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Resumen Las infecciones respiratorias agudas (IRA) causadas por virus son una importante causa de morbilidad y mortalidad en el mundo, afectando principalmente a niños y adultos mayores. Se asocian a un alto número de consultas y hospitalizaciones, a una significativa sobrecarga del sistema de salud y a un alto costo económico. La vigilancia de virus respiratorios tiene el potencial de ayudar a optimizar la respuesta sanitaria, garantizar la disponibilidad de recursos humanos, racionalizar los recursos y disminuir los costos asociados a la atención en salud. Con el objetivo de optimizar la recolección y visualización de los datos de nuestro actual sistema de vigilancia de virus respiratorios, se diseñó una plataforma basada en R y sus paquetes Shiny, que permite la creación de una interfase web interactiva y amigable para la recolección, análisis y publicación de los datos. Se ingresaron a esta plataforma los datos de la red de vigilancia metropolitana de virus respiratorios disponibles desde 2006. En esta plataforma, el investigador demora menos de un minuto en registrar los datos. El análisis y publicación es inmediato, llegando a cualquier usuario con un dispositivo conectado a Internet, quien puede elegir las variables a consultar. Con un costo muy bajo, en poco tiempo y utilizando el lenguaje de programación R, se logró crear un sistema simple e interactivo, disminuyendo el tiempo de carga y análisis de datos de forma considerable, posiblemente aumentando el impacto y la disponibilidad de esta vigilancia. Abstract Acute respiratory infections (ARI) are an important cause of morbidity and mortality worldwide, affecting mainly children and the elderly. They are associated with a high economic burden, increased number of medical visits and hospitalizations. The surveillance of the circulation of respiratory viruses can reduce the health care associated costs, and to optimize the health response. A platform based on R and its package Shiny was designed, to create an interactive and friendly web interface for gathering, analysis and publication of the data. The data from the Chilean metropolitan respiratory viruses surveillance network, available since 2006, was uploaded into the platform. Using this platform, the researcher spends less than 1 minute to upload the data, and the analysis and publication is immediate, available to be seen by any user with a device connected to Internet, who can choose the variables to be displayed. With a very low cost, in a short time, and using the R programming language, it was possible to create a simple, and interactive platform, considerably decreasing the upload and analysis time, and increasing the impact and availability of this surveillance.

Infectious endocarditis (IE) by Bartonella species is an emerging problem worldwide. We report two cases of native valve Bartonella-associated IE events, both affecting adult male patients with a history of alcohol abuse and a low socioeconomic status. Admissions were due to pancytopenia and bleeding in one case and embolic stroke in the other. Blood cultures were negative and IgG indirect immunofluorescence assays (IFA) were positive for B. henselae/B. quintana in high titers (1/16,384-1/16,384, and 1/32,768 -1/16,384, respectively). Cases were classified as definitive IE events according to modified Duke criteria due to the presence of valve vegetations with at least three minor criteria. One patient required aortic mechanical valve replacement and survived, and the other died after a massive hemorrhagic transformation of his stroke. PCR amplification and sequencing of the 16S ribosomal bacterial DNA from a valve tissue sample obtained at surgery in the patient who survived, confirmed B. quintana as the etiological agent. Bartonella-associated IE is an emerging problem in Chile, present in disadvantaged populations. It should be suspected in patients with culture-negative IE. IFA does not discriminate between B. henselae and B. quintana infection, but high titers suggest IE. Complementary PCR techniques may help to elucidate the final causative agent. La endocarditis infecciosa(EI) asociada a Bartonella es un problema emergente a nivel mundial. Publicamos los 2 primeros casos de EI en válvula nativa asociados a Bartonella en Chile, los que afectaron a pacientes masculinos con historia de consumo de alcohol y bajos ingresos. La hospitalización fue provocada por pancitopenia y hemorragias en un caso y por un evento cerebrovascular en el otro. Se solicitó serología para Bartonella por inmunofluorescencia indirecta (IFI) para ampliar el estudio ante hemocultivos negativos y en ambos casos se reportaron resultados intensamente positivos para B. henselae y B. quintana1/16.384-1/16.384 y 1/32.768 -1/16.384, respectivamente). Los casos se clasificaron como eventos definitivos de EI según los criterios modificados de Duke debido a la presencia de vegetaciones valvulares con al menos 3 criterios menores. Un paciente requirió reemplazo valvular aórtico y sobrevivió, y el otro falleció tras una transformación hemorrágica masiva del infarto cerebral. La amplificación del ADN ribosomal 16S por RCP y posterior secuenciación de una muestra de tejido valvular confirmó la presencia de B. quintana. La EI por Bartonella sp. es un problema emergente en Chile, probablemente asociada a poblaciones desfavorecidas, la que debe ser sospechada en pacientes con cultivos negativos. La IFI no permite discriminar infecciones por B. henselae o B. quintana pero los títulos altos sugieren EI. Técnicas complementarias por RCP pueden ayudar a dilucidar el diagnóstico.

