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A conservação da qualidade de solos nativos e cultivados na região do Cerrado, vista do ponto de vista microbiológico, tem sido discutida tanto com foco ecológico quanto produtivo. Neste trabalho, a biota do solo sob Cerrado nativo foi contrastada com aquela presente nos sistemas de cultivo plantio direto (soja/sorgo), integração lavoura-pecuária (soja/braquiária), café, floresta de eucalipto cultivada e pastagem não manejada, formando o objeto de estudo. Posto que é laborioso levantar todos os parâmetros físicos e químicos que circundam a qualidade de um solo e como a comunidade de fungos e bactérias sofre influência direta destes fatores, o estudo microbiológico, exclusivamente, pode responder sobre a qualidade de um sistema nativo ou cultivado. Para este estudo foram coletadas 10 amostras compostas dentro de cada sistema de cultivo em forma de transecto, distando 20 metros entre si. A comunidade microbiológica foi avaliada quanto a sua densidade a partir da quantificação do carbono da biomassa microbiana, do carbono total, do nitrogênio da biomassa e do nitrogênio total. Sabendo que a avaliação quantitativa não seria suficiente para expressar o comportamento da comunidade microbiana, a análise do potencial metabólico baseada nos testes de capacidade degradativa de substratos, teste enzimático e respiração basal do solo, foram aplicadas. Os dados quantitativos mostraram que as áreas de pastagem e plantio direto apresentam uma biomassa microbiana semelhante ao solo sob Cerrado nativo (controle) porém divergem significativamente na capacidade degradativa dos substratos e na atividade enzimática, mostrando que o cultivo imprimiu seleção sobre a microbiota nestas áreas. The conservation of native and cultivated soils quality in the Cerrado region, seen by a microbiological point of view, has been discussed with both ecological as productive focus. In this work, the quality of native Cerrado was contrasted with that present in no-tillage system (soybean/sorghum), crop-livestock system (soy/pasture), cultivated coffee, eucalyptus forest and not managed grassland, to form the object of study. Since it is laborious to assess all the physical and chemical parameters that surround the quality of soil and, as the community of fungi and bacteria receive direct influence of these factors, the microbiological study can answer questions about the quality of a native or cultivated system. For this study 10 composite samples were collected within each cropping system on a transect shape, lying 20 meters from each other. The microbial community was evaluated for its density from the quantification of microbial biomass carbon, total carbon, microbial biomass nitrogen and total nitrogen. Once is known that the quantitative assessment would not be enough to express the behavior of microbial community, an analysis of the metabolic potential based on degrading capacity of substrates, enzyme assay and basal soil respiration tests were applied. Quantitative data showed that areas of pasture and no-tillage had similar microbial biomass of the soil under native Cerrado (control) but differ significantly in the degradative capacity of substrates and enzyme activity, showing that crops impress selection under microbiota in these areas. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES