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BackgroundPork is of great importance in world trade and represents the largest source of fatty acids in the human diet. Lipid sources such as soybean oil (SOY), canola (CO), and fish oil (FO) are used in pig diets and influence blood parameters and the ratio of deposited fatty acids. Scientific studies that improve our nutrigenomic knowledge about pig and human health through the consumption of pork are of great importance. In this study, the main objective was to evaluate changes in gene expression in porcine skeletal muscle tissue resulting from the dietary oil sources and to identify metabolic pathways and biological process networks through RNA-Seq.ResultsThe addition of FO in the diet of pigs led to intramuscular lipid with a higher FA profile composition of C20:5 n-3, C22:6 n-3, and SFA (C16:0 and C18:0). Blood parameters for the FO group showed lower cholesterol and HDL content compared with CO and SOY groups. Skeletal muscle transcriptome analyses revealed 65 differentially expressed genes (DEG, FDR 10%) between CO vs SOY, and 531 DEG for SOY vs FO comparison, and 32 DEG for CO vs FO. The enrichment analysis of the DEG lists revealed lipid metabolism, metabolic diseases, and inflammation processes networks, such as "regulation of lipid metabolism: RXR-dependent regulation of lipid metabolism via PPAR, RAR and VDR", “transport HDL-mediated reverse cholesterol transport”, and "TNF- α , IL-1 β induce dyslipidemia and inflammation in obesity and type 2 diabetes in adipocytes". ConclusionThe genes identified in this study provided relevant information on biological processes and lipid metabolism pathways. The enrichment of the basal diet with oil containing different FA profiles influenced fatty acid composition of intramuscular fat, blood parameters, and the gene differential expression in metabolic pathways and processes network in skeletal muscle of pigs. The results provide mechanisms to help us understand the behavior of genes according to fatty acids.

Brewer's spent yeast (BSY)

Brewer's spent yeast (BSY) Saccharomyces cerevisiae has been explored as a bio-vehicle for the encapsulation of bioactive compounds and as a delivery system.

Processed meat products have been increasingly consumed, a highlight being dried-cured coppa, commonly purchased sliced, making it more susceptible to bacterial deterioration and lipid oxidation. The aim of this work was to produce and apply bi-layers films based on gelatin (in both layers) with addition of nisin and/or Pitanga leaf hydroethanolic extract (PLHE) only in the food contact thinner layer, in order to evaluate their effect on the refrigerated storage of sliced dried-cured coppa. Dried-cured coppa slices covered with active films were vacuum-packaged and stored under refrigeration for 120 days. Every 30 days, samples were tested for moisture content, water activity, pH, color parameters, lipid oxidation by TBARS and peroxide index methods, and microbiological analysis. The different film formulations presented no influence on the water activity, pH and color parameters of sliced dried-cured coppa. However, they significantly affected moisture content, bacterial count and lipid oxidation. The addition of both active compounds - nisin and PLHE - in the food contact thinner layer was observed to have the most favorable effect.

A population of 370 European-Zebu composite beef heifers, consisting of six different breed compositions (A-F), were characterized genetically, using RFLP markers of luteinizing hormone receptor (LHR) and follicle-stimulating hormone receptor (FSHR) genes. Our objectives were to genetically characterize this population and to determine the structure and the genetic variability of this hybrid herd. The genotypes were determined through PCR, followed by digestion with restriction endonucleases. The PCR-RFLP analysis made it possible to identify the LHR and FSHR genotypes, as well as to characterize the degree of heterozygosis, which was high for all of the breed compositions, for both loci, except for two combinations for LHR (B and C). The observed heterozygosity (Ho) was lower than the expected heterozygosity (He) for compositions C (for LHR) and A and D (for FSHR); however, for the population as a whole, Ho was above He (with a mean of 57 versus 46%, respectively), reflecting the elevated genetic variability in this population and also the informative value of the RFLP markers, which could be useful for population genetic characterization studies. The analysis of the degree of genetic structure of this population, estimated by the Nei's statistic, for both loci, indicated an elevated total genetic diversity (HT = 47%), with most of this variability being due to intrapopulational diversity (HS = 46%), with a low degree of genetic differentiation among the six breed compositions (GST = 1.2%). The estimates generated by the Wright's F statistic indicated a non-endogamic population, with excess heterozygotes (FIT = -0.22), which was also observed at the intrapopulational level (FIS = -0.23). The results gave evidence that the genetic selection applied to this European-Zebu composite population did not affect the expected high genetic variability for this type of crossbreeding, which makes it possible to use these animals to obtain economically valuable productive and reproductive traits.

A obesidade felina é uma afecção cada vez mais recorrente e pode implicar no desenvolvimento de diversas comorbidades, tais como resistência insulínica, diabetes, hiperlipidemia e disbiose. A composição da dieta pode influenciar nos parâmetros glicêmicos, lipidêmicos, saciedade e na microbiota de animais obesos com resistência insulínica. Um exemplo de aditivo que pode ser utilizado com este propósito são os beta-glucanos (BG), que podem diminuir as concentrações séricas de colesterol, triglicérides, glicemia pós-prandial e aumentar a saciedade. Além de ter potencial prebiótico e poder modular a saúde intestinal através da microbiota. O objetivo do presente estudo foi avaliar os efeitos da inclusão de 0,06% de BG na dieta de gatos obesos e em escore de condição corporal (ECC) sobre a microbiota retal. Foram selecionados 20 gatos, machos e fêmeas, SRD, com idades entre 1 e 7 anos, na rotina de uma clínica veterinária particular. Os animais foram divididos em dois grupos: Grupo obeso [(OB), ECC 8 e 9/9, gordura corporal média de 28,8 ± 7,9%; determinada pelo método de diluição de isótopos de deutério] e grupo controle [(CO) ECC 5/9 e gordura corporal média de 17,4 ± 6,6%]. Todos os animais foram alimentados por 21 dias (T0) com um alimento controle (AC - 0,0% de BG) e depois por 90 dias (T90) com um alimento teste (AT - mesma composição do AC, porém com adição de 0,06% de BG). Amostras de sangue e swab retal foram coletadas em T0 e T90 para avaliação da microbiota e do perfil metabolômico (cromatografia gasosa acoplada à espectrometria de massas). O DNA total foi extraído das fezes e estas foram sequenciadas pela metodologia Illumina. As abundâncias observadas foram avaliadas usando um modelo linear generalizado, considerando distribuição binomial e usando a função de link logit, a comparação entre os grupos e o efeito da dieta foi realizado pelo teste ANOVA com medidas repetidas no tempo no SAS. Não foi encontrada diferença entre os índices de alfa e beta diversidade levantados nesse estudo. Não foi observado efeito principal de tratamento (entre os grupos OB x GC; p >0,05), houve efeito principal de tempo (efeito da suplementação de beta glucano T0 x T90; p 0.05), there was a time main effect (effect of T0 x T90 beta glucan supplementation; p

