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International audience; Chlordecone (CLD) levels measured in the rivers of the French West Indies were among the highest values detected worldwide in freshwater ecosystems, and its contamination is recognised as a severe health, environmental, agricultural, economic, and social issue. In these tropical volcanic islands, rivers show strong originalities as simplified food webs, or numerous amphidromous migrating species, making the bioindication of contaminations a difficult issue. The objective of this study was to search for biological responses to CLD pollution in a spatially fixed and long-lasting component of the rivers in the West Indies: the epilithic biofilm. Physical properties were investigated through complementary analyses: friction, viscosity as well as surface adhesion were analyzed and coupled with measures of biofilm carbon content and exopolymeric substance (EPS) production. Our results have pointed out a mesoscale chemical and physical reactivity of the biofilm that can be correlated with CLD contamination. We were able to demonstrate that epilithic biofilm physical properties can effectively be used to infer freshwater environmental quality of French Antilles rivers. The friction coefficient is reactive to contamination and well correlated to carbon content and EPS production. Monitoring biofilm physical properties could offer many advantages to potential users in terms of effectiveness and ease of use, rather than more complex or time-consuming analyses. Out of the 11,435 French water bodies analysed for quality compliance according to regulations imposed by European legislation, 10% are located between the tropics and the equator, thousands of kilometres away from European shores 1. In the outermost tropical territories, climatic characteristics often result in highly turbulent tropical streams 2 that support simplified ecosystems with very few primary producers. Due to high river flow, perennial phytoplankton, zooplankton and macroalgae are scarce or missing and the epilithic biofilm deserves here, even more than elsewhere, the comparison with a real productive and contributive "microbial skin" 3. The epilithic biofilm is the only endogenous long-lasting primary producer that grows on submersed river stones and is largely exploited as a food source by all diadromous fish or crustaceans 4,5. In these countries, the simplified food webs and the massive flows of post-larvae and juveniles regularly re-entering the rivers and migrating

International audience; La Nouvelle-Calédonie, archipel français ultramarin du Pacifique Sud-Ouest, est considérée comme un hot-spot mondial de biodiversité en raison de l'endémisme exceptionnel de sa faune et de sa flore. L'île principale, appelée la Grande Terre, s'étire sur environ 450 km de long pour 40 à 50 km de large et présente une superficie d'environ deux fois la Corse. Ses affleurements ultramafiques font l'objet d'une activité minière liée à l'exploitation des gisements de nickel. Elle subit aussi des pollutions urbaines (dont celles de l'agglomération de Nouméa, qui représente 100 000 habitants) et domestiques (tribus), des pollutions agricoles, etc... De ce fait, la gestion de l'environnement est une préoccupation majeure de la vie politique locale, en particulier pour les aspects de protection de la ressource en eau et de la biodiversité patrimoniale. En fonction de son statut de collectivité sui generis, la Nouvelle-Calédonie n'est pas soumise à la réglementation européenne. Cependant, les dispositions règlementaires prises pour préserver la qualité des hydrosystèmes s'inspirent largement de la Directive Cadre sur l'Eau, en utilisant notamment des compartiments biologiques pertinents pour l'évaluation de leur état écologique. A cet effet, un programme de recherche-développement visant à la mise au point d'un nouvel indice d'évaluation diatomique des cours d'eau de Nouvelle-Calédonie a été réalisé entre fin 2012 et fin 2017. Les réalisations de terrain, basées sur 4 campagnes de prélèvements réparties sur 2 saisons (saison sèche-saison humide), ont permis d'obtenir 210 doublets de données associant des descripteurs abiotiques de qualité des milieux et les inventaires diatomiques correspondants.Les investigations de données ont débuté par une phase d'analyses exploratoires classiques (analyses multivariées, analyses des correspondances...), en vue d'appréhender : 1) la nature et l'intensité des gradients abiotiques présents localement et 2) leur mise en relation avec la distribution des espèces diatomiques locales, qui restaient encore méconnues avant la réalisation de ce programme, tant sur le plan taxinomique que de leur autoécologie spécifique. En complément, une analyse ascendante hiérarchique a permis de repérer la typologie des assemblages diatomiques, à associer les biotypes obtenus avec les conditions environnementales locales, et à en repérer les principales espèces structurantes au moyen de l'IndVal. Au bilan, ces différentes approches nous ont permis de cerner la diversité et la structure des communautés diatomiques des cours d'eau calédoniens et de commencer à appréhender l'effet de structuration exercé par les facteurs environnementaux et les pressions anthropiques. Dans un second temps, une approche innovante s'est appuyée sur l'utilisation du programme TITAN (Threshold Indicator Taxa ANalysis) pour la détection de seuils écologiques d'augmentation ou de diminution de la distribution de taxons, permettant le repérage et la sélection de taxons d'alerte vis-à-vis de 7 métriques élémentaires d'anthropisation (4 d'entre elles étant relatives à l'enrichissement trophique et 3 se focalisant sur les impacts miniers).Au final, l'IDNC (Indice Diatomique de Nouvelle-Calédonie) adopte le principe d'One Out-All Out pour déterminer l'état écologique des cours d'eau de Nouvelle-Calédonie sur la base du plus mauvais état observé (métrique intégrée trophique versus métrique intégrée minière).

