7 results on '"Da Silva Abdou Malik"'
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2. A rapid and sensitive method to detect Toxoplasma gondii oocysts in soil samples
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Escotte-Binet, Sandie, Da Silva, Abdou Malik, Cancès, Benjamin, Aubert, Dominique, Dubey, Jitender, La Carbona, Stéphanie, Villena, Isabelle, and Poulle, Marie-Lazarine
- Published
- 2019
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3. Soil contamination by Echinococcus multilocularis in rural and urban vegetable gardens in relation to fox, cat and dog faecal deposits
- Author
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Da Silva Abdou Malik, Bastien Matthieu, Umhang Gérald, Boué Franck, Bastid Vanessa, Boucher Jean-Marc, Caillot Christophe, de Garam Carine Peytavin, Renault Camille, Faisse Marine, Courquet Sandra, Scalabrino Vincent, Millon Laurence, Knapp Jenny, and Poulle Marie-Lazarine
- Subjects
environmental contamination ,soil-transmitted parasites ,foodborne parasites ,copro-qpcr ,soil flotation ,Infectious and parasitic diseases ,RC109-216 - Abstract
Echinococcus multilocularis eggs are deposited on the ground with the faeces of the carnivore definitive hosts. A reliable assessment of the spatial distribution of E. multilocularis eggs in environments used by humans is crucial for the prevention of alveolar echinococcosis (AE). This study was conducted in 192 rural and 71 urban vegetable gardens in AE endemic areas of north-eastern France. Its objective was to explore the relationship between the spatial distribution of E. multilocularis estimated from the collection and molecular analysis of two types of samples: faeces and soil. A total of 1024 carnivore faeces and 463 soil samples were collected and analysed by real-time PCR. No fox droppings and no positive soil samples were collected from the urban gardens. Positive soil samples, positive carnivore faeces, or both, were found in 42%, 24% and 6% of the sampled rural gardens, respectively. No significant association was found between the detection of E. multilocularis in soil samples collected from 50 gardens during a single sampling session and the extent and frequency of deposits of fox and cat faeces collected during repeated sampling sessions conducted in the previous months. In 19/50 gardens, E. multilocularis was detected in the soil while no positive faeces had been collected in the previous 12 months. Conversely, in 8/50 gardens, no soil samples were positive although positive faeces had been collected in the previous months. Collecting and analysing faeces provide information on soil contamination at a given time, while analysing soil samples provides an overview of long-term contamination.
- Published
- 2021
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4. Assessment of the Genetic Diversity of Echinococcus multilocularis from Copro-Isolated Eggs
- Author
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Knapp, Jenny, primary, Da Silva, Abdou Malik, additional, Courquet, Sandra, additional, and Millon, Laurence, additional
- Published
- 2021
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5. Etude du rôle des hôtes définitifs impliqués dans la contamination environnementale par Echinococcus multilocularis en zone d’endémie
- Author
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da Silva, Abdou Malik and STAR, ABES
- Subjects
Copro-Génotypage ,Environmental contamination ,Individual identification ,Carnivore faeces ,[SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases ,Copro-genotyping ,Echinococcus multilocularis ,Fèces de carnivores ,Contamination environnementale ,Identification individuelle ,Persistance ,[SDV.MP.PAR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology - Abstract
Alveolar echinococcosis remains an expanding zoonosis despite improved sanitary measures, changing dietary habits and decreasing populations in the most at-risk socio-economic categories. Environmental contamination with Echinococcus multilocularis, the parasite responsible for this zoonosis, and the risk of infection for humans depend on the distribution of carnivore faeces, as definitive hosts of the parasite. This study aimed to characterise the contribution of foxes, dogs and cats to environmental contamination with E. multilocularis in endemic area. The presence of E. multilocularis eggs was confirmed most significantly in fox faeces. Furthermore, our studies demonstrated local spatial heterogeneity in the exposure risk to E. multilocularis eggs via fox faeces, which represents a key parameter in the local transmission of the parasite. In addition, investigation of soil contamination with E. multilocularis in vegetable gardens suggests that E. multilocularis eggs could persist for at least one year after the disappearance of faeces carrying the parasite. Individual contribution of foxes to environmental contamination with E. multilocularis was explored by genotyping their faeces with microsatellite markers. Among infested foxes, we identified a few individuals (35%) that deposited the majority of faeces tested positive for E. multilocularis (60%). Finally, the identification of EmsB genetic profiles of E. multilocularis eggs isolated from definitive host faeces suggests transmission of the parasite from foxes, then considered as a local reservoir, to dogs and cats via predation of the local rodent population. The whole study demonstrates the major role of the sylvatic cycle perpetuated by foxes in maintaining the synanthropic cycle of the parasite. It seems then measures to control E. multilocularis abundance in the field must necessarily cover the territory of fox individuals that are super-spreaders for the parasite in order to s ucceed in interrupting the local cycle of the parasite., L’échinococcose alvéolaire demeure une zoonose en expansion malgré l’amélioration des mesures sanitaires, le changement des habitudes alimentaires et la diminution des populations des catégories socio-économiques les plus à risque. La contamination de l’environnement par Echinococcus multilocularis, le parasite responsable de cette zoonose, et le risque d’infection pour l’homme dépendent de la distribution des fèces des carnivores hôtes définitifs du parasite. Cette étude visait à caractériser la contribution des renards, chiens et chats dans la contamination environnementale par E. multilocularis en zone d’endémie. La présence des œufs d’E. multilocularis a été confirmée plus significativement dans les fèces de renards. De plus, nos travaux ont démontré une hétérogénéité spatiale locale du risque d’exposition aux œufs d’E. multilocularis via les fèces de renards, ce qui représente un paramètre clé dans la transmission locale du parasite. Par ailleurs, l’étude de la contamination des sols de potagers par E. multilocularis laisse penser que les œufs du parasite pouvaient persister pendant au moins une année après la disparition des fèces porteuses du parasite. La contribution individuelle des renards dans la contamination de l’environnement par E. multilocularis a été explorée par l’identification de leurs fèces par génotypage à l’aide de marqueurs microsatellites. Parmi les renards infestés, nous avons mis en évidence quelques individus (35%) ayant déposé la majorité des fèces testées positives pour E. multilocularis (60%). Enfin, l’identification des profils génétiques EmsB des œufs d’E. multilocularis isolés des fèces des hôtes suggère une transmission du parasite des renards, alors considérés comme un réservoir local du parasite, vers les chiens et chats via la prédation d’une même population locale de rongeurs. L’ensemble du travail démontre le rôle majeur du cycle sylvatique entretenu par les renards dans le maintien du cycle syna nthropique du parasite. Il semble alors que les mesures de contrôle d’abondance d’E. multilocularis sur le terrain doivent nécessairement couvrir le territoire des renards super-propagateurs du parasite pour espérer interrompre le cycle local du parasite.
