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Additional file 1: Table S1. GenBank accession numbers of the sequences used for Anaplasma phagocytophilum rrs and gltA phylogenies. Sequences generated in this study are highlighted in bold. Table S2. GenBank accession numbers of the sequences used for Anaplasma phagocytophilum groEL phylogeny. Sequences generated in this study are highlighted in bold.

Two species of grey foxes are recognized in the Southern Cone of America: Lycalopex griseus, and L. gymnocercus, which were traditionally separated by size and some cranial differences. Morphometric analyses of the skull showed that both species could be the same and that they show clinal variation, while DNA studies based on one mitochondrial marker suggested that they belong to different species. Our objective is to evaluate the systematic status of these foxes using three mitochondrial markers (cytochrome B, cytochrome oxidase I, and control region), and a large sample covering a wide geographic range. The results indicate that there are two clades, that are not sister taxa, a finding that is more congruent with the hypothesis of two species, but their geographic distribution is not coincident with the accepted distribution of L. griseus and L. gymnocercus. Consequently, the distribution of L. griseus is extended eastern including north and center of Argentina, towards the west and south of the Paraná, Paraguay and Río de la Plata rivers. On the other hand, the clade that probably represents L. gymnocercus is restricted to the east of those rivers, except for a few specimens collected in Santa Fe, close to the Paraná river. However, an analysis of a wider sample using nuclear DNA is needed to confirm the taxonomic identity of these species of grey foxes. Dos especies de zorros grises se reconocen en el Cono Sur de América: Lycalopex griseus y L. gymnocercus, que tradicionalmente estaban separadas por tamaño y algunas diferencias craneales. Análisis morfométricos del cráneo mostraron que estas especies podrían ser una sola que muestra variación clinal, mientras que estudios de ADN basados en un marcador mitocondrial sugirieron que pertenecen a especies diferentes. Nuestro objetivo es evaluar el estado sistemático de estos zorros utilizando tres marcadores mitocondriales (citocromo B, citocromo oxidasa I y región control) y una muestra grande que cubre un amplio rango geográfico. Los resultados indican que hay dos clados, que no son taxones hermanos, un hallazgo que es más congruente con la hipótesis de dos especies, pero su distribución geográfica no es coincidente con la distribución aceptada de L. griseus y L. gymnocercus. Consecuentemente, la distribución de L. griseus se extiende hacia el este, incluyendo el norte y centro de la Argentina, hacia el este y el sur de los ríos Paraná, Paraguay y Río de la Plata. Por el otro lado, el clado que probablemente representa a L. gymnocercus está restringido hacia el este de esos ríos, excepto por algunos especímenes colectados en Santa Fe, cerca del río Paraná. Sin embargo, se necesita un análisis de una muestra más amplia que utilice ADN nuclear para confirmar la identidad taxonómica de estas especies de zorros grises Fil: Chemisquy, Maria Amelia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Universidad Nacional de La Rioja. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Universidad Nacional de Catamarca. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Secretaría de Industria y Minería. Servicio Geológico Minero Argentino. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Provincia de La Rioja. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja; Argentina Fil: Prevosti, Francisco Juan. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Universidad Nacional de La Rioja. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Universidad Nacional de Catamarca. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Secretaría de Industria y Minería. Servicio Geológico Minero Argentino. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Provincia de La Rioja. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja; Argentina Fil: Martínez, Pablo. Universidade Federal de Sergipe. Campus Itabaiana; Brasil Fil: Raimondi, Vanina Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia"; Argentina. Universidad de Ginebra; Suiza Fil: Cabello Stom, Javier E.. Universidad San Sebastián Sede de la Patagonia; Chile Fil: Acosta Jamett, Gerardo. Universidad Austral de Chile; Chile Fil: Montoya Burgos, Juan Ignacio. Universidad de Ginebra; Suiza

Two species of grey foxes are recognized in the Southern Cone of America: Lycalopex griseus, and L. gymnocercus, which were traditionally separated by size and some cranial differences. Morphometric analyses of the skull showed that both species could be the same and that they show clinal variation, while DNA studies based on one mitochondrial marker suggested that they belong to different species. Our objective is to evaluate the systematic status of these foxes using three mitochondrial markers (cytochrome B, cytochrome oxidase I, and control region), and a large sample covering a wide geographic range. The results indicate that there are two clades, that are not sister taxa, a finding that is more congruent with the hypothesis of two species, but their geographic distribution is not coincident with the accepted distribution of L. griseus and L. gymnocercus. Consequently, the distribution of L. griseus is extended eastern including north and center of Argentina, towards the west and south of the Paraná, Paraguay and Río de la Plata rivers. On the other hand, the clade that probably represents L. gymnocercus is restricted to the east of those rivers, except for a few specimens collected in Santa Fe, close to the Paraná river. However, an analysis of a wider sample using nuclear DNA is needed to confirm the taxonomic identity of these species of grey foxes. Dos especies de zorros grises se reconocen en el Cono Sur de América: Lycalopex griseus y L. gymnocercus, que tradicionalmente estaban separadas por tamaño y algunas diferencias craneales. Análisis morfométricos del cráneo mostraron que estas especies podrían ser una sola que muestra variación clinal, mientras que estudios de ADN basados en un marcador mitocondrial sugirieron que pertenecen a especies diferentes. Nuestro objetivo es evaluar el estado sistemático de estos zorros utilizando tres marcadores mitocondriales (citocromo B, citocromo oxidasa I y región control) y una muestra grande que cubre un amplio rango geográfico. Los resultados indican que hay dos clados, que no son taxones hermanos, un hallazgo que es más congruente con la hipótesis de dos especies, pero su distribución geográfica no es coincidente con la distribución aceptada de L. griseus y L. gymnocercus. Consecuentemente, la distribución de L. griseus se extiende hacia el este, incluyendo el norte y centro de la Argentina, hacia el este y el sur de los ríos Paraná, Paraguay y Río de la Plata. Por el otro lado, el clado que probablemente representa a L. gymnocercus está restringido hacia el este de esos ríos, excepto por algunos especímenes colectados en Santa Fe, cerca del río Paraná. Sin embargo, se necesita un análisis de una muestra más amplia que utilice ADN nuclear para confirmar la identidad taxonómica de estas especies de zorros grises.

La ecorregión valdiviana o de bosque templado lluvioso de Valdivia representa uno de los cinco mayores ecosistemas de este tipo en el mundo y el único de América del Sur, alberga una gran biodiversidad y un alto nivel de especies endémicas, formando parte de un paisaje característico que ha sido influenciado por los procesos glaciares del pleistoceno, sobre todo en la Patagonia. La biodiversidad en esta Ecorregión está desapareciendo a un ritmo veloz, debido a diferentes causas de origen antrópico, poniendo en riesgo de extinción a varias especies de fauna nativa como el pudú (Pudu puda), el zorro chilote (Lycalopex fulvipes) y la ranita de Darwin (Rhinoderma darwinii). La UICN reconoce la necesidad de conservar la biodiversidad en sus tres niveles: ecosistemas, especies y genes. Si se ignoran los factores genéticos en la gestión de especies amenazadas es probable que se produzcan acciones inadecuadas para su subsistencia. La genética de la conservación se ocupa de las aplicaciones genéticas y evolutivas a los problemas de conservación. La pérdida de variabilidad genética en una población lleva a una disminución del potencial adaptativo de ésta, aumentando la probabilidad de extinción. De esta manera, la genética de la conservación trata de entender las relaciones genéticas de las especies para gestionar las poblaciones, asegurando la mantención de la diversidad. En Chile existe un gran desconocimiento acerca de las especies de fauna nativa y los problemas que las amenazan, lo que dificulta poder instaurar acciones para preservarlas. El objetivo de esta tesis fue determinar la variabilidad genética y la estructura filogeográfica del pudú, el zorro chilote y la ranita de Darwin con el fin de aconsejar en la gestión para su conservación. Para ello se realizó un muestreo en gran parte del área de distribución de las especies colectando muestras de heces, pelo, cuero, sangre, músculo e hisopos bucales para extraer, amplificar y estudiar el ADN mediante PCR, secuenciación automática, genotipado y análisis informáticos, utilizando y diseñando marcadores moleculares mitocondriales y nucleares. En el zorro chilote además se realizó una búsqueda de patógenos, utilizando técnicas moleculares, que pudiesen ser una amenaza para su conservación. Se logró diseñar marcadores moleculares microsatélites para el pudú y el zorro chilote; determinar y evaluar la diversidad genética de las especies de estudio, contribuir a resolver la filogeografía de estas especies y su historia evolutiva y pesquisar agentes patógenos en el zorro chilote. Tanto para el pudú como la ranita de Darwin los aspectos genéticos actuales no parecen ser una amenaza para su preservación pues ambas especies muestran una variabilidad genética elevada. Muy diferente es lo ocurrido con el zorro chilote que presenta una diversidad genética extremadamente baja y poblaciones fragmentadas, lo que supone una amenaza adicional. A esto se suma el hallazgo de agentes infecciosos que pudiesen afectar su estado sanitario. La alta estructuración poblacional y la gran diversidad genética encontrada en el pudú y la ranita de Darwin, se relaciona directamente con la compleja historia y estructura orogénica de esa zona y con los procesos glaciares del pleistoceno. De esta manera estas especies coinciden en un patrón filogeográfico pudiendo haber compartido algunos refugios glaciares patagónicos. En todas las especies estudiadas se reconocen varias Unidades Evolutivamente Significativas (UESs), que deben ser consideradas y tratadas de manera independiente en cualquier plan de conservación, para proteger y mantener el potencial evolutivo sin homogeneizar el fondo genético. De la misma manera, es importante asegurar la mantención de hábitats adecuados para asegurar la subsistencia de cada una de estas UESs. Finalmente, en los programas de reproducción ex situ tanto con fines científicos como recreativos o productivos, debiesen considerar el mantener las líneas evolutivas mencionadas que puedan servir como reservorio ante eventualidades que mermen las poblaciones silvestres.

Kit de productos de alta calidad y contenidos científico, dirigidos a distintos públicos, que incluye: 1 exposición interactiva; 1 libro de juegos y contenidos científicos; Set de juegos didácticos en papel de fácil reproducción y una serie de 3 cápsulas Concurso Nacional Proyectos de Valoración y Divulgación de la Cy T Concurso Nacional Proyectos de Valoración y Divulgación de la Cy T XVIII Concurso de Proyectos XVIII Concurso de Proyectos EXPLORA EXPLORA

5 Pág. Centro de Investigación en Sanidad Animal (CISA), Screening of serum and fecal samples from huemul (Hippocamelus bisulcus) and pudu (Pudu puda) from southern Chile for Mycobacterium bovis and Mycobacterium avium paratuberculosis (MAP) found all but four samples Mycobacterium-negative. The positive sequences showed only 92-93% similarity with MAP and were from remote Isla Riesco populations., This work was supported by Asociacion Kauyeken through Fondo Nacional de Desarrollo Regional Project 5961 and the J. M. Kaplan Fund, Buin Zoo, NGO Chiloe Silvestre, Universidad San Sebastian-Sede Puerto Mont and ANID/CONICYT Fondecyt 3160056 and 11181180 (to D.M.-A.), and Estancia Anita Beatriz