A doença renal crônica (DRC) é a enfermidade mais comum que acomete gatos e é caracterizada pela progressiva redução do número de néfrons funcionais. Com o avanço da doença, os animais podem apresentar manifestações clínicas mais evidentes, conhecida como síndrome urêmica. O presente estudo objetivou avaliar os efeitos de um alimento coadjuvante renal com 37,77% de proteína e 0,51% de fósforo na matéria seca, no perfil aminoacídico plasmático e urinário, composição corporal, peso corporal (PC), escore de massa muscular (EMM) e escore de condição corporal (ECC) de gatos com DRC. O estudo foi conduzido utilizando um total de 25 gatos provenientes dos gatis do Centro de Desenvolvimento Nutricional da PremieR pet ® (CDN) e do Centro de Pesquisa em Nutrologia de Cães e Gatos (CEPEN pet/FMVZ-USP). Dez gatos saudáveis, seis gatos com DRC no estádio 1 e nove gatos com DRC no estádio 2 foram alimentados por 30 dias com um alimento comercial recomendado para gatos com mais de 12 anos de idade. No dia 0 (T0) passaram a receber o alimento teste até o dia 60 (T60). As variáveis do hemograma; concentrações séricas de creatinina, nitrogênio não ureico (BUN), cálcio total, fósforo total, sódio, potássio, cloro, proteína total, albumina, triglicérides e colesterol; atividade sérica das enzimas fosfatase alcalina (FA), alanina aminotransferase (ALT), gama glutamil transferase (GGT); PC, ECC e EMM foram determinadas no início (T0) e após 30 (T30) e 60 dias ao tempo zero (T60). A concentração sérica de dimetilarginina simétrica (SDMA), concentração plasmática e urinária de aminoácidos e a avaliação da composição corporal foram determinadas no início (T0) e ao final do estudo (T60). Todas as variáveis foram analisadas considerando um modelo linear misto geral que contemplou os efeitos fixos de grupo, momentos e interação grupos versus momento, além dos efeitos aleatórios de animal dentro de grupo, classe de idade, raça e resíduo. Quando houve diferença entre as médias foi realizado o teste de Tukey (p

Embora os custos da genotipagem tenham diminuído ao longo dos últimos anos, em cavalos, chips comerciais ainda apresentam um preço elevado e, atualmente, há no mercado apenas duas alternativas disponíveis. Com efeito, o número de cavalos genotipados nos estudos publicados é baixo e, em geral, os pesquisadores encontram problemas quanto a representatividade das populações por parte dos animais genotipados. Assim, o objetivo do presente trabalho foi propor estratégias de genotipagem em populações de cavalos não genotipadas, prospectando, antes de investimentos financeiros, quais os melhores métodos para seleção genômica nesta espécie. Foi utilizada como material de estudo, a população de cavalos Campolina. Inicialmente um estudo sobre os fundadores, bem como a formação de linhagens no pedigree foi conduzido. Para tanto, foi utilizada análise de componentes principais e conseguiu-se determinar a ocorrência de três linhagens fundadoras na população recente desta raça. Além disso foi conduzido um estudo de redução de posto, no qual testaram-se 19 modelos sendo nove modelos de componentes principais; nove modelos fatores analíticos e um modelo multicaracterística padrão. Em abordagem frequentista, via máxima verossimilhança restrita em algoritmo de informação média, pôde-se determinar que o melhor modelo é um modelo fator analítico com cinco fatores. Foi ainda empregado um estudo utilizando análise confirmatória de fatores para determinar como as características mensuradas na população Campolina se combinam e quais os efeitos causais entre as características latentes que, de fato, causam os fenótipos observáveis. Como resultados, a qualidade morfológica tem um efeito causal sobre a morfologia que, por sua vez, tem um efeito causal sobre o andamento. A partir destes resultados, um estudo com modelos recursivos bem como estruturais permitiu concluir como os atributos de andamento se interconectam causando uns aos outros para criar a pontuação total de andamento. Por fim, um estudo com dados simulados foi feito. Para tanto foram simulados três cenários com diferentes estruturas populacionais e quatro características. Foram então testadas seis diferentes estratégias de genotipagem juntamente quatro diferentes modelos estatísticos para predições genômicas. Houve efeito significativo da interação entre característica e cenário, bem como da interação entre característica e estratégia de genotipagem sobre a acurácia de predição do valor genômico. Sobre a porcentagem de viés, houve efeito significativo apenas da estratégia de genotipagem. No tocante a modelos, os métodos em passo único foram mais acurados e menos viesados tanto para características contínuas quanto para binárias. Futuras implementações de seleção genômica em cavalos deveriam considerar a amostragem de animais com o maior número de progênies para genotipagem, implementando modelos de passo único semi-paramétricos para as predições genômicas. Although genotyping costs have decreased over the last few years, in horses, commercial chips still carry a high price and, currently, there are only two alternatives available on the market. In fact, the number of genotyped horses in the published studies is low and, in general, researchers find problems regarding the representativeness of populations by the genotyped animals. Thus, the aim of the present work was to propose genotyping strategies in non-genotyped horse populations, prospecting, before financial investments, which are the best methods for genomic selection in this species. The Campolina horse population was used as study material. Initially a study on the founders as well as the formation of pedigree lines was conducted. Therefore, principal component analysis was used, and it was possible to determine the occurrence of three founder lines in the recent population of this breed. In addition, a study of rank reduction was conducted, in which 19 models were tested, being nine models of principal components; nine factor analytic models and one standard multi-trait model. In a frequentist approach, through restricted maximum likelihood in an average information algorithm, was found best model is a factor-analytic model with five common factors. A study using confirmatory factor analysis was also employed to determine how measured traits in the Campolina population are combined and what causal effects among latent traits causes the observable phenotypes. As a result, morphological quality has a causal effect on morphology which, in turn, has a causal effect on gait. From these results, a study with recursive as well as structural equation models allowed to conclude how the gait attributes interconnect causing each other to create the total gait score. Finally, a study with simulated data was carried out. For this, three scenarios with different population structures and four traits were simulated. Six different genotyping strategies were then tested along with four different statistical models for genomic predictions. There was a significant effect of the interaction between trait and scenario, as well as the interaction between trait and genotyping strategy on prediction accuracy. On the percentage of bias, there was only a significant effect of the genotyping strategy. About models, the single-step methods were more accurate and less biased for both continuous and binary traits. Future implementations of genomic selection in horses should consider sampling animals with the largest number of progenies for genotyping, implementing semi-parametric single-step models for genomic predictions.