Resumen Introduccion: Las infecciones asociadas a atencion de salud (IAAS) aumentan la morbilidad y mortalidad. Durante 2014, en Hospital Clinico Red de Salud UC Christus (RS-UCCH) se estimo que 15% de las infecciones virales respiratorias fueron adquiridas durante la atencion de salud, siendo mas frecuente el virus influenza. Objetivos: Caracterizacion clinico-epidemiologica de IAAS por influenza en pacientes hospitalizados en unidades de pacientes criticos (UPC) y cuidados especiales. Material y Metodos: Estudio descriptivo. Se incluyeron pacientes en UPC y cuidados especiales con IAAS influenza entre 2014 y 2017 en RS-UCCH. IAAS por influenza se definio como: inicio de sintomas y/o RPC-TR positiva para virus influenza ≥ 48 h de ingreso hospitalario, sin sintomatologia respiratoria o estudio negativo previo. Resultados: Se identificaron 22 pacientes, edad mediana 74 anos. La influenza fue adquirida en promedio al dia 13; el 77% fue por influenza A y el 27% presento coinfeccion respiratoria. Trece (59%) estaban hospitalizados en UPC, dos (15%) por problemas pulmonares. El 86% tenia co-morbilidad y el 50% descompensacion de ella. No estaba vacunado 59%; la letalidad observada fue 18%. Conclusiones: IAAS por influenza ocurrio en pacientes cronicos, de mayor edad y no vacunados. Es primordial educar en prevencion de IAAS y mantener altas coberturas de vacunacion. Background: Healthcare-associated infections (HAIs) increase morbidity and mortality. During 2014, at the Hospital Clinico Red de Salud UC Christus (RS-UCCH) it was estimated that 15% of respiratory viral infections were acquired during hospitalization and influenza A was more frequent. Aims: Clinical and epidemiological characterization of HAIs due to influenza virus in patients hospitalized in critical care units (CCU) and special care. Methods: Descriptive study. We included patients hospitalized in CCU and special care with hospital acquired influenza during 2014-2017. HAI due to influenza was defined as: symptom onset and/or positive influenza PCR after ≥ 48 hours of hospital admission, without previous respiratory symptoms or previous negative influenza test study. Results: 22 patients were identified, median age was 74 years. Influenza was acquired average on day 13. Influenza A was detected in 77% and 27% had respiratory co-infection. Thirteen (59%) were hospitalized in CCU, only 2 (15%) due to lung problems. Comorbidity was present in 86% and decompensation in 50%. Only 41% received influenza vaccine. The associated lethality was 18%. Conclusions: HAI due to influenza occurred in chronic, older and unvaccinated patients. Education about HAIs and continuous high vaccination coverage must be reinforced.

Resumen El enfrentamiento del diagnóstico diferencial y etiológico de las enfermedades infecciosas de los pacientes con cáncer, incluyendo los receptores de trasplante de precursores hematopoyéticos (TPH), debe corresponder a una decisión informada, oportuna y que repercuta directamente en una conducta médica que determine una mejor sobrevida y calidad de vida de los pacientes. El objetivo de este trabajo fue aportar en el manejo de estos pacientes desarrollando una herramienta útil al médico clínico para tomar estas decisiones. Para ello se agruparon las infecciones por sistemas comprometidos diferenciando los posibles agentes etiológicos en bacterias, virus, hongos y parásitos, explicitando los exámenes diagnósticos más relevantes, mencionando la o las técnicas recomendadas, junto con el tipo de muestra óptima para su adecuado procesamiento. De manera adicional, se incorporó el ítem “nivel de requerimiento” para sugerir lo que, a juicio de los autores y la evidencia existente, debe estar presente obligatoriamente en el centro o puede ser derivable a otro laboratorio. The confrontation of the differential and etiological diagnosis of the infectious diseases of cancer patients, including hematopoietic stem cells transplant (HSCT) recipients, must correspond to an informed, timely decision that directly affects medical behavior that determines a better survival and quality of life for patients. The main goal of this work was to contribute to the management of these patients developing a useful tool for the clinician to make these decisions. For that, infections were grouped by compromised systems, differentiating the possible etiological agents in bacteria, viruses, fungi and parasites, highlighting the relevant diagnostic tests, mentioning the recommended techniques together with the optimal sample type for proper processing. In addition, under each group of techniques we added the item “level of requirement” to suggest what, in the opinion of the authors and the existing evidence, must be mandatory to have at local level or can be derivable to another laboratory.

Resumen El virus de la parotiditis produce una infección benigna caracterizada por un aumento de volumen parotídeo que, antes de la introducción de la vacuna tres vírica, afectaba principalmente a niños y adolescentes. Luego de que esta vacuna se implementara en el Programa Nacional de Inmunizaciones, se produjo una notable disminución en su incidencia. Además, ocasionó un cambio en la edad y presentación clínica, siendo más frecuente en adultos jóvenes con mayor riesgo de complicaciones. Presentamos dos casos clínicos de parotiditis en adultos jóvenes confirmados por serología y en uno de ellos, por biología molecular. Se caracterizó el virus como del genotipo G, como el descrito en los brotes en E.U.A y Europa, diferente al virus contenido en la vacuna. El virus parotídeo sigue circulando en nuestro país y debemos mantenernos alerta ante eventuales brotes. Se hace relevante optimizar el diagnóstico etiológico por serología o técnicas de biología molecular con fines clínicos y epidemiológicos. Mumps virus usually produces a benign infection characterized by increased parotid volume which, prior to vaccination, mainly affected children and adolescents. After the introduction of measles, mumps and rubella (MMR) vaccine, mumps incidence decreased dramatically. This intervention also produced a change in its clinical presentation, moving to young adult patients, with an increased risk of complications. We report two clinical mumps cases in young adults with different clinical presentations. In both cases, serologic assays were assessed and, in one case, a polymerase chain reaction (PCR) was performed in order to confirm the diagnosis. The isolated virus was characterized and identifed as G genotype, the same genotype observed during outbreaks in United States and Europe, and different to the vaccinal strain. Mumps virus is currently circulating in Chile and it is important to be aware of possible outbreaks. Viral diagnosis can be difficult, particularly in populations with high vaccination coverage. Therefore, the access to etiologic study through PCR and serology becomes more relevant in order to optimize clinical management and secondary prevention measures.