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1. Environmental determinants of spatial and temporal variations in the transmission of Toxoplasma gondii in its definitive hosts

Author: Sandrine Ruette, Estelle Germain, Ludovic Say, Emmanuelle Gilot-Fromont, Eve Afonso, Marie-Lazarine Poulle, Sébastien Devillard, Isabelle Villena, Dominique Aubert, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre de Recherche et de Formation en Eco-éthologie ( 2C2A-CERFE ), Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ), Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage, CNERA Prédateurs Animaux déprédateurs, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive ( LBBE ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin ( CEFREM ), Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre de Recherche et de Formation en Eco-éthologie (2C2A-CERFE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Ecologie et évolution des populations, Département écologie évolutive [LBBE], Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biodémographie évolutive, and Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE)
Subjects: 0106 biological sciences, Veterinary medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030231 tropical medicine, biology.animal_breed, Population, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Article, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, parasitic diseases, medicine, Seroprevalence, Felis catus, education, ComputingMethodologies_COMPUTERGRAPHICS, Meteorological variations, education.field_of_study, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], biology, Felis, Felis silvestris, Zoonosis, Toxoplasma gondii, medicine.disease, biology.organism_classification, Toxoplasmosis, Farm density, Infectious Diseases, 13. Climate action, European wildcat, North-Atlantic Oscillation index, Animal Science and Zoology, Parasitology, Spatial variability
Abstract: Graphical abstract, Highlights • Toxoplasma gondii seroprevalences in 112 European wildcats, 20 domestic cats and 47 hybrids are reported. • The seroprevalence (overall 65.2%) did not differ with the type of cat. • High farm densities and mild winters are associated with the highest seroprevalence., Toxoplasmosis is a major zoonosis, and its prevention requires multiple approaches due to the complex life-cycle of its causative agent, Toxoplasma gondii. Environmental contamination by oocysts is a key factor in the transmission of T. gondii to both humans and meat-producing animals; however, its spatial and temporal variations are poorly understood. We analysed the distribution of T. gondii seropositivity in a sample of 210 cats, including the European wildcat (Felis silvestris silvestris), the domestic cat (Felis silvestris catus) and their hybrids that were collected in Central and Eastern France between 1996 and 2006. We searched for spatial variability among communes and temporal variations among years to relate this variability to landscape and meteorological conditions, which can affect the population dynamics of rodent hosts and the survival of oocysts. The overall seroprevalence was 65.2% (95% CI: 58.6–71.4). As expected, adults were more often infected than young individuals, while the occurrence of infection was not related to cat genotypes. Seroprevalence correlated significantly with farm density and the North-Atlantic Oscillation index, which describes temporal variations of meteorological conditions at the continental scale. The highest seroprevalence values were obtained in areas with high farm densities and during years with cool and moist winters. These results suggest that both farming areas and years with cool and wet winters are associated with increased T. gondii seroprevalence in cats. As cat infection determines the environmental contamination by oocysts, climate and landscape characteristics should be taken into account to improve the risk analysis and prevention of T. gondii.
Published: 2013
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2. Mission Tara Microplastics: a holistic set of protocols and data resources for the field investigation of plastic pollution along the land-sea continuum in Europe

Author: Ghiglione, Jean-François, Barbe, Valérie, Bruzaud, Stéphane, Burgaud, Gaëtan, Cachot, Jérôme, Eyheraguibel, Boris, Lartaud, Franck, Ludwig, Wolfgang, Meistertzheim, Anne-Leila, Paul-Pont, Ika, Pesant, Stéphane, ter Halle, Alexandra, Thiebeauld, Odon, Ghiglione, J., Philip, L., Odobel, C., Pandin, C., Pujo-Pay, M., Conan, P., Luckas, N., Barbe, V., Wincker, P., Bruzaud, S., Kedzierski, M., Palazot, M., Soccalingame, L., Burgaud, G., Philippe, A., Cachot, J., Morin, B., Dusacre, E., Clérandeau, C., Lefebvre, C., Eyheraguibel, B., Lartaud, F., Ludwig, W., de Madron, X. Durrieu, Weiss, L., Meistertzheim, A., Calves, I., Lebaron, K., Lavergne, E., Paul-Pont, I., Huvet, A., Dubreuil, C., Pesant, S., ter Halle, A., Albignac, M., Thiebeauld, O., Crenn, K., Gassane, T., Merakeb, L., Bauvois, C., Galgani, F., Gerigny, O., Pedrotti, M., Gorsky, G., Lombard, F., Alligant, S., Lacroix, C., Navarro, L., Sperandio, B., Diémé, B., Bowler, C., Troublé, R., Hentinger, R., Abreu, A., Thomas, M., Bourdreux, M., Schramm, J., Moulin, C., Bernollin, E., Hertau, M., Audrain, S., Bin, N., Tournon, Y., Boulon, L., Aurat, F., Blijdorp, L., Pire, C., Bin, S., Gicquel, C., Oriot, M., Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire d'Ingénierie des Matériaux de Bretagne (LIMATB), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques (LECOB), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), SMODD - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable (SMODD), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de biologie moléculaire des plantes (IBMP), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), and Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [CHIM]Chemical Sciences
Abstract: The Tara Microplastics mission was conducted for 7 months to investigate plastic pollution along nine major rivers in Europe—Thames, Elbe, Rhine, Seine, Loire, Garonne, Ebro, Rhone, and Tiber. An extensive suite of sampling protocols was applied at four to five sites on each river along a salinity gradient from the sea and the outer estuary to downstream and upstream of the first heavily populated city. Biophysicochemical parameters including salinity, temperature, irradiance, particulate matter, large and small microplastics (MPs) concentration and composition, prokaryote and microeukaryote richness, and diversity on MPs and in the surrounding waters were routinely measured onboard the French research vessel Tara or from a semi-rigid boat in shallow waters. In addition, macroplastic and microplastic concentrations and composition were determined on river banks and beaches. Finally, cages containing either pristine pieces of plastics in the form of films or granules, and others containing mussels were immersed at each sampling site, 1 month prior to sampling in order to study the metabolic activity of the plastisphere by meta-OMICS and to run toxicity tests and pollutants analyses. Here, we fully described the holistic set of protocols designed for the Mission Tara Microplastics and promoted standard procedures to achieve its ambitious goals: (1) compare traits of plastic pollution among European rivers, (2) provide a baseline of the state of plastic pollution in the Anthropocene, (3) predict their evolution in the frame of the current European initiatives, (4) shed light on the toxicological effects of plastic on aquatic life, (5) model the transport of microplastics from land towards the sea, and (6) investigate the potential impact of pathogen or invasive species rafting on drifting plastics from the land to the sea through riverine systems.
Published: 2023
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3. Environmental factors associated with the seroprevalence of Toxoplasma gondii in Wild Boars (Sus scrofa), France

Author: Marina Beral, Dominique Aubert, Jean Hars, Emmanuelle Gilot-Fromont, David Abrial, Sophie Rossi, François Klein, Marie-Eve Terrier, Céline Richomme, Isabelle Villena, Patrick Gasqui, Elsa Jourdain, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments (AFSSA), AFSSA, CNERA Cervidés Sanglier (ONCFS), Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage, Unité d'épidémiologie animale, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biodémographie évolutive, Département écologie évolutive [LBBE], Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche d'Épidémiologie Animale (UEA), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin ( CEFREM ), Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments ( AFSSA ), CNERA Cervidés Sanglier ( ONCFS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive ( LBBE ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Unité de recherche d'Épidémiologie Animale ( UEA ), EPSP, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications [Grenoble] ( TIMC-IMAG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Station Biologique de la Tour du Valat-Biologie des Infections Virales Émergentes ( UBIVE ), Institut Pasteur [Paris]-Institut Pasteur [Paris], Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: Veterinary medicine, Health, Toxicology and Mutagenesis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Sus scrofa, 030308 mycology & parasitology, 0302 clinical medicine, Risk Factors, Seroepidemiologic Studies, MESH: Risk Factors, Zoonoses, MESH : Seroepidemiologic Studies, MESH: Animals, MESH : Sus scrofa, 0303 health sciences, MESH: Toxoplasmosis, Animal, Ecology, biology, seroprevalence, Zoonosis, MESH: Toxoplasma, MESH : Risk Factors, risk factor, symbols, France, MESH: Zoonoses, Toxoplasma, environment, wildlife, 030231 tropical medicine, Toxoplasma gondii, MESH : Zoonoses, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, Wild boar, MESH : Toxoplasma, biology.animal, parasitic diseases, medicine, Seroprevalence, Animals, Poisson regression, MESH : France, MESH: Seroepidemiologic Studies, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Felis, zoonosis, medicine.disease, biology.organism_classification, Toxoplasmosis, MESH: Sus scrofa, MESH: France, Toxoplasmosis, Animal, Animal ecology, modified agglutination test, MESH : Toxoplasmosis, Animal, MESH : Animals
Abstract: International audience; Toxoplasma gondii is a protozoan parasite infecting humans and animals. Wild boars Sus scrofa are a potential source of human infection and an appropriate biological model for analyzing T. gondii dynamics in the environment. Here, we aimed to identify environmental factors explaining the seroprevalence of toxoplasmosis in French wild boar populations. Considering 938 individuals sampled from 377 'communes', overall seroprevalence was 23% (95% confidence interval: [22-24]). Using a Poisson regression, we found that the number of seropositive wild boars detected per 'commune' was positively associated with the presence of European wildcats (Felis silvestris) and moderate winter temperatures.
Published: 2012
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4. Monitoring temps reel haute resolution d'un littoral: MAGOBS (Villeneuve-les-Maguelone, Golfe du Lion, France)

Author: Samuel Meulé, Bénédicte Guerinel, François Sabatier, Nicolas Robin, Damien Sous, Philippe Larroudé, Dominique Astruc, Vincent Rey, Miguel Manna, Elena Brambilla, Raphaël Certain, Olivier Lobry, Nicolas Arnaud, Pascal Azerad, David Martinie, Frédéric Bouchette, Risques (Géosciences Montpellier), Géosciences Montpellier, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Mathématiques et de Modélisation de Montpellier (I3M), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Écoulements Géophysiques et Industriels [Grenoble] (LEGI), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Risques ( Géosciences Montpellier ), Université des Antilles et de la Guyane ( UAG ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université des Antilles et de la Guyane ( UAG ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université des Antilles et de la Guyane ( UAG ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Mathématiques et de Modélisation de Montpellier ( I3M ), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin ( CEFREM ), Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire des écoulements géophysiques et industriels ( LEGI ), Université de Grenoble-Alpes-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre européen de recherche et d'enseignement de géosciences de l'environnement ( CEREGE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Collège de France ( CdF ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ), Institut méditerranéen d'océanologie ( MIO ), and Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: Hydrographie, Système d'alerte, [ SDU.STU.OC ] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, Etat de mer, Vague, Risques côtiers, Niveau d'eau, Submersion, Courantologie, Instrumentation, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography
Abstract: Le lido de Villeneuve-lès-Maguelone (Languedoc-Roussillon) est un archétype de littoral microtidal, dominé par la houle, en érosion, et largement affecté par la submersion marine lors des tempêtes. Les observations réalisées dans le cadre du Système d'Observation Littoral - Trait de Côte (SO LTC) concernent l'hydrodynamique et le transport sédimentaire dans l'avant-côte et la lagune. La tache d'observation MAGOBS (Observatoire Aresquiers-Maguelone-Palavas) de cet observatoire regroupe un dispositif instrumental automatisé composé de 30 points d'acquisition en temps réel entre 6 mètres de profondeur et le haut de plage (à terre) ainsi que dans la lagune. Le dispositif est opérationnel depuis mai 2011. Son déploiement a permis de déverrouiller les difficultés techniques liées à la mesure temps réel en zone littorale : choix du type des appareils de mesure, de la technologie embarquée, des cadences d'acquisition, résolution des questions du transfert de la donnée. Le dispositif produit 2 Tera-octets de données par an. Les données sont stockées sur un ensemble de serveurs dédiés. Les données sont mises en ligne sur le site du SO-LTC (www.soltc.org), immédiatement après premiers traitements et qualification. Elles commencent à être utilisées pour des calculs de niveau d'eau à la côte, et dansdes outils de prédiction des vagues et des niveaux à la côte associant mesure et modélisation.
Published: 2012
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5. Three-dimensional modelling of wave-induced current from the surf zone to the inner shelf

Author: Patrick Marsaleix, François Bourrin, Yann Leredde, Florent Lyard, C. Mayet, Fabrice Ardhuin, Héloïse Michaud, Claude Estournel, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Laboratoire d'aérologie (LAERO), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie et de biogéochimie (LOB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Echanges Côte-Large (ECOLA), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Laboratoire d'Océanographie Spatiale (LOS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), The publication of this article is financed by CNRS-INSU, Laboratoire d'aérologie (LA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Géosciences Montpellier, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bassins, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Laboratoire d’Oéanographie Spatiale [Plouzané] (LOS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Laboratoire d’Électrotechnique et d’Électronique de Puissance - ULR 2697 (L2EP), Centrale Lille-Haute Etude d'Ingénieurs-Université de Lille-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d’Électrotechnique et d’Électronique de Puissance - EA 2697 (L2EP), Ecole Centrale de Lille-École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Haute Etude d'Ingénieurs-Université de Lille, Laboratoire d'Océanographie Spatiale (Ifremer), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive [CEFE], Laboratoire d'aérologie [LAERO], Laboratoire d'océanographie et de biogéochimie [LOB], Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin [CEFREM], Echanges Côte-Large [ECOLA], Laboratoire d’Électrotechnique et d’Électronique de Puissance - ULR 2697 [L2EP], and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, Wind stress, Forcing (mathematics), Surf zone, 01 natural sciences, 010305 fluids & plasmas, 0103 physical sciences, Bathymetry, 14. Life underwater, lcsh:Environmental sciences, Rip current, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, 0105 earth and related environmental sciences, lcsh:GE1-350, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 010505 oceanography, lcsh:Geography. Anthropology. Recreation, Breaking wave, Geophysics, Longshore drift, lcsh:G, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Climatology, Sediment transport, Geology
Abstract: We develop and implement a new method to take into account the impact of waves into the 3-D circulation model SYMPHONIE (Marsaleix et al., 2008, 2009a), following the simplified equations of Bennis et al. (2011) which use glm2z-RANS theory (Ardhuin et al., 2008b). These adiabatic equations are completed by additional parameterizations of wave breaking, bottom friction and wave-enhanced vertical mixing, making the forcing valid from the surf zone through to the open ocean. The wave forcing is performed by wave generation and propagation models WAVEWATCH III® (Tolman, 2008, 2009; Ardhuin et al., 2010) and SWAN (Booij et al., 1999). The model is tested and compared with other models for a plane beach test case, previously tested by Haas and Warner (2009) and Uchiyama et al. (2010). A comparison is also made with the laboratory measurements of Haller et al. (2002) of a barred beach with channels. Results fit with previous simulations performed by other models and with available observational data. Finally, a realistic case of energetic waves travelling over a coast of the Gulf of Lion (in the northwest of the Mediterranean Sea) for which currents are available at different depths as well as an accurate bathymetric database of the 0–10 m depth range, is then simulated. A grid nesting approach is used to account for the different forcings acting at different spatial scales. The simulation coupling the effects of waves and currents is successful to reproduce the powerful northward littoral drift in the 0–15 m depth zone. More precisely, two distinct cases are identified: when waves have a normal angle of incidence with the coast, they are responsible for complex circulation cells and rip currents in the surf zone, and when they travel obliquely, they generate a northward littoral drift. These features are more complicated than in the test cases, due to the complex bathymetry and the consideration of wind and non-stationary processes. Wave impacts in the inner shelf are less visible since wind and regional circulation seem to be the predominant forcings. Besides, a discrepancy between model and observations is noted at that scale, possibly linked to an underestimation of the wind stress. Lastly, this three-dimensional method allows a good representation of vertical current profiles and permits to calculate the shear stress associated with wave and current. Future work will focus on the combination with a sediment transport model.
Published: 2011
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6. Small-scale variability in the coupling/uncoupling of bacteria, phytoplankton and organic carbon fluxes along the continental margin of the Gulf of Lions, Northwestern Mediterranean Sea

Author: F. Van Wambeke, Patrick Raimbault, Pascal Conan, Serge Heussner, Frédéric Diaz, Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines (LMGEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines ( LMGEM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin ( CEFREM ), Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Océanographie Microbienne ( LOMIC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Short term variability, chemistry.chemical_element, Aquatic Science, Oceanography, 01 natural sciences, Particulate detritus, [ SDE ] Environmental Sciences, Mediterranean sea, Water column, Carbon budget, Phytoplankton, Dissolved organic carbon, 14. Life underwater, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, 0105 earth and related environmental sciences, Total organic carbon, Bacterial production, geography, geography.geographical_feature_category, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Continental shelf, 010604 marine biology & hydrobiology, Biological pump, Phytoplankton export, Organic carbon flux, Northwestern Mediterranean, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, chemistry, [SDE]Environmental Sciences, Environmental science, Carbon
Abstract: International audience; A High Frequency Flux (HFF) experiment was conducted during spring 1997 on the continental slope of the Gulf of Lions (Northwestern Mediterranean Sea) with the aim of examining the dynamical and biological processes controlling particle transfer in this margin environment. Within this general framework, a special attention was paid to short temporal and small spatial variations of phytoplankton and bacterial production through six hydrological and biological surveys performed during a 7-week period at nine sampling stations located on a 10 Â 20-mile grid. Downward fluxes of particulate organic carbon at each station were measured by traps deployed at 240 m depth. The f-ratio and the ratio of integrated bacterial to primary production (IBP/IPP ratio), computed as indexes of biological export for each survey and station, did not provide a clear, unambiguous understanding of the importance of biological processes in the cycling of carbon in the upper water column. However, the data collected allowed to draw up carbon budgets for the different phases of the experiment. The comparison of primary production with measured and estimated organic carbon removal terms (sinking, cycling through the microbial food web, grazing by ciliates and metazoans) showed that a balance was never reached between fluxes of production and removal of organic carbon during the course of the experiment. The system shifted from an initial situation of 'missing' carbon (removal > production) to one of 'excess' carbon (removal < production). Factors such as horizontal advection of carbon into and out of the experimental area and accumulation of dissolved organic carbon (dissolved biological pump) are invoked to explain the observed imbalances. A sensitivity test of the budget to the variations of the different parameters involved showed that bacterial growth efficiency was the most important factor affecting the budget. D
Published: 2002
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7. Formation and evolution of glauconite in the Demerara Contourite depositional system related to NADW circulation changes during late Quaternary (French Guiana)

Author: Alina Tudryn, Pierre Giresse, Lies Loncke, Cédric Tallobre, Maria-Angela Bassetti, Germain Bayon, Roselyne Buscail, Sébastien Zaragosi, Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche Géosciences Marines (Ifremer) (GM), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géosciences Paris Sud (GEOPS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 010506 paleontology, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, engineering.material, Marginal plateau, 010502 geochemistry & geophysics, 01 natural sciences, Sedimentary depositional environment, Paleontology, Glauconite, 14. Life underwater, Glacial period, 0105 earth and related environmental sciences, Earth-Surface Processes, North Atlantic Deep Water, Geology, Contourite, Authigenic, Demerara plateau, [SDU]Sciences of the Universe [physics], 13. Climate action, Interglacial, engineering, Quaternary
Abstract: International audience; The Demerara Plateau is a marginal plateau which forms a bathymetric relief on the sea floor. Here, contourite deposits have been studied in detail, following the recent discovery of contourite sequences likely related to the bottom currents and linked both to contour current and peculiar sea-floor morphology. A chronostratigraphic framework, based on δ18O relative variations and palaeomagnetic events in sediment cores allows correlating sediment processes to current intensity changes and major climate phases (glacial or interglacial). The studied sediments are enriched in glauconitic grains. In addition, the glauconite mineralogical maturity can easily correlate to low sedimentation rate and slightly energetic bottom currents on the seafloor. Based on these data and using the glauconitic authigenic mineral as proxy for inferring the degree of winnowing at the sediment-water interface, we might put forward the hypothesis that the intensity of NADW is higher during the glacial stages and lower during interglacial periods.
Published: 2019
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8. 150 years of foredune initiation and evolution driven by human and natural processes

Author: David Rosebery, B. Destribats, Vincent Marieu, Stéphane Bujan, Quentin Laporte-Fauret, Richard Michalet, Julie Billy, A. Nicolae Lerma, Patrick A. Hesp, Nicolas Robin, Bruno Castelle, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Office National des Forêts (ONF)
Subjects: Foredune, 010504 meteorology & atmospheric sciences, GPR, Anthropogenic influence, Earth science, Storm, Vegetation, 15. Life on land, 010502 geochemistry & geophysics, 01 natural sciences, Deposition (geology), Natural (archaeology), Sand fences, 13. Climate action, Foredune stratification, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Facies, Ground-penetrating radar, Foredune Coastal dune history, Aeolian processes, 14. Life underwater, Geology, Truc Vert, 0105 earth and related environmental sciences, Earth-Surface Processes
Abstract: International audience; Foredunes are efficient natural coastal defenses acting as protective barriers during storm events. They also have the capacity to be an ecosystem hosting significant biodiversity. The economic development and/or recreational use of the foredune commonly results in a modification of natural functioning and the concomitant mixing of natural and anthropogenic processes. While the impact of human interventions on the short term evolution of coastal dunes is reasonably well understood, relatively less is known on their imprint at a scale of several decades. The Truc Vert beach-dune system (SW France), which has been exposed to various dune management strategies for more than a century, provides a relevant site to explore the respective contributions of natural and anthropogenic processes on coastal foredune evolution and the current coastal dune landscape. For this purpose, the coastal dune system was investigated using several approaches that combine ground penetrating radar (GPR), topographic data, aerial photographs and historical maps.A 20-m thick GPR sequence provides a stratigraphic record from which we detail ~150-year period of coastal dune change, including the initiation of the foredune. Results show a mixture of radar facies typical of natural aeolian erosion or deposition and radar facies that are the signature of human actions. These anthropogenic works include a large fence emplaced in 1860 to build and fix the foredune, and intense mechanical reshaping of the dune profile by bulldozers in 1972 followed by an intensive planting of vegetation. These various management strategies had a profound influence on coastal dune changes and, in turn, on the current coastal dune landscape. Historic archives documenting coastal dune works were critical to discriminate some of the radar facies, which could be wrongfully interpreted as natural erosion or deposition facies. Therefore, these results demonstrate the importance of coupling GPR and historical documentation wherever possible to determine, in part or fully, the contributions of human interventions and actions in modern dune evolution and morphological development.
Published: 2021
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9. Geometry, fractal dimension and settling velocity of flocs during flooding conditions in the Rhône ROFI

Author: Frédéric Jourdin, François Bourrin, P. R. Renosh, Romaric Verney, Gaël Many, X. Durrieu de Madron, Aurélien Gangloff, Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER Centre de Bretagne), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 (LOG), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), and Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, Flocculation, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Rhone, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Soil science, Aquatic Science, Oceanography, 01 natural sciences, Fractal dimension, Sphericity, Settling, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Settling velocity, Advection, 010604 marine biology & hydrobiology, Sediment, 6. Clean water, Plume, ROFI, [SDE]Environmental Sciences, Environmental science, Particle size
Abstract: Regions Of Freshwater Influence (ROFI) are of particular interest in a source-to-sink approach in terms of sediment advection, settling, and deposition in the coastal zone. An experiment was carried out in the ROFI of the Rhone River in February 2016 to describe the properties of suspended particulate matter (SPM) during a flood event. A digital holographic camera (LISST-HOLO, 20–2000 μm) was used to estimate the variability of fine sediment floc properties (size, nature and shape) formed in the Rhone mouth. An automatic image toolbox was developed to classify the different constituents of the SPM (as diatoms, bubbles and flocs) and to describe the diversity of floc shapes existing in the material in suspension. We estimated the fractal dimension (DF3D), the aspect ratio (AR) and the settling velocity of flocs (Ws). The estimated DF3D ranged between 2.0 and 2.5 highlights the complexity of floc shape, which was used as a proxy of the flocculation mechanism functioning in the Rhone mouth. Additionally, we performed a sensitivity analysis on the estimate of Ws using different shape-related coefficients (α/β) and primary particle size (dP). The results highlighted the impact of the flocculation of fine sediments on the increase of Ws from 0.01 to 3 mm s−1 when floc sizes increase from 30 to 500 μm. Ws showed a decrease of 41% considering the sphericity of flocs that emphasized the need to consider the floc shape to properly estimate their settling velocity. We showed that an increase of dP from 1 to 12 μm induces a fivefold increase of Ws that showed the need for an adequate system to properly estimate the size of primary particles. These results emphasized the need to take into account such variability in future model of floc dynamics in ROFI to properly estimate plume sinking rate and SPM dynamics.
Published: 2019
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10. Recent hydrological variability of the Moroccan Middle Atlas Mountains inferred from microscale sedimentological and geochemical analyses of lake sediments

Author: Edouard Bard, Bertil Hebert, Ali Rhoujjati, Corinne Sonzogni, Emmanuel Chapron, Abdelfattah Benkaddour, Laurence Vidal, Guillaume Jouve, Florence Sylvestre, William Rapuc, Thierry Courp, Laurent Dezileau, Anaëlle Simonneau, Rachid Adallal, Kazuyo Tachikawa, Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Faculté des Sciences Semlalia [Marrakech], Université Cadi Ayyad [Marrakech] (UCA), Géographie de l'environnement (GEODE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géosciences Montpellier, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (EDYTEM), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - UMR7327 (ISTO), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biogéosystèmes Continentaux - UMR7327, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), ANR-11-IDEX-0001-02/11-LABX-0061,OTMed,Objectif Terre : Bassin Méditerranéen(2011), ANR-11-IDEX-0001-02/11-IDEX-0001,AMIDEX,AMIDEX(2011), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Collège de France - Chaire Evolution du climat et de l'océan, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Environnements, Dynamiques et Territoires de Montagne (EDYTEM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), EPOC Laboratory Rock-Eval pyrolysis at ISTO Laboratory Labex OT-Med ANR-11-LABX-0061 French National Research Agency (ANR) MISTRALS/Paleomex projects, ANR-11-IDEX-0001,Amidex,INITIATIVE D'EXCELLENCE AIX MARSEILLE UNIVERSITE(2011), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chaire Evolution du climat et de l'océan, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université des Antilles (UA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC)
Subjects: Mediterranean climate, 010506 paleontology, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Runoff, XRF, Climate change, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Microfacies, 01 natural sciences, Proxy (climate), Arts and Humanities (miscellaneous), Moroccan Middle Atlas, Sea level, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Earth-Surface Processes, Sediment, 15. Life on land, North Africa hydrology, Lake sediments, Water resources, 13. Climate action, [SDU]Sciences of the Universe [physics], General Earth and Planetary Sciences, Sedimentary rock, Physical geography, Lake level, Surface runoff, Geology
Abstract: Study of the hydro-sedimentary dynamics of lakes provides key information on hydrological changes. In this work, we investigate Lake Azigza in the Moroccan Middle Atlas, a region that suffers from a scarcity of observational hydrological data necessary for a coherent management of water resources. Sedimentary deposits of Lake Azigza (32°58′N, 5°26′W, 1,550 m above sea level) were dated and analyzed by combining geochemical and mineralogical measurements coupled with microfacies characterization for the last 134 yr. The detrital component derived from X-ray fluorescence elemental composition and microstructures analysis of the lake sediments provided proxies of runoff activity and lake-level changes, respectively. These proxies were calibrated with regional hydro-climatic and instrumental measurements available over the last 50 yr and used to reconstruct past hydrological changes on inter-annual to decadal time scales between 1879 and 2013. Since 1879, lake level and runoff proxies responded in phase to regional inter-annual precipitation variations. We also show that after the major lake-level drop observed in 2008, the response of the runoff proxy to variable precipitation regime is enhanced. Such an approach emphasizes the potential of these hydro-climate-sensitive sedimentary archives to assess the impact of climate change in the Mediterranean region.
Published: 2019
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11. Human cryptosporidiosis in immunodeficient patients in France (2015–2017)

Author: Damien Costa, Romy Razakandrainibe, Marc Sautour, Stéphane Valot, Louise Basmaciyan, Gilles Gargala, Denis Lemeteil, Loïc Favennec, Frédéric Dalle, Anne Debourgogne, Adela Angoulvant, Patrice Agnamey, Julie bonhomme, Brigitte Degeilh, Cathy Chemla, Cécile Garnaud, Coralie Lollivier, Cécile angebault, Pascal Delaunay, Guillaume Desoubeaux, Emilie Fréalle, Frédéric Grenouillet, Florent Morio, Françoise Botterel, Ghania Belkadi, Hélène Yera, Gilles Nevez, Xavier Iriart, Isabelle Accoceberry, Julie Brunet, Marc Thellier, Meja Rabodonirina, Milene Sasso, Charline Miossec, Murielle Nicolas, Nicole Desbois, Philippe Poirier, Christelle Pomares, Sandrine Houze, Yohann Le govic, Anne Pauline Bellanger, Franck Labbe, Marie Laure Darde, Olivier Duquesnoy, Pierre Flori, Patrick Bastien, Thomas Gueudet, Isabelle Villena, Dominique Aubert, Estelle Cateau, Marie-Elisabeth Bougnoux, Nathalie Kapel, Eric Dannaoui, Alexis Valentin, Anne Totet, Jean Menotti, Denis Blanchet, Magalie Demar, Emmanuel Dutoit, Renaud Piarroux, Emilie Sitterle, Denis Magne, Samsa Hamane, Antoine Berry, Cecile Ramade, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Institut Pasteur de Madagascar, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon), Infections Parasitaires : Transmission, Physiopathologie et Thérapeutiques (IP-TPT), Service de Santé des Armées-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle (ESCAPE), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Appareil Digestif Environnement Nutrition (ADEN ), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Stress, Immunité, Pathogènes (SIMPA), Université de Lorraine (UL), Anofel Cryptosporidium National Network, Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294 (AGIR ), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie, Université de Caen Normandie (UNICAEN), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie (UGA UFRP), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-Hôpital l'Archet, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut Pasteur de Dakar, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), Service de parasitologie-mycologie [CHU Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), CHU Bordeaux [Bordeaux], Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamique des interactions Hôte pathogène, Université de Strasbourg (UNISTRA), Immunité et Infection, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR113-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Parasitologie et Mycologie, Hospices Civils de Lyon (HCL), Biologie, Génétique et Pathologie des Pathogènes Eucaryotes (MIVEGEC-BioGEPPE), Pathogènes, Environnement, Santé Humaine (EPATH), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie-Sérologies Bactériennes et Parasitaires [CHU de la Martinique], Centre Hospitalier Universitaire de la Martinique - CHU Martinique, Parasitologie-Mycologie Fort de France, CHU Fort de France, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Bichat - Claude Bernard, Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Neuroépidémiologie Tropicale (NET), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Groupe Immunité des Muqueuses et Agents Pathogènes (GIMAP), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), CHU Clermont-Ferrand, Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (LPM), IFR 53, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-CHU Maison Blanche-UPRES EA 2070, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie et biologie des interactions (EBI), Université de Poitiers-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Departments of Medical Parasitology and Mycology, Service de réanimation médicale, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Laboratoire Hospitalo-Universitaire de Parasitologie-Mycologie, Université des Antilles (UA)-Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Laboratoire de parasitologie mycologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe hospitalier Albert Chenevier – Henri Mondor, Service de Parasitologie et Mycologie, CHU Toulouse [Toulouse]-Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Région Haute Normandie, Projet COS Sesa, 2015-2018, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Service de Santé des Armées, Université de Rennes (UR), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM), Université de Toulouse (UT), Service de Parasitologie et Mycologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], and Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Pediatrics, Epidemiology, Cryptosporidiosis, 0302 clinical medicine, Risk Factors, Child, Immunodeficiency, [SDV.MP.MYC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, biology, Mortality rate, Cryptosporidium, General Medicine, Middle Aged, 3. Good health, Diarrhea, Infectious Diseases, Cryptosporidium parvum, Child, Preschool, Protozoan, Cyclosporine, Female, Immunotherapy, France, medicine.symptom, Cryptosporidium hominis, Immunosuppressive Agents, Adult, medicine.medical_specialty, Adolescent, 030231 tropical medicine, 030106 microbiology, Immunology, Context (language use), Tacrolimus, 03 medical and health sciences, Immunocompromised Host, Young Adult, medicine, Humans, [SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, Immunocompromised, Aged, Immunosuppression Therapy, Infant, Newborn, Infant, Mycophenolic Acid, medicine.disease, biology.organism_classification, Parasitology
Abstract: International audience; Cryptosporidiosis is a common disease in children and immunodeficient individuals. In 2006, a national network was set up on the surveillance of human cryptosporidiosis in France. Since January 2015, the 41 tertiary care hospitals and the 3 private laboratories of the French National Network on the surveillance of human cryptosporidiosis have been able to declare confirmed cases of cryptosporidiosis online. Between 2015 and 2017, 210 cases of cryptosporidiosis were declared in immunodeficient patients in France; Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis represented 66% and 22% of cases, respectively. A peak was observed in autumn. Cryptosporidiosis occurred mainly in a context of solid organ transplantation (SOT) (49%) and of HIV infection (30%). In SOT recipients, cryptosporidiosis appeared more frequently in the first 6 months post transplantation. Regarding cases declared in SOT recipients, mycophenolate mofetil was used in 68%. A mortality rate of 6% was observed. Present results underline the importance of screening for cryptosporidiosis in immunocompromised patients suffering from diarrhea, especially in the course of major cell mediated immunodeficiency or even systematic screening before SOT. Exclusive Cryptosporidium free water feeding could be suggested during major cell mediated immunodeficiency.
Published: 2018
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12. Organic phosphorus in atmospheric deposition over the Mediterranean Sea: An important missing piece of the phosphorus cycle

Author: François Bourrin, Kalliopi Violaki, N. Delsaut, Nikos Mihalopoulos, Dominique Aubert, Giorgos Kouvarakis, Environmental Chemistry Processes Laboratory, Department of Chemistry, Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire astronomique de Strasbourg (OAS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environmental Chemical Processes Laboratory [Heraklion] (ECPL), Department of Chemistry [Heraklion], University of Crete [Heraklion] (UOC)-University of Crete [Heraklion] (UOC), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Violaki, Kalliopi
Subjects: Wet season, Mediterranean climate, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, chemistry.chemical_element, 010501 environmental sciences, Aquatic Science, 01 natural sciences, Mediterranean sea, 14. Life underwater, Phosphorus cycle, Precipitation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Hydrology, Phosphorus, Geology, New production, [SDE.MCG] Environmental Sciences/Global Changes, Deposition (aerosol physics), Oceanography, chemistry, 13. Climate action, Environmental chemistry, [SDE]Environmental Sciences
Abstract: International audience; To obtain a comprehensive picture of the spatial distribution of atmospheric phosphorus (P) speciation in the Mediterranean Sea, deposition samples were collected from the eastern (E) and northwestern (NW) Mediterranean and analyzed for both organic and inorganic P forms. Dissolved P, especially in organic form, is dominant during the wet season, while higher insoluble P fluxes are recorded during the dry period, mainly due to dust outbreaks. Wet deposition has a significant contribution to the atmospheric phosphorus flux; over the NW Mediterranean accounting for 80% of the total dissolved phosphorus (TDP). The seven-year average TDP flux during the wet season in the NW basin, of 1.78 mmol m −2 y −1 , is almost double that of the two-year average in the eastern Mediterranean. The difference is attributed mainly to the precipitation height being 2-3 times higher in the NW Mediterranean compared to the East. Dissolved organic phosphorus (DOP) is the dominant P fraction in both wet and dry deposition samples, presenting similar fluxes (1.16 and 0.94 mmol m −2 y −1 , in the eastern and northwestern basins respectively). Finally, assuming that all TDP is bioavailable, atmospheric deposition of TDP could account for up to 38% of new production in the eastern Mediterranean, while during oligotrophic periods of the NW Mediterranean it could increase the new production by 14%.
Published: 2018

13. AMS radiocarbon dating of carbonate cements in late Pleistocene alluvial conglomerates, Verdouble River. Palaeoenvironmental implications concerning the Palaeolithic site of Tautavel (Pyrénées-Orientales)

Author: Pierre Giresse, Michel Martzluff, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche sur les Sociétés et Environnements en Méditerranées (CRESEM), and Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)
Subjects: 010506 paleontology, Provenance, Pleistocene, carbonate cement, Lithology, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, 010502 geochemistry & geophysics, 01 natural sciences, conglomérat, law.invention, Conglomerate, paléoenvironnement, Paleontology, AMS 14C, law, Tautavel, Radiocarbon dating, Pléistocène, 0105 earth and related environmental sciences, Earth-Surface Processes, palaeoenvironment, ciment carbonaté, 15. Life on land, conglomerate, Interglacial, Facies, Alluvium, Geology
Abstract: International audience; The Pleistocene alluvial conglomerates of the Verdouble River valley, close to the famous Palaeolithic site of Tautavel, were the object of lithologic determinations including microtextural analysis intended to define their provenance, their sedimentary facies and their calcite cement. Previous age assignments by other authors envisage that these conglomerates belong to the MIS 7 (Mindel-Riss interglacial). For the first time, single-phase and some polyphase cements were AMS 14C dated to MIS 3 and possibly to MIS 4, respectively Würm III and Würm II substages. Some 15 ages range from 10,130 years BP to > 48,000 years BP. They testify to a rather late karst-induced excavation of the Gouleyrous Gorge and consequently to the relatively recent connection between the upstream and downstream basins of the Verdouble River. Consequently, this connection did not exist at the time of the Tautavel Man (450,000 years BP). Lateral erosion by floods of the Verdouble probably destroyed the Palaeolithic soils and settlements downstream of the Gouleyrous Gorges: the limited preserved evidence is exactly situated upstream at the confluence of the Vingrau Stream and Verdouble River.; Les conglomérats alluviaux pléistocènes de la vallée du Verdouble, proches du célèbre site paléolithique de Tautavel, ont fait l’objet de déterminations lithologiques des galets afin de déterminer leur provenance et d’analyses microstructurales des ciments calcitiques préliminaires aux datations AMS du 14C. Pour la première fois, ces ciments monophasés ou rarement polyphasés ont pu être datés du stade isotopique 3 ou peut-être 4 (sous-étages III et II du Würm) et non du stade 7 (interglaciaire Mindel-Riss) comme envisagé antérieurement par quelques auteurs. Les 15 âges obtenus se situent entre 10130 ans BP et plus de 48 000 ans. Ils témoignent d’une incision karstique relativement tardive des Gorges des Gouleyrous et, en corollaire, de l’ouverture récente de la communication entre les parties amont et aval du bassin du Verdouble, communication qui n’était pas encore achevée à l’époque de l’Homme de Tautavel, il y a 450 000 ans. Les érosions latérales des crues du Verdouble ont, dès lors, détruit les témoins de possibles sols d’habitat paléolithiques à l’aval des Gouleyrous : le seul modeste témoin conservé se situe précisément à l’amont des Gorges, au confluent du Ruisseau de Vingrau avec le Verdouble.
Published: 2015
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14. Mussel as a Tool to Define Continental Watershed Quality

Author: Maxime Lepretre, Gabrielle Magniez, Iris Barjhoux, Marc Bonnard, Damien Rioult, Gaëlle Daniele, Mélissa Palos-Ladeiro, Dominique Aubert, Emilie Lance, Odile Dedourge-Geffard, Elise David, Aurélie Bigot-Clivot, Elodie Géba, Arnaud Salvador, Jean Armengaud, Alain Geffard, Emmanuelle Vulliet, Isabelle Villena, Stress Environnementaux et BIOsurveillance des milieux aquatiques (SEBIO), Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR Condorcet, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS), Protozooses Transmises par l'Alimentation (Cryptosporidiose, Giardose et Toxoplasmose) : Mode de Contamination et Pathogénie (PROTAL) - EA 3800 (PROTAL), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Institut des Sciences Analytiques (ISA), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), TRACES - Technologie et Recherche en Analyse Chimique pour l'Environnement et la Santé, Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), ANABIO-MS - Analyse biomoléculaire par spectrométrie de masse - Biological Analysis by Mass Spectrometry, Commissariat à l'Energie Atomique, Centre de Marcoule (CEA), Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-SFR Condorcet, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle (ESCAPE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Reims Champagne-Ardenne, Fluides, automatique, systèmes thermiques (FAST), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biochimie des Systèmes Perturbés (LBSP), Unité de Recherche Interactions Animal-Environnement - EA 4689 (IAE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)
Subjects: 0301 basic medicine, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Watershed, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], Mussel, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Fishery, 03 medical and health sciences, 030104 developmental biology, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, [SDE]Environmental Sciences, Environmental science, [CHIM]Chemical Sciences, Quality (business), [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, media_common
Abstract: International audience
Published: 2017
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15. Overview of the VERDON-ISTP Program and main insights from the VERDON-2 air ingress test

Author: S. Bernard, E. Hanus, J. Bonnin, A. Gallais-During, B. Gleizes, P.-P. Malgouyres, S. Morin, G. Ducros, Y. Pontillon, CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire d'Analyse de la Migration des Radioéléments (LAMIR), Service d'Analyses, d'Elaboration, d'Expérientations et d'Examens des combustibles (SA3E), Département d'Etudes des Combustibles (DEC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Département d'Etudes des Combustibles (DEC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Réseaux épuration et qualité des eaux (UR REBX), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Subjects: Fission products, [PHYS.NUCL]Physics [physics]/Nuclear Theory [nucl-th], 020209 energy, Nuclear engineering, Uranium dioxide, Radioactive waste, 02 engineering and technology, [PHYS.NEXP]Physics [physics]/Nuclear Experiment [nucl-ex], Solid fuel, ISTP, 7. Clean energy, 01 natural sciences, 010305 fluids & plasmas, chemistry.chemical_compound, Nuclear Energy and Engineering, chemistry, 13. Climate action, 0103 physical sciences, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, Environmental science, Energy source, MOX fuel, Burnup
Abstract: International audience; In order to reduce the uncertainties concerning source term assessment under LWR severe accident conditions, the International Source Term Program has been launched. Four main R&D research axes have been addressed in this program: iodine behaviour in the RCS and containment, study of the boron carbide effect on fuel degradation and FP release, study of the air effect on fuel and FP behaviour, FP release from high burn-up UO2 and MOX fuels.As far as the source term quantification is concerned, four VERDON tests have been defined and were performed in the VERDON laboratory at the CEA Cadarache Centre. We present an overview of these four tests, devoted to the study of FP release from high burn-up UO2 and MOX fuels. We focus on the VERDON-2 air ingress test performed on MOX fuel with a specific loop dedicated to FP release and transport. It addressed two issues: Ru release under mixed steam-air conditions following lower head failure and transport/re-volatilization of Ru and volatile FPs in the primary circuit. The latter was performed thanks to the implementation of thermal gradient tubes exposed at different phases of the sequence. In this configuration, the VERDON facility combines the ability of the analytical approach to identify and understand the physical phenomena involved, with a semi-integral approach, which allows the results to be applied to source term assessments for reactor application. This VERDON-2 test has shown a rather unexpected low release of ruthenium from the MOX sample and no re-volatilization from the thermal gradient tubes. On the contrary, a significant re-volatilization of iodine has been observed when switching to mixed steam-air conditions, as well as a low, but measurable amount of iodine transported under gaseous form downstream of the thermal gradient tubes.
Published: 2017
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16. Processes controlling very low sedimentation rates on the continental slope of the Gonone-Orosei canyon system, NE Sardinia—terrestrial and oceanic significance

