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15 results on '"Fillatre, Yoann"'

3. PhytoHub V1.4: A new release for the online database dedicated to food phytochemicals and their human metabolites

Author

Bento da Silva, Andreia, Giacomoni, Franck, Pavot, Balthazar, Fillatre, Yoann, Rothwell, Joseph, Bartolomé Sualdea, Bergona, Veyrat, Catherine, Garcia-Villalba, Rocio, Gladine, Cécile, Kopec, Rachel, Hollman, Peter, Landberg, Rikard, Morand, Christine, Nunes dos Santos, C., Nyström, L, Pujos-Guillot, Estelle, Bronze, Maria, Tomas-Barberan, Francisco, Urpi-Sarda, Mireia, Wiczkowski, Wislaw, Knox, C, Manach, Claudine, Instituto de Technologia Quimica e Biologica, University of Lisbon, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Centro de Edafologia y Biologia Aplicada del Segura, RIKILT, Wageningen University and Research Center (WUR), Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Institute of Food Nutrition and Health (ETH), University of Barcelona, Institute of Animal Reproduction and Food Research PAS, OMx, University of Alberta, Universidade de Lisboa (ULISBOA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Universidade de Lisboa = University of Lisbon (ULISBOA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université

Subjects
base de données en ligne, Bioinformatics, Alimentation et Nutrition, Bio-informatique, Food and Nutrition, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], composé phytochimique, relation alimentation santé, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, profil métabolique, LC-MS
Abstract

Support: ANR Project ALIA-007-PhenoMeNEp; COST Action FA 1403 POSITIVe; JPI HDHL FoodBAll projectSupport: ANR Project ALIA-007-PhenoMeNEp; COST Action FA 1403 POSITIVe; JPI HDHL FoodBAll project; PhytoHub V1.4: A new release for the online database dedicated to food phytochemicals and their human metabolites. The 1. International Conference on Food Bioactives & Health

Published
2016

4. PhytoHub version 1.0: a food metabolome database dedicated to dietary phytochemicals

Author

Giacomoni, Franck, Fillatre, Yoann, Rothwell, Joseph, Eisner, R., Cesaire, Daniel, Pujos-Guillot, Estelle, Knox, C., Manach, Claudine, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, In Siliflo Inc, and Nutrigenomics Organisation (NuGO). NLD.

Subjects
base de données, régime alimentaire, métabolome, biomarqueur métabolique, spectrométrie de masse, [SDV]Life Sciences [q-bio], metabolite
Abstract

The 1st international workshop on the ‘Food metabolome and biomarkers for dietary exposure’, organized in Glasgow last year, identified as a priority the development of databases and libraries of spectra for the food metabolome. The food metabolome comprises all metabolites present in human biofluids and tissues that directly derive from the digestion and metabolism of food chemicals. Exploration of the food metabolome through mass spectrometry untargeted profiling has opened new avenues for the discovery of intake biomarkers, also a key priority in nutrition research as described in the JPI HDHL strategic agenda and recent BioNH call. A large proportion of the food metabolome consists of metabolites of phytochemicals such as polyphenols and terpenes. Identification of these metabolites in metabolomic profiles is often a bottleneck in biomarker discovery, as their standards are not commercially available and their integration in online databases and libraries of spectra is still very limited. As part of the ANR PhenoMeNep project, we have designed PhytoHub (www.phytohub.eu), dedicated to all phytochemicals commonly ingested with the diet. Chemical data include name, chemical structure and identifiers, synonyms, physico- chemical properties. Data also include the taxonomy, foods of origin (linked to FooDB), compound of origin (if a metabolite), biofluid location and literature references. Known metabolites are manually extracted from the literature and references are attached. Since the metabolism of many phytochemicals has not been studied yet, in silico prediction of metabolism will be used. We are developing an in-house tool from (1) a compilation of all biotransformations (and combinations) occurring in humans (including gut microbiota biotransformations) for each chemical class and (2) analysis of functional groups on precursor phytochemicals. A list of predicted metabolites will be generated for each phytochemical. Mass spectral data come from literature, other databases on phytochemicals and experimental data from our collaborative platforms. Hopefully in silico prediction of mass fragmentation will be added in the future. An efficient relational design supports a powerful and intuitive web interface. For a queried monoisotopic mass or molecular formula, the database will return a list of metabolites or phytochemical precursors, along with their spectral data and possible dietary and metabolic origins. For a queried food, it will return a list of metabolites likely to be present in biofluids after consumption. MS-MS and custom advanced searches are also possible. PhytoHub is the first database to collate information on phytochemical metabolites from a metabolomics standpoint, and should facilitate identification of unknowns in non-targeted profiling. The version 1.0 of PhytoHub is online, with a first dataset on the 240 most consumed terpenes and their known metabolites. It will be updated monthly. Any willingness to contribute to this freely accessible resource is welcome so that the database can be as complete, accurate and useful as possible.

