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Genomic position of QNFC1 in GB51130 (predicted E3 Ubiquitin Ligase). QNFC1 is located in an exon of GB51130, which has an alternatively spliced transciript variant in newly-emerged workers (6bp downstream from the splice site)

Statistics of compiled AMPs for broad taxonomic group. (PDF 34Â kb)

Properties of gene models. Gene models were tagged based on the presence of eukaryotic or prokaryotic sequences, as assessed by comparison to the NCBI nr database (see Methods). The properties of the gene models were analysed based on the numbers of exons and the transcriptional expression levels. (PDF 481Â kb)

Over- or under-represented Superfamily domains in SC and XT. Superfamily domains that are unusually enriched in SC and XT. Domains with |deviation|â >â 0.5 are shown. (PDF 64Â kb)

Supplementary information describing relationship between Xestospongia testudinaria and Xestospongia muta, antimicrobial peptides, and evolutionary rates of innate immune domains in analyzed sponge genomes. (PDF 790Â kb)

Detailed statistics of our sponge genomes and transcriptomes. (PDF 263Â kb)

Comparison of gene annotation quality among sponge dataset. Transcript models of 16 sponge species are compared to address the quality of gene annotation. (PDF 60Â kb)

Taxonomic origins of the AMPs that were successfully aligned to the sponge genomes. (PDF 47Â kb)

• Premise of the study: To investigate fungal species identity and diversity in mycorrhizal fungi of order Sebacinales, we developed phylogenetic markers. These new markers will enable future studies investigating species delineation and phylogenetic relationships of the fungal symbionts and facilitate investigations into evolutionary interactions among Sebacina species and their orchid hosts. • Methods and Results: We generated partial genome sequences for a Sebacina symbiont originating from Caladenia huegelii with 454 genome sequencing and from three symbionts from Eriochilus dilatatus and one from E. pulchellus using Illumina sequencing. Six nuclear and two mitochondrial loci showed high variability (10–31% parsimony informative sites) for Sebacinales mycorrhizal fungi across four genera of Australian orchids (Caladenia, Eriochilus, Elythranthera, and Glossodia). • Conclusions: We obtained highly informative DNA markers that will allow investigation of mycorrhizal diversity of Sebacinaceae fungi associated with terrestrial orchids in Australia and worldwide.

Ecological developmental biology (eco-devo) explores the mechanistic relationships between the processes of individual development and environmental factors. Recent studies imply that some of these relationships have deep evolutionary origins, and may even pre-date the divergences of the simplest extant animals, including cnidarians and sponges. Development of these early diverging metazoans is often sensitive to environmental factors, and these interactions occur in the context of conserved signaling pathways and mechanisms of tissue homeostasis whose detailed molecular logic remain elusive. Efficient methods for transgenesis in cnidarians together with the ease of experimental manipulation in cnidarians and sponges make them ideal models for understanding causal relationships between environmental factors and developmental mechanisms. Here, we identify major questions at the interface between animal evolution and development and outline a road map for research aimed at identifying the mechanisms that link environmental factors to developmental mechanisms in early diverging metazoans.

La présente invention a pour objet un nouveau procédé de fractionnement de sous-produit animal issu des procédés utilisés dans la filière de la charcuterie industrielle comprenant les étapes suivantes : a) broyage du sous-produit animal jusqu'à obtenir des particules dont la taille varie de 0,1 mm à 100 mm. b) mise en contact de la matière broyée à l'étape a) avec de l'eau à une température allant de 20°C à 85°C ; c) séparation de la phase solide et de la phase liquide du mélange obtenu à l'étape b) à une température allant de 20°C à 85°C ; d) décantation de la phase liquide obtenue à l'étape c) ; e) refroidissement et séparation de la phase aqueuse et de la phase grasse obtenues après la décantation de l'étape d) ; ainsi que les diverses utilisations des produits obtenus par ce procédé., Process of fractionation of animal by-product comprises: (a) grinding animal by-product to obtain particles having a size of 0.1-100 mm; (b) contacting the material with water at a temperature of 20-85[deg] C; (c) separating the solid phase and liquid phase from the mixture at a temperature of 20-85[deg] C; (d) decanting the liquid phase obtained in step (c); and (e) cooling and separating the aqueous and fatty phase obtained after the step (d). An independent claim is included for protein solution obtained by the method, containing 1-20 wt.% of dry extract comprising: 75-95 wt.% of protein; 1-10 wt.% of fat, and 0.5-3 wt.% of minerals; 0.1-5 wt.% of sulfated glycosaminoglycans; and 0.01-1 wt.% of hyaluronic acid.

Le coproduit de fabrication de jambon sec est issu de l'opération de désossage de la cuisse de porc parée, salée, séchée et affinée. Il est constitué à plus de 85 % d'os et de tissus associés (cartilages, ligaments, tendons). Le concassage au broyeur à marteau permet d'homogénéiser le coproduit en morceaux de taille inférieure à 8 cm (> 90 % compris entre 40 et 80 mm). La composition chimique de la matière sèche du mélange (77 ± 3 % de MS) est de 33 ± 5 % en protéines (89 % de collagène, 14 % de protéines hydrosolubles, 6 % d'acide aminés libres), 31 ± 3 % en lipides (triglycérides : 70 % ; diglycérides : 3,5 % ; acides gras libres : 11 % ; saturé/insaturé : 0,87 ; 24 % C16 :0 ; 13 % C18 :0 ; 2 % C16 :1 ; 38 % C18 :1 ; 4 % C18 :2) et 26 ± 4 % de matière minérale (phosphate de calcium 88 % ; NaCl 9 %). L'extraction aqueuse des lipides et des protéines du coproduit est étudiée en contacteur agité. Le raffinat solide est séparé par filtration à chaud sous forme de granulat et la matière grasse entraînée est séparée par décantation à froid. L'étude de l'influence des principaux facteurs de l'extraction liquide/solide (temps de contact : 30 à 90 min, température : 40 à 90°C ; ratio eau/coproduit : 4 à 10) grâce à la réalisation d'un plan d'expérience met en évidence les effets de la solubilisation et la coagulation des protéines sur l'entraînement des lipides et leur décantation sous forme de matière grasse. Mis en oeuvre à l'échelle pilote (64 kg de coproduit de jambon sec concassé, 207 kg d'eau, 30 min à 90°C en contacteur agité), le procédé de fractionnement aqueux conduit par filtration centrifuge et séchage à un granulat stable (rendement : 59 % ; matière minérale : 41 % ; protéines : 43 % ; lipides : 16 %), source de phosphate de calcium (95 % de la matière minérale) et de gélatine ou de colle d'os (88 % de protéines de nature collagénique). La fraction matière grasse décantée (rendement : 24 % ; lipides : 93 % ; triglycérides : 75 % ; diglycérides : 4 % ; acides gras libres : 7 % ; saturé/insaturé : 0,82 % ; 37 % C16 :0 ; 15 % C18 :0 ; 2 % C16 :1 ; 44 % C18 :1 ; 8 % C18 :2) présente les mêmes caractéristiques physicochimiques que le saindoux, avec une odeur proche de celle du jambon sec (19 COV aromatiques identifiés présents dans les arômes majoritaires de jambon). La fraction protéines solubilisées, obtenue sous forme de lyophilisat après concentration de la phase aqueuse (rendement : 8 % ; protéines : 52 % dont 29 % d'acides aminés libres ; matière minérale : 29 % dont 90 % NaCl, lipides : 3 %), contient aussi des glucosaminoglycanes sulfatés (GAGs : 3,4 %). Ces caractéristiques de composition, associées à ses propriétés épaississantes et gélifiantes, adhésives et stabilisantes d'émulsion, font de cette fraction minoritaire du procédé de fractionnement aqueux du coproduit de jambon sec, un extrait aux multiples applications à forte valeur ajoutée (source de peptones pour la culture de champignons et de levures, adhésif et liant naturel, ingrédient de formulation alimentaire nutracétique et cosmétique).

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Issue Date : 2012-01-27; Process of fractionation of animal by-product comprises: (a) grinding animal by-product to obtain particles having a size of 0.1-100 mm; (b) contacting the material with water at a temperature of 20-85[deg] C; (c) separating the solid phase and liquid phase from the mixture at a temperature of 20-85[deg] C; (d) decanting the liquid phase obtained in step (c); and (e) cooling and separating the aqueous and fatty phase obtained after the step (d). An independent claim is included for protein solution obtained by the method, containing 1-20 wt.% of dry extract comprising: 75-95 wt.% of protein; 1-10 wt.% of fat, and 0.5-3 wt.% of minerals; 0.1-5 wt.% of sulfated glycosaminoglycans; and 0.01-1 wt.% of hyaluronic acid.; La présente invention a pour objet un nouveau procédé de fractionnement de sous-produit animal issu des procédés utilisés dans la filière de la charcuterie industrielle comprenant les étapes suivantes : a) broyage du sous-produit animal jusqu'à obtenir des particules dont la taille varie de 0,1 mm à 100 mm. b) mise en contact de la matière broyée à l'étape a) avec de l'eau à une température allant de 20°C à 85°C ; c) séparation de la phase solide et de la phase liquide du mélange obtenu à l'étape b) à une température allant de 20°C à 85°C ; d) décantation de la phase liquide obtenue à l'étape c) ; e) refroidissement et séparation de la phase aqueuse et de la phase grasse obtenues après la décantation de l'étape d) ; ainsi que les diverses utilisations des produits obtenus par ce procédé.

Mean difference in the proportion of patterns between strands at nadrin-2 following resampling of patterns in Workers (A) and Queens (B). Resampling was performed 1000 times and the mean difference between strands was computed and averaged across three replicates.

Mean difference in the proportion of patterns between strands at nadrin-2 following resampling of patterns in Workers (A) and Queens (B). Resampling was performed 1000 times and the mean difference between strands was computed and averaged across three replicates.