Os estudos proteômicos têm alcançado destaque na área de produção animal, visando um melhor entendimento dos mecanismos biológicos que levam a um produto final de qualidade. Diversos fatores influenciam na qualidade final da carne bovina, entre eles, destaca-se a condição sexual. Animais não castrados apresentam carcaça mais magra, carne mais escura, menos macia e de pior palatabilidade em relação aos animais castrados. O presente estudo teve como objetivos: (i) caracterizar o perfil proteico da carne de bovinos Nelore castrados e não castrados; (ii) comparar o perfil proteico da carne entre animais castrados e não castrados, identificando as proteínas diferencialmente abundantes; (iii) realizar associação entre as proteínas diferencialmente abundantes e as características físico-químicas, metabólicas, bioquímicas e maciez objetiva da carne; e por fim, (iv) identificar possíveis mecanismos moleculares envolvidos nas diferenças entre animais castrado e não castrado. As análises das características de qualidade e metabólitos da carne foram realizadas em uma população de 242 bovinos da raça Nelore, sendo 122 castrados e 120 não castrados. O perfil proteico da carne foi avaliado, por meio de proteômica quantitativa livre de gel e livre de marcadores (“label-free ”), em amostras coletadas 24 horas após o abate de 6 animais castrados e 6 animais não castrados. Foram identificadas 605 proteínas no total, sendo 330 foram comuns para animais castrados e não castrados, 139 foram encontradas apenas em animais castrados e 136 apenas em animais não castrados. Foram identificadas 21 proteínas diferencialmente abundantes (DAP) entre as condições sexuais. Cinco proteínas foram encontradas apenas nos animais castrados e presentes em, pelo menos, cinco das seis amostras biológicas. Duas proteínas foram encontradas apenas nos animais não castrados e presentes em, pelo menos, cinco das seis amostras biológicas. Proteomic studies have achieved prominence in the area of animal production, aiming at a better understanding of the biological mechanisms that lead to a quality end product. Several factors influence the final quality of beef, among them, the sexual condition stands out. Non-castrated animals have thinner carcass, darker, less tender meat and worse palatability than castrated animals. The present study aims to: (i) characterize the protein profile of Meat from steers and intact Nellore male cattle; (ii) compare the meat protein profile from steers and intact Nellore male cattle to identify differentially abundant proteins; (iii) make an association between differentially abundant proteins and meat quality and metabolite traits; and finally (iv) identify possible molecular pathways involved with the sexual condition. The meat quality and metabolites traits analysis were performed in a population of 241 Nellore cattle, being 122 castrated and 120 non-castrated. The muscle protein profile was evaluated from samples collected 24 hours after slaughter of 6 steers and 6 intact animals by “label-free ” quantitative gel free proteomics. A total of 605 proteins were identified, of which 330 were common for both steers and intact animals, 139 were found only in steers and 136 only in intact animals. We identified 21 differentially abundant proteins (DAP) between sexual conditions. Five proteins were considered exclusive for steers animals and present, at least, for five of six biological samples. Two other proteins were considered exclusive in intact animals and present, at least, for five of the six biological samples.

Beta-glucanos são polissacarídeos que podem melhorar diversas alterações metabólicas e de saciedade consequentes à obesidade. O objetivo do presente estudo foi avaliar os efeitos da inclusão de 0,06% de beta-glucanos na dieta de gatos obesos em parâmetros do metabolismo de carboidratos e lipídeos, indicadores de resistência insulínica, citocinas inflamatórias, parâmetros de saciedade e coeficiente de digestibilidade aparente (CDA) dos nutrientes. Nove gatos diagnosticados com obesidade não-induzida [(grupo obeso OB) escore de condição corporal (ECC) 8-9 /9] e nove gatos não obesos [(Grupo controle CO) ECC 5/9] foram alimentados por 15 dias (T0) com a dieta controle (0,0% de beta-glucanos) e depois por 90 dias (T90) com a dieta teste (0,06% de beta-glucanos). Amostras de sangue foram coletadas em T0 e T90 para avaliação do índice HOMA (insulina basal x glicemia basal/22,5), concentrações plasmáticas de triglicerídeos, colesterol e lipoproteínas (por método enzimático-colorimétrico e cromatografia líquida para separação rápida de proteínas FPLC), anandamida (por ELISA), frutosamina (por ensaio colorimétrico cinético), amilina, interleucina 10 (IL-10), grelina e peptídeo semelhante ao glucagon 1 (GLP-1) (por reação em cadeia de polimerase em tempo real quantitativo). A composição corporal também foi avaliada no início e final do estudo pelo método de diluição de isótopos de deutério. Foram utilizados sete gatos do centro de pesquisa para a determinação do CDA das dietas, pelo método de coleta total de fezes. Para avaliar a comparação entre os grupos e o efeito da dieta foi realizado teste de ANOVA com medidas repetidas no tempo. Quando houve diferença entre as médias foi realizado o teste de Tukey. Para a análise de consumo de beta-glucanos, digestibilidade e resultados da análise de expressão gênica, os dados foram analisados por análise de variância e, valores de P