Published
2014

5. The Sampling Method by Evaporation under Nitrogen as a Complementary Approach for the Multiresidue Analysis of 256 Pesticides in Lavandin Essential Oil by LC/ESI/sSRM

Author

Rondeau, David, Fillatre, Yoann, Daguin, Antoine, Jadas-Hecart, Alain, Communal, Pierre-Yves, Institut d'Électronique et des Technologies du numéRique (IETR), Université de Nantes (UN)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupement Interrégional de recherche sur les produits agropharmaceutiques (GIRPA), Université d'Angers (UA), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique UMR 6554 (LETG), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique (LETG-Angers), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Nantes Université (NU)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Nantes (UN)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN)

Subjects
[CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2013

6. New biomarkers of coffee consumption identified by non targeted metabolomic profiling in cohort study subjects

Author

Fillatre, Yoann, Rothwell, Joe, Touvier, Mathilde, Lyan, Bernard, Martin, Jean-Francois, Joly, Charlotte, GUEHO, Soizic, Fezeu Kamedjie, Léopold, Arnault, Nathalie, Sébédio, Jean-Louis, Comte, Blandine, Hercberg, Serge, Pujos-Guillot, Estelle, Galan, Pilar, Manach, Claudine, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plate-Forme d'Exploration du Métabolisme, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR Phenomenep ALIA-2010-007, Conseil Regional Auvergne-FEDER post-doc grant (YF), Metabolomics Society., Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-MetaboHUB-Clermont, and MetaboHUB-MetaboHUB

Subjects
facteur de risque, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Alimentation et Nutrition, Chimie analytique, Food and Nutrition, bénéfice, consommateur, café, Analytical chemistry, biomarqueur, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, caféine
Abstract

Communication orale Yoann Fillâtre; International audience

Published
2013

7. Multiresidue Analysis of 256 Pesticides in Lavandin Essential Oil by LC/ESI/sSRM: Advantages and Drawbacks of a Sampling Method by Evaporation Under Nitrogen

Author

Fillatre, Yoann, Rondeau, David, Daguin, Antoine, Jadas-Hecart, Alain, Communal, Pierre-Yves, Groupement Interrégional de recherche sur les produits agropharmaceutiques (GIRPA), Université d'Angers (UA), Institut d'Électronique et des Technologies du numéRique (IETR), Université de Nantes (UN)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique UMR 6554 (LETG), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique (LETG-Angers), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Nantes Université (NU)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Nantes (UN)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN)

Subjects
[CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2013

8. Food metabolomics applied in cohorts to accelerate the discovery of nutritional biomarkers

Author

Fillatre, Yoann, Touvier, Mathilde, Rothwell, J.A, Lyan, Bernard, Martin, Jean-Francois, Joly, Charlotte, GUEHO, Soizic, Fezeu Kamedjie, Léopold, Arnault, Nathalie, Sébédio, Jean-Louis, Comte, Blandine, Hercberg, Serge, Pujos-Guillot, Estelle, Galan Hercberg, Pilar, Manach, Claudine, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme d'Exploration du Métabolisme, MetaboHUB, ANR-11-INBS-0010, Centre de Recherche en Nutrition Humaine (CRNH). FRA., ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris 13 (UP13)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR-11-INBS-0010/11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d’une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l’innovation(2011), and Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
Alimentation et Nutrition, Chimie analytique, Food and Nutrition, Analytical chemistry, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract

communication orale : Claudine Manach The Second International Congress of Translational Research in Human Nutrition is organised by the Research Centre in Human Nutrition (CRNH) of Auvergne, of which INRA is a member, in collaboration with NuGO, European Association of universities and research institutes in the field of nutrigenomics.communication orale : Claudine ManachThe Second International Congress of Translational Research in Human Nutrition is organised by the Research Centre in Human Nutrition (CRNH) of Auvergne, of which INRA is a member, in collaboration with NuGO, European Association of universities and research institutes in the field of nutrigenomics.; The purpose of dietary assessment is to estimate usual and recent intake of foods, nutrients, bioactive compounds and food contaminants for exploration of associations with health outcomes and monitoring of population nutritional status. These data are still extremely difficult to obtain. Methods currently used are based on dietary questionnaires which have inherent limitations linked to self-reporting. A complementary approach to questionnaires is the use of biomarkers. However, only a few biomarkers have been properly validated, which do not cover the wide range offoods consumed. Metabolomics has emerged as a promising approach to discover nutritional biomarkers. Typically, plasma or urine samples collected before and after acute intake of a specific food are profiled using NMR or high resolution Mass Spectrometry (MS) and compared usingmultivariate statistics to pinpoint the signals reflecting the consumption of the target food. In a proof-of-concept study on citrus, we showed that urine profiling of cohort subjects stratified by consumption could be a more effective strategy for discovery of sensitive biomarkers of intake.

Published
2013

9. Use of high resolution mass spectrometry for identification of specific biomarkers of coffee consumption

Author

Fillatre, Yoann, Rothwell, J.A, Lyan, Bernard, Martin, Jean-Francois, Joly, Charlotte, Touvier, Mathilde, GUEHO, Soizic, Fezeu Kamedjie, Léopold, Arnault, Nathalie, Sébédio, Jean-Louis, Comte, Blandine, Hercberg, Serge, Galan Hercberg, Pilar, Pujos-Guillot, Estelle, Manach, Claudine, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Plateforme d'Exploration du Métabolisme, MetaboHUB, Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-11-INBS-0010, Centre de Recherche en Nutrition Humaine (CRNH). FRA., ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011), Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris 13 (UP13)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR-11-INBS-0010/11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d’une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l’innovation(2011), Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), and HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], Alimentation et Nutrition, Chimie analytique, analyse métabolique, Food and Nutrition, analyse spectrométrique, Analytical chemistry, bioinformatique, profil métabolique
Abstract

Présentation poster : Y. Fillâtre The Second International Congress of Translational Research in Human Nutrition is organised by the Research Centre in Human Nutrition (CRNH) of Auvergne, of which INRA is a member, in collaboration with NuGO, European Association of universities and research institutes in the field of nutrigenomics ANR Phenomenep ALIA-2010-007 Conseil Regional Auvergne-FEDER post-doc grantPrésentation poster : Y. FillâtreThe Second International Congress of Translational Research in Human Nutrition is organised by the Research Centre in Human Nutrition (CRNH) of Auvergne, of which INRA is a member, in collaboration with NuGO, European Association of universities and research institutes in the field of nutrigenomicsANR Phenomenep ALIA-2010-007 Conseil Regional Auvergne-FEDER post-doc grant; As part of the ANR PhenoMeNEp project, non-targeted profiling is used to identify potential biomarkers of plant food consumption. Using 24 hour dietary recall and food frequency questionnaire data, 144 high (median 974 grams/day) and 66 low (median 305 grams/day) consumers of fruit and vegetables were selected from the French SU.VI.MAX2 cohort. Morning spot urine samples from each subject

Published
2013

10. PhytoHUB :a new knowledge database on dietary phytochemicals and their human metabolites

Author

Giacomoni, Franck, Fillatre, Yoann, Rothwell, J.A, Knox, C., Eisner, R., Cesaire, Daniel, Quintana, Mercedes, Sébédio, Jean-Louis, Comte, Blandine, Pujos-Guillot, Estelle, Manach, Claudine, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, In Siliflo Inc, ANR Phenomenep ALIA-2010-007, and Centre de Recherche en Nutrition Humaine (CRNH). FRA.