- Published
- 2021
6. Génotypage par le microsatellite EmsB sur oeufs isolés d'Echinococcus multilocularis : diversité génétique chez un hôte définitif et au niveau local
- Author
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Da Silva, Abdou Malik, COURQUET, Sandra, MILLON, Laurence, RIEFFEL, Dominique, Giraudoux, Patrick, Raoul, Francis, Knapp, Jenny, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), and Société Française de Parasitologie
- Subjects
[SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health - Abstract
National audience; Echinococcus multilocularis (Em) est un cestode Responsable de l’échinococcose alvéolaire.Les carnivores hôtes définitifs abritent les vers adultes qui produisent des œufs (formes infectantes des rongeurs et de l’homme) répandus dans l’environnement avec les fèces. L’utilisation de marqueurs moléculaires permet d’identifier et de suivre des variants génétiques parasitaires dans la population vulpine. Cependant l’ADN est souvent extrait des vers adultes impliquant un piégeage et une autopsie pratiqués sur les carnivores. Nous avons développé une approche non invasive qui a consisté à typer un à un les œufs contenus dans des fèces de renard, chien et chat testées positives par une qPCR spécifique d’Em et à étudier leur variabilité génétique à l'aide du microsatellite EmsB. Des œufs d’Em ont été isolés par flottaison dans 1/3 (31/96) des fèces de carnivores (70 de renard, 15 de chien, 6 de chat) collectées dans un village situé en zone d’endémie de l’échinococcose alvéolaire (département du Doubs) et testées positives par la qPCR. En analyses préliminaires, 18 œufs isolés `a partir de 6 fèces de renard (1 à 4 œufs par fèces) présentaient 3 profils EmsB différents notifiés précédemment dans la région d’étude, en France et en Europe. Ces données confirment que la présence d’ADN du parasite ne présume pas de la présence des œufs. Une confirmation par flottaison est alors nécessairepour estimer le risque infectieux. Dans cette approche non invasive, l’isolement individuel des œufs a permis de mettre en évidence pour la première fois des profils EmsB à partir des fèces.
- Published
- 2019
7. Soil contamination by Echinococcus multilocularisin rural and urban vegetable gardens in relation to fox, cat and dog faecal deposits
- Author
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Da Silva, Abdou Malik, Bastien, Matthieu, Umhang, Gérald, Boué, Franck, Bastid, Vanessa, Boucher, Jean-Marc, Caillot, Christophe, de Garam, Carine Peytavin, Renault, Camille, Faisse, Marine, Courquet, Sandra, Scalabrino, Vincent, Millon, Laurence, Knapp, Jenny, Poulle, Marie-Lazarine, Da Silva, Abdou Malik, Bastien, Matthieu, Umhang, Gérald, Boué, Franck, Bastid, Vanessa, Boucher, Jean-Marc, Caillot, Christophe, de Garam, Carine Peytavin, Renault, Camille, Faisse, Marine, Courquet, Sandra, Scalabrino, Vincent, Millon, Laurence, Knapp, Jenny, and Poulle, Marie-Lazarine
- Abstract
Echinococcus multiloculariseggs are deposited on the ground with the faeces of the carnivore definitive hosts. A reliable assessment of the spatial distribution of E. multiloculariseggs in environments used by humans is crucial for the prevention of alveolar echinococcosis (AE). This study was conducted in 192 rural and 71 urban vegetable gardens in AE endemic areas of north-eastern France. Its objective was to explore the relationship between the spatial distribution of E. multilocularisestimated from the collection and molecular analysis of two types of samples: faeces and soil. A total of 1024 carnivore faeces and 463 soil samples were collected and analysed by real-time PCR. No fox droppings and no positive soil samples were collected from the urban gardens. Positive soil samples, positive carnivore faeces, or both, were found in 42%, 24% and 6% of the sampled rural gardens, respectively. No significant association was found between the detection of E. multilocularisin soil samples collected from 50 gardens during a single sampling session and the extent and frequency of deposits of fox and cat faeces collected during repeated sampling sessions conducted in the previous months. In 19/50 gardens, E. multiloculariswas detected in the soil while no positive faeces had been collected in the previous 12 months. Conversely, in 8/50 gardens, no soil samples were positive although positive faeces had been collected in the previous months. Collecting and analysing faeces provide information on soil contamination at a given time, while analysing soil samples provides an overview of long-term contamination.
- Published
- 2021
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