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28 results on '"David, Sarah-Anne"'

1. Thermal Manipulation During Embryogenesis Impacts H3K4me3 and H3K27me3 Histone Marks in Chicken Hypothalamus

Author

David, Sarah-Anne, primary, Vitorino Carvalho, Anaïs, additional, Gimonnet, Coralie, additional, Brionne, Aurélien, additional, Hennequet-Antier, Christelle, additional, Piégu, Benoît, additional, Crochet, Sabine, additional, Couroussé, Nathalie, additional, Bordeau, Thierry, additional, Bigot, Yves, additional, Collin, Anne, additional, and Coustham, Vincent, additional

Published
2019
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2. Analyse bioinformatique des marques d'histone chez le poulet exposé à la chaleur pendant l'incubation

Author

Gimonnet, Coralie, David, Sarah-Anne, Vitorino Carvalho, Anais, Piegu, Benoit, Hennequet-Antier, Christelle, Brionne, Aurélien, Bigot, Yves, Collin, Anne, Coustham, Vincent, Biologie des Oiseaux et Aviculture (BOA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, adaptation à la chaleur, [SDV]Life Sciences [q-bio], poulet, incubation des oeufs, [INFO]Computer Science [cs], histone, bioinformatique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2019

3. Epigenome-wide analysis of the impact of a thermal manipulation treatment on avian embryo

Author

David, Sarah-Anne, Vitorino Carvalho, Anais, Gimonnet, Coralie, Crochet, Sabine, Bordeau, Thierry, Gataud, Flora, Piegu, Benoit, Hennequet-Antier, Christelle, Brionne, Aurélien, Mersch, Marjorie, Bigot, Yves, Pitel, Frédérique, Collin, Anne, Coustham, Vincent, Biologie des Oiseaux et Aviculture (BOA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
epigénétique, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], oiseau, [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, environnement
Abstract

National audience

Published
2018

4. Impact de la thermo-manipulation embryonnaire sur l'aposition de H3K27ME3 et H3K4ME3 dans l'hypothalamus de poulet agé de 35 jours

Author

David, Sarah-Anne, Vitorino Carvalho, Anais, Gimonnet, Coralie, Couroussé, Nathalie, Crochet, Sabine, Bordeau, Thierry, Piegu, Benoit, Hennequet-Antier, Christelle, Brionne, Aurélien, Bigot, Yves, Collin, Anne, Coustham, Vincent, Biologie des Oiseaux et Aviculture (BOA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département INRA PHASE, Région Centre Val-de-Loire, Financement INRA sur crédit incitatif « Stressepimark » (2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
stress thermique, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], poulet, [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, embryon de poulet
Abstract

National audience

Published
2018

5. Analyse bioinformatique des modifications post-traductionnelles des histones chez le poulet thermomanipulé durant l'embryogenèse

Author

Gimonnet, Coralie, David, Sarah-Anne, Vitorino Carvalho, Anais, Piégu, Benoît, Hennequet-Antier, Christelle, Brionne, Aurélien, Bigot, Yves, Collin, Anne, COUSTHAM, Vincent, Biologie des Oiseaux et Aviculture (BOA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INRA PHASE, Financement INRA sur crédit incitatif « Stressepimark » (2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
stress thermique, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, poulet, embryogénèse, histone, Sciences agricoles, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Agricultural sciences, embryon de poulet
Abstract

National audience

Published
2018

7. Impact of embryonic thermal manipulation on quail transcriptome and methylome

Author

Vitorino Carvalho, Anais, Couroussé, Nathalie, Crochet, Sabine, David, Sarah-Anne, Bordeau, Thierry, Godet, Estelle, Piégu, Benoît, Hennequet-Antier, Christelle, Brionne, Aurélien, Noirot, Celine, Bigot, Yves, Pitel, Frederique, Collin, Anne, Coustham, Vincent, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
thermal manipulation, DNA methylation, epigenetics, méthylation de l'adn, chicken, [SDV]Life Sciences [q-bio], quail, transcriptome, poulet, incubation des oeufs, coturnix japonica, embryogenèse, effet thermique, caille, thermal stimulation, phénotype, épigénétique, stimulation thermique, température, thermal effect
Abstract

