular-genetic methods. DNA of bacteria isolated from late-blowing defected cheeses was used. The purified DNA was diluted to 10 ng/µl and its ability to be amplified was verified by PCR with universal primers. By genus-specific PCR was proved that DNA of all samples belongs to Clostridium genus. Based on species-specific PCR reactions, it was determined that 7 strains belong to C. butyricum and 12 strains belong to C. tyrobutyricum. 15 strains were positively detected in both species-specific PCRs and therefore identified as mixed cultures. Another 10 strains were not classified into tested species. Strains with the gene encoding the enzyme hydrogenase hydA were searched using PCR. Specific PCR products for this gene were detected in 30 strains of the analysed collection. Especially intense were the amplicons by all strains belonging to C. butyricum species.
39. Aplikace baktérie Agrobacterium tumefaciens
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Táto práca sa zaoberá biotechnologickými aplikáciami baktérie Agrobacterium tumefaciens, ktorá je schopná sprostredkovávať genetickú transformáciu nie len rastlín. Medzi hlavné body projektu patrí popis základných vlastností a cytológia A. tumefaciens s následným prehžadom využitia danej baktérie v modifikačných metódach rôznych organizmov. Ciežom state o biotechnologickom využití A. tumafaciens je porovnanie účinnosti tejto metódy modifikácie s inými, zhrnutie pozitív jej používania pre budúci vývoj žudstva a predstavenie základných transformačných metód modifikácie najdôležitejších úžitkových plodín. Poslednou časťou projektu je stručné zhrnutie základných štatistických a legislatívnych údajov z oblasti týkajúcej sa geneticky modifikovaných plodín., This project focus on biotechnologic applications of bacterium named Agrobacterium tumefaciens, which is capable to mediate genetic transformation not only for plants. Main points of project are divided between description of basic natures and cytology of A. tumafaciens following by overview of usage A. tumefaciens in methods of modifications of diffrent cells. Target of paper about biotechnologic use of A. tumefaciens is confrontation of effectivity of this method of modification with else, summary of positiv benefits of its using for future development of human population and introduction of fundamental transformation methods of modification most important crop plants. Final part of project is brief summation of basic statement from statistics and legislature of genetic modified crops.
40. Studium podmínek aerobní kultivace vybraných kmenů rodu Lactobacillus
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Cíl práce byl zaměřen na studium podmínek růstu kmenů Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 a Lbc. salivarius CCDM 216 v médiích s různým obsahem zdroje uhlíku (glukóza, laktóza a syrovátka). Další část experimentu se zabývala studiem podmínek růstu bakterií při stresových podmínkách (nízké pH). Kontrola čistoty bakteriální kultury byla ověřena křížovým roztěrem. Čistota DNA izolované z bakterií byla ověřena agarózovou gelovou elektroforézou, koncentrace DNA byla stanovena spektrofotometricky. Přítomnost bakterií rodu Lactobacillus byla ověřena pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) s rodově specifickými primery., The aim of this study was focused on the study of conditions of growth of strains Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 211, Lbc. paracasei CCDM 212, Lbc. paracasei subsp. paracasei CCDM 213 and Lbc. salivarius CCDM 216 in media with different amount of carbon-source (glucose, lactose and whey). Next part of the experiment was dealed with study of conditions of bacteria growth at stress conditions (lower pH). The purity od bacterial culture was verified with help of streaking. Purity DNA isolated from bacteria was tested using agarose gel electrophoresis, DNA concentration was estimated spectrophotometricaly. The presence of bacteria of genus Lactobacillus was proved using polymerase chain reaction (PCR) with genus specific primers.
