Search

Aerosols that influence many factors from climatic conditions to human health are mixed with the atmosphere because of natural processes or human activities. This study focuses on a total of 292 days of Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer uncertainty and 0.55 μm data between January 1, 2019 and April 19, 2021 when aerosol optical depth images can be taken. March 15, 2020 was considered as the turning point for the pandemics which the effects started to be felt seriously in Turkey. The data was analyzed for two periods of time as before the Covid-19 pandemic and during the pandemic. The region of the study involves Karabük and Karadeniz Ereğli where they are among the important industrial cities of Turkey while the scope involves the effect of the pandemic on aerosol optical depth. The purpose is to reveal the effect of pandemics on the aerosol optical depth. It has been determined that there is a seasonal cycle in the general uncertainty aerosol optical depth values. The Uncertainty aerosol optical depth is higher in Karabük than in Ereğli on the general average both before the Covid 19 pandemics and during the pandemics. In addition, both locations had a decrease in aerosol optical depth values for the 149-day period during the pandemics compared to the 143-day period before the pandemics. The decrease in 0.55 μm aerosol optical depth and the uncertainty data during pandemics draw attention. Furthermore, the rate of reduction increases. When the particulate matter 10 values taken from Karabük Kardemir 1 station are compared with the analysis, there is a similarity in terms of the seasonal cycle, while the highest values occur in late autumn and early winter. With the pandemics, there was a significant decrease of 32% in the amount of particulate matter 10. The remarkable decrease is attributed to the great impact of the slowdown in human activities, including industries., Aerosoller doğal süreçler ya da insan faaliyetleri sonucunda atmosfere karışmakta ve iklim şartlarından insan sağlığına kadar birçok faktör üzerinde etkili olmaktadır. Bu çalışmada 1 Ocak 2019 ve 19 Nisan 2021 tarihleri arasında aerosol optik derinlik görüntüsü alınabilen toplam 292 günlük Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer uncertainty ve 0.55 μm verileri kullanılmıştır. Salgının etkisinin Türkiye’de ciddi anlamda hissedildiği 2020 Mart ayının 15. günü analizlerde salgın öncesi ve salgın süreci ayrım günü olarak belirlenmiştir. Türkiye’nin önemli sanayi kentleri arasında yer alan Karabük ve Karadeniz Ereğlisi araştırmanın alan kapsamını, bu şehirlerde Covid-19 salgın sürecinin aerosol optik derinliği üzerindeki etkisi ise konu kapsamını oluşturmaktadır. Araştırmanın amacı salgın sürecinin aerosol optik derinliği üzerindeki etkisini ortaya koymaktır. Yapılan analizler sonucunda genel olarak uncertainty aerosol optik derinlik değerlerinde mevsimsel bir döngünün var olduğu tespit edilmiştir. Uncertainty aerosol optik derinliğinin hem genel ortalama hem de Covid 19 salgın süreci öncesi ve salgın sürecinde Karabük şehrinde Ereğli’ye oranla daha fazla olduğu görülmektedir. Ayrıca her iki çalışma alanında da aerosol optik derinlik değerlerinde salgın sürecindeki 149 günlük dönemde, salgın öncesindeki 143 günlük döneme göre düşüş yaşanmıştır. 0.55 μm aerosol optik derinlik verileri ile yapılan analizlerde, uncertainty verilerine paralel olarak Covid 19 sürecinde azalma dikkat çekmekte ve azalma miktarı artmaktadır. Karabük Kardemir 1 istasyonundan alınan partikül madde 10 değerleri ile analiz sonuçları karşılaştırıldığında mevsimsel döngü bakımından benzerlik görülmekle birlikte en yüksek değerler sonbahar sonu ve kış başlarında ortaya çıkmaktadır. Ayrıca salgın süreci ile birlikte partikül madde 10 miktarında %32 gibi önemli oranda düşüş yaşanmıştır. Bu düşüşte salgın süreciyle birlikte sanayi de dahil olmak üzere insan faaliyetlerinde meydana gelen yavaşlamanın etkisi büyüktür.

HACIHALİLOĞLU KAYISI (Prunus armeniaca) ÇEŞİDİNDE TRANSKRİPTOM ANALİZİOnur CANBULATErciyes Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Yüksek Lisans Tezi, Haziran 2019Danışman: Doç. Dr. Kahraman GÜRCANÖZETKayısı (Prunus armeniaca) başta olmak üzere sert çekirdekli meyveler ulusal ekonomimizde önemli yere sahiptir. Ülkemiz özellikle dünya kurutmalık kayısı pazarında lider konumdadır. Kayısıda genetik, genomik ve transkriptom çalışmaları son yıllarda giderek artmıştır. Bu çalışmada 'Hacıhaliloğlu' kayısı çeşidin de, genç meyve, yaprak, çiçek, kök ve kotiledon dokularında transkriptom profili oluşturulmuştur. Illumina Novaseq6000 sistemi ile 100 bazlık çift-uçlu (pair-end) okumalar üretilmiş, her bir örnek için 40 milyon temiz okuma elde edilmiştir. Okumalar NCBI veri tabanın da kayıtlı şeftali (Prunus_persica_NCBIv2) referans genomuna eşleştirilmiş, trankriptler elde edilmiştir. Toplam 26.358 unigen tespit edilmiştir. Doku spesifik ve ortak olarak ifade edilen genler belirlenmiş ve gen ekspresyon seviyeleri karşılaştırılmıştır. Elde edilen transkriptom analiz sonuçlarının, kayısı ıslah ve genetik çalışmalarına katkı sağlayacağı düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler: Kayısı (Prunus armeniaca), Transkriptom Analizi, RNA-seq TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF APRICOT (Prunus armeniaca) VARRIETY `HACIHALİLOĞLU`Onur CANBULATErciyes University, Institute of ScienceM.Sc. Thesis, June 2019Adviser: Doç. Dr. Kahraman GÜRCANABSTRACTApricot (Prunus armeniaca) and other stone fruits are important in Turkish national economy. Turkey is especially the leader in the world dried apricot production. Genetic, genomic and transcriptome studies in apricot have increased in recent years. In this study, transcriptome profile of immature fruit, leaf, flower, root and cotyledon tissues of 'Hacıhaliloğlu' apricot cultivar were produced. Illumina Novaseq6000 system was used to obtain 40 million 100-base pair-end readings for each sample. The readings are mapped to the reference genome of Peach (Prunus_persica_NCBIv2) deposited in the NCBI to determine the transcript. A total of 26,358 unigene were detected. Tissue specific and co-expressed genes were identified. Gene expression levels at five tissues were compared. The results of transcriptome analysis will contribute to the apricot breeding and genetics.Key Words: Apricot (Prunus armeniaca), Transcriptome analysis, RNA-seq 81