The growing global demand for safe and sustainable food production has motived a restructuring in the beef production sector aiming the production of better quality products without increasing the productive cost. Thus, animal breeding aims to improve economic productivity of future generations of domestic species through selection. Most of the economic important traits in livestock has a complex and quantitative expression, that is, they are influenced by a large number of genes and affected by environmental factors. However, there is no consensus among researches about the best methodology to obtain genomic prediction for each trait. There are different methods and pseudophenotypes used in genomic predictions, being necessary to determine the ideal for each trait of interest. In Chapter 2, the aim of this study was to estimate genetic parameters and identify genomic regions associated with carcass traits obtained by ultrasound and visual scores in Nellore cattle. Data from ~66,000 animals from the National Association of Breeders and Researchers (ANCP) were used. The variance components for back fat thickness (BF), rump fat thickness (RF) and Longissimus muscle area (LMA) were estimated considering a linear model whereas a threshold model were fitted for body structure (BS), finishing precocity (FP) and musculature (MS) traits were used. The SNP solutions were estimated using the ssGBLUP approach by considering windows of 10 consecutive SNPs. Regions that explained for more than 1.0% of the additive genetic variance were used. Gene enrichment analysis revealed GO biological processes that might be directly influenced the organism growth and development. In Chapter 3, the aim of this study was to compare the genomic prediction ability for carcass composition indicator traits in Nellore cattle using the Best Linear Unbiased Prediction (BLUP), Genomic BLUP (GBLUP), singlestep GBLUP (ssGBLUP), Bayesian methods (BayesA, BayesB, BayesC and BayesianLASSO) and an approach combining the pedigree matrix of genotyped animals and the genomic matrix using a Bayesian analysis. Phenotypic and genotypic information on about 66, and 21,000 animals, respectively, evaluated by ANCP were available for BF, RF, LMA, BS, FP and MS. To obtain the prediction ability, the dataset was split into training (genotyped sires and dams with progenies) and validation (genotyped young animals without progeny records and without phenotypes) subsets. In terms of prediction ability and bias, Bayesian approaches were superior for visual scores traits and the ssGBLUP for carcass traits obtained by ultrasonography, however, more biased results were obtained for BF and RF using the ssGBLUP. The ssGBLUP model showed less biased prediction for low heritability traits, such as LMA, and also it has lower computational demand and it is a straightforward method for implementing genomic selection in beef cattle. In Chapter 4, the aim of this study was to estimate genetic parameters and to identify genomic regions associated with the calving ease (CE) in precocious Nellore heifers. A total of 1,277 CE phenotypes were collected and scored into two categories: i- non assisted calving, categorized as success (1) and ii- assisted calving where heifers required any form of assistance or intervention to give birth, categorized as failure (2). The direct and maternal heritability estimates for CE were low (0.18) and moderate (0.39) respectively, indicating that genetic progress for this trait is feasible, and so, it would respond favorably to direct selection. Gene enrichment analysis revealed processes that might directly influence fetal processes involved in female pregnancy and stress response. A crescente busca por produção alimentar sustentável tem incentivado uma reestruturação no setor de produção de carne visando obter produtos de melhor qualidade sem aumentar os custos de produção. Deste modo, o melhoramento genético animal tende a melhorar a produtividade econômica das futuras gerações de espécies de interesse econômico por meio da seleção. A maioria das características de interesse econômico na pecuária é de expressão quantitativa e complexa, ou seja, são influenciadas por vários genes e afetadas por fatores ambientais. No entanto, ainda não há consenso entre os pesquisadores sobre a melhor metodologia para a obtenção da predição genômica para cada característica. Existem diferentes métodos e pseudofenótipos utilizados em predições genômicas, sendo necessário determinar o ideal para a característica de interesse. No Capítulo 2, o objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos e identificar regiões genômicas associadas a características de carcaça obtidas por ultrassonografia e escores visuais em bovinos Nelore. Foram utilizados dados de aproximadamente 66.000 animais provenientes da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). Os componentes de variância para espessura de gordura subcutânea (EG), espessura de gordura subcutânea da garupa (EGP8) e área de olho de lombo (AOL) foram estimados considerando um modelo linear, e um modelo de limiar para as características, como estrutura corporal (E), precocidade (P) e musculosidade (M). As soluções dos SNPs foram estimadas por meio da metodologia ssGBLUP considerando janelas de 10 SNPs adjacentes. Regiões que representaram mais de 1.0% da variância genética aditiva foram utilizadas. A análise de enriquecimento funcional revelou processos biológicos que podem influenciar diretamente o crescimento e desenvolvimento animal. No Capítulo 3, objetivou-se com este estudo comparar a habilidade de predição genômica de características indicadoras de composição de carcaça em bovinos Nelore usando os métodos BLUP, GBLUP, ssGBLUP, métodos Bayesianos (BayesA, BayesB, BayesC e BayesianLASSO) e uma metodologia combinando a matriz de parentesco dos animais genotipados com a matriz genômica e métodos Bayesianos. Foram obtidas informações fenotípicas e genotípicas de aproximadamente 66.000 e 21.000 animais, respectivamente, avaliados pela ANCP para BF, RF, LMA, BS, FP e MS. Para obter a habilidade de predição, o conjunto de dados foi dividido em subconjuntos de treinamento (touros genotipados e mães com progênies) e validação (animais jovens genotipados sem registros de progênies e sem fenótipos). Em relação a habilidade de predição e o viés, os métodos bayesianos foram superiores para as características de escores visuais e o ssGBLUP para as características de carcaça obtidas por ultrassonografia, entretanto, resultados mais tendenciosos foram obtidos para BF e RF quando utilizado o ssGBLUP. O modelo ssGBLUP apresentou predição menos viesada para as características de baixa herdabilidade, como LMA, e também apresentou menor demanda computacional, caracterizado por ser um método que não necesita de cálculo de pseudofenótipos para a implementação da seleção genômica em bovinos de corte. No Capítulo 4, o objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos e identificar regiões genômicas associadas à facilidade de parto (CE) em novilhas Nelore precoces. Um total de 1.277 fenótipos para CE foram coletados e classificados em duas categorias: i- parto não assistido, categorizado como sucesso (1) e ii- parto assistido, no qual as novilhas necessitaram de qualquer forma de assistência ou intervenção para parir, categorizado como falha (2). As estimativas de herdabilidade direta e materna para CE foram baixas (0,18) e moderadas (0,39), respectivamente, indicando que o progresso genético para essa característica é viável e, portanto, responderia favoravelmente à seleção direta. A análise de enriquecimento funcional revelou processos que podem influenciar diretamente os processos fetais envolvidos na gestação e na resposta ao estresse.

