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1. Clinical outcomes after treatment with direct antiviral agents: beyond the virological response in patients with previous HCV-related decompensated cirrhosis

Author: Pageaux, G. (Georges-Philippe), Nzinga, C. (Clovis Lusivika), Ganne, N. (Nathalie), Samuel, D. (Didier), Dorival, C. (Céline), Zoulim, F. (Fabien), Cagnot, C. (Carole), Decaens, T. (Thomas), Thabut, D. (Dominique), Asselah, T. (Tarik), Mathurin, P. (Philippe), Habersetzer, F. (Francois), Bronowicki, J. (Jean-Pierre), Guyader, D. (Dominique), Rosa, I. (Isabelle), Leroy, V. (Vincent), Chazouilleres, O. (Olivier), de Ledinghen, V. (Victor), Bourliere, M. (Marc), Causse, X. (Xavier), Cales, P. (Paul), Metivier, S. (Sophie), Loustaud-Ratti, V. (Véronique), Riachi, G. (Ghassan), Alric, L. (Laurent), Gelu-Simeon, M. (Moana), Minello, A. (Anne), Gournay, J. (Jérôme), Geist, C. (Claire), Tran, A. (Albert), Abergel, A. (Armand), Portal, I. (Isabelle), d'Alteroche, L. (Louis), Raffi, F. (François), Fontaine, H. (Hélène), Carrat, F. (Fabrice), Pol, S. (Stanislas), Baumert, Thomas F., Doffoel, M. (Michel), Mutter, C. (Catherine), Simo-Noumbissie, P. (Pauline), Razi, E. (Esma), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathogénèse et Traitement des Maladies du Foie, Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Saclay, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Physiopathologie des Maladies Inflammatoires de l'Intestin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle (IADI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), CHU Pontchaillou [Rennes], Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHI Créteil, Biomécanique cellulaire et respiratoire (BCR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Université d'Angers (UA), CHU Toulouse [Toulouse], Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), French ANRS CO22 Hepather Cohort: Delphine Bonnet, Virginie Payssan-Sicart, Chloe Pomes, François Bailly, Marjolaine Beaudoin, Dominique Giboz, Kerstin Hartig-Lavie, Marianne Maynard, Eric Billaud, David Boutoille, Morane Cavellec, Caroline Chevalier, Isabelle Hubert, Pierre Goepfert, Adrien Lannes, Françoise Lunel, Jérôme Boursier, Nathalie Boyer, Nathalie Giuily, Corinne Castelnau, Giovanna Scoazec, Aziza Chibah, Sylvie Keser, Karim Bonardi, Anaïs Vallet-Pichard, Philippe Sogni, Juliette Foucher, Jean-Baptiste Hiriart, Amandine Legendre, Faiza Chermak, Marie Irlès-Depé, Si Nafa Si Ahmed, Christelle Ansaldi, Nisserine Ben Amara, Valérie Oules, Jacqueline Dunette, Rodolphe Anty, Eve Gelsi, Régine Truchi, Elena Luckina, Nadia Messaoudi, Joseph Moussali, Barbara De Dieuleveult, Héloïse Goin, Damien Labarrière, Pascal Potier, Si Nafa Si Ahmed, Véronique Grando-Lemaire, Pierre Nahon, Séverine Brulé, Rym Monard, Caroline Jezequel, Audrey Brener, Anne Laligant, Aline Rabot, Isabelle Renard, Thomas F Baumert, Michel Dofföel, Catherine Mutter, Pauline Simo-Noumbissie, Esma Razi, Hélène Barraud, Mouni Bensenane, Abdelbasset Nani, Sarah Hassani-Nani, Marie-Albertine Bernard, Georges-Philippe Pageaux, Michael Bismuth, Ludovic Caillo, Stéphanie Faure, Marie Pierre Ripault, Christophe Bureau, Sarah Launay, Jean Marie Peron, Marie Angèle Robic, Léa Tarallo, Marine Faure, Bruno Froissart, Marie-Noelle Hilleret, Jean-Pierre Zarski, Odile Goria, Victorien Grard, Hélène Montialoux, Muriel François, Christian Ouedraogo, Christelle Pauleau, Anne Varault, Tony Andreani, Bénédicte Angoulevant, Azeline Chevance, Lawrence Serfaty, Teresa Antonini, Audrey Coilly, Jean-Charles Duclos Vallée, Mariagrazia Tateo, Corinne Bonny, Chanteranne Brigitte, Géraldine Lamblin, Léon Muti, Abdenour Babouri, Virginie Filipe, Camille Barrault, Laurent Costes, Hervé Hagège, Soraya Merbah, Paul Carrier, Maryline Debette-Gratien, Jérémie Jacques, Guillaume Lassailly, Florent Artu, Valérie Canva, Sébastien Dharancy, Alexandre Louvet, Marianne Latournerie, Marc Bardou, Thomas Mouillot, Yannick Bacq, Didier Barbereau, Charlotte Nicolas, Caroline Chevalier, Isabelle Archambeaud, Sarah Habes, Nisserine Ben Amara, Danièle Botta-Fridlund, Eric Saillard, Marie-Josée Lafrance, Carole Cagnot, Alpha Diallo, Lena Wadouachi, Ventzi Petrov-Sanchez, Douae Ammour, Loubna Ayour, Jaouad Benhida, Fabrice Carrat, Frederic Chau, Céline Dorival, Audrey Gilibert, Isabelle Goderel, Warda Hadi, Clovis Luzivika Nzinga, Grégory Pannetier, François Pinot, Odile Stahl, François Téloulé, Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), and Jonchère, Laurent
Subjects: Liver Cirrhosis, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Survival, Hepatocellular carcinoma, [SDV]Life Sciences [q-bio], Decompensated cirrhosis, Infectious and parasitic diseases, RC109-216, Hepacivirus, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, complications, drug therapy, Gastroenterology, Antiviral Agents, Virological response, Internal medicine, Medicine, Humans, In patient, business.industry, Hepatitis C virus, Research, Liver Neoplasms, Hepatitis C, [SDV] Life Sciences [q-bio], Sustained virological response, Infectious Diseases, Direst-acting antiviral agents, therapeutic use, business, After treatment
Abstract: Background In HCV-infected patients with advanced liver disease, the direct antiviral agents-associated clinical benefits remain debated. We compared the clinical outcome of patients with a previous history of decompensated cirrhosis following treatment or not with direct antiviral agents from the French ANRS CO22 HEPATHER cohort. Methods We identified HCV patients who had experienced an episode of decompensated cirrhosis. Study outcomes were all-cause mortality, liver-related or non-liver-related deaths, hepatocellular carcinoma, liver transplantation. Secondary study outcomes were sustained virological response and its clinical benefits. Results 559 patients met the identification criteria, of which 483 received direct antiviral agents and 76 remained untreated after inclusion in the cohort. The median follow-up time was 39.7 (IQR: 22.7–51) months. After adjustment for multivariate analysis, exposure to direct antiviral agents was associated with a decrease in all-cause mortality (HR 0.45, 95% CI 0.24–0.84, p = 0.01) and non-liver-related death (HR 0.26, 95% CI 0.08–0.82, p = 0.02), and was not associated with liver-related death, decrease in hepatocellular carcinoma and need for liver transplantation. The sustained virological response was 88%. According to adjusted multivariable analysis, sustained virological response achievement was associated with a decrease in all-cause mortality (HR 0.29, 95% CI 0.15–0.54, p Conclusion Treatment with direct antiviral agents is associated with reduced risk for mortality. The sustained virological response was 88%. Thus, direct antiviral agents treatment should be considered for any patient with HCV-related decompensated cirrhosis. Trial registration: ClinicalTrials.gov registry number: NCT01953458.
Published: 2022

2. Predictive Factors for Hepatocellular Carcinoma in Chronic Hepatitis B Using Structural Equation Modeling: A Prospective Cohort Study

Author: Jean-Pierre Bronowicki, Clovis Lusivika-Nzinga, Jean-Charles Duclos-Vallée, Ghassan Riachi, Anne Minello, Thomas Decaens, Louis d’Alteroche, Fabrice Carrat, Isabelle Portal, François Raffi, Fabien Zoulim, Sophie Metivier, Véronique Loustaud-Ratti, François Habersetzer, Jérôme Gournay, Olivier Chazouillères, Paul Calès, Victor de Ledinghen, Xavier Causse, Stanislas Pol, Céline Dorival, Isabelle Rosa, Dominique Larrey, Tarik Asselah, Marc Bourlière, Claire Geist, Nathanael Lapidus, Laurent Lam, Moana Gelu-Simeon, Laurent Alric, Vincent Leroy, Hélène Fontaine, Armand Abergel, Nathalie Ganne, Dominique Thabut, Philippe Mathurin, Albert Tran, Dominique Guyader, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CHU Saint-Antoine], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Centre Hépato-Biliaire [Hôpital Paul Brousse] (CHB), Hôpital Paul Brousse-Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, CRHU Nancy, Physiopathologie des Maladies Inflammatoires de l'Intestin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHI Créteil, Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service d'hépatologie [CHU Saint-Antoine], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), CHU Toulouse [Toulouse], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Immunité Innée - Innate Immunity, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], The ANRS CO22 HEPATHER cohort is sponsored and funded by INSERM‐ANRS and conducted in collaboration with Association Française pour l'étude du Foie (AFEF). The cohort received supports from ANR (Agence Nationale de la Recherche), DGS (Direction Générale de la Santé), MSD, Janssen, Gilead, Abbvie, BMS, and Roche., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CRSA], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHU Saint-Antoine], Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Jonchère, Laurent
Subjects: Male, Liver Cancer, medicine.medical_specialty, Hepatocarcinogenesis, Hepatitis B virus, Carcinoma, Hepatocellular, Epidemiology, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Liver transplantation, Sciences du Vivant [q-bio]/Cancer, medicine.disease_cause, Gastroenterology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Hepatitis B, Chronic, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Risk Factors, Internal medicine, medicine, Humans, Prospective Studies, Prospective cohort study, Aged, Hepatology, business.industry, Liver Neoplasms, Carcinoma, Hepatocellular, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030220 oncology & carcinogenesis, Hepatocellular carcinoma, Cohort, 030211 gastroenterology & hepatology, Metabolic syndrome, business, Liver cancer
Abstract: International audience; BACKGROUND and AIMS: The factors predicting hepatocellular carcinoma (HCC) occurrence in chronic hepatitis B need to be precisely known to improve its detection. We identified pathways and individual predictive factors associated with HCC in the ANRS CO22 HEPATHER cohort. METHODS: The study analyzed HBV-infected patients recruited at 32 French expert hepatology centers from August 6, 2012, to December 31, 2015. We excluded patients with chronic HCV, HDV and a history of HCC, decompensated cirrhosis or liver transplantation. Structural equation models were developed to characterize the causal pathways leading to HCC occurrence. The association between clinical characteristics (age, gender, body-mass index, liver fibrosis, alcohol consumption, smoking status, diabetes, hypertension, dyslipidemia, alpha-fetoprotein, HBV DNA levels, antiviral therapy) and incident HCC was quantified. RESULTS: Among the 4,489 patients included, 33 patients reported incident HCC. The median follow-up was 45.2 months. Age (β = 0.18 by decade, 95% CI 0.14-0.23), male gender (β = 0.23, 95% CI 0.18-0.29), metabolic syndrome (β = 0.28, 95% CI 0.22-0.33), alcohol consumption (β = 0.09, 95% CI 0.05-0.14) and HBV DNA (β = 0.25, 95% CI 0.17-0.34) had a significant and direct effect on the occurrence of advanced liver fibrosis. Liver fibrosis (β = 0.71, 95% CI 0.55-0.87) predicted, in turn, the occurrence of HCC. CONCLUSIONS: Liver fibrosis mediates the effects of age, gender, alcohol, metabolic syndrome and HBV DNA on the occurrence of HCC. Elderly men with chronic hepatitis B, risky alcohol use, advanced liver fibrosis, metabolic syndrome and high HBV DNA levels should be monitored closely to detect the development of HCC.
Published: 2021

3. Liver Disease and Coronavirus Disease 2019: From Pathogenesis to Clinical Care

Author: Thomas F. Baumert, Marc G. Ghany, Florian Wrensch, Antonio Saviano, univOAK, Archive ouverte, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg, National Institutes of Health [Bethesda] (NIH), Institut Universitaire de France (IUF), Ministère de l'Education nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (M.E.N.E.S.R.), and U19 AI123862
Subjects: Liver Cirrhosis, medicine.medical_specialty, Cirrhosis, Reviews, Disease, Review, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, medicine.disease_cause, Chronic liver disease, Global Health, Asymptomatic, Gastroenterology, 03 medical and health sciences, Liver disease, 0302 clinical medicine, Liver Function Tests, Internal medicine, medicine, Humans, 030304 developmental biology, Coronavirus, Liver injury, 0303 health sciences, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, medicine.diagnostic_test, Hepatology, business.industry, SARS-CoV-2, Acute-On-Chronic Liver Failure, COVID-19, medicine.disease, 3. Good health, Liver, Disease Progression, 030211 gastroenterology & hepatology, medicine.symptom, Liver function tests, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Infection with the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), a novel coronavirus that emerged in late 2019, is posing an unprecedented challenge to global health. Coronavirus disease 2019 (COVID-19), the clinical disease caused by SARS-CoV-2, has a variable presentation ranging from asymptomatic infection to life-threatening acute respiratory distress syndrome and multiorgan failure. Liver involvement is common during COVID-19 and exhibits a spectrum of clinical manifestations from asymptomatic elevations of liver function tests to hepatic decompensation. The presence of abnormal liver tests has been associated with a more severe presentation of COVID-19 disease and overall mortality. Although SARS-CoV-2 RNA has been detected in the liver of patients with COVID-19, it remains unclear whether SARS-CoV-2 productively infects and replicates in liver cells and has a direct liver-pathogenic effect. The cause of liver injury in COVID-19 can be attributed to multiple factors, including virus-induced systemic inflammation, hypoxia, hepatic congestion, and drug-induced liver disease. Among patients with cirrhosis, COVID-19 has been associated with hepatic decompensation and liver-related mortality. Additionally, COVID-19's impact on health care resources can adversely affect delivery of care and outcomes of patients with chronic liver disease. Understanding the underlying mechanisms of liver injury during COVID-19 will be important in the management of patients with COVID-19, especially those with advanced liver disease. This review summarizes our current knowledge of SARS-CoV-2 virus-host interactions in the liver as well the clinical impact of liver disease in COVID-19. journal article review 2020 Dec 17 2020 12 17 imported
Published: 2020

4. Tight junction proteins in gastrointestinal and liver disease

Author: Punita Dhawan, Mirjam B. Zeisel, Thomas F. Baumert, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Université de Strasbourg (UNISTRA), Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Nebraska Medical Center, University of Nebraska System-University of Nebraska System, Buffet Cancer Center [Omaha, NE, USA], VA Nebraska-Western Iowa Health Care System [Omaha, NE, USA], Pôle hépato-digestif [Strasbourg], Nouvel Hôpital Civil, Hospices Civils de Strasbourg-Institut Hospitalo-Universitaire de strasbourg, ARC, Paris and Institut Hospitalo-Universitaire, Strasbourg (TheraHCC IHUARC IHU201301187), the European Union (ERC-AdG-HEPCIR, ERC-PoC-2016-PRELICAN, EU H2020-667273-HEPCAR, U Strasbourg Foundation HEPKIN), the National Institutes of Health (NCI 1R21CA209940-01A1, NIAID R03AI131066, NIAID 5U19AI123862-02), the Institut Universitaire de France (IUF), the IdEx Program of the University of Strasbourg, the Impulsion Program of the IDEXLYON, BX002086 (VA merit), CA216746 (NIH/NCI) and a pilot project award from Fred and Pamela Buffet Cancer Center, which is funded by a National Cancer Institute Cancer Center Support Grant under award number P30 CA036727. This work has been published under the framework of the LABEX ANR-10-LABX-0028_HEPSYS and benefits from funding from the state managed by the French National Research Agency as part of the investments for the future programme., ANR-10-LABX-0028,HepSys,Functional genomics of viral hepatitis and liver disease(2010), European Project: 667273,H2020,H2020-PHC-2015-two-stage,HEP-CAR(2016), European Project: 671231,H2020,ERC-2014-ADG,HEPCIR(2016), European Project: 755460,PRELICAN, Zeisel, Mirjam, Mechanisms underlying hepatocellular carcinoma pathogenesis and impact of co-morbidities. - HEP-CAR - - H20202016-01-01 - 2019-12-31 - 667273 - VALID, and Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: hepatitis C virus, 0301 basic medicine, Carcinoma, Hepatocellular, Gastrointestinal Diseases, tight junction, colorectal cancer, Disease, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, Biology, Antiviral Agents, Article, Tight Junctions, Pathogenesis, 03 medical and health sciences, Liver disease, 0302 clinical medicine, medicine, Humans, Molecular Targeted Therapy, Receptor, Integral membrane protein, Gastrointestinal Neoplasms, colorectal, Regulation of gene expression, Tight Junction Proteins, Tight junction, Liver Diseases, Liver Neoplasms, Gastroenterology, Cancer, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, hepatocellular carcinoma, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, 3. Good health, Gastrointestinal Tract, Cell Transformation, Neoplastic, 030104 developmental biology, Liver, Claudins, Cancer research, claudin-1, 030211 gastroenterology & hepatology, hepatitis C
Abstract: Over the past two decades a growing body of evidence has demonstrated an important role of tight junction (TJ) proteins in the physiology and disease biology of gastrointestinal (GI) and liver disease. On one side, TJ proteins exert their functional role as integral proteins of TJs in forming barriers in the gut and the liver. Furthermore, TJ proteins can also be expressed outside TJs where they play important functional roles in signaling, trafficking and regulation of gene expression. A hallmark of TJ proteins in disease biology is their functional role in epithelial-to-mesenchymal transition. A causative role of TJ proteins has been established in the pathogenesis of colorectal cancer and gastric cancer. Among the best characterized roles of TJ proteins in liver disease biology is their function as cell entry receptors for hepatitis C virus – one of the most common causes of hepatocellular carcinoma. At the same time TJ proteins are emerging as targets for novel therapeutic approaches for GI and liver disease. Here we review our current knowledge of the role of TJ proteins in the pathogenesis of GI and liver disease biology and discuss their potential as therapeutic targets.
Published: 2018

5. Direct-acting antiviral agent–based regimen for HCV recurrence after combined liver-kidney transplantation: Results from the ANRS CO23 CUPILT study

Author: Jérôme Dumortier, A. Rohel, Jean-Charles Duclos-Vallée, Christophe Duvoux, Vincent Di Martino, Christine Silvain, Sébastien Dharancy, Danielle Botta-Fridlund, Sylvie Radenne, Maryline Debette-Gratien, Nassim Kamar, Audrey Coilly, Vincent Leroy, Georges-Philippe Pageaux, Armand Abergel, Louis d’Alteroche, Emilie Rossignol, Claire Francoz, Pauline Houssel-Debry, P. Perré, Filomena Conti, Claire Fougerou-Leurent, François Habersetzer, Camille Besch, Christophe Moreno, H. Montialoux, Valérie Canva, Albert Tran, Didier Samuel, Victor de Lédinghen, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hôpital Paul Brousse, Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Service d'Hépatologie, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Créteil, France., Hôpital Henri Mondor, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Gastroentérologie et hépatologie, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Hôpital Michallon, Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépato-gastro-entérologie, Hôpital Huriez-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hôpital Erasme [Bruxelles] (ULB), Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Département d'hépatologie, Service d'hépatologie, Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Hôpital de la Milétrie, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Chirurgie Digestive, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Chirurgie digestive et hépatobiliaire, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Pharmacologie des Immunosuppresseurs et de la Transplantation (PIST), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie et Nutrition [CHU Limoges], CHU Limoges, ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Jonchère, Laurent
Subjects: Graft Rejection, Male, Sofosbuvir, [SDV]Life Sciences [q-bio], medicine.medical_treatment, kidney transplantation/nephrology, Hepacivirus, 030230 surgery, Liver transplantation, medicine.disease_cause, 0302 clinical medicine, Recurrence, Risk Factors, Immunology and Allergy, liver disease: infectious, Pharmacology (medical), Prospective Studies, Prospective cohort study, education.field_of_study, Graft Survival, Middle Aged, Prognosis, Hepatitis C, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], kidney failure/injury, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Drug Therapy, Combination, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, medicine.drug, Adult, medicine.medical_specialty, infectious disease, Hepatitis C virus, Population, clinical research/practice, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, Internal medicine, medicine, Humans, Adverse effect, education, [SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Transplantation, business.industry, Kidney Transplantation, Liver Transplantation, Regimen, Immunology, infection and infectious agents - viral: hepatitis C, business, liver transplantation/hepatology, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; Hepatitis C virus (HCV) infection is associated with reduced patient survival following combined liver-kidney transplantation (LKT). The aim of this study was to assess the efficacy and safety of second-generation direct-acting antivirals (DAAs) in this difficult-to-treat population. The ANRS CO23 "Compassionate use of Protease Inhibitors in Viral C Liver Transplantation" (CUPILT) study is a prospective cohort including transplant recipients with recurrent HCV infection treated with DAAs. The present work focused on recipients with recurrent infection following LKT. The study population included 23 patients. All patients received at least one NS5B inhibitor (sofosbuvir) in their antiviral regimen an average of 90 months after LKT. Ninety-six percent of recipients achieved a sustained virological response (SVR) at week 12 (SVR12). In terms of tolerance, 39% of recipients presented with at least one serious adverse event. None of the patients experienced acute rejection during therapy and there were no deaths during follow-up. The glomerular filtration rate (GFR) decreased significantly from baseline to the end of therapy. However, this study did not show that the decline in GFR persisted over time or that it was directly related to DAAs. The DAA-based regimen is well tolerated with excellent results in terms of efficacy. It will become the gold standard for the treatment of recurrent HCV following LKT.
Published: 2017

6. Clinical outcomes in patients with chronic hepatitis C after direct-acting antiviral treatment a prospective cohort study

Author: Albert Tran, Victor de Ledinghen, Armand Abergel, Céline Dorival, Olivier Chazouillères, Louis d’Alteroche, Isabelle Rosa, Didier Samuel, Moana Gelu-Simeon, Laurent Alric, Vincent Leroy, Jérôme Gournay, François Habersetzer, Dominique Guyader, Stanislas Pol, Véronique Loustaud-Ratti, Ghassan Riachi, Jean-Pierre Bronowicki, Hélène Fontaine, Anne Minello, Christophe Hézode, Philippe Mathurin, Claire Geist, Nathalie Ganne, Mélanie Simony, Dominique Thabut, François Raffi, Xavier Causse, Patrick Marcellin, Sophie Metivier, Paul Calès, Isabelle Portal, Marc Bourlière, Dominique Larrey, Fabien Zoulim, Fabrice Carrat, Alpha Diallo, Georges Haour, Tarik Asselah, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Département d'hépatologie [CHU Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Biomécanique cellulaire et respiratoire (BCR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU), Physiopathologie des Maladies Inflammatoires de l'Intestin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Image Science for Interventional Techniques (ISIT), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHR Metz-Thionville], Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Equipe EPICAD (LNC - U1231), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Aix Marseille Université (AMU), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service d'hépatologie et de gastroentérologie [Hôpital Saint-Joseph - Marseille], Aix Marseille Université (AMU)-Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHU Toulouse [Toulouse], Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], CCSD, Accord Elsevier, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), and Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS)
Subjects: Adult, Liver Cirrhosis, Male, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Cirrhosis, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030204 cardiovascular system & hematology, Liver transplantation, Antiviral Agents, Gastroenterology, 03 medical and health sciences, Liver disease, Viewpoint, 0302 clinical medicine, Internal medicine, medicine, Humans, Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, Prospective cohort study, Aged, Proportional Hazards Models, business.industry, Incidence, Liver Neoplasms, Hazard ratio, General Medicine, Hepatitis C, Hepatitis C, Chronic, Middle Aged, Hepatology, medicine.disease, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Treatment Outcome, Hepatocellular carcinoma, Female, France, business
Abstract: Although direct-acting antivirals have been used extensively to treat patients with chronic hepatitis C virus (HCV) infection, their clinical effectiveness has not been well reported. We compared the incidence of death, hepatocellular carcinoma, and decompensated cirrhosis between patients treated with direct-acting antivirals and those untreated, in the French ANRS CO22 Hepather cohort.We did a prospective study in adult patients with chronic HCV infection enrolled from 32 expert hepatology centres in France. We excluded patients with chronic hepatitis B, those with a history of decompensated cirrhosis, hepatocellular carcinoma, or liver transplantation, and patients who were treated with interferon-ribavirin with or without first-generation protease inhibitors. Co-primary study outcomes were incidence of all-cause mortality, hepatocellular carcinoma, and decompensated cirrhosis. The association between direct-acting antivirals and these outcomes was quantified using time-dependent Cox proportional hazards models. This study is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT01953458.Between Aug 6, 2012, and Dec 31, 2015, 10 166 patients were eligible for the study. 9895 (97%) patients had available follow-up information and were included in analyses. Median follow-up was 33·4 months (IQR 24·0-40·7). Treatment with direct-acting antivirals was initiated during follow-up in 7344 patients, and 2551 patients remained untreated at the final follow-up visit. During follow-up, 218 patients died (129 treated, 89 untreated), 258 reported hepatocellular carcinoma (187 treated, 71 untreated), and 106 had decompensated cirrhosis (74 treated, 32 untreated). Exposure to direct-acting antivirals was associated with increased risk for hepatocellular carcinoma (unadjusted hazard ratio [HR] 2·77, 95% CI 2·07-3·71) and decompensated cirrhosis (3·83, 2·29-6·42). After adjustment for variables (age, sex, body-mass index, geographical origin, infection route, fibrosis score, HCV treatment-naive, HCV genotype, alcohol consumption, diabetes, arterial hypertension, biological variables, and model for end-stage liver disease score in patients with cirrhosis), exposure to direct-acting antivirals was associated with a decrease in all-cause mortality (adjusted HR 0·48, 95% CI 0·33-0·70) and hepatocellular carcinoma (0·66, 0·46-0·93), and was not associated with decompensated cirrhosis (1·14, 0·57-2·27).Treatment with direct-acting antivirals is associated with reduced risk for mortality and hepatocellular carcinoma and should be considered in all patients with chronic HCV infection.INSERM-ANRS (France Recherche NordSud Sida-HIV Hépatites), ANR (Agence Nationale de la Recherche), DGS (Direction Générale de la Santé), MSD, Janssen, Gilead, AbbVie, Bristol-Myers Squibb, and Roche.
Published: 2019

7. Impact of Cytomegalovirus Infection on the Outcome of Patients With Cirrhosis

Author: Faivre, Morgan, Cottet, Vanessa, Bour, Jean-Baptiste, Richou, Carine, Valmary-Degano, Séverine, Thiefin, Gerard, Andreoletti, Laurent, Geist, Claire, Schvoerer, Evelyne, Malve, Brice, Habersetzer, François, Fafi-Kremer, Samira, Binquet, Christine, Jouve, Jean-Louis, Bronowicki, Jean-Pierre, Doffoël, Michel, Hillon, Patrick, Herbein, Georges, Monnet, Elisabeth, Di Martino, Vincent, Laboratoire de Virologie Médicale et Moléculaire - EA 4684 (CardioVir), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Service d'Hépatologie [CHRU Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques (CIC-EC), Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de sérologie-virologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Service d'hépatogastroentérologie (CHU Reims), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Unité de virologie médicale [Reims], Hôpital Robert Debré, Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHR Metz-Thionville], Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour les Matériaux et l'Environnement (LCPME), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Virologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Service d'Hépato-Gastro-Entérologie (CHU de Dijon), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Service d’Hépatogastroentérologie, NHC, CHU de Strasbourg, Agents pathogènes et inflammation - UFC (EA 4266) (API), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), and Service d'Anatomie pathologique [CHRU Besançon]
Subjects: [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Clinical aspects, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Cirrhosis and its complications, digestive system diseases, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; Goals: The aims of this study were to evaluate whether cytomegalovirus (CMV) infection is associated with hepatocellular carcinoma (HCC) and liver-related mortality in cirrhotic patients.Background: In cirrhotic patients, the determinants of HCC and liver-related death are imperfectly known. CMV infection, by its prooncogenic and proinflammatory properties, may favor both the development of HCC and deleterious systemic inflammation.Study: In the 1178 patients included between June 2008 and December 2012 in the CIrrhose et Risque de Carcinome Hépatocellulaire dans le grand-Est (CIRCE) study, a French multicenter case-control study designed to identify risk factors of HCC among cirrhotic patients, we identified 432 patients with interpretable CMV serological status at baseline. They included 159 cases with HCC and 273 controls. We measured factors associated with HCC at baseline and subsequent HCC in controls, and predictors of overall and liver-related death in the whole study population.Results: During a median follow-up of 31 months, 25 cases of HCC developed in controls, and 209 deaths (163 liver-related) were recorded. There were 247 (57.2%) CMV-seropositive patients. CMV seropositivity was not associated with more frequent HCC at baseline or during follow-up, but among CMV-positive patients with HCC, the proportion of multinodular, infiltrative, or metastatic tumors at diagnosis was higher (73.8% vs. 57.3%; P=0.029), inducing higher mortality (74% vs. 52% at 3 years; P=0.004). By Cox-regression adjusted for age, gender, Model for End-stage Liver Disease (MELD) score, HCC at baseline, and diabetes, CMV seropositivity independently predicted all-cause (hazard ratio=1.45; 95% confidence interval, 1.08-1.94; P=0.013) and liver-related mortality (hazard ratio=1.56; 95% confidence interval, 1.04-2.30; P=0.031).Conclusions: In this preliminary study, CMV-seropositive cirrhotic patients were at higher risk of liver-related death caused by more aggressive HCCs or severe cirrhosis complications. These findings warrant confirmation.
Published: 2019

8. Functional microRNA screen uncovers O-linked N-acetylglucosamine transferase as a host factor modulating hepatitis C virus morphogenesis and infectivity

Author: Hervé Lerat, Jean-Christophe Meunier, Sarah C. Durand, Thomas Baumert, Mirjam B. Zeisel, Laurent Brino, Amélie Weiss, Frank Jühling, Béatrice Chane-Woon-Ming, Catherine Fauvelle, Sophie Pernot, Marion Mercey, Anne Bull, Sébastien Pfeffer, Katharina Herzog, Wolfgang Raffelsberger, Simonetta Bandiera, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques (IVH), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Morphogénèse et antigénicité du VIH et du virus des Hépatites (MAVIVH - U1259 Inserm - CHRU Tours ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génomique d'Evry (IG), Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Architecture et Réactivité de l'ARN (ARN), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Interaction virus-hôte et maladies du foie, MATHELIN, Sandra, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Maladies Virales et Hépatiques, inserm U1110, University of Leipzig (Bioinformatics Group), Universität Leipzig [Leipzig], Virus, pseudo-virus: Morphogénèse et Antigénicité, Université de Tours-EA3856, Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut für Physik and CINSaT, Universität Kassel, and Universität Kassel [Kassel]
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], Cell, molecular mechanisms, Hepacivirus, medicine.disease_cause, Liver disease, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Gene expression, Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie cellulaire, Morphogenesis, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Host factor, Infectivity, [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, 0303 health sciences, Virulence, Gastroenterology, virus diseases, 3. Good health, Cell biology, Up-Regulation, medicine.anatomical_structure, Gene Knockdown Techniques, Host-Pathogen Interactions, Hcv, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], 030211 gastroenterology & hepatology, Hepatitis C virus, Biology, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, N-Acetylglucosaminyltransferases, Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire, Article, 03 medical and health sciences, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], microRNA, medicine, hepatocyte, Humans, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, 030304 developmental biology, Life Cycle Stages, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, MicroRNAs, Gene Expression Regulation, Hepatocytes, hepatitis C, Genome-Wide Association Study
Abstract: ObjectiveInfection of human hepatocytes by the hepatitis C virus (HCV) is a multistep process involving both viral and host factors. microRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs that post-transcriptionally regulate gene expression. Given that miRNAs were indicated to regulate between 30% and 75% of all human genes, we aimed to investigate the functional and regulatory role of miRNAs for the HCV life cycle.DesignTo systematically reveal human miRNAs affecting the HCV life cycle, we performed a two-step functional high-throughput miRNA mimic screen in Huh7.5.1 cells infected with recombinant cell culture-derived HCV. miRNA targeting was then assessed using a combination of computational and functional approaches.ResultsWe uncovered miR-501-3p and miR-619-3p as novel modulators of HCV assembly/release. We discovered that these miRNAs regulate O-linked N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) transferase (OGT) protein expression and identified OGT and O-GlcNAcylation as regulators of HCV morphogenesis and infectivity. Furthermore, increased OGT expression in patient-derived liver tissue was associated with HCV-induced liver disease and cancer.ConclusionmiR-501-3p and miR-619-3p and their target OGT are previously undiscovered regulatory host factors for HCV assembly and infectivity. In addition to its effect on HCV morphogenesis, OGT may play a role in HCV-induced liver disease and hepatocarcinogenesis.
Published: 2019

9. Safety of sofosbuvir-based regimens after liver transplantation longitudinal assessment of renal function in the prospective ANRS CO23 CUPILT study

Author: Rodolphe Anty, Alpha Diallo, Vincent Leroy, L. D’Alteroche, Jean Charles Duclos-Vallée, Claire Fougerou-Leurent, Christophe Duvoux, Vincent L.M. Esnault, P. Perré, François Habersetzer, Audrey Coilly, Aurelie Veislinger, Nassim Kamar, V. Di Martino, Emilie Rossignol, Valérie Canva, Maryline Debette-Gratien, Carole Cagnot, François Durand, Didier Samuel, Clémence M. Canivet, Danielle Botta-Fridlund, H. Montialoux, V. de Ledinghen, Christine Silvain, Camille Besch, Jérôme Dumortier, Albert Tran, Guillaume Favre, Pauline Houssel-Debry, Georges Philippe Pageaux, S. Radenne, H. Danjou, Sébastien Dharancy, Fabio Conti, Pascal Lebray, Armando Abergel, Christophe Moreno, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Laboratoire de PhysioMédecine Moléculaire (LP2M), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Grenoble, Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), CHU Toulouse [Toulouse], Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille, Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Strasbourg, CHU Marseille, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, CHU Limoges, ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Hôpital Lapeyronie [Montpellier] (CHU), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)
Subjects: medicine.medical_specialty, Sofosbuvir, Hepatitis C virus, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], Urology, Renal function, Hepacivirus, 030230 surgery, Liver transplantation, medicine.disease_cause, Kidney, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Recurrence, Ribavirin, Medicine, Humans, Pharmacology (medical), Longitudinal Studies, Prospective Studies, Renal Insufficiency, Chronic, Aged, Creatinine, Hepatology, business.industry, Gastroenterology, Middle Aged, Hepatitis C, 3. Good health, Liver Transplantation, medicine.anatomical_structure, chemistry, Cohort, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, business, medicine.drug, Glomerular Filtration Rate
Abstract: International audience; Background In liver transplant recipients with hepatitis C virus recurrence, there is concern about renal safety of sofosbuvir-based regimens. Changes in serum creatinine or in the estimated glomerular filtration rate (eGFR) under treatment are used to look for possible renal toxicity. However, serum creatinine and eGFR are highly variable. Aim To analyse renal function trajectory with numerous assays of serum creatinine over a long period of time. Methods In a multicentre cohort of 139 patients, the eGFR was obtained from serum creatinine using the Chronic Kidney Disease-Epidemiology Collaboration (CKD-EPI) equation. Slopes of eGFR were defined as a change in eGFR during a period divided by time. Pre-treatment, on-treatment and post-treatment periods were 9 months, 3-9 months and 4.5 months. Interactions between eGFR slopes and the pre-treatment eGFR, use of ribavirin or mycophenolate mofetil, and stage of fibrosis were addressed. On-treatment eGFR slopes were separated in tertiles. Pre- and post-treatment eGFR slopes were compared globally and according to tertiles. Results The post-treatment eGFR slope was significantly better than pre-treatment eGFR slope (+0.18 (IQR -0.76 to +1.32) vs -0.11 (IQR -1.01 to +0.73) mL/min/1.73 m(2)/month, P=0.03) independently of the pre-treatment eGFR (P=0.99), ribavirin administration (P=0.26), mycophenolate mofetil administration (P=0.51) and stage of fibrosis (F3 and F4 vs lower stages, P=0.18; F4 vs lower stages, P=0.08; F4 Child-Pugh B and C vs lower stages, P=0.38). Tertiles of on-treatment eGFR slopes were -1.71 (IQR -2.54 to -1.48), -0.78 (IQR -1.03 to -0.36) and +0.75 (IQR +0.28 to +1.47) mL/min/1.73 m(2)/month. Pre- and post-treatment eGFR slopes were not significantly different according to tertiles (respectively, P=0.34, 0.08, 0.73). Conclusion The eGFR varies during treatment and gives a confusing picture of the renal safety of sofosbuvir-based regimens. In contrast, longitudinal assessment of the eGFR shows a rising trajectory over longer time, meaning that these therapies are safe for the kidneys in our cohort of liver transplant recipients.
Published: 2018

10. 12 weeks of a Ribavirin-free Sofosbuvir and NS5A inhibitor regimen is enough to treat recurrence of hepatitis C after liver transplantation

Author: Houssel-Debry, Pauline, Coilly, Audrey, Fougerou-Leurent, Claire, Jezequel, Caroline, Duvoux, Christophe, De Ledinghen, Victor, Radenne, Sylvie, Kamar, Nassim, Leroy, Vincent, Di Martino, Vincent, D'Alteroche, Louis, Canva, Valérie, Conti, Filomena, Dumortier, Jerome, Montialoux, Hélène, Lebray, Pascal, Botta-Fridlund, Danielle, Tran, Albert, Moreno, Christophe, Silvain, Christine, Besch, Camille, perre, philippe, Francoz, Claire, Abergel, Armando, Habersetzer, François, Debette-Gratien, Maryline, Cagnot, Carole, Diallo, Alpha, Chevaliez, Stéphane, Rossignol, Emilie, Veislinger, Aurelie, Duclos-Vallee, Jean-Charles, Pageaux, Georges-Philippe, CHU Pontchaillou [Rennes], Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Paul Brousse, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Henri Mondor, Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépatologie [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Grenoble, Service d'hépatologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Université libre de Bruxelles (ULB), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Clermont-Ferrand, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Service d'Hépato-Gastro-Entérologie et Nutrition [CHU Limoges], CHU Limoges, ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Centre de physiopathologie de Toulouse Purpan ( CPTP ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Jean Minjoz-Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours ( CHRU TOURS ), Université Libre de Bruxelles [Bruxelles] ( ULB ), CHU de Poitiers, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, ANRS, ANRS (France Recherche Nord & Sud Sida-HIV Hépatites), Paris, France, Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Henri Mondor [Créteil], Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), and Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS)
Subjects: treatment duration, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], viruses, ANRS CO23 CUPILT cohort, [SDV]Life Sciences [q-bio], Ribavirin use, virus diseases, Direct-acting antiviral agents, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, digestive system diseases
Abstract: International audience; Sofosbuvir (SOF) combined with NS5A inhibitors has demonstrated its efficacy in treating a recurrence of HCV after liver transplantation. However, the duration of treatment and the need for ribavirin (RBV) remain unclear in this population. Our aim was to determine whether liver transplant recipients could be treated with an SOF+NS5A inhibitor-based regimen without RBV for 12 weeks after liver transplantation (LT).
Published: 2018

11. Hepatitis B Virus Evasion From Cyclic Guanosine Monophosphate-Adenosine Monophosphate Synthase Sensing in Human Hepatocytes

Author: Julie Lucifora, Charlotte Bach, David Durantel, Eloi R. Verrier, Ivan Hirsch, Mirjam B. Zeisel, Seung-Ae Yim, Nicolas Manel, Nathalie Pochet, Laurent Mailly, Sarah C. Durand, Thomas F. Baumert, Patrick Pessaux, Houssein El Saghire, Laura Heydmann, Vincent Turon-Lagot, Catherine Schuster, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pôle hépato-digestif [Strasbourg], Nouvel Hôpital Civil, Hospices Civils de Strasbourg-Institut Hospitalo-Universitaire de strasbourg, Immunité et cancer (U932), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de recherche Paris, sciences et lettres [Institut Curie, Paris], Institut Curie [Paris], Department of Genetics and Microbiology [Prague, Czech Republic] (Faculty of Science), Charles University [Prague] (CU), Department of Neurology [Cambridge, MA, USA] (Ann Romney Center for Neurologic Diseases), Harvard Medical School [Boston] (HMS)-Brigham and Women's Hospital [Boston], Cell Circuits Program [Cambridge, MA, USA], Broad Institute of MIT and Harvard (BROAD INSTITUTE), Harvard Medical School [Boston] (HMS)-Massachusetts Institute of Technology (MIT)-Massachusetts General Hospital [Boston]-Harvard Medical School [Boston] (HMS)-Massachusetts Institute of Technology (MIT)-Massachusetts General Hospital [Boston], Interaction virus-hôte et maladies du foie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), This work was supported by the European Union (ERC-AdG-2014-671231- HEPCIR, EU H2020-667273-HEPCAR, EU-InfectEra HepBccc), the National Institute of Health (NIAID 1R03AI131066-01A1, NCI R21 CA209940 and NIAID U19AI123862), the Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hepatites Virales (ANRS, 2015/1099), the Fondation ARC pour la Recherche sur le Cancer (TheraHCC IHUARC IHU201301187), GACR 17-15422S, and a PhD fellowship of the Région Alsace, France. The work has been published under the framework of the LABEX ANR-10-LABX-0028_HEPSYS and benefits from funding from the state managed by the French National Research Agency as part of the Investments for the future program. E.R.V. was supported by an ANRS fellowship (ECTZ50121)., ANR-10-IDEX-0002,UNISTRA,Par-delà les frontières, l'Université de Strasbourg(2010), Baumert, Thomas F., Initiative d'excellence - Par-delà les frontières, l'Université de Strasbourg - - UNISTRA2010 - ANR-10-IDEX-0002 - IDEX - VALID, and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Blotting, Western, Cell Culture Techniques, Guanosine, Biology, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, Hepatocytes/metabolism/*virology, medicine.disease_cause, liver, Real-Time Polymerase Chain Reaction, Virus, Hepatitis B/immunology/*physiopathology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Mice, Cyclic guanosine monophosphate–adenosine monophosphate, medicine, capsid, DNA, Viral/immunology, Hepatitis B virus/*pathogenicity, Humans, innate immunity, Hepatitis B virus, Innate immune system, Hepatology, Effector, In Situ Hybridization, Fluorescence/methods, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Virology, antiviral, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, 3. Good health, Nucleotides, Cyclic/*metabolism, 030104 developmental biology, Real-time polymerase chain reaction, chemistry, Cell culture, Host-Pathogen Interactions, Immune Evasion/immunology/*physiology, recognition, Gene Expression Profiling/methods
Abstract: International audience; Chronic hepatitis B virus (HBV) infection is a major cause of chronic liver disease and cancer worldwide. The mechanisms of viral genome sensing and the evasion of innate immune responses by HBV infection are still poorly understood. Recently, the cyclic guanosine monophosphate-adenosine monophosphate synthase (cGAS) was identified as a DNA sensor. In this study, we investigated the functional role of cGAS in sensing HBV infection and elucidate the mechanisms of viral evasion. We performed functional studies including loss-of-function and gain-of-function experiments combined with cGAS effector gene expression profiling in an infectious cell culture model, primary human hepatocytes, and HBV-infected human liver chimeric mice. Here, we show that cGAS is expressed in the human liver, primary human hepatocytes, and human liver chimeric mice. While naked relaxed-circular HBV DNA is sensed in a cGAS-dependent manner in hepatoma cell lines and primary human hepatocytes, host cell recognition of viral nucleic acids is abolished during HBV infection, suggesting escape from sensing, likely during packaging of the genome into the viral capsid. While the hepatocyte cGAS pathway is functionally active, as shown by reduction of viral covalently closed circular DNA levels in gain-of-function studies, HBV infection suppressed cGAS expression and function in cell culture models and humanized mice. Conclusion: HBV exploits multiple strategies to evade sensing and antiviral activity of cGAS and its effector pathways.
Published: 2018

12. A Global Interactome Map of the Dengue Virus NS1 Identifies Virus Restriction and Dependency Host Factors

Author: Mohamed Lamine Hafirassou, Laurent Meertens, Claudia Umaña-Diaz, Athena Labeau, Ophelie Dejarnac, Lucie Bonnet-Madin, Beate M. Kümmerer, Constance Delaugerre, Philippe Roingeard, Pierre-Olivier Vidalain, Ali Amara, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, INSERM U944 Laboratoire de Pathologie et Virologie Moléculaire, Laboratoire de Pathologie et Virologie Moléculaire, Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathologie cellulaire : aspects moléculaires et viraux / Pathologie et Virologie Moléculaire, Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute of Virology, University of Bonn Medical Centre, Génétique et Ecologie des Virus, Génétique des Virus et Pathogénèse des Maladies Virales, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Virus, pseudo-virus: Morphogénèse et Antigénicité, Université de Tours-EA3856, Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT - UMR 8601), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Tours (UT)-EA3856, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Collège de France (CdF)-PSL Research University (PSL), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Glycosylation, viruses, [SDV]Life Sciences [q-bio], Viral Nonstructural Proteins, Receptors for Activated C Kinase, Virus Replication, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Dengue, 03 medical and health sciences, Humans, Protein Interaction Maps, RNA, Small Interfering, lcsh:QH301-705.5, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, 030306 microbiology, virus diseases, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, Dengue Virus, 3. Good health, Neoplasm Proteins, HEK293 Cells, lcsh:Biology (General), Multiprotein Complexes, Host-Pathogen Interactions, HeLa Cells
Abstract: Dengue virus (DENV) infections cause the most prevalent mosquito-borne viral disease worldwide, for which no therapies are available. DENV encodes seven non-structural (NS) proteins that co-assemble and recruit poorly characterized host factors to form the DENV replication complex essential for viral infection. Here, we provide a global proteomic analysis of the human host factors that interact with the DENV NS1 protein. Combined with a functional RNAi screen, this study reveals a comprehensive network of host cellular processes involved in DENV infection and identifies DENV host restriction and dependency factors. We highlight an important role of RACK1 and the chaperonin TRiC (CCT) and oligosaccharyltransferase (OST) complexes during DENV replication. We further show that the OST complex mediates NS1 and NS4B glycosylation, and pharmacological inhibition of its N-glycosylation function strongly impairs DENV infection. In conclusion, our study provides a global interactome of the DENV NS1 and identifies host factors targetable for antiviral therapies.
Published: 2018

13. Carcinome hépatocellulaire après éradication du virus de l’hépatite C par les antiviraux à action directe

Author: Nourdine, Hamdane, Thomas F, Baumert, Mirjam B, Zeisel, Zeisel, Mirjam, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Université de Strasbourg (UNISTRA), Pôle hépato-digestif, Nouvel Hôpital Civil, Hospices Civils de Strasbourg-Institut Hospitalo-Universitaire de strasbourg, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Carcinoma, Hepatocellular, Risk Factors, Incidence, Liver Neoplasms, Humans, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Hepacivirus, Hepatitis C, Chronic, Antiviral Agents, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology
Abstract: International audience;
Published: 2018

14. A targeted functional RNA interference screen uncovers glypican 5 as an entry factor for hepatitis B and D viruses

Author: Eloi R. Verrier, Tom Croonenborghs, Georges Abou-Jaoudé, Daniel J. Felmlee, Nathalie Pochet, Amélie Weiss, Sarah C. Durand, François Habersetzer, Mickael Renaud, Catherine Schuster, Charlotte Bach, Che C. Colpitts, Thomas F. Baumert, Magali Soumillon, Camille Sureau, David Durantel, Laura Heydmann, Mirjam B. Zeisel, Laurent Brino, Michael Nassal, María Mora González López Ledesma, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University Hospital Freiburg, Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS), Service d’Hépatogastroentérologie, NHC, CHU de Strasbourg, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques (IVH), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Pillet, Lauriane
Subjects: 0301 basic medicine, RNA, Untranslated, Glypican, Culture, Growth, medicine.disease_cause, Hepatitis, Liver disease, Belgium, Germany, pathogenicity, Cells, Cultured, Cultured, Untranslated, Genomics, Hepatitis B, 3. Good health, Liver, Hepatocellular carcinoma, Viruses, Medicine, RNA Interference, France, Hepatitis Delta Virus, Infection, Cell Division, Hepatitis B virus, Cells, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Biology, Hepatitis B virus PRE beta, Virus, 03 medical and health sciences, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Glypicans, Viral entry, medicine, Humans, therapy, Hepatology, Carcinoma, Proteins, Virus Internalization, medicine.disease, Virology, 030104 developmental biology, physiology, Hepatocytes, RNA
Abstract: Chronic hepatitis B and D infections are major causes of liver disease and hepatocellular carcinoma worldwide. Efficient therapeutic approaches for cure are absent. Sharing the same envelope proteins, hepatitis B virus and hepatitis delta virus use the sodium/taurocholate cotransporting polypeptide (a bile acid transporter) as a receptor to enter hepatocytes. However, the detailed mechanisms of the viral entry process are still poorly understood. Here, we established a high-throughput infectious cell culture model enabling functional genomics of hepatitis delta virus entry and infection. Using a targeted RNA interference entry screen, we identified glypican 5 as a common host cell entry factor for hepatitis B and delta viruses. Conclusion: These findings advance our understanding of virus cell entry and open new avenues for curative therapies. As glypicans have been shown to play a role in the control of cell division and growth regulation, virus–glypican 5 interactions may also play a role in the pathogenesis of virus-induced liver disease and cancer. (Hepatology 2016;63:35–48)
Published: 2015

15. Integrative analysis of CD8 T-cell responses in the context of adaptive immunity to acute Hepatitis C virus infection

Author: Wolski, David, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Université de Strasbourg, Thomas Baumert, Georg Lauer, and STAR, ABES
Subjects: [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, T cell exhaustion, CD4 help, Hepatitis C virus, CD8 T cells, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Lymphocytes T CD8, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Régulation Transcriptionnelle, Transcriptional regulation, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Lymphocytes T CD4 auxiliaires, Dysfonction des Lymphocytes T, Virus de l’hépatite C
Abstract: Infection with Hepatitis C virus typically establishes chronic infection, but about 20% of subjects clear HCV spontaneously. There is strong evidence that functional CD8 T cells are critical for HCV control. In the first part of my thesis we identified a new marker for exhausted T cells, CD39, that we showed to be upregulated in chronic HCV infection, progressive HIV infection and in chronic infection with LCMV. In the second part we used an integrative analysis approach to study transcriptional regulation of CD8 T cells in the acute phase of HCV infection with different outcomes. We found early transcriptional changes in key immune effector pathways as well as metabolic and nucleosomal processes in CD8 T cells from patients with persistent infection. Some of these changes track with a lack of HCV-specific CD4 T cells exhibit associations with subject age and sex. Our findings suggest that CD8 T cell exhaustion in HCV infection is linked to early gene regulatory events that are not only amplified by chronic inflammation and a lack of CD4 help, but might also be influenced by disease-relevant host factors such as patient age and sex., Le virus de l'hépatite C (VHC) établit généralement une infection chronique. Néanmoins, environ 20% des sujets vont résoudre spontanément l’infection. Il existe des preuves solides que les cellules T CD8 sont essentielles au contrôle du VHC. Dans la première partie de ma thèse, nous avons identifié un nouveau marqueur de la dysfonction des lymphocytes T, CD39, comme étant régulé positivement au cours de l'infection chronique par le VHC, le VIH et dans un modèle d’infection chronique par LCMV. Dans une deuxième partie, nous avons utilisé une approche d'analyse intégrative pour étudier la régulation transcriptionnelle des cellules T CD8 au cours de la phase aiguë de l'infection par le VHC. Nous avons identifié des changements précoces dans la régulation transcriptionelle d’importantes fonctions effectrices, de voies métaboliques et du nucléosome par les cellules T CD8 des patients souffrant d'une infection persistante. Certains de ces changements corrèlent avec l’absence des cellules T CD4 spécifiques du VHC et sont associés avec l’âge et le sexe du sujet infecté. Nos résultats suggèrent que la dysfonction des lymphocytes T CD8 au cours de l'infection par le VHC est liée à des événements précoces dans la régulation des gènes, non seulement amplifiés par une inflammation chronique et une absence des cellules T CD4 auxiliaires, mais qui pourraient également être influencés par des facteurs de l’hôte tels que l’âge et le sexe.
Published: 2017

16. Clinical development of hepatitis C virus host-targeting agents

Author: Thomas F. Baumert, Mirjam B. Zeisel, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Université de Strasbourg (UNISTRA), Pôle hépato-digestif, Nouvel Hôpital Civil, Hospices Civils de Strasbourg-Institut Hospitalo-Universitaire de strasbourg, Grant support from the European Union, NIH, the French National Agency for Research on AIDS and Viral Hepatitis, the French Research Agency, and the French Foundation for Cancer Research (ARC)., and Zeisel, Mirjam
Subjects: 0301 basic medicine, biology, business.industry, Host (biology), Hepatitis C virus, Hepacivirus, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, General Medicine, Hepatitis C, medicine.disease, medicine.disease_cause, biology.organism_classification, Virology, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Article, 03 medical and health sciences, 030104 developmental biology, medicine, business, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience;
Published: 2017

17. Safety and efficacy of daclatasvir-sofosbuvir in HCV genotype 1-mono-infected patients

Author: Dominique Thabut, Eric Billaud, Alpha Diallo, Sandy Lucier, Valérie Bourcier, Christophe Hézode, Fabien Zoulim, Isabelle Rosa, François Habersetzer, Patrick Marcellin, Ghassan Riachi, Anne Minello, Jérôme Gournay, Jean-Pierre Bronowicki, Eric Saillard, Claire Geist, Hélène Fontaine, Isabelle Fouchard-Hubert, Céline Dorival, Marc Bourlière, Dominique Larrey, Dominique Guyader, Sophie Metivier, Louis d’Alteroche, Albert Tran, Laurent Alric, Fabrice Carrat, Xavier Causse, Didier Samuel, Philippe Mathurin, Stanislas Pol, Victor de Ledinghen, Jean-Pierre Zarski, Olivier Chazouillères, Ventzislava Petrov-Sanchez, Véronique Loustaud-Ratti, Service d'hépatologie médicale [CHU Cochin], CHU Cochin [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Service d'hépato-gastro-entérologie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Département de la recherche clinique et du développement, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique ( iPLESP ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), AP HP, Departement Gastroenterologie, Centre Hospitalier Universitaire Henri Mondor, CHU Saint-Eloi, Cellules souches normales et cancéreuses, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Montpellier ( UM ), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux ( NGERE ), Université de Lorraine ( UL ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de Recherche sur le Cancer de Lyon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre méditérannéen de médecine moléculaire ( C3M ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Gastro-entérologie - Hépatologie [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Département d'hépato-gastroentérologie, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Centre hépato-biliaire - CHB [Paul Brousse, Paris], Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Foie, métabolismes et cancer, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service d’Hépatologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Institut de Recherche en Santé Digestive - IRSD [Purpan, Toulouse], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse ( ENVT ), Institut National Polytechnique de Toulouse ( INPT ) -Institut National Polytechnique de Toulouse ( INPT ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine ( CR Saint-Antoine ), Service d'hépatologie [Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [APHP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Service d'Hépato-Gastroentérologie [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Service d'Hépato-gastroentérologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier, Hôpital Huriez-Université de Lille, Pharmacologie des Immunosuppresseurs et de la Transplantation ( PIST ), Université de Limoges ( UNILIM ) -CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST FR CNRS 3503 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie et Nutrition [CHU Limoges], CHU Limoges, CHU Trousseau [Tours], CHRU Tours, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers ( CHU Angers ), PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ), Laboratoire HIFIH, Université d'Angers ( UA ), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Hépato-gastro-entérologie et oncologie digestive, Centre Hospitalier Régional d'Orléans ( CHR ), Centre hospitalier régional Metz-Thionville ( CHR Metz-Thionville ), CHI Créteil, Hôpital Hôtel-Dieu [Paris]-Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Service des maladies infectieuses [Nantes], Recherches fondamentales, cliniques et thérapeutiques sur les hépatites virales, ANRS, INSERM-ANRS (France REcherche Nord&sud Sida-vih Hépatites), France, ANR (Agence Nationale de la Recherche), France, DGS (Direction Générale de la Santé), France and MSD, United States, Janssen, United States, Gilead, United States, Abbvie, United States, BMS, United States, Roche, Switzerland., Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Nutrition et cerveau (U1213, U855), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Molecular virology and immunology – Physiopathology and therapeutic of chronic viral hepatitis (Team 18) (Inserm U955), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service d'hépato-gastro-entérologie [APHP Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Pôle Maladies de l'appareil digestif [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Grenoble-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Hôpital Beaujon [AP-HP], Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Service d'hépatologie [CHU Saint-Antoine], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Pharmacologie des Immunosuppresseurs et de la Transplantation (PIST), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Hôtel-Dieu de Nantes, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Jonchère, Laurent, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Service Hépato-gastro-entérologie et oncologie digestive [CHR Orléans], Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Université Grenoble Alpes (UGA)-CHU Grenoble, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, CHU Cochin [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AP-HP Hôpital Paul Brousse, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AP-HP Hôpital Paul Brousse, Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), CHU Saint-Antoine [APHP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Jean Verdier [Bondy], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHR), and Hôpital Hôtel-Dieu [Paris]-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)
Subjects: Male, Pyrrolidines, Sofosbuvir, Sustained Virologic Response, Hepacivirus, Direct antiviral agents, medicine.disease_cause, Chronic hepatitis C, Gastroenterology, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Medicine, 030212 general & internal medicine, biology, Imidazoles, Valine, Hepatitis B, Middle Aged, Genotype 1, 3. Good health, [ SDV.MHEP.MI ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Treatment Outcome, Cirrhosis, [SDV.SP.PHARMA] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Cohort, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, RNA, Viral, 030211 gastroenterology & hepatology, Drug Therapy, Combination, Female, [ SDV.MHEP.HEG ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, France, medicine.drug, medicine.medical_specialty, Daclatasvir, Hepatitis C virus, Antiviral Agents, Severe fibrosis, 03 medical and health sciences, Internal medicine, Ribavirin, Hepather cohort, Humans, Aged, Hepatology, business.industry, [ SDV.SP.PHARMA ] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, biology.organism_classification, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Treatment, Regimen, chemistry, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Carbamates, business
Abstract: International audience; Background & aims - We report the first real-life results of the sofosbuvir+daclatasvir combination in hepatitis C virus (HCV) genotype 1 infected patients. Methods - The France REcherche Nord&Sud Sida-hiv Hépatites (ANRS) CO22 HEPATHER "Therapeutic options for hepatitis B and C: A French cohort" is a multicentre observational cohort which aims to include 15,000 HCV- and 10,000 HBV-infected patients. We selected all participants (n=768) with a HCV genotype 1 who initiated sofosbuvir (400mg/day) and daclatasvir (60mg/day) before October 1st 2014, with or without ribavirin (1-1.2g/day) for a duration of 12weeks or 24weeks. The main endpoint criterion was sustained virological response at 12weeks (SVR12), defined by the absence of detectable HCV-RNA 12weeks after the last treatment intake. Missing SVR12 measurements were imputed using SVR24 measurements (n=45), otherwise considered as virological failure (n=18). Results - A SVR12 was obtained in 729/768 (95%) patients, ranging from 92% (12-week sofosbuvir+daclatasvir) to 99% (24-week sofosbuvir+daclatasvir+ribavirin). The SVR12 rates did not significantly differ between the 24-week (550/574 (96%)) and the 12-week (179/194 (92%); p=0.0688) durations or between regimens with (165/169 (98%)) or without ribavirin (564/599 (94%); p=0.0850). The SVR12 rate was greater than 97% in non-cirrhotic patients irrespective of the treatment duration or the addition of ribavirin. Among cirrhotic patients, the SVR12 rate was higher with 24 than 12-week regimen (423/444 (95%) vs. 105/119 (88%); p=0.0054). Conclusion - The sofosbuvir+daclatasvir combination is associated with a high rate of SVR12 in patients infected by genotype 1, with an optimal duration of 12weeks in non-cirrhotic and 24weeks in cirrhotic patients. The number of patients receiving ribavirin was too low to adequately assess its impact. Lay summary - The sofosbuvir+daclatasvir combination of antiviral drugs is associated with a high rate (95%) of viral eradication in patients infected by HCV genotype 1. The best duration of a ribavirin-free sofosbuvir+daclatasvir combination seems to be 12weeks in non-cirrhotic patients and 24weeks for those with cirrhosis. Clinical trial number: NCT01953458.
Published: 2017

18. Sofosbuvir and NS5A inhibitors without Ribavirin during 12 weeks are efficient to treat hepatitis C recurrence after liver transplantation only in genotype 1. Results from the CO23 ANRS CUPILT study

Author: Houssel-Debry, Pauline, Coilly, Audrey, Fougerou-Leurent, Claire, Jezequel, Caroline, Duvoux, Christophe, Ledinghen, Victor, Radenne, Sylvie, Kamar, Nassim, Leroy, Vincent, Di Martino, Vincent, d'Alteroche, Louis, Canva-Delcambre, Valerie, Conti, Filomena, Dumortier, Jérôme, Montialoux, Helene, Lebray, Pascal, Botta-Fridlund, Danielle, Anty, Rodolphe, Moreno, Christophe, Silvain, Christine, Besch, Camille, Perré, Philippe, Francoz, Claire, Abergel, Armand, Habersetzer, François, Debette-Gratien, Maryline, Rohel, Alexandra, Diallo, Alpha, Rossignol, Emilie, Danjou, Helene, Veislinger, Aurelie, Duclos-Vallée, Jean-Charles, Pageaux, Georges-Philippe, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Paul Brousse, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Centre hépato-biliaire (CHB), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Service des Maladies de l'Appareil Digestif [CHU Rennes], Pôle Recherche Clinique-Santé Publique [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor, Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépatologie, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Grenoble Alpes - UFR Médecine (UGA UFRM), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], service d'Hépato-gastro-entérologie, Hospices Civiles de Lyon-Hôpital Edouard Heriault, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Chirurgie Digestive, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Département Digestif, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-Hôpital de l'Archet, Hôpital Erasme [Bruxelles] (ULB), Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital de la Milétrie, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Service d'Hépato-Gastro-Entérologie, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Hepatinov (DHU), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre Hépato-Biliaire Paul Brousse, Centre National de Référence pour la maladie de Wilson (CNR wilson), CNR Wilson, Service de Neurologie, Hôpital Lariboisière, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Multiorgan Transplantation, CHU Toulouse [Toulouse], Service de gastro-entérologie [CHU Trousseau], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Service de Chirurgie Digestive, Hépato-Bilio-pancréatique et Transplantation Hépatique [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-CHU Saint-Eloi, Hôpital Paul Brousse-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Centre hépato-biliaire ( CHB ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri-Mondor, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Institut de médecine moléculaire de Rangueil ( I2MR ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Grenoble Alpes - UFR Médecine ( UGA UFRM ), Université Grenoble Alpes ( UGA ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Jean Minjoz-Université de Franche-Comté ( UFC ), Service de gastro-entérologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], CHRU Tours, Service de chirurgie digestive hépato-bilio-pancréatique transplantation hépatique [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine ( CR Saint-Antoine ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Human HepCell [AP-HP Hôpital Saint-Antoine], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP - Hôpital Saint-Antoine -Paris Biotech santé, APHP, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Hôpital de la Conception [CHU - APHM] ( LA CONCEPTION ), Centre méditérannéen de médecine moléculaire ( C3M ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Nice-Hôpital de l'Archet, Hôpital Erasme, Université Libre de Bruxelles [Bruxelles] ( ULB ), Centre hospitalier universitaire de Poitiers ( CHU Poitiers ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques ( RESINFIT ), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Université de Limoges ( UNILIM ), Hepatinov ( DHU ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Centre Hépato-Biliaire Paul Brousse, Centre National de Référence pour la maladie de Wilson ( CNR wilson ), and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -CHU Saint-Eloi
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; Meeting Abstract: 925
Published: 2017

19. A 2-year multicenter, double-blind, randomized, placebo-controlled study of bezafibrate for the treatment of primary biliary cholangitis in patients with inadequate biochemical response to ursodeoxycholic acid therapy (Bezurso)

Author: Eric Nguyen-Khac, Olivier Chazouillères, Dominique Larrey, Isabelle Ollivier-Hourmand, Armando Abergel, Alexandra Rousseau, Tabassome Simon, Anne Minello, François Habersetzer, Christophe Corpechot, Dominique Guyader, Fabien Zoulim, Odile Goria, Olivier Roux, Gisèle N'Kontchou, Jean-Pierre Bronowicki, C. Silvain, Farid Gaouar, Jean-Pierre Zarski, R.E. Poupon, V. de Ledhingen, Patrick Potier, Alexandra Heurgué-Berlot, Maryline Debette-Gratien, P. Mathurin, Jérôme Boursier, Maladies fibro-inflammatoires d’origine métabolique et biliaire du foie [CRSA], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS - UM 4 (UMR 8258 / U1022)), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Foie, métabolismes et cancer, Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service d'hépato-gastro-entérologie [Rennes] = Gastroenterology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Laboratoire Inflammation, Tissus épithéliaux et Cytokines (LITEC), Université de Poitiers, Institut d'astrophysique spatiale (IAS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National d’Études Spatiales [Paris] (CNES), Service d'Hépatologie Gastro-entérologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Service d'Hépato-Gastro-Entérologie et Nutrition [CHU Limoges], CHU Limoges, Cellules souches normales et cancéreuses, Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Département d'Hépato-Gastroentérologie et de Transplantation Hépatique [CHU Saint-Eloi], Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université de Montpellier (UM), Service d’Hépatologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Groupe de Recherche sur l'alcool et les pharmacodépendances - UMR INSERM_S 1247 (GRAP), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato Gastroenterologie [CHU Amiens-Picardie], CHU Amiens-Picardie, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CIC AP-HP (hegp Ex-Broussais)/inserm, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-Gastro-Enterologie et Nutrition [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: medicine.medical_specialty, Bezafibrate, animal structures, Hepatology, business.industry, health care facilities, manpower, and services, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, Placebo-controlled study, Gastroenterology, Ursodeoxycholic acid, Double blind, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, 030220 oncology & carcinogenesis, Internal medicine, medicine, 030211 gastroenterology & hepatology, In patient, business, health care economics and organizations, medicine.drug
Abstract: International Liver Congress / 52nd Annual Meeting of the European-Association-for-the-Study-of-the-Liver-Disease, Amsterdam, NETHERLANDS, APR 19-23, 2017; International audience
Published: 2017

20. Changes in serum bile acid levels associated with bezafibrate add-on therapy in patients with primary biliary cholangitis and inadequate biochemical response to ursodeoxycholic acid: results from the BEZURSO trial (NCT01654731)

Author: Corpechot, C., Chazouilleres, O., Humbert, L., Rousseau, A., Le Gruyer, A., Habersetzer, F., Philippe Mathurin, Goria, O., Potier, P., Anne, M., Silvain, C., Abergel, A., Debette-Gratien, M., Larrey, D. G., Roux, O., Bronowicki, J. P., Boursier, J., Ledinghen, V., Heurgue-Berlot, A., Nguyen-Khac, E., Zoulim, F., Ollivier-Hourmand, I., Zarski, J. P. H., Nkontchou, G., Gaouar, F., Simon, T., Poupon, R., Rainteau, D., CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire des biomolécules (LBM UMR 7203), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pontchaillou [Rennes], Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Pôle Hépato-digestif, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service des Maladies de l'Appareil Digestif et de la Nutrition [CHRU Lille], Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille-CHU Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Unité d'Hépatologie [CHU Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Department of Digestive and Hepatobiliary Medecine, University Medical Hospital, Institut Pascal (IP), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacologie des Immunosuppresseurs et de la Transplantation (PIST), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie et Nutrition [CHU Limoges], CHU Limoges, Département d'Hépato-Gastroentérologie et de Transplantation Hépatique [CHU Saint-Eloi], Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université de Montpellier (UM), Méthodes Formelles pour la Bioinformatique (LS2N - équipe MéForBio), Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital universitaire Robert Debré [Reims], Groupe de Recherche sur l'alcool et les pharmacodépendances - UMR INSERM_S 1247 (GRAP), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hospices Civils de Lyon (HCL), Service d'Hépatologie [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d’Hépato-Gastroentérologie [CHU Angers], PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: 68th Annual Meeting of the American-Association-for-the-Study-of-Liver-Diseases (AASLD) / Liver Meeting, Washington, DC, OCT 20-24, 2017; International audience
Published: 2017

21. Hepatitis C Virus, Cholesterol and Lipoproteins — Impact for the Viral Life Cycle and Pathogenesis of Liver Disease

Author: Mathieu Lefèvre, Catherine Schuster, Mohamed Lamine Hafirassou, Daniel J. Felmlee, Thomas Baumert, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Pôle Hépato-digestif, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), European Union (ERC-2008-AdG-233130-HEPCENT and Interreg IV FEDER-Hepato-Regio-Net 2009, T.F.B.), the Agence Nationale de Recherches sur le SIDA (ANRS) (2010-307/2011-415, C.S.), the European Association for Study of the Liver (EASL) (fellowship award to D.J.F.), and the French National ―Investissement d'Avenir‖ LabEx HEPSYS (T.F.B., C.S.)., and Baumert, Thomas F.
Subjects: Apolipoprotein E, Very low-density lipoprotein, Hepacivirus, lcsh:QR1-502, Review, medicine.disease_cause, lcsh:Microbiology, apoE, Liver disease, 0302 clinical medicine, apoB, Virus Release, 0303 health sciences, biology, Hepatitis C virus, Hepatitis C, 3. Good health, secretion, Infectious Diseases, Hepatocellular carcinoma, entry, lipids (amino acids, peptides, and proteins), 030211 gastroenterology & hepatology, viral attachment, assembly, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, 03 medical and health sciences, Virology, medicine, Humans, viral immune escape, triglyceride, Triglycerides, 030304 developmental biology, Virus Assembly, cholesterol, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Virus Internalization, lipid disorder, medicine.disease, biology.organism_classification, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, lipoproteins, Immunology, apolipoproteins, Lipoprotein
Abstract: International audience; Hepatitis C virus (HCV) is a leading cause of chronic liver disease, including chronic hepatitis, fibrosis, cirrhosis, and hepatocellular carcinoma. Hepatitis C infection associates with lipid and lipoprotein metabolism disorders such as hepatic steatosis, hypobetalipoproteinemia, and hypocholesterolemia. Furthermore, virus production is dependent on hepatic very-low-density lipoprotein (VLDL) assembly, and circulating virions are physically associated with lipoproteins in complexes termed lipoviral particles. Evidence has indicated several functional roles for the formation of these complexes, including co-opting of lipoprotein receptors for attachment and entry, concealing epitopes to facilitate immune escape, and hijacking host factors for HCV maturation and secretion. Here, we review the evidence surrounding pathogenesis of the hepatitis C infection regarding lipoprotein engagement, cholesterol and triglyceride regulation, and the molecular mechanisms underlying these effects.
Published: 2013

22. Sofosbuvir-based antiviral therapy in hepatitis C virus patients with severe renal failure

Author: Jérôme Dumortier, François Bailly, Anaïs Vallet-Pichard, Marie-Claude Gagnieu, Sylvie Radenne, Olivier Guillaud, François Habersetzer, Jean-Didier Grangé, Nassim Kamar, Anne Minello, Georges-Philippe Pageaux, Laurent Alric, Vincent Leroy, Service d'hépatogastroentérologie [Hôpital Edouard Herriot, Hospices Civils de Lyon], Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Service d'hépatogastroentérologie [Hôpital de la Croix-Rousse, Hospices Civils de Lyon], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Département d'Hépato-Gastroentérologie et de Transplantation Hépatique [CHU Saint-Eloi], Université de Montpellier (UM)-CHU Saint-Eloi, Département d'hépatologie [CHU Cochin], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Pôle Hépato-digestif, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Hospices Civils de Lyon, Groupement Hospitalier Edouard Herriot, Laboratoire de Biochimie et Biologie Moléculaire, Lyon, France, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes, Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Service de Medecine Interne, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépato-gastroentérologie [CHU Grenoble Alpes], Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes (CHU Grenoble Alpes), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Université de Montpellier ( UM ) -CHU Saint-Eloi, Institut Pasteur [Paris]-CHU Cochin [AP-HP]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Service d'hépato-gastro-entérologie [Hôpital Tenon], CHU Tenon [APHP], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Centre de Physiopathologie de Toulouse Purpan ( CPTP ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital de Rangueil, Pharmacochimie et Pharmacologie Pour le Développement ( PHARMA-DEV ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes ( CHU Grenoble Alpes ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université de Montpellier (UM), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service Médecine interne [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)
Subjects: [ SDV.MHEP.UN ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, Simeprevir, Male, medicine.medical_specialty, Daclatasvir, Sofosbuvir, Hepatitis C virus, medicine.medical_treatment, 030232 urology & nephrology, Hepacivirus, medicine.disease_cause, Gastroenterology, [SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Pegylated interferon, Internal medicine, medicine, Humans, Renal Insufficiency, Retrospective Studies, Transplantation, direct-acting antiviral, tolerance, treatment, business.industry, Ribavirin, Hepatitis C, Hepatitis C, Chronic, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, haemodialysis, chemistry, Nephrology, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, Hemodialysis, hepatitis C, business, medicine.drug, Glomerular Filtration Rate
Abstract: IF 4.470; International audience; BackgroundChronic hepatitis C virus (HCV) infection is the most common chronic liver disease in patients with end-stage renal disease (ESRD). Over the last few years, second-generation direct-acting antivirals have been revolutionary in the treatment of hepatitis C, and sofosbuvir (SOF) is the backbone of most modern treatment strategies. Since SOF is eliminated through the kidney, the aim of this multicentre retrospective study was to assess its antiviral efficacy and safety in HCV-infected patients with severe renal failure [including haemodialysis (HD) patients].MethodsFifty patients (36 males, mean age ± standard deviation 60.5 ± 7.5 years) with chronic HCV infection (G1: 28/56%, cirrhosis: 27/54%) and severe renal failure [i.e. MDRD estimated glomerular filtration rate (eGFR)
Published: 2016

23. Multicentre experience using daclatasvir and sofosbuvir to treat hepatitis C recurrence - The ANRS CUPILT study

Author: Armando Abergel, Christophe Moreno, Danielle Botta-Fridlund, Sylvie Radenne, Maryline Debette-Gratien, Pauline Houssel-Debry, Pascal Lebray, A. Rohel, Claire Francoz, Jean-Charles Duclos-Vallée, P. Perré, François Habersetzer, Nassim Kamar, Christine Silvain, Didier Samuel, H. Danjou, Rodolphe Anty, Vincent Leroy, Emilie Rossignol, Victor de Lédinghen, Louis d’Alteroche, Anne-Marie Roque-Afonso, Camille Besch, Filomena Conti, Christophe Duvoux, Georges-Philippe Pageaux, Valérie Canva, Claire Fougerou-Leurent, Jérôme Dumortier, Vincent Di Martino, Audrey Coilly, Hôpital Paul Brousse, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Centre hépato-biliaire (CHB), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pôle Recherche Clinique-Santé Publique [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor, Service d'hépatologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), ScaLable Information Discovery and Exploitation [Grenoble] (SLIDE), Laboratoire d'Informatique de Grenoble (LIG ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Service d'hépato-gastro-entérologie, Hôpital Huriez-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Hôpital Erasme [Bruxelles] (ULB), Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), service d'Hépato-gastro-entérologie, Hospices Civiles de Lyon-Hôpital Edouard Heriault, Hôpital de la Milétrie, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Chirurgie Digestive, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Département Digestif, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-Hôpital de l'Archet, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Pathogénèse et traitement de l'hépatite fulminante et du cancer du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre hépato-biliaire - CHB [Paul Brousse, Paris], Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse, Hepatinov (DHU), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre Hépato-Biliaire Paul Brousse, Centre National de Référence pour la maladie de Wilson (CNR wilson), CNR Wilson, Service de Neurologie, Hôpital Lariboisière, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), ANRS (France REcherche Nord & sud Sida-HIV Hepatites-FRENCH), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Multiorgan Transplantation, CHU Toulouse [Toulouse], Service de gastro-entérologie [CHU Trousseau], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Service de Chirurgie Digestive, Hépato-Bilio-pancréatique et Transplantation Hépatique [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-CHU Saint-Eloi, Hôpital Paul Brousse-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Centre hépato-biliaire ( CHB ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri-Mondor, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Jean Minjoz-Université de Franche-Comté ( UFC ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Institut de médecine moléculaire de Rangueil ( I2MR ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de gastro-entérologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], CHRU Tours, ScaLable Information Discovery and Exploitation [Saint Martin d’Hères] ( SLIDE ), Laboratoire d'Informatique de Grenoble ( LIG ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Hôpital Huriez-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), APHP, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Hôpital Erasme, Université Libre de Bruxelles [Bruxelles] ( ULB ), Centre hospitalier universitaire de Poitiers ( CHU Poitiers ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Hôpital de la Conception [CHU - APHM] ( LA CONCEPTION ), Centre méditérannéen de médecine moléculaire ( C3M ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ), CHU Nice-Hôpital de l'Archet, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques ( RESINFIT ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Université de Limoges ( UNILIM ) -CHU Limoges, Service de chirurgie digestive hépato-bilio-pancréatique transplantation hépatique [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine ( CR Saint-Antoine ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Human HepCell [AP-HP Hôpital Saint-Antoine], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP - Hôpital Saint-Antoine -Paris Biotech santé, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Hepatinov ( DHU ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Centre Hépato-Biliaire Paul Brousse, Centre National de Référence pour la maladie de Wilson ( CNR wilson ), and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -CHU Saint-Eloi
Subjects: Compassionate Use Trials, medicine.medical_specialty, drug-drug interactions, Daclatasvir, Sofosbuvir, Hepatitis C virus, medicine.medical_treatment, Hepacivirus, Liver transplantation, medicine.disease_cause, Gastroenterology, Antiviral Agents, virus-infection, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Model for End-Stage Liver Disease, Pegylated interferon, Internal medicine, Ribavirin, medicine, Humans, Prospective Studies, combination, Hepatology, business.industry, association, natural-history, Hepatitis C, interferon, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, medicine.disease, 3. Good health, liver-transplant recipients, hcv infection, [ SDV.SP ] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, Treatment Outcome, chemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, triple therapy, Immunology, 030211 gastroenterology & hepatology, Drug Therapy, Combination, France, business, medicine.drug
Abstract: International audience; Background & Aims:HCV recurrence remains a major issue in the liver transplant field, as it has a negative impact on both graft and patient survival. The purpose of this study was to investigate the efficacy and safety of treating HCV recurrence with sofosbuvir (SOF) and daclatasvir (DCV) combination therapy. Methods: From October 2013 to March 2015, 559 liver recipients were enrolled in the prospective multicentre France REcherche Nord&Sud Sida-hiv Hepatites (ANRS) Compassionate use of Protease Inhibitors in viral C Liver Transplantation cohort. We selected 137 patients with an HCV recurrence receiving SOF and DCV, whatever the genotype or fibrosis stage. The use of ribavirin and the duration of therapy were at the investigator's discretion. The primary efficacy end point was a sustained virological response (SVR) 12 weeks after the end of treatment. Results: The SVR rate 12 weeks after completing treatment was 96% under the intention-to treat analysis and 99% when excluding non-virological failures. Only two patients experienced a virological failure. The serious adverse event (SAE) rate reached 17.5%. Four patients (3%) stopped their treatment prematurely because of SAEs. Anaemia was the most common AE, with significantly more cases in the ribavirin group (56% vs. 18%; p
Published: 2015

24. Stump closure reinforcement with absorbable fibrin collagen sealant sponge (TachoSil®) does not prevent pancreatic fistula after distal pancreatectomy: the FIABLE* multicenter controlled randomized study

Author: Pablo Ortega-Deballon, Patrick Pessaux, Alain Sauvanet, Jean-Michel Fabre, Antonio Sa Cunha, Nicolas Carrere, Bernard Meunier, Abe Fingerhut, François Lacaine, Hôpital Paul-Brousse (Villejuif, Val-de-Marne), Service de Chirurgie Générale et Digestive, Hôpital Purpan, Toulouse, Service de Chirurgie Hépatobiliaire et Digestive, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Foie, métabolismes et cancer, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Physiopathologie hépatique, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Chirurgie Digestive II, CHU Saint-Eloi, Service de chirurgie hepato-pancreato-biliaire, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Pôle Hépato- digestif, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon ( ENSBANA ), Service de Chirurgie Digestive, Cancérologique, Générale, Endocrinienne et Urgences (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Medical University Graz, CHU Tenon [APHP], Nycomed supported the performance of this study, Jonchère, Laurent, Hôpital Paul Brousse, Service de Chirurgie Hépatobiliaire et Digestive [Rennes] = Hepatobiliary and Digestive Surgery [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Tenon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), and Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: Male, absorbable fibrin collagen sealant sponge (TachoSil®), [SDV]Life Sciences [q-bio], 030230 surgery, law.invention, 0302 clinical medicine, Randomized controlled trial, prevention, law, distal pancreatectomy, Aged, 80 and over, reinforcement, biology, Thrombin, General Medicine, TachoSil, Middle Aged, [SDV] Life Sciences [q-bio], Drug Combinations, Treatment Outcome, Pancreatic fistula, 030220 oncology & carcinogenesis, post-operative pancreatic fistula, Female, Distal pancreatectomy, Adult, medicine.medical_specialty, Fibrin, 03 medical and health sciences, Pancreatic Fistula, Young Adult, Pancreatectomy, Double-Blind Method, multicenter controlled randomized study, medicine, Humans, Aged, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Significant difference, Suture Techniques, Fibrinogen, Pancreatic Diseases, Stump closure, medicine.disease, Surgery, biology.protein, Splenic vessel, Ligation, business
Abstract: International audience; Background - The aim of this study is to evaluate the effectiveness of TachoSil sponge on distal pancreatectomy remnant stump in reducing the rate and severity of postoperative pancreatic fistula (POPF). Methods - All consecutive patients requiring distal pancreatectomy were randomized in 45 centers. The principal end point was onset of "clinically relevant" POPF. Univariate and multivariate analyses were searched for predictive factors. Results - Of the 270 patients randomized (134 with TachoSil; 136 without), 150 (55.6%) patients sustained a POPF [74 clinically relevant and 76 clinically silent (27.4% and 28.1%), respectively]: no statistically significant difference was found between patients sustaining clinically relevant POPF [41 (30.6%) with vs 33 (24.3%) without TachoSil (P = .276)], or overall POPF [73 (54.5%) with vs 77 (56.6%) without TachoSil, (P = .807)], but there were more clinically relevant POPF after hand-sewn (32.3%) versus mechanical closure (19.8%) (P = .025) and, in case of splenic preservation, after splenic vessel ligation (15/32, 46.9%) versus vascular preservation (17/72, 23.6%) (P = .024). Hand-sewn pancreatic remnant closure (P = .023) and splenic vessel ligation in splenic preservation (P = .035) were independent predictive factors for the onset of clinically relevant POPF. Conclusion - TachoSil sponge reinforcement of the proximal remnant after distal pancreatectomy reduced neither the rate nor the severity of POPF.
Published: 2015

25. Hepatitis C virus entry and cell-cell transmission : implication for viral life cycle and antiviral treatment

Author: Xiao, Fei, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Université de Strasbourg, Thomas Baumert, and STAR, ABES
Subjects: [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Hepatitis C virus, Viral entry, Virus de l'hépatite C, virus diseases, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.BBM.BM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Direct-acting antiviral, Entry inhibitor, Cell-cell transmission, Transmission de cellule à cellule, Entrée virale, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Inhibiteur d'entrée, Antiviral à action directe
Abstract: Hepatitis C virus (HCV) poses a threat to global health with infecting about 170 million people. Current therapies cannot cure all the patients infected with HCV and have obvious side effects. In the first part of my thesis, we uncovered combinations of direct-acting antivirals (DAAs) and entry inhibitors caracterized by a synergistic effect in prevention and treatment of HCV infection using HCV cell culture models and human liver chimeric uPA-SCID mice, thereby providing a new strategy to control HCV infection. In the second part of my thesis, we demonstrated that HCV cell-cell transmission is the dominant transmission route in cell culture models and that DAA-resistant HCV spread efficiently through cell-cell transmission to develop viral resistance. Blocking cell-cell transmission using entry inhibitors allows to prevent the emergence of DAA-resistant virus and potentiates the antiviral efficacy of DAAs to clear HCV infection. In summary, we provide novel strategies to enhance antiviral efficacy by combining entry inhibitors and DAAs and to prevent viral resistance by blocking viral cell-cell transmission., Le virus de l'hépatite C (HCV) représente un problème de santé publique à l'échelle mondiale. Les thérapies actuelles ne permettent pas de guérir tous les patients infectés par le HCV et certains antiviraux ont des effets secondaires importants. Dans la première partie de ma thèse, nous avons identifié des combinaisons d'antiviraux à action directe (DAA) et d'inhibiteurs d'entrée caractérisés par un effet synergique dans la prévention et le traitement du HCV dans des modèles de culture cellulaire et les souris uPA-SCID avec un foie chimérique. Ceci représente une nouvelle stratégies de lutte contre l'infection par le HCV. Dans la seconde partie de ma thèse, nous avons démontré que le mode de transmission du HCV de cellule à cellule est la voie de transmission dominante dans les modèles de culture cellulaire. De plus, les virus résistant aux DAA se propagent efficacement grâce à la transmission de cellule à cellule. L'inhibition de la transmission de cellule à cellule en utilisant des inhibiteurs d'entrée est un moyen efficace pour empêcher l'émergence de virus résistant aux DAA et pour potentialiser l'efficacité antivirale des DAA pour éradiquer l'infection par le HCV.
Published: 2014

26. Evaluation préclinique de thérapies innovantes pour le carcinome hépatocellulaire et l'infection chronique par le virus de l'hépatite C

Author: Wu, Tao, STAR, ABES, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Université de Strasbourg, Éric Robinet, and Patrick Pessaux
Subjects: Hepatitis C virus, Hepatocellular carcinoma, [ SDV.IMM.IMM ] Life Sciences [q-bio]/Immunology/Immunotherapy, Carcinome hépatocellulaire, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Animal models, Immunothérapie adoptive, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Adoptive immunotherapy, Modèles animaux, Hépatite C, [ SDV.MHEP.HEG ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Oncogènes, [SDV.IMM.IMM] Life Sciences [q-bio]/Immunology/Immunotherapy, Allogeneic suicide gene-modified killer cell, Lymphocytes génétiquement modifiés exprimant un gène suicide
Abstract: The hepatitis C virus (HCV) infection is a major problem of public health, due to its high prevalence and to the severity of its complications, cirrhosis and hepatocellular carcinoma (HCC). The aims of the thesis project are (i) to set up and characterize orthotopic HCC models in the small animal (orthotopic transplantation in immunodeficient mice of the human HCC cell line Huh-7, expressing the luciferase reporter gene) and in the large animal (autologous transplantation of porcine hepatocytes previously ex vivo-transformed by lentiviral-meidated transfer of a combination of six oncogenes) and (ii) to provide the proof-of-concept of an innovative adoptive allogeneic immunotherapy approach for the treatment of HCC and prevention of liver graft reinfection by HCV, through the administration of allogeneic suicide gene-modified lymphocytes (GML). Such a suicide gene allows for the control of GML, leading to their conditional elimination in case of undesirable side effects. Thus, we have demonstrated that, at high dose, these GML present an in vitro cytotoxic activity toward HCC cell lines and an in vivo antitumoral effect against orthotopic Huh-7 tumors. At low level, the GML have an antiviral activity against HCV, without toxicity against target cells. These results open the perspective for an original approach of immunotherapy for the treatment of HCC in association with current treatments and for the prevention of liver graft reinfection by HCV at time of liver transplantation., L’infection par le virus de l’hépatite C (VHC) représente un problème majeur de santé publique du fait de sa prévalence élevée et de la sévérité de ses complications, cirrhose et carcinome hépatocellulaire (CHC). Les objectifs du projet de thèse sont (i) de mettre en place et caractériser des modèles orthotopiques de CHC chez le petit animal (xénogreffe orthotopique de la lignée de CHC humaine Huh-7 exprimant le gène rapporteur de la luciférase chez la souris immunodéficiente) et chez le gros animal (transplantation autologue d’hépatocytes de cochon préalablement transformés ex vivo par transfert par voie lentivirale d’une combinaison de six oncogènes) et (ii) d’apporter la preuve de concept d’une approche innovante d’immunothérapie adoptive allogénique du CHC et de l’infection chronique par le VHC, par administration de lymphocytes génétiquement modifiés (LGM) allogéniques exprimant un gène de toxicité conditionnelle, ou gène suicide. Un tel gène suicide permet le contrôle des LGM, conduisant à leur élimination conditionnelle en cas d’effets secondaires indésirables. Ainsi, nous avons montré que, à dose élevée, ces LGM exercent in vitro une activité cytotoxique vis-à-vis de lignées de CHC humaines et in vivo une activité anti-tumorale vis-à-vis de tumeurs orthotopiques Huh-7. A faible dose, les LGM présentent une activité anti-virale vis-à-vis du VHC sans induire de toxicité. Ces résultats ouvrent la perspective à une approche originale d’immunothérapie du CHC, associée aux traitements actuels et de prévention de la réinfection du greffon hépatique par le VHC lors de la transplantation.
Published: 2014

27. Etude du rôle des protéines cellulaires RACK1 et TIP47 dans l'infection par le virus de l'hépatite C

Author: Hafirassou , Mohamed Lamine, STAR, ABES, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Université de Strasbourg, and Catherine Schuster
Subjects: [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Translation, RACK1, Viral egress, TIP47, Assemblage, Lipid droplets, VHC, [ SDV.MP.VIR ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Traduction, IRES, HCV, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Export, Viral assembly, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Gouttelettes lipidiques
Abstract: The hepatitis C virus (HCV) relies on cellular factors to complete its life cycle and persist in its host. One of the strategies employed by our laboratory is the in-depth study of the network of virus-host interactions to identify new therapeutic cellular targets and develop more effective antivirals to overcome viral resistance.During my PhD, I studied two cellular factors involved in the HCV life cycle. The first factor is the ribosomal protein RACK1. We have shown that this protein is specifically required for the HCV IRES-mediated translation but not for the cap-mediated translation. The second factor is the lipid droplets binding protein TIP47. We have shown that this protein is important for both assembly and export of viral particles. This work shows that new therapeutic targets could be considered in the fight against HCV., Le virus de l’hépatite C (VHC) dépend de facteurs cellulaires pour accomplir son cycle viral et persister dans l’hôte. L’une des stratégies de notre laboratoire consiste à étudier de manière approfondie le réseau d’interactions virus-hôte, afin d’identifier de nouvelles cibles thérapeutiques cellulaires et de développer des antiviraux plus efficaces pour vaincre la résistance virale. Durant ma thèse j’ai étudié deux facteurs cellulaires importants pour le VHC. Le premier est la protéine ribosomale RACK1. Nous avons montré que cette protéine est spécifiquement requise pour la traduction IRES-dépendante du VHC, et non pour la traduction coiffe-dépendante. Le deuxième facteur est une protéine de surface des gouttelettes lipidiques appelée TIP47. Nous avons montré que cette protéine est importante à la fois pour l’assemblage et pour l’export des particules virales. L’ensemble de ces travaux montre que de nouvelles cibles thérapeutiques pourraient être envisagées pour lutter contre le VHC.
Published: 2014

28. Functional analysis of claudin-6 and claudin-9 as entry factors for hepatitis C virus infection of human hepatocytes using monoclonal antibodies

Author: Fritz Grunert, Patrick Pessaux, John F. Thompson, Claire Gondeau, Hubert E. Blum, Christine Thumann, Jane A. McKeating, Sarah C. Durand, Joachim Lupberger, Thomas F. Baumert, Gary M. Reynolds, Laura Heydmann, Isabel Fofana, Laetitia Zona, Mirjam B. Zeisel, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Department of Medicine II, University of Freiburg [Freiburg], Pôle Hépato- digestif, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Cellules souches normales et cancéreuses, Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), NIHR Liver Biomedical Research Unit, University of Birmingham [Birmingham], Aldevron GmbH, This work was supported by Inserm, University of Strasbourg, the Zentrales Innovationsprogramm Mittelstand, the European Union (ERC-2008-AdG-233130-HEPCENT, INTERREG-IV-Rhin Supérieur-FEDER-Hepato-Regio-Net 2009 and 2012, EU FP7 HEPAMAB), ANRS (2011/132, 2012/239, 2012/318, 2013/108) and 173 Laboratoire d'excellence LabEx HepSYS (Investissement d'Avenir, ANR-10-LAB-28) Research in McKeating lab is funded by Medical Research Council and NIHR Liver Biomedical Research Unit., European Project: 233130,EC:FP7:ERC,ERC-2008-AdG,HEPCENT(2009), Baumert, Thomas F., and Molecular Analysis of Hepatitis C Virus Neutralization and Entry For the Development of Novel Antiviral Immunopreventive Strategies - HEPCENT - - EC:FP7:ERC2009-04-01 - 2014-03-31 - 233130 - VALID
Subjects: endocrine system diseases, medicine.drug_class, Hepacivirus, Hepatitis C virus, Immunology, medicine.disease_cause, Monoclonal antibody, urologic and male genital diseases, Microbiology, digestive system, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Antibodies monoclonal, Virology, medicine, Humans, Claudin, Cells, Cultured, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, biology, Functional analysis, Antibodies, Monoclonal, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Virus Internalization, biology.organism_classification, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, Virus-Cell Interactions, 3. Good health, Insect Science, Claudins, Hepatocytes, biology.protein, 030211 gastroenterology & hepatology, Antibody, tissues
Abstract: The relevance of claudin-6 and claudin-9 in hepatitis C virus (HCV) entry remains elusive. We produced claudin-6- or claudin-9-specific monoclonal antibodies that inhibit HCV entry into nonhepatic cells expressing exogenous claudin-6 or claudin-9. These antibodies had no effect on HCV infection of hepatoma cells or primary hepatocytes. Thus, although claudin-6 and claudin-9 can serve as entry factors in cell lines, HCV infection into human hepatocytes is not dependent on claudin-6 and claudin-9.
Published: 2013

29. Etude des facteurs cellulaires responsables de l'initiation et de la dissémination du virus de l'hépatite C

Author: Turek, Marine, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Université de Strasbourg, Thomas Baumert, and STAR, ABES
Subjects: [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Hepatitis C virus, Viral entry, Virus de l'hépatite C, HCV infection, SRB1, Virus, CD81, Entrée virale, HCV, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Infection, Hépatocytes, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: HCV infection is the leading cause of chronic liver disease. The current SOC is still limited by high costs, toxicity and emergence of viral resistance. In the first part of my thesis we focused our workon viral entry. Viral entry is required for initiation, spread, and maintenance of infection, and thus is a promising target for the development of new antiviral therapies. CD81 and SR-BI are the first entry factors identified as important for HCV entry. In our work we confirmed their crucial role in entry, especially at the post-binding step. In addition we proved their key role in viral dissemination through the cell-cell transmission. As HCV mainly infects hepatocytes, we studied in the second part of my thesis, the restricted cellular tropism of HCV to hepatocytes and we defined the minimal host factors rendering non hepatic cell lines susceptible to HCV infection by the establishment of a powerful tool to identify new assembly and replication factors., Le VHC est une cause majeure de cancer du foie. Le traitement actuel est caractérisé par à un cout élevé, la présence de toxicité et l’émergence de résistance virale. Dans la 1ère partie de ma thèse, je me suis intéressé à l’entrée virale. L’entrée est nécessaire pour l’initiation ; la dissémination et le maintien de l’infection et représente ainsi une cible intéressante dans le développement de thérapies antivirales : CD81 et SRBI sont les 1ers facteurs décrits comme importants pour l’entrée : Nous avons confirmé leur rôle clé dans l’entrée et les étapes suivant l’entrée. De plus, nous avons montré leur rôle crucial dans la transmission cellule/cellule. Le VHC infecte principalement les hépatocytes, nous avons étudié en seconde partie de ma thèse le tropisme restreint du VHC aux hépatocytes. En définissant les facteurs essentiels à l’infection de cellules non hépatiques et en développant un modèle cellulaire afin d’identifier de nouveaux facteurs d’assemblage et de réplication du VHC.
Published: 2013

30. A bile acid transporter as a candidate receptor for hepatitis B and D virus entry

Author: Fei Xiao, Thomas Baumert, Jane A. McKeating, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, NIHR Liver Biomedical Research Unit, University of Birmingham [Birmingham], Pôle Hépato-digestif, Nouvel Hôpital Civil, and Baumert, Thomas F.
Subjects: viruses, Duck hepatitis B virus, medicine.disease_cause, digestive system, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Viral entry, medicine, Gene silencing, Antiviral, Receptor, 030304 developmental biology, Hepatitis B virus, 0303 health sciences, biology, Hepatology, virus diseases, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, cccDNA, Hepatitis B, medicine.disease, biology.organism_classification, Virology, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, infection, 3. Good health, 030211 gastroenterology & hepatology, Hepatitis D virus, liver disease, pathogen
Abstract: Support by Inserm, ANRS, University of Strasbourg, the European Union (INTERREG-IV-Rhin Supérieur-FEDER -Hepato-Regio-Net 2009 and 2012), the Laboratoire d'excellence HEPSYS (ANR-10-LAB-28) and MRC.; International audience; Human hepatitis B virus (HBV) infection and HBV-related diseases remain a major public health problem. Individuals coinfected with its satellite hepatitis D virus (HDV) have more severe disease. Cellular entry of both viruses is mediated by HBV envelope proteins. The pre-S1 domain of the large envelope protein is a key determinant for receptor(s) binding. However, the identity of the receptor(s) is unknown. Here, by using near zero distance photo-cross-linking and tandem affinity purification, we revealed that the receptor-binding region of pre-S1 specifically interacts with sodium taurocholate cotransporting polypeptide (NTCP), a multiple transmembrane transporter predominantly expressed in the liver. Silencing NTCP inhibited HBV and HDV infection, while exogenous NTCP expression rendered nonsusceptible hepatocarcinoma cells susceptible to these viral infections. Moreover, replacing amino acids 157-165 of nonfunctional monkey NTCP with the human counterpart conferred its ability in supporting both viral infections. Our results demonstrate that NTCP is a functional receptor for HBV and HDV.
Published: 2013

31. Hepatitis C Virus Envelope Glycoprotein Signatures Are Associated With Treatment Failure and Modulation of Viral Entry and Neutralization

Author: Mirjam B. Zeisel, François Habersetzer, John E. Tavis, Samira Fafi-Kremer, John M. Murray, Aurélie Velay, Anne-Claire Erba, Jean-Pierre Gut, Isabel Fofana, Evelyne Schvoerer, Rémy Moenne-Loccoz, Maureen J. Donlin, Marine Turek, Françoise Stoll-Keller, Michel Doffoel, Thomas F. Baumert, Interaction virus-hôte et maladies du foie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d’Hépatogastroentérologie, NHC, CHU de Strasbourg, Virology Laboratory, General Hospital Papageorgiou, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Service d'hépato-gastroentérologie, CHU Strasbourg-Hopital Civil, and SCHVOERER, Evelyne
Subjects: Male, Hepacivirus, Viral transformation, Antibodies, Viral, medicine.disease_cause, 0302 clinical medicine, Viral Envelope Proteins, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Immunology and Allergy, Treatment Failure, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, chemistry.chemical_classification, [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, 0303 health sciences, biology, Middle Aged, Hepatitis C, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, Adult, Genotype, Hepatitis C virus, Antiviral Agents, Structure-Activity Relationship, 03 medical and health sciences, Neutralization Tests, Viral entry, Ribavirin, medicine, Humans, Immune Evasion, 030304 developmental biology, Computational Biology, Virus Internalization, biology.organism_classification, Antibodies, Neutralizing, Herpesvirus glycoprotein B, Virology, NS2-3 protease, HEK293 Cells, chemistry, Mutation, Immunology, Mutagenesis, Site-Directed, Glycoprotein, CD81
Abstract: BACKGROUND: A major challenge for antiviral treatment of hepatitis C virus (HCV) infection is viral resistance, potentially resulting from the high variability of HCV envelope glycoproteins and subsequent selection of strains with enhanced infectivity and/or immune escape. METHODS: We used a bioinformatics and functional approach to investigate whether E1/E2 envelope glycoprotein structure and function were associated with treatment failure in 92 patients infected with HCV genotype 1. RESULTS: Bioinformatics analysis identified 1 sustain virological response (R)-related residue in E1 (219T) and 2 non-SVR (NR)-related molecular signatures in E2 (431A and 642V) in HCV genotype 1a. Two of these positions also appeared in minimal networks separating NR patients from R patients. HCV pseudoparticles (HCVpp) expressing 431A and 642V resulted in a decrease in antibody-mediated neutralization by pretreatment sera. 431A/HCVpp entry into Huh7.5 cells increased with overexpression of CD81 and SR-BI. Moreover, an association of envelope glycoprotein signatures with treatment failure was confirmed in an independent cohort (Virahep-C). CONCLUSIONS: Combined in silico and functional analyses demonstrate that envelope glycoprotein signatures associated with treatment failure result in an alteration of host cell entry factor use and escape from neutralizing antibodies, suggesting that virus-host interactions during viral entry contribute to treatment failure.
Published: 2013

32. A novel monoclonal anti-CD81 antibody produced by genetic immunization efficiently inhibits Hepatitis C virus cell-cell transmission

Author: Isabel Fofana, Christine Thumann, Fritz Grunert, Thomas F. Baumert, Fei Xiao, Marine Turek, Rajiv G. Tawar, John F. Thompson, Laetitia Zona, Mirjam B. Zeisel, Baumert, Thomas F., Programme 'Chaires d'excellence': aide à l'accueil de chercheurs et d'enseignants chercheurs de haut niveau venant de l'étranger - Infection par le virus de l'hépatite C : Etude des interactions virus-cellule cible et des mécanismes impliqués dans la pathogénie de l'infection - - HCV HOST INTERACTION2005 - ANR-05-CEXC-0008 - CEXC - VALID, Molecular Analysis of Hepatitis C Virus Neutralization and Entry For the Development of Novel Antiviral Immunopreventive Strategies - HEPCENT - - EC:FP7:ERC2009-04-01 - 2014-03-31 - 233130 - VALID, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Aldevron GmbH, his work was supported by Inserm, University of Strasbourg, the European Union (ERC-2008-AdG-233130-HEPCENT, INTERREG-IV-Rhin Supe ́rieur- FEDER-Hepato-Regio-Net 2009 and 2012), the chair of excellence program of the Agence Nationale de la Recherche France (ANR-05-CEXC-008), ANRS (2009/183, 2011/132, 2012/239), Laboratoire d'excellence LabEx HEPSYS (Investissement d'Avenir, ANR-10-LAB-28), the Direction Ge ́ne ́rale de l'Offre de Soins (A12027MS) and Aldevron (Pro Inno II (KA0690901UL8))., ANR-05-CEXC-0008,HCV HOST INTERACTION,Infection par le virus de l'hépatite C : Etude des interactions virus-cellule cible et des mécanismes impliqués dans la pathogénie de l'infection(2005), and European Project: 233130,EC:FP7:ERC,ERC-2008-AdG,HEPCENT(2009)
Subjects: Anatomy and Physiology, Gastroenterology and hepatology, Cancer Treatment, lcsh:Medicine, Hepacivirus, Drug resistance, medicine.disease_cause, Hepatitis, 0302 clinical medicine, Viral Envelope Proteins, Immune Physiology, lcsh:Science, 0303 health sciences, Multidisciplinary, biology, Antibodies, Monoclonal, virus diseases, Antivirals, Hepatitis C, Immunizations, 3. Good health, Infectious hepatitis, Oncology, Monoclonal, Medicine, Infectious diseases, 030211 gastroenterology & hepatology, Antibody, Research Article, medicine.drug_class, Hepatitis C virus, Immunology, Viral diseases, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, Monoclonal antibody, Microbiology, Antibodies, Tetraspanin 28, 03 medical and health sciences, Antibody Therapy, Viral entry, Virology, medicine, Animals, Humans, Rats, Wistar, Biology, Liver diseases, 030304 developmental biology, lcsh:R, Cell Membrane, Immunity, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Hepatitis C Antibodies, Virus Internalization, Antibodies, Neutralizing, digestive system diseases, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Rats, Immunization, biology.protein, lcsh:Q, Clinical Immunology, CD81
Abstract: International audience; BACKGROUND AND AIMS: Hepatitis C virus (HCV) infection is a challenge to prevent and treat because of the rapid development of drug resistance and escape. Viral entry is required for initiation, spread, and maintenance of infection, making it an attractive target for antiviral strategies. METHODS: Using genetic immunization, we produced four monoclonal antibodies (mAbs) against the HCV host entry factor CD81. The effects of antibodies on inhibition of HCV infection and dissemination were analyzed in HCV permissive human liver cell lines. RESULTS: The anti-CD81 mAbs efficiently inhibited infection by HCV of different genotypes as well as a HCV escape variant selected during liver transplantation and re-infecting the liver graft. Kinetic studies indicated that anti-CD81 mAbs target a post-binding step during HCV entry. In addition to inhibiting cell-free HCV infection, one antibody was also able to block neutralizing antibody-resistant HCV cell-cell transmission and viral dissemination without displaying any detectable toxicity. CONCLUSION: A novel anti-CD81 mAb generated by genetic immunization efficiently blocks HCV spread and dissemination. This antibody will be useful to further unravel the role of virus-host interactions during HCV entry and cell-cell transmission. Furthermore, this antibody may be of interest for the development of antivirals for prevention and treatment of HCV infection.
Published: 2013

33. Study of viral and cellular factors involved in hepatitis C virus escape during liver transplantation

Author: Fauvelle, Catherine, STAR, ABES, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Université de Strasbourg, Thomas Baumert, and Samira Fafi-Kremer
Subjects: Persistence, [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Transplantation, [SDV.IMM] Life Sciences [q-bio]/Immunology, viruses, [ SDV.IMM ] Life Sciences [q-bio]/Immunology, Hépatite C, Lipoprotein, [ SDV.MP.VIR ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Hepatitis C, Persistance, Lipoprotéine
Abstract: Hepatitis C virus (HCV)-cirrhosis and HCC are leading indications for liver transplantation. Reinfection of the liver graft is universal and no way of prevention exists. Mechanisms employed by HCV to evade the immune system and reinfect the liver graft are unknown. This thesis work identified new mechanisms and key determinants involved in viral persistence. Weidentified a novel clinically and therapeutically important mechanism of viral evasion, where coevolution simultaneously occurs between cellular entry factor use and escape from neutralization. We also discovered that virus-apoE interaction is unique mechanism of viral evasion from neutralizing antibodies. Identification of new viral and host factors involved in viral escape paves the way in the development of new prevention strategies and prophylactic vaccine., La cirrhose et le carcinome hépatocellulaire liés au virus de l’hépatite C (HCV) sont des indications majeures de transplantation hépatique. La réinfection du greffon par le HCV est systématique et sans moyen de prévention. Les mécanismes par lesquels le virus échappe au système immunitaire afin de réinfecter le greffon sont mal connus. Ce travail de thèse a permis d’identifier de nouveaux mécanismes et des déterminants clés impliqués dans la persistance virale. Nous avons identifié que l’utilisation des facteurs d’entrée cellulaires par le HCV évolue simultanément avec ses capacités d’échappement aux nAbs, et démontré qu’apo E est un composant clé des lipoparticules virales intervenant dans la persistance du HCV. L’identification de nouveaux facteurs viraux et cellulaires impliqués dans l’échappement viral, apporte de nouvelles perspectives dans le développement de nouvelles stratégies de prévention de la réinfection ainsi que dans le développement d’un vaccin prophylactique.
Published: 2013

34. Potent calcium phosphate nanoparticle surface coating for in vitro and in vivo siRNA delivery: a step toward multifunctional nanovectors

Author: Roxane Saad, Florent Meyer, Ali Ouadi, Thirunavukkarasu Devarasu, Joelle Ogier, Patrice Laquerriere, Eric Robinet, Jean-Claude Voegel, Thomas F. Baumert, Benoît Frisch, Biomatériaux et Bioingénierie (BB), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Recherches Subatomiques (DRS-IPHC), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Conception et application de molécules bioactives (CAMB), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interaction virus-hôte et maladies du foie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biomatériaux : Processus biophysiques et biologiques aux interfaces, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Faculté de Chirurgie Dentaire-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Institut Gilbert-Laustriat : Biomolécules, Biotechnologie, Innovation Thérapeutique, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques (IVH), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Gaillard, Brigitte
Subjects: Small interfering RNA, Biodistribution, Materials science, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH] Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Biomedical Engineering, 02 engineering and technology, General Chemistry, General Medicine, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, Molecular biology, In vitro, 0104 chemical sciences, Surface coating, In vivo, Spect imaging, Biophysics, Gene silencing, General Materials Science, Luciferase, 0210 nano-technology, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; The present study describes hybrid nanoparticles, built by alternate deposition of siRNA and modified polyethyleneimine (tyrosine-grafted PEI or tyrosine/galactose-grafted PEI) on calcium phosphate nanoparticles. These “easy to produce” nanoparticles (NPs) present an efficient gene silencing effect demonstrated in vitro in a luciferase expressing cell culture model and in vivo in a tumour xenograft mouse model. The luciferase gene silencing percentage reached up to 95% in vitro with biocompatible doses of siRNA. Interestingly, we show by SPECT imaging of radiolabeled particles that without modifying the size, stability and in vitro efficiency, the grafting of a sugar moiety on PEI can modify the in vivo biodistribution of the particles. The proof of concept that galactose-grafting on PEI could change biodistribution without changing the gene silencing efficiency makes them versatile tools for specific delivery of small interfering RNA. As they have been designed so far, biodistribution is mainly located in the liver and thus these innovative nanoparticles open a realistic and feasible strategy for siRNA delivery into the liver in vivo.
Published: 2013

35. An Aboriginal Australian Genome Reveals Separate Human Dispersals into Asia

Author: Xiao, Xiaosen, Wang, Yong, Lohmueller, Kirk, Rasmussen, Rasmus, Albrechtsen, Anders, Li, Line, Li, Stinus, Metspalu, Mait, Jombart, Thibaut, Kivisild, Toomas, Zhai, Weiwei, Eriksson, Anders, Manica, Andrea, Orlando, Ludovic, De La Vega, Francisco, Tridico, Silvana, Metspalu, Ene, Nielsen, Kasper, Ávila-Arcos, María, Moreno-Mayar, J. Víctor, Muller, Craig, Dortch, Joe, Gilbert, Thomas, Lund, Ole, Wesolowska, Agata, Karmin, Monika, Weinert, Lucy, Wang, B., Li, Jun, Tai, Shuaishuai, Xiao, Fei, Hanihara, Tsunehiko, Van Driem, George, Jha, Aashish, Ricaut, François-Xavier, De Knijff, Peter, Migliano, Andrea, Gallego Romero, Irene, Kristiansen, Karsten, Lambert, David, Brunak, Søren, Forster, Peter, Brinkmann, Bernd, Nehlich, Olaf, Bunce, Michael, Richards, Richard, Gupta, Ramneek, Bustamante, Carlos, Krogh, Anders, Foley, Robert, Lahr, Marta, Balloux, François, Villems, Richard, Nielsen, Rasmus, Wang, Jun, Willerslev, Eske, Rasmussen, M., Guo, X., Rasmussen, S., Skotte, L., Lindgreen, S., De La Vega, M., Avila-Arcos, M., Gilbert, M., Weinert, A., Ricaut, X., Lambert, M., Richards, M., Foley, A., Sicheritz-Ponten, Thomas, PLA University of Science and Technology, Department of Biological Statistics and Computational Biology, Cornell University, Section of Biostatistics [Copenhagen], Department of Public Health [Copenhagen], Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU), University of Tartu, Medical Research Council, Centre for Outbreak Analysis and Modelling (MRC), Imperial College Faculty of Medicine, Leverhulme Centre for Human Evolutionary Studies University of Cambridge, University of Cambridge [UK] (CAM), Swedish Institute of Space Physics [Uppsala] (IRF), Section for GeoGenetics, Globe Institute, Center for Biological Sequence Analysis, Technical University of Denmark [Lyngby] (DTU), Department of Veterinary Medicine, University of Cambridge, Cambridge, UK, Centre d'économie industrielle i3 (CERNA i3), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-PSL Research University (PSL)-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris, Interaction virus-hôte et maladies du foie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Center for Human and Clinical Genetics, Leiden University Medical Center (LUMC), Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Southern Denmark (SDU), University of Edinburgh, UMR 6578 : Adaptabilité Biologique et Culturelle (UAABC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Dept Integrat Biol, Chinese Academy of Agricultural Mechanization Sciences (CCCME), Laboratoire sols, solides, structures - risques [Grenoble] (3SR), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Service de Médecine interne A et polyclinique médicale [CHU Limoges], CHU Limoges, Department of Pathology [Stanford], Stanford Medicine, Stanford University-Stanford University, Medical Research Council Centre for Outbreak Analysis and Modelling, Imperial College London-Faculty of Medicine-Department of Infectious Disease Epidemiology, State Key Laboratory for Mineral Deposits Research, Nanjing University (NJU), Department of Human Genetics, University of Michigan [Ann Arbor], University of Michigan System-University of Michigan System, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Anthropologie Moléculaire et Imagerie de Synthèse (AMIS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Biology [Copenhagen], Faculty of Science [Copenhagen], Center for Biological Sequence Analysis [Lyngby], Department of Physics, University of Sussex, UMR 6578 : Anthropologie Bio-Culturelle (UAABC), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), State Key Laboratory of Lithospheric Evolution (SKL), Institute of Geology and Geophysics [Beijing] (IGG), Chinese Academy of Sciences [Beijing] (CAS)-Chinese Academy of Sciences [Beijing] (CAS), Stanford University [Stanford], Nanjing University of Science and Technology (NJUST), Cornell University [New York], Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH)-Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universiteit Leiden-Universiteit Leiden, Danmarks Tekniske Universitet = Technical University of Denmark (DTU), and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, Male, MESH: Sequence Analysis, DNA, Native Hawaiian or Other Pacific Islander, MESH: Emigration and Immigration, [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, Ethnic group, 01 natural sciences, Linkage Disequilibrium, Gene flow, Gene Frequency, MESH: Hominidae, Ethnicity, MESH: Animals, MESH: Phylogeny, Phylogeny, Genetics, 0303 health sciences, education.field_of_study, Multidisciplinary, MESH: Asian Continental Ancestry Group, biology, Asia, Eastern, MESH: Asia, MESH: Polymorphism, Single Nucleotide, New guinea, Hominidae, MESH: European Continental Ancestry Group, Emigration and Immigration, Human evolution, MESH: Linkage Disequilibrium, Ethnology, MESH: Ethnic Groups, MESH: Genome, Mitochondrial, MESH: Oceanic Ancestry Group, Gene Flow, Asia, Population, Black People, MESH: Genetics, Population, 010603 evolutionary biology, DNA, Mitochondrial, Polymorphism, Single Nucleotide, White People, Article, 03 medical and health sciences, Asian People, MESH: Computer Simulation, MESH: Gene Frequency, MESH: Western Australia, Animals, Humans, East Asia, Computer Simulation, education, MESH: Gene Flow, MESH: Genome, Human, 030304 developmental biology, MESH: Humans, [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], Genome, Human, MESH: DNA, Mitochondrial, Sequence Analysis, DNA, Western Australia, MESH: Haplotypes, biology.organism_classification, MESH: Far East, MESH: Male, Genetics, Population, Haplotypes, Genome, Mitochondrial, Biological dispersal, MESH: African Continental Ancestry Group
Abstract: International audience; We present an Aboriginal Australian genomic sequence obtained from a 100-year-old lock of hair donated by an Aboriginal man from southern Western Australia in the early 20th century. We detect no evidence of European admixture and estimate contamination levels to be below 0.5%. We show that Aboriginal Australians are descendants of an early human dispersal into eastern Asia, possibly 62,000 to 75,000 years ago. This dispersal is separate from the one that gave rise to modern Asians 25,000 to 38,000 years ago. We also find evidence of gene flow between populations of the two dispersal waves prior to the divergence of Native Americans from modern Asian ancestors. Our findings support the hypothesis that present-day Aboriginal Australians descend from the earliest humans to occupy Australia, likely representing one of the oldest continuous populations outside Africa.
Published: 2011

36. Evolutionary history of hepatitis C virus genotype 5a in France, a multicenter ANRS study

Author: Juliette Foucher, Ghassan Riachi, Sophie Vallet, Julien Guglielmini, Hélène Le Guillou-Guillemette, Arielle R. Rosenberg, Sophie Alain, Jacques Izopet, Evelyne Schvoerer, Véronique Loustaud-Ratti, Cécile Henquell, Hélène Peigue-Lafeuille, Philippe Podevin, Henri Coppere, Armand Abergel, Vincent Thibault, Dominique Roulot, Syria Laperche, Elisabeth André, Jean-Luc Bailly, Jean-Christophe Plantier, Sophie Metivier, Catherine Gaudy, Rafael Juan Pérez-Serra, Olivier Garraud, Jannick Verbeeck, Marc Van Ranst, Jérôme Gournay, Cyrille Feray, Antoine Mahul, Isabelle Fouchard-Hubert, Florence Legrand-Abravanel, Gilles Bommelaer, Audrey Mirand, Pascale Trimoulet, Henia Saoudin, Jean-Baptiste Nousbaum, Hélène Odent-Malaure, Yazid Baazia, Pascal Lebray, Louis d’Alteroche, Samir Gourari, François Habersetzer, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique et Physiologie bactériennes [Gosselies], Université libre de Bruxelles (ULB), Laboratory of Clinical Virology, Rega Institute for Medical Research, Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Laboratoire d'Informatique, de Modélisation et d'optimisation des Systèmes (LIMOS), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Ecole Nationale Supérieure des Mines de St Etienne-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Paris, Centre National de Référence Virus des hépatites B, C et Delta, Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Bordeaux [Bordeaux], Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service de Gastro-entérologie - Hépatologie [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse], Service de bactériologie-virologie [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Service de Virologie [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire de Biologie Cellulaire, UPRES 1833, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Groupe Immunité des Muqueuses et Agents Pathogènes (GIMAP), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), Institute of Computer Science - University of Augsburg (ICS), Universität Augsburg [Augsburg], Service d'hépato-gastro-entérologie, Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), Service de gastroenterologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Service de bactériologie-Virologie-Hygiène [Avicenne], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Université de Limoges (UNILIM), Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Laboratoire de Virologie, CHU Strasbourg, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Epidémiologie et pathogénie des infections à entérovirus (EPIE), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Etablissement Français du Sang (EFS), EFS, VIROLOGIE, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratory of Clinical and Epidemiological Virology, Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)-Rega Institute for medical research, Service d'Hépatogastroentérologie, Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Ecole Nationale Supérieure des Mines de St Etienne-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, CHU Saint-Eloi, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Ecole Nationale Supérieure des Mines de St Etienne (ENSM ST-ETIENNE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pôle Maladies de l'appareil digestif [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM), Laboratoire Virologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris 13 (UP13)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Libre de Bruxelles [Bruxelles] (ULB), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Sigma CLERMONT (Sigma CLERMONT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure des Mines de St Etienne, Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP], Service d'Hépato-Gastroentérologie [Rouen], Hôpital Hôtel-Dieu [Paris]-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Avicenne, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Jean Verdier [Bondy], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)
Subjects: Microbiology (medical), Adult, Male, Genotype, Population, Molecular Sequence Data, Mutation, Missense, Hepacivirus, Microbiology, Coalescent theory, Evolution, Molecular, 03 medical and health sciences, Flaviviridae, 0302 clinical medicine, Viral Envelope Proteins, Phylogenetics, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Genetics, Prevalence, Humans, education, Molecular clock, Molecular Biology, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Phylogeny, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Aged, 0303 health sciences, education.field_of_study, Cross Infection, biology, Molecular epidemiology, Phylogenetic tree, Transfusion Reaction, Bayes Theorem, Middle Aged, biology.organism_classification, Virology, Hepatitis C, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, France
Abstract: The epidemic history of HCV genotype 5a is poorly documented in France, where its prevalence is very low, except in a small central area, where it accounts for 14.2% of chronic hepatitis C cases. A Bayesian coalescent phylogenetic investigation based on the E1 envelope gene and a non-structural genomic segment (NS3/4) was carried out to trace the origin of this epidemic using a large sample of genotype 5a isolates collected throughout France. The dates of documented transmissions by blood transfusion were used to calibrate five nodes in the phylogeny. The results of the E1 gene analysis showed that the best-fitting population dynamic model was the expansion growth model under a relaxed molecular clock. The rate of nucleotide substitutions and time to the most recent common ancestors (tMRCA) of genotype 5a isolates were estimated. The divergence of all the French HCV genotype 5a strains included in this study was dated to 1939 [95% HPD: 1921–1956], and the tMRCA of isolates from central France was dated to 1954 [1942–1967], which is in agreement with epidemiological data. NS3/4 analysis provided similar estimates with strongly overlapping HPD values. Phylodynamic analyses give a plausible reconstruction of the evolutionary history of HCV genotype 5a in France, suggesting the concomitant roles of transfusion, iatrogenic route and intra-familial transmission in viral diffusion.
Published: 2011

37. Hepatitis B Virus Core Variants, Liver Fibrosis, and Hepatocellular Carcinoma

Author: Catherine Schuster, Thomas Baumert, Gaëtan Ligat, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Université de Strasbourg (UNISTRA), Interaction virus-hôte et maladies du foie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pôle hépato-digestif [Strasbourg], Nouvel Hôpital Civil, Hospices Civils de Strasbourg-Institut Hospitalo-Universitaire de strasbourg, Institut Universitaire de France (IUF), Ministère de l'Education nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (M.E.N.E.S.R.), The authors acknowledge support by the European Union (ERC-2014-AdG-671231-HEPCIR, EU-H2020-667273- HEPCAR), ANRS (15/1099), ARC (IHU201301187), ANR (Laboratoire d’Excellence HEPSYS ANR-10-LAB-28 and Infect- ERA hepBccc) and the National Institutes of Health (NIAID U19AI123862-01, NIAID R03AI131066, NCI R21CA209940)., ANR-10-IDEX-0002,UNISTRA,Functional genomics of viral hepatitis and liver disease(2010), European Project: 667273,H2020,H2020-PHC-2015-two-stage,HEP-CAR(2016), ANR-10-IDEX-0002,UNISTRA,Par-delà les frontières, l'Université de Strasbourg(2010), Baumert, Thomas F., Initiative d'excellence - Par-delà les frontières, l'Université de Strasbourg - - UNISTRA2010 - ANR-10-IDEX-0002 - IDEX - VALID, Mechanisms underlying hepatocellular carcinoma pathogenesis and impact of co-morbidities. - HEP-CAR - - H20202016-01-01 - 2019-12-31 - 667273 - VALID, ANR-10-LABX-0028,HepSys,Functional genomics of viral hepatitis and liver disease(2010), ANR-13-IFEC-0006,hepBccc,Host factors in hepatitis B virus cccDNA formation as novel antiviral targets and biomarkers - identification, preclinical evaluation and impact for liver disease.(2013), and European Project: 671231,H2020,ERC-2014-ADG,HEPCIR(2016)
Subjects: Adult, Liver Cirrhosis, Hepatitis B virus, Carcinoma, Hepatocellular, Adolescent, Genotype, Liver fibrosis, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, medicine.disease_cause, Article, Young Adult, 03 medical and health sciences, Hepatitis B, Chronic, 0302 clinical medicine, Carcinoma, medicine, Humans, Child, Indigenous Peoples, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Hepatology, business.industry, Hepatitis B virus core, Liver Neoplasms, Infant, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Middle Aged, Hepatitis B, medicine.disease, Virology, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, 3. Good health, Child, Preschool, 030220 oncology & carcinogenesis, Hepatocellular carcinoma, Mutation (genetic algorithm), Mutation, business, Alaska
Abstract: Hepatitis B virus (HBV) genotype F1b infection is strongly associated with hepatocellular carcinoma (HCC) in young Alaskan Native (AN) people. However, the mechanisms by which genotype F1b causes HCC are unclear. Here, we analyzed the clinical and virological significance of genotype F1b in long-term serial samples from 20 HCC patients with HBV infection. Complete sequence analyses revealed that all isolates were genotype F1b. In the HCC patients, T1938C and A2051C mutations in the core region had accumulated significantly with A1762T/G1764A mutations in the basal core promoter (BCP) region and G1896A mutation in the precore (PC) region. Several HBV clones containing the core mutations were examined for their replication efficiency and core stability in vitro. Clones containing the A2051C mutation replicated more efficiently than the wild type in association with enhanced stability of core protein dimerization. In chimeric mice with human hepatocytes carrying BCP/PC/2051 mutant but not with wild-type virus, liver fibrosis was induced in association with high levels of serum HBV DNA and hepatitis B surface antigen. Interestingly, microarray analysis and validation study showed that five genes associated with cell proliferation or carcinogenesis, v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene homolog, Grb2-associated binding protein 2, bradykinin receptor B2, follistatin, and mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, were significantly up-regulated in human hepatocytes infected with genotype F1b, particularly the BCP/PC/2051 mutant, compared with other genotypes. Conclusion: We have identified an association between Alaska-specific core mutations and HCC development in AN people infected with genotype F1b; accumulation of these core mutations during the course of chronic infection with genotype F1b would contribute to HCC development in AN people earlier in life.
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38. Hepatitis C Virus-Induced Upregulation of MicroRNA miR-146a-5p in Hepatocytes Promotes Viral Infection and Deregulates Metabolic Pathways Associated with Liver Disease Pathogenesis

Author: Sarah C. Durand, Catherine Schuster, Tao Ye, Emilie Crouchet, Patrick Pessaux, Christine Thumann, Sophie Pernot, I. Fofana, Simonetta Bandiera, Markus H. Heim, Marine A. Oudot, Jochen Barths, Hussein El Saghire, Thomas F. Baumert, Mirjam B. Zeisel, Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Maladies Virales et Hépatiques, inserm U1110, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques (IVH), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Nanterre - UFR Sciences sociales et administration (UPN SSA), Université Paris Nanterre (UPN), Interaction virus-hôte et maladies du foie, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Strasbourg, and University Hospital Basel [Basel]
Subjects: Adult, Male, Transcriptional Activation, 0301 basic medicine, Carcinoma, Hepatocellular, Hepatitis C virus, Viral pathogenesis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, Hepacivirus, Biology, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, Chronic liver disease, medicine.disease_cause, Microbiology, Pathogenesis, 03 medical and health sciences, Liver disease, Virology, medicine, Humans, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Gene Expression Profiling, Liver cell, Liver Neoplasms, High-Throughput Nucleotide Sequencing, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Hepatitis C, Middle Aged, medicine.disease, digestive system diseases, Virus-Cell Interactions, Up-Regulation, 3. Good health, MicroRNAs, 030104 developmental biology, Insect Science, Host-Pathogen Interactions, Hepatocytes, Female, Liver cancer, Biomarkers, Metabolic Networks and Pathways, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Hepatitis C virus (HCV)-induced chronic liver disease is a leading cause of hepatocellular carcinoma (HCC). However, the molecular mechanisms underlying HCC development following chronic HCV infection remain poorly understood. MicroRNAs (miRNAs) play an important role in homeostasis within the liver, and deregulation of miRNAs has been associated with liver disease, including HCC. While host miRNAs are essential for HCV replication, viral infection in turn appears to induce alterations of intrahepatic miRNA networks. Although the cross talk between HCV and liver cell miRNAs most likely contributes to liver disease pathogenesis, the functional involvement of miRNAs in HCV-driven hepatocyte injury and HCC remains elusive. Here we combined a hepatocyte-like cell-based model system, high-throughput small RNA sequencing, computational analysis, and functional studies to investigate HCV-miRNA interactions that may contribute to liver disease and HCC. Profiling analyses indicated that HCV infection differentially regulated the expression of 72 miRNAs by at least 2-fold, including miRNAs that were previously described to target genes associated with inflammation, fibrosis, and cancer development. Further investigation demonstrated that the miR-146a-5p level was consistently increased in HCV-infected hepatocyte-like cells and primary human hepatocytes, as well as in liver tissue from HCV-infected patients. Genome-wide microarray and computational analyses indicated that miR-146a-5p overexpression modulates pathways that are related to liver disease and HCC development. Furthermore, we showed that miR-146a-5p has a positive impact on late steps of the viral replication cycle, thereby increasing HCV infection. Collectively, our data indicate that the HCV-induced increase in miR-146a-5p expression both promotes viral infection and is relevant for pathogenesis of liver disease. IMPORTANCE HCV is a leading cause of chronic liver disease and cancer. However, how HCV induces liver cancer remains poorly understood. There is accumulating evidence that a viral cure does not eliminate the risk for HCC development. Thus, there is an unmet medical need to develop novel approaches to predict and prevent virus-induced HCC. miRNA expression is known to be deregulated in liver disease and cancer. Furthermore, miRNAs are essential for HCV replication, and HCV infection alters miRNA expression. However, how miRNAs contribute to HCV-driven pathogenesis remains elusive. Here we show that HCV induces miRNAs that may contribute to liver injury and carcinogenesis. The miR-146a-5p level was consistently increased in different cell-based models of HCV infection and in HCV patient-derived liver tissue. Furthermore, miR-146a-5p increased HCV infection. Collectively, our data are relevant to understanding viral pathogenesis and may open perspectives for novel biomarkers and prevention of virus-induced liver disease and HCC.
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39. Plasmodium P36 determines host cell receptor usage during sporozoite invasion

Author: Manzoni, Giulia, Marinach, Carine, Topçu, Selma, Briquet, Sylvie, Grand, Morgane, Tolle, Matthieu, Gransagne, Marion, Lescar, Julien, Andolina, Chiara, Franetich, Jean-François, Zeisel, Mirjam B, Huby, Thierry, Rubinstein, Eric, Snounou, Georges, Mazier, Dominique, Nosten, François, Baumert, Thomas F, Silvie, Olivier, Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Nuffield (Nuffield), University of Oxford [Oxford], Shoklo Malaria Research Unit [Mae Sot, Thailand] (SMRU), Mahidol Oxford Tropical Medicine Research Unit (MORU), Wellcome Trust-Mahidol University [Bangkok]-University of Oxford [Oxford]-Wellcome Trust-Mahidol University [Bangkok]-University of Oxford [Oxford], Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition (ICAN), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Modèles de Cellules Souches Malignes et Thérapeutiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut André Lwoff - Biologie intégrée de la cellule, virus et cancer (IALBICVC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Hépatogastroentérologie, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Oxford, University of Oxford-Mahidol University [Bangkok]-Wellcome Trust-University of Oxford-Mahidol University [Bangkok]-Wellcome Trust, Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases (ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), and HAL UPMC, Gestionnaire
Subjects: Plasmodium, Mouse, QH301-705.5, Science, malaria, P. berghei, P. falciparum, Host-Parasite Interactions, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, parasitic diseases, hepatocyte, Animals, sporozoite, P. vivax, Parasites, [SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, Biology (General), Microbiology and Infectious Disease, P. yoelii, Sporozoites, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Hepatocytes, Medicine, Other, [SDV.MP.PAR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, Research Article, Human
Abstract: Plasmodium sporozoites, the mosquito-transmitted forms of the malaria parasite, first infect the liver for an initial round of replication before the emergence of pathogenic blood stages. Sporozoites represent attractive targets for antimalarial preventive strategies, yet the mechanisms of parasite entry into hepatocytes remain poorly understood. Here we show that the two main species causing malaria in humans, Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax, rely on two distinct host cell surface proteins, CD81 and the Scavenger Receptor BI (SR-BI), respectively, to infect hepatocytes. By contrast, CD81 and SR-BI fulfil redundant functions during infection by the rodent parasite P. berghei. Genetic analysis of sporozoite factors reveals the 6-cysteine domain protein P36 as a major parasite determinant of host cell receptor usage. Our data provide molecular insights into the invasion pathways used by different malaria parasites to infect hepatocytes, and establish a functional link between a sporozoite putative ligand and host cell receptors. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.25903.001, eLife digest Malaria is an infectious disease that affects millions of people around the world and remains a major cause of death, especially in Africa. It is caused by Plasmodium parasites, which are transmitted by mosquitoes to mammals. Once in the mammal, the parasites infect liver cells, where they multiply. Previous studies have suggested that proteins on the surface of the liver cells and on the parasite affect how Plasmodium infects liver cells. Understanding how these proteins enable the parasites to enter the cells may help researchers to develop treatments that interrupt the parasite life cycle and prevent infection. Manzoni et al. have now investigated how different malaria parasite species interact with liver cells. The main parasite species that infect humans are Plasmodium falciparum in Africa and Plasmodium vivax outside Africa. Manzoni et al. found that P. falciparum and P. vivax infect human liver cells by two different routes: P. falciparum interacts with a liver cell protein called CD81, and P. vivax interacts with a liver cell protein called SR-BI. Further experiments that used mutant forms of malaria parasites that infect mice showed that a parasite protein called P36 determines which liver cell protein the parasite will interact with. The next step is to understand how P36 interacts with the liver cell proteins and to identify other parasite proteins that help Plasmodium to invade cells. In the future, such knowledge may help to develop a highly effective malaria vaccine. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.25903.002
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40. Reply: Intratumor fibrotic HCC, a subtype matching the Hoshida S1 subclass?

Author: Désert R, Foucher F, Guillout M, Nieto N, and Musso O
Subjects: Humans, Mutation, Carcinoma, Hepatocellular pathology, Liver Neoplasms pathology
Published: 2024
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