Author: "Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP)" - Searchworks@Jio Institute Digital Library Search Results

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1. Reconstitutions paléolimnologiques et paléoclimatiques à partir de l'étude des assemblages de Chironomidae (Insecta : Diptera) subfossiles et de la matière organique sédimentaire de la séquence tardiglaciaire du Lago dell'Accesa (Toscane, Italie).

Author: Laboratoire Chrono-environnement ; Université de Franche-Comté - CNRS, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP) ; CNRS - Institut de recherche pour le développement [IRD] - Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse - Université de Provence - Aix-Marseille I - Université Paul Cézanne - Aix-Marseille III, Institut des Sciences de la Terre d'Orléans (ISTO) ; CNRS - INSU - Université d'Orléans, Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (EDYTEM) ; Université de Savoie - CNRS, Millet, Laurent, Vannière, Boris, Magny, Michel, Beaulieu (de), Jacques-Louis, Disnar, Jean-Robert, Laggoun-Défarge, Fatima, Verneaux, Valérie, Walter-Simonnet, Anne-Véronique, Ortu, Elena, Bossuet, Gilles, Laboratoire Chrono-environnement ; Université de Franche-Comté - CNRS, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP) ; CNRS - Institut de recherche pour le développement [IRD] - Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse - Université de Provence - Aix-Marseille I - Université Paul Cézanne - Aix-Marseille III, Institut des Sciences de la Terre d'Orléans (ISTO) ; CNRS - INSU - Université d'Orléans, Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (EDYTEM) ; Université de Savoie - CNRS, Millet, Laurent, Vannière, Boris, Magny, Michel, Beaulieu (de), Jacques-Louis, Disnar, Jean-Robert, Laggoun-Défarge, Fatima, Verneaux, Valérie, Walter-Simonnet, Anne-Véronique, Ortu, Elena, and Bossuet, Gilles

2. Modelling the distribution and compositional variation of plant communities at the continental scale

Author: Daniel Dítě, Jonathan Lenoir, Xavier Font, Željko Škvorc, Milan Chytrý, Zygmunt Kącki, François Gillet, Joop H.J. Schaminée, Laura Casella, Stephan M. Hennekens, Michal Hájek, Emiliano Agrillo, Florian Jansen, Petra Hájková, Jozef Šibík, Susana Suárez-Seoane, Ute Jandt, John S. Rodwell, Jörg Brunet, Henry Brisse, Borja Jiménez-Alfaro, Ariel Bergamini, Wolfgang Willner, Jose Manuel Álvarez-Martínez, Ioannis Tsiripidis, Lucia Sekulová, Department of Botany and Zoology, Masaryk University, Area de Ecología, Departamento de Biodiversidad y Gestión Ambiental, Facultad de Ciencias Biológicas y Ambientales, Universidad de León [León], ALTERRA Wageningen, ALTERRA, Vienna Institute for Nature Conservation and Analyses ( VINCA ), Czech University of Life Sciences Prague, WSL Lausanne, WSL, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Southern Swedish Forest Research Centre, Swedish University of Agricultural Sciences ( SLU ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Department of Botany & Zoology, Masaryk, Philips Research Europe - Hamburg, Sector Medical Imaging Systems, Philips Research, Ecologie et Dynamique des Systèmes Anthropisés ( EDYSAN ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), University of Nijmegen, Masaryk University [Brno] (MUNI), Vienna Institute for Nature Conservation and Analyses (VINCA), Instituto de Hidráulica Ambiental, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Università degli Studi di Udine - University of Udine [Italie], Laboratory of Ecological Systems, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Department of Botany and Zoology [Brno] (SCI / MUNI), Faculty of Science [Brno] (SCI / MUNI), Masaryk University [Brno] (MUNI)-Masaryk University [Brno] (MUNI), Ecologie et Dynamique des Systèmes Anthropisés - UMR CNRS 7058 (EDYSAN), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aristotle University of Thessaloniki, Universitat de Barcelona, Ecologia, Facultad de Ciencias Biologicas y Ambientales, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Ecologie et Dynamique des Systèmes Anthropisés (EDYSAN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, and Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE)
Subjects: 0106 biological sciences, generalized dissimilarity modelling, Occupancy, extent of occurrence, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, habitat conservation, Bos- en Landschapsecologie, Extrapolation, Plant Ecology and Nature Conservation, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Geographical distance, vegetation, Forest and Landscape Ecology, Plant varieties, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Vegetatie, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Sampling bias, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Vegetation, Varietats de plantes, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, community distribution models, Habitat conservation, Species diversity, Plant community, 15. Life on land, PE&RC, Ecología. Medio ambiente, plant communities, Habitat, community distribution models, ecosystem properties, extent of occurrence, generalized dissimilarity modelling, habitat conservation, plant communities, vegetation, Environmental science, ecosystem properties, Plantenecologie en Natuurbeheer, Vegetatie, Bos- en Landschapsecologie, Physical geography, Vegetation, Forest and Landscape Ecology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; Aim. We investigate whether (1) environmental predictors allow to delineate the distribution of discrete community types at the continental scale and (2) how data completeness influences model generalization in relation to the compositional variation of the modelled entities. Location. Europe. Methods. We used comprehensive datasets of two community types of conservation concern in Europe: acidophilous beech forests and base‐rich fens. We computed community distribution models (CDMs) calibrated with environmental predictors to predict the occurrence of both community types, evaluating geographical transferability, interpolation and extrapolation under different scenarios of sampling bias. We used generalized dissimilarity modelling (GDM) to assess the role of geographical and environmental drivers in compositional variation within the predicted distributions. Results. For the two community types, CDMs computed for the whole study area provided good performance when evaluated by random cross‐validation and external validation. Geographical transferability provided lower but relatively good performance, while model extrapolation performed poorly when compared with interpolation. Generalized dissimilarity modelling showed a predominant effect of geographical distance on compositional variation, complemented with the environmental predictors that also influenced habitat suitability. Main conclusions. Correlative approaches typically used for modelling the distribution of individual species are also useful for delineating the potential area of occupancy of community types at the continental scale, when using consistent definitions of the modelled entity and high data completeness. The combination of CDMs with GDM further improves the understanding of diversity patterns of plant communities, providing spatially explicit information for mapping vegetation diversity and related habitat types at large scales.
Published: 2018

3. Climate changes during the Lateglacial in South Europe: new insights based on pollen and brGDGTs of Lake Matese in Italy

Author: Mary Robles, Odile Peyron, Guillemette Ménot, Elisabetta Brugiapaglia, Sabine Wulf, Oona Appelt, Marion Blache, Boris Vannière, Lucas Dugerdil, Bruno Paura, Salomé Ansanay-Alex, Amy Cromartie, Laurent Charlet, Stephane Guédron, Jacques-Louis de Beaulieu, Sébastien Joannin, Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement (LGL-TPE), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Portmouth University, German Research Centre for Geosciences - Helmholtz-Centre Potsdam (GFZ), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Plant Sciences, University of Bern, Maison des Sciences de l'Homme et de l'Environnement Claude Nicolas Ledoux (UAR 3124) (MSHE), Oeschger Centre for Climate Change Research (OCCR), Laboratoire de Géophysique Interne et Tectonophysique (LGIT), Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire Central des Ponts et Chaussées (LCPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géochimie, Institut des Sciences de la Terre (ISTerre), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-PRES Université de Grenoble-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-PRES Université de Grenoble-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Università degli Studi del Molise = University of Molise (UNIMOL), Cornell University [New York], Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR219-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Gustave Eiffel-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), and Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Bølling-Allerød, Younger Dryas, Molecular Biomarker, Paleoclimate, Tephra, Transfer functions, Lateglacial, [SHS.ENVIR]Humanities and Social Sciences/Environmental studies, [SDE]Environmental Sciences, Mediterranean region Palynology Molecular Biomarker Paleoclimate Transfer functions Tephra Younger Dryas Bølling-Allerød Lateglacial, Mediterranean region, Palynology
Abstract: The Lateglacial (14,700–11,700 cal BP) is a key climate period marked by rapid but contrasted changes in the Northern Hemisphere. Indeed, regional climate differences have been evidenced during the Lateglacial in Europe and the Northern Mediterranean areas. However, past climate patterns are still debated since temperature and precipitation changes are poorly investigated towards the lower European latitudes. Lake Matese in Southern Italy is a key site in the Central Mediterranean to investigate climate patterns during the Lateglacial. This study uses a multi-proxy approach including magnetic susceptibility, geochemistry (XRF core scanning), pollen data and molecular biomarkers like branched Glycerol Dialkyl Glycerol Tetraethers (brGDGTs) to reconstruct climate changes and their impacts at Matese. Palaeotemperatures and -precipitation patterns are quantitatively inferred from pollen assemblages (multi-method approach: Modern Analogue Technique, Weighted Averaging Partial Least Squares regression, Random Forest, and Boosted Regression Trees) and brGDGTs calibrations. The results are compared to a latitudinal selection of regional climate reconstructions in Italy to better understand climate processes in Europe and in the circum-Mediterranean region. A warm Bølling–Allerød and a marked cold Younger Dryas are revealed in all climate reconstructions inferred from various proxies (chironomids, ostracods, speleothems, pollen, brGDGTs), showing no latitudinal differences in terms of temperatures across Italy. During the Bølling–Allerød, no significant changes in terms of precipitation are recorded, however, a contrasted pattern is visible during the Younger Dryas. Slightly wet conditions are recorded south of latitude 42° N whereas dry conditions are recorded north of latitude 42° N. During the Younger Dryas, cold conditions can be attributed to the southward position of North Atlantic sea-ice and of the Polar Frontal JetStream whereas the increase of precipitation is Southern Italy seems to be linked to relocation of Atlantic storm tracks into the Mediterranean, induced by the Fennoscandian ice sheet and the North European Plain. On the contrary, during the Bølling–Allerød warm conditions can be linked to the northward position of North Atlantic sea-ice and of the Polar Frontal JetStream.
Published: 2023

4. Early to mid-Holocene climate change at Lago dell'Accesa (central Italy): Climate signal or anthropogenic bias?

Author: Willy Tinner, Boris Vannière, Verushka Valsecchi, Jacques-Louis de Beaulieu, Daniele Colombaroli, André F. Lotter, Emmanuel Chapron, Michel Magny, Elisa Vescovi, Walter Finsinger, Oeschger Centre for Climate Change Research (OCCR), University of Bern, Palaeoecology, Institute of Environmental Biology, Utrecht University [Utrecht], Centre de Bio-Archéologie et d'Ecologie (CBAE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2), Environmental Change Research, University of Oregon [Eugene], Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Department of environmental Sciences, Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich), Institut des Sciences de la Terre d'Orléans (ISTO), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Department of Paleoecology, Centre de Bio-Archéologie et d'Ecologie ( CBAE ), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Eidgenössische Technische Hochschule [Zürich] ( ETH Zürich ), Institut des Sciences de la Terre d'Orléans ( ISTO ), Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université d'Orléans ( UO ) -Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE)
Subjects: Mediterranean climate, 010506 paleontology, human impact, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Climate change, lake-level changes, precipitation, Mediterranean, 01 natural sciences, Arts and Humanities (miscellaneous), Paleoclimatology, Earth and Planetary Sciences (miscellaneous), [ SDU.ENVI ] Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, Precipitation, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, Holocene, 0105 earth and related environmental sciences, Palynology, Paleontology, temperature, Vegetation, 15. Life on land, Evergreen, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, 13. Climate action, Climatology, pollen, transfer functions, Environmental science
Abstract: International audience; Despite the high potential of pollen records for climate reconstruction, pollen-climate relationships may be biased due to past and present human activities on the landscape. We use (i) transfer functions based on modern pollen-climate relationships to infer seasonal temperature and summer precipitation for the period 11 500-4500 cal. a BP and (ii) lake-level change records based on different sedimentary proxies in multiple cores that are mainly indicative for summer hydrology at Lago dell'Accesa (central Italy). Quantitative reconstructions indicate lowest summer precipitation during two phases (8500-7700 cal. a BP and after 6000 cal. a BP) and a gradual winter temperature increase from 11 500 to ca. 8000 cal. a BP. Lowest summer precipitation was reconstructed during these phases characterised by vegetation shifts from open forests dominated by summergreen oaks (Quercus) to forests dominated by evergreen oaks (Quercus ilex), which are at present most abundant where summer drought is stronger. Similarly, the lake-level record indicates two long-lasting low summer precipitation phases (8800-7700 and 6400-4400 cal. a BP) that were interrupted by short-term high summer precipitation events. Based on the broad agreement between the pollen-inferred summer precipitation and the low-frequency lake-level changes, we suggest that the duration of the high summer precipitation events may have been too short to maintain drought-sensitive trees, which may have been affected by high mortality rates when summer dry conditions returned. Although past and modern pollen-climate relationships may very likely have been affected by human activities since the Neolithic (i.e. when exploitation of the landscape started), we reject the hypothesis of a significant anthropogenic bias in the pollen-based climate reconstruction. In addition, we suggest that pollen-based and lake-level reconstructions may have different inherent abilities of capturing high- and low-frequency precipitation signals
Published: 2010

5. Predicting soil quality indices with near infrared analysis in a wildfire chronosequence

Author: Lauric Cécillon, Nathalie Cassagne, Michel Vennetier, Sonia Czarnes, Jean-Jacques Brun, Raphaël Gros, Ecosystèmes montagnards ( UR EMGR ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), French Agency for Environment and Energy Management, ADEME, Unité de Recherches Forestières Méditerranéennes ( URFM ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Ecosystèmes méditerranéens et risques ( UR EMAX ), CEMAGREF, Ecosystèmes montagnards (UR EMGR), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Unité de Recherches Forestières Méditerranéennes (URFM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Ecosystèmes méditerranéens et risques (UR EMAX), Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Spectrophotometry, Infrared, Hydrolases, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Soil, Soil health, Organic Chemicals, Waste Management and Disposal, Soil Microbiology, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, chemistry.chemical_classification, Soil monitoring, NIRS Soil quality Soil health Soil monitoring GISQ Soil biogenic structures, 04 agricultural and veterinary sciences, Hydrogen-Ion Concentration, Pollution, 6. Clean water, NIRS, Metals, GISQ, Soil microbiology, Environmental Engineering, Soil test, Nitrogen, Chronosequence, [ SDV.SA.SDS ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, Soil science, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, complex mixtures, Fires, Soil quality, [ SDV.EE ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Soil biogenic structures, Cellulase, Ammonia, Environmental Chemistry, Organic matter, 0105 earth and related environmental sciences, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Nitrates, Bacteria, Soil organic matter, 15. Life on land, chemistry, Soil water, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: [Departement_IRSTEA]Territoires [TR1_IRSTEA]SEDYVIN [TR2_IRSTEA]SEDYVIN; International audience; We investigated the power of near infrared (NIR) analysis for the quantitative assessment of soil quality in a wildfire chronosequence. The effect of wildfire disturbance and soil engineering activity of earthworms on soil organic matter quality was first assessed with principal component analysis of NIR spectra. Three soil quality indices were further calculated using an adaptation of the method proposed by Velasquez et al. [Velasquez, E., Lavelle, P., Andrade, M. GISQ, a multifunctional indicator of soil quality. Soil Biol Biochem 2007; 39: 3066–3080.], each one addressing an ecosystem service provided by soils: organic matter storage, nutrient supply and biological activity. Partial least squares regression models were developed to test the predicting ability of NIR analysis for these soil quality indices. All models reached coefficients of determination above 0.90 and ratios of performance to deviation above 2.8. This finding provides new opportunities for the monitoring of soil quality, using NIR scanning of soil samples.
Published: 2009

6. Modern pollen/vegetation/land-use relationships in mountain environments: an example from the Champsaur valley (French Alps)

Author: Mona Court-Picon, Alexandre Buttler, Jacques-Louis de Beaulieu, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de chrono-écologie ( LCE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire des systèmes écologiques ( ECOS ), Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne ( EPFL ), WSL Lausanne, WSL, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de chrono-écologie - CNRS (UMR6565) (LCE), Laboratoire des systèmes écologiques (ECOS), Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research WSL
Subjects: [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, 010506 paleontology, Archeology, Land use, Ecology, Paleontology, Plant Science, Vegetation, 15. Life on land, 010502 geochemistry & geophysics, medicine.disease_cause, 01 natural sciences, Correspondence analysis, Surface pollen samples . Modern pollen land-use relationships . Anthropogenic indicators . Numerical analyses . French Alps, Geography, Deciduous, Canonical correspondence analysis, Pollen, [SDE]Environmental Sciences, medicine, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Landscape archaeology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Terroir
Abstract: This study aims at elucidating modern pollen spectra/environmental data relationships from both natural and human-induced vegetation types as an aid for palaeoecological reconstructions. A set of 51 surface moss polsters was sampled from different vegetation and land-use types in the Champsaur area (French Alps) and analysed to obtain modern pollen analogues of ancient cultural landscapes in mountain ecosystems. Samples were selected from grazed areas,mown meadows, cultivated fields, fallow land and deciduous and coniferous forests.Vegetation composition around the sampling points and seventeen types of environmental variables (e.g., management type, soil and topography) were collected all for these 51 sites. Patterns of modern local pollen variation in relation to the environmental variables were explored by means of canonical correspondence analysis (CCA) and associated statistical tests. This correlative model allows us to determine the major explanatory variables and to identify taxa indicative of particular anthropogenic activities, and thus may help to calibrate fossil pollen assemblages.The indicator pollen types are evaluated in the light of comparable material from lowland and mid-elevation areas of western Europe. The results of the French data-set confirm some of the conclusions drawn from the North European data-sets, but also show some site specific features.Pollen markers with a broader global significance common to other regions include Rhinanthus type, Apiaceae and Dipsacaceae for mown meadows, Urtica type, Plantago media/major, Trifolium type and Potentilla type for grazed areas, and Cerealia type, Centaurea cyanus,and Polygonum aviculare for cultivated fields. New pollen anthropogenic indicators typical of our study area are Sanguisorba officinalis, Vicia type (mowing), Lotus type, Onobrychis type, Centaurea nigra type, Serratula type (grazing), Sinapis type and Papaver rhoeas (cultivation). This study provides potentially valuable analogues for humaninduced vegetation types, and it may then become possible to interpret more objectively local pollen diagrams from Alpine mountain environments in terms of past cultural landscape development.
Published: 2006

7. mtDNA polymorphisms in five French groups: importance of regional sampling

Author: Vincent Dubut, Pascal Murail, Lionel Chollet, Nérina Mogentale-Profizi, François Cartault, Myriam Serre, Eliane Beraud-Colomb, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département de Biologie Moléculaire, Centre Hospitalier de Toulon-La Seyne, De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie ( PACEA ), Université de Bordeaux ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Adhésion et Inflammation ( LAI ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Adhésion et Inflammation (LAI), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), and Huchet, Jean-Bernard
Subjects: 0106 biological sciences, Mitochondrial DNA, [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, Distribution (economics), Population genetics, phylogeography, DNA, Mitochondrial, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Haplogroup, 03 medical and health sciences, Irish, mtDNA diversity, Brittany, Genetics, Humans, Genetics (clinical), DNA Primers, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Base Sequence, business.industry, Sampling (statistics), French, sampling procedure, language.human_language, [SHS.ANTHRO-BIO] Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, Phylogeography, Genetics, Population, Geography, Evolutionary biology, [ SHS.ANTHRO-BIO ] Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, language, historical admixture, France, business
Abstract: International audience; According to classical markers, France has been reported to be regionally heterogeneous. Here, we propose to test the homogeneity of the French mitochondrial gene pool by analysing D-Loop and coding regions polymorphisms in 210 individuals stemming from five regions. The data set obtained was also used to test the ability of mitochondrial DNA to detect well historically established admixtures (admixtures between British/Irish people and native Breton people in our case). For these purposes, the sampling procedure was subject to special care, concerning the individuals' geographical origin and maternal pedigree. The mtDNA analysis revealed some regional specificities in haplogroup distribution, which is discussed in terms of successive settlements of France. Statistical analyses were conducted to investigate mtDNA diversity and structure within and between British, Irish and French groups. They tended to show affinities between Morbihan region and Britain plus Ireland. Furthermore, genetic evidences were in line with the fact that Morbihan region results from an admixture event, agreeing with historical evidences of successive migrations from Britain and Ireland into Brittany. These results also tended to outline the fact that two geographically very adjacent samples (Morbihan and Finiste`re), sharing a cultural and linguistic area, can present a distinct genetic pattern. Although mtDNA analyses were able to identify a historically reported admixture event, we point out here the high influence of the sampling procedure and representativeness over the migrations hypothesis. We also underline the importance of regional sampling for studies on the spread and/or origin of specific European haplogroups (here U5a1a and U8).
Published: 2003

8. N and P use efficiencies of basil cultivated in organically fertilized growing media

Author: L. Paillat, P. Cannavo, A. Dourdan, F. Barraud, R. Guénon, L. Huché-Thélier, PREMIER TECH Growers & Consumers, Unité de Recherche Environnement Physique de la plante Horticole (EPHOR), Université d'Angers (UA)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, and Premier Tech GC Co. French national association of research and technology (Association Nationale de la Recherche et de la Technologie, ANRT) : CIFRE 2017/0752.
Subjects: Bark, Peat, Organic fertilizer, [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, Horn, Wood fiber, Horticulture, Coir, [SDV.SA.HORT]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Horticulture, Basil (Ocimum basilicum L.), Plant-growth promoting rhizobacteria (Bacillus sp.)
Abstract: International audience; Sustainable production in soilless cultivation systems may be achieved by using recycled organic materials as constituents of growing media (GM) and as organic fertilizers. Synchronizing nutrient releases from organic fertilizer mineralization with plant needs in containerized production is difficult to manage for greenhouse growers. This is further amplified by the diversification of GM constituents, driving microbial activities. We aimed to evaluate how the plant can adapt its nutrition to different organic fertilization strategies and ensure its growth depending on the GM and organic fertilizer types. Ocimum basilicum L. was grown for 60 days in a greenhouse in pots filled with three different GM: 100% peat (Peat); 70% peat and 30% coir fiber (GM1); and 50% coir pith, 25% composted bark, 25% wood fiber (GM2). Two contrasted organic fertilizers were used (horn and a granular fertilizer), mixed to the GM, localized in the pot, or combined with Bacillus sp. inoculation as plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR). Standard mineral fertilization mixed to the GM was also used as a control treatment. We investigated basil growth (height, biomass, leaf area, chlorophyll and flavonol contents) as well as nitrogen (N) and phosphorus (P) use efficiencies, from their uptake by the roots to their allocation to the plant organs. Basil performances were mainly affected by the GM type. Peat provided optimal conditions for plant development. In GM1, basil maximized the utilization of available N and P taken up from the GM and reached the highest biomass production. Basil performances were especially low when it was grown on GM2 because of a strong competition for N between microbes and the roots. The fertilizer type, its localization and PGPR inoculation did not affect basil growth or nutrition in peat; these treatments had only little effect on basil grown on GM1 and GM2, and affected its performances differently depending on the GM type. This study provides evidence that fertilization must be thoughtfully managed depending on the GM in organically fertilized systems.Keywords
Published: 2022

9. Les occupations pré et protohistoriques du Clos de Roque, a Saint-Maximin-la-Sainte-Baume (Var)

Author: Maxime Remicourt, Valérie Andrieu-Ponel, Cédric Audibert, Audrey Baradat, Janet Battentier, Davhya Belkacem, Emilie Blaise, Marion Dousse, Sandrine Bonnardin, Jean-Baptiste Caverne, Paul Fernandes, Magali Gerbe, Benjamin Girard, Thibault Lachenal, Cédric Lepère, Christine Locatelli, Lucie Martin, Benoît Paravel, Nina Parisot, Philippe Ponel, Didier Pousset, Mathieu Rué, Schmitt Aurore, Ingrid Sénépart, Pascal Tallet, Eric Thirault, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements (AASPE), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Culture et Environnements, Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age (CEPAM), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Laboratoire méditerranéen de préhistoire Europe-Afrique (LAMPEA), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Centre d'Études Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age (CEPAM), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (EDYTEM), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Expertise du Bois et de Datation par Dendrochronologie (LEB2d), Laboratoire d'Expertise du Bois et de Datation par Dendrochronologie, Archéologie, Terre, Histoire, Sociétés [Dijon] (ARTeHiS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC), Paléotime, Comité Francéclat, Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés (TRACES), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Norbert Elias (CNELIAS), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Archeodunum, Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), Université Lumière - Lyon 2 (UL2), Aix-Marseille Université - Faculté de médecine (AMU MED), Aix Marseille Université (AMU), ARCHEORIENT - Environnements et sociétés de l'Orient ancien (Archéorient), Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), SRA PACA, Aix-en-Provence, École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Archeodunum S.A. : investigations archéologiques, entreprise, Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Ministère de la Culture (MC), Université de Genève (UNIGE), Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements ( AASPE ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Culture et Environnements, Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age ( CEPAM ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire méditerranéen de préhistoire Europe-Afrique ( LAMPEA ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ) -Institut national de recherches archéologiques préventives ( Inrap ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Archéologie des Sociétés Méditerranéennes ( ASM ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'Études Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age ( CEPAM ), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne ( EDYTEM ), Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Expertise du Bois et de Datation par Dendrochronologie ( LEB2d ), Archéologie, Terre, Histoire, Sociétés [Dijon] ( ARTeHiS ), Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ) -Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC), Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Remicourt, Maxime
Subjects: sépulture, Néolithique final, [SHS.ARCHEO] Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, âge du Bronze, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Néolithique moyen I, occupations, habitat, Néolithique récent, Néolithique moyen, Bronze ancien, Age du fer méditerranéen, puit
Published: 2012

10. Factors Underlying the Narrow Distribution of the Mediterranean Annual Plant Arenaria provincialis (Caryophyllaceae)

Author: Estelle Dumas, Errol Véla, Alex Baumel, Thierry Tatoni, Laurence Affre, Sami Youssef, Marianick Juin, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: 0106 biological sciences, Ecological niche, 0303 health sciences, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Diaspore (botany), Ecology, Range (biology), Biogeography, Niche differentiation, Paleontology, Plant Science, 15. Life on land, Biology, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, Biological dispersal, Realized niche width, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Endemism, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology
Abstract: The factors responsible for the patterns of niche differentiation and narrow endemism have rarely been investigated in annual Mediterranean plants. This topic was addressed here by performing comparative studies on realized niches, regional occupancy, global biogeographical distribution and seed traits of a set of Arenaria (Caryophyllaceae) species inhabiting southern Provence (SE France), focusing in particular on Arenaria provincialis, a narrow endemic restricted to the hills and modest calcareous mountains around the city of Marseille. Field studies were carried out from 2008 to 2009 at 624 sites in the limestone mountains where Arenaria species are likely to occur. The Arenaria species occurring in southern Provence vary greatly in their patterns of regional occupancy and their biogeographical distribution. Multivariate analysis of the realized niche showed that they have some similar limiting environmental factors in common, but they do not all occupy the same habitats. Studies on the fruits and seeds showed that the endemic A. provincialis has a larger seed than its congeners and a capsule that remains closed and falls from the plant at maturity. This well-differentiated diaspore specific to A. provincialis may be responsible for the limited dispersal capacity of this species. Phylogenetic analyses showed that A. provincialis is not closely related to the other taxa inhabiting southern Provence, but rather to Arenaria occurring in highland areas in the south of France. The restricted pattern of distribution of A. provincialis is probably due to the past isolation event from which it originated and to its limited dispersal capacity, rather than resulting from its ecological niche range.
Published: 2011

11. Holocene seasonality changes in central Mediterranean reconstructed from Lake Accesa and Tenaghi Philippon pollen sequences

Author: Peyron , Odile, Goring , Simon, Dormoy , Isabelle, Kotthoff , Ulrich, Pross , Joerg, De Beaulieu , Jacques-Louis, Drescher-Schneider , Ruth, Vannière , Boris, Magny , Michel, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Department of Biological Sciences [Burnaby], Simon Fraser University (SFU.ca), Department of Geosciences, Universität Hamburg (UHH), Institute of Geosciences [Frankfurt am Main], Goethe-Universität Frankfurt am Main, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Simon Fraser University ( SFU.ca ), Universität Hamburg ( UHH ), Institute of Geosciences, University of Frankfurt, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and ANR LAMA
Subjects: [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2011

12. Erosion et anthropisation dans la tourbière du Lauza (Alpes Sud, France)

Author: Linoir , Damien, Bossuet , Gilles, Walter-Simonnet , Anne-Véronique, Simonnet , Jean-Pierre, Court-Picon , Mona, De Beaulieu , Jacques-Louis, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Published: 2010

13. Découverte d'un habitat et d'un dépôt métallique non funéraire du VIIIe s. av. J.-C. dans le lit de l'Hérault à Agde, sur le site de La Motte

Author: Moyat , Philippe, Dumont , Annie, Mariotti , Jean-François, Janin , Thierry, Greck , Sandra, Bouby , Laurent, Ponel , Philippe, Verdin , Pascal, Verger , Stephane, Archéologie, Terre, Histoire, Sociétés [Dijon] ( ARTeHiS ), Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ) -Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Archéologie des Sociétés Méditerranéennes ( ASM ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de Bio-Archéologie et d'Ecologie ( CBAE ), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de Recherches Archéologiques Préventives ( INRAP ), Institut national de recherches archéologiques préventives ( Inrap ), Centre d'Études Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age ( CEPAM ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Archéologies d'Orient et d'Occident et Sciences des textes ( AOROC ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Archéologie, Terre, Histoire, Sociétés [Dijon] (ARTeHiS), Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Centre de Bio-Archéologie et d'Ecologie (CBAE), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap), Centre d'Études Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age (CEPAM), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Archéologies d'Orient et d'Occident et Sciences des textes (AOROC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Ministère de la Culture (MC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL), and Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-École pratique des hautes études (EPHE)
Subjects: Habitat, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Archéologie, Hérault, [ SHS.ARCHEO ] Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Archéologie subaquatique, Dépôt métallique
Abstract: International audience; Eine im Februar 2004 im Hérault durchgeführte Unterwasserprospektion an einem Ort mit dem Flurnamen La Motte bei Agde ermöglichte die partielle Entdeckung und Kartierung einer vorgeschichtlichen Siedlung. Zu den aufgenommenen Funden zählen Bauhölzer, Keramik, Tierreste und Mahlgeräte. Die an der Ober- fläche liegende Keramik wurde systematisch aufgesammelt, um über eine Stichprobe zur Untersuchung und Datierung verfügen zu können. Diese Stichprobe lässt sich mit den üblichen Serien der spätbronze- zeitlichen Fundplätze des Languedoc unmittelbar vergleichen. Ein Ensemble von Bronzeobjekten aus der Besiedlungszeit wurde in den Bauresten gefunden und als Block geborgen. Es wurde in mehreren Teil- blöcken im Labor (CREAM Vienne) untersucht und erbrachte 333 Objekte - vor allem Trachtgegenstände -, die sich von den jüngeren Depots des Typs Launac unterscheiden. Die Untersuchung dieses Depots ist Thema eines anderen Beitrags (Verger/Dumont/Moyat/Mille in diesem Band). Zum ersten Mal in Europa wurde ein Ensemble von Metallobjekten aus einer vorgeschichtlichen Flusssiedlung in situ geborgen. Gewöhnlich sind solche Funde - wenn sie die Archäologen erreichen - Baggerfunde ohne Kontext. Die bei Tauchgängen prospektierte Zone wurde bathymetrisch aufgenommen. Das daraus resultierende Bild zeigt deutlich, dass die Siedlung an einer seichten Stelle lag: ein flaches Ufer, eine Insel, eine Flussschwelle des Jahrbuch des Römisch-Germanischen Zentralmuseums 54 * 2007 Hérault oder ein Hügel in einer Lagune. Wie auch immer, wird mit dieser Entdeckung die Frage der Besiedlung von Agde vor dem 7. Jahrhundert v. Chr. neu gestellt. Dieser Fund weist auch auf ein in Südfrankreich bisher ungeahntes Potential an Flusssiedlungen unter Wasser hin.; Une prospection subaquatique réalisée en février 2004 dans le lit de l'Hérault à Agde, au lieu-dit La Motte, a permis de repérer et de topographier une partie d'un habitat protohistorique. Parmi les vestiges recensés, on note la présence de bois d'architecture, de céramique, de faune et de matériel de mouture. La cérami- que a fait l'objet d'un ramassage de surface afin de disposer d'un échantillon pour étude et datation. Ce lot est directement comparable aux séries habituellement découvertes sur les sites de la fin de l'Âge du Bronze languedocien. Un ensemble d'objets en bronze, contemporain de l'occupation, a été découvert dans les structures d'habitat. Coffré sur place puis prélevé en blocs, sa fouille en laboratoire (CREAM Vienne) a permis de recenser 333 éléments, essentiellement de parure, qui diffèrent des dépôts de type lau- nacien, plus récents. L'étude de ce dépôt fait l'objet d'un autre article (Verger / Dumont / Moyat / Mille dans ce même volume). C'est la première fois en Europe qu'un ensemble d'objets métalliques est découvert en place, dans un site protohistorique de contexte fluvial. Habituellement, ce type de découverte, lorsqu'il par- vient aux archéologues, est issu de dragages et est considéré comme étant hors contexte. Un relevé bathy- métrique a concerné le secteur prospecté en plongée: l'image obtenue montre très nettement que le site se trouvait sur une zone de haut-fond: une berge basse de cours d'eau, une île ou un seuil dans le lit de l'Hérault, ou une butte en contexte lagunaire. Quoiqu'il en soit, la découverte de cet habitat renouvelle la problématique de l'occupation d'Agde, antérieurement au VIIe s. av. J.-C. Elle révèle également l'existence d'un potentiel de sites immergés en contexte fluvial, jusque là insoupçonné pour le sud de la France.
Published: 2010

14. Âges et modalités de la mise en place de la couverture limoneuse de la basse plaine de la Garonne d’après l’exemple du site de Fontréal (Castelnau-d’Estrétefonds, Haute-Garonne)

Author: Laurent Bruxelles, Fabrice Pons, Frédéric Magnin, Alain Bertrand, Institut National de Recherches Archéologiques Préventives ( INRAP ), Institut national de recherches archéologiques préventives ( Inrap ), Archéologie des Sociétés Méditerranéennes ( ASM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CNRS, Centre National de la Recherche Scientifique - MNHN - CNRS - USR 2936, Station d’Ecologie Expérimentale, Moulis, France, Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap), Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés (TRACES), Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français en Afrique du Sud (IFAS), Institut Français en Afrique du Sud, Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Ministère de la Culture (MC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Station d’Ecologie Expérimentale du CNRS à Moulis (SEEM), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Haute-Garonne, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Girou, Néolithique, Terrasses de la Garonne, malacofaune, Tardiglaciaire, basse plaine, anthropisation, [SHS]Humanities and Social Sciences, Hers, couverture limoneuse, [ SHS.ARCHEO ] Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, [ SHS ] Humanities and Social Sciences, Midi toulousain
Abstract: International audience; Les opérations d’archéologie préventive menées sur la basse plaine de la Garonne, à sa confluence avec les vallées de l’Hers etdu Girou, ont permis de réaliser une série d’observations concernant l’origine de la couverture limoneuse. Ainsi, sa mise en place apu être précisée par l’appoint de données stratigraphiques et sédimentologiques, couplées aux informations paléoenvironnementaleset archéologiques. Cette couverture limoneuse, clairement polygénique, moule les irrégularités du toit du corps alluvial de la basseplaine. Elle débute par des limons d’inondation qui nappent les reliefs sablo-graveleux. Une abondante malacofaune y est préservéeet a fourni des éléments convergents pour situer leur accumulation à la fin du Pléniglaciaire supérieur. Dans les points bas de latopographie, cette formation a ensuite été recouverte par des limons argileux hydromorphes qui correspondent au colmatage de basfonds palustres. Leur accumulation est pro parte synchrone de l’occupation néolithique du site de Fontréal et comprend, à sa base,du matériel archéologique épars ainsi que quelques foyers lenticulaires en place. La répartition des vestiges néolithiques montre, enoutre, que la topographie de ce secteur était encore nettement différenciée il y a 4 000 à 5 000 ans et que les secteurs en relief ont étépréférentiellement occupés. Le reste du colmatage est nettement plus récent et l’on retrouve, parfois sur plus de deux mètres d’épaisseur,des fragments de briques et de mortier roulés. Leur présence permet de rattacher cette importante sédimentation à l’époquemoderne et découle de l’impact des déboisements massifs et de la mise en culture du versant molassique qui domine le site. Sur labasse plaine, les activités agricoles ont finalement achevé son nivellement complet et lui ont donné l’aspect uniformément plan quel’on observe aujourd’hui.
Published: 2010

15. Holocene seasonality changes in central Mediterranean reconstructed from Lake Accesa and Tenaghi Philippon pollen sequences

Author: Peyron , Odile, Goring , Simon, Dormoy , Isabelle, Kotthoff , Ulrich, Pross , Joerg, De Beaulieu , Jacques-Louis, Drescher-Schneider , Ruth, Magny , Michel, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Department of Biological Sciences [Burnaby], Simon Fraser University ( SFU.ca ), Department of Geosciences, Universität Hamburg ( UHH ), Institute of Geosciences, University of Frankfurt, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), ANR LAMA, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Simon Fraser University (SFU.ca), Universität Hamburg (UHH), Institute of Geosciences [Frankfurt am Main], Goethe-Universität Frankfurt am Main, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes
Published: 2009

16. The climate in central Italy during the last 15,000 yrs BP: seasonality changes inferred from pollen and lake levels

Author: Peyron , Odile, Goring , Simon, Magny , Michel, De Beaulieu , Jacques-Louis, Drescher-Schneider , Ruth, Vannière , Boris, Dormoy , Isabelle, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Department of Biological Sciences [Burnaby], Simon Fraser University ( SFU.ca ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), ANRLAMA, ANRLAMA,ANRLAMA, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Simon Fraser University (SFU.ca), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, ANR-07-BLAN-0009,LAMA,Holocene changes in environment and climate, and history of human societies in Central Mediterranean as reflected by LAke and MArine records(2007), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes
Published: 2009

17. Inter- and Extra-Indian Admixture and Genetic Diversity in Reunion Island Revealed by Analysis of Mitochondrial DNA

Author: Dubut, Vincent, Murail, Pascal, Pech, Nicolas, Thionville, Marie-Dominique, Cartault, François, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Huchet, Jean-Bernard, Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie ( PACEA ), Université de Bordeaux ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), and Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: Reunion Island, mtDNA, [ SHS.ANTHRO-BIO ] Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, admixture, phylogeography, ethnic groups, Indian Diaspora, [SHS.ANTHRO-BIO] Humanities and Social Sciences/Biological anthropology
Abstract: International audience; Reunion Island is a French territory located in the western Indian Ocean. The genetic pattern of the Reunionese population has been shaped by contributions from highly contrasting regions of the world. Over the last 350 years, several migration waves and cultural and socio-economic factors have led to the emergence of six main ethnic groups in Reunion. India is one of the principal regions that contributed to the setting up of the Reunionese population. Diversity, demographic and admixture analyses were performed on mtDNA variation of the Reunionese of Indian ancestry, including the Malbar and Zarab ethnic groups, in order to question their history. Using a phylogeographical approach, we generated and analysed quantitative data on the contribution of the Indian parental populations. Furthermore, we showed that the settlement of Reunion Island by Indians did not involve a founder effect, except in the very beginning of the Reunionese settlement (at the end of the 17th century). The accuracy of our results was optimised by a re-evaluation of the classification of the Southern Asian mtDNA haplogroups. Finally, by comparing our results to a previous study dealing with the Reunionese population, we highlighted how ethno-historical data are critical for reconstructing the complex history of multiethnic populations.
Published: 2009

18. Périodes d'anthropisation et modifications de sédimentation depuis 8000 ans sans le massif du Champsaur

Author: Court-Picon, Mona, Linoir, Damien, Bossuet, Gilles, Walter-Simonnet, Anne-Véronique, Simonnet, Jean-Pierre, De Beaulieu, Jacques-Louis, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1
Published: 2009

19. The Holocene climate in Mediterranean regions: what can we learn from quantitative climate reconstructions

Author: Peyron , Odile, Magny , Michel, Dormoy , Isabelle, Vannière , Boris, De Beaulieu , Jacques-Louis, Drescher-Schneider , Ruth, Combourieu-Nebout , Nathalie, Kotthoff , Ulrich, Pross , Joerg, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Department of Geosciences, Universität Hamburg (UHH), Institute of Geosciences [Frankfurt am Main], Goethe-Universität Frankfurt am Main, ANRLAMA, ANR-07-BLAN-0009,LAMA,Holocene changes in environment and climate, and history of human societies in Central Mediterranean as reflected by LAke and MArine records(2007), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] ( LSCE ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Universität Hamburg ( UHH ), Institute of Geosciences, University of Frankfurt, and ANR-07-BLAN-0009,LAMA,Holocene changes in environment and climate, and history of human societies in Central Mediterranean as reflected by LAke and MArine records ( 2007 )
Subjects: [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes
Published: 2008

20. Spatio-temporal Functional Regression on Paleo-ecological Data

Author: Bel , Liliane, Bar-Hen , Avner, Cheddadi , Rachid, Petit , Rémy, Mathématiques et Informatique Appliquées (MIA-Paris), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Mathématiques Appliquées Paris 5 (MAP5 - UMR 8145), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions (INSMI)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions (INSMI)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Mathématiques et Informatique Appliquées ( MIA-Paris ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Mathématiques Appliquées à Paris 5 ( MAP5 - UMR 8145 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biodiversité, Gènes & Communautés ( BioGeCo ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bordeaux ( UB )
Subjects: FOS: Computer and information sciences, [STAT.AP]Statistics [stat]/Applications [stat.AP], Spatio-temporal modeling, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], [ STAT.AP ] Statistics [stat]/Applications [stat.AP], Functional Data Analysis, Climate change, Applications (stat.AP), [ MATH.MATH-ST ] Mathematics [math]/Statistics [math.ST], Biodiversity, [STAT.TH]Statistics [stat]/Statistics Theory [stat.TH], [ STAT.TH ] Statistics [stat]/Statistics Theory [stat.TH], Statistics - Applications
Abstract: The influence of climate on biodiversity is an important ecological question. Various theories try to link climate change to allelic richness and therefore to predict the impact of global warming on genetic diversity. We model the relationship between genetic diversity in the European beech forests and curves of temperature and precipitation reconstructed from pollen databases. Our model links the genetic measure to the climate curves through a linear functional regression. The interaction in climate variables is assumed to be bilinear. Since the data are georeferenced, our methodology accounts for the spatial dependence among the observations. The practical issues of these extensions are discussed.
Published: 2008

21. Variable selection in near infrared spectra for the biological characterization of soil and earthworm casts

Author: Sonia Czarnes, Jean-Jacques Brun, Nathalie Cassagne, Lauric Cécillon, Raphaël Gros, Ecosystèmes montagnards (UR EMGR), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Unité de Recherches Forestières Méditerranéennes (URFM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Université de Lyon, Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystèmes montagnards ( UR EMGR ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Unité de Recherches Forestières Méditerranéennes ( URFM ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: Soil biology, [ SDV.SA.SDS ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, Soil Science, Mineralogy, Biomass, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, 01 natural sciences, Microbiology, Soil biogenic structures, Microbiological activity, PLSR, Partial least squares regression, Selection (genetic algorithm), biology, Chemistry, 010401 analytical chemistry, Near-infrared spectroscopy, Earthworm, 04 agricultural and veterinary sciences, biology.organism_classification, Wavelength selection, 0104 chemical sciences, Soil structure, NIRS, Soil water, [SDE]Environmental Sciences, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Soil macrofauna
Abstract: [Departement_IRSTEA]GT [TR1_IRSTEA]SET / DYMON; International audience; Near infrared reflectance spectroscopy (NIRS) was used to predict six biological properties of soil and earthworm casts including extracellular soil enzymes, microbial carbon, potential nitrification and denitrification. Partial least squares regression (PLSR) models were developed with a selection of the most important near infrared wavelengths. They reached coefficients of determination ranging from 0.81 to 0.91 and ratios of performance-to-deviation above 2.3. Variable selection with the variable importance in the projection (VIP) method increased dramatically the prediction performance of all models with an important contribution from the 17502500 nm region. We discuss whether selected wavelengths can be attributed to macronutrient availability or to microbial biomass. Wavelength selection in NIR spectra is recommended for improving PLSR models in soil research.
Published: 2008

22. Palaeoenvironments, climate and human impact during the Late-Glacial and Holocene in mountainous ecosystems: the high-resolution multi-proxy record of the Lauza peat bog (Champsaur, French Alps)

Author: Court-Picon, Mona, Walter-Simonnet, Anne-Véronique, Linoir, Damien, Bossuet, Gilles, De Beaulieu, Jacques-Louis, Peyron, Odile, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Eclipse2Opeyron, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes
Published: 2008

23. Late-glacial and Holocene vegetation dynamics at various altitudes in the Ellero Valley, Maritime Alps, nortwestern Italy

Author: Consolata Siniscalco, Jacques-Louis de Beaulieu, Elena Ortu, Rosanna Caramiello, Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (EDYTEM), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Environnements, Dynamiques et Territoires de Montagne (EDYTEM), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne ( EDYTEM ), Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: Palynology, 010506 paleontology, Pollen zone, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Ecology, biology, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Vegetation, 15. Life on land, biology.organism_classification, 01 natural sciences, Allerød oscillation, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Physical geography, Younger Dryas, Glacial period, Beech, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Geology, Holocene, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: International audience; This study aims to reconstruct the variations of the vegetation zonation in the Ellero Valley (Maritime Alps, Italy) since the Late-glacial. Based on the analysis of percentages of dominant pollen taxa (Pinus, Abies, Fagus, deciduous Quercus, Artemisia, Poaceae) in sediment cores from three peat bogs at different altitudes (Pian Marchisio, 1624 m, Rifugio Mondovì, 1760 m and Torbiera del Biecai, 1920 m) this study offers an interpretation of pollen percentages in terms of vegetation cover. The correlation of the pollen zones in the three diagrams is validated by correspondence analysis and supported by twelve 14C (AMS) dates. The Oldest and the Younger Dryas are characterized by steppe vegetation dominated by Artemisia. The Bølling/Allerød warming which separates the Oldest and the Younger Dryas is characterized by a Pinus shift. Pine and birch forests develop at 1900 m asl at the beginning of the Holocene. The fir-wood colonization of the mountainous and subalpine belts is dated 9540-9406 cal. years BP and follows these first phases. Fir development and the arrival of beech are dated 8767-8543 cal. years BP: beech is recorded about 1000-2000 years earlier than in the adjacent regions. It develops between 1100 and 1600 m asl, forming a vegetation belt between the oak-wood in the lowland and the subalpine fir-wood. Fir decreases from 2792-2459 cal. years BP. Since this period, a beech-fir mountainous belt has been present at 1700 m. Both the suppression of the fir-forest and the lowering of the upper beech-wood limit to 1500 m are due to human activity during the last millennium.
Published: 2008

24. A novel nonsymbiotic hemoglobin from oak: cellular and tissue specificity of gene expression

Author: Audrey Berger, James F. Dat, Pierre-Marie Badot, Hélène Folzer, Nicolas Capelli, Michèle Crèvecoeur, Claire Parent, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Département de Botanique et Biologie Végétale, Université de Genève ( UNIGE ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Genève (UNIGE), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, MESH : Molecular Sequence Data, MESH : Oxygen, Physiology, MESH: Plant Shoots, MESH : Plant Roots, MESH: Plant Roots, Plant Science, MESH: Amino Acid Sequence, MESH: RNA, Plant, MESH : Hemoglobins, 01 natural sciences, Plant Roots, Hemoglobins, Quercus, Gene Expression Regulation, Plant, Gene expression, Cloning, Molecular, Hypoxia, MESH: Phylogeny, Peptide sequence, Phylogeny, MESH: Organ Specificity, Plant Proteins, 0303 health sciences, Oak (Quercus petraea, Quercus robur), MESH: Plant Proteins, MESH : Amino Acid Sequence, MESH : In Situ Hybridization, nonsymbiotic hemoglobin, MESH : Plant Shoots, MESH : Water, ddc:580, MESH: Hemoglobins, Organ Specificity, RNA, Plant, Quercus petraea, oak (Quercus petraea, In situ hybridization, Quercus robur), Plant Shoots, MESH: Oxygen, MESH : Cloning, Molecular, Molecular Sequence Data, education, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, Quercus robur, MESH : Organ Specificity, 03 medical and health sciences, MESH: Gene Expression Profiling, MESH: In Situ Hybridization, ddc:570, MESH: Quercus, MESH : Plant Proteins, Botany, MESH: Water, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, MESH: Cloning, Molecular, Northern blot, Amino Acid Sequence, MESH: Gene Expression Regulation, Plant, Gene, 030304 developmental biology, MESH: Molecular Sequence Data, hypoxia, MESH : RNA, Plant, [ SDV.BC ] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Gene Expression Profiling, MESH : Gene Expression Profiling, Water, MESH : Phylogeny, Meristem, biology.organism_classification, Molecular biology, Oxygen, Nonsymbiotic hemoglobin, gene expression, in situ hybridization, MESH : Quercus, MESH : Gene Expression Regulation, Plant, 010606 plant biology & botany
Abstract: International audience; This study presents the isolation and characterization of a novel nonsymbiotic Hb gene from sessile oak (Quercus petraea) seedlings, herein designated QpHb1. The cellular and tissue expression of QpHb1 was analysed by Northern blotting and in situ hybridization. The encoded protein was predicted to consist of 161 amino acid residues, and shares 71 and 51% amino acid sequence identity with the Arabidopsis class 1 and 2 nonsymbiotic Hb, respectively. Northern blot analysis revealed that QpHb1 was strongly expressed in roots. Spatial expression analysis of QpHb1 in the root apical region of sessile oak by in situ hybridization indicated that transcripts were mostly abundant in protoxylem cell initials, some cortical cells and the protoderm. In addition, when comparing the expression profile of QpHb1 in sessile and pedunculate oak (Quercus robur), two species with contrasted hypoxia tolerance, the transcript level of QpHb1 rose early in the most flood-tolerant species, pedunculate oak, during root submergence. The spatial-temporal expression of QpHb1 suggests that this gene could participate in perception and signalling during hypoxia.
Published: 2008

25. Les assemblages de Chironomidae et les cortèges polliniques, outils de reconstitutions quantitatives des changements du climat holocène: une approche croisée au col du Petit St Bernard (lac 'Dessus-Verney', 2280 m)

Author: Oliver Heiri, Yannick Miras, Michel Magny, Laurent Millet, Jacques-Louis de Beaulieu, Elena Ortu, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Environnements, Dynamiques et Territoires de Montagne (EDYTEM), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Géographie Physique et Environnementale (GEOLAB), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Utrecht University Palaeoecology, Laboratory of Palaeobotany and Palynology (UTRECHT UNIVERSITY), Utrecht University [Utrecht], Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Alpis Graia interreg, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne ( EDYTEM ), Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Géographie Physique et Environnementale ( GEOLAB ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut Sciences de l'Homme et de la Société ( IR SHS UNILIM ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut national de recherches archéologiques préventives ( Inrap ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Université Clermont Auvergne ( UCA ), Utrecht University Palaeoecology, Laboratory of Palaeobotany and Palynology ( UTRECHT UNIVERSITY ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (EDYTEM), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), and Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université ( AMU ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV )
Subjects: 2. Zero hunger, Paléoclimat, chironomidae, pollen, Holocène, paléoclimat, température, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, [ SDU.STU ] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Forestry, General Medicine, Température, Chironomidae, temperature, Holocene, pai.eoci.imate, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Geography, 13. Climate action, Pollen
Abstract: Changes in July air temperature during the the last 8000 years were inferred from subfossil chironomid and pollen data from Lake Dessus-Verney (2280 m a.s. I., Northern French Alps). July air temperature was inferred from chironomids using an inference model based on the distribution of chironomid assemblages in 114 Swiss lakes. July, January, annual temperatures and annual precipitation were reconstructed from pollen data using the Modern Analogue Technique applied to a modern data set composed of more than 3000 modern pollen spectra. July temperatures derived from both proxies were compared to a reference climate record for the region : the lake-level fluctuations in Jura, northern Alps and the Swiss Plateau. Pollen and Chironomids showed in concert a series of cold reversals at ca 1700, 2500, 3100, 5400 and 7800 cal. BP which were synchronous with high lake-level phases. Whereas chironomid suggest a Holocene climate optimum around 6000-7000 cal. BP in agreement with many previous studies, pollen failed to show equivalent long-term climate variability. This may result from a lack of good analogues in the modern training set. The study of new modern spectra and a constraint of the choice of analogues in the modern pollen data base using chironomid-inferred July temperature are needed to improve the results of pollen-inferred climate reconstruction in the Alpine area., Les variations des températures moyennes de juillet pendant les 8000 dernières années ont été reconstituées quantitativement à partir des assemblages de Chironomidae et des cortèges polliniques de l 'enregistrement du lac «Dessus-Verney » (2280 m, Alpes du nord, France). Les températures de l ' air de juillet et janvier ont été inférées d 'après les thanatocé noses de Chironomidae grâce à une fonction de transfert élaborée à partir de l 'étude de la distribution actuelle des communautés de Chironomidae dans 114 lacs du Plateau et des Alpes Suisses. Les températures annuelles, de juillet, ainsi que les précipitations annuelles ont été reconstituées d'après les données polliniques par la méthode des analogues modernes appliquée à une base de données composée de 3000 spectres polliniques actuels. Les quantifications des températures de juillet déduites des deux bio-marqueurs ont été comparées à un enregistrement climatique choisi comme référence pour notre zone d'étude : les variations de niveaux de lacs dans le Jura, les Alpes du Nord, et le Plateau Suisse. Le pollen et les Chironomidae concordent pour indiquer une série de refroidissements centrés sur 1 700, 2500, 3100, 5400 et 7800 cal. BP synchrones avec des phases de hauts niveaux lacustres. Alors que les assemblages de Chironomidae suggèrent, en accord avec de nombreux travaux antérieurs, un optimum climatique holocène situé entre 6000-7000 cal. BP, les cortèges polliniques ne permettent pas de mettre en évidence une tendance à long terme équivalente. Plusieurs pistes sont proposées pour l'amélioration de la pertinence des reconstitutions climatiques d'après les enregistrements polliniques : (1) l'augmentation de la base de données polliniques actuelle et (2) l'utilisation des reconstitutions quantitatives des températures estivales déduites des Chironomidae comme contrainte pour la sélection des meilleurs analogues polliniques modernes., Millet Laurent, Ortu Elena, Miras Yannick, Heiri Oliver, Magny Michel, Beaulieu Jacques-Louis de. Les assemblages de Chironomidae et les cortèges polliniques, outils de reconstitutions quantitatives des changements du climat holocène : une approche croisée au Col du Petit St Bernard, lac «Dessus-Verney », 2280 m. In: Collection EDYTEM. Cahiers de géographie, numéro 6, 2008. Du climat à l’homme, dynamique holocène de l’environnement dans le Jura et les Alpes. pp. 65-76.
Published: 2008

26. A novel non-symbiotic hemoglobin from oak: Cellular and tissue specificity of gene expression

Author: Parent , Claire, Berger , Audrey, Folzer , Hélène, Dat , James, Crevècoeur , Michèle, Badot , Pierre-Marie, Capelli , Nicolas, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Département de Botanique et Biologie Végétale, Université de Genève ( UNIGE ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Genève (UNIGE), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3
Subjects: [ SDV.BV ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, hypoxia, education, gene expression, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, nonsymbiotic hemoglobin, in situ hybridization, oak (Quercus petraea, Quercus robur)
Abstract: International audience; This study presents the isolation and characterization of a novel nonsymbiotic Hb gene from sessile oak ( Quercus petraea ) seedlings, herein designated QpHb1 . • The cellular and tissue expression of QpHb1 was analysed by Northern blotting and in situ hybridization. • The encoded protein was predicted to consist of 161 amino acid residues, and shares 71 and 51% amino acid sequence identity with the Arabidopsis class 1 and 2 nonsymbiotic Hb, respectively. Northern blot analysis revealed that QpHb1 was strongly expressed in roots. Spatial expression analysis of QpHb1 in the root apical region of sessile oak by in situ hybridization indicated that transcripts were mostly abundant in protoxylem cell initials, some cortical cells and the protoderm. In addition, when comparing the expression profile of QpHb1 in sessile and pedunculate oak (Quercus robur), two species with contrasted hypoxia tolerance, the transcript level of QpHb1 rose early in the most flood-tolerant species, pedunculate oak, during root submergence. • The spatial–temporal expression of QpHb1 suggests that this gene could participate in perception and signalling during hypoxia.
Published: 2008

27. Early-Holocene climatic oscillations recorded by lake-level fluctuations in west-central Europe and in central Italy

Author: Boris Vannière, Laurent Millet, Michel Magny, Anne-Véronique Walter-Simonnet, Carole Bégeot, Jacques-Louis de Beaulieu, Oliver Heiri, Odile Peyron, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de chrono-écologie ( LCE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratory of Palaeobotany and Palynology, Utrecht University [Utrecht], Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire de chrono-écologie - CNRS (UMR6565) (LCE), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 010506 paleontology, Archeology, Global and Planetary Change, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Geology, Middle zone, 01 natural sciences, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Preboreal, 13. Climate action, Climatology, Western europe, Period (geology), Mediterranean area, Meltwater, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Holocene, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: On the basis of lake-level data, the period of the Preboreal oscillation (PBO) at 11 300–11 150 cal yr BP as defined by the GRIP oxygen-isotope record appears to correspond to wetter climatic conditions in west-central Europe and to a marked drying in north-central Italy. Additional short-lived phases of higher lake level have been identified before the PBO at ca 11 450–11 400 and 11 350 cal yr BP in west-central Europe, and at ca 11 500 cal yr BP in Italy. Such multiple climatic oscillations around the PBO have been observed in various records in northwestern Europe. On the basis of various proxies, a map of changes in moisture over western Europe during the PBO indicates a mid-latitude zone between 58 and 43°N characterised by wetter conditions, while a drier climate developed in southern and northern Europe. This wet middle zone shows a larger extension and suggests a more meandering, weaker Atlantic Westerly Jet during the PBO than during the 8.2 kyr event. A comparison of lake-level records in west-central Europe with (1) outbursts from North American and north-European proglacial lakes, and (2) variations in solar activity as reflected by 14 C and the 10 Be records supports the hypothesis that the PBO was a response to successive meltwater pulses at 11 300, 11 250, 11 200 and 11 170 cal yr BP and to a sudden decrease in solar activity at 11 250 cal yr BP. This study points to the necessity of developing integrated multi-proxy approaches to construct more robust regional event stratigraphies, and of better documenting palaeohydrological changes in the Mediterranean area.
Published: 2007

28. Paléoenvironnements, climats et sociétés au cours du Tardiglaciaire et de l'Holocène en milieu montagnard : l'enregistrement multi-proxy à haute résolution de la séquence du Lauza (1.140 m, Champsaur, Alpes françaises du Sud)

Author: Court-Picon , Mona, Walter-Simonnet , Anne-Véronique, Linoir , Damien, Bossuet , Gilles, De Beaulieu , Jacques-Louis, Peyron , Odile, Laboratoire de chrono-écologie - CNRS (UMR6565) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Laboratoire de chrono-écologie ( LCE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, and Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE)
Published: 2007

29. Biodiversity patterns in present French forests are related to former Roman agriculture

Author: Dambrine, E., Dupouey, J.-L., Laüt, L., Humbert, L., Thinon, M., Beaufils, Th., Richard, Hervé, Ecosystèmes Forestiers : Microbiologie, Pathologie et Biogéochimie (NANCY ECOSYST FOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité biogéochimie des écosystèmes forestiers (BEF), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Ecosystèmes Forestiers : Microbiologie, Pathologie et Biogéochimie ( NANCY ECOSYST FOR ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), and Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE)
Subjects: land-use history, Roman agriculture, soil nutrient status, temperate forest, archaeology, Central France, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society, plant diversity
Abstract: International audience; Combined archaeological and ecological investigations in a large ancient oak forest in Central France have revealed a dense network of ancient human settlements dating from the Roman period. We demonstrate a strong correlation between present-day forest plant diversity patterns and the location of Roman farm buildings. Plant species richness strongly increases toward the center of the settlements, and the frequency of neutrophilous and nitrogen-demanding species is higher. This pattern is paralleled by an increase in soil pH, available P, and δ15N, indicating the long-term impact of former agricultural practices on forest biogeochemical cycles. These extensive observations in a forested region on acid soils complement and confirm previous results from a single Roman settlement on limestone. Ancient Roman agricultural systems are increasingly being identified in contemporary French forests; the broad extent and long-lasting effects of previous cultivation shown in this study require that land-use history be considered as a primary control over biodiversity variations in many forest landscapes, even after millennia of abandonment.
Published: 2007

30. Périodes d'anthropisation et modification de la sédimentation depuis 8000 ans dans le massif du Champsaur (Hautes Alpes)

Author: Court-Picon, Mona, Linoir, Damien, Bossuet, Gilles, Walter-Simonnet, Anne-Véronique, Simonnet, Jean-Pierre, De Beaulieu, Jacques-Louis, Peyron, Odile, Laboratoire de chrono-écologie - CNRS (UMR6565) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Laboratoire de chrono-écologie ( LCE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, and Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE)
Published: 2007

31. Climate and environmental evolution scenarios for the Meuse/Haute-Marne region, France

Author: Andrieu-Ponel, Valérie, Texier, Delphine, Brulhet, Jacques, de Beaulieu, Jacques-Louis, Bégeot, Carole, Cheddadi, Rachid, Gandouin, Emmanuel, Goodess, Claire, Guiter, Frédéric, Hamelin, Bruno, Loutre, Marie-France, Magny, Michel, Masson-Delmotte, Valérie, Paillard, Didier, Petit-Maire, Nicole, Ponel, Philippe, Pons-Branchu, Edwige, Reille, Maurice, Ruffaldi, Pascale, Thorne, Mike C., van Vliet-Lanoë, Brigitte, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Services communs OMP - UMS 831 (UMS 831), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Agence Nationale pour la Gestion des Déchets Radioactifs (ANDRA), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École polytechnique (X), Géochrononologie Traceurs Archéométrie (GEOTRAC), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Computer Science, University of East Anglia [Norwich] (UEA), Domaines Océaniques (LDO), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Observatoire des Sciences de l'Univers-Institut d'écologie et environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB), Laboratoire Géosystèmes (FRE CNRS 3298), Université de Lille, Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Services communs OMP (UMS 831), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226, Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Glaces et Continents, Climats et Isotopes Stables (GLACCIOS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Modélisation du climat (CLIM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut d'écologie et environnement-Observatoire des Sciences de l'Univers-Université de Brest (UBO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géosystèmes - UMR 8157, Université de Lille, Sciences et Technologies-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), UMS 831 unité mixte de service ( UMS 831 ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National d'Etudes Spatiales ( CNES ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Observatoire Midi-Pyrénées ( OMP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Agence Nationale pour la Gestion des Déchets Radioactifs ( ANDRA ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier ( ISEM ), Université de Montpellier ( UM ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre européen de recherche et d'enseignement de géosciences de l'environnement ( CEREGE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Collège de France ( CdF ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ), Katholieke Universiteit Leuven ( KU Leuven ), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] ( LSCE ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Pierre-Simon-Laplace ( IPSL ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Centre National d'Etudes Spatiales ( CNES ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), University of East Anglia [Norwich] ( UEA ), Domaines Océaniques ( LDO ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut d'écologie et environnement-Observatoire des Sciences de l'Univers-Université de Brest ( UBO ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ), Université européenne de Bretagne ( UEB ), and Laboratoire Géosystèmes ( FRE CNRS 3298 )
Subjects: [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2007

32. Les massifs de l'Argentiérois du Mésolithique au début de l'Antiquité: au croisement des données archéologiques et paléoenvironnementales en Haute montagne (Hautes-Alpes, Parc National des Ecrins)

Author: Tzortzis, Stefan, Mocci, Florence, Walsh, Kevin, Talon, Brigitte, Court-Picon, Mona, Dumas, Vincent, Py, Vanessa, Richer, Suzi, UMR 6578 : Adaptabilité Biologique et Culturelle ( UAABC ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Camille Jullian - Histoire et archéologie de la Méditerranée et de l'Afrique du Nord de la protohistoire à la fin de l'Antiquité ( CCJ ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Department of Archaeology, University of York [York, UK], Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire d'archéologie médiévale méditerranéenne ( LAMM ), Université de Provence - Aix-Marseille 1-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Dept of Archaeology, Hervé Richard, Dominique Garcia, UMR 6578 : Anthropologie Bio-Culturelle (UAABC), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Camille Jullian - Histoire et archéologie de la Méditerranée et de l'Afrique du Nord de la protohistoire à la fin de l'Antiquité (CCJ), Aix Marseille Université (AMU)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire d'archéologie médiévale méditerranéenne (LAMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Université de Provence - Aix-Marseille 1-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE)
Subjects: Moyen Age, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, archéologie, [ SHS.ARCHEO ] Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Préhistoire, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, Alpes, occupation du sol, pastoralisme, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography
Abstract: International audience; Depuis 1998, un programme de recherche pluridisciplinaire sur l’occupation du sol et le pastoralisme de la Préhistoire au Moyen Âge dans les Alpes méridionales est mené sur les hauts massifs de l’Argentiérois (Hautes-Alpes), sous la direction de Kevin Walsh et de Florence Mocci. Des dix phases d’occupation et d’activité agropastorale mises en évidence (prospections et fouilles), entre 1 600 et 2 700 mètres d’altitude, quatre se distinguent : le Mésolithique, le Néolithique, l’Âge du Bronze et la période médiévale. Au travers des premières données archéologiques et environnementales, cet article de synthèse présente, depuis le Tardiglaciaire jusqu’au début de l’Antiquité, les grandes caractéristiques de l’occupation du sol mais aussi l’originalité et l’importance de l’activité humaine dans cette zone alpine. Le Mésolithique est lié à l’exploration saisonnière, à finalité essentiellement cynégétique, des territoires d’altitude accessibles depuis la fin des temps glaciaires. Le Néolithique et l’Âge du Bronze correspondent à une multiplication des gisements archéologiques marquant une rupture dans la gestion de l’espace montagnard. Les paysages sont largement façonnés par les activités humaines ; l’entretien des terres cultivées et des alpages paraît continu. À partir de l’Âge du Bronze ancien, l’une des évolutions qui se manifestent sur les sites d’altitude concerne l’apparition, entre 2 067 et 2 303 mètres d’altitude, de structures pastorales bâties datées par 14C.
Published: 2006

33. Climatic oscillation in central Italy during the Last Glacial-Holocene transition : the record from Lake Accesa

Author: Laurent Millet, Michel Magny, Anne-Véronique Walter-Simonnet, Jacques-Louis de Beaulieu, Odile Peyron, Gilles Bossuet, Boris Vannière, Ruth Drescher-Schneider, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire de chrono-écologie ( LCE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département de Géosciences, Université de Franche-Comté ( UFC ), ECLIPSE, Laboratoire de chrono-écologie - CNRS (UMR6565) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut für Pflanzenwissenschaften, Karl-Franzens-Universität Graz, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3, and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1
Subjects: 010506 paleontology, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Lateglacial, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, lake-level fluctuations, Older Dryas, 01 natural sciences, law.invention, Arts and Humanities (miscellaneous), law, Earth and Planetary Sciences (miscellaneous), Deglaciation, Younger Dryas, Glacial period, Radiocarbon dating, Tephra, Holocene, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, vegetation history, 0105 earth and related environmental sciences, central Italy, Paleontology, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Preboreal, 13. Climate action, Climatology, early Holocene, Physical geography, Geology, fire frequency
Abstract: This paper presents an event stratigraphy based on data documenting the history of vegetation cover, lake-level changes and fire frequency, as well as volcanic eruptions, over the Last Glacial–early Holocene transition from a terrestrial sediment sequence recovered at Lake Accesa in Tuscany (north-central Italy). On the basis of an age–depth model inferred from 13 radiocarbon dates and six tephra horizons, the Oldest Dryas–Bolling warming event was dated to ca. 14 560 cal. yr BP and the Younger Dryas event to ca. 12 700–11 650 cal. yr BP. Four sub-millennial scale cooling phases were recognised from pollen data at ca. 14 300–14 200, 13 900–13 700, 13 400–13 100 and 11 350–11 150 cal. yr BP. The last three may be Mediterranean equivalents to the Older Dryas (GI-1d), Intra-Allerod (GI-1b) and Preboreal Oscillation (PBO) cooling events defined from the GRIP ice-core and indicate strong climatic linkages between the North Atlantic and Mediterranean areas during the last Termination. The first may correspond to Intra-Bolling cold oscillations registered by various palaeoclimatic records in the North Atlantic region. The lake-level record shows that the sub-millennial scale climatic oscillations which punctuated the last deglaciation were associated in central Italy with different successive patterns of hydrological changes from the Bolling warming to the 8.2 ka cold reversal. Copyright © 2006 John Wiley & Sons, Ltd.
Published: 2006

34. SOIL PHYSICO-CHEMICAL CHANGES FOLLOWING APPLICATION OF MUNICIPAL SOLID WASTE LEACHATES TO GRASSLANDS

Author: Pierre Faivre, Jérôme Poulenard, Raphaël Gros, Lucile Jocteur Monrozier, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences du Sol, Centre Interdisciplinaire Scientifique de la Montagne (CISM), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Interdisciplinaire Scientifique de la Montagne ( CISM ), Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3, Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Delorme, Christine, and Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Environmental Engineering, Municipal solid waste, porosity, salts, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, complex mixtures, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [SDV.EE.ECO] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Environmental Chemistry, Leachate, soil quality, [SDU.STU.HY]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, waste leachates, Porosity, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Water Science and Technology, aggregate stability, Ecological Modeling, Environmental engineering, SALT, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, Pollution, Soil quality, Soil contamination, 6. Clean water, [ SDV.EE.ECO ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Cinder, 13. Climate action, Bottom ash, Environmental chemistry, Soil water, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science
Abstract: Concerns about the use of residues from municipal solid waste incinerators (MSWI) in construction materials usually focus on the potential for heavy metals and organic chemicals to leach into drainage waters under the influence of rain. We hypothesised that high level of salts in the MSWI leachates may cause more of a problem, particularly on soil physico-chemical properties. Both bottom ash (BA) and Solidified Air Pollution Control residue (SAPCr) leachates were added to experimental grassland plots. The amounts of Na+ increased by up to 13% in soils supplemented with each leachate. A decrease of the soil total porosity (−14%) was evidence of a subsequent adverse physical effect of this strong salinity. The potential for the grass cover type (species composition or density) to limit this adverse effect was discussed. Laboratory tests allowed us to determine that undiluted SAPCr induced slaking of aggregates accompanied by a strong decrease of aggregate stability, to 49% of control values. Undiluted BA induced dispersion of clays and others fine particles, which are then dislodged and transported into pores, causing blockage and decreasing total porosity. Clay dispersion followed by aggregate collapse occurred when soil solution contaminated by SAPCr was diluted by rainwater. This work stressed the importance of accounting for mineral contaminants, such as salts, when conducting an assessment of waste reuse scenarios.
Published: 2006

35. Does disturbance and restoration of alpine grassland soils affect the genetic structure and diversity of bacterial and N2-fixing populations?

Author: Gros, Raphaël, Jocteur-Monrozier, Lucile, Faivre, Pierre, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Laboratoire des Sciences du Sol, Centre Interdisciplinaire Scientifique de la Montagne (CISM), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Centre Interdisciplinaire Scientifique de la Montagne ( CISM ), Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), and Delorme, Christine
Subjects: [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [SDV.EE.ECO] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, complex mixtures, [ SDV.EE.ECO ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems
Abstract: Responses of bacterial communities to disturbance and restoration processes were investigated on alpine grassland soil. Bulk soil, rhizosphere soil and two soil separates, i.e. sand-size (2000-200 mm) and silt-size (50-2 mm) were sampled from undisturbed grassland soil to soil under restoration for 1 month, 1 year, 4 years and 13 years after disturbance. Automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) of nifH gene pools were used to assay genetic structure of the bacterial communities and N2-fixing guild. According to the distribution of ARISA band length in bacterial phyla, the dominance of ARISA bands below 400 bp showed that Gram-positive bacteria would be predominant in the studied grassland soil when not disturbed. Disturbance affected the genetic structure of bacterial community and of N2-fixing guild in relation to their location within the selected habitats. Shifts in IGS and nifH profiles of bulk soil metagenome were larger than those observed from sandsize- and silt-size-fractions, accounting for 40–50% of the variance in the profiles. Restoration of the genetic structure of telluric bacteria community and N2-fixing populations was found to be influenced by the spatial heterogeneity of the soil and niche diversification.Particular bacterial genetic structure within distinct habitats were evidenced and must be defined as subdivisions of the meta-community of bulk soil. Scale of soil microbial diversity/stability relationships is discussed with special attention to disconnected bacterial habitat compared with whole soil with multiple niches.
Published: 2006

36. Hypoxia Stress: Current Understanding and Perspectives

Author: Dat, James, Folzer, Hélène, Parent, Claire, Badot, Pierre-Marie, Capelli, Nicolas, INH : Pathologie végétale : biodiversité, écologie, interactions bioagresseurs-plantes (PAVE), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Teixeira da Silva JA (ed), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Angers (UA), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), INH : Pathologie végétale : biodiversité, écologie, interactions bioagresseurs-plantes ( PAVE ), Université d'Angers ( UA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), and Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC )
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published: 2006

37. Reconstitutions paléolimnologiques et paléoclimatiques à partir de l'étude des assemblages de Chironomidae (Insecta : Diptera) subfossiles et de la matière organique sédimentaire de la séquence tardiglaciaire du Lago dell'Accesa (Toscane, Italie)

Author: Millet, Laurent, Vannière, Boris, Magny, Michel, de Beaulieu, Jacques-Louis, Disnar, Jean-Robert, Laggoun-Défarge, Fatima, Verneaux, Valérie, Walter-Simonnet, Anne-Véronique, Ortu, Elena, Bossuet, Gilles, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Institut des Sciences de la Terre d'Orléans (ISTO), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (EDYTEM), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut des Sciences de la Terre d'Orléans ( ISTO ), Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université d'Orléans ( UO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne ( EDYTEM ), Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Environnements, Dynamiques et Territoires de Montagne (EDYTEM)
Published: 2006

38. Changes in the forest environment of Western Europe and the rise and fall civilisation: a case study in France

Author: de Beaulieu, Jacques-Louis, Barbero, Marcel, Reille, Maurice, Richard, Hervé, Marguerie, Dominique, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université ( AMU ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre de Recherche en Archéologie, Archéosciences, Histoire ( CReAAH ), Le Mans Université ( UM ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ) -Institut national de recherches archéologiques préventives ( Inrap ) -Université de Rennes 2 ( UR2 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Nantes - UFR Sciences et Techniques, Université de Nantes ( UN ) -Université de Nantes ( UN ), Yoshinori Yasuda, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre de Recherche en Archéologie, Archéosciences, Histoire (CReAAH), Le Mans Université (UM)-Université de Rennes (UR)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes - UFR Histoire, Histoire de l'Art et Archéologie (UFR HHAA), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Ministère de la Culture (MC), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Nantes Université (NU)-Ministère de la Culture (MC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Le Mans Université (UM), Université de Nantes (UN)-Le Mans Université (UM)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), and Richard, Hervé
Subjects: [SDE.ES] Environmental Sciences/Environmental and Society, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society
Abstract: International audience
Published: 2001

39. Structure–function analysis of pectate lyase Pel3 reveals essential facets of protein recognition by the bacterial type 2 secretion system

Author: Patrice Gouet, Lionel Ballut, Florence Ruaudel, Natalia Guschinskaya, Xavier Robert, Camille Pineau, Isabelle R. Gonçalves, Vladimir E. Shevchik, Microbiologie, adaptation et pathogénie (MAP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Trafic et signalisation membranaires chez les bactéries (MTSB), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Génomique fonctionnelle des Champignons Phytopathogènes (GFCP), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3, Microbiologie moléculaire et biochimie structurale / Molecular Microbiology and Structural Biochemistry (MMSB), and Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Models, Molecular, Protein Conformation, alpha-Helical, structure–function, 0301 basic medicine, bacterial pathogenesis, PL-3, polysaccharide lyases of family 3, [SDV]Life Sciences [q-bio], Pectobacterium, Gene Expression, Pectobacterium carotovorum, Crystallography, X-Ray, virulence factor, Biochemistry, Type three secretion system, Pel, pectate lyase, Protein structure, Cell Wall, Type II Secretion Systems, GSP, general secretory pathway, Cloning, Molecular, Phylogeny, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, biology, Type II secretion system, Chemistry, Plants, Dickeya dadantii, Recombinant Proteins, plant pathogen, Cell biology, Isoenzymes, Pectate lyase, Bacterial outer membrane, Protein Binding, Research Article, Genetic Vectors, type II secretion system (T2SS), T3SS, type 3 secretion system, r.m.s.d., root-mean-square deviation, IPTG, isopropyl-β-d-thiogalactopyranoside, 03 medical and health sciences, Bacterial Proteins, Plant Cells, protein secretion, Escherichia coli, [CHIM]Chemical Sciences, Protein Interaction Domains and Motifs, Secretion, Amino Acid Sequence, protein structure, Dickeya, Molecular Biology, Polysaccharide-Lyases, Binding Sites, Sequence Homology, Amino Acid, 030102 biochemistry & molecular biology, CD, catalytic domain, Cell Biology, biology.organism_classification, pectinase, 030104 developmental biology, T2SS, type 2 secretion system, Protein Conformation, beta-Strand, Sequence Alignment
Abstract: The type II secretion system (T2SS) transports fully folded proteins of various functions and structures through the outer membrane of Gram-negative bacteria. The molecular mechanisms of substrate recruitment by T2SS remain elusive but a prevailing view is that the secretion determinants could be of a structural nature. The phytopathogenic γ-proteobacteria, Pectobacterium carotovorum and Dickeya dadantii, secrete similar sets of homologous plant cell wall degrading enzymes, mainly pectinases, by similar T2SSs, called Out. However, the orthologous pectate lyases Pel3 and PelI from these bacteria, which share 67% of sequence identity, are not secreted by the counterpart T2SS of each bacterium, indicating a fine-tuned control of protein recruitment. To identify the related secretion determinants, we first performed a structural characterization and comparison of Pel3 with PelI using X-ray crystallography. Then, to assess the biological relevance of the observed structural variations, we conducted a loop-substitution analysis of Pel3 combined with secretion assays. We showed that there is not one element with a definite secondary structure but several distant and structurally flexible loop regions that are essential for the secretion of Pel3 and that these loop regions act together as a composite secretion signal. Interestingly, depending on the crystal contacts, one of these key secretion determinants undergoes disorder-to-order transitions that could reflect its transient structuration upon the contact with the appropriate T2SS components. We hypothesize that such T2SS-induced structuration of some intrinsically disordered zones of secretion substrates could be part of the recruitment mechanism used by T2SS.
Published: 2021

40. GCN5 modulates salicylic acid homeostasis by regulating H3K14ac levels at the 5′ and 3′ ends of its target genes

Author: Ruggieri, Valentino, Alexiou, Konstantinos, Morata, Jordi, Argyris, Jason, Pujol, Marta, Yano, Ryoichi, Nonaka, Satoko, Ezura, Hiroshi, Cigliano, Riccardo Aiese, Sanseverino, Walter, Puigdomenech, Pere, Casacuberta, Josep, Kirienko, Anna, Porozov, Yuri, Malkov, Nikita, Akhtemova, Gulnara, Le Signor, Christine, Thompson, Richard, Saffray, Christine, Dalmais, Marion, Tikhonovich, Igor, Dolgikh, Elena, Boucheham, Anouar, Sommard, Vivien, Zehraoui, Farida, Batouche, Mohamed, Israeli, David, Tahi, Fariza, Jacob, Pierre, Avni, Adi, Ligerot, Yasmine, De Saint Germain, Alexandre, Waldie, Tanya, Kadakia, Nikita, Pillot, Jean-Paul, Prigge, Michael, Aubert, Gregoire, Leyser, Ottoline, Estelle, Mark, Debellé, Frederic, Rameau, Catherine, GOUZY, Jerome, Badouin, Hélène, Lemainque, Arnaud, Vergne, Philippe, Moja, Sandrine, Choisne, Nathalie, Pont, Caroline, Carrere, Sebastien, Caissard, Jean-Claude, Couloux, Arnaud, Cottret, Ludovic, Aury, Jean-Marc, Szécsi, Judit, Madoui, Mohammed-Amin, Yang, Shu-Hua, Piola, Florence, Larrieu, Antoine, Perez, Magali, Labadie, Karine, Perrier, Lauriane, govetto, Benjamin, LABROUSSE, Yoan, Villand, Priscilla, Bardoux, Claudia, Boltz, Véronique, Lopez-Roques, Celine, Heitzler, Pascal, Vernoux, Teva, Quesneville, Hadi, Boualem, Adnane, Liu, Chang, Le Bris, Manuel, Salse, Jerome, Baudino, Sylvie, Wincker, Patrick, François, Léa, Verdenaud, Marion, Fu, Xiaopeng, Ruleman, Darcy, Dubois, Annick, Vandenbussche, Michiel, Raymond, Olivier, Just, Jérémy, Bendahmane, Mohammed, Giner, Ana, Pascual, Laura, Bourgeois, Michael, Gyetvai, Gabor, Rios, Pablo, Picó, Belén, Troadec, Christelle, Bendahmane, Abdel, Garcia-Mas, Jordi, MARTIN-HERNANDEZ, Ana Montserrat, Kim, Soonkap, Piquerez, Sophie, Ramirez-Prado, Juan, Mastorakis, Emmanouil, Veluchamy, Alaguraj, Latrasse, David, Manza-Mianza, Deborah, Brik-Chaouche, Rim, Huang, Ying, Rodriguez-Granados, Natalia, Concia, Lorenzo, Blein, Thomas, Citerne, Sylvie, Bendahmane, Abdelhafid, Bergounioux, Catherine, Crespi, Martin, Mahfouz, Magdy, Raynaud, Cécile, Hirt, Heribert, Ntoukakis, Vardis, BENHAMED, Moussa, Centre for Research in Agricultural Genomics (CRAG), IRTA, Center for Research in Agricultural Genomics, University of Tsukuba, Sequentia Biotech SL, LAboratoire PLasma et Conversion d'Energie (LAPLACE), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay (IPS2 (UMR_9213 / UMR_1403)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology, University Salah Boubnider Constantine 3, Laboratoire d'Informatique de Paris-Nord (LIPN), Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut Galilée-Université Paris 13 (UP13)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LIRE laboratory, Constantine, University of Constantine, GENETHON 3, Université Paris Saclay (COmUE), Tel Aviv University [Tel Aviv], Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Sainsbury Laboratory, University of Cambridge [UK] (CAM), University of California [San Diego] (UC San Diego), University of California, Laboratoire de chimie organique et organométallique (LCOO), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Division of Biology [La Jolla], University of California-University of California, UMR 0441 INRA / CNRS : Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sexe et évolution, Département PEGASE [LBBE] (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire de Biotechnologies Végétales appliquées aux Plantes Aromatiques et Médicinales (LBVPAM), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), Unité de Recherche Génomique Info (URGI), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Département de chirurgie, CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque, Génomique métabolique (UMR 8030), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), Reproduction et développement des plantes (RDP), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés (LEHNA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre for Plant Integrative Biology [Nothingham] (CPIB), University of Nottingham, UK (UON), Institut de Génomique d'Evry (IG), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), GeT PlaGe, Genotoul, Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sun Yat-Sen University [Guangzhou] (SYSU), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Huazhong Agricultural University, Division of Biology [Pasadena], California Institute of Technology (CALTECH), Unité de recherche Génétique et amélioration des fruits et légumes (GAFL), Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses à Graines (UMRLEG) (UMR 102), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Universitat Politecnica de Valencia (UPV), Institute of Agrifood Research and Technology (IRTA), Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentaries, King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), School of Economics and Management [Beijing] (BUAA), Beihang University, Institut de biotechnologie des plantes (IBP), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Warwick [Coventry], AgroParisTech, and ANR-18-CE20-0015,EPICLIPSE,Dynamique des marques épigénétiques dans les cellules hôtes infectées et subversion de l'épigénome par le pathogène.(2018)
Subjects: 0106 biological sciences, Transcription, Genetic, AcademicSubjects/SCI00010, [SDV]Life Sciences [q-bio], Arabidopsis, Biology, Genes, Plant, 01 natural sciences, Histones, 03 medical and health sciences, Gene Expression Regulation, Plant, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Genetics, Homeostasis, Plant Immunity, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Epigenetics, Promoter Regions, Genetic, QH426, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Histone Acetyltransferases, 030304 developmental biology, Regulation of gene expression, 0303 health sciences, Arabidopsis Proteins, Lysine, Gene regulation, Chromatin and Epigenetics, Acetylation, Biotic stress, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, Cell biology, Chromatin, enzymes and coenzymes (carbohydrates), Histone, Acetyltransferase, Transcription Coactivator, biology.protein, 5' Untranslated Regions, Salicylic Acid, 010606 plant biology & botany
Abstract: The modification of histones by acetyl groups has a key role in the regulation of chromatin structure and transcription. The Arabidopsis thaliana histone acetyltransferase GCN5 regulates histone modifications as part of the Spt-Ada-Gcn5 Acetyltransferase (SAGA) transcriptional coactivator complex. GCN5 was previously shown to acetylate lysine 14 of histone 3 (H3K14ac) in the promoter regions of its target genes even though GCN5 binding did not systematically correlate with gene activation. Here, we explored the mechanism through which GCN5 controls transcription. First, we fine-mapped its GCN5 binding sites genome-wide and then used several global methodologies (ATAC-seq, ChIP-seq and RNA-seq) to assess the effect of GCN5 loss-of-function on the expression and epigenetic regulation of its target genes. These analyses provided evidence that GCN5 has a dual role in the regulation of H3K14ac levels in their 5′ and 3′ ends of its target genes. While the gcn5 mutation led to a genome-wide decrease of H3K14ac in the 5′ end of the GCN5 down-regulated targets, it also led to an increase of H3K14ac in the 3′ ends of GCN5 up-regulated targets. Furthermore, genome-wide changes in H3K14ac levels in the gcn5 mutant correlated with changes in H3K9ac at both 5′ and 3′ ends, providing evidence for a molecular link between the depositions of these two histone modifications. To understand the biological relevance of these regulations, we showed that GCN5 participates in the responses to biotic stress by repressing salicylic acid (SA) accumulation and SA-mediated immunity, highlighting the role of this protein in the regulation of the crosstalk between diverse developmental and stress-responsive physiological programs. Hence, our results demonstrate that GCN5, through the modulation of H3K14ac levels on its targets, controls the balance between biotic and abiotic stress responses and is a master regulator of plant-environmental interactions.
Published: 2020

41. Persistence of microcystin production by Planktothrix agardhii (Cyanobacteria) exposed to different salinities

Author: Audrey Combès, Stéphanie Fayolle, Katia Comte, Evelyne Franquet, Julia Vergalli, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes (MCAM), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Sciences Analytiques, Bioanalytiques, et Miniaturisation (LSABM), Chimie-Biologie-Innovation (UMR 8231) (CBI), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)
Subjects: 0106 biological sciences, chemistry.chemical_classification, Cyanobacteria, Abiotic component, biology, Brackish water, 010604 marine biology & hydrobiology, Plant Science, Microcystin, Aquatic Science, Cyanotoxin, biology.organism_classification, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Acclimatization, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, 6. Clean water, Salinity, chemistry.chemical_compound, chemistry, 13. Climate action, Chlorophyll, Botany, 14. Life underwater, [SDV.EE.BIO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Bioclimatology
Abstract: International audience; Recent reports predict increases in harmful cyanobacteria in water systems worldwide due to climatic and environmental changes, which would compromise water quality and public health. Among abiotic changes, higher salinities are expected to promote the growth of certain harmful species, such as Planktothrix agardhii, which forms blooms in brackish waters. Since P. agardhii is a common producer of cyanotoxin, we investigated the growth and tolerance of this species when exposed in vitro to a range of salinities, while assessing variations in its microcystin diversity and production in batch cultures during a time-frame experiment spanning 18 days. The study revealed salt acclimation of the brackish P. agardhii, which continued to produce microcystins in salty cultures, while maintaining its growth capacity at low to medium NaCl (ranging from 0 to 7.5 g l−1). With higher concentrations (10 to 15 g l−1) significantly less growth occurred, corresponding to the shortening of cyanobacterial filaments, which nevertheless maintained their metabolic functions, as revealed by the high intensity of chlorophyll auto-fluorescence and persistent microcystin production. These findings showed that moderate to high salt levels do not inhibit microcystin production by P. agardhii, at least for several weeks. This raises questions concerning the persistence of harmful cyanobacteria in shallow water systems more exposed to evaporation and consequently to an increase in salinity in the future, as predicted by various climate models.
Published: 2020

42. The Eurasian Modern Pollen Database (EMPD), version 2

Author: Juliana Atanassova, Christine M. Åkesson, Piotr Kołaczek, Marco Zanon, Kari Loe Hjelle, Lyudmila S. Shumilovskikh, Heikki Seppä, Nathalie Combourieu-Nebout, Vachel A. Carter, James Edward Schofield, Krystyna Milecka, Iria García-Moreiras, Takeshi Nakagawa, Walter Finsinger, Willy Tinner, Castor Muñoz Sobrino, Anne Birgitte Nielsen, José Antonio López-Sáez, Elena Marinova, Philipp Stojakowits, Tatiana G. Antipina, Silvia Sabariego Ruiz, Roman Abegglen, Vlasta Jankovská, Oksana G. Zanina, Mariusz Gałka, Arsenii T. Galimov, Maria Papadopoulou, Manfred Rösch, Kevin J. Edwards, Patricia L. Fall, Basil A. S. Davis, Philipp Sommer, Elissaveta Bozilova, Ulrike Herzschuh, Verushka Valsecchi, Natalia Ryabogina, Ikuko Kitaba, Elena Novenko, Michelle Leydet, Anna Pędziszewska, Nata K. Panova, Almut Mrotzek, Donatella Magri, Eleonora Clo, Isabelle Matthias, R. Scott Anderson, Tatiana Blyakharchuk, Kazimierz Tobolski, Vincent Lebreton, Leanne N. Phelps, Irina G. Gvozdeva, André F. Lotter, Nina I. Belyanina, Assunta Florenzano, William J. Fletcher, Ioan Tantau, Suzanne A.G. Leroy, Roxana Grindean, Normunds Stivrins, Elena G. Lapteva, Francisca Alba-Sánchez, J. Sakari Salonen, Tatiana I. Petrenko, Tatyana V. Sapelko, Angelica Feurdean, Anna Maria Mercuri, Yuri A. Mikishin, G Furlanetto, Susanne Jahns, Cesare Ravazzi, Helena Svobodova Svitavska, Anastasia Mavridou, Carlo Alessandro Montanari, Jose Manuel Mesa-Fernández, Sampson Panajiotidis, Ruth Beer, Stéphanie Desprat, Federico Di Rita, María J. Ramos-Román, Emna Gaceur, Joanna Święta-Musznicka, Małgorzata Latałowa, Thomas Giesecke, Olga K. Borisova, Galina Bukreeva, M. Jane Bunting, Manuel Chevalier, Achille Mauri, Maria Angela Guido, Darya A. Lopatina, César Morales-Molino, Spassimir Tonkov, Marcelina Zimny, Monika Karpińska-Kołaczek, Sergey Ivanov, Gonzalo Jiménez-Moreno, Daniele Colombaroli, Morteza Djamali, Heather S. Pardoe, Olga D. Naidina, Margarita Tsakiridou, Université de Lausanne, Swiss National Science Foundation, López Sáez, José Antonio [0000-0002-3122-2744], Institute of Earth Surface Dynamics [Lausanne], Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Charles University [Prague] (CU), Lomonosov Moscow State University (MSU), Oeschger Centre for Climate Change Research (OCCR), University of Bern, Histoire naturelle de l'Homme préhistorique (HNHP), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of physical chemistry, Uppsala University, Senckenberg biodiversität und klima forschungszentrum (BIK-F), Forschungsinstitut Senckenberg (SGN), Laboratorio di Palinologia e Paleobotanica, Adam Mickiewicz University in Poznań (UAM), Department of Palynology and Climate Dynamics, Georg-August-University = Georg-August-Universität Göttingen, Alfred Wegener Institute for Polar and Marine Research (AWI), Natural History Collections, University of Bergen (UiB)-University of Bergen (UiB), A.F. Ioffe Physical-Technical Institute, Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), Brandenburgisches Landesamt für Denkmalpflege und Archäologisches Landesmuseum, Universidad de Granada = University of Granada (UGR), Institute of Geoecology and Geoinformation, Department of Plant Ecology, Gdansk University, University of Gdańsk (UG), Laboratoire de Recherche en Sciences Humaines (Lares-Las), Université de Rennes 2 (UR2), Dipartimento di biologia ambientale, Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA), Department of Botany, Sofia University 'St. Kliment Ohridski', NASA Ames Research Center (ARC), Department of Biogeography and Palaeoecology, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Lund University [Lund], Laboratoire d'Informatique, Systèmes, Traitement de l'Information et de la Connaissance (LISTIC), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), CNR-IDPA, Dipartimento di Scienze dell'Ambiente e del Territorio, Università degli Studi di Milano-Bicocca = University of Milano-Bicocca (UNIMIB), Department of Physics and Astronomy [Turku], University of Turku, Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki, Department of Geography [Riga], Софийски университет = Sofia University, University of Portsmouth, Aix Marseille Université (AMU), Avignon Université (AU), López Sáez, José Antonio, Davis, B, Chevalier, M, Sommer, P, Carter, V, Finsinger, W, Mauri, A, Phelps, L, Zanon, M, Abegglen, R, Akesson, C, Alba-Sanchez, F, Scott Anderson, R, Antipina, T, Atanassova, J, Beer, R, Belyanina, N, Blyakharchuk, T, Borisova, O, Bozilova, E, Bukreeva, G, Jane Bunting, M, Clo, E, Colombaroli, D, Combourieu-Nebout, N, Desprat, S, Di Rita, F, Djamali, M, Edwards, K, Fall, P, Feurdean, A, Fletcher, W, Florenzano, A, Furlanetto, G, Gaceur, E, Galimov, A, Galka, M, Garcia-Moreiras, I, Giesecke, T, Grindean, R, Guido, M, Gvozdeva, I, Herzschuh, U, Hjelle, K, Ivanov, S, Jahns, S, Jankovska, V, Jimenez-Moreno, G, Karpinska-Kolaczek, M, Kitaba, I, Kolaczek, P, Lapteva, E, Latalowa, M, Lebreton, V, Leroy, S, Leydet, M, Lopatina, D, Lopez-Saez, J, Lotter, A, Magri, D, Marinova, E, Matthias, I, Mavridou, A, Mercuri, A, Mesa-Fernandez, J, Mikishin, Y, Milecka, K, Montanari, C, Morales-Molino, C, Mrotzek, A, Sobrino, C, Naidina, O, Nakagawa, T, Nielsen, A, Novenko, E, Panajiotidis, S, Panova, N, Papadopoulou, M, Pardoe, H, Pedziszewska, A, Petrenko, T, Ramos-Roman, M, Ravazzi, C, Rosch, M, Ryabogina, N, Ruiz, S, Sakari Salonen, J, Sapelko, T, Schofield, J, Seppa, H, Shumilovskikh, L, Stivrins, N, Stojakowits, P, Svitavska, H, Swieta-Musznicka, J, Tantau, I, Tinner, W, Tobolski, K, Tonkov, S, Tsakiridou, M, Valsecchi, V, Zanina, O, Zimny, M, University of St Andrews. School of Geography & Sustainable Development, University of St Andrews. Environmental Change Research Group, Department of Geosciences and Geography, Université de Lausanne (UNIL), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226, Department of Botany, Faculty of Science, Charles University, Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Georg-August-University [Göttingen], Departamento de Estratigrafía y Paleontología, Universidad de Granada, Universidad de Granada (UGR), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome], Sofia University 'Sv. Kliment Ohridski', Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Department of Geology, Lund University, Sölvegatan 12, SE-22362 Lund, Sweden, Università degli Studi di Milano-Bicocca [Milano] (UNIMIB), University of Helsinki, and University of Sofia
Subjects: 0106 biological sciences, LAKE CONSTANCE REGION, Palynology Palaeoecology Palaeoclimatology, 010504 meteorology & atmospheric sciences, HUMAN IMPACT, recent pollen deposition, 580 Plants (Botany), medicine.disease_cause, 01 natural sciences, 2417.10 Paleobotánica, [SDV.SA.SF]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Silviculture, forestry, ddc:550, SURFACE POLLEN, SOUTHERN NORWAY, SDG 13 - Climate Action, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, lcsh:Environmental sciences, SDG 15 - Life on Land, lcsh:GE1-350, 0303 health sciences, CLIMATE-CHANGE, GE, APUSENI NATURAL PARK, lcsh:QE1-996.5, Foundation (engineering), European pollen database, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], Europe, LAST GLACIAL MAXIMUM, Geography, NORTHERN IBERIAN PLATEAU, pollen, GE Environmental Sciences, 1171 Geosciences, 010506 paleontology, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Earth and Planetary Sciences(all), Library science, Climate change, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, 010603 evolutionary biology, neotoma, 03 medical and health sciences, Eurasian Modern Pollen Database, 2502.05 Paleoclimatología, Pollen, medicine, SIERRA-NEVADA, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, 0105 earth and related environmental sciences, 030304 developmental biology, Botánica, HOLOCENE VEGETATION HISTORY, DAS, 15. Life on land, 2416.03 Palinología, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, lcsh:Geology, [SDU]Sciences of the Universe [physics], MCP, General Earth and Planetary Sciences, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: The Eurasian (née European) Modern Pollen Database (EMPD) was established in 2013 to provide a public database of high-quality modern pollen surface samples to help support studies of past climate, land cover, and land use using fossil pollen. The EMPD is part of, and complementary to, the European Pollen Database (EPD) which contains data on fossil pollen found in Late Quaternary sedimentary archives throughout the Eurasian region. The EPD is in turn part of the rapidly growing Neotoma database, which is now the primary home for global palaeoecological data. This paper describes version 2 of the EMPD in which the number of samples held in the database has been increased by 60% from 4826 to 8134. Much of the improvement in data coverage has come from northern Asia, and the database has consequently been renamed the Eurasian Modern Pollen Database to reflect this geographical enlargement. The EMPD can be viewed online using a dedicated map-based viewer at https://empd2.github.io and downloaded in a variety of file formats at https: //doi.pangaea.de/10.1594/PANGAEA.909130 (Chevalier et al., 2019)., Swiss National Science Foundation (SNSF) 200021_169598, University of Lausanne
Published: 2020

43. A divergent CheW confers plasticity to nucleoid-associated chemosensory arrays

Author: Leon Espinosa, Aurelie Barneoud, Deborah Byrne, Emilia M. F. Mauriello, Virginie Molle, Julien Herrou, Tâm Mignot, Philippe Roche, Marie-Jeanne Basse, Annick Guiseppi, Juan Jesus Vicente, Audrey Moine, Laboratoire de chimie bactérienne (LCB), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Washington [Seattle], Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires - UMR5100 (LMGM), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory of Pathogen Host Interactions [Montpellier] (LPHI), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-14-CE11-0023,Bacterial sensing,Perception microbiénne pendant les comportements sociaux(2014), Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires (LMGM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LPHI - Laboratory of Pathogen Host Interactions (LPHI), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1
Subjects: Cancer Research, Operon, Cell motility, QH426-470, Biochemistry, 0302 clinical medicine, Protein structure, Cell Movement, Macromolecular Structure Analysis, Post-Translational Modification, Amino Acids, Phosphorylation, Genetics (clinical), chemistry.chemical_classification, Regulation of gene expression, Fluorescence microscopy, Microscopy, 0303 health sciences, Crystallography, Organic Compounds, Physics, Chemotaxis, Light Microscopy, Condensed Matter Physics, Amino acid, Cell biology, Chemistry, Phenotype, Physical Sciences, Basic Amino Acids, Signal transduction, Chemosensory clusters, Research Article, Signal Transduction, Cell Physiology, Myxococcus xanthus, Methyl-Accepting Chemotaxis Proteins, Biology, Research and Analysis Methods, 03 medical and health sciences, Bacterial Proteins, Genetics, Solid State Physics, Nucleoid, Protein structure comparison, Histidine, Molecular Biology, Cell fusion, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 030304 developmental biology, 030306 microbiology, Crystal structure, Organic Chemistry, fungi, Chemical Compounds, Biology and Life Sciences, Proteins, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Cell Biology, Gene Expression Regulation, Bacterial, chemistry, Frzb, bacteria, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Chemosensory systems are highly organized signaling pathways that allow bacteria to adapt to environmental changes. The Frz chemosensory system from M. xanthus possesses two CheW-like proteins, FrzA (the core CheW) and FrzB. We found that FrzB does not interact with FrzE (the cognate CheA) as it lacks the amino acid region responsible for this interaction. FrzB, instead, acts upstream of FrzCD in the regulation of M. xanthus chemotaxis behaviors and activates the Frz pathway by allowing the formation and distribution of multiple chemosensory clusters on the nucleoid. These results, together, show that the lack of the CheA-interacting region in FrzB confers new functions to this small protein., Author summary Chemosensory systems are signaling complexes that are widespread in bacteria and allow the modulation of different cellular functions, such as taxis and development, in response to the environment. We show that the Myxococcus xanthus FrzB is a divergent CheW lacking the region involved in the interaction with the histidine kinase FrzE. Instead, it acts upstream of FrzCD to allow the formation of multiple distributed Frz chemosensory arrays at the nucleoid. The loss of the CheA-interacting region in FrzB might have been selected to confer plasticity to nucleoid-associated chemosensory systems. By unraveling a new accessory protein and its function, this work opens new insights into the knowledge of the regulatory potentials of bacterial chemosensory systems.
Published: 2019

44. Late-glacial and Holocene European pollen data

Author: Basil A. S. Davis, Steffen Wolters, Graciela Gil-Romera, Richard H. W. Bradshaw, Walter Finsinger, Ralph Fyfe, Heather Binney, Michelle Leydet, Petr Kuneš, Jacques-Louis de Beaulieu, Thomas Giesecke, Norbert Kühl, Simon Brewer, University of Utah, Georg-August-Universität Göttingen, Université de Genève ( UNIGE ), Centre de Bio-Archéologie et d'Ecologie ( CBAE ), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), University of Southampton [Southampton], Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université ( AMU ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), School of Geography, University of Plymouth-University of Plymouth, Instituto Pirenaico de Ecologia, Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Spain] ( CSIC ), Steinmann-Institut für Geologie, Mineralogie und Paläontologie, Bonn Universität [Bonn], Charles University [Prague], School of Environmental Sciences, University of Liverpool, University of Liverpool, Department of Geography, University of Liverpool-University of Liverpool, ÉcolePolytechniqueFédérale de Lausanne (EPFL), School of Architecture, Civil and Environmental, Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier ( ISEM ), Université de Montpellier ( UM ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie ( IMEP ), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Georg-August-University = Georg-August-Universität Göttingen, Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Southampton, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plymouth University-Plymouth University, Instituto Pirenaico de Ecologìa = Pyrenean Institute of Ecology [Zaragoza] (IPE - CSIC), Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn, Charles University [Prague] (CU), Georg-August-University [Göttingen], Université de Genève (UNIGE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE), Instituto Pirenaico de Ecologia (IPE), and Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC)
Subjects: 010506 paleontology, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [ SDV.BV.BOT ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, Geography, Planning and Development, medicine.disease_cause, 01 natural sciences, [ SDV.SA.SF ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Silviculture, forestry, Abundance (ecology), vegetation, lcsh:G3180-9980, Pollen, Earth and Planetary Sciences (miscellaneous), medicine, [ SDU.ENVI ] Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, Glacial period, Environmental history, [ SDV.BIBS ] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], Holocene, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, lcsh:Maps, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Vegetation, 15. Life on land, Europe, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Taxon, Geography, Climatology, European Pollen Database, late-glacial, Physical geography, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society
Abstract: International audience; The European Pollen Database (EPD) is a community effort to archive and make available pollen sequences from across the European continent. Pollen sequences provide records that may be used to infer past vegetation and vegetation change. We present here maps based on 828 sites from the EPD giving an overview of changes in postglacial pollen assemblages in Europe over the past 15,000 years. The maps show the distribution and abundance of 54 different pollen taxa at 500 year intervals, supported by new age-depth models and associated chronological uncertainty analysis. Results show the individualistic patterns of spread of different pollen taxa, and provide a standardized dataset for further analysis, defining a spatial context for the study of past plant and vegetation changes and other aspects of environmental history in Europe.
Published: 2017

45. 'Faidherbia-Flux': adapting crops to climate changes in a semi-arid agro-sylvo-pastoral open observatory (Senegal)

Author: Olivier Rouspard, Cathy Clermont-Dauphin, Alain Audebert, Josias Sanou, Jonas Koala, Christophe Jourdan, Orange Didier, Do, F. C., Alain Rocheteau, Isabelle Bertrand, Emile Faye, Tall, L., Gaglo, E., Tounkara, A., Demarchi, G., Brévault, T., Rémi Vezy, Guerric le Maire, Josiane Seghieri, Cournac, L., Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Architecture et Fonctionnement des Espèces Fruitières [AGAP] (AFEF), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut de l'Environnement et Recherches Agricoles [Ouagadougou] (INERA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Biodiversité et écologie fonctionnelle des micro-organismes pour la Transformation de composés récalcitrants (BIOTRANS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Cirad-PERSYST), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre IRD de Montpellier (IRD), Fonctionnement agroécologique et performances des systèmes de cultures horticoles (UPR HORTSYS), Institut Sénégalais de Recherches Agricoles [Dakar] (ISRA), Montpellier Cirad, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie et Intensification Durables des cultures annuelles (UPR AIDA), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Institut de recherche pour le développement [Dakar, Sénégal] (IRD Hann Maristes), Christophe Dupraz, M. Gosme, G. Lawson, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre national de la recherche scientifique et technologique [Ouagadougou] (CNRST), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
Subjects: Yield, LER_M, P40 - Météorologie et climatologie, F08 - Systèmes et modes de culture, adaptation aux changements climatiques, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics, Phylogenetics and taxonomy, Drone, K10 - Production forestière, Pests, Sénégal, Faidherbia effect, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Système agrosylvopastoral, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; The adaptation of semi-arid crops to climate changes is theoretically possible through agroforestry, provided that the trees exert little competition, or even increase the multifunctional LER (LER_M). We monitored microclimate, net primary productivity (NPP), CO2 and H2O fluxes in a semiarid agro-sylvo-pastoral system (Niakhar, Senegal), dominated by the multipurpose Faidherbia albida (FA) tree. Undercrops were mainly millet and peanut, under annual rotation. We scanned a 1.24 ha millet under FA plot with UAV photogrammetry in RGB, thermal infrared and multispectral bands. At harvest, we collected 12 subplots of 15 millet holes each, distributed either below the crown of FA, or at 2.5 x crown radius, or at 5 x crown radius. We separated all organs. The whole millet root system (0-200 cm) was sampled also in 2 m trenches, totalizing 4 millet holes, where all roots were sorted by layer. The whole plot harvest will allow extrapolating yield from subplots, through UAV images. Millet yield per unit ground area was about 3 times higher below FA, with still a positive influence at 2.5 x crown radius and less impacts of pests close to FA. In the trenches, we noted higher soil humidity and SOC close to the FA trunks. This observatory is open for collaboration.
Published: 2019

46. A new species of Anomaloglossus (Anura: Aromobatidae) of the stepheni group with the redescription of A. baeobatrachus (Boistel and de Massary, 1999), and an amended definition of A. leopardus Ouboter and Jairam, 2012

Author: Alain Dubois, Philippe Gaucher, Jean-Pierre Vacher, Elodie A. Courtois, Rawien Jairam, Antoine Fouquet, Chloé Deschamps, Paul E. Ouboter, Philippe J. R. Kok, Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Evolution et Diversité Biologique (EDB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Preuves, Programmes et Systèmes (PPS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire Ecologie, Evolution, Interactions des Systèmes amazoniens (LEEISA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anton de Kom Universiteit van Suriname - Anton de Kom University of Suriname [Paramaribo] (UVS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Vrije Universiteit Brussel (VUB), Biology, Amphibian Evolution Lab, Ecology and Systematics, Laboratoire Ecologie, évolution, interactions des systèmes amazoniens (LEEISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Guyane (UG)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE)
Subjects: Zoology, [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics, Phylogenetics and taxonomy, Amphibia, Amazonia, Aromobatidae, [SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology, Animals, Animalia, Chordata, Clade, Endemism, Biology, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Taxonomy, Leopardus, biology, Reproduction, Dendrobatidae, Holotype, Endotrophy, Biodiversity, Reproductive mode, biology.organism_classification, Guiana Shield, Taxon, Larva, Animal Science and Zoology, Type locality, Taxonomy (biology), Guyana, Anura
Abstract: International audience; Anomaloglossus is a species-rich genus of frogs endemic to the Guiana Shield that still harbors several unnamed species. Within the A. stepheni species group (which includes four valid nominal species), A. baeobatrachus has an uncertain taxonomic status, notably because the holotype was an unvouchered specimen depicted in a popular journal. Another member of this group, A. leopardus, was only superficially described, lacking information on the sex of specimens in the type series and on advertisement call. Therefore, these two taxa need clarifications in order to allow the description of the extant undescribed species. In this paper, we redescribe A. baeobatrachus based on newly collected material from the species type locality and provide information about its reproductive ecology. We also provide an amended definition of A. leopardus using newly collected material from its type locality. These two species form a clade along with a third species from the Eastern Guiana Shield, which is also described herein. The reproductive biology of A. baeobatrachus and A. stepheni is very similar. Both species have endotrophic and nidicolous tadpoles, despite being distantly related, suggesting independent evolution of this breeding mode. The new species and A. leopardus, on the other hand, have exotrophic tadpoles.
Published: 2019

47. Aix-en-Provence, 6, boulevard Ferdinand-de-Lesseps, 5, avenue de Tübingen

Author: Zielinsky, Caroline, Bonnet, Stéphane, Rey, Emilie, Huguet, Céline, Lacombe, Aline, Attia, Nicolas, Chateauneuf, Florent, Chazottes, Marie-Astrid, Magnin , Frédéric, Charlotte, Mela, Tardy de Montravel, Alice, Nin, Núria, Susini, Vanina, Direction Archéologie et Muséum de la ville d'Aix-en-Provence, Centre Technique Municipal RTE des Milles Aix-en-Provence, Laboratoire d'Archéologie Médiévale et Moderne en Méditerranée (LA3M), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix-Marseille Université - Faculté des Arts, Lettres, Langues et Sciences Humaines (AMU ALLSH), Aix Marseille Université (AMU), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Muséum, Direction Archéologie d'Aix-en-Provence, Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: Aix-en-Provence, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, archéologie, fouille
Published: 2019

48. Early impact of agropastoral activities and climate on the littoral landscape of Corsica since mid-Holocene

Author: Kewin Pêche-Quilichini, Joseph Cesari, Maurice Reille, Franck Leandri, Valérie Andrieu-Ponel, François Demory, Yoann Poher, Marc-Antoine Vella, Marie-Madeleine Ottaviani-Spella, Matthieu Ghilardi, Doriane Delanghe, Milieux Environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols (METIS), École pratique des hautes études (EPHE)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sciences pour l'environnement (SPE), Université Pascal Paoli (UPP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire méditerranéen de préhistoire Europe-Afrique (LAMPEA), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pascal Paoli (UPP), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Topography, Atmospheric Science, Time Factors, Marsh, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Climate, Social Sciences, Plant Science, Forests, 01 natural sciences, Trees, Erica arborea, Holocene, Climatology, Islands, Quaternary Period, Multidisciplinary, geography.geographical_feature_category, Ecology, biology, Plant Anatomy, Eukaryota, Geology, Agriculture, Plants, Terrestrial Environments, Archaeology, [SDU.STU.ST]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Stratigraphy, [SDE]Environmental Sciences, Pollen, Medicine, France, Research Article, Valleys, Olive Trees, Geological Phenomena, 010506 paleontology, Vine, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Science, Pastoralism, Ecosystems, Rivers, [SDU.STU.GM]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geomorphology, Paleoclimatology, 0105 earth and related environmental sciences, Palynology, Landforms, geography, Holocene Epoch, Ecology and Environmental Sciences, Organisms, Biology and Life Sciences, Paleontology, Geomorphology, Geologic Time, Chalcolithic, 15. Life on land, biology.organism_classification, Olive trees, 13. Climate action, Earth Sciences, Cenozoic Era
Abstract: International audience; A multidisciplinary study (geomorphology, sedimentology and palynology) shows that the landscapes of the southwest coast of Corsica have been deeply modified by humans and the climate since 3000 BC. Significant and rapid landscape transformations are recorded between the Chalcolithic and the Middle Bronze Ages (3000–1300 BC). Several major (2.2 ka BC, 1.2 ka BC) and local (3000 BC) detrital events affected the Taravo Lower Valley in relation to global climatic changes and anthropic activities. The vegetation dynamics since 3000 BC show alternating phases of agriculture and abandonment until the complete disappearance of the original forest populations in the vicinity of the Canniccia Marshes. An early phase of Olea cultivation is recorded between 2900 and 2300 BC. Plant macro-remains indicate that cereals, vine and many species of Fabaceae were cultivated in the nearby of the archaeological sites during the middle to the late Chalcolithic Age. The event of 2.2 ka BC corresponds to an abandonment phase in the lower Taravo Valley. Pastoralism dominated agricultural activities between 2200 and 1700 BC. During Roman times, agriculture is characterized by olive and vine cultivation. A new peak of pastoralism and the cultivation of Castanea are noted during invasion times (500 to 1000 AD), showing that invasions didn’t disturb agricultural activities in the Taravo Valley. During the Pisa Period (end of the 9th C. to then end of 13th C. AD), pastoralism declined and vine and cereals were cultivated in the very nearby of the Canniccia Marshes. During the Genoa Period upwards (end of the 13th C. to 1769 AD), a decline in agriculture and a recrudescence of the forest (maquis and pine) are recorded, leading to the settlement of a present-day vegetal landscape dominated by an Erica arborea maquis.
Published: 2019

49. Lessons from the fish: a multi-species analysis reveals common processes underlying similar species-genetic diversity correlations

Author: Lisa Fourtune, Jérôme G. Prunier, Simon Blanchet, Géraldine Loot, Ivan Paz-Vinas, Station d'écologie théorique et expérimentale (SETE), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1, Evolution et Diversité Biologique (EDB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Population, Biodiversity, population, Aquatic Science, Biology, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, genetics, 14. Life underwater, education, biodiversity, education.field_of_study, Genetic diversity, Ecology, Species diversity, biology.organism_classification, rivers, Phoxinus, 030104 developmental biology, Barbatula, community, Alpha diversity, Species richness, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; Species-genetic diversity correlations (SGDCs) have been investigated over a large spectra of organisms, which has greatly improved our understanding of parallel processes potentially driving both species and genetic diversity. However, there are still few studies comparing SGDCs (and underlying processes) for multiple species sampled over a single landscape. Here, focusing on freshwater fish sampled across a large river basin (the Garonne-Dordogne river basin, France), we combined a multi-species approach and causal analyses to (i) assess and compare both -SGDCs and -SGDCs among species, and (ii) infer processes underlying -SGDCs and -SGDCs. Genetic, intraspecific diversity was assessed for four sympatric fish (Barbatula barbatula, Gobio occitaniae, Phoxinus phoxinus and Squalius cephalus) using microsatellite markers. Species diversity was quantified as species richness using electric fishing, and environmental conditions were thoroughly described for 81 sites. We found significant and moderate positive -SGDCs for all four fish species, whereas -SGDCs were weaker in strength and positively significant for two of the four species. Causal analyses identified two common variables (geographical isolation and area of available habitats) underlying the -SGDC relationships. Although weak, we found that -SGDC correlations related to a direct relationship between taxonomic and genomic differentiation, and to the common influence of the abiotic environment acting as a filter on both species and alleles. Our study shows that similar ecological and evolutionary processes related to environmental filtering, migration, drift and colonisation history act for explaining both species and genetic diversity of fish communities.
Published: 2016

50. Effect or organic amendments on soil enzymatic activities. Results of the 'Bioindicators' French program

Author: Riah, Wassila, Cheviron, Nathalie, Trap, Jean, Criquet , Steven, Peltre, Clement, Houot, Sabine, Legras, Marc, Vian, Jean-François, Bispo, Antonio, Grand, Cécile, Galsomies, Laurence, Pérès, Guenola, Laval, Karine, Trinsoutrot-Gattin, Isabelle, Mougin, Christian, Unité de recherche en agro-écologie des territoires (AGRI'TERR ), École supérieure d'ingénieurs et de techniciens pour l'agriculture (ESITPA), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Avignon Université (AU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (I.S.A.R.A.), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnement et Grandes Cultures (EGC), UR 0251 Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Physico-chimie et Ecotoxicologie des Sols d'agrosystèmes contaminés (PESSAC), Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (ISARA), ProdInra, Archive Ouverte, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Supérieur d'Agriculture Rhône-Alpes, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), and Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Avignon Université (AU)-Université de Provence - Aix-Marseille 1
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2018

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