Objetivou-se avaliar a expressão de genes relacionados ao metabolismo lipídico, bem como identificar por meio da ferramenta de proteômica diferencial, as principais diferenças no perfil proteico do músculo longissimus thoracis (LT) e da espessura de gordura subcutânea (EGS) de progênies Nelore, filhos de touros com DEP contrastante para precocidade sexual e crescimento. Para isso, o presente estudo foi dividido em 3 manuscritos. Em síntese, foram utilizados 105 bovinos, machos não castrados, com idade média de 20 ± 2 meses e 400 ± 24 kg, provenientes de um mesmo rebanho, com informações genéticas para precocidade e crescimento. Os animais foram confinados por 100 dias e realizada a ultrassonografia de carcaça a cada 28 dias. Foram coletadas amostras de sangue para determinar as concentrações metabólicas e hormonais na última pesagem. Os animais foram abatidos após 100 dias de confinamento e durante o abate foram colhidas amostras do músculo LT e da EGS entre a 12a e 13a costelas além de amostras da gordura visceral (GV). Todas essas amostras foram imediatamente congeladas em nitrogênio líquido e mantidas em freezer 80oC até a realização das análises de expressão gênica por PCR em tempo real (RT-qPCR) e análise e SDS-PAGE, seguida de identificação proteica pela análise de espectrometria de massas acoplada a cromatografia liquida (LC- MS/MS). Durante a desossa foi avaliada a gordura intramuscular (MAR) no músculo LT. Também foram coletados bifes para lipídeos totais, perfil de ácidos graxos e solubilidade do colágeno. Os animais foram selecionados de acordo com a DEP de seus pais (touros). Do total de 105 animais, foram selecionados 6 pais com DEP’s simultaneamente contrastantes para precocidade e crescimento, de forma que cada grupo experimental tivessem 3 pais. A partir dos pais, foram formados 2 grupos contrastantes denominados de alta DEP (H_EPD; N=16) e baixa DEP (L_EPD; N=16). Os animais do grupo H_EPD tiveram maior EGS (P=0,006); menor LDL (P=0,014); maior IGF-1 (P=0,064); maior solubilidade do colágeno (P=0,098); menor expressão do gene LPL, no LT (P=0,045). Também este grupo apresentou maior expressão dos genes envolvidos na lipogênese avaliados na EGS: ACACA (P=0,060), LPL (P=0,085), ACOX1 (P= 0,100), LEP (P=0,030), SDC (P= 0,009), e GAPDH (P=0,081), do que os animais do grupo L_DEP. Uma banda eletroforética foi detectada como diferencialmente abundante no músculo LT (banda 16) e três bandas eletroforéticas foram detectadas como diferentemente abundantes na EGS (bandas 24, 30, 32). As vias KEGG do metabolismo de piruvato, glicólise/gluconeogênese, metabolismo de carbono, biossíntese de aminoácidos, dentre outras, foram enriquecidas para as proteínas diferencialmente abundantes identificadas no LT e na EGS. A seleção genética para precocidade e crescimento afeta o proteoma muscular e consequentemente o metabolismo lipídico e proteico de bovinos não castrados. O hormônio IGF-1, o gene LPL e as proteínas PKLR, PKM, ALDOA, DLD, GPI, VIM, ACTC1, OXCT1, GAPDH, LDHA, LDHB, MDH1, MDH2, IDH1, PGK1, SUCLG2 and ACY1 podem ser considerados futuros biomarcadores candidatos para EGS. This study aimed to evaluate the expression of genes related to lipid metabolism, as well as to identify, through the proteomics tool, differences in the protein profile of Longissimus thoracis (LT) and backfat thickness (BFT) proteins of Nelore progenies, offspring of bulls with contrasting factors of expected progeny difference (EPD) for precocity and growth. For this, the present study was divided into 3 manuscripts. In summary, 105 male bulls were used, with a mean age of 20 ± 2 months and 400 ± 24 kg, from the same herd, with the genetic information of precocity and growth. The animals remained confined for 100 days, and the carcass ultrasound was performed every 28 days. Blood samples were collected to determine the metabolic and hormonal profile. The animals were slaughtered after 100 days and during slaughter, muscle LT and BFT were collected between the 12th and 13th ribs, in addition to visceral fat (GV). All of these were immediately frozen in liquid nitrogen and kept in a freezer 80oC until the analysis of gene expression by real-time PCR (RT-qPCR) and analysis and SDS-PAGE, followed by the identification of proteins by coupled mass spectrometry liquid chromatography (LC-MS / MS). During boning, the intramuscular fat (MAR) in the LT muscle was evaluated. Steaks for total lipids, fatty acid profile, and collagen solubility were also collected. The animals were selected according to a EPD from their parent bulls. Were selected 6 parents with EPD contrasting simultaneously for precocity and growth, so that each experimental group had 3 parents bulls. Then, were formed, 2 contrasting groups called high EPD (H_EPD; N = 16) and low EPD (L_EPD; N = 16), using 32 progenies. The animals in the H_EPD group had higher BFT (P = 0.006); lower LDL (P = 0.014); higher IGF-1 (P = 0.064); greater collagen solubility (P = 0.098); lower expression of the LPL gene, in LT (P = 0.045). This group also showed greater expression of the genes involved in lipogenesis evaluated in BFT: ACACA (P = 0.060), LPL (P = 0.085), ACOX1 (P = 0.100), LEP (P = 0.030), SDC (P = 0.009), and GAPDH (P = 0.081), than the animals in the L_EPD group. One electrophoretic band was detected as differently abundant in the LT muscle (band 16) and three electrophoretic bands were detected as differently abundant in the BFT (bands 24, 30, 32). The KEGG pathways of pyruvate metabolism, glycolysis/gluconeogenesis, carbon metabolism, amino acid biosynthesis, among others, were enriched for the differentially abundant proteins identified in the LT and BFT. The genetic selection for precocity and growth affects the muscle proteome and consequently the lipid and protein metabolism of non-castrated cattle. The IGF-1 hormone, the LPL gene, and the PKLR, PKM, ALDOA, DLD, GPI, VIM, ACTC1, OXCT1, GAPDH, LDHA, LDHB, MDH1, MDH2, IDH1, PGK1, SUCLG2, and ACY1 proteins can be considered future biomarkers candidates for BFT.

This study aimed to compare the effects of the feed additives lasalocid, narasin and virginiamycin to cattle fed high-forage diet. The hypothesis was that the inclusion of these additives would improve nutrient digestibility, change rumen fermentation and, increase the performance of beef cattle fed high-forage diet. Two experiments were designed to evaluate the effects of lasalocid, narasin, and virginiamycin on apparent total tract nutrient digestibility, rumen fermentation characteristics, blood parameters, and performance of Bos indicus cattle fed high-forage diet. In Exp. 1, 32 rumen-fistulated Nellore steers (initial shrunk BW = 355 ± 4.4 kg) were assigned to a randomized complete block design (n = 8), according to their initial shrunk BW. Steers were fed daily and diets were composed of 99% of coastcross haylage and 1% of concentrate, used as a delivery vehicle for the additives. The experimental diets consisted of 1) forage-based diet without feed additives (CON); 2) 13 mg/kg DM of narasin (NAR); 3) 20 mg/kg DM of lasalocid (LAS); and 4) 20 mg/kg DM of virginiamycin (VM). The experimental period lasted 140 d, divided into 5 periods of 28 d each. The inclusion of feed additives did not affect the DMI (P = 0.46), consequently, did not affect the nutrients intake (P > 0.05). In addition, there was no difference in nutrient digestibility among diets (P > 0.05). There was an interaction between treatment x day (P < 0.01) for total SCFA, acetate, propionate, and acetate:propionate (A:P) ratio. Animals offered NAR had the greatest total SCFA values on days 84 and 112 (P < 0.05), whereas acetate concentration was lowest to NAR on days 28, 56, 112 (P < 0.05), and lower on day 140 in relation to CON and LAS(P < 0.05). The treatment NAR had the greatest propionate and lowest A:P ratio values on days 28, 56, 112 and 140 when compared to other treatments(P < 0.05). In Exp. 2, 160 Nellore yearling bulls were blocked (n = 10) by initial shrunk BW (212 ± 3.1 kg) in a 140-d feedlot trial. Bulls were fed daily and diets were composed of 96% of coastcross haylage and 4% of concentrate, used as a delivery vehicle for the additives. The treatment NAR had a greater ADG (P = 0.04) than CON and VM and was similar to the LAS. In turn, the animals that received LAS presented a similar ADG to those of the other treatments. The gain:feed (G:F) was greater (P = 0.05) for NAR than CON and VM. Besides, LAS supplementation increased (P = 0.05) the G:F compared with CON, with no difference compared to VM. Consequently, the treatment NAR had the greatest final BW (P = 0.03) than others. In conclusion, NAR improves rumen parameters and performance of yearling bulls fed high-forage diets and LAS improves feed efficiency. Este estudo teve como objetivo comparar os efeitos dos aditivos alimentares lasalocida, narasina e virginiamicina para bovinos alimentados com dietas de alta forragem. A hipótese foi de que a inclusão desses aditivos melhoraria a digestibilidade dos nutrientes, alteraria a fermentação ruminal e melhoraria o desempenho de bovinos de corte alimentados com dietas de alta forragem. Foram delineados dois experimentos para avaliar os efeitos das moléculas lasalocida, narasina e virginiamicina sobre a digestibilidade aparente do trato total, parâmetros de fermentação ruminal, sanguíneos e desempenho de bovinos Nelore (Bos indicus) alimentados com dieta de alto volumoso. No experimento 1, 32 novilhos Nelore providos de cânula ruminal (peso corporal em jejum = 355 ± 4,4 kg) foram aleatorizados em blocos (n = 8), de acordo com seu peso corporal em jejum. Os novilhos foram alimentados diariamente e as dietas eram compostas de 99% de pré-secado de Coastcross e 1% de concentrado, usado como veículo de fornecimento dos aditivos. As dietas experimentais consistiam em 1) dieta baseada em forragem sem aditivos (CON); 2) 13 mg/kg de MS de narasina (NAR); 3) 20 mg/kg de MS de lasalocida e 4) 20 mg/kg de MS de virginiamicina (VM). O período experimental durou 140 dias, divididos em 5 períodos de 28 dias cada. A inclusão dos aditivos não afetou o CMS (P = 0,46), consequentemente, não afetou o consumo de nutrientes (P > 0,05). Além disso, não houve diferença na digestibilidade dos nutrientes entre as dietas (P > 0,05). Houve uma interação tratamento x dia (P < 0,01) para AGCC, acetato, propionato e a taxa acetato:propionato (A:P). Os animais que consumiram NAR tiveram os maiores valores de AGCC nos dias 84 e 112 (P < 0,05), enquanto as concentrações de acetato foram as menores para NAR nos dias 28, 56, 112 (P < 0,05), e menor no dia 140 em relação ao CON e LAS (P < 0,05). O tratamento NAR teve o maior valor de propionato e menor A:P nos dias 28, 56, 112 e 140 quando comparado com os outros tratamentos (P < 0,05). No experimento 2, 160 novilhos Nelore foram blocados (n = 10) pelo peso inicial em jejum (212 ± 3,1 kg) em um confinamento de 140 dias de duração. Os novilhos foram alimentados diariamente e as dietas foram compostas de 96% de pré-secado de Coastcross e 4% de concentrado, usados como veículo de fornecimento para os aditivos. O tratamento NAR teve o maior GMD (P = 0,04) do que CON e VM e foi similar para LAS. Por outro lado, os animais que receberam LAS apresentaram um GMD similar a estes outros tratamentos. A eficiência alimentar (GMD/CMS) foi maior (P = 0,05) para NAR em comparação ao grupo CON e VM. Além disso, o fornecimento de LAS aumentou (P = 0,05) a eficiência alimentar comparado ao CON, com nenhuma diferença comparado a VM. Consequentemente, o tratamento NAR teve o maior peso final (P = 0,03) do que os outros tratamentos. Em conclusão, NAR melhorou os parâmetros e desempenho de novilhos alimentados com dietas de alta forragem e LAS melhorou a eficiência alimentar.

