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Additional file 1: Table S1. Genetic variants in vitamin pathway associated with atopy or asthma, or 25 (OH) D serum levels. Table S2. Genotypic Frequency of associates SNV’s in vitamin D pathway by outcomes.

Submitted by Maria Creuza Silva (mariakreuza@yahoo.com.br) on 2014-10-03T18:26:58Z No. of bitstreams: 1 TESE FINAL GUSTAVO COSTA. 2014.pdf: 2966354 bytes, checksum: 03e2bef54d23cadea3e32bfc6a5e8093 (MD5) Approved for entry into archive by Maria Creuza Silva (mariakreuza@yahoo.com.br) on 2014-10-07T14:06:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE FINAL GUSTAVO COSTA. 2014.pdf: 2966354 bytes, checksum: 03e2bef54d23cadea3e32bfc6a5e8093 (MD5) Made available in DSpace on 2014-10-07T14:06:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE FINAL GUSTAVO COSTA. 2014.pdf: 2966354 bytes, checksum: 03e2bef54d23cadea3e32bfc6a5e8093 (MD5) As doenças complexas são aquelas cujas manifestações, dependem da exposição a múltiplos fatores ambientais e sociais e a fatores genéticos. Os estudos epidemiológicos clássicos são incapazes de abranger todos estes fatores que determinam uma doença complexa. Houve a necessidade de novas abordagens metodológicas que preenchesse esta lacuna. Neste contexto, a epidemiologia genética surgiu como uma área com grandes perspectivas de avanços no que corresponde a melhor compreensão destas doenças. É um campo que busca ampliar o conhecimento tradicional da epidemiologia nos determinantes de doenças e, em especial, nos efeitos conjuntos de determinantes genéticos, ambientais e sociais. Este campo se ampliou com o desenvolvimento da genômica e de suas técnicas de varredura do material genético dos indivíduos. Grandes esforços da comunidade científica internacional têm sido feitos para determinar a arquitetura genética de diversas doenças complexas A mãe da criança, entre as quais incluem-se a asma e as alergias. A causalidade genética vem ganhando cada vez mais importância no entendimento da asma e alergias e apesar da descoberta de diversos genes associados a estes desfechos a reprodutibilidade nos estudos de gene candidato é baixa. No Brasil, o projeto SCAALA (Social Changes, Asthma and Allergy in Latin America Programme) vem contribuindo com informações importantes para a compreensão dos fatores ambientais e sociais relacionados a prevalência de asma e alergias em uma população miscigenada. Isto criou oportunidade para desenvolvermos um estudo sobre fatores genéticos que possa contribuir para o entendimento da alta ocorrência de asma e alergias nesta população. A tese foi desenvolvida sob a forma de três artigos, o primeiro teve como objetivos estudar os efeitos de fatores de risco genéticos no desenvolvimento dos sintomas de asma, através de uma análise exploratória, por varredura genômica, além disso, visava estimar a herdabilidade e identificar possíveis rotas metabólicas associadas a sintomas de asma. O segundo artigo teve como objetivo estudar os efeitos de fatores de risco genéticos no surgimento da atopia através da análise de um painel com alta densidade de polimorfismos genéticos numa população susceptivel a niveis elevados de IgE especifica, estimar pequenos efeitos genéticos e inferir rotas metabólicas associadas a atopía. O terceiro artigo teve como objetivo confirmar o papel das variantes genéticas da região 17q21 nos sintomas de asma na infância em uma população urbana de crianças latino-americanas, e explorar as interações com atopia e outras exposições selecionadas pela sua relevância.

Submitted by Yasmim Almeida (yasmim.almeida@ufba.br) on 2021-07-12T14:14:59Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO-YASMIM-PPGPIOS.pdf: 2107549 bytes, checksum: 7625c02a82e45595e1600ef0365eb4eb (MD5) Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2021-07-27T14:30:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO-YASMIM-PPGPIOS.pdf: 2107549 bytes, checksum: 7625c02a82e45595e1600ef0365eb4eb (MD5) Made available in DSpace on 2021-07-27T14:30:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO-YASMIM-PPGPIOS.pdf: 2107549 bytes, checksum: 7625c02a82e45595e1600ef0365eb4eb (MD5) FAPESB Introdução: a endoglina (ENG, CD105) é um correceptor integrante da família do fator de crescimento transformante-beta e participa da regulação de processos celulares como proliferação, diferenciação, migração e apoptose. ENG é mais conhecida por sua expressão em células endoteliais, desempenhando papel importante na angiogênese e na vasculogênese, porém sua expressão diferencial já foi associada a desfechos patogênicos, inclusive devido a mutações no gene ENG. Objetivos: descrever a frequência de variantes genéticas em ENG, analisar a distribuição da frequência alélica de populações pseudoancestais, analisar funcionalmente in silico as variantes genéticas em ENG e descrever as variantes genéticas que possam estar envolvidas em processos patogênicos descritos em outras populações. Metodologia: utilizamos os bancos de dados genômicos dos projetos SCAALA e ProAR, para o presente estudo descritivo. A informação genética foi extraída e as análises genéticas descritivas e funcional in silico foram realizadas através de programas livres e plataformas on-line. Resultados: foram analisadas 85 variantes genéticas, dessas, 50 variantes apresentaram alelo de menor frequência (MAF) entre 0% e 50% e 32 variantes foram monomórficas. As frequências das variantes genéticas, no geral, foram intermediárias entre as frequências de populações africanas e europeias. As análises funcionais in silico indicaram que, entre as 33 variantes missense extraídas, 10 apresentaram escore prejudicial. Conclusão: variantes genéticas em ENG, descritas no presente trabalho, foram previamente associadas com os alelos mais frequentes em outras populações ao fenótipo de malformação arteriovenosa cerebral esporádica, telangiectasia hereditária hemorrágica tipo 1 com apresentação de malformação arteriovenosa pulmonar e à pré-eclâmpsia. Estudos adicionais sobre os mecanismos funcionais desse gene são necessários, uma vez que a ENG participa de uma série de processos celulares importantes e mais esforços devem ser feitos para estudos genéticos na população brasileira, considerando a miscigenação dessa população.