41. Identifikace vybraných bakterií v sýrech pomocí PCR
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Španová, Alena, and Burdychová, Radka
- Abstract
Táto práca je zameraná na identifikáciu a druhovú špecifikáciu 44 kmeňov klostridií s využitím molekulárne-genetických metód. Bola použitá DNA z baktérií vyizolovaných zo syrov s defektom neskorého durenia. Amplifikovatežnosť prečistenej DNA nariedenej na 10 ng/µl bola overená pomocou PCR s univerzálnymi primermi. Rodová PCR využívajúca primery špecifické pre rod Clostridium potvrdila, že všetky vzorky patria práve do tohto rodu. Na základe druhovo špecifických PCR metód sa jednoznačne určila príslušnosť 7 kmeňov k druhu Clostridium butyricum a 12 kmeňov k druhu Clostridium tyrobutyricum. 15 vzoriek DNA bolo identifikovaných ako zmiešané kultúry, zvyšných 10 kmeňov nebolo zaradených do druhu. Pomocou PCR boli hžadané kmene, ktoré nesú gén kódujúci hydrogenázu hydA. Z identifikovaného súboru boli špecifické PCR produkty pre tento gén detekované u 30 kmeňov. Intenzívny amplikon dávali všetky kmene druhu C. butyricum., This work is focused on identification and species specification of a collection of 44 clostridial strains using molecular-genetic methods. DNA of bacteria isolated from late-blowing defected cheeses was used. The purified DNA was diluted to 10 ng/µl and its ability to be amplified was verified by PCR with universal primers. By genus-specific PCR was proved that DNA of all samples belongs to Clostridium genus. Based on species-specific PCR reactions, it was determined that 7 strains belong to C. butyricum and 12 strains belong to C. tyrobutyricum. 15 strains were positively detected in both species-specific PCRs and therefore identified as mixed cultures. Another 10 strains were not classified into tested species. Strains with the gene encoding the enzyme hydrogenase hydA were searched using PCR. Specific PCR products for this gene were detected in 30 strains of the analysed collection. Especially intense were the amplicons by all strains belonging to C. butyricum species.
42. Biodegradace organických látek aplikací termofilní kultury
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Babák, Libor, and Burdychová, Radka
- Abstract
Cílem práce je studium biodegradability modifikovaných polyuretanových materiálů (pěn a folií) v glukosovém mediu a biodegadability syrovátky pomocí směsné aerobní termofilní bakteriální kultury rodů Bacillus a Thermus. Kultivace probíhaly ve fermentoru a v Erlenmayerových baňkách na temperované třepačce. Nejlépe probíhala degradace polyuretanů při odbourávání ve fermentoru. Docházelo zde k nejvýraznějšímu nárůstu biomasy i poklesu CHSK. Hlavní vliv na degradaci měl abiotický rozpad materiálu a až následně se mohla projevit utilizace štěpných produktů mikrobiálními kulturami. Z dosažených výsledků se jako nejvhodnější modifikační činidlo jeví 10 % karboxymethyl celulóza. Srovnáním polyuretanových pěn a folií jsou lépe odbouratelné polyuretany ve formě pěn. Odbouráváním syrovátky ve fermentoru, která byla zbavena bílkovin, bylo dosaženo 50% poklesu CHSK a laktosy v prvních 20 hodinách. Optimální pH pro biodegradaci syrovátky pro kultivace směsnou termofilní bakteriální kulturu se jeví hodnota 6,5., The aim of this work is focused on biodegradability study of modified polyurethane materials (foams and foils) in glukose medium and biodegradation of whey. The biodegradability was tested with using mixed thermophilic aerobic bacterial culture of the Bacillus and Thermus genera. The cultivations were practised in the fermentor and in Erlenmayer flasks in a heated shaker. Maximal reduction of COD and culture growth has been achieved by biodegradation of polyuretane in the fermentor. Main effect of degradation was abiotic destruction of PUR materials and consequent utilization of degradation products by bacterial culture. These tests indicated that the best modification agent for biodegradation was 10% carboxymethyl cellulose. The polyurethane foam was more decomposed then the polyurethane foil. Biodegradation of whey without proteins in the fermentor was detected decrease of CHSK and lactose concentration about 50 % in 20th hour. Optimal conditions for whey biodegradation with the thermophilic bacterial culture were pH 6,5 and temperature 60 °C.