Impact of embryonic thermal manipulation on quail transcriptome and methylome. Incubation and Fertility Research Group (IFRG). Fundamental Physiology and Perinatal Development Group (WPSA)

Published
2017

8. Epigenetics for heat tolerance

Author

Collin-Chenot, Anne, David, Sarah-Anne, Pitel, Frederique, Piégu, Benoît, Hennequet-Antier, Christelle, Carvalho, Anais, Loyau, Thomas, Nyuiadzi, Dzidzo, Noirot, Celine, Bigot, Yves, Tona, Jacob Kokou, Coustham, Vincent, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), CERSA, Université de Lomé [Togo], Agence Nationale de la Recherche Projets ‘Jeunes Chercheuses et Jeunes Chercheurs’ ANR-09-JCJC-0015-01 THERMOCHICK et ANR-15-CE02-0009 QuailHeatE, INRA Departements PHASE et GA, projets Epitherm et StressEpiMark, métaprogramme INRA Gestion Intégrée de la Santé des Animaux Projet GISA-ROBUSTCHICK (www.gisa.inra.fr/en). PPAAO Togo, Région Centre Val de Loire, MESR, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
épigénétique, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, oiseau, food and beverages, élevage, reproductive and urinary physiology, health care economics and organizations, humanities, résistance à la température
Abstract

Epigenetics for heat tolerance. Symposium CERSA Poultry Production under ho and humid climate conditions

Published
2017

9. Impact of embryonic heat conditioning on bird epigenome

Author

Couroussé, Nathalie, Carvalho, Anais, Crochet, Sabine, David, Sarah-Anne, Bordeau, Thierry, Godet, Estelle, Piegu, Benoit, Hennequet-Antier, Christelle, Noirot, Celine, Bigot, Yves, Pitel, Frederique, Collin, Anne, Coustham, Vincent, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
animal structures, bird, épigénétique, epigenetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], température, quail, épigénome, caille, environment, transcriptome, perinatal, expression des gènes
Abstract

Changes in gene activity through epigenetic alterations induced by early environmental challenges during the embryogenesis are known to impact the phenotype, health and disease risk of animals. The epigenome is therefore an essential contributor to phenotypic plasticity, and learning how environmental exposures translate into persisting epigenetic changes may open new doors to improve robustness and resilience of developing animals. Birds are agronomic species of choice to directly manipulate the embryonic environment and study its consequences on the developing animal. We previously showed that the heat tolerance of male commercial chickens was improved by cyclically elevating the egg incubation temperature. This treatment named embryonic heat conditioning (HC) was associated with changes in gene expression that persisted during the development of chickens and enhanced gene expression response in case of heat challenge at slaughter age, 35 days post-hatch. To further explore the molecular basis of heat acclimation, we took advantage of an inbred line of japanese quails (Coturnix japonica) to investigate the impact of HC on bird methylome. Among other advantages, quail generation cycle is 3-4 time faster than chicken and the use of an inbred genotype should reduce the phenotype variations associated with genetic variability. We performed a characterization of HC on quail phenotype in interaction with a post-hatch heat stress at the onset of sexual maturity. Several parameters such as weight of the animals, temperature, egg laying for females, hormone levels and blood gas characteristics were measured. Concomitantly we investigated the impact of HC on quail transcriptome by RNA-seq and methylome by a whole genome bisulfite sequencing (WGBS) on brain tissues sampled at hatch. Analysis of the results is ongoing and preliminary data will be presented.

Published
2017

10. Resistance of reprogramming after nuclear transfer is mediated by multiple chromatin repressive pathways

Author

Beaujean, Nathalie, David, Sarah-Anne, Brochard, Vincent, Jullien, Jérôme, Gurdon, John, Institut cellule souche et cerveau / Stem Cell and Brain Research Institute (SBRI), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie du développement et reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Gurdon Institute, Wellcome Trust and Cancer Research, University of Cambridge, Institut cellule souche et cerveau (U846 Inserm - UCBL1), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and German Research Center for Environmental Health - Helmholtz Center München (GmbH). Neuherberg, DEU.

Subjects
nuclear transfer, clonage d'embryon, mice, transfert nucléaire, développement embryonnaire, [SDV]Life Sciences [q-bio], embryo, reprogrammation epigénétique, souris, development, epigenetic, foetal development, expression des gènes
Abstract

International audience; Reprogramming by Nuclear Transfer (NT) has caught the interest of many research groups due to the opportunity of testing nuclear potency. Moreover, the opportunity to clone by NT has been achieved in a variety of mammalian species and has potential applications for human health, improvement of agriculture species, protection of exotic and endangered species, as well as the advancement of basic biological research. On the other hand, the overall efficiency of producing live cloned offspring is quite low. Although many species can now be cloned, most SCNT embryos undergo developmental arrest before or soon after implantation and the success rate of live offspring production remains very low.Many studies are pointing out the different epigenetic constraints seen in NT embryos, such as aberrant DNA methylation patterns as well as abnormal histone modification patterns. Indeed, even though chromatin remodeling is imposed by the oocyte reprogramming factors on the donor nucleus, the switch from a “somatic” configuration to an embryonic one is often not well achieved. H3K9me3 and H3K27me3 are two repressive modifications suspected to be involved in the resistance to reprogramming after nuclear transfer. In our last study, we provide evidence that H2A ubiquitylation is also contributing to resistance to transcriptional reprogramming in mouse nuclear transfer embryos. We identified mouse genes that are resistant to reprogramming by oocyte factors and demonstrate that deubiquitylation of H2A upon USP21 over-expression can overcome this resistance.

Published
2017

11. Etude de l’impact de l’acclimatation embryonnaire à la chaleur du poulet de chair sur des modifications épigénétiques

Author

David, Sarah-Anne, Piégu, Benoît, Hennequet-Antier, Christelle, Bigot, Yves, Bordeau, Thierry, Crochet, Sabine, Couroussé, Nathalie, Beauclair, Linda, Collin-Chenot, Anne, Coustham, Vincent, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département INRA PHASE, Région Centre Val-de-Loire, Financement INRA sur crédit incitatif « Stressepimark » (2015), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ProdInra, Archive Ouverte

Subjects
modification épigénique, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], broilers, [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], embryon, séquençage à haut débit, embryo, acclimatation au chaud, bioinformatique, poulet de chair
Abstract

Broilers genetically selected for their performance suffer from heat exposure at slaughter age (D35). In a contextof global warming, it is possible to enhance heat tolerance by heat acclimation during embryogenesis. Thetreatment consists in increasing cyclically the incubation temperature of the eggs during the embryonic days E7to E16. This heat acclimation modifies physiology, metabolism and gene expression in the long term. Thealteration of the early environment can impact gene expression by epigenetic modifications. Therefore the geneexpression variations observed at D35 could be linked to a modification of the epigenome induced by theembryonic treatment, which persists throughout development. Two post-translational modifications could beimplicated, the tri-methylation of lysine 27 on the histone H3 (H3K27me3) involved in epigenetic memory underan environmental stimulus and the tri-methylation of lysine 4 on the histone H3 (H3K4me3) linked to genetranscriptional activation. To study these marks we have adjusted the chromatin immunoprecipitation (ChIP)technique to the hypothalamus, which is the center of thermoregulation. ChIP was followed by high throughputsequencing to study without bias the differentially enriched regions between the controls and the heat acclimatedchicken. Preliminary sequencing results for the hypothalamus will be presented., Les poulets sélectionnés pour leurs performances de croissance sont sensibles aux variations de température. Le traitement d’acclimatation embryonnaire à la chaleur permet de rendre les animaux plus tolérants à la chaleur à l’âge d’abattage (J35). Ce traitement consiste à augmenter de façon cyclique la température d’incubation desoeufs entre les jours E7 et E16 de l’embryogenèse. Il modifie la physiologie, le métabolisme et l’expression desgènes à long terme. L’altération de l’environnement précoce peut avoir un impact à long terme sur l’expressiondes gènes notamment par le biais de modifications épigénétiques. Les modifications d’expression de gènesobservées chez les poulets à J35 pourraient être dues à une altération de l’épigénome induite par le traitementlors de l’embryogenèse et persistant au cours du développement. Nous étudions deux modifications posttraductionnelles des histones, la triméthylation de la lysine 27 sur l’histone H3 (H3K27me3) décrite commeayant un rôle dans la mémoire épigénétique sous l’influence de l’environnement et la triméthylation de la lysine4 sur l’histone H3 (H3K4me3) associée à des gènes transcriptionnellement actifs. Afin de caractériser cesmarques nous avons mis au point la technique d’immuno-précipitation de la chromatine (ChIP) pourl’hypothalamus, centre de la thermorégulation. Le ChIP a été suivi d’un séquençage haut débit afin dedéterminer sans a priori les régions différentiellement enrichies en ces deux marques entre les individus témoinset acclimatés. Les premiers résultats issus du séquençage sur l’hypothalamus seront présentés.