Submitted by Pós Imunologia (ppgimicsufba@gmail.com) on 2017-07-31T18:17:37Z No. of bitstreams: 1 Héllen 2016 DISSERTAÇÃO.pdf: 2773118 bytes, checksum: 499f85579cfcd2c7ee95032bfea51e33 (MD5) Approved for entry into archive by Edvaldo Souza (edvaldosouza@ufba.br) on 2017-08-01T20:42:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Héllen 2016 DISSERTAÇÃO.pdf: 2773118 bytes, checksum: 499f85579cfcd2c7ee95032bfea51e33 (MD5) Made available in DSpace on 2017-08-01T20:42:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Héllen 2016 DISSERTAÇÃO.pdf: 2773118 bytes, checksum: 499f85579cfcd2c7ee95032bfea51e33 (MD5) CAPES, FAPESB Evidências sugerem um potencial papel da citocina imunoreguladora IL-10 numa variedade de doenças humanas, incluindo a asma. Esta citocina exerce um papel importante na regulação da atividade dos principais subtipos celulares e citocinas diretamente envolvidas nas reações alérgicas. Nesta perspectiva, polimorfismos (SNPs) no gene da IL-10 podem afetar a produção desta citocina implicando na ocorrência de asma e atopia. O objetivo deste estudo foi investigar o impacto de polimorfismos no gene da IL-10 sobre os níveis de produção da citocina, e associálos a atopia e aos diferentes fenótipos de asma em adultos asmáticos. Para isso, foi extraído DNA do sangue periférico de 1.406 indivíduos participantes de um estudo caso-controle do Núcleo de Excelência em Asma da Bahia e as amostras foram genotipadas por TaqMan®. Testamos possíveis associações entre SNPs da IL-10 com asma, citocina e teste cutâneo (SPT), utilizando, para tanto, regressões logísticas ou lineares quando apropriadas, ajustadas por sexo, idade, cor da pele e infecções helmínticas utilizando o software PLINK 1.9. Os níveis de IL-10 no plasma foi significativamente maior (p

Submitted by Pós Imunologia (ppgimicsufba@gmail.com) on 2017-07-31T18:57:58Z No. of bitstreams: 1 ANAQUE DISSERTAÇÃO - Versão Final - 21.03.2017.pdf: 2518048 bytes, checksum: 7c8b38757c1fbbd07024d5cfe3bd76ad (MD5) Approved for entry into archive by Edvaldo Souza (edvaldosouza@ufba.br) on 2017-08-01T20:30:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ANAQUE DISSERTAÇÃO - Versão Final - 21.03.2017.pdf: 2518048 bytes, checksum: 7c8b38757c1fbbd07024d5cfe3bd76ad (MD5) Made available in DSpace on 2017-08-01T20:30:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ANAQUE DISSERTAÇÃO - Versão Final - 21.03.2017.pdf: 2518048 bytes, checksum: 7c8b38757c1fbbd07024d5cfe3bd76ad (MD5) CNPQ A asma alérgica é uma morbidade de relevante impacto mundial que afeta milhões de indivíduos. É uma doença complexa que envolve a combinação de fatores ambientais e genéticos que são determinantes de seu desenvolvimento. Muitos genes têm sido reportados por estarem envolvidos com asma e atopia, dentre eles os genes DAD1 e OXA1L, presentes no cromossomo 14, que podem também estar envolvidos a essas condições. O gene DAD1 é considerado um regulador negativo da apoptose e OXA1L é reportado por seu envolvimento na biogênese e fosforilação oxidativa mitocondrial. Não existem dados na literatura que demonstrem variantes nesses genes associados com essas morbidades. Desta forma, sabendo-se da importância da apoptose e biogênese mitocondrial na reposta inflamatória da asma e alergia, polimorfismos nesses genes podem estar associados como fatores de risco ou proteção para seu desenvolvimento. Portanto, o objetivo deste estudo é avaliar se polimorfismos em DAD1 e OXA1L estão associados com asma e marcadores de atopia na população do SCAALA do inglês (Social Change Asthma and Allergy in Latin America) e qual o impacto funcional destas variantes, uma vez que estejam associadas com estes desfechos. O DNA de 1.307 indivíduos foram genotipados usando Illumina 2.5 Human Omni Bead chip. Foram realizadas análises de regressão logística a fim de avaliar a associação de variantes em DAD1 e OXA1L com asma e marcadores de alergia utilizando software PLINK 1.9 ajustados por sexo, idade, infecções helmínticas e marcadores de ancestralidade no modelo aditivo. O alelo G do SNP rs1681577 do DAD1 foi negativamente associado com asma (OR: 0.80; IC: 0.64 – 0.99; p: 0.039). Além disso, o alelo A do rs17119961 foi positivamente associado com teste cutâneo para P. americana (OR: 2.13; IC: 1.36 – 3.32; p