43. Charakterizace mikroorganismů v jogurtech a probiotických výrobcích
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Španová, Alena, and Burdychová, Radka
- Abstract
Zvýšená konzumace fermentovaných mléčných výrobků v posledních letech vede k zavádění nových výrobků na trh. Funkční a probiotické produkty jsou v dnešní době také hojně rozšířeny. Cílem diplomové práce bylo posoudit mikrobiální kvalitu komerčních jogurtů a nefarmakologických probiotických výrobků. Bylo zkoumáno 24 vzorků jogurtů a 8 vzorků probiotických mléčných výrobků. Pozornornost byla zaměřena zvláště na kvantifikaci mikroorganismů v jednotlivých výrobcích a na sledování viability buněk. Většina mléčných produktů obsahovala počty odpovídající minimální požadované hodnotě 1x107cfu/ml. Nicméně byly objeveny produkty, které neobsahovaly živé bakterie nebo obsahovaly jen jejich menší množství. To platí zejména pro běžné jogurty. Probiotické mléčné výrobky v zásadě obsahovaly větší množství bakterií než jogurty, protože je u nich navíc požadováno 1x106cfu/ml minimálního množství specifických bakterií jiných než jogurtových startovacích kultur. Isoláty z fermentovaných mléčných výrobků byly identifikovány jako Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. Isoláty byly poté rozlišeny na jednotlivé kmeny pomocí RAPD použitím tří různých primerů. Byla zjištěna velká různorodost mezi kmeny rodu Lactobacillus spp. používaných různými podniky., The increased consuming of milk fermented products in the last years led to the raising of new trademarks. In fact functional and probiotic foods are at this moment widely diffused too. The aim of the thesis was to evaluate the microbial quality of commercial yoghurts and non-pharmacological probiotic products. It was examined 24 samples of yogurts and 8 samples of probiotic milk products. Investigated was the load of microbial population of each product as well as the viability of the cells. Most of milk products contained viable counts corresponded to minimum required level of 1x107 cfu/ml. However, there were found products which did not contain viable bacteria or contained only its fewer amounts. This holds mainly for some conventional yogurts. Probiotic milk products basically showed larger amount of enumerated bacteria then yogurts as they are required to contain minimum of 1x106cfu/ml of specific microorganisms others than normal starter cultures. The isolates from fermented milk products were identified to belong to species Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. The isolates were then strain-typed by RAPD using three different primers. It was found out rich variations among strains of Lactobacillus spp. used by different companies.
44. Charakterizace mikroorganismů v jogurtech a probiotických výrobcích
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Kocourková, Hana, Španová, Alena, Burdychová, Radka, and Kocourková, Hana
- Abstract
Zvýšená konzumace fermentovaných mléčných výrobků v posledních letech vede k zavádění nových výrobků na trh. Funkční a probiotické produkty jsou v dnešní době také hojně rozšířeny. Cílem diplomové práce bylo posoudit mikrobiální kvalitu komerčních jogurtů a nefarmakologických probiotických výrobků. Bylo zkoumáno 24 vzorků jogurtů a 8 vzorků probiotických mléčných výrobků. Pozornornost byla zaměřena zvláště na kvantifikaci mikroorganismů v jednotlivých výrobcích a na sledování viability buněk. Většina mléčných produktů obsahovala počty odpovídající minimální požadované hodnotě 1x107cfu/ml. Nicméně byly objeveny produkty, které neobsahovaly živé bakterie nebo obsahovaly jen jejich menší množství. To platí zejména pro běžné jogurty. Probiotické mléčné výrobky v zásadě obsahovaly větší množství bakterií než jogurty, protože je u nich navíc požadováno 1x106cfu/ml minimálního množství specifických bakterií jiných než jogurtových startovacích kultur. Isoláty z fermentovaných mléčných výrobků byly identifikovány jako Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. Isoláty byly poté rozlišeny na jednotlivé kmeny pomocí RAPD použitím tří různých primerů. Byla zjištěna velká různorodost mezi kmeny rodu Lactobacillus spp. používaných různými podniky., The increased consuming of milk fermented products in the last years led to the raising of new trademarks. In fact functional and probiotic foods are at this moment widely diffused too. The aim of the thesis was to evaluate the microbial quality of commercial yoghurts and non-pharmacological probiotic products. It was examined 24 samples of yogurts and 8 samples of probiotic milk products. Investigated was the load of microbial population of each product as well as the viability of the cells. Most of milk products contained viable counts corresponded to minimum required level of 1x107 cfu/ml. However, there were found products which did not contain viable bacteria or contained only its fewer amounts. This holds mainly for some conventional yogurts. Probiotic milk products basically showed larger amount of enumerated bacteria then yogurts as they are required to contain minimum of 1x106cfu/ml of specific microorganisms others than normal starter cultures. The isolates from fermented milk products were identified to belong to species Streptococcus thermophilus and Lactobacillus spp. The isolates were then strain-typed by RAPD using three different primers. It was found out rich variations among strains of Lactobacillus spp. used by different companies.