Published
2017

12. Gene resistance to transcriptional reprogramming following nuclear transfer is directly mediated by multiple chromatin-repressive pathways

Author

Jullien, Jerome, Vodnala, Munender, Pasque, Vincent, Oikawa, Mami, Miyamoto, Kei, Allen, George, David, Sarah Anne, Brochard, Vincent, Wang, Stan, Bradshaw, Charles, Koseki, Haruhiko, Sartorelli, Vittorio, Beaujean, Nathalie, Gurdon, John, Cancer Research UK Gurdon Institute, Wellcome Trust, University of Cambridge, Department of Development and Regeneration, Laboratory of Molecular Developmental Biology, Graduate School of Biology-Oriented Science and Technology, Kinki University, UMR 1198, Biologie du Développement et Reproduction, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris-Saclay, Biologie du développement et reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory of Muscle Stem Cells and Gene Regulation, National Institute of Arthritis, Musculoskeletal and Skin Diseases (NIAMS), N, National Institutes of Health, Center for Integrative Medical Sciences, Laboratory for Developmental Genetics, RIKEN - Institute of Physical and Chemical Research [Japon] (RIKEN), Laboratory of Muscle Stem Cells and Gene Regulation, National Institute of Arthritis, Musculoskeletal and Skin Diseases (NIAMS), Wellcome Trust 101050/Z/13/Z 092096/Z/10/Z 081277, MRC (MR/ K011022/1, Gurdon Institute core grant from Cancer Research UK C6946/A14492, Intramural Research Program of NIAMS at the NIH 1Z01AR041126-17, Svenska Sallskapet for Medicinsk Forskning (SSMF), Gates Cambridge Trust and NIH-Cambridge MD/PhD Program T32GM007367, Society for the Promotion of Science (JSPS), Human Frontier Science Program RGP0021/2016, JSPS KAKENHI JP16H01321 JP16H01222, Grant for Basic Science Research Projects from The Sumitomo Foundation 150810, Wallonia-Brussels International Excellence Grant, Research Foundation -Flanders (FWO) G0F7716N, KU Leuven Research Fund (BOFZAP) StG/15/021BF C14/16/077, Biologie du Développement et Reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratory for Developmental Genetics [Yokohama] (RIKEN IMS), RIKEN Center for Integrative Medical Sciences [Yokohama] (RIKEN IMS), RIKEN - Institute of Physical and Chemical Research [Japon] (RIKEN)-RIKEN - Institute of Physical and Chemical Research [Japon] (RIKEN), Jullien, Jerome [0000-0002-7868-0021], Bradshaw, Charles [0000-0002-3528-458X], Gurdon, John [0000-0002-5621-3799], and Apollo - University of Cambridge Repository