Author: Vincenzo Pascucci, Virginie Gaullier, Gaël Lymer, Isabelle Thinon, Pierre Giresse, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dipartimento di Architettura, Università degli studi di Sassari, Géosystèmes - UMR 8157, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille, Sciences et Technologies, Université de Lille, Sciences et Technologies, and Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, Pleistocene, Geochemistry, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Environmental Science (miscellaneous), Sardinia, 010502 geochemistry & geophysics, Oceanography, 01 natural sciences, quaternary sediment, Continental margin, Earth and Planetary Sciences (miscellaneous), Orosei canyon, 14. Life underwater, Geomorphology, 0105 earth and related environmental sciences, Canyon, geography, geography.geographical_feature_category, Terrigenous sediment, Continental shelf, Geotechnical Engineering and Engineering Geology, tyrhenian sea, Turbidite, Facies, Siliciclastic, Geology
Abstract: 16 pages; International audience; The narrow shelf and upper slope immediately above the Gonone canyon head off NE Sardinia represent areas of very low sedimentation rates. Along the sides of the canyon head (1,600 m water depth), the sediment deposits are homogeneous but show alternating light-grey intervals rich in carbonate and dark-grey ones rich in organic matter, possibly related to distal turbidite processes. Deposits older than 50,000 years are already encountered at core depths of 2.50 m, the sedimentation rates varying from 6-21 cm/103 years in the lower parts of two cores and from 1.5-3 cm/103 years in the upper parts. At about 35,000 years BP, both cores show a simultaneous drop in sedimentation rate by a factor of 3, probably in response to local mechanisms of channel avulsion. Lithological, mineralogical and geochemical properties reveal the environmental factors which are responsible for the extremely slow sediment accumulation. The southernmost sector of the coast, and partly also of the shelf, consists of Jurassic limestones which supply only small amounts of fine grained material transported in suspension. During the last sea-level highstand, the accumulation of the Cedrino River pro-delta remained restricted to the coast, the low siliciclastic sediment yields resulting in poor shelf sediment trapping. The present morphology of the canyon head prevented the occurrence of gravity processes in the deeper part of the canyon system, including the coring sites. Accordingly, deposition was mainly fed by hemipelagic material of planktonic origin, together with only moderate terrigenous inputs. On a wider late Pleistocene timescale, seismic data indicate the occurrence of a coarse-grained, layered turbidite facies, implying a very different architecture of the canyon drainage system probably prior to 60,000 years BP.
Published: 2014
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17. Lepidapedon sereti n. sp. (Digenea: Lepidapedidae) in Coelorinchus sereti (Gadiformes: Macrouridae) from deep waters off Vanuatu

Author: Rodney A. Bray, Elisabeth Faliex, Jean-François Allienne, Gabriel Mouahid, The Natural History Museum [London] (NHM), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie et évolution des interactions [2011-2014] (2EI), and Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, Zoology, Coelorinchus, 01 natural sciences, Pacific ocean, Digenea, 030308 mycology & parasitology, 03 medical and health sciences, Vanuatu, Lepidapedon, Animals, 14. Life underwater, Sensu stricto, 0303 health sciences, Pacific Ocean, General Veterinary, biology, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, Gadiformes, General Medicine, biology.organism_classification, Deep water, Infectious Diseases, Excretory system, Insect Science, Parasitology, Trematoda, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; : Lepidapedon sereti n. sp. is described from the macrourid Coelorinchus sereti from the deep water off Vanuatu. It is placed in the Elongatum group and Elongatum subgroup. It differs from the other species described in this subgroup by the distinctly dorsally subterminal excretory pore. It also differs from other species in combinations of size, excretory vesicle length, proportions of forebody, post-testicular region and other metric features. This constitutes the first record of a Lepidapedon (sensu stricto) from the Central Western Pacific Ocean.
Published: 2013
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18. Live (stained) benthic foraminifera from the Cap-Ferret Canyon (Bay of Biscay, NE Atlantic): A comparison between the canyon axis and the surrounding areas

Author: Sabine Schmidt, Edouard Metzger, Christophe Fontanier, Philippe Kerhervé, Roselyne Buscail, Bruno Deflandre, Frans Jorissen, Pauline Duros, Sébastien Zaragosi, Sylvain Rigaud, Florian Cesbron, Marie-Lise Delgard, Laboratoire d'études des fossiles et bio-indicateurs récents, Université d'Angers (UA)-UPRES EA 2644, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), UMR 5805 Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Tropospheric Research (IFT), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire des Bio-Indicateurs Actuels et Fossiles (BIAF), Université d'Angers (UA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bio-Indicateurs Actuels et Fossiles (BIAF), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), and Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: 0106 biological sciences, Canyon, geography, geography.geographical_feature_category, 010504 meteorology & atmospheric sciences, biology, Continental shelf, 010604 marine biology & hydrobiology, 15. Life on land, Aquatic Science, Oceanography, biology.organism_classification, 01 natural sciences, Foraminifera, Benthic zone, [SDE]Environmental Sciences, Sediment gravity flow, Bathymetry, 14. Life underwater, Transect, Bay, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Geology, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: Living (Rose Bengal stained) benthic foraminiferal faunas were investigated at 13 deep-sea stations sampled in the Cap-Ferret Canyon area (NE Atlantic). One station (151 m) is located on the continental shelf close to the canyon head. All other stations are located along 2 bathymetric transects: 7 sites along the canyon axis with depths ranging from 300 to 3000 m and 5 stations along the adjacent flank with depths ranging from 300 m to 2000 m. Sedimentological analyses indicate that the Cap-Ferret Canyon is at present inactive in terms of sediment gravity flow. Compared to stations on the adjacent flank, canyon-axis stations are generally characterised by shallow oxygen penetration depths, high diffusive oxygen uptakes (DOU) and high lipid contents. Higher mineralisation rates recorded in the canyon axis are likely due to a preferential focusing of labile organic matter in the canyon axis. Foraminiferal standing stocks do not exhibit any straightforward correlation with the different descriptors of organic matter available in the sediment. However, foraminiferal standing stock and diversity along the canyon axis are generally higher than on the adjacent flank. Canyon axis sites yield dominant species that are similar to those at adjacent flank and open slope stations located at comparable water depths. However, intermediate and deep infaunal species were only recorded in the lower canyon axis, where high amounts of organic matter were observed in deeper sediment layers. Finally, the faunal composition in the Cap-Ferret Canyon is different compared to the nearby Cap-Breton Canyon, where sediment gravity flows are active. The absence of pioneer species and the occurrence of highly specialized taxa are both consistent with the much more stable conditions in terms of hydro-sedimentary conditions prevailing in the Cap-Ferret Canyon.
Published: 2013
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19. Net offshore bar migration variability at a regional scale: Inter-site comparison (Languedoc-Roussillon, France)

Author: Jean-Paul Barusseau, Nicolas Aleman, Raphaël Certain, Nicolas Robin, Mathieu Gervais, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, Range (biology), Net offshore migration, 010502 geochemistry & geophysics, regional scale, 01 natural sciences, Bathymetry, [SDU.STU.GM]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geomorphology, 14. Life underwater, Sedimentary budget, 0105 earth and related environmental sciences, Earth-Surface Processes, Water Science and Technology, computer.programming_language, geography, geography.geographical_feature_category, Ecology, Shoal, Lidar, Oceanography, sandbars, Harbour, Submarine pipeline, Scale (map), computer, wave energy, coastal structures
Abstract: International audience; The Languedoc-Roussillon coastline is a large unit stretching out over 200 km of sandy low coast in a wave dominated environment. The nearshore is characterized by a quasi continuous system of double sandbar that displays a wide range of typology. The interannual sandbar dynamic was investigated using 2D bathymetric profiles and 3D LiDAR imagery. This study has allowed determining the sandbar systems affected by the Net Offshore Migration (NOM). At a regional scale, conditions necessary to NOM development depend on the sandbar morphologies (crescentic or straight), the wave energy and the associated coastal orientation (low or high energy, sheltered area), the coastal structures (harbour and coastal defences) and the nearshore sedimentary budget. The areas where the NOM occurs show cycle dynamic differences. This regional inter-site comparison highlights that nearshore morphology and bar parameters seem to influence the nearshore bar behaviour. Interaction between the nearshore slope, width of the bar zone and the migration rate control the NOM duration. The sandbar volume and the regional wave climate influence also the migration rate of the system. On the Languedoc-Roussillon coast, the sediment grain size does not appear to influence the seaward bar migration.
Published: 2013
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20. Baseline determination of the atmospheric Pb, Sr and Nd isotopic compositions in the Rhine valley, Vosges mountains (France) and the Central Swiss Alps

Author: Th. Perrone, Dominique Aubert, M. Lahd Geagea, François Gauthier-Lafaye, Peter Stille, Centre de géochimie de la surface (CGS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)
Subjects: biology, Baseline (sea), 15. Life on land, 010501 environmental sciences, Plant litter, 010502 geochemistry & geophysics, biology.organism_classification, 01 natural sciences, Pollution, Moss, 13. Climate action, Geochemistry and Petrology, visual_art, Environmental chemistry, visual_art.visual_art_medium, Environmental Chemistry, Bark, Lichen, Geomorphology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Geology, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: The Pb, Sr and Nd isotopic compositions of biomonitors (lichen, moss, bark) and soil litter from different regions in the Rhine valley, as well as of
Published: 2008
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21. Suspended sediment transport in the Gulf of Lions (NW Mediterranean): Impact of extreme storms and floods

Author: X. Durrieu de Madron, Albert Palanques, Claude Estournel, Caroline Ulses, Ecosystems Studies, Laboratoire d'aérologie (LAERO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Marine Sciences / Institut de Ciències del Mar [Barcelona] (ICM), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, 3D sediment transport modeling, Submarine canyon, Aquatic Science, 010502 geochemistry & geophysics, Oceanography, Sediment budget, 01 natural sciences, Sediment resuspension, Mediterranean sea, Continental margin, 14. Life underwater, Northwestern Mediterranean Sea, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, Sedimentary budget, 0105 earth and related environmental sciences, Canyon, [PHYS.PHYS.PHYS-AO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Atmospheric and Oceanic Physics [physics.ao-ph], geography, geography.geographical_feature_category, Continental margins, Sediment, Geology, 15. Life on land, Sediment transport, 6. Clean water, Northwestern Mediterranean, 13. Climate action, Gulf of Lions, Erosion
Abstract: Special issue Sediment Dynamics in the Gulf of Lions; the Impact of Extreme Events.-- 23 pages, 10 figures, 5 tables, 3 appendix, In situ observations were combined with 3D modeling to gain understanding of and to quantify the suspended sediment transport in the Gulf of Lions (NW Mediterranean Sea). The outputs of a hydrodynamic-sediment transport coupled model were compared to near-bottom current and suspended sediment concentration measurements collected at the head of seven submarine canyons and at a shallow shelf site, over a 6-month period (November 2003-May 2004). The comparisons provide a reasonable validation of the model that reproduces the observed spatial and time variations. The study period was marked by an unusual occurrence of marine storms and high river inputs. The major water and sediment discharges were supplied by the Rhone, the largest Mediterranean river, during an exceptional flood accompanying a severe marine storm in early December 2003. A second major storm, with moderate flooding, occurred in February 2004. The estimate of river input during the studied period was 5.9 Mt. Our study reveals (i) that most of the particulate matter delivered by the Rhone was entrapped on the prodelta, and (ii) that marine storms played a crucial role on the sediment dispersal on the shelf and the off-shelf export. The marine storms occurring in early December 2003 and late February 2004 resuspended a very large amount of shelf sediment (>8 Mt). Erosion was controlled by waves on the inner shelf and by energetic currents on the outer shelf. Sediment deposition took place in the middle part of the shelf, between 50 and 100 m depth. Resuspended sediments and river-borne particles were transported to the southwestern end of the shelf by a cyclonic circulation induced by these onshore winds and exported towards the Catalan shelf and into the Cap de Creus Canyon which incises the slope close to the shore. Export taking place mostly during marine storms was estimated to reach 9.1 Mt during the study period. © 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved, This study was supported by the EUROSTRATAFORM Project funded by EU (EVK3-CT-2002-00079), within EU Fifth Framework Programme: Energy, Environment and Sustainable Development
Published: 2008
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22. Last millennia sedimentary record on a micro-tidal, low-accumulation prodelta (Têt NW Mediterranean)

Author: André Monaco, Jean-Claude Aloïsi, Joan-Albert Sanchez-Cabeza, François Bourrin, Xavier Durrieu de Madron, Johanna Lofi, Roselyne Buscail, Gerard Jeanty, Serge Heussner, Gilles Saragoni, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Marine Environment Laboratories [Monaco] (IAEA-MEL), International Atomic Energy Agency [Vienna] (IAEA), Géosciences Montpellier, and Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, 010502 geochemistry & geophysics, Oceanography, 01 natural sciences, Deposition (geology), Mediterranean sea, sedimentary sequence, Geochemistry and Petrology, 14. Life underwater, Sedimentology, Gulf of Lion, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, 0105 earth and related environmental sciences, prodelta, sedimentology, Sediment, Geology, turitella communis, Sedimentation, Diagenesis, 13. Climate action, radiocarbon, Erosion, Sedimentary rock, 210Pb
Abstract: SUBSURF; Statistical sequential analysis was performed on a series of sediment cores collected from the Têt prodelta in the Gulf of Lions, northwestern Mediterranean Sea, between October 2003 and October 2004. Seabed changes during that period were correlated to hydrodynamic conditions (waves and currents) and river discharge. Low sediment supply prevents full preservation of new sediment strata on this low-accumulation prodelta located on a microtidal, storm-dominated inner shelf. Severe meteorological events caused a rapid succession of erosion and deposition phases. For example, the December 2003 flood and storm produced a flood layer deposit that persisted for 2 months with only slight transformations due to early diagenesis and/or bioturbation, until a new storm event eroded this layer. A typical sedimentary sequence was observed for the secular deposits composed of a 10-cm-thick sandy layer overlaying siltyclayey layers. These characteristic features were used to analyse the last millennia sedimentary record of the Têt prodelta. The low preservation of freshly deposited sediments and variable sedimentation rates during the last millennia period yield a sedimentary sequence formed by the outcropping of muddy prodeltaic units intersected by heterogeneous siltysandy units similar to those formed under present day hydrodynamic conditions. No flood layer was found related to catastrophic flooding of the last century in the sedimentary record. The Little Ice Age ( 15501850 AD) probably favoured the formation of a well-developed muddy prodelta in the mouth of the Têt River. Later on, the decrease of sediment supply by rivers due to climate change and/or human activities (damming, irrigation), and the increase of the number of high-energy storms reaching the coast, induced a coarsening of the top sediment layer on this prodelta. This modern change of the substrate is also observed in the composition of benthic biota found in the substrate
Published: 2007
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23. Reconstitution du détristisme au cours du néoglaciaire : vers l'identification d'un signal météorologique régional pyrénéen

Author: Simonneau, Anaëlle, Galop, Didier, Chapron, Emmanuel, Kazuyo, Tachikawa, Courp, Thierry, Mazier, Florence, Houet, Thomas, Bard, Edouard, Biogéosystèmes Continentaux - UMR7327, Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - UMR7327 (ISTO), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géographie de l'environnement (GEODE), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chaire Evolution du climat et de l'océan, Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-11-LABX-0010,DRIIHM / IRDHEI,Dispositif de recherche interdisciplinaire sur les Interactions Hommes-Milieux(2011), PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Collège de France - Chaire Evolution du climat et de l'océan, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)
Subjects: Pyrénées, climat, érosion diachronique, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, [SDE]Environmental Sciences, Néoglaciaire, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, OHM
Abstract: International audience; Dans le cadre de l’Observatoire Homme Milieu Haut Vicdessos et des programmes de recherche EMPAL, DYVAH, ALTOS et ARCHIVOS, nous proposons l’étude à hautes résolutions spatiale et temporelle de cinq séquences lacustres pyrénéennes holocènes. L’objectif de cette démarche intégrée est de reconstituer l’érosion diachronique des surfaces continentales via l’analyse et la datation de chaque séquence sédimentaire, afin d’en dégager un signal météorologique, voire climatique. Localisé dans un rayon de 20 kilomètres, chaque lac d’origine glaciaire se caractérise cependant par des bassins versants aux caractéristiques géomorphologiques et géologiques contrastées (canyons rocheux, granite, roches métamorphiques), ainsi que par des pressions an- thropiques différentes (pastoralisme ou hydroélectricité). La caractérisation de l’ensemble des systèmes étudiés repose alors sur une approche multi-paramètres incluant un ou plusieurs carottages lacustres, et des analyses détaillées hautes résolutions des propriétés minérales des sédiments (susceptibilité magnétique, radiographie etmicrofluorescence X). Ces propriétés sont par ailleurs comparées aux signatures géochimiques de chaque bassin versant afin de réaliser une approche source-puits spécifique de chaque système. Enfin, l’étude diachronique des signaux est rendue possible via des datations radionucléides et radiocarbones qui ont été réalisées sur chaque séquence sédimentaire prélevée afin de générer des modèles âges-profondeurs indépendants, dont certains ont d’ores et déjà été discutés (Simonneau et al., 2013). La description sédimentaire, couplée aux radiographies X, a permis de distinguer différentsfaciès en fonction de leurs densités apparentes et de leurs granularités. Quelle que soit la séquence sédimentaire considérée, la sédimentation de fond est systématiquement interrompue par le dépôt de sables plus ou moins grossiers. Les analyses géochimiques réalisées sur les formations géologiques permettent alors d’avoir une lecture appropriée des signaux minéraux mesurés sur chaque séquence. Ainsi, en présence de substrats granitiques, le rubidium s’avère être l’élément le plus représentatif des flux détritiques, tandis qu’en présence de roches métamorphiques, ce sont les éléments potassium ettitane qui sont considérés. Certains pics de concentration en ces éléments chimiques s’avèrent contemporains des dépôts sableux précédemment décrits, d’autres non. Cette double signature, granulométrique et géochimique, permettrait de hiérarchiser l’intensité des flux détritiques et donc l’intensité des évènements météorologiques hydrologiques locaux sur chaque système. Les événements sableux témoignant alors d’épisodes pluvieux ou de fontes nivales plus marqués. Au-delà de la signature locale, la comparaison inter-sites des flux détritiques reconstitués sur ces cinq séquences autorise une discussion plus approfondie de la signature météorologique régionale enregistrée. En effet, la comparaison diachronique des flux reconstitués à partir des modèles d’âges de chaque séquence met enévidence des évènements simultanés entre les sites. Avec des pressions anthropiques différentes, ce 388 synchronisme régional suggère que le facteur de forçage à l’origine de ces phases érosives soit davantage d’origine climatique. 13 épisodes intenses de détritisme liés à des péjorations climatiques ont donc été identifiés et datés aux alentours de 4715, 4455, 3875, 2620, 1670, 1380, 1035, 845 (AD1105), 620(AD1330), 430 (AD1520), 215 (AD1735) et 105 (AD1845) cal BP, ainsi qu’en AD1955 et AD1985. Chaque épisode s’avère contemporain de péjorations climatiques humides largement documentées dans les Alpes, suggérant que ces deux massifs montagnards soient soumis aux mêmes influences climatiques. Par ailleurs, la comparaison inter-sites démontre également une augmentation de la fréquence des évènements hydrologiques pendant le Petit Âge Glaciaire, ainsi que lors des minimas solaires.
Published: 2015

24. Longshore variability of beach states and bar types in a microtidal, storm-influenced, low-energy environment

Author: Raphaël Certain, Nicolas Aleman, Edward J. Anthony, Jean-Paul Barusseau, Nicolas Robin, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: LiDAR, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Bar types, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Context (language use), 010502 geochemistry & geophysics, 01 natural sciences, Dean parameter, Headland, Geological context, River mouth, Nearshore bars, Bathymetry, 14. Life underwater, [SDU.STU.GM]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geomorphology, Geomorphology, 0105 earth and related environmental sciences, Earth-Surface Processes, geography, geography.geographical_feature_category, Shoal, Storm, Oceanography, Beach ridge, Beach states, Beach morphodynamics, Geology
Abstract: Beach classification models are widely used in the literature to describe beach states in response to environmental conditions. These models were essentially developed for sandy barred to barless beaches in micro- to mesotidal environments subject to moderate to high wave energy conditions and have been based on field studies over limited stretches of coast. Here,we further interrogate the performance of the Australian beach classification scheme by analysing beach states and corresponding bar types on a regional scale in a storm-influenced, low wave-energy, microtidal environment, using a large and unique spatial and temporal dataset of supra- and subtidal beach morphology and sedimentology. The 200 km-long coast of the Gulf of Lions in theMediterranean consists of quasi-continuous sandy beaches with a well-developed double sandbar system. All the reported classical beach stateswere observed on this coast, from reflective to dissipative, alongwith two more unusual states: the rock platform-constrained beach state which is associated with bedrock outcrops, and the non-barred dissipative beach statewhich ismore commonly found in large tidal-range settings. LiDAR bathymetry shows that the transitions between beach state zones are marked mainly headlands but transitions also occur progressively along stretches of continuous sandy beach. The longshore distribution of beach states and associated bar types on a regional scale can be related to the variability of hydrodynamic conditions (wave incidence and energy) and sediment characteristics (particle size). However, the influence of these parameters on beach state seems to be largely controlled by the geological context such as the presence of a river mouth, headland or rock platform. Finally, we assessed the ability of the parameter Ω, commonly used to characterise beach states, which combines wave characteristics and sediment fall velocity, to predict the observed beach states and bar types using a very large set of hydrodynamic and sedimentary data. Our results, based on high frequency spatial sampling, show that the fall velocity of the subtidal sediment coupled with wave statistics one month prior the observed beach state strongly improved the predictive power of the parameter Ω.
Published: 2015
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25. Influence of deep-water derived isoprenoid tetraether lipids on the TEXH86 paleothermometer in the Mediterranean Sea

Author: Kim, J.H., Schouten, S., Rodrigo-Gámiz, M., Rampen, S.W., Marino, G., Huguet, C., Helmke, P., Buscail, R., Hopmans, E.C., Pross, J., Sangiorgi, F., Middelburg, J., Sinninghe Damsté, J.S., Royal Netherlands Institute for Sea Research (NIOZ), Faculty of Geosciences [Utrecht], Utrecht University [Utrecht], Federal Institute of Hydrology (BfG), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Earth Sciences [Heidelberg], Universität Heidelberg [Heidelberg], Organic geochemistry & molecular biogeology, Marine Palynology, Organic geochemistry, Geochemistry, and Marine palynology and palaeoceanography
Subjects: [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences
Abstract: The View the MathML sourceTEX86H paleothermometer based on isoprenoid glycerol dialkyl glycerol tetraethers (isoGDGTs) has widely been applied in various marine settings to reconstruct past sea surface temperatures (SSTs). However, it still remains uncertain how well this proxy reconstructs annual mean SSTs. Here, we assess environmental factors governing the View the MathML sourceTEX86H paleothermometer in the Mediterranean Sea, by studying the distribution of isoGDGTs in surface sediments, suspended particulate matter (SPM), and two sediment cores. A redundancy analysis using the fractional abundance of the six major isoGDGTs indicates that the sedimentary isoGDGTs are mostly influenced by three environmental factors explaining a large part (74%) of the variance in isoGDGT distribution. In order of decreasing significance, these factors are annual mean SST, continental organic matter input as indicated by the BIT index, and water depth. However, when considering only the four isoGDGTs that are used for the View the MathML sourceTEX86H proxy, water depth is the most significant parameter, explaining 63% of the variance. Indeed, a strong positive relationship between water depth and View the MathML sourceTEX86H is observed in both surface sediments and SPM from the Mediterranean Sea. This is driven by an increase in fractional abundances of GDGT-2 and crenarchaeol regio-isomer and a decrease in the fractional abundances of GDGT-1 and GDGT-3 with increasing water depth, leading to a bias to higher temperatures of View the MathML sourceTEX86H in deep-water surface sediments. The fact that the water-depth trend is also apparent in SPM suggests that this change might be due to a change in thaumarchaeotal community thriving below surface mixed-layer waters and that this signal is, at least partly, incorporated into sedimentary isoGDGTs. Interestingly, surface-sediment View the MathML sourceTEX86H values from >1000 m water depth do not show a correlation with water depth anymore and instead are correlated to annual mean SSTs. A composite deep-water View the MathML sourceTEX86H dataset of surface sediments from both the Mediterranean Sea and the Red Sea, interconnected regional restricted basins with relatively high bottom-water temperatures and high salinity, forms a distinctive correlation line, statistically distinct from that of the general global correlation. Application of this correlation on two sedimentary records from the western Mediterranean Sea covering the last deglaciation yields SSTs nearly identical to those obtained with the View the MathML sourceU37K' paleothermometer, whereas the global calibration substantially overestimates SSTs. Our results show that the warm bias of the View the MathML sourceTEX86H proxy in the Mediterranean Sea is not due to seasonality, as previously suggested. Further research is needed to elucidate the mechanism behind the strong water depth trend of View the MathML sourceTEX86H in the Mediterranean Sea which is not apparent in open ocean settings.
Published: 2015
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26. Biogeochemistry of fatty acids in a river-dominated Mediterranean ecosystem (Rhône River prodelta, Gulf of Lions, France): Origins and diagenesis

Author: Gilles Vétion, Christophe Rabouille, Roselyne Buscail, Audrey M. Pruski, Solveig Bourgeois, Jennifer Coston-Guarini, Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques (LECOB), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Océan et Interfaces (OCEANIS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Fatty acid degradation, 01 natural sciences, Sedimentary depositional environment, chemistry.chemical_compound, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Geochemistry and Petrology, [SDU.STU.GC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geochemistry, Redox condition, Rhône River, Mediterranean Sea, Organic matter, 14. Life underwater, Early diagenesis, 0105 earth and related environmental sciences, chemistry.chemical_classification, Total organic carbon, 010604 marine biology & hydrobiology, Fatty acid, Sediment, Biogeochemistry, 15. Life on land, Ocean margin, 6. Clean water, Diagenesis, Oceanography, chemistry, 13. Climate action, Lipid biogeochemistry, Geology, Fatty acid biomarkers
Abstract: International audience; Major rivers transfer high loads of continental particulate organic matter to deltaic environments, where the impact on the biogeochemistry and productivity of coastal sediments depends on the sources and lability of these inputs. Our aims are to provide new insights into the reactivity of riverine inputs in coastal environments and to delineate the parameters controlling their fate in these dynamic systems. Sediment cores were collected from a Mediterranean deltaic system (the Rhône prodelta and its adjacent shelf) during a period of moderate river discharge (Spring 2007) and analyzed for their fatty acid composition. Sediment properties were also described using biochemical bulk analyses (organic carbon and lipids), granulometry and profiles of redox potential. Based on the bulk compositional changes and hierarchical clustering of the fatty acid biomarkers, we determined the principal sources of organic matter and their spatial distribution. Fatty acids were primarily of continental origin in the prodelta, shifting to a higher contribution from marine sources in the shelf area. Fatty acids derived from both continental and marine sources were efficiently degraded in the sediments by microbial decay processes in the upper oxic layer. Degradation rate constants calculated from the down-core decreases in concentrations indicate that fatty acid degradation was enhanced in sediments influenced by the Rhône River. The most important parameters affecting fatty acid preservation were the inherent stability of individual molecular components and their physical association with mineral matrices, the source and freshness of the inputs, and the depositional environment (redox condition, accumulation rates).
Published: 2015
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27. Comments on 'Middle to Late Holocene Paleoclimatic Change and the Early Bantu Expansion in the Rain Forests of Western Central Africa'

Author: Giresse, Pierre, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Savoyat, Olivier
Subjects: [SDU.STU] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2015

28. Archives sédimentaires lacustres des changements environnementaux et des activités humaines au cours des derniers 5000 ans

Author: Chapron, Emmanuel, Simonneau, A., Tachikawa, K., Courp, T., Garcia, M., Perdereau, L., Desmet, M., Bard, E., Géographie de l'environnement (GEODE), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Collège de France - Chaire Evolution du climat et de l'océan, Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-11-LABX-0010,DRIIHM / IRDHEI,Dispositif de recherche interdisciplinaire sur les Interactions Hommes-Milieux(2011), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chaire Evolution du climat et de l'océan, and Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Subjects: OHM Pyrenees, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2014

29. Spatiotemporal changes in surface sediment characteristics and benthic macrofauna composition off the Rhône River in relation to its hydrological regime

Author: Céline Labrune, Bruno Deflandre, Martin Desmalades, Solveig Bourgeois, Jean Michel Amouroux, Gilles Vétion, Paulo Bonifácio, Roselyne Buscail, Béatrice Rivière, François Lantoine, Alicia Romero-Ramirez, Karine Escoubeyrou, Antoine Grémare, Sabrina Bichon, Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques (LECOB), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 5805 Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École pratique des hautes études (EPHE), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Subjects: 0106 biological sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Water flow, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Aquatic Science, Oceanography, 01 natural sciences, Mediterranean sea, Benthos, Rhône River, Mediterranean Sea, zoobenthos, 14. Life underwater, particulate organic matter, 0105 earth and related environmental sciences, Total organic carbon, Hydrology, 010604 marine biology & hydrobiology, temporal variations, Sediment, 15. Life on land, 13. Climate action, Granulometry, Benthic zone, floods, Environmental science, Sedimentary rock
Abstract: International audience; The consequences of changes in the water flow of the Rhône River on surface sediment characteristics and benthic macrofauna composition were assessed within 3 distinct areas: (1) the delta front, (2) the prodelta, and (3) the distal zone. Five stations were sampled during or closely after: (1) an oceanic flood (April 2007), (2) a generalized flood (May 2008), (3) a Cevenol flood (December 2008), and (4) a dry period (July 2011). Measurements of sediment characteristics included granulometry (D0.5), bulk descriptors of sedimentary organics (OC, TN and THAA), descriptors of labile components of sedimentary organics (chloropigments, EHAA), and both descriptors of origin (Chl-b/Chl-a, C/N) and lability (Chl-a/(Chl-a+Phaeo-a), EHAA/THAA) of sedimentary organics. Sediment Profile Images were collected during April 2007, May 2008 and July 2011. Temporal changes in both sedimentary organics and benthic macrofauna were more important in the delta front and the prodelta than in the distal zone. Bulk characteristics of sedimentary organics presented decreasing inshore/offshore gradients during both April 2007 and July 2011 but not during May and December 2008. There were significant temporal changes in EHAA/THAA at all stations. Changes in benthic macrofauna composition differed between: (1) the delta front and the prodelta, and (2) the distal zone. In the former area, the dry period was associated with establishing a mature community characterized by high abundances and species richness. The best description of spatiotemporal changes in benthic macrofauna composition by surface sediment characteristics was obtained using D0.5, Chl-b/Chl-a, Chl-a/(Chl-a+Phaeo-a) and EHAA, which supports the role of the quality of sedimentary organics in controlling benthic macrofauna composition.
Published: 2014
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30. Particle size distribution and estimated carbon flux across the Arabian Sea oxygen minimum zone

Author: Lionel Guidi, Léo Berline, Stephane Pesant, X. Durrieu de Madron, Antoine Sciandra, F. Roullier, Marc Picheral, Lars Stemmann, Ecologie Marine et BIOdiversité (EMBIO), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), The publication of this article is financed by CNRS-INSU, TARA, and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)
Subjects: 0106 biological sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Oxygen Minimum Zone, Nepheloid layer, lcsh:Life, Flux, Oxygen minimum zone, 01 natural sciences, Zooplankton, Deep sea, Life, lcsh:QH540-549.5, QH501-531, 14. Life underwater, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, QH540-549.5, 0105 earth and related environmental sciences, Earth-Surface Processes, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, QE1-996.5, Detritus, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, Arabian Sea, lcsh:QE1-996.5, Geology, Particulates, lcsh:Geology, lcsh:QH501-531, Oceanography, Particles, 13. Climate action, Environmental science, lcsh:Ecology, Bloom
Abstract: The goal of the Arabian Sea section of the TARA oceans expedition was to study large particulate matter (LPM > 100 μm) distributions and possible impact of associated midwater biological processes on vertical carbon export through the oxygen minimum zone (OMZ) of this region. We propose that observed spatial patterns in LPM distribution resulted from the timing and location of surface phytoplankton bloom, lateral transport, microbial processes in the core of the OMZ, and enhanced biological processes mediated by bacteria and zooplankton at the lower oxycline. Indeed, satellite-derived net primary production maps showed that the northern stations of the transect were under the influence of a previous major bloom event while the most southern stations were in a more oligotrophic situation. Lagrangian simulations of particle transport showed that deep particles of the northern stations could originate from the surface bloom while the southern stations could be considered as driven by 1-D vertical processes. In the first 200 m of the OMZ core, minima in nitrate concentrations and the intermediate nepheloid layer (INL) coincided with high concentrations of 100 μm < LPM < 200 μm. These particles could correspond to colonies of bacteria or detritus produced by anaerobic microbial activity. However, the calculated carbon flux through this layer was not affected. Vertical profiles of carbon flux indicate low flux attenuation in the OMZ, with a Martin model b exponent value of 0.22. At three stations, the lower oxycline was associated to a deep nepheloid layer, an increase of calculated carbon flux and an increase in mesozooplankton abundance. Enhanced bacterial activity and zooplankton feeding in the deep OMZ is proposed as a mechanism for the observed deep particle aggregation. Estimated lower flux attenuation in the upper OMZ and re-aggregation at the lower oxycline suggest that OMZ may be regions of enhanced carbon flux to the deep sea relative to non OMZ regions.
Published: 2014
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31. Monitoring of Intense Events of Deep Water Formations in the Northwestern Mediterranean over the last five years

Author: Houpert, Loïc, Durrieu de Madron, Xavier, Testor, Pierre, Bosse, Anthony, Mortier, Laurent, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Variabilité de l'Océan et de la Glace de mer (VOG), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636))
Subjects: [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2014

32. Wave-driven circulation over a double nearshore bar system during storm conditions

Author: Nicolas Aleman, Edward J. Anthony, Frédéric Bouchette, Nicolas Robin, Samuel Meulé, Raphaël Certain, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géosciences Montpellier, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Risques (Géosciences Montpellier), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Surf zone, 01 natural sciences, 010305 fluids & plasmas, Undertow, Mediterranean sea, 0103 physical sciences, Current profile, 14. Life underwater, Transect, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Earth-Surface Processes, Water Science and Technology, Ecology, surf zone, SHORECIRC, Storm, ADCP, Current (stream), Longshore drift, Oceanography, Circulation (fluid dynamics), longshore current, Climatology, undertow, Geology
Abstract: Robin, N., Certain, R., Bouchette, F., Anthony, E.J., Meule, S., and Aleman, N., 2014. Wave-driven circulation over a double nearshore bar system during storm conditions. In: Green, A.N. and Cooper, J.A.G. (eds.), Proceedings 13th International Coastal Symposium (Durban, South Africa), Journal of Coastal Research, Special Issue No. 70, pp. 084–089, ISSN 0749-0208. Current profiles and waves were recorded from a multi-instrumented transect over a double nearshore bar system in the Gulf of Lions, NW Mediterranean Sea (France) during storm conditions with shoreface significant wave heights of up to 3.2 m. The results constitute a preliminary analysis aimed at constraining the 3D nearshore circulation in a microtidal system. Significant time changes in the vertical distribution of nearshore velocities were observed, forced by the wind/wave conditions. Such vertical changes have been highlighted by theoretical velocity profiles in the literature, but our study demonstrates much larger variability than...
Published: 2014
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33. Species or local environment, what determines the infection of rodents by Toxoplasma gondii?

Author: Régine Geers, Isabelle Villena, Emmanuelle Gilot-Fromont, Cécile Gotteland, Marie-Lazarine Poulle, Dominique Aubert, Maxime Galan, Yannick Chaval, Nathalie Charbonnel, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (LPM), IFR 53, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-CHU Maison Blanche-UPRES EA 2070, Centre de biologie et de gestion des populations, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche et de Formation en Eco-éthologie (2C2A-CERFE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Biodémographie évolutive, Département écologie évolutive [LBBE], Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Agence Française de Sécurité Sanitaire de l'Environnement et du Travail (AFSSET) / Agence de l'Environnement et de la Maitrise de l'Energie (ADEME) / Région Champagne-Ardenne, European Project: 261504,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2010-single-stage,EDENEXT(2011), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: Male, Risk, Rural Population, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030231 tropical medicine, Zoology, Antibodies, Protozoan, Toxoplasma gondii, Rodentia, rural area, Biology, Logistic regression, 030308 mycology & parasitology, Serology, Rodent Diseases, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Seroepidemiologic Studies, Direct agglutination test, Zoonoses, medicine, Seroprevalence, Animals, Humans, Demography, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Models, Statistical, commensal species, Risk of infection, landscape, medicine.disease, biology.organism_classification, Toxoplasmosis, Rats, Infectious Diseases, Toxoplasmosis, Animal, rodents, Immunology, Multivariate Analysis, Animal Science and Zoology, Parasitology, Female, France, ecology, Toxoplasma, local scale
Abstract: SUMMARYToxoplasmosis is largely present in rural areas but its spatial distribution in this environment remains poorly known. In particular, it is unclear if areas of high density of cats, the only hosts excreting Toxoplasma gondii, constitute foci of high prevalence. To improve our understanding of the spatial distribution of T. gondii in rural areas, we performed a serological survey in rodents from two villages in France. We trapped 710 rodents including commensal rats and meadow or forest voles and mice. The presence of T. gondii was examined using PCR, mice inoculation and modified agglutination test for antibodies (MAT). We conducted multivariate and discriminant analyses to identify biological, ecological or spatial variables that could explain T. gondii serology in rodents. We then used a logistic regression to assess the relative influence of each explanatory variable. Overall seroprevalence was 4·1%. Commensal-rats were more infected (12·5%) than non-commensal species (3·7%). However, the major determinant of the risk of infection was the distance to the nearest farm (OR = 0·75 for 100 m), which explained the risk in all species or non-commensal species only. We contrast the role of species characteristics and that of the local environment, and discuss the risk of environmental contamination for humans.
Published: 2014
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34. Silver European eels health in Mediterranean habitats

Author: Gaël Simon, Elisabeth Faliex, Henri Farrugio, Marc Manetti, Séverine Paris, Pierre Sasal, Elsa Amilhat, Raymonde Lecomte-Finiger, Laurence Delahaut, Géraldine Fazio, Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche Interactions Animal-Environnement - EA 4689 (IAE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), IFREMER Laboratoire Ressources Halieutiques (IFREMER Laboratoire Ressources Halieutiques), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), and Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, Pollution, Mediterranean climate, endocrine system, animal structures, Anguillicoloides crassus, media_common.quotation_subject, Mediterranean lagoons, Population, Context (language use), 010501 environmental sciences, Aquatic Science, 01 natural sciences, contamination, Swim bladder, 14. Life underwater, silver eel, education, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 0105 earth and related environmental sciences, media_common, education.field_of_study, Ecology, biology, Anguilla anguilla, 010604 marine biology & hydrobiology, pathogens, Silver eel, biology.organism_classification, spawner quality, Habitat, 13. Climate action, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; The degradation in the quality of silver eel and their health could have been a major factor in the collapse of the European eel (Anguilla anguilla) population. However, the health status of the spawners has been poorly studied until now. This study evaluated the quality of migrant male silver eels from four Mediterranean habitats in France presenting different degrees of contamination: Canet-Saint-Nazaire, Salses-Leucate and Bages-Sigean lagoons and La Berre River. We considered pathogens including Anguillicoloides crassus and EVEX virus and the concentration of chemical contaminants including PCBs, OCs and heavy metals. Our study results revealed different patterns of pollution and infection in the four habitats, with high individual variability. No single silver eel was free of pollution. Total dichloro-diphenyl-trichloroethane (DDT) and copper contaminations, as well as the Swim bladder Degenerative Index (induced by parasitism), were remarkably high in eels from Canet lagoon, while eels from Salses lagoon showed lower levels of contaminants and parasite infection. A non-negligible proportion of eels were strongly impacted with levels of contaminants/parasites that could potentially impair their migration and reproduction. Our study revealed low to moderate contamination levels compared with the other Mediterranean sites previously reported, except for high concentrations of DDTs and Cu in Canet lagoon. We discuss the contribution of these results in the context of possible implications for silver eels reproductive success and local eel population management.
Published: 2014
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35. Increase in soil erosion after agricultural intensification: evidence from a lowland basin in France

Author: Thierry Courp, Olivier Evrard, Emmanuel Chapron, Sébastien Salvador-Blanes, Hans Adriaensen, François Lecompte, Marc Desmet, Irène Lefèvre, Anthony Foucher, Anaëlle Simonneau, Olivier Cerdan, GéoHydrosystèmes COntinentaux (GéHCO EA6293), Université de Tours (UT), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Géochimie Des Impacts (GEDI), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - UMR7327 (ISTO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Géographie de l'environnement (GEODE), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Plateforme CIRE, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agence de l’Eau Loire Bretagne (Loire-Brittany Water Agency), AELB, Université de Tours, Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: land use change, Drainage basin, agricultural catchment, lowland, Structural basin, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, Panoply, Earth and Planetary Sciences (miscellaneous), Temperate climate, Dominance (ecology), [SDU.STU.GM]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geomorphology, [SDU.STU.HY]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, pond sediments, Hydrology, Global and Planetary Change, geography, geography.geographical_feature_category, Ecology, Terrigenous sediment, sediment yields, 15. Life on land, Erosion, Environmental science, Sedimentary rock, Eutrophication
Abstract: International audience; Changes in agricultural practices impact sediment transfer in catchments and rivers. Long term archives of sediment deposits in agricultural plains of northwestern Europe are rarely available, however, for reconstructing and quantifying erosion and sedimentation rates for the second half of the 20th century. In this context, a multi-parameter analysis was conducted on sedimentary deposits accumulated in a pond created in the 11th century and draining a 24 km2 cultivated catchment in western France. This catchment is representative of cultivated and drained lowland environments where agriculture has intensified during the last 60 years.High resolution seismic profiles and surface sediment samples (n = 74) were used to guide the collection of cores (n = 3) representative of the sequence of sediment accumulated in the pond. The cores were analysed to quantify and characterize the evolution of sediment dynamics in the pond.The first land consolidation period (1954-1960) was characterized by a dominance of allochtonous material input to the pond. This input represents an erosion of 1900 to 2300 t.km−2.yr−1 originating from the catchment. Then, between 1970-1990, the terrigenous input decreased progressively and tended to stabilize. Eutrophication and associated primary production increased in the pond. These processes generated the majority of material accumulated in the pond during this period. Further land consolidation programs conducted in 1992 generated a new increase in soil erosion and sediment input to the reservoir. For the last 10 years, terrigenous input to the pond corresponds to a catchment-wide erosion rate between 90 and 102 t.km−2.yr−1. While a strong decrease is observed, it still represents a 60-fold increase of the sediment flux compared to the pre-intensification period. These large temporal variations of sedimentation rates over a few decades underline the dynamics of sediment transfer and raise questions about the sustainability of soil resources in lowland temperate environments.
Published: 2014
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36. Composition and distribution of dissolved carbohydrates in the Beaufort Sea Mackenzie Margin (Arctic Ocean)

Author: Bruno Charrière, Christos Panagiotopoulos, Richard Sempéré, Violaine Jacq, CE, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biogéochimie-Traceurs-Paléoclimat (BTP), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MALINA, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636))
Subjects: Beaufort Sea, ved/biology, ved/biology.organism_classification_rank.species, Distribution and origins of carbohydrates, General Chemistry, Beaufort sea, Structural basin, Oceanography, Mackenzie River margin, Arctic, Dissolved organic carbon (DOC), 13. Climate action, Abundance (ecology), Dissolved carbohydrates (TDCHO), Dissolved organic carbon, Terrestrial plant, Environmental Chemistry, Composition (visual arts), 14. Life underwater, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other, Relative species abundance, Geology, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, Water Science and Technology
Abstract: International audience; The sugar composition (TDCHO) of dissolved organic matter (DOM) was studied in the Mackenzie margin (Southeast Beaufort Sea) in summer 2009 as a part of the MALINA project. Sampling was performed in shelf (bottom depth ≤100 m), slope (100 m < bottom depth ≤1000 m), and basin (bottom depth > 1000 m) areas of the Mackenzie margin. Our results showed that sugar concentrations did not follow dissolved organic carbon (DOC) patterns, which decreased from shelf to basin stations (from 115 to 65 µM), but instead remained rather constant (965-900 nM), indicating an accumulation of sugars in surface waters (0-80 m). TDCHO concentrations exhibited their highest values (> 1000 nM) and higher relative abundance to DOC in the central sector of the studied area, especially in the zone between 130-135°W indicating differences in their distribution in the broader area and possible various sources. TDCHO represented 6 ± 2% and 8 ± 3% of DOC (TDCHO-C/DOC) for shelf and basin stations, respectively. Based on values of bacterial carbon demand and glucosidase activities, it was estimated that ~4% of DOC was available as carbohydrate for bacterial utilization within the basin area, whereas the value drops to
Published: 2014
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37. A Michaelis–Menten type equation for describing methylmercury dependence on inorganic mercury in aquatic sediments

Author: Cederic Garnier, Nevenka Mikac, Erwan Tessier, Charles Gobeil, Daniel Cossa, Françoise Elbaz-Poulichet, Nathalie Patel-Sorrentino, Roselyne Buscail, Sylvain Rigaud, Véronique Lenoble, Institut des Sciences de la Terre (ISTerre), Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-PRES Université de Grenoble-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Processus de Transfert et d'Echanges dans l'Environnement - EA 3819 (PROTEE), Université de Toulon (UTLN), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Center for marine and Environmental Research, 'Ruđer Bošković' Institute, Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre Eau Terre Environnement - INRS (INRS-ETE), Institut National de la Recherche Scientifique [Québec] (INRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-PRES Université de Grenoble-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Rudjer Boskovic Institute [Zagreb], Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre Eau Terre Environnement [Québec] (INRS - ETE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Biomagnification, chemistry.chemical_element, Michaelis–Menten kinetics, Methylation, chemistry.chemical_compound, [SDU.STU.GC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geochemistry, Environmental Chemistry, Organic matter, 14. Life underwater, Methylmercury, Earth-Surface Processes, Water Science and Technology, Demethylation, chemistry.chemical_classification, Lability, Ecology, Mercury, Anoxic waters, Mercury (element), chemistry, 13. Climate action, Aquatic sediment, Environmental chemistry, mercury, methylmercury, aquatic sediment, methylation, demethylation, [SDE]Environmental Sciences
Abstract: International audience; Methylation of mercury (Hg) is the crucial process that controls Hg biomagnification along the aquatic food chains. Aquatic sediments are of particular interest because they constitute an essential reservoir where inorganic divalent Hg (HgII) is methylated. Methylmercury (MeHg) concentrations in sediments mainly result from the balance between methylation and demethylation reactions, two opposite natural processes primarily mediated by aquatic microorganisms. Thus, Hg availability and the activity of methylating microbial communities control the MeHg abundance in sediments. Consistently, some studies have reported a significant positive correlation between MeHg and HgII or total Hg (HgT), taken as a proxy for HgII, in aquatic sediments using enzyme-catalyzed methylation/demethylation mechanisms. By compiling 1,442 published and unpublished HgT–MeHg couples from lacustrine, riverine, estuarine and marine sediments covering various environmental conditions, from deep pristine abyssal to heavily contaminated riverine sediments, we show that a Michaelis–Menten type relationship is an appropriate model to relate the two parameters: MeHg = aHgT/(K m + HgT), with a = 0.277 ± 0.011 and K m = 188 ± 15 (R 2 = 0.70, p < 0.001). From K m variations, which depend on the various encountered environmental conditions, it appears that MeHg formation and accumulation are favoured in marine sediments compared to freshwater ones, and under oxic/suboxic conditions compared to anoxic ones, with redox potential and organic matter lability being the governing factors.
Published: 2014
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38. Historical evolution and extreme climate events during the last 400years on the Rhone prodelta (NW Mediterranean)

Author: M. Arnaud, Christophe Fontanier, Alessandra Negri, Roselyne Buscail, Aurélie Goineau, Anne-Sophie Fanget, Gwenael Jouet, Daniel Cossa, Grégoire M. Maillet, Serge Berné, Bernard Dennielou, Maria-Angela Bassetti, Jean-Francois Chiffoleau, Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire de Planétologie et Géodynamique [UMR 6112] (LPG), Université d'Angers (UA)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche Géosciences Marines (Ifremer) (GM), Dipartimento di Scienze del Mare, Università Politecnica delle Marche [Ancona] (UNIVPM), and Agence Nationale de la Recherche, ANR ANR-06-VULN-005
Subjects: Delta, 010504 meteorology & atmospheric sciences, biology, Sediment, Geology, 15. Life on land, 010502 geochemistry & geophysics, Oceanography, biology.organism_classification, 01 natural sciences, Foraminifera, Paleontology, Mediterranean sea, 13. Climate action, Geochemistry and Petrology, Benthic zone, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Streamflow, Littoral zone, Sedimentary rock, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: International audience; The Rhone River is the most important source of freshwater and sediment to the western Mediterranean Sea. Deltaic lobes and littoral prisms compose the sedimentary units that make up the whole "Rhone subaqueous delta", which reaches up to 50m in thickness. Individual lobes, that accompanied the retreat of the Rhone during sea-level rise, and the subsequent westward then eastward shift of the main outlet, display averaged sedimentation rates in excess of 1cmyr-1, containing both continental and marine material. During the industrial period, most of the river flow was delivered through the Pégoulier and Roustan distributary channels, which evolved under human influence. Within the prodeltas associated to these distributaries, very expanded sedimentation rates (andgt;10cmyr-1), allow the documentation of historical extreme climate events.A 7.71. m long piston core (RHS-KS57) was retrieved from the distal prodelta (79. m water depth). A multi-proxy study was carried out, using microfossil assemblages (ostracods, benthic foraminifera and coccoliths) in combination with sedimentological and geochemical proxies. Our results show that (1) Four different intervals (I-IV, spanning a time-range comprised between ~. 1600. AD and Present-day) have been differentiated from this multi-proxy analysis. They correspond to a different position of distributary channels. Each interval correlates with the different phases of channel avulsion, induced by climate events or by human activity. (2) The signature of extreme floods, that can be identified by the punctuated occurrence of freshwater (continental) ostracods (e.g. Candona spp., Ilyocypris sp.) correlating with increases in grain-size and/or organic carbon content. They correspond to decadal-scale increased runoffs reported in historical archives. Our study demonstrates the relevance of benthic microfossil studies for reconstructing paleoenvironmental changes in transitional (marine/continental) settings. © 2012 Elsevier B.V.
Published: 2013
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39. Origin and fate of copper in a small Mediterranean vineyard catchment: New insights from combined chemical extraction and δ65Cu isotopic composition

Author: D. El Azzi, Jérôme Viers, Jean-Luc Probst, Dominique Aubert, Anne Probst, Maritxu Guiresse, Katell Guizien, J. Caparros, François Charles, Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut de Recherche pour le Développement - IRD (FRANCE), Université Pierre et Marie Curie, Paris 6 - UPMC (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Université de Perpignan Via Domitia - UPVD (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), Géosciences Environnement Toulouse (GET), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques (LECOB), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Environmental Engineering, chemistry.chemical_element, 010501 environmental sciences, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, 010502 geochemistry & geophysics, Ecotoxicologie, 01 natural sciences, River sediments, Soil, Non-residual fractions, Isotopes, Environmental Chemistry, Organic matter, Vitis, Waste Management and Disposal, 0105 earth and related environmental sciences, chemistry.chemical_classification, geography, geography.geographical_feature_category, Bedrock, Science des sols, Agriculture, 15. Life on land, Particulates, Pollution, Copper, 6. Clean water, Leaching model, Fungicides, Industrial, chemistry, Environmental chemistry, Soil water, Storm runoff, Soils, France, [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology, Cu isotopes, Surface runoff, Surface water, Suspended matter, Geology
Abstract: International audience; For centuries, many Mediterranean catchments were covered with vineyards in which copper was widely applied to protect grapevines against fungus. In the Mediterranean-type flow regime, brief and intense flood events increase the stream water discharge by up to 10 times and cause soil leaching and storm runoff. Because vineyards are primarily cultivated on steep slopes, high Cu fluxes are discharged by surface water runoff into the rivers. The purpose of this work was to investigate the riverine behavior and transport of anthropogenic Cu by coupling a sequential chemical extraction (SCE) procedure, used to determine Cu partitioning between residual and non-residual fractions, with δ65Cu isotopic measurements in each fraction. In the Baillaury catchment, France, we sampled soils (cultivated and abandoned), river bed sediments (BS), suspended particulate matter (SPM), and river water during the flash flood event of February 2009. Copper partitioning using SCE show that most of Cu in abandoned vineyard soil was in the residual phase (>60%) whereas in cultivated soil, BS and SPM, Cu was mostly (>25%) in non-residual fractions, mainly adsorbed onto iron oxide fractions. A small fraction of Cu was associated with organic matter (5 to 10%). Calculated enrichment factors (EF) are higher than 2 and the anthropogenic contribution was estimated between 50 to 85%. Values for δ65Cu in bulk samples were similar to bedrock therefore; δ65Cu on SCE fractions of superficial soils and SPM allowed for discrimination between Cu origin and distribution. Copper in residual fractions was of natural mineral origin (δ65Cu close to local bedrock, +0.07‰). Copper in water soluble fraction of SPM (δ65Cu = +0.26‰) was similar to dissolved river Cu (δ65Cu = +0.31‰). Copper from fungicide treatment (δ65Cu = −0.35‰) was bound to organic matter (δ65Cu = −0.20‰) without or with slight isotopic fractioning. A preferential adsorption of 65Cu onto iron oxides (δ65Cu = +0.5‰) is shown.
Published: 2013
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40. Diatom fluxes in the NW Mediterranean: evidence from a 12-year sediment trap record and surficial sediments

Author: María Angeles Bárcena, K J Sebastian Meier, Serge Heussner, Francisco Javier Sierro, Luc Beaufort, José A. Flores, Richard W. Jordan, Andrés S. Rigual-Hernández, Dpt Biological Sciences, Macquarie University, Macquarie University, Department of Earth and Environmental Sciences [Yamagata], Yamagata University, University of Salamanca, Centro de Investigación en Reproduccion Caprina, Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro (UAAAN), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidad de Salamanca, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: 0106 biological sciences, Mediterranean climate, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Ecology, biology, 010604 marine biology & hydrobiology, Wind stress, Sediment, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Sediment trap (geology), Aquatic Science, biology.organism_classification, 01 natural sciences, Coccolith, Oceanography, Water column, Diatom, Flux (metallurgy), 13. Climate action, 14. Life underwater, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Geology, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: International audience; We examined the total diatom flux and species composition, total coccolith flux and total mass flux collected with a sediment trap between October 1993 and January 2006 in the northeastern entrance of the Gulf of Lions (North Western Mediterranean). The average daily diatom and coccolith fluxes (3 x 10(7) valves m(2) d(1) and 6.1 x 10(8) coccoliths m(2) day(-1), respectively) are comparable in magnitude with previously reported data sets in other high productivity areas of the Western Mediterranean. The temporal particle flux pattern reflected the variations in surface oceanographic conditions and primary productivity, which showed strong annual cycling. Highest diatom, coccolith and total mass fluxes always occurred during the winter-spring transition, while minima were observed during summer. Changes in the diverse diatom communities reflected the water column conditions throughout the record. The intensity of the diatom winter-spring blooms seemed to be enhanced in those years with intense and cold winds during winter, whereas years with low winter wind stress were liable to be less productive for diatoms. Coccolith fluxes exhibited a more stable interannual pattern than diatom fluxes. Significant discrepancies were found between the sediment trap and surficial sediment diatom assemblages.
Published: 2013
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41. 3D hydrodynamic modelling of a microtidal barred beach (Sète, NW Mediterranean Sea) during storm conditions

Author: Michaud, Heloise, Robin, Nicolas, Estounel, C., Marsaleix, Patrick, Leredde, Yann, Certain, R., Bouchette, Frederic, Risques (Géosciences Montpellier), Géosciences Montpellier, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD), Laboratoire d'aérologie (LAERO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 3d model, waves, measurements, current, hydrodynamic
Abstract: The field campaign on the Sète coast deployed during the winter 2009 was used to understand the hydrodynamics on a double barred beach in the surf zone during storm periods. The large set of measurements collected at several position and depth were also useful to improve the 3D circulation model Symphonie that takes into account the atmospherics and wave forcings. Once implemented on the beach and supplemented with some additional parameterizations concerning the roller effects and the bottom friction, the model was tuned and validated in the surf zone. The role of the different processes was then analysed. Thus, the roller and the bottom friction are of primary importance in the dynamics of the circulation. Thanks to its 3D nature and once associated with a sediment transport model and a morphodynamic model, Symphonie will offer a good representation of the sediment transport.
Published: 2013

42. Individual and combined effects of copper and parasitism on osmoregulation in the European eel Anguilla anguilla

Author: Catherine Lorin-Nebel, Evelyse Grousset, Sylvie Biagianti, Elsa Amilhat, Gaël Simon, Eva Blondeau-Bidet, Vincent Felten, Guy Charmantier, Ecologie des systèmes marins côtiers (Ecosym), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux (LIEC), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche Interactions Animal-Environnement - EA 4689 (IAE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université Montpellier 1 (UM1)
Subjects: Gill, Gills, Health, Toxicology and Mutagenesis, Osmolality, medicine.disease_cause, Random Allocation, heterocyclic compounds, 0303 health sciences, biology, Anguilla anguilla, Ecology, 04 agricultural and veterinary sciences, Water-Electrolyte Balance, Dracunculoidea, Blood, [SDE]Environmental Sciences, Osmoregulation, France, [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology, endocrine system, animal structures, Anguillicoloides crassus, chemistry.chemical_element, Parasitism, Zoology, Aquatic Science, Osmometry, 03 medical and health sciences, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Osmotic Pressure, Infestation, medicine, Animals, 14. Life underwater, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, 030304 developmental biology, Environmental Exposure, biology.organism_classification, Anguilla, Copper, Salinity, Nematode, chemistry, 13. Climate action, Ionic concentrations, 040102 fisheries, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Na+/K+-ATPase activity, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Water Pollutants, Chemical, [SDV.EE.IEO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis
Abstract: International audience; The European eel (Anguilla anguilla), a catadromous species, breeds in the sea and migrates to estuarine, lagoon or freshwater habitats for growth and development. Yellow eels, exposed to low or fluctuating salinities, are also exposed to multiple other stressors as pollution, over-fishing and parasitism, which contribute to the dramatic decrease of eel populations in several European countries. The objective of this study was to evaluate the single and combined effects of waterborne copper and experimental infestation of eels with the nematode Anguillicoloides crassus after a salinity challenge from nearly isotonic (18 ppt) to hypo- (5 ppt) and hypertonic (29 ppt) conditions, in order to investigate the osmoregulatory capacity of eels exposed to these stressors. In a nearly isotonic condition (18 ppt), blood osmolality remained constant over the 6 weeks contamination to Cu2+ and Anguillicoloides crassus. In fish exposed to a salinity challenge of 29 ppt for 2 weeks, no significant effect was recorded in blood osmolality, Na+/K+-ATPase (NKA) activity, Na+ and Cl− concentrations. After 2 weeks at 5 ppt however, a significant blood osmolality decrease was detected in fish exposed to Anguillicoloides crassus infestation with or without Cu2+ addition. This decrease may originate from lower Cl− levels measured in eels exposed to both stressors. Blood Na+ levels remained relatively stable in all tested animals, but gill NKA activities were lower in eels exposed to combined stress. No apparent branchial lesions were detected following the different treatments and immunolocalization of NKA revealed well-differentiated ionocytes. Thus, the 5 ppt challenge in eels exposed to copper and Anguillicoloides crassus seems to clearly enhance iono/osmoregulatory disturbances. Funded by ANR CES/CIEL 2008–12.
Published: 2013
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43. Survey of submesoscale structures at the margin of the Northern Current in the North Western Mediterranean Sea using Gliders: observations and diagnostics

Author: Bosse, Anthony, Testor, Pierre, Mortier, Laurent, Béguery, Laurent, Bernardet, Karim, Taillandier, Vincent, D'Ortenzio, Fabrizio, Prieur, Louis, Coppola, Laurent, Bourrin, François, Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Division technique INSU/SDU (DTI), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Division Technique de l'INSU (DT INSU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Subjects: [SDU.STU.GP]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph]
Abstract: International audience; From 2008 on, repeated sections crossing the Northern Current (NC) were operated by gliders as part of a global observing system (MOOSE project) of the North Western Mediterranean Sea. This work is dedicated to the analysis of the submesoscale thermohaline variability at the margin of this current observed by gliders. The mean circulation of the basin is characterized by a cyclonic gyre (whose Northern part is the so-called NC) associated with a doming of the isopycnals preconditionning the whole interior basin to great vertical mixing. The thermal and haline differences between the Atlantic Water (AW) transported by the NC and older and modified AW off the coast leads to a frontal structure. Especially in winter, when the mixed layer depth used to reach several hundreds of meters offshore, isopycnal outcropping and the role of frontal processes are enhanced leading to intense variability at scales smaller than the deformation radius. Based on diagnostics using the Potential Vorticity (PV) computed from the glider data assuming quasi-geostrophic conditions and no variation in the alongshore direction, we discuss the dynamical processes at work, with a focus on 2 typical examples: (1) the first example takes place in winter during a strong vertical mixing event. While the glider crossed the frontal region, the temperature and salinity fields exhibit vertical motions at depths about 0-400m. Frontogenesis might be at play through mesoscale strain since the glider shows an intense mesoscale activity but a weak stratification and enhanced horizontal buoyancy gradient actually make the Ertel PV reach negative values and symmetric instability is likely to be a prominent mechanism explaining the observed variability. (2) the second example takes place in spring. We identify an episode of down-front wind blowing during the glider deployment which could have extracted PV from the surface layer. However, the geostrophic turbulence is in that case likely to play a key role in the formation of the observed variability of the temperature and salinity since it is organized along slopes characterized by an aspect ratio of an order of f/N.
Published: 2013

44. Modelling the interannual variability (1979-2012) of the Mediterranean open-sea deep convection using a coupled regional climate system model

Author: Somot, Samuel, Testor, Pierre, Durrieu de Madron, Xavier, Houpert, Loïc, Herrmann, Marine, Dubois, Clotilde, Sevault, Florence, Groupe d'étude de l'atmosphère météorologique (CNRM-GAME), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Météo France-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre national de recherches météorologiques (CNRM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDU.STU.GP]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph]
Abstract: International audience; The North-Western Mediterranean Sea is known as one of the only place in the world where open-sea deep convection occurs (often up to more than 2000m) with the formation of the Western Mediterranean Deep Water (WMDW). This phenomena is mostly driven by local preconditioning of the water column and strong buoyancy losses during Winter. At the event scale, the WMDW formation is characterized by different phases (preconditioning, strong mixing, restratification and spreading), intense air-sea interaction and strong meso-scale activity but, on a longer time scale, it also shows a large interannual variability and may be strongly affected by climate change with impact on the regional biogeochemistry. Therefore simulating and understanding the temporal variability of the North-Western Mediterranean open-sea deep convection is considered as quite a challenging task for the ocean and climate modelling community. Achieving such a goal requires to work with high resolution models for the ocean and the atmosphere interacting freely and to run long-term and temporally homogeneous simulations with a realistic chronology. In agreement with this statement, we developed at Meteo-France / CNRM a Mediterranean Regional Climate System Model (RCSM) that includes high-resolution representation of the regional atmosphere, land surface, rivers and ocean. The various components are respectively ALADIN (50 km), ISBA (50 km), TRIP (50 km) and NEMO-MED8 (10 km). All the components are interactively coupled daily and a simulation over the period 1979-2012 has been performed using the atmosphere ERA-Interim reanalysis and the ocean NEMOVAR1° reanalysis as 3D lateral-boundary conditions. Spectral nudging technique is applied in the atmosphere. We first evaluate the ability of this model to simulate some of the observed WMDW formation events (air-sea flux, timing, water mass characteristics, deep water formation rate) thanks to the large observational efforts recently carried out to better document this phenomena (programmes HyMeX, MERMEX, MOOSE). We then analyze the interannual variability of this open-sea deep convection comparing the relative role of the water column preconditioning and of the winter buoyancy loss.
Published: 2013

45. New insights of the Northern Current in the Western Mediterranean Sea from Gliders data: Mean structure, Transport, and Seasonal Variability

Author: Bosse, Anthony, Testor, Pierre, Mortier, Laurent, Béguery, Laurent, Bernardet, Karim, Taillandier, Vincent, D'Ortenzio, Fabrizio, Prieur, Louis, Coppola, Laurent, Bourrin, François, Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Division technique INSU/SDU (DTI), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Division Technique de l'INSU (DT INSU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Subjects: [SDU.STU.GP]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph]
Abstract: International audience; In the last 5 years, an unprecedented effort in the sampling of the Northern Current (NC) has been carried out using gliders which collected more than 50 000 profiles down to 1000m maximum along a few repeated sections perpendicular to the French coast. Based on this dataset, this study presents a very first quantitative picture of the NC on 0-1000m depth. We show its mean structure of temperature and salinity characterized by the different Water Masses of the basin (Atlantic Water, Winter Intermediate Water, Levantine Intermediate Water and Western Mediterranean Deep Water) for each season and at different location. Geostrophic currents are derived from the integration of the thermal-wind balance using the mean glider-estimate of the current during each dive as a reference. Estimates of the heat, salt, and volume transport are then computed in order to draw an heat and salt budget of the NC. The results show a strong seasonal variability due to the intense surface buoyancy loss in winter resulting in a vertical mixing offshore that makes the mixed layer depth reaching several hundreds of meters in the whole basin and in a very particular area down to the bottom of the sea-floor (deep convection area). The horizontal density gradient intensifies in winter leading to geostrophic currents that are more intense and more confined to the continental slope, and thus to the enhancement of the mesoscale activity (meandering, formation of eddies through baroclinic instability...). The mean transport estimates of the NC is found to be about 2-3Sv greater than previous spurious estimates. The heat budget of the NC also provides an estimate of the mean across shore heat/salt flux directly impacting the region in the Gulf of Lion where deep ocean convection, a key process in the thermohaline circulation of the Mediterranean Sea, can occur in Winter.
Published: 2013

46. Characteristics of Geostrophic Eddies in the North Western Mediterranean as observed by Gliders and simulated by a high-resolution Model: formation, behaviour and dissipation

Author: Bosse, Anthony, Testor, Pierre, Mortier, Laurent, Damien, Pierre, Estournel, Claude, Marsaleix, Patrick, Béguery, Laurent, Bernardet, Karim, Taillandier, Vincent, D'Ortenzio, Fabrizio, Prieur, Louis, Coppola, Laurent, Bourrin, François, Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'aérologie (LAERO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Division Technique de l'INSU (DT INSU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Division technique INSU/SDU (DTI), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDU.STU.GP]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph]
Abstract: International audience; Since 2008, gliders repeated transects crossing the basin of the North Western Mediterranean Sea and regularly sampled mesoscale structures with an high horizontal resolution of about 2-3 km between each profile required in that region of small internal deformation radius (
Published: 2013

47. Interaction of dense dense shelf water cascading and open-sea convection in the Northwestern Mediterranean during winter 2012

Author: Durrieu de Madron, Xavier, Houpert, Loïc, Puig, Pere, Sanchez-Vidal, Anna, Testor, Pierre, Bosse, Anthony, Estournel, Claude, Somot, Samuel, Bourrin, François, Bouin, Marie-Noëlle, Calafat, Anthony, Canals, Miquel, Coppola, Laurent, D'Ortenzio, Fabrizio, Font, Jordi, Heussner, Serge, Martín, Jacobo, Mortier, Laurent, Palanques, Albert, Raimbault, Patrick, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'aérologie (LAERO), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre national de recherches météorologiques (CNRM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Marine Sciences / Institut de Ciències del Mar [Barcelona] (ICM), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Groupe d'étude de l'atmosphère météorologique (CNRM-GAME), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Météo France-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDU.STU.GP]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph]
Abstract: International audience; The winter of 2012 experienced peculiar atmospheric conditions that triggered a massive formation of dense water on the continental shelf and in the deep basin of the Gulf of Lions. Multi-platforms observations enabled, with an unprecedented resolution, a synoptic view of dense water formation and spreading at basin scale. Five months after its formation, the dense water of coastal origin created a distinct bottom layer up to few hundreds of meters thick over the central part of the NW Mediterranean basin, which was overlaid by a layer of newly formed deep water produced by open-sea convection. These observations highlight the role of intense episodes of both dense shelf water cascading and open-sea convection to the alteration of the characteristics of the NW Mediterranean deep waters.
Published: 2013

48. Bages-Sigean and Canet-St Nazaire lagoons (France): physico-chemical characteristics and contaminant concentrations (Cu, Cd, PCBs and PBDEs) as environmental quality of water and sediment

Author: Séverine Paris-Palacios, Florence Vouvé, Fabrice Alliot, Marion Desmousseaux, Pierre Labadie, Elsa Amilhat, Sylvie Biagianti-Risbourg, Roselyne Buscail, Elisabeth Faliex, Christophe Canal, Dominique Aubert, Marc Chevreuil, Institut de Modélisation et d'Analyses en géo-environnement et santé - Espace Développement (IMAGES-Espace DEV), UMR 228 Espace-Dev, Espace pour le développement, Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM), Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Milieux Environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols (METIS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 5805 Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR CIEL CESA [00501 2008], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), and Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Subjects: Mediterranean climate, Pollution, Geologic Sediments, PBDEs, Mediterranean lagoons, Health, Toxicology and Mutagenesis, media_common.quotation_subject, Cd, [SDU.STU.GC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geochemistry, Water Quality, Dissolved organic carbon, Halogenated Diphenyl Ethers, Environmental Chemistry, Ecotoxicology, Organic matter, Seawater, PCBs, 14. Life underwater, Cu, media_common, Environmental quality, Total organic carbon, chemistry.chemical_classification, Water, Sediment, General Medicine, Polychlorinated Biphenyls, 6. Clean water, Salinity, chemistry, 13. Climate action, Environmental chemistry, [SDE]Environmental Sciences, Environmental science, France, Copper, Water Pollutants, Chemical, Cadmium, Environmental Monitoring
Abstract: International audience; Environmental characteristics in water and sediments of two contrasted coastal Mediterranean lagoons, Bages-Sigean and Canet-St Nazaire, were measured over a three season survey. The urban pollution (treatment plant discharges) is very important in Canet-St Nazaire lagoon reflecting untreated sewages, while in Bages-Sigean, the northern part appears more impacted due to larger anthropogenic inputs. Dissolved Cd concentrations are on the whole similar in both lagoons, whereas Cu concentrations are by far higher in lagoon Canet-St Nazaire. Cu concentrations appear to be highly dependent on dissolved organic carbon whereas salinity seems to control Cd variations. Concerning the sediments, the confined northern part of lagoon Bages-Sigean shows organic carbon and total nitrogen enrichment whereas lipid concentrations are much higher in the Canet-St Nazaire lagoon. Cu complexation seems to be strongly related to organic matter as evidenced by the two significant positive relationships, on one hand between Cu and organic carbon, and on the other hand, between Cu and lipids. On the contrary, Cd concentrations appear to be mainly controlled by carbonates. PCBs and PBDEs were detected only in sediments and show relatively low concentrations compared to similar lagoon environments. Regarding the sediment quality guidelines, Cd, Cu and PCBs in both lagoons did not exceed any Probable Effect Concentration (PEC).
Published: 2013
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49. Reproductive cycle and temperature-related differences in baseline levels of HSP70 and metallothioneins in wild oyster populations of Crassostrea gigas

Author: Meistertzheim, Anne-Leila, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and UnivBrestBU, AdminHAL
Subjects: Thermal limit, urogenital system, Reproduction, [SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, Temperature, Gonad, Heat Shock Proteins, [SDV] Life Sciences [q-bio], Maturation stage, Crassostrea gigas, ELISA, Sex, Repartition area, Metallothioneins
Abstract: International audience; Heat Shock Protein 70 (HSP70) are generalist stress proteins expressed in response to numerous environmental stresses. However, the baselines of these constitutive proteins are still unknown in many organisms and in particular marine intertidal species such as the Pacific oyster, Crassostrea gigas. I demonstrate that levels of heat shock proteins (HSP) and other stress proteins (metallothioneins, MTs) quantified by ELISA, remained similar in gills, mantle and digestive gland between oysters inhabiting cold and hot sites. In contrast, endogenous HSPs and MTs levels in gonad changed significantly during gametogenesis. In female gonads, the constitutive form of HSP70 and the MTs increased from immature to mature stages (about more than 3-fold) and decreased after spawning. In male gonads, the same expression patterns were observed, whereas protein levels were lower and decreased once fully mature. I hypothesize that the high level of stress proteins in eggs may increase survival of oyster progeny
Published: 2013

50. Genetic structure of European flounder Platichthys flesus: effects of both the southern limit of the species' range and chemical stress

Author: Grégory Charrier, Henrique N. Cabral, Louis Quiniou, Edouard Lavergne, Jean Laroche, Anne-Leila Meistertzheim, Isabelle Calves, Bruno Guinand, Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Senckenberg Forschungsinstitut und Naturmuseum, Ichthyology Section, LOEWE - Biodiversität und Klima Forschungszentrum (BiK-F), Tropical Marine Ecosystems Group, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Gothenburg (GU), Centro de Oceanografia, Université de Lisbonne, Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Subjects: 0106 biological sciences, Population, Species distribution, Flounder, Aquatic Science, Biology, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Nucleotide diversity, 03 medical and health sciences, Peripheral population, Genetics, Climate change, 14. Life underwater, EUROPEAN FLOUNDER, education, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, education.field_of_study, Genetic diversity, European flounder, Ecology, biology.organism_classification, Platichthys, Pollution, Genetic structure, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Estuaries
Abstract: International audience; The genetic structure of European flounder Platichthys flesus populations was analysed in the southern part of the species' distribution area, from England to Portugal; samples were collected in 5 estuaries which were chosen because of their latitudinal cline, the level of contaminants and the possibility of hypoxia: the Tamar in England; the Canche, Seine and Vilaine in France; and the Mondego in Portugal. Analysing the variability of a mitochondrial marker (cytochrome c oxidase subunit 1), we observed (1) a moderately higher nucleotide diversity in the Tamar and Canche, reflecting the probable existence of a major refugium in this sector during the last glacial maximum, and (2) a reduced genetic differentiation over the whole data set. The use of 8 microsatellites underlined the maintenance of genetic diversity in the peripheral population of the Mondego, located near the southern limit of the species' range; furthermore, significant pairwise differentiations of populations including Mondego underlined the particular genetic status of this Portuguese population. The polymorphism of a candidate gene involved in energetic metabolism, AMP-desaminase isoform 1, was investigated focusing on exon 1; we found the highest heterozygosities in the more polluted populations (Seine, Tamar) and marked differentiations compared to the other group of populations (Mondego, Vilaine, Canche). The pattern of variability observed for the AMP-desaminase suggests that in chronically contaminated flounder populations, cocktails of pollutants act as selective agents directly or indirectly on this locus.
Published: 2013
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