1. Towards better traceability of field sampling data
- Author
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Plumejeaud-Perreau , Christine, Linyer , Hector, Pignol , Cécile, Cipière , Sébastien, Quinton , eric, Ancelin , Julien, Heintz , Wilfried, Damy , Sylvie, Raoul , Francis, Clemens , Anne, Dujardin , Florence, Moal , Françoise Le, Montargès-Pelletier , Emmanuelle, Bretagnolle , Vincent, LTSER Zone Atelier Plaine & Val de Sèvre, LIttoral ENvironnement et Sociétés - UMR 7266 (LIENSs), Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (EDYTEM), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LTSER Zone Atelier Alpes, Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Domaine expérimental de Saint-Laurent-de-la-Prée (ST LAURENT DE LA PREE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Zone Atelier Bassin du Rhône, Zone Atelier Basson du Rhône, École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux (LIEC), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372 (CEBC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LIttoral ENvironnement et Sociétés - UMRi 7266 (LIENSs), LTSER «Zone Atelier Plaine & Val de Sevre» [France], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LIttoral ENvironnement et Sociétés - UMR 7266 ( LIENSs ), Université de La Rochelle ( ULR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne ( EDYTEM ), Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecosystèmes aquatiques et changements globaux ( UR EABX ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Domaine expérimental de Saint-Laurent-de-la-Prée ( ST LAURENT DE LA PREE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural ( DYNAFOR ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Conservatoire National des Arts et Métiers - Rhône-Alpes ( CNAM Rhône-Alpes ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux ( LIEC ), Université de Lorraine ( UL ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372 ( CEBC )
- Subjects
[ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes ,[ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology ,[SDE.IE]Environmental Sciences/Environmental Engineering ,[SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes ,[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology ,[SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society ,[ SDE.IE ] Environmental Sciences/Environmental Engineering ,[ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society - Abstract
Poster; International audience; Ensuring traceability of field experimental data or laboratory sampling data to conduct reproducible research is a challenge at the present time. Between the time when geolocalized specimens (biotic or abiotic) are taken, and the time the resulting data ends up in analysis published within a study, many manual operations take place and may generate errors. The French LTSER have joined forces at the national level to propose a solution as generic as possible to this problem of monitoring of the samples and the data associated with them. Compared to existing solutions (such as Laboratory Information Management Systems), we target a robust labeling solution adapted to outdoor working conditions, with the management of stocks and movements of samples. We designed and realized a prototype tested from end to end, using an open source software (https://github.com/Irstea/collec), cheap Zebra printers (mobile or not) and raspberries as devices. This solution provides sufficient flexibility for the wide variety of existing protocols. Its strength is the record of all contextual data associated with the samples, which constitute important parameters of the subsequent analyzes. At last, not only traceability is guaranteed, but also a gain of time and a rationalization of the storage of samples that will induce a return on investment.
- Published
- 2017