Subjects
Male, Nuclear Transfer Techniques, Transcription, Genetic, souris, Epigenesis, Genetic, Animals, Genetically Modified, Histones, Xenopus laevis, Biologie de la reproduction, Cloning, Molecular, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, health care economics and organizations, Reproductive Biology, Biologie du développement, Gene Expression Regulation, Developmental, Cellular Reprogramming, Development Biology, xenopus, transfert nucléaire, Female, résistance génétique, Ubiquitin Thiolesterase, epigenetic, nuclear transfer, Mice, 129 Strain, mice, méthylation de l'adn, education, Article, Cell Line, resistance, épigénétique, transcriptional reprogramming, Animals, reprogrammation, oocyte, Molecular Biology, Cell Nucleus, chromatin, Ubiquitination, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, Cell Biology, DNA Methylation, Fibroblasts, Chromatin Assembly and Disassembly, Embryo, Mammalian, Mice, Inbred C57BL, Oocytes, chromatine
Abstract

Summary Understanding the mechanism of resistance of genes to reactivation will help improve the success of nuclear reprogramming. Using mouse embryonic fibroblast nuclei with normal or reduced DNA methylation in combination with chromatin modifiers able to erase H3K9me3, H3K27me3, and H2AK119ub1 from transplanted nuclei, we reveal the basis for resistance of genes to transcriptional reprogramming by oocyte factors. A majority of genes is affected by more than one type of treatment, suggesting that resistance can require repression through multiple epigenetic mechanisms. We classify resistant genes according to their sensitivity to 11 chromatin modifier combinations, revealing the existence of synergistic as well as adverse effects of chromatin modifiers on removal of resistance. We further demonstrate that the chromatin modifier USP21 reduces resistance through its H2AK119 deubiquitylation activity. Finally, we provide evidence that H2A ubiquitylation also contributes to resistance to transcriptional reprogramming in mouse nuclear transfer embryos., Graphical Abstract, Highlights • Identification of genes resistant to direct transcriptional reprogramming • Determination of resistant gene sensitivity to 11 chromatin modifier combinations • USP21 removes resistance through its H2AK119 deubiquitylation activity • USP21 improves the reprogramming of gene expression in two-cell-stage mouse embryos, Using nuclear transfer to Xenopus oocytes, Jullien et al. identify genes in MEF nuclei whose epigenetic configuration directly resists transcriptional reprogramming by oocyte factors. They show that loss of resistance can be achieved by a combinatorial action of chromatin modifiers, which alter H2A ubiquitylation, H3K9, H3K27, and DNA methylation levels.

Published
2017

13. Epigenetics for heat tolerance

Author

David, Sarah-Anne, Pitel, Frederique, Piégu, Benoît, Hennequet-Antier, Christelle, Vitorino Carvalho, Anais, Loyau, Thomas, Nyuiadzi, Dzidzo, Noirot, Celine, Bigot, Yves, Tona, Jacob Kokou, Coustham, Vincent, and Collin, Anne

Subjects
épigénétique, oiseau, élevage, résistance à la température
Published
2017

14. Impact of embryonic heat acclimation on histone post-translational modifications in chicken

Author

David, Sarah-Anne, Piégu, Benoît, Hennequet-Antier, Christelle, Bordeau, Thierry, Crochet, Sabine, Couroussé, Nathalie, Jacques, Aurore, Beauclair, Linda, Bigot, Yves, Collin, Anne, Coustham, Vincent, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Avicoles (SRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ProdInra, Archive Ouverte

Subjects
[SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, sélection génétique, [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], chicken, [SDV]Life Sciences [q-bio], poulet, embryo, embryogénèse, effet thermique, histone, poussin, stress, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, thermotolérance, embryon, altération epigénétique, [INFO]Computer Science [cs], acclimatation au chaud, faune aviaire, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

Impact of embryonic heat acclimation on histone post-translational modifications in chicken. 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group"

Published
2016

16. Variations épigénétiques en réponse à la chaleur chez le poulet de chair

Author

David, Sarah-Anne, Beauclair, Linda, Moncollin, V., Collin, Anne, Coustham, Vincent, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), ProdInra, Migration, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Subjects
modification post traductionnelle des histones, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], épigénétique, [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], chaleur, oiseau, adaptation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2016

17. Etude du rôle des modifications post-traductionnelles des histones dans l’acclimatation embryonnaire à la chaleur chez le poulet

Author

David, Sarah-Anne, Moncollin, V., Collin, Anne, Coustham, Vincent, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)

Subjects
épigénétique, [SDV]Life Sciences [q-bio], poulet, modification post-traductionnelle, [INFO]Computer Science [cs], acclimatation au chaud, histone
Abstract

National audience; L’environnement précoce des individus est capable d’impacter l’expression des gènes à long terme via des altérations de leur épigénome. Par exemple chez Drosophila melanogaster l’exposition à un stress thermique au cours de l’embryogenèse induit des modifications épigénétiques visibles à l’âge adulte via le complexe PRC2 (Polycomb Repressive Complex 2) (pour revue Steffen and Ringrose 2014). Une marque d’histones modulée par PRC2 est la tri-méthylation de la lysine 27 sur l’histone H3 (H3K27Me3). Cette marque est décrite comme ayant un rôle dans la mémoire d’un état répressif sous l’influence de l’environnement. Notamment chez Arabidopsis thaliana, suite à l’exposition au froid de l’hiver cette marque maintient la répression d’un répresseur floral pour permettre la floraison (Coustham et al. 2012). Dans un contexte de réchauffement climatique, notre équipe a étudié les effets d’un protocole expérimental permettant d’acclimater les poulets à la chaleur pendant l’embryogénèse (Piestun et al., 2008 ; Loyau et al., 2013). En effet, les animaux sélectionnés pour leurs performances de croissance sont peu résistants aux variations de températures. Le traitement d’acclimatation embryonnaire à la chaleur (TAEC) correspond à une augmentation cyclique de la température et de l’humidité relative (HR) pendant l’incubation des jours E7 à E16 de l’embryogénèse (de 37,8°C et 55% HR à 39,5°C et 65% HR pendant 12h). Cette modification de l’environnement précoce des individus altère peu l’éclosabilité et améliore le taux de survie lors d’un coup de chaleur survenant à l’âge d’abattage (J35). Cette thermotolérance accrue est associée de changements physiologiques, métaboliques et d’expressions de gènes à 5 semaines (Piestun et al., 2011, et Loyau et al., 2013, 2014). Nos recherches reposent sur l’hypothèse que les différences d’expressions de gènes observées chez les individus acclimatés peuvent être induites par des modifications épigénétiques survenant durant le TAEC et qui perdurent au cours du développement. Les travaux présentés porteront sur la mise au point de l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) sur deux tissus de poulet afin de cartographier H3K27Me3.

Published
2016

18. Importance de la première semaine d'élevage en production avicole de chair

Author

Collin, Anne, Nyuiadzi, Dzidzo, Tona, K., Leterrier, Christine, Tesseraud, Sophie, Coustham, Vincent, Everaert, N., Wang, Y., David, Sarah-Anne, Loyau, Thomas, Guilloteau, Laurence, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Lomé [Togo], Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Liège, Laboratory of Livestock Physiology, Department of Biosystems, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Département Santé Animale (DEPT SA), Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W). BEL., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2015

19. Mise au point de l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) pour une étude en séquençage haut-débit sur tissus de poulet

Author

David, Sarah-Anne, Bordeau, Thierry, Crochet, Sabine, Couroussé, Nathalie, Desmarais, Amélie, Beauclair, Linda, Bigot, Yves, Moncollin, V., Collin, Anne, Coustham, Vincent, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)

Subjects
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, expression génique, [SDV]Life Sciences [q-bio], poulet, séquençage à haut débit, [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2015

20. An Assessment of Fixed and Native Chromatin Preparation Methods to Study Histone Post-Translational Modifications at a Whole Genome Scale in Skeletal Muscle Tissue

Author

David, Sarah-Anne, primary, Piégu, Benoît, additional, Hennequet-Antier, Christelle, additional, Pannetier, Maëlle, additional, Aguirre-Lavin, Tiphaine, additional, Crochet, Sabine, additional, Bordeau, Thierry, additional, Couroussé, Nathalie, additional, Brionne, Aurélien, additional, Bigot, Yves, additional, Collin, Anne, additional, and Coustham, Vincent, additional

Published
2017
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21. Analyse du méthylome du poulet de chair acclimaté à la chaleur

Author

Coustham, Vincent, Plenecassagnes, Julien, Lejeune, Clara, Crochet, Sabine, David, Sarah-Anne, Loyau, Thomas, Zerjal, Tatiana, Leroux, Sophie, Esquerre, Diane, Salin, Gerald, Noirot, Celine, Pitel, Frederique, Collin, Anne, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Archive Ouverte

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Il existe chez les animaux et l'Homme une mémoire de l'environnement embryonnaire (nutrition, stress, polluants...) qui peut influencer le métabolisme des individus à l'âge adulte. Cette mémoire de l’environnement précoce est expliquée en partie par des variations de l’état épigénétique des gènes, transmises au cours des divisions cellulaires au cours du développement et influençant la façon dont des gènes impliqués dans divers processus physiologiques et métaboliques s’expriment. La compréhension des mécanismes d'action de l'environnement précoce, notamment l'alimentation maternelle et les pratiques d'élevage pour les animaux de rente, représente une réelle opportunité pour améliorer la santé et le bien-être des animaux.Le poulet, de par son développement embryonnaire dans l'œuf, est une espèce agronomique de choix pour manipuler directement l'environnement précoce et en étudier l'impact sur le devenir de l'animal. L'incubation des œufs est déterminante pour le développement du poussin, et différents paramètres d'incubation doivent être contrôlés. Dans un contexte de réchauffement climatique et d'augmentation de la production avicole dans les pays chauds, il est possible d'améliorer la résistance à la chaleur et le bien-être des poulets de chair en augmentant de manière cyclique la température d'incubation des œufs lors de l'embryogenèse. Le traitement d'acclimatation embryonnaire à la chaleur permet d'améliorer la thermotolérance des animaux à l'âge d'abattage sans impact négatif sur l'éclosabilité, la composition corporelle ni la qualité de la viande des animaux. Ce traitement est associé à des changements d'expression de gènes qui perdurent durant le développement des animaux, suggérant des perturbations épigénétiques sous-jacentes. Dans cette communication, nous analysons l'impact du traitement d'acclimatation embryonnaire à la chaleur sur la méthylation de l'ADN à l'échelle du génome.

Published
2015

22. Impact d'une exposition embryonnaire à la chaleur sur le methylome du poulet de chair

Author

Coustham, Vincent, Plenecassagnes, Julien, Lejeune, Clara, David, Sarah-Anne, Crochet, Sabine, Loyau, Thomas, Zerjal, Tatiana, Leroux, Sophie, Esquerre, Diane, Salin, Gerald, Noirot, Celine, Pitel, Frederique, Collin, Anne, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], and ProdInra, Archive Ouverte

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2015

23. Genome-wide methylation analysis of heat-acclimated chicken

Author

Coustham, Vincent, Esquerre, Diane, Noirot, Céline, Plenecassagnes, Julien, Lejeune, Clara, David, Sarah-Anne, Crochet, Sabine, Loyau, Thomas, Zerjal, Tatiana, Leroux, Sophie, Salin, Gérald, Collin, Anne, Pitel, Frédérique, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
genome-wide, chicken, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], methylation, [MATH]Mathematics [math], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2015

24. Variations in egg incubation temperature enable chicken acclimation through long-lasting changes in energy metabolism

Author

Loyau, Thomas, Metayer-Coustard, Sonia, Berri, Cécile, Mignon-Grasteau, Sandrine, Hennequet-Antier, Christelle, Praud, Christophe, Duclos, Michel Jacques, Tesseraud, Sophie, Coustham, Vincent, Nyuiadzi, Dzidzo, David, Sarah-Anne, Everaert, N., Siegel, P.B., Yalçin, Servet, Yahav, S., Collin, Anne, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Togolais de la Recherche Agronomique, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Université de Liège, Bioinformatics Institute, Virginia Polytechnic Institute and State University [Blacksburg], Ege university, and Agricultural Research Organization

Subjects
changement de température, [SDV]Life Sciences [q-bio], incubation des oeufs, [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, performance, oeuf de poule, résistance à la température
Abstract

National audience

Published
2015

25. L'eutypiose en Charentes : résultats de dix ans d'étude sur Ugni blanc

Author

Dumot, V., Menard, E., Courlit, Y., Ouvrié, M., Desaché, F., Boursier, N., David, Sarah-Anne, Dubos, B., Larignon, P., Unité Mixte de Recherche en Santé Végétale (INRA/ENITA) (UMRSV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB)-Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV), and ProdInra, Migration

Subjects
diatrypale, [SDV.BV.PEP] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BV.PEP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy
Abstract

National audience

Published
2004

26. Constitution d'une mini-banque d'images de glandes coliques et de tissus reconstruits acquises par microscopie confocale à balayage laser (rats normaux et rats légèrement inflammés par consommation de sulfate de dextran sodique)

Author

David, Sarah-Anne, Unité de recherche Fonctions Digestives et de Nutrition Humaines (UFDNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Université de Rennes 1 (UR1), FRA.

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], RAT
Abstract

* CR de Nantes. Service de Documentation. BP 71627. 44316 Nantes Cedex 03 Diffusion du document : CR de Nantes. Service de Documentation. BP 71627. 44316 Nantes Cedex 03 Diplôme : Maîtrise

Published
1999

27. Les mycotoxines du mais en France

Author

Richard-Molard, Daniel, David, Sarah-Anne, Unité de microbiologie et technologie céréalières, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
1994

28. Gene Resistance to Transcriptional Reprogramming following Nuclear Transfer Is Directly Mediated by Multiple Chromatin-Repressive Pathways.

Author

Jullien J, Vodnala M, Pasque V, Oikawa M, Miyamoto K, Allen G, David SA, Brochard V, Wang S, Bradshaw C, Koseki H, Sartorelli V, Beaujean N, and Gurdon J

Subjects
Animals, Animals, Genetically Modified, Cell Line, Chromatin genetics, Chromatin Assembly and Disassembly, Cloning, Molecular, Embryo, Mammalian cytology, Embryo, Mammalian metabolism, Female, Fibroblasts metabolism, Gene Expression Regulation, Developmental, Male, Mice, Mice, 129 Strain, Mice, Inbred C57BL, Oocytes, Ubiquitin Thiolesterase genetics, Ubiquitin Thiolesterase metabolism, Ubiquitination, Xenopus laevis, Cell Nucleus metabolism, Cellular Reprogramming, Chromatin metabolism, DNA Methylation, Epigenesis, Genetic, Histones metabolism, Nuclear Transfer Techniques, Transcription, Genetic
Abstract

Understanding the mechanism of resistance of genes to reactivation will help improve the success of nuclear reprogramming. Using mouse embryonic fibroblast nuclei with normal or reduced DNA methylation in combination with chromatin modifiers able to erase H3K9me3, H3K27me3, and H2AK119ub1 from transplanted nuclei, we reveal the basis for resistance of genes to transcriptional reprogramming by oocyte factors. A majority of genes is affected by more than one type of treatment, suggesting that resistance can require repression through multiple epigenetic mechanisms. We classify resistant genes according to their sensitivity to 11 chromatin modifier combinations, revealing the existence of synergistic as well as adverse effects of chromatin modifiers on removal of resistance. We further demonstrate that the chromatin modifier USP21 reduces resistance through its H2AK119 deubiquitylation activity. Finally, we provide evidence that H2A ubiquitylation also contributes to resistance to transcriptional reprogramming in mouse nuclear transfer embryos., (Copyright © 2017 The Author(s). Published by Elsevier Inc. All rights reserved.)

Published
2017
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