45. Identifikace vybraných bakterií v sýrech pomocí PCR
- Author
-
Španová, Alena, Burdychová, Radka, Gregušová, Barbora, Španová, Alena, Burdychová, Radka, and Gregušová, Barbora
- Abstract
Táto práca je zameraná na identifikáciu a druhovú špecifikáciu 44 kmeňov klostridií s využitím molekulárne-genetických metód. Bola použitá DNA z baktérií vyizolovaných zo syrov s defektom neskorého durenia. Amplifikovatežnosť prečistenej DNA nariedenej na 10 ng/µl bola overená pomocou PCR s univerzálnymi primermi. Rodová PCR využívajúca primery špecifické pre rod Clostridium potvrdila, že všetky vzorky patria práve do tohto rodu. Na základe druhovo špecifických PCR metód sa jednoznačne určila príslušnosť 7 kmeňov k druhu Clostridium butyricum a 12 kmeňov k druhu Clostridium tyrobutyricum. 15 vzoriek DNA bolo identifikovaných ako zmiešané kultúry, zvyšných 10 kmeňov nebolo zaradených do druhu. Pomocou PCR boli hžadané kmene, ktoré nesú gén kódujúci hydrogenázu hydA. Z identifikovaného súboru boli špecifické PCR produkty pre tento gén detekované u 30 kmeňov. Intenzívny amplikon dávali všetky kmene druhu C. butyricum., This work is focused on identification and species specification of a collection of 44 clostridial strains using molecular-genetic methods. DNA of bacteria isolated from late-blowing defected cheeses was used. The purified DNA was diluted to 10 ng/µl and its ability to be amplified was verified by PCR with universal primers. By genus-specific PCR was proved that DNA of all samples belongs to Clostridium genus. Based on species-specific PCR reactions, it was determined that 7 strains belong to C. butyricum and 12 strains belong to C. tyrobutyricum. 15 strains were positively detected in both species-specific PCRs and therefore identified as mixed cultures. Another 10 strains were not classified into tested species. Strains with the gene encoding the enzyme hydrogenase hydA were searched using PCR. Specific PCR products for this gene were detected in 30 strains of the analysed collection. Especially intense were the amplicons by all strains belonging to C. butyricum species.
46. Biodegradace organických látek aplikací termofilní kultury
- Author
-
Babák, Libor, Burdychová, Radka, Piechová, Jana, Babák, Libor, Burdychová, Radka, and Piechová, Jana
- Abstract
Cílem práce je studium biodegradability modifikovaných polyuretanových materiálů (pěn a folií) v glukosovém mediu a biodegadability syrovátky pomocí směsné aerobní termofilní bakteriální kultury rodů Bacillus a Thermus. Kultivace probíhaly ve fermentoru a v Erlenmayerových baňkách na temperované třepačce. Nejlépe probíhala degradace polyuretanů při odbourávání ve fermentoru. Docházelo zde k nejvýraznějšímu nárůstu biomasy i poklesu CHSK. Hlavní vliv na degradaci měl abiotický rozpad materiálu a až následně se mohla projevit utilizace štěpných produktů mikrobiálními kulturami. Z dosažených výsledků se jako nejvhodnější modifikační činidlo jeví 10 % karboxymethyl celulóza. Srovnáním polyuretanových pěn a folií jsou lépe odbouratelné polyuretany ve formě pěn. Odbouráváním syrovátky ve fermentoru, která byla zbavena bílkovin, bylo dosaženo 50% poklesu CHSK a laktosy v prvních 20 hodinách. Optimální pH pro biodegradaci syrovátky pro kultivace směsnou termofilní bakteriální kulturu se jeví hodnota 6,5., The aim of this work is focused on biodegradability study of modified polyurethane materials (foams and foils) in glukose medium and biodegradation of whey. The biodegradability was tested with using mixed thermophilic aerobic bacterial culture of the Bacillus and Thermus genera. The cultivations were practised in the fermentor and in Erlenmayer flasks in a heated shaker. Maximal reduction of COD and culture growth has been achieved by biodegradation of polyuretane in the fermentor. Main effect of degradation was abiotic destruction of PUR materials and consequent utilization of degradation products by bacterial culture. These tests indicated that the best modification agent for biodegradation was 10% carboxymethyl cellulose. The polyurethane foam was more decomposed then the polyurethane foil. Biodegradation of whey without proteins in the fermentor was detected decrease of CHSK and lactose concentration about 50 % in 20th hour. Optimal conditions for whey biodegradation with the thermophilic bacterial culture were pH 6,5 and temperature 60 °C.
Catalog
Discovery Service for Jio Institute Digital Library
For full access to our library's resources, please sign in.