O objetivo dessa pesquisa foi avaliar os aspectos genéticos relacionados a características morfológicas e de produção de embriões in vitro em bovinos da raça Gir Leiteiro. O primeiro estudo focou na estimação de parâmetros genéticos e o efeito do aumento do coeficiente de endogamia (F) nas características de conformação, além de descrever a subpopulação de vacas Gir leiteiro com fenótipo de morfologia coletado. Um conjunto de dados contendo registros para 15 características de conformação de um total de 3.800 vacas foi analisado. O arquivo de pedigree utilizado para o cálculo de F continha 44.318 animais. As estimativas de herdabilidade (h2) variaram de 0,04 a 0,50, nas quais as características de estrutura corporal apresentaram maiores h2 . Com um coeficiente de endogamia médio de 1,30% e uma relação de parentesco médio entre indivíduos de 1,91%, além de um aumento nas taxas médias anuais desse parentesco entre animais Efeitos relevantes da depressão endogamica foram detectados na maioria das características analisadas. As características relacionadas à estrutura corporal apresentaram maiores herdabilidades, seguidos pelas características de conformação de úbere e pernas e pés. O segundo estudo, teve como objetivo realizar uma análise genética detalhada das características de produção de embriões in vitro em vacas da raça Gir leiteiro. Um conjunto de dados contendo 11,450 registros de procedimentos de coleta de óvulos (OPU) e fertilização in vitro (FIV) de 2,684 doadores da raça Gir Leiteiro foi avaliado. As características analisadas foram número (NOV) e porcentagem (POV) de oócitos viáveis; número (NGI) e porcentagem (PGI) de oócitos grau I; número (NEMB) e porcentagem (PEMB) de embriões viáveis. As estimativas de herdabilidade variam de 0,16 até 0,32 para características de contagem e de 0,01 a 0,06 para características percentuais. A proporção da variação total representada pelo efeito genético aditivo do touro (sêmen usado na FIV) para NEMB e PEMB foi 7% e 5% respectivamente. As associações entre os valores genéticos de touros do teste de progênie para características de IVEP, produção de leite, idade no primeiro parto e características de conformação foram principalmente baixas ou próximas de zero. The objective of this study was to evaluate the genetic aspects related to morphological and in vitro embryo production in Gir Dairy cattle. The first study focused on the estimation of genetic parameters and the effect of the inbreeding coefficient (F) on morphological traits, in addition to describing the subpopulation of Gir Dairy cows with morphology phenotype collected. A data set containing records for 15 conformation traits, a total of 3,800 cows was analyzed. The pedigree file used for the calculation of F contained 44,318 animals. Estimates of heritability (h2) ranged from 0.04 to 0.50, in which body structure traits showed higher h2 . With an average inbreeding coefficient of 1.30 and an average relationship between individuals of 1.91% In addition to an increase in the annual average rates of relationship between animals relevant effects of inbrreding depresion were detected in most of the analyzed traits. Traits related to body structure showed higher heritabilities, followed by the traits of udder conformation and legs and feet. The second study aimed to conduct a detailed genetic analysis of in vitro embryo production traits in Gir Dairy cattle cows. A data set containing 11.450 records of procedures for the collection of oocyte (OPU) and in vitro fertilization (IVF) of 2.684 donors of Gir Dairy breed was evaluated. The analyzed traitswere number (NOV) and percentage (POV) of viable oocytes; number (NGI) and percentage (PGI) of oocytes grade I; number (NEMB) and percentage (PEMB) of viable embryos. Heritability estimates vary from 0.16 to 0.32 for counting traits and 0.01 to 0.06 for percentages traits. The proportion of total variation represented by additive genetic effect of bull (semen used in IVF) to NEMB and PEMB was 7 and 5 % respectively. The associations between the breeding values for progeny test bulls for IVEP traits, milk production, age at first calving and conformation traits were mostly low or close to zero.

Este estudo foi conduzido com o objetivo de avaliar o efeito da suplementação com culturas vivas de Aspergillus oryzae e enzima fibrolítica sobre a digestibilidade da fibra, cinética e ecossistema ruminal de vacas em lactação. Experimento 1: foi realizada a avaliação da composição química e perfil fermentativo de silagens inoculadas com doses de enzimas fibrolíticas (0, 1,3 e 2,6g/kg MS, Fibrozime®, Alltech) no processo de ensilagem de cana-deaçúcar (alta e baixa digestibilidade da FDN) e de milho em diferentes tempos de ensilagem (30, 60 e 120d). O delineamento foi DIC, com 27 tratamentos e 3 repetições por tratamento. A inclusão de enzima fibrolítica, assim como o aumento do tempo de ensilagem, promoveram o aumento nos conteúdos de FDN e FDA, e redução da digestibilidade da FDN das silagens de cana-de-açúcar, acompanhado de aumento de perdas de MS por efluentes, e redução da recuperação de matéria seca, sem efeito na silagem de milho. Experimento 2: o objetivo foi avaliar a digestibilidade in vitro da MS (DIVMS) e da FDN (DIVFDN), através de ensaio de cinética fermentativa e produção de gases in vitro, de volumosos (silagem de milho e de canade-açúcar), em resposta à adição de doses de A. oryzae (0, 1, 3 e 5g/100ml) ou doses de enzima fibrolítica (0, 8, 16 e 24g/100ml), ou a combinação de ambos. O delineamento foi em DIC, com 32 tratamentos com 3 repetições por tratamento. A inclusão de A. oryzae aumentou a DIVFDN e DIVMS, independentemente do volumoso. A maior dose do fungo aumentou a produção potencial de gases na silagem de cana. A enzima fibrolítica elevou a DIVFDN e DIVMS apenas na silagem de milho, aumentou o volume final de gases e reduziu o tempo de colonização, independente da dose. Experimento 3, com o objetivo de quantificar o efeito da inclusão de A. oryzae (5g/animal/d), enzima fibrolítica (24g/animal/d) e combinação de ambos sobre o consumo de MS, taxa de digestão e passagem ruminal da FDN, fermentação ruminal, e composição da população de bactérias ruminais, foram utilizadas 8 vacas em lactação, da raça Holandesas, canuladas no rúmen. As rações experimentais foram compostas de 61% de volumoso na MS, a base de silagem de milho. O delineamento foi de dois quadrados latinos 4x4 contemporâneos, com 4 tratamentos e 8 repetições por tratamento. Os aditivos elevaram o consumo de MS e FDN potencialmente degradável, em comparação ao controle. Não houve efeito sobre a produção de leite, mas o tratamento com o fungo elevou a gordura do leite. O tratamento com fungo e sua combinação com enzima fibrolítica elevaram a concentração de acetato ruminal. O tratamento com o fungo, assim como sua combinação com a enzima fibrolítica, elevaram a digestibilidade ruminal da FDN e FDNpd. Foi observado aumento da taxa de digestão ruminal da FDN nos tratamentos com fungo e a combinação com enzima fibrolítica. Os aditivos apresentaram potencial para modular a fermentação ruminal, onde a combinação do fungo com a enzima apresentou resultados positivos sobre os parâmetros de digestibilidade ruminal da fibra. This study aimed to evaluate the effects of supplementation with live cultures of Aspergillus oryzae and fibrolytic enzyme on fiber digestibility, kinetics and rumen ecosystem of lactating cows. Experiment 1: the chemical composition and fermentative profile of silages inoculated with doses of fibrolytic enzymes (0, 1,3 e 2,6g/kg MS, Fibrozime®, Alltech) at ensiling of sugarcane varieties and corn, in different ensilage periods (30, 60 e 120d), was evaluated. The design was completely randomized (CRD), with 27 treatments and 3 repetitions by treatment. The inclusion of fibrolytic enzyme, as well as increased silage time, promoted the increase of NDF and ADF contents, and the reduction of NDF digestibility of sugarcane silages, accompanied by increased losses of DM by effluents and reduction of dry matter recovery, with no effect on corn silage. Experiment 2: the objective was to evaluate the in vitro digestibility of DM and NDF by fermentative kinetics and in vitro gas production of roughage (corn and sugarcane silage) in response to the addition of live cultures doses of A. oryzae (0, 1, 3 and 5g/100ml) or doses of fibrolytic enzyme (0, 8, 16 and 24g/100ml), or the combination of both. The design was completely randomized (CRD), with 36 treatments and 3 repetitions by treatment. The inclusion of A. oryzae increased IVDNDF and IVDDM, regardless of the roughage. The higher dose of the fungus increased the potential gas production in sugarcane silage. The fibrolytic enzyme elevated IVDNDF and IVDDM only in corn silage, increased the final volume of gases and reduced colonization time, regardless of the dose. Experiment 3: in order to quantify the effect of the inclusion of A. oryzae (5g/animal/d), fibrolytic enzyme (24g/animal/d) and combination of both on DM intake, digestion rate and ruminal passage of NDF, ruminal fermentation, and population composition of ruminal bacteria, eight ruminalcannulated Holstein cows were used. The experimental diets was composed of 61% roughage in DM, containing corn silage. The design was two contemporary 4x4 Latin squares, with 4 treatments and 8 repetitions per treatment. The additives increased the consumption of DM and NDF potentially degradable fraction in comparison to the control. There was no effect on milk production, but treatment with the fungus raised the milk fat content. A. oryzae and its combination with fibrolytic enzyme increased the ruminal acetate concentration, and increased ruminal digestibility of NDF and pdNDF. An increase in the ruminal digestion rate of NDF was observed in treatments with fungus and the combination with fibrolytic enzyme. The additives had the potential to modulate the ruminal fermentation, where the combination of the fungus with the enzyme presented positive results on the ruminal digestibility parameters of the fiber.

This study aimed to identify genomic regions influencing growth traits in Nellore cattle and evaluate the predictive ability of each trait based on results obtained from single-step Genome-Wide Association Studies (ssGWAS) considering different SNP markesr densities. The National Association of Breeders and Researchers provided the dataset from eighteen Nellore herds participating of the Nellore Brazil breeding program. The traits birth weight (BW), adjusted weight at 210 (W210) and at 450 (W450) days of age and adult cow weight (ACW) were considered. A total of 963 animals, genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip, were used as a reference population to impute genotypes of 7,689 animals, genotyped in low-density panel. Genotype imputation was performed using the FImpute 2.2 software. Several genes in enrichment analysis were related to muscle and adipose tissue development and metabolism, feed efficiency, milk composition and maternal behavior. The predictive ability varied from low (0.10) to moderate (0.68). The predictive ability and bias for both panels were similar for all traits. The results found in this study should improve the understanding of genetic and physiologic mechanism associated with growth traits. However, the association of these results with other approaches, like system biologic and other omics information should improve the identification of causative genetic variants in growth traits in indicine cattle. Este estudo teve como objetivo identificar regiões genômicas que influenciam características de crescimento em bovinos da raça Nelore e avaliar a capacidade preditiva de cada característica com base nos resultados obtidos a partir da metodologia single-step Genome-Wide Association Studies (ssGWAS) considerando diferentes densidades de marcadores do tipo SNP. A Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores disponibilizou o conjunto de dados de dezoito rebanhos bovinos participