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324 results on '"Charles, Sandrine"'

1. Chemical effects on ecological interactions within a model-experiment loop

Author

Lamonica, Dominique, Charles, Sandrine, Clément, Bernard, and Lopes, Christelle

Subjects
Archaeology, CC1-960, Science
Abstract

We propose in this paper a method to assess the effects of a contaminant on a micro-ecosystem, integrating the population dynamics and the interactions between species. For that, we developed a dynamic model to describe the functioning of a microcosm exposed to a contaminant and to discriminate direct and indirect effects. Then, we get back from modelling to experimentation in order to identify which of the collected data have really been necessary and sufficient to estimate model parameters in order to propose a more efficient experimental design for further investigations. We illustrated our approach using a 2-L laboratory microcosm involving three species (the duckweed Lemna minor, the microalgae Pseudokirchneriella subcapitata and the daphnids Daphnia magna) exposed to cadmium contamination. We modelled the dynamics of the three species and their interactions using a mechanistic model based on coupled ordinary differential equations. The main processes occurring in this three-species microcosm were thus formalized, including growth and settling of algae, growth of duckweeds, interspecific competition between algae and duckweeds, growth, survival and grazing of daphnids, as well as cadmium effects. We estimated model parameters by Bayesian inference, using simultaneously all the data issued from multiple laboratory experiments specifically conducted for this study. Cadmium concentrations ranged between 0 and 50 μg.L-1 . For all parameters of our model, we obtained biologically realistic values and reasonable uncertainties. The cascade of cadmium effects, both direct and indirect, was identified. Critical effect concentrations were provided for the life history traits of each species. An example of experimental design adapted to this kind a microcosm was also proposed. This approach appears promising when studying contaminant effects on ecosystem functioning.

Published
2023
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3. Impacts of neonicotinoids on biodiversity: a critical review

Author

Mamy, Laure, Pesce, Stéphane, Sanchez, Wilfried, Aviron, Stéphanie, Bedos, Carole, Berny, Philippe, Bertrand, Colette, Betoulle, Stéphane, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Coeurdassier, Michael, Coutellec, Marie-Agnès, Crouzet, Olivier, Faburé, Juliette, Fritsch, Clémentine, Gonzalez, Patrice, Hedde, Mickael, Leboulanger, Christophe, Margoum, Christelle, Mougin, Christian, Munaron, Dominique, Nélieu, Sylvie, Pelosi, Céline, Rault, Magali, Sucré, Elliott, Thomas, Marielle, Tournebize, Julien, and Leenhardt, Sophie

Published
2023
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6. Main conclusions and perspectives from the collective scientific assessment of the effects of plant protection products on biodiversity and ecosystem services along the land–sea continuum in France and French overseas territories

Author

Pesce, Stéphane, Mamy, Laure, Sanchez, Wilfried, Amichot, Marcel, Artigas, Joan, Aviron, Stéphanie, Barthélémy, Carole, Beaudouin, Rémy, Bedos, Carole, Bérard, Annette, Berny, Philippe, Bertrand, Cédric, Bertrand, Colette, Betoulle, Stéphane, Bureau-Point, Eve, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Chauvel, Bruno, Coeurdassier, Michael, Corio-Costet, Marie-France, Coutellec, Marie-Agnès, Crouzet, Olivier, Doussan, Isabelle, Faburé, Juliette, Fritsch, Clémentine, Gallai, Nicola, Gonzalez, Patrice, Gouy, Véronique, Hedde, Mickael, Langlais, Alexandra, Le Bellec, Fabrice, Leboulanger, Christophe, Margoum, Christelle, Martin-Laurent, Fabrice, Mongruel, Rémi, Morin, Soizic, Mougin, Christian, Munaron, Dominique, Nélieu, Sylvie, Pelosi, Céline, Rault, Magali, Sabater, Sergi, Stachowski-Haberkorn, Sabine, Sucré, Elliott, Thomas, Marielle, Tournebize, Julien, and Leenhardt, Sophie

Published
2023
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12. In Silico Methods for Environmental Risk Assessment: Principles, Tiered Approaches, Applications, and Future Perspectives

Author

Astuto, Maria Chiara, primary, Di Nicola, Matteo R., additional, Tarazona, José V., additional, Rortais, A., additional, Devos, Yann, additional, Liem, A. K. Djien, additional, Kass, George E. N., additional, Bastaki, Maria, additional, Schoonjans, Reinhilde, additional, Maggiore, Angelo, additional, Charles, Sandrine, additional, Ratier, Aude, additional, Lopes, Christelle, additional, Gestin, Ophelia, additional, Robinson, Tobin, additional, Williams, Antony, additional, Kramer, Nynke, additional, Carnesecchi, Edoardo, additional, and Dorne, Jean-Lou C. M., additional

Published
2022
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13. Hierarchical modelling of species sensitivity distribution: development and application to the case of diatoms exposed to several herbicides

Author

King, Guillaume Kon Kam, Larras, Floriane, Charles, Sandrine, and Delignette-Muller, Marie Laure

Subjects
Statistics - Applications
Abstract

The Species Sensitivity Distribution (SSD) is a key tool to assess the ecotoxicological threat of contaminant to biodiversity. It predicts safe concentrations for a contaminant in a community. Widely used, this approach suffers from several drawbacks: i)summarizing the sensitivity of each species by a single value entails a loss of valuable information about the other parameters characterizing the concentration-effect curves; ii)it does not propagate the uncertainty on the critical effect concentration into the SSD; iii)the hazardous concentration estimated with SSD only indicates the threat to biodiversity, without any insight about a global response of the community related to the measured endpoint. We revisited the current SSD approach to account for all the sources of variability and uncertainty into the prediction and to assess a global response for the community. For this purpose, we built a global hierarchical model including the concentration-response model together with the distribution law for the SSD. Working within a Bayesian framework, we were able to compute an SSD taking into account all the uncertainty from the original raw data. From model simulations, it is also possible to extract a quantitative indicator of a global response of the community to the contaminant. We applied this methodology to study the toxicity of 6 herbicides to benthic diatoms from Lake Geneva, measured from biomass reduction.

Published
2015

14. MOSAIC_SSD: a new web-tool for the Species Sensitivity Distribution, allowing to include censored data by maximum likelihood

Author

King, Guillaume Kon Kam, Veber, Philippe, Charles, Sandrine, and Delignette-Muller, Marie Laure

Subjects
Statistics - Applications
Abstract

Censored data are seldom taken into account in Species Sensitivity Distribution (SSD) analysis. However, they are found in virtually every dataset and sometimes represent the better part of the data. Stringent recommendations on data quality often lead to discard a lot of this meaningful data, often resulting in datasets of reduced size, which lack representativeness of any realistic community. However, it is reasonably simple to include censored data into SSD by using an extension of the standard maximum likelihood method. In this paper, we detail this approach based on the use of the R-package \emph{fitdistrplus}, dedicated to the fit of parametric probability distributions. In particular, we introduce the new web-tool MOSAIC$\_$SSD to fit an SSD on datasets containing any kind of data, censored or not. MOSAIC$\_$SSD allows predicting any Hazardous Concentration (HC) and provides in addition bootstrap confidence intervals on the prediction. In the end, taking examples from published data, we illustrate the added value of including censored data in SSD., Comment: 26 pages, 2 figures

Published
2013

15. Statistical handling of reproduction data for exposure-response modelling

Author

Delignette-Muller, Marie Laure, Lopes, Christelle, Veber, Philippe, and Charles, Sandrine

Subjects
Statistics - Applications
Abstract

Reproduction data collected through standard bioassays are classically analyzed by regression in order to fit exposure-response curves and estimate ECx values (x% Effective Concentration). But regression is often misused on such data, ignoring statistical issues related to i) the special nature of reproduction data (count data), ii) a potential inter-replicate variability and iii) a possible concomitant mortality. This paper offers new insights in dealing with those issues. Concerning mortality, particular attention was paid not to waste any valuable data - by dropping all the replicates with mortality - or to bias ECx values. For that purpose we defined a new covariate summing the observation periods during which each individual contributes to the reproduction process. This covariate was then used to quantify reproduction - for each replicate at each concentration - as a number of offspring per individual-day. We formulated three exposure-response models differing by their stochastic part. Those models were fitted to four datasets and compared using a Bayesian framework. The individual-day unit proved to be a suitable approach to use all the available data and prevent bias in the estimation of ECx values. Furthermore, a non-classical negative-binomial model was shown to correctly describe the inter-replicate variability observed in the studied datasets.

Published
2013

17. Editorial trend: adverse outcome pathway (AOP) and computational strategy — towards new perspectives in ecotoxicology.

Author

Baudiffier, Damien, Audouze, Karine, Armant, Olivier, Frelon, Sandrine, Charles, Sandrine, Beaudouin, Remy, Cosio, Claudia, Payrastre, Laurence, Siaussat, David, Burgeot, Thierry, Mauffret, Aourell, Degli Esposti, Davide, Mougin, Christian, Delaunay, Delphine, and Coumoul, Xavier

Subjects
ENVIRONMENTAL toxicology, ARTIFICIAL intelligence, PHARMACODYNAMICS, COMPUTATIONAL neuroscience, TOXICOLOGY, SYSTEMS biology, RISK assessment
Abstract

The adverse outcome pathway (AOP) has been conceptualized in 2010 as an analytical construct to describe a sequential chain of causal links between key events, from a molecular initiating event leading to an adverse outcome (AO), considering several levels of biological organization. An AOP aims to identify and organize available knowledge about toxic effects of chemicals and drugs, either in ecotoxicology or toxicology, and it can be helpful in both basic and applied research and serve as a decision-making tool in support of regulatory risk assessment. The AOP concept has evolved since its introduction, and recent research in toxicology, based on integrative systems biology and artificial intelligence, gave it a new dimension. This innovative in silico strategy can help to decipher mechanisms of action and AOP and offers new perspectives in AOP development. However, to date, this strategy has not yet been applied to ecotoxicology. In this context, the main objective of this short article is to discuss the relevance and feasibility of transferring this strategy to ecotoxicology. One of the challenges to be discussed is the level of organisation that is relevant to address for the AO (population/community). This strategy also offers many advantages that could be fruitful in ecotoxicology and overcome the lack of time, such as the rapid identification of data available at a time t, or the identification of "data gaps". Finally, this article proposes a step forward with suggested priority topics in ecotoxicology that could benefit from this strategy. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2024
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21. Approches de modélisation pour évaluer les effets écotoxicologiques des pesticides : revue critique

Author

Larras, Floriane, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Pelosi, Céline, Le Gall, Morgane, Mamy, Laure, and Beaudoin, Rémy

Abstract

• Devant la multiplicité et la diversité des pesticides (PPP), des contextes agro-pédoclimatiques, des écosystèmes récepteurs et des espèces en présence, il est impossible de réaliser des expériences de laboratoire ou sur le terrain pour évaluer les impacts de toutes les substances dans tous les milieux, aux différentes échelles d’organisation biologique et sur l’ensemble de la biodiversité • La modélisation apparaît ainsi comme un outil fondamental pour évaluer les effets écotoxicologiques des PPP • La modélisation permet aussi d’aborder des questions complexes, comme les effets des mélanges de PPP • Enfin, elle est requise au niveau réglementaire dans le cadre de l’évaluation des risques liés aux PPP avant leur mise sur le marché L’objectif de ce travail a consisté à réaliser une revue bibliographique des approches de modélisation permettant d’évaluer les effets des PPP sur les organismes, populations et communautés des espèces non-cibles.

Published
2023

22. Optimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis

Author

Charles, Sandrine, Ducrot, Virginie, Azam, Didier, Benstead, Rachel, Brettschneider, Denise, De Schamphelaere, Karel, Filipe Goncalves, Sandra, Green, John W., Holbech, Henrik, Hutchinson, Thomas H., Faber, Daniel, Laranjeiro, Filipe, Matthiessen, Peter, Norrgren, Leif, Oehlmann, Jörg, Reategui-Zirena, Evelyn, Seeland-Fremer, Anne, Teigeler, Matthias, Thome, Jean-Pierre, Tobor Kaplon, Marysia, Weltje, Lennart, and Lagadic, Laurent

Published
2016
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24. Tobramycin Therapeutic Drug Monitoring in Adult patients with Cystic Fibrosis: Clinical-Based Empiric Dosing versus Model-Informed Precision Dosing

Author

PRAET, Antonin, primary, WDOWIK, Juliette, additional, NAVE, Viviane, additional, DURUPT, Stéphane, additional, REYNAUD, Quitterie, additional, NOVE-JOSSERAND, Raphaële, additional, DURIEU, Isabelle, additional, REIX, Philippe, additional, CHARLES, Sandrine, additional, BOURGUIGNON, Laurent, additional, and GOUTELLE, Sylvain, additional

Published
2023
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26. The use of new approach methodologies for the environmental risk assessment of food and feed chemicals

Author

Di Nicola, Matteo Riccardo, primary, Cattaneo, Irene, additional, Nathanail, Alexis V., additional, Carnesecchi, Edoardo, additional, Astuto, Maria Chiara, additional, Steinbach, Melina, additional, Williams, Antony John, additional, Charles, Sandrine, additional, Gestin, Ophélia, additional, Lopes, Christelle, additional, Lamonica, Dominique, additional, Tarazona, Jose Vicente, additional, and Dorne, Jean Lou C.M., additional

Published
2023
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33. Development and validation of an OECD reproductive toxicity test guideline with the pond snail Lymnaea stagnalis (Mollusca, Gastropoda)

Author

Ducrot, Virginie, Askem, Clare, Azam, Didier, Brettschneider, Denise, Brown, Rebecca, Charles, Sandrine, Coke, Maïra, Collinet, Marc, Delignette-Muller, Marie-Laure, Forfait-Dubuc, Carole, Holbech, Henrik, Hutchinson, Thomas, Jach, Arne, Kinnberg, Karin L., Lacoste, Cédric, Le Page, Gareth, Matthiessen, Peter, Oehlmann, Jörg, Rice, Lynsey, Roberts, Edward, Ruppert, Katharina, Davis, Jessica Elphinstone, Veauvy, Clemence, Weltje, Lennart, Wortham, Ruth, and Lagadic, Laurent

Published
2014
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34. Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques

Author

Leenhardt, Sophie (coord.), Mamy, Laure, Pesce, Stéphane, Sanchez, Wilfried, Achard, Anne-laure, Amichot, Marcel, Artigas, Joan, Aviron, Stéphanie, Barthélémy, Carole, Beaudouin, Rémy, Bedos, Carole, Bérard, Annette, Berny, Philippe, Bertrand, Cédric, Bertrand, Colette, Betoulle, Stéphane, Bureau-point, Eve, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Chauvel, Bruno, Coeurdassier, Mickael, Corio-costet, Marie-france, Coutellec, Marie-agnès, Crouzet, Olivier, Doussan, Isabelle, Faburé, Juliette, Fritsch, Clémentine, Gallai, Nicola, Gonzalez, Patrice, Gouy, Véronique, Hedde, Mickael, Langlais, Alexandra, Le Bellec, Fabrice, Leboulanger, Christophe, Le Gall, Morgane, Le Perchec, Sophie, Margoum, Christelle, Martin-laurent, Fabrice, Mongruel, Remi, Morin, Soizic, Mougin, Christian, Munaron, Dominique, Nélieu, Sylvie, Pelosi, Céline, Rault, Magali, Sabater, Sergi, Stachowski-haberkorn, Sabine, Sucré, Eliott, Thomas, Marielle, and Tournebize, Julien

Abstract

Chaque année, entre 55000 et 70000 tonnes de substances actives phytopharmaceutiques, incluant celles utilisables en agriculture biologique et de biocontrôle, sontvendues sur le territoire français métropolitain et d’outre-meret sont utilisées pour la protection des cultures ou l’entretien des jardins, espaces végétalisés et infrastructures (JEVI). Dans le même temps, le rapport sur l’évaluation mondiale de la biodiversité et des services écosystémiques établi en 2019 par la Plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques(IPBES) dresse le bilan alarmant d’une érosion sans précédent de la biodiversité. La pollution chimique générée par les activités humaines, incluant les produits phytopharmaceutiques (PPP), est identifiée parmi les causes de cette érosion. Cette pollution s’ajoute à d’autres pressions, comme les destructions d’habitats causées par l’urbanisation, l’intensification des pratiques agricoles et sylvicoles, et les conséquences duchangement climatique. Face à ce constat, la réglementation européenne en matière de mise sur le marché des PPP vise un degré élevé de protection, avec en particulier pour principe d’éviter tout effet inacceptable sur l’environnement. Toutefois, elle ne parvient pas complètement à atteindre cet objectif, en raison notamment d’une prise en compte insuffisante dela diversité des interactions telles qu’elles se produisent dans l’environnement (entre substances, entre organismes, avec une variété de facteurs physico-chimiques, etc.). C’est dans ce contexte que les ministres chargés de l’Environnement, de l’Agriculture et de la Recherche ont sollicité INRAE et l’Ifremer pour réaliser un état des lieux des connaissances scientifiques relatives aux impacts des PPP sur la biodiversité et les services écosystémiques. La précédente expertise scientifique collective (ESCo) portant sur Pesticides, agriculture et environnement avait été réalisée en 2005. Le présent exercice consiste à en actualiser les résultats, en les élargissant à l’ensemble du continuum terre-mer et en incluant les usages de PPP relevant des zones non agricoles (JEVI). A la différence de celle de 2005, cette ESCo est positionnée en aval de l’utilisation des PPP, pour traiter du devenir et des impacts de ces substances une fois introduites dans l’environnement. Elle ne traite pas des pratiques ou systèmes agricoles permettant de réduire les utilisations de PPP, ni des stratégies préventives de régulation des bioagresseurs. Ces thématiques font l’objet d’autres travaux en cours, notamment une autre ESCo conduite par INRAE sur la gestion des couverts végétaux pour la régulation naturelle des bioagresseurs dont les résultats sont attendus à l’automne 2022. Ces deux exercices s’inscrivent dans le cadre du Plan Ecophyto II+, en complément de l’expertise Pesticides et santé humaine publiée par l’Inserm en 2021. Le périmètre de la présente ESCo couvre les différents milieux (terrestre, atmosphérique, aquatiques continental et marin, à l’exception des eaux souterraines) dans leur continuité, du lieu d’application jusqu’à l’océan, en France métropolitaine et d’outre-mer, à partir de connaissances produites ou transposables dans ce type de contexte (climat, PPP utilisés, biodiversité présente, etc.). Il intègre tous lesproduits destinés à la protection des cultures ou à l’entretiendes JEVI, qu’il s’agisse de PPP conventionnels ou de produits ou agents de biocontrôle, dès lors qu’ils sont susceptibles de se retrouver dans l’environnement du fait d’une utilisation actuelle ou plus ancienne. Le cadre d’analyse mis en place considère la biodiversité dans ses dimensions structurelle etfonctionnelle, et il intègre la question des services écosystémiques. L’attention est ainsi plus particulièrement portée sur des travaux qui documentent la mise en évidence desrisques et des effets dans des conditions environnementales réalistes, et à des niveaux d’organisation biologique (ex. individu, population, communauté, écosystème) susceptibles de faciliter le lien à établir avec la biodiversité ainsi qu’avec les fonctions et services écosystémiques. (https://www.inrae.fr/sites/default/files/pdf/ExpertiseCollectivePestiEcotox_R%C3%A9sum%C3%A9.pdf)

Published
2022

37. Implementation of Model-Based Dose Adjustment of Tobramycin in Adult Patients with Cystic Fibrosis

Author

Reverchon, Jérémy, primary, Tuloup, Vianney, additional, Garreau, Romain, additional, Nave, Viviane, additional, Cohen, Sabine, additional, Reix, Philippe, additional, Durupt, Stéphane, additional, Nove-Josserand, Raphaele, additional, Durieu, Isabelle, additional, Reynaud, Quitterie, additional, Bourguignon, Laurent, additional, Charles, Sandrine, additional, and Goutelle, Sylvain, additional

Published
2022
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39. SI-Improvements in estimating bioaccumulation metrics in the light of toxicokinetics models and Bayesian inference

Author

CHARLES, Sandrine and RATIER, Aude

Subjects
Environmental Risk Assessment, classification of chemical substances, REACH regulation, accumulation-depuration test
Abstract

This is the supplementary information provided with the manuscript submitted in the journal Archives of Environmental Contamination and Toxicology with the same title.

Published
2022
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42. Tobramycin Therapeutic Drug Monitoring in Adult patients with Cystic Fibrosis: Clinical-Based Empiric Dosing versus Model-Informed Precision Dosing

Author

PRAET, Antonin, primary, CHARLES, Sandrine, additional, WDOWIK, Juliette, additional, NAVE, Viviane, additional, DURUPT, Stéphane, additional, REYNAUD, Quitterie, additional, NOVE-JOSSERAND, Raphaële, additional, DURIEU, Isabelle, additional, REIX, Philippe, additional, BOURGUIGNON, Laurent, additional, and GOUTELLE, Sylvain, additional

Published
2022
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43. Lung cancer mortality in the European cohort of titanium dioxide workers: a reanalysis of the exposure–response relationship

Author

Guseva Canu, Irina, primary, Gaillen-Guedy, Alan, additional, Antilla, Ahti, additional, Charles, Sandrine, additional, Fraize-Frontier, Sandrine, additional, Luce, Danièle, additional, McElvenny, Damien Martin, additional, Merletti, Franco, additional, Michel, Cecile, additional, Pukkala, Eero, additional, Schubauer-Berigan, Mary K, additional, Straif, Kurt, additional, Wild, Pascal, additional, and Richardson, David B, additional

Published
2022
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45. Students' Performance and Satisfaction with Web vs. Paper-Based Practice Quizzes and Lecture Notes

Author

Macedo-Rouet, Monica, Ney, Muriel, and Charles, Sandrine

Abstract

The use of computers to deliver course-related materials is rapidly expanding in most universities. Yet the effects of computer vs. printed delivery modes on students' performance and motivation are not yet fully known. We compared the impacts of Web vs. paper to deliver practice quizzes that require information search in lecture notes. Hundred and twenty two undergraduate students used either a web site or printed documents to answer 18 mathematics questions during a tutored session. A revised Web site was designed based on ergonomic criteria, to test the hypothesis that improved usability would decrease time spent on the task, the number of pages consulted, and students' perceived cognitive load. The group working with printed documents had the highest performance. Furthermore, students perceived the paper materials as less effortful to read, and expressed preference for printing lecture notes and questions. However, students appreciated having a Web site available. No differences were found between the two sites. We conclude that Web delivery imposed higher perceived cognitive load due to the need to read lengthy documents. We suggest possible ways to improve Web-based practice materials, such as simultaneous display of questions and lecture notes. (Contains 3 tables and 2 figures.)

Published
2009
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46. Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Rapport de l’expertise scientifique collective

Author

Mamy, Laure, Pesce, Stéphane, Sanchez, Wilfried, Amichot, Marcel, Artigas, Joan, Aviron, Stéphanie, Barthélémy, Carole, Beaudouin, Rémy, Bedos, Carole, Bérard, Annette, Berny, Philippe, Bertrand, Cédric, Bertrand, Colette, Betoulle, Stéphane, Bureau-Point, Ève, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Chauvel, Bruno, Coeurdassier, Michael, Corio-Costet, M.-F., Coutellec, Marie-Agnès, Crouzet, Olivier, Doussan, Isabelle, Douzals, Jean Paul, Fabure, Juliette, Fritsch, Clémentine, Gallai, Nicola, Gonzalez, Patrice, Gouy, Véronique, Hedde, Mickael, Langlais, Alexandra, Le Bellec, Fabrice, Leboulanger, C, Margoum, Christelle, Martin-Laurent, Fabrice, Mongruel, Rémi, Morin, Soizic, Mougin, Christian, Munaron, Dominique, Nelieu, Sylvie, Pélosi, Céline, Rault, Magali, Ris, N., Sabater, Sergi, Stachowski-Haberkorn, Sabine, Sucré, Elliott, Thomas, Marielle, Tournebize, Julien, Achard, Anne Laure, Le Gall, Morgane, Le Perchec, Sophie, Delebarre, Estelle, Larras, Floriane, Leenhardt, Sophie, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes (RiverLy), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Côte d'Azur (UCA), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Biodiversité agroécologie et aménagement du paysage (UMR BAGAP), Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Laboratoire Population-Environnement-Développement (LPED), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Stress Environnementaux et BIOsurveillance des milieux aquatiques (SEBIO), Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-SFR Condorcet, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Mycotoxines et Toxicologie Comparée des Xénobiotiques (MET), Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Norbert Elias (CNELIAS), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - 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Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Institut d'Études Politiques [IEP] - Toulouse-École Nationale Supérieure de Formation de l'Enseignement Agricole de Toulouse-Auzeville (ENSFEA), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut de l'Ouest : Droit et Europe (IODE), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fonctionnement agroécologique et performances des systèmes de cultures horticoles (UPR HORTSYS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Cirad-PERSYST), MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Aménagement des Usages des Ressources et des Espaces marins et littoraux - Centre de droit et d'économie de la mer (AMURE), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Instituto Catalán de Investigación del Agua - ICRA (SPAIN) (ICRA), Physiologie et biotechnologie des Algues (PBA), Biotechnologies et Ressources Marines (BRM), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Unité de Recherches Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux (URAFPA), Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Hydrosystèmes continentaux anthropisés : ressources, risques, restauration (UR HYCAR), Département Ecosystèmes aquatiques, ressources en eau et risques - INRAE (AQUA), Direction pour la Science Ouverte (DipSO), Direction de l'Expertise scientifique collective, de la Prospective et des Etudes, Ministère de la Transition Ecologique, Ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation, Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche, INRAE, and IFREMER

Subjects
Services écosystèmiques, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Pesticides -- Toxicologie, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biodiversité, Produits phytopharmaceutiques
Abstract

Chaque année, entre 55 000 et 70 000 tonnes de substances actives phytopharmaceutiques, incluant celles utilisables en agriculture biologique et de biocontrôle, sont vendues sur le territoire français métropolitain et d’outre-mer et sont utilisées pour la protection des cultures ou l’entretien des jardins, espaces végétalisés et infrastructures (JEVI). Dans le même temps, le rapport sur l’évaluation mondiale de la biodiversité et des services écosystémiques établi en 2019 par la Plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques (IPBES) dresse le bilan alarmant d’une érosion sans précédent de la biodiversité. La pollution chimique générée par les activités humaines, incluant les produits phytopharmaceutiques (PPP), est identifiée parmi les causes de cette érosion. Cette pollution s’ajoute à d’autres pressions, comme les destructions d’habitats causées par l’urbanisation, l’intensification des pratiques agricoles et sylvicoles, et les conséquences du changement climatique. Face à ce constat, la réglementation européenne en matière de mise sur le marché des PPP vise un degré élevé de protection, avec en particulier pour principe d’éviter tout effet inacceptable sur l’environnement. Toutefois, elle ne parvient pas complètement à atteindre cet objectif, en raison notamment d’une prise en compte insuffisante de la diversité des interactions telles qu’elles se produisent dans l’environnement (entre substances, entre organismes, avec une variété de facteurs physico-chimiques, etc.).C’est dans ce contexte que les ministres chargés de l’Environnement, de l’Agriculture et de la Recherche ont sollicité INRAE et l’Ifremer pour réaliser un état des lieux des connaissances scientifiques relatives aux impacts des PPP sur la biodiversité et les services écosystémiques. La précédente expertise scientifique collective (ESCo) portant sur Pesticides, agriculture et environnement avait été réalisée en 2005. Leprésent exercice consiste à en actualiser les résultats, en les élargissant à l’ensemble du continuum terre-mer et en incluant les usages de PPP relevant des zones non agricoles (JEVI). A la différence de celle de 2005, cette ESCo est positionnée en aval de l’utilisation des PPP, pour traiter du devenir et des impacts de ces substances une fois introduites dans l’environnement. Elle ne traite pas des pratiques ou systèmes agricoles permettant de réduire les utilisations de PPP, ni des stratégies préventives de régulation des bioagresseurs. Ces thématiques font l’objet d’autres travaux en cours, notamment une autre ESCo conduite par INRAE sur la gestion des couverts végétaux pour la régulation naturelle des bioagresseurs dont les résultats sont attendus à l’automne 2022. Ces deux exercices s’inscrivent dans le cadre du Plan Ecophyto II+, en complément de l’expertise Pesticides et santé humaine publiée par l’Inserm en 2021.Le périmètre de la présente ESCo couvre les différents milieux (terrestre, atmosphérique, aquatiques continental et marin, à l’exception des eaux souterraines) dans leur continuité, du lieu d’application jusqu’à l’océan, en France métropolitaine et d’outre-mer, à partir de connaissances produites ou transposables dans ce type de contexte (climat, PPP utilisés, biodiversité présente, etc.). Il intègre tous les produits destinés à la protection des cultures ou à l’entretien des JEVI, qu’il s’agisse de PPP conventionnels ou de produits ou agents de biocontrôle, dès lors qu’ils sont susceptibles de se retrouver dans l’environnement du fait d’une utilisation actuelle ou plus ancienne. Le cadre d’analyse mis en place considère la biodiversité dans ses dimensions structurelle et fonctionnelle, et il intègre la question des services écosystémiques. L’attention est ainsi plus particulièrement portée sur des travaux qui documentent la mise en évidence des risques et des effets dans des conditions environnementales réalistes, et à des niveaux d’organisation biologique (ex. individu, population, communauté, écosystème) susceptibles de faciliter le lien à établir avec la biodiversité ainsi qu’avec les fonctions et services écosystémiques.

Published
2022

47. Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Rapport de l’expertise scientifique collective

Author

Leenhardt, Sophie, Mamy, Laure, Pesce, Stéphane, Sanchez, Wilfried, Achard, Anne Laure, Amichot, Marcel, Artigas, Joan, Aviron, Stéphanie, Barthélémy, Carole, Beaudouin, Rémy, Bedos, Carole, Bérard, Annette, Berny, Philippe, Bertrand, Cédric, Bertrand, Colette, Betoulle, Stéphane, Bureau-Point, Ève, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Chauvel, Bruno, Coeurdassier, Michael, Corio-Costet, M.-F., Coutellec, Marie-Agnès, Crouzet, Olivier, Doussan, Isabelle, Fabure, Juliette, Fritsch, Clémentine, Gallai, Nicola, Gonzalez, Patrice, Gouy, Véronique, Hedde, Mickael, Langlais, Alexandra, Le Bellec, Fabrice, Leboulanger, C, Le Gall, Morgane, Le Perchec, Sophie, Margoum, Christelle, Martin-Laurent, Fabrice, Mongruel, Rémi, Morin, Soizic, Mougin, Christian, Munaron, Dominique, Nelieu, Sylvie, Pélosi, Céine, Rault, Magali, Sabater, Sergi, Stachowski-Haberkorn, Sabine, Sucré, Elliott, Thomas, Marielle, and Tournebize, Julien

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2022
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48. Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Rapport d'ESCo

Author

Mamy, Laure (ed.), Pesce, Stéphane (ed.), Sanchez, Wilfried (ed.), Leenhardt, Sophie (ed.), Amichot, Marcel, Artigas, Joan, Aviron, Stéphanie, Barthélémy, Carole, Beaudouin, Rémy, Bedos, Carole, Berard, Annette, Berny, Philippe, Bertrand, Cédric, Bertrand, Colette, Betoulle, Stéphane, Bureau-Point, Eve, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Chauvel, Bruno, Coeurdassier, Michaël, Coutellec, Marie-Agnès, Crouzet, Olivier, Doussan, Isabelle, Fabure, Juliette, Fritsch, Clémentine, Gallai, Nicola, Gonzalez, Patrice, Gouy-Boussada, Véronique, Hedde, Mickaël, Langlais, Alexandra, Le Bellec, Fabrice, Leboulanger, Christophe, Margoum, Christelle, Martin-Laurent, Fabrice, Mongruel, Rémi, Morin, Soizic, Mougin, Christian, Munaron, Dominique, Nelieu, Sylvie, Pelosi, Céline, Rault, Magali, Sabater, Sergi, Stachowski-Haberkorn, Sabine, Sucre, Eliott, Thomas, Marielle, Tournebize, Julien, Douzals, Jean-Paul, and Ris, Nicolas

Abstract

Dans le cadre du Plan Ecophyto II+, qui organise les moyens mis en oeuvre par le gouvernement français pour réduire les usages de produits phytopharmaceutiques, différents travaux d'expertise scientifique sont conduits de manière complémentaire. L'Inserm a présenté en juin 2021 les résultats d'une expertise collective dont il avait été saisi sur les effets des produits phytopharmaceutiques sur la santé humaine, intitulée Pesticides et santé – Nouvelles données. La présente expertise scientifique collective (ESCo) est quant à elle centrée sur les impacts de ces produits sur la biodiversité et les services écosystémiques. Une autre ESCo restituée à l'automne 2022 porte sur la gestion des couverts végétaux pour réguler les bioagresseurs des cultures. Les ESCo ont pour objet d'établir un état des lieux et une analyse critique des connaissances scientifiques disponibles au niveau mondial sur des sujets aux dimensions multiples. Cette analyse est réalisée par un collège pluridisciplinaire d'experts scientifiques appartenant à des organismes publics de recherche ou d'enseignement supérieur. Commandée en mars 2020 par le ministère de la Transition Ecologique, le ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation et le ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche, la présente expertise a été confiée à INRAE et à l'Ifremer. Elle actualise et complète les travaux antérieurs qui avaient été restitués en 2005 sur Pesticides, agriculture et environnement, et en 2008 sur Agriculture et biodiversité. Les résultats sont publiés sur les sites internet d'INRAE et de l'Ifremer sous trois formats de documents disponibles en ligne. Le présent rapport comporte un rappel des éléments de contexte de l'expertise, la description de la méthode mise en oeuvre et de l'ensemble de la bibliographie qui intègre plus de 4 000 références, les éléments de cadrage scientifique de l'ESCo, l'ensemble des analyses produites par les experts, ainsi que les conclusions générales qui en découlent. La synthèse rassemble les principaux constats établis dans le rapport d'ESCo, sans mobiliser l'intégralité du corpus bibliographique utilisé. Le résumé présente succinctement les principaux enseignements tirés de ces travaux. En outre, les résultats ont fait l'objet, le 5 mai 2022, d'un colloque public de restitution, dont les captations vidéos sont également disponibles en ligne.

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2022

49. Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques- Résumé de l'Expertise scientifique collective - Mai 2022

Author

Leenhardt, Sophie (ed.), Mamy, Laure (ed.), Pesce, Stéphane (ed.), Sanchez, Wilfried (ed.), Achard, Anne-Laure, Amichot, Marcel, Artigas, Joan, Aviron, Stéphanie, Barthélémy, Carole, Beaudouin, Rémy, Bedos, Carole, Berard, Annette, Berny, Philippe, Bertrand, Cédric, Bertrand, Colette, Betoulle, Stéphane, Bureau-Point, Eve, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Chauvel, Bruno, Coeurdassier, Michaël, Corio-Costet, Marie-France, Coutellec, Marie-Agnès, Crouzet, Olivier, Delebarre, Estelle, Doussan, Isabelle, Douzals, Jean-Paul, Fabure, Juliette, Fritsch, Clémentine, Gallai, Nicola, Gonzalez, Patrice, Gouy-Boussada, Véronique, Hedde, Mickaël, Langlais, Alexandra, Larras, Floriane, Le Bellec, Fabrice, Leboulanger, Christophe, Le Gall, Morgane, Le Perchec, Sophie, Margoum, Christelle, Martin-Laurent, Fabrice, Mongruel, Rémi, Morin, Soizic, Mougin, Christian, Munaron, Dominique, Nelieu, Sylvie, Pelosi, Céline, Rault, Magali, Ris, Nicolas, Sabater, Sergi, Stachowski-Haberkorn, Sabine, Sucre, Eliott, Thomas, Marielle, and Tournebize, Julien

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2022

50. Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques - Synthèse de l'Expertise scientifique collective - Mai 2022

Author

Leenhardt, Sophie (ed.), Mamy, Laure (ed.), Pesce, Stéphane (ed.), Sanchez, Wilfried (ed.), Amichot, Marcel, Artigas, Joan, Aviron, Stéphanie, Barthélémy, Carole, Beaudouin, Rémy, Bedos, Carole, Berard, Annette, Berny, Philippe, Bertrand, Cédric, Bertrand, Colette, Betoulle, Stéphane, Bureau-Point, Eve, Charles, Sandrine, Chaumot, Arnaud, Chauvel, Bruno, Coeurdassier, Michaël, Corio-Costet, Marie-France, Coutellec, Marie-Agnès, Crouzet, Olivier, Doussan, Isabelle, Fabure, Juliette, Fritsch, Clémentine, Gallai, Nicola, Gonzalez, Patrice, Gouy-Boussada, Véronique, Hedde, Mickaël, Langlais, Alexandra, Le Bellec, Fabrice, Leboulanger, Christophe, Margoum, Christelle, Martin-Laurent, Fabrice, Mongruel, Rémi, Morin, Soizic, Mougin, Christian, Munaron, Dominique, Nelieu, Sylvie, Pelosi, Céline, Rault, Magali, Ris, Nicolas, Sabater, Sergi, Stachowski-Haberkorn, Sabine, Sucre, Eliott, Thomas, Marielle, Tournebize, Julien, and Douzals, Jean-Paul

Abstract

Chaque année, entre 55000 et 70000 tonnes de substances actives phytopharmaceutiques, incluant celles utilisables en agriculture biologique et de biocontrôle, sont vendues sur le territoire français métropolitain et d'outre-mer et sont utilisées pour la protection des cultures ou l'entretien des jardins, espaces végétalisés et infrastructures (JEVI). Dans le même temps, le rapport sur l'évaluation mondiale de la biodiversité et des services écosystémiques établi en 2019 par la Plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques (IPBES) dresse le bilan alarmant d'une érosion sans précédent de la biodiversité. La pollution chimique générée par les activités humaines, incluant les produits phytopharmaceutiques (PPP), est identifiée parmi les causes de cette érosion. Cette pollution s'ajoute à d'autres pressions, comme les destructions d'habitats causées par l'urbanisation, l'intensification des pratiques agricoles et sylvicoles, et les conséquences du changement climatique. Face à ce constat, la réglementation européenne en matière de mise sur le marché des PPP vise un degré élevé de protection, avec en particulier pour principe d'éviter tout effet inacceptable sur l'environnement. Toutefois, elle ne parvient pas complètement à atteindre cet objectif, en raison notamment d'une prise en compte insuffisante de la diversité des interactions telles qu'elles se produisent dans l'environnement (entre substances, entre organismes, avec une variété de facteurs physico-chimiques, etc.). C'est dans ce contexte que les ministres chargés de l'Environnement, de l'Agriculture et de la Recherche ont sollicité INRAE et l'Ifremer pour réaliser un état des lieux des connaissances scientifiques relatives aux impacts des PPP sur la biodiversité et les services écosystémiques. La précédente expertise scientifique collective (ESCo) portant sur Pesticides, agriculture et environnement avait été réalisée en 2005. Le présent exercice consiste à en actualiser les résultats, en les élargissant à l'ensemble du continuum terre-mer et en incluant les usages de PPP relevant des zones non agricoles (JEVI). A la différence de celle de 2005, cette ESCo est positionnée en aval de l'utilisation des PPP, pour traiter du devenir et des impacts de ces substances une fois introduites dans l'environnement. Elle ne traite pas des pratiques ou systèmes agricoles permettant de réduire les utilisations de PPP, ni des stratégies préventives de régulation des bioagresseurs. Ces thématiques font l'objet d'autres travaux en cours, notamment une autre ESCo conduite par INRAE sur la gestion des couverts végétaux pour la régulation naturelle des bioagresseurs dont les résultats sont attendus à l'automne 2022. Ces deux exercices s'inscrivent dans le cadre du Plan Ecophyto II+, en complément de l'expertise Pesticides et santé humaine publiée par l'Inserm en 2021. Le périmètre de la présente ESCo couvre les différents milieux (terrestre, atmosphérique, aquatiques continental et marin, à l'exception des eaux souterraines) dans leur continuité, du lieu d'application jusqu'à l'océan, en France métropolitaine et d'outre-mer, à partir de connaissances produites ou transposables dans ce type de contexte (climat, PPP utilisés, biodiversité présente, etc.). Il intègre tous les produits destinés à la protection des cultures ou à l'entretien des JEVI, qu'il s'agisse de PPP conventionnels ou de produits ou agents de biocontrôle, dès lors qu'ils sont susceptibles de se retrouver dans l'environnement du fait d'une utilisation actuelle ou plus ancienne. Le cadre d'analyse mis en place considère la biodiversité dans ses dimensions structurelle et fonctionnelle, et il intègre la question des services écosystémiques. L'attention est ainsi plus particulièrement portée sur des travaux qui documentent la mise en évidence des risques et des effets dans des conditions environnementales réalistes, et à des niveaux d'organisation biologique (ex. individu, population, communauté, écosystème) susceptibles de faciliter le lien à établir avec la biodiversité ainsi qu'avec les fonctions et services écosystémiques. (https://www.inrae.fr/sites/default/files/pdf/ExpertiseCollectivePestiEcotox_R%C3%A9sum%C3%A9.pdf)

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2022

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