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International audience; Madagascar reports few measles cases annually and high vaccination campaign coverage. However, the underlying age profile of immunity and risk of a measles outbreak is unknown. We conducted a nested serological survey, testing 1,005 serum samples (collected between November 2013 and December 2015 via Madagascar's febrile rash surveillance system) for measles immunoglobulin G antibody titers. We directly estimated the age profile of immunity and compared these estimates with indirect estimates based on a birth cohort model of vaccination coverage and natural infection. Combining these estimates of the age profile of immunity in the population with an age-structured model of transmission, we further predicted the risk of a measles outbreak and the impact of mitigation strategies designed around supplementary immunization activities. The direct and indirect estimates of age-specific seroprevalence show that current measles susceptibility is over 10%, and modeling suggests that Madagascar may be at risk of a major measles epidemic.

Background Rift Valley fever (RVF) is one of the main vector borne zoonotic diseases that affects a wide range of ruminants and human beings in Africa and the Arabian Peninsula. A rapid and specific test for RVF diagnosis at the site of a suspected outbreak is crucial for the implementation of control measures. Methodology/Principal findings A first-line lateral flow immunochromatographic strip test (LFT) was developed for the detection of the nucleoprotein (N) of the RVF virus (RVFV). Its diagnostic performance characteristics were evaluated using reference stocks isolates recovered from different hosts and in geographic regions mimicking clinical specimens and from known RVF negative serum samples. A high level of diagnostic accuracy (DSe (35/35), DSp (167/169)) was observed, including the absence of cross-reactivity with viruses belonging to different genera. Author summary Rift Valley fever (RVF) is a viral disease that affects a wide range of animals and human beings in Africa and the Arabian Peninsula involving low case fatality rates. A rapid and specific test for RVF diagnosis at the site of a suspected outbreak is crucial for the implementation of control measures. Here, we report the development and the evaluation of the diagnostic performance characteristics of a pen-side test found to be a highly accurate and valuable first-line diagnostic tool for on-site RVF detection.

Objective: West Nile virus (WNV) is considered as the most prevalent arbovirus in Madagascar, yet few studies have focused on WNV circulation in wild birds and horses. The aims of this study are (i) to provide recent estimates of WNV seroprevalence and incidence in horses, (ii) to assess which wild bird species are exposed to WNV and (iii) to identify risk factors associated with exposure in horses and wild birds. Materials and methods: Horses from 4 regions of Madagascar were sampled before and after the 2015-2016 rainy season to estimate prevalence and incidence. Stable and horse characteristics were collected through a questionnaire. A wide range of wild birds species from the same regions were sampled in 2016-2017. Antibodies against WNV in horses and birds were tested using a competition ELISA test; results of a subset of samples were further confirmed using either a specific microsphere immunoassay for horses or a viral neutralization assay for birds. Logistic models were developed to identify risk factors. Results: Overall seroprevalence in horses was 33.5% (n=254) and incidence during the rainy season was 8.8% (n=147). Age, presence of ponds, use of insecticides and combined presence of rice fields and ruminants in the vicinity of stables were identified as risk factors. Overall, 352 birds (belonging to 41 species) were tested and 12.5% (belonging to 19 species) were seropositive. Birds caught outside wetlands, in Alaotra Mangoro region, belonging to the Passeriformes order, and species with an area of distribution in the Indian Ocean islands were significantly more exposed to WNV. Conclusion: This study confirms that WNV is endemic with high levels of circulation in horses, although no clinical cases were recorded. For the first time in Madagascar, 19 species of wild birds (among which 12 of the 21 Passeriformes species) were shown to be exposed to WNV.