Subjects
métabolisme intestinal, base de données, Alimentation et Nutrition, Food and Nutrition, digestion, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, métabolisme microbien, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, métabolisme hépatique, métabolomique
Abstract

Présentation poster : Fillâtre Yoann The Second International Congress of Translational Research in Human Nutrition is organised by the Research Centre in Human Nutrition (CRNH) of Auvergne, of which INRA is a member, in collaboration with NuGO, European Association of universities and research institutes in the field of nutrigenomics; National audience

Published
2013

11. Comparison of the urine metabolomes of stratified SUVIMAX2 subjects to identify biomarkers of fruit and vegetable intake

Author

Fillatre, Yoann, Rothwell, Joe, Touvier, Mathilde, Lyan, Bernard, Martin, Jean-Francois, Joly, Charlotte, Gueho, Soizic, Fezeu Kamedjie, Léopold, Arnault, Nathalie, Sébédio, Jean-Louis, Comte, Blandine, Hercberg, Serge, Pujos-Guillot, Estelle, Galan, Pilar, Manach, Claudine, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR Phenomenep ALIA-2010-007, Conseil Regional Auvergne-FEDER post-doc grant (YF), Metabolomics Society., Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), and HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Subjects
métabolome, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, alimentation végétale, spectrométrie de masse, Alimentation et Nutrition, Chimie analytique, Food and Nutrition, métabolisme digestif, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Analytical chemistry, biomarqueur, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, urine
Abstract

Présentation poster Yoann Fillâtre; International audience

Published
2013

12. Metabolomic profiling to identify biomarkers of coffee consumption in SU.VI.MAX2 cohort subjects

Author

Rothwell, J.A, Fillatre, Yoann, Lyan, Bernard, Martin, Jean-Francois, Touvier, Mathilde, GUEHO, Soizic, Meklat, Noura, Fezeu, Leopold, Comte, Blandine, Hercberg, Serge, Galan, Pilar, Pujos-Guillot, Estelle, Manach, Claudine, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme d'Exploration du Métabolisme, MetaboHUB, and Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

13. A metabolomics approach to identify biomarkers of coffee consumption in subjects from the SU.VI.MAX2 cohort

Author

Rothwell, J.A, Fillatre, Yoann, Lyan, Bernard, Martin, Jean-Francois, Touvier, Mathilde, GUEHO, Soizic, Meklat, Noura, Fezeu, Leopold, Comte, Blandine, Hercberg, Serge, Galan, Pilar, Pujos-Guillot, Estelle, Manach, Claudine, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (UREN), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme d'Exploration du Métabolisme, MetaboHUB, and Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2012

14. Produits phytosanitaires : Développement d'une méthode d'analyse multi-résidus dans les huiles essentielles par couplage de la chromatographie liquide avec la spectrométrie de masse en mode tandem

Author

Fillatre, Yoann, MOLTECH-Anjou, Université d'Angers (UA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Angers, and David Rondeau

Subjects
trappe d'ions linéaire, analyse multi-résidus, Scheduled SRM, essential oil, multi-residue analysis, linear ion trap, spectrométrie de masse, 4000 QTrap, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, huile essentielle, LC-MS/MS, electrospray, pesticide, mass spectrometry
Abstract