International audience; In New Caledonia, integrated management of aquatic environments and resources has been identified since the early 2000s as a priority and was one of the objectives of the action plan drawn up in 2004 by local (government, Provinces) and national authorities in the framework of the overseas action plan of the National Strategy for Biodiversity (SNB). This plan is currently in its second cycle of implementation (2011-2020). This priority is also recognized by the Caledonian Sustainable Development Plan, as well as by the Regional Strategy for Biodiversity of PROE (i.e. Oceanian regional program for environment). Following the thematic "freshwater" workshops in April 2010, the Observatory of the Environment in New Caledonia (OEIL), the Department of Veterinary, Food and Rural Affairs (DAVAR) from the government of New Caledonia and the CNRT "Nickel and its environment" have decided to support a Research and Development program aimed at developing a new biological index for rivers based on a compartment of phototrophic primary producers, the benthic diatoms. The implementation of this program, which was carried out from October 2012 to the end of 2017, was entrusted to a consortium experienced in that field, which associated the French national Research Institute in Science and Technology for the Environment and Agriculture (IRSTEA) and the private consultants Asconit Consultants and Bioeko. The objective of this document is to provide a practical manual intended to allow the implementation of the Diatomic Index of New Caledonia (IDNC) under methodological conditions guaranteeing reliability of the results. In that aim, it describes every stages of implementation of the IDNC, since the sampling of the diatoms until the calculation of the index score, without omitting the samples treatment, the permanent slides confection, the realization of diatom inventories and data banking. It also includes a chapter describing the different phases of the index design, in order to allow operators and project managers to understand the main principles of its development and operation. Even if more theoretical, this information is essential for the good prescription of the IDNC as for the interpretation of its results. This document is complementary to the IDNC Final Report (Marquié et al. 2018) and to the last edited version of the atlas of New Caledonian diatoms, Volume 1 (Marquié et al., 2018 a) and Volume 2 (Marquié et al., 2018 b) It addresses the key elements for implementing the IDNC in a practical and educational way.; En Nouvelle-Calédonie, la gestion intégrée des milieux et ressources aquatiques a été identifiée depuis le début des années 2000 comme une priorité et fait partie des objectifs du plan d'action élaboré en 2004 par les collectivités locales (gouvernement, Provinces) et nationales dans le cadre du plan d'action outre-mer de la Stratégie Nationale pour la Biodiversité (SNB), actuellement dans sa seconde phase de mise en oeuvre (plan 2011-2020). Cette priorité est également reconnue par le Schéma de développement durable du territoire Calédonien, ainsi que par la Stratégie régionale pour la Biodiversité du PROE (Programme Régional Océanien de l'Environnement). Suite à la tenue des Ateliers thématiques "eau douce" en avril 2010, l'Observatoire de l'Environnement en Nouvelle-Calédonie (OEIL), la Direction des Affaires Vétérinaires, Alimentaires et Rurales (DAVAR) du gouvernement de la Nouvelle-Calédonie et le CNRT "Nickel et son environnement " ont décidé de soutenir un programme de Recherche-Développement visant à la mise au point d'un nouvel indice biologique s'appuyant sur un compartiment de producteurs primaires phototrophes, les diatomées benthiques des cours d'eau. La réalisation de ce programme, dont la réalisation s'est échelonnée d'octobre 2012 à fin 2017, a été confiée à un consortium expérimenté en la matière qui associait l'Institut national de Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture (IRSTEA) et les bureaux d'études Asconit Consultants et Bioeko. L'objectif du présent document est de fournir un ouvrage pratique destiné à permettre la mise en oeuvre de l'Indice Diatomique de Nouvelle-Calédonie (IDNC) dans des conditions qui garantissent la fiabilité du résultat. Pour cela, il reprend toutes les étapes de la mise en oeuvre de l'IDNC depuis l'échantillonnage des diatomées jusqu'au calcul de la note indicielle, sans omettre le traitement des échantillons, la confection des lames permanentes, la réalisation des inventaires diatomiques et la bancarisation des données. Il inclut également un chapitre qui reprend les différentes phases de la conception de l'indice, afin de permettre aux opérateurs et maîtres d'ouvrage d'en comprendre les grands principes d'élaboration et de fonctionnement. Ces connaissances, bien que plus théoriques, sont indispensables à la prescription de l'IDNC autant qu'à l'interprétation des résultats. Ce document est donc complémentaire du Rapport Final IDNC (Marquié et al. 2018) et de l'atlas des diatomées de Nouvelle-Calédonie dans la version finale éditée (Marquié et al. 2018 a; Marquié et al. 2018 b) et aborde les éléments clés de la mise en oeuvre de l'IDNC de manière pratique et didactique.