Purpose: In 2008-09, an outbreak of Rift Valley fever (RVF) virus occurred in Madagascar. Spatial heterogeneity in seroprevalence (SP) and case occurrence frequencies suggested that some areas are more favorable to RVF circulation. The objectives of our study were to identify environmental factors in favor to human and cattle infections; test the relevance of using local cattle infection as human infection predictor and give a new insight on the respective role of direct and vectorial transmission both in human and cattle. Methods: We used 2 independent cattle and human serological datasets originating from two national surveys (2009 and 2011-13). Multiple Factor Analysis (MFA) was used to characterize environments of the whole island in terms of climate and landscape. The datasets were analyzed independently using a generalized linear mixed model (GLMM) with the individual serological status- human or cattle- as the binomial response. Explicative variables were age and MFA factors for cattle model (M1) and age, gender, MFA factors and contact with ruminants and their product for human model (M2). Then human and cattle data were analyzed jointly by GLMM with the human individual status as binomial response. In addition to the previous explicative variables cattle SP predicted by M1 was used. Models accuracies were tested using ROC curve method. Results: Four MFA factors were selected. Age and factor4 - humid (irrigation, lake, marshland) environment - had a positive effect on SP of cattle and human living in rural areas (p

A serological study was performed in 2009 in Madagascar highlands to evaluate the point prevalence rate of RVF antibodies in ruminants and identify environmental and trade factors potentially linked to RVF persistence and transmission. Nine hundred ruminants were randomly selected among 51 villages and sampled. Sera were analysed using a commercial validated ELISA test. For each ruminant, the following variables were recorded: age, location of the night pen, minimum distance from the pen to the closest water point and the forest, water point type, and the way owners use to renewal their herd: auto-renewal vs purchase. Serological data were analysed using a generalized linear mixed model, the individual serological status being the binomial response, and the above-mentioned variables the explicative factors, and the breeder as random effect. The overall IgG seroprevalence rate was 28% [IC95% 25-31]. The main effect on prevalence was due to age (P=10-4) suggesting an endemic RVF circulation in this area. The distance to the closest water point was a protective factor (P=5×10-3) but the type of water point had no effect on the prevalence rate: a substantial part of the transmission is due to vectors and several mosquito species are probably involved. Ruminants belonging to owners renewing their herd by purchase were significantly more infected than others (P=0.04), suggesting that cattle trade may contribute to the circulation of the virus in this area. This is the first evidence of a recurrent transmission of RVFV in such an ecosystem which associates a wet, temperate climate, high altitude, paddy fields, and vicinity to a dense rain forest. Persistence mechanisms need to be further investigated. (Texte intégral)

