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En Uruguay las seroprevalencias de las infecciones causadas por los virus de la inmunodeficiencia humana y de las hepatitis B y C son marcadamente más elevadas en poblaciones de riesgo. Importa conocerlas, así como sus posibles causas, con la finalidad de implementar intervenciones apropiadas. El objetivo del trabajo consiste en conocer la prevalencia de las infecciones causadas por los virus de la inmunodeficiencia humana y de las hepatitis B y C en usuarios de drogas por vía inyectable, mayores de 18 años, que habitaban en Montevideo y en el área metropolitana en el año 2003; simultáneamente analizar la influencia de los consumos inyectables, de las prácticas sexuales y de ciertos comportamientos en la prevalencia de dichas infecciones. Del universo de usuarios de drogas por vía inyectable que habitaban el área metropolitana de Uruguay se seleccionó una muestra de 200 individuos mayores de 18 años y que hubiesen comenzado su consumo después de 1980. La captación se realizó mediante la técnica de "bola de nieve", entre octubre y diciembre de 2003. Se diseñó un estudio de prevalencia, utilizando una fuente de datos primaria, abordada mediante un estudio serológico y una entrevista simultáneamente. Las prácticas de riesgo se analizaron mediante el cálculo de prevalencias relativas (PR) y sus intevalos de confianza de 95%. La asociación estadística se determinó mediante la prueba de chi cuadrado de Mantel Haenszel. El nivel de significación estadística fijado fue de 0,10 (p< 0,10). Las prevalencias halladas fueron 18,5% para virus de inmunodeficiencia humana; 19,5% para virus de la hepatitis B, y 21,5% para virus de la hepatitis C; 33% presentó alguna de las infecciones, 15% registró una, 9,5% dos y 8,5% hasta tres. Para todas las infecciones las características de inyectarse con frecuencia semanal o mayor, haber consumido más de dos años, compartir jeringas y agujas, limpiar el material de punción para reutilizarlo, tener pareja sexual positiva para el virus de la inmunodeficiencia humana o portadora de síndrome de inmuno deficiencia adquirida o usuarios de drogas inyectables, y haber estado preso alguna vez resultaron ser, o mostraron tendencia a ser, factores de riesgo para infectarse. Las prevalencias halladas fueron menores que las de los países de la región. No obstante, la tercera parte de los usuarios de drogas inyectables se encuentran infectados por alguno de los virus, vinculado a conductas de riesgo propias de este colectivo. Summary In Uruguay seroprevalence of HIV, hepatitis B and C virus infections are clearly higher in populations at risk. An appropiate management of these infections requires kowledge of these conditiones and their posible causes. The aim of the paper is to determine the prevalence of HIV, hepatitis B and C virus infections among intravenous drug users, older than 18 years, living in Montevideo metropolitan area in 2003; and to analize the influence of intravenous drugs, sexual practices and other behaviours on this prevalence. A sample of 200 users living in the metropolitan area of Montevideo, older than 18 years, that started injections after 1980 was selected by a snowball method from October to December 2003. A prevalence study was designed using primary data, by interviews and serologic studies. Risk practices were analized by relative prevalence (RP) and 95 percent confidence interval. Chi-square Mantel Haenszel Statistics was used to determine statistics associations (p

Introducción: las infecciones respiratorias agudas bajas constituyen una importante causa de muerte en menores de cinco años. En los niños menores de dos años, de 70 a 90% son de causa viral. Si bien el adenovirus determina de 2 a 5% de estas infecciones, su importancia radica en la alta mortalidad, vinculada fundamentalmente a brotes intrahospitalarios. Objetivo: describir las características clínicas , radiológicas y evolutivas de los niños menores de dos años, hospitalizados con infecciones respiratorias agudas bajas por adenovirus en el Centro Hospitalario Pereira Rossell durante dos períodos: mayo-noviembre de 1998 y mayo-setiembre de 1999 Métodos: el diagnóstico virológico se realizó en muestras de aspirado nasofaríngeo por detección de antígenos virales mediante inmunofluorescencia. En 1999 se realizó aislamiento viral en cultivo. Resultados: se identificó adenovirus en 28 niños: por inmunofluorescencia en 25 y por cultivo celular en 10. Correspondieron a infecciones intrahospitalarias seis de 18 diagnosticadas en 1998 y una de nueve diagnosticadas en 1999. Predominaron los niños menores de seis meses, eutróficos, sin antecedentes patológicos previos. Los síntomas más frecuentes fueron tos, polipnea, tirajes y fiebre prolongada. Los hallazgos radiológicos más frecuentes fueron infiltrado intersticial e hiperinsuflación; nueve tenían consolidación. Diez de 27 niños requirieron cuidado intensivo, cinco de ellos habían adquirido la infección en el hospital. Fallecieron cuatro niños y otros cinco pacientes quedaron oxígenodependientes. Conclusión: sospechar tempranamente esta infección e implementar estrategias que incluyan diagnóstico viral podría evitar la IIH con la consiguiente morbimortalidad. Destinar recursos para ello, inclinará el balance final costo-beneficio a nivel individual, institucional y social. Resumo Introdução: as infecções respiratórias agudas baixas (IRAB) constituem uma importante causa de morte em crianças de 5 anos. Nas crianças com menos de 2 anos o 70 - 90 % são de origem viral. Embora adenovirus determine o 2 - 5 % destas infecções, sua importância radica na alta mortalidade vinculada fundamentalmente a causas intrahospitalárias. Objetivo: descrever as características clínicas , radiológicas e evolutivas das crianças com menos de 2 anos, hospitalizadas com IRAB por adenovirus no Centro Hospitalário Pereira Rossell durante 2 períodos: maio-novembro de 1998 e maio-setembro de 1999. Métodos: o diagnóstico virológico realizou-se em amostras de aspirado nasofaríngeo por presença de antígenos virais por imunofluorescência (IF). Em 1999 realizou-se isolamento viral em cultivo. Resultados: identificou-se adenovirus em 28 crianças: por (IF) em 25 e por cultivo celular em 10. Corresponderam a infecções intrahospitalárias (IIH) 6 de 18 diagnosticadas em 1998 e 1 de 9 diagnosticadas en 1999. Predominaram as crianças com menos de 6 meses, eutróficos, sem antecedentes patológicos prévios. Os síntômas mais freqüentes foram tosse, polipnea, tiragem e febre prolongada. Os registros radiológicos mais freqüentes foram infiltrado intersticial e hiperinsuflação; 9 tinham consolidação. Dez de 27 crianças estiveram com cuidado intensivo, 5 de essas tinham adquirido a infecção no hospital. Faleceram 4 meninos e outros 5 pacientes ficaram oxígenodependentes. Conclusão: suspeitar antecipadamente esta infecção e implementar estratégias que incluam diagnóstico viral, poderia evitar a IIH com a conseguinte morbimortalidade. Destinar meios para este fim terá um benefício a nível individual, institucional e social. Summary Introduction: acute lower respiratory infections (ALRI) represent an important cause of death in children under 5 years of age. In children under 2 years of age the aetiology is viral in 70-90% of the cases. Although adenoviruses only cause 2 - 5% of these they are of a significant importance because they have a high mortality rate, primarily linked to nosocomial outbreaks. Objective: we present the clinical and radiological characteristics of the disease and the outcome of children under two years of age affected by ALRI caused by adenovirus infections at the Centro Hospitalario Pereira Rossell during 2 different periods: May-November 1998 and May-September 1999. Methods: virological diagnosis was performed on nasopharyngeal aspirates by viral antigen detection with immunofluorescence (IF). Viral culture and isolation was also performed during the May-September 1999 period. Results: adenovirus infection was proven in 28 children, 25 cases with IF and in 10 cases with cell culture. In 6 of the 18 1998 cases and 1 of 1999 the infection was nosocomial. Most of the children were under 6 years of age at the time of infection, previously healthy and well nourished. The most frequent symptoms were cough, polypnea, chest retraction and prolonged fever. The most frequent radiological findings were interstitial infiltrates and hyperinsuflation, 9 cases showed images of dense consolidation. 10 out of 27 children were admitted to intensive care for respiratory support, 5 of which correspond to the nosocomial infection group. Four children died and five remained oxygen-dependent. Conclusion: the early suspicion of adenoviral infection and a management strategy that includes viral isolation and diagnosis could help diminish nosocomial infections and its related morbidity and mortality. The allocation of adequate financing should result in a great individual, institutional and social benefit.

Introducción: el virus respiratorio sincicial es el agente patógeno detectado con más frecuencia en niños hospitalizados por infección respiratoria aguda baja. Las recomendaciones para profilaxis han sido usadas para lactantes con alto riesgo de enfermedad severa por virus respiratorio sincicial. Nuestra hipótesis fue que niños sin factores de riesgo pueden desarrollar enfermedad severa por virus respiratorio sincicial. Objetivo: el objetivo del presente estudio fue determinar la incidencia de virus respiratorio sincicial en infección respiratoria aguda baja graves en niños menores de 90 días de edad y evaluar las características de dicha población. Método: se realizó un estudio prospectivo, descriptivo, entre el 1 de abril y el 30 de setiembre de 2000. Fueron incluidos todos los pacientes menores de 90 días con infección respiratoria aguda baja que presentaban signos de falla respiratoria y requirieron admisión en la Unidad de Reanimación y Estabilización del Departamento de Emergencia Pediátrica. Muestras de aspirado nasofaríngeo fueron testadas mediante inmunofluorescencia directa y cultivos celulares para identificar virus respiratorio sincicial. Resultados: fueron enrolados un total de 61 pacientes; fue detectado virus respiratorio sincicial en aspirado nasofaríngeo en 34 de ellos (56%). Tres prematuros (menores de 32 semanas) fueron excluidos del análisis por tratarse de niños con factores de riesgo (n=31). Los datos demográficos fueron los siguientes: varones 21/31 (68%); edad rango (media) 6-90 (40 días), 8/31 (26%) menores de 29 días; peso de nacimiento 1.510-4.160 g (2.990 g); edad gestacional 33-40 (38 semanas); alimentación materna exclusiva 14/31 (45%); medio socioeconómico deficitario 26/31 (84%); bien nutridos 25/31 (81%); peso 2.500-6.600 g (4.300 g); cultivos positivos al virus respiratorio sincicial 13/31 (42%); derivación a unidad de cuidado intensivo 24/31 (77%), 22 sin antecedentes patológicos, 21 de término; 18 bien nutridos; ocho menores de 29 días; 16 mayores de 29 días (p=0,052); media de estadía en UCI 6,7 días; asistencia ventilatoria mecánica 12/31 (39%); mortalidad 0/31. Conclusiones: en esta serie el virus respiratorio sincicial es responsable de más de la mitad (56%) de las infecciones respiratorias agudas bajas en niños menores de 90 días que llegan al hospital con severa falla respiratoria. Las infecciones severas por este virus no solo afectan niños de alto riesgo sino también a los de término, previamente sanos, bien controlados, eutróficos y con alimentación materna exclusiva, al menos en el grupo procedente de un medio socioeconómico deficitario asistido en el hospital público. Introdução: o vírus respiratório sincicial é o patógeno detectado com mais frequência em crianças hospitalizadas por infeção respiratória aguda baixa. As recomendações para profilaxia tem sido usadas para lactentes com alto risco de doença severa por vírus respiratório sincicial. Nossa hipótese foi que crianças sem fatores de risco podem desenvolver doença severa por vírus respiratório sincicial. Objetivo: o objetivo deste estudo foi determinar a incidência de vírus respiratório sincicial em infeção respiratória aguda baixa graves em crianças com menos de 90 dias de idade e avaliar as caraterísticas desta população. Método: realizou-se um estudo prospectivo, descritivo, entre 01/04/2000 e 30/09/2000. Foram incluídos todos os pacientes com menos de 90 dias com infeção respiratória aguda baixa que apresentavam sinais de falha respiratória e requeriram admissão na URE do DEP. Amostras de aspirado naso-faringeo foram testadas mediante inmunofluorescência direta e cultivos celulares para identificar vírus respiratório sincicial. Resultados: um total de 61 pacientes foram estabelecidos; vírus respiratório sincicial foi detectado em aspirado naso-faringeo em 34 deles (56%). Três prematuros (

The analysis of genetic diversity in SARS‐CoV‐2 is the focus of several studies, providing insights into how the virus emerged and evolves. Most common changes in SARS‐CoV‐2 are single or point nucleotide substitutions; meanwhile, insertions and deletions (indels) have been identified as a less frequent source of viral genetic variability. Here, we report the emergence of a 12‐nucleotide deletion in ORF7a, resulting in a 4‐amino acid in‐frame deletion. The Δ12 variant was identified in viruses from patients of a single outbreak and represents the first report of this deletion in South American isolates. Phylogenetic analysis revealed that Δ12 strains belong to the lineage B.1.1 and clustered separated from the remaining Uruguayan strains. The ∆12 variant was detected in 14 patients of this outbreak by NGS sequencing and/or two rapid and economic methodologies: Sanger amplicon sequencing and capillary electrophoresis. The presence of strong molecular markers as the deletion described here are useful for tracking outbreaks and reveal a significant aspect of the SARS‐CoV‐2 evolution on the robustness of the virus to keep its functionality regardless loss of genetic material.

Two severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) variants associated with increased transmission and immune evasion, P.1 and P.2, emerged in Brazil and spread throughout South America. Here, we report genomes corresponding to these variants that were recently detected in Uruguay. These P.1 and P.2 genomes share all substitutions that are characteristic of these variants.