Nowadays, about 3000 essential oils are produced and used worldwide in various application fields related to pharmaceutical, agronomic, food and perfume industries. These oils are extracted from citrus or medicinal and aromatic plants. Due to the use of pesticides in plant cultivation, the presence of such residues cannot be ruled out. The variety of pesticides used and the widespread use of essential oils necessitate the development of a multi-residue analytical method to ensure consumers' health. The state of the art of analytical methods related to this issue has revealed a clear lack of performance both in terms of detection limit as well as in the number of analyzed pesticides. This manuscript proposes the development of a multi-residue analytical method of pesticides in essential oils by coupling liquid chromatography and mass spectrometry, technology which is, considering the bibliography, the best dedicated to answer this problematic. After demonstrating the performance of the new acquisition mode Scheduled SRM, available on the mass spectrometer 4000 QTrap, for the detection and quantification of 250 pesticides in a determined solvant, the importance of considering the nature of matrix in sample's preparation as well as during the sample's analysis has further been proved by the study of two representative essential oils (lavandin and lemon). Finally, the multi-residue LC-MS/MS analysis method has been applied to the research of pesticides in real essential oils. This method has demonstrated its ability to detect, quantify and identify pesticides in these matrices through the use of a coupled acquisition mode SRM-EPI making use of the hybrid mass spectrometer's specificities and especially its linear ion trap. Moreover this work has shown the importance of having such a method, considering the number of detected pesticides and their relatively high concentrations. These ones can indeed reach a level higher than one milligram per liter in the analyzed essential oils.; De nos jours, environ 3000 huiles essentielles sont produites et utilisées dans le monde avec des champs d'application aussi variés que la cosmétique, la parfumerie l'agro-alimentaire, la pharmacie et l'aromathérapie. Ces huiles sont extraites des hespéridés ou des plantes aromatiques et médicinales. Étant donné que la culture de ces matières premières implique généralement l'application de pesticides, la présence de tels résidus dans les huiles essentielles ne peut pas être écartée. Compte tenu du nombre important de pesticides employés et des nombreux champs d'application des huiles essentielles, il apparaît nécessaire, afin d'assurer la santé du consommateur, de disposer d'une méthode d'analyse multi-résidus capable de doser les pesticides dans les huiles essentielles. L'état de l'art des méthodes d'analyse lié à cette problématique a révélé un manque évident de performance des méthodes actuelles aussi bien en termes de limite de détection que du nombre de pesticides analysés. Ce mémoire propose donc la mise au point d'une méthode d'analyse multi-résidus de pesticides dans les huiles essentielles par couplage de la chromatographie liquide et de la spectrométrie de masse, technologie la plus à même de répondre à la problématique au vue de la bibliographie. Après avoir mis en évidence les performances du nouveau mode d'acquisition Scheduled SRM, disponible sur le spectromètre de masse 4000 QTrap, pour la détection et la quantification de 250 pesticides dans un solvant déterminé, l'importance de considérer la nature de la matrice, aussi bien dans les méthodes de préparation que lors de l'analyse de l'échantillon, a ensuite été démontrée en étudiant deux huiles essentielles représentatives (lavandin et citron). Enfin, la méthode d'analyse multi-résidus LC-MS/MS a été appliquée à la recherche de pesticides dans des échantillons réels d'huiles essentielles. Elle a démontré sa capacité à détecter, quantifier et identifier les pesticides dans ces matrices au travers de l'utilisation d'un mode d'acquisition couplé SRM-EPI faisant appel aux spécificités du spectromètre de masse hybride et notamment de sa trappe d'ion linéaire. Ce travail a de plus révélé l'importance de disposer d'une telle méthode au regard du nombre de pesticides détectés dans les échantillons et de leurs concentrations relativement élevées. Celles-ci peuvent en effet atteindre des teneurs supérieures au milligramme par litre dans les huiles essentielles analysées.

Published
2011

15. Phytosanitary products : development of a mutiresidue analysis method in essential oils by liquid chromatography coupled with mass spectrometry in tandem mode

Author

Fillatre, Yoann, Plé, Anne-Marie, MOLTECH-Anjou, Université d'Angers (UA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Angers, and David Rondeau

Subjects
[CHIM.ANAL] Chemical Sciences/Analytical chemistry, trappe d'ions linéaire, analyse multi-résidus, Scheduled SRM, essential oil, multi-residue analysis, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, linear ion trap, spectrométrie de masse, 4000 QTrap, huile essentielle, LC-MS/MS, electrospray, pesticide, mass spectrometry
Abstract

Nowadays, about 3000 essential oils are produced and used worldwide in various application fields related to pharmaceutical, agronomic, food and perfume industries. These oils are extracted from citrus or medicinal and aromatic plants. Due to the use of pesticides in plant cultivation, the presence of such residues cannot be ruled out. The variety of pesticides used and the widespread use of essential oils necessitate the development of a multi-residue analytical method to ensure consumers' health. The state of the art of analytical methods related to this issue has revealed a clear lack of performance both in terms of detection limit as well as in the number of analyzed pesticides. This manuscript proposes the development of a multi-residue analytical method of pesticides in essential oils by coupling liquid chromatography and mass spectrometry, technology which is, considering the bibliography, the best dedicated to answer this problematic. After demonstrating the performance of the new acquisition mode Scheduled SRM, available on the mass spectrometer 4000 QTrap, for the detection and quantification of 250 pesticides in a determined solvant, the importance of considering the nature of matrix in sample's preparation as well as during the sample's analysis has further been proved by the study of two representative essential oils (lavandin and lemon). Finally, the multi-residue LC-MS/MS analysis method has been applied to the research of pesticides in real essential oils. This method has demonstrated its ability to detect, quantify and identify pesticides in these matrices through the use of a coupled acquisition mode SRM-EPI making use of the hybrid mass spectrometer's specificities and especially its linear ion trap. Moreover this work has shown the importance of having such a method, considering the number of detected pesticides and their relatively high concentrations. These ones can indeed reach a level higher than one milligram per liter in the analyzed essential oils., De nos jours, environ 3000 huiles essentielles sont produites et utilisées dans le monde avec des champs d'application aussi variés que la cosmétique, la parfumerie l'agro-alimentaire, la pharmacie et l'aromathérapie. Ces huiles sont extraites des hespéridés ou des plantes aromatiques et médicinales. Étant donné que la culture de ces matières premières implique généralement l'application de pesticides, la présence de tels résidus dans les huiles essentielles ne peut pas être écartée. Compte tenu du nombre important de pesticides employés et des nombreux champs d'application des huiles essentielles, il apparaît nécessaire, afin d'assurer la santé du consommateur, de disposer d'une méthode d'analyse multi-résidus capable de doser les pesticides dans les huiles essentielles. L'état de l'art des méthodes d'analyse lié à cette problématique a révélé un manque évident de performance des méthodes actuelles aussi bien en termes de limite de détection que du nombre de pesticides analysés. Ce mémoire propose donc la mise au point d'une méthode d'analyse multi-résidus de pesticides dans les huiles essentielles par couplage de la chromatographie liquide et de la spectrométrie de masse, technologie la plus à même de répondre à la problématique au vue de la bibliographie. Après avoir mis en évidence les performances du nouveau mode d'acquisition Scheduled SRM, disponible sur le spectromètre de masse 4000 QTrap, pour la détection et la quantification de 250 pesticides dans un solvant déterminé, l'importance de considérer la nature de la matrice, aussi bien dans les méthodes de préparation que lors de l'analyse de l'échantillon, a ensuite été démontrée en étudiant deux huiles essentielles représentatives (lavandin et citron). Enfin, la méthode d'analyse multi-résidus LC-MS/MS a été appliquée à la recherche de pesticides dans des échantillons réels d'huiles essentielles. Elle a démontré sa capacité à détecter, quantifier et identifier les pesticides dans ces matrices au travers de l'utilisation d'un mode d'acquisition couplé SRM-EPI faisant appel aux spécificités du spectromètre de masse hybride et notamment de sa trappe d'ion linéaire. Ce travail a de plus révélé l'importance de disposer d'une telle méthode au regard du nombre de pesticides détectés dans les échantillons et de leurs concentrations relativement élevées. Celles-ci peuvent en effet atteindre des teneurs supérieures au milligramme par litre dans les huiles essentielles analysées.

Published
2011

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