Introduction : A Madagascar, les premières épidémies et épizooties de Fièvre de la Vallée du Rift (FVR) ont été rapportées en 1990-1991. A la suite des épidémies et épizooties de FVR en Afrique de l'Est en 2006-2007, la FVR a été détectée dans les îles du sud ouest de l'Océan Indien (Union des Comores, Madagascar) en 2007 et 2008. A Madagascar, le premier cas humain a été détecté en Janvier 2008 suivi de nombreux cas humains et animaux jusqu'en mars 2009. Des études rétrospectives ont montré que le VFVR avait largement circulé dans le pays depuis 2007. Au cours d'une épidémie, des moustiques ont été collectés autour des cas et des pools de femelles non gorgées composées d'Anopheles coustani, Anopheles squamosus/cydippis et Culex antennatus ont été trouvé infectés par le VFVR, suggérant que ces espèces auraient pu jouer un rôle dans la transmission du virus. Les analyses phylogénétiques des souches ayant circulé lors des épisodes de 2008-2009 ont montré que le virus était génétiquement proche de celui ayant circulé en 2006-2007 au Kenya suggérant une nouvelle introduction du virus à Madagascar depuis l'Afrique de l'Est. Les mécanismes d'introduction, de maintenance et de diffusion du VFVR à Madagascar restent à élucider. Pour une meilleure compréhension de ces mécanismes, plusieurs études ont été mises en place dans le cadre du programme de coopération scientifique sur les maladies émergentes dans l'Océan Indien (OI) : le PCSMAE AnimalRisk avec pour objectifs (i) détecter une circulation à bas-bruit du VFVR, (ii) déterminer les espèces de moustiques pouvant être impliquées dans cette circulation à bas-bruit, (iii) déterminer si le virus circulant actuellement est génétiquement similaire à celui circulant en 2008-2009 et enfin (iv) identifier des facteurs de risque et les mécanismes associés à cette circulation et à la dissémination de VRFV à Madagascar, (v) étudier les flux de ruminant à l'intérieur du pays et entre les îles du sud ouest de l'OI Méthodes : Un troupeau sentinelle a été mis en place dans deux zones agro-écologiques différentes à Tuléar (Sud) et Mampikony (Nord-Ouest). Cent cinquante zébus (60 à Mampikony et 90 à Tulear) âgés de 6 mois à 13 mois au début de l'étude ont été identifiés et prélevés mensuellement. Les prélèvements de sérums ont été testés pour une recherche en Immunoglobuline (Ig) M et Ig G dirigées contre le VFVR par ELISA sandwich et ELISA indirect respectivement. Des captures entomologiques ont été organisées dans les sites d'étude en mai et septembre 2010 et mars 2011 pour Tuléar ainsi qu'en avril 2010 et avril 2011 à Mampikony. Enfin une étude sur les flux commerciaux de ruminants dans le pays et entre les îles de l'OI a été menée. Résultats : Durant la période d'étude 53 animaux ont été détectés positifs en IgM dirigées contre le VFVR, traduisant une circulation récente du VFVR. Le nombre d'animaux positif en IgM est plus élevé à Tuléar qu'à Mampikony (respectivement 38 et 15 animaux). Le pic de nouveaux individus en contact avec le VFVR est situé en janvier 2011. La détection du VFVR par RT-PCR dans les sérums récoltés est en cours. Les enquêtes menées dans les ports situés au nord et au nord ouest de Madagascar ne nous ont pas permises d'identifier des importations illicites d'animaux vivants ou denrées alimentaires d'origine animale (DAOA) depuis l'Afrique de l'Est ou l'Archipel des Comores. En revanche, nos enquêtes nous ont permis de déterminer que des exportations de bovins avaient eu lieu depuis le port de Manjunga à destinations des Comores. L'étude sur les flux de bovins dans le pays, nous a permis de déterminer et quantifier les flux d'animaux entrant et sortant des marchés à zébus d'Ambalavao, Ihosy et Ampanotonkana et les flux entrant à Antananarivo. Au total, 10 849 moustiques dont 5 genres et 31 espèces à Mampikony et 5 706 moustiques dont 4 genres et 16 espèces à Tuléar ont été identifiés. En 2010, les vecteurs potentiels (seules les trois espèces citées plus haut sont concernées)

Identifié à Madagascar depuis 1979, le virus de la Fièvre de la Vallée du Rift (FVR) provoque régulièrement épidémies et épizooties dans la région Océan Indien. Lancé en 2009, le programme "AnimalRisk" a déjà mis en évidence lors de sa première phase, un passage important du virus dans la région et notamment dans tout l'archipel des Comores pour lequel aucune information n'était connue à ce jour. En effet, plus d'un ruminant comorien sur trois prélevé a été testé positif à la recherche d'anticorps anti-FVR. La prévalence globale de la maladie est de 32.8% (28.6% - 36.9%) et varie en fonction des îles avec Anjouan 26.6% (20.0% - 33,3%), Grande Comore 34.3% (28,7% - 40,0%) et Mohéli 45.8% (31.7% - 59.9%). Cette nouvelle donnée, aussi importante, méritait d'être complétée afin de savoir si le virus était toujours présent dans l'archipel. L'importation régulière de ruminants tanzaniens par l'Union des Comores ainsi que les échanges formels et informels de personnes et d'animaux entre les îles de la zone sont des risques d'introduction ou de réintroduction des pathogènes et notamment du virus de la FVR. Plus encore, les facteurs potentiels d'endémisation de la maladie doivent être identifiés et caractérisés afin d'évaluer le risque d'apparition de futures épidémies ou épizooties. Pour répondre à ces questions, un large dispositif a été mis en place lors de la seconde phase du programme " AnimalRisk "dans tous les pays de l'Océan Indien affectés par cette maladie. Pour deux zones de Madagascar, cinq de Mayotte et quatre de l'Union des Comores, des animaux sentinelles ont été identifiés et un suivi sérologique et virologique a été réalisé pendant au moins un an. Des nouvelles données sur les flux d'animaux ont été également collectées suite à la mise en place d'un suivi mensuel des échanges au niveau des points d'entrées/sorties probables d'animaux dans les îles de l'archipel des Comores. En parallèle, la caractérisation du milieu ainsi que des pratiques d'élevage et de commercialisation a été effectuée. Enfin, un suivi entomologique, mené en même temps que le suivi animal, a été réalisé sur les mêmes zones afin de recenser les espèces entomologiques hématophages et les vecteurs potentiels du virus de la FVR. Les résultats préliminaires de ce second volet du programme " AnimalRisk " vont tous dans le même sens. Le virus de la FVR est bien présent et circule en période interépidémique dans tous les pays de l'étude. Ainsi, pour la seule Union des Comores, sur une moyenne de 20 animaux suivis par site pour Anjouan et Mohéli et 35 pour la Grande Comore, onze animaux ont séroconverti. Les séroconversion ont été observées sur les trois îles mais l'incidence la plus élevée est observée à Mohéli avec 35.9% des animaux naïfs de l'étude ayant séroconverti sur 15 mois. (Texte intégral)

Pour répondre aux défis lancés par les maladies émergentes dans l'Océan Indien, les acteurs de la santé animale ont mis en place depuis début 2009 le réseau AnimalRisk-OI. Ce réseau a pour objectif d'apporter un soutien technique et scientifique aux systèmes de surveillance et de proposer des réponses pour une meilleure gestion des risques sanitaires dans la zone. Les partenaires sont les référents de l'OIE dans l'Océan Indien, à savoir les services vétérinaires ainsi que les structures de recherche impliquées en santé animale. Le réseau AnimalRisk-OI n'a pas pour vocationde se substituer aux systèmes de surveillance existants, mais il est chargé d'animer une réflexion autour des problématiques observées par des téléweb conférences bimensuelles, des réunions annuelles et des bulletins d'information trimestriels et de nourrir des actions de recherche qui visent à mieux comprendre l'épidémiologie de certaines maladies et donc de proposer des mesures de gestion adéquates pour mieux les maîtriser. Les premiers résultats de la surveillance et des investigations sur certaines maladies considérées prioritaires par les partenaires sont présentés ici. Les orientations envisagées, outre la poursuite de la synergie entre les actions de surveillance et de recherche, sont un rapprochement avec la santé humaine pour permettre une approche commune et harmonisée de l'appréciation et de la gestion des risques sanitaires dans l'Océan Indien.

Bats are reservoirs for emerging human pathogens, including Hendra and Nipah henipaviruses and Ebola and Marburg filoviruses. These viruses demonstrate predictable patterns in seasonality and age structure across multiple systems; previous work suggests that they may circulate in Madagascar's endemic fruit bats, which are widely consumed as human food. We aimed to (a) document the extent of henipa- and filovirus exposure among Malagasy fruit bats, (b) explore seasonality in seroprevalence and serostatus in these bat populations and (c) compare mechanistic hypotheses for possible transmission dynamics underlying these data. To this end, we amassed and analysed a unique dataset documenting longitudinal serological henipa- and filovirus dynamics in three Madagascar fruit bat species. We uncovered serological evidence of exposure to Hendra-/Nipah-related henipaviruses in Eidolon dupreanum, Pteropus rufus and Rousettus madagascariensis, to Cedar-related henipaviruses in E. dupreanum and R. madagascariensis and to Ebola-related filoviruses in P. rufus and R. madagascariensis. We demonstrated significant seasonality in population-level seroprevalence and individual serostatus for multiple viruses across these species, linked to the female reproductive calendar. An age-structured subset of the data highlighted evidence of waning maternal antibodies in neonates, increasing seroprevalence in young and decreasing seroprevalence late in life. Comparison of mechanistic epidemiological models fit to these data offered support for transmission hypotheses permitting waning antibodies but retained immunity in adult-age bats. Our findings suggest that bats may seasonally modulate mechanisms of pathogen control, with consequences for population-level transmission. Additionally, we narrow the field of candidate transmission hypotheses by which bats are presumed to host and transmit potentially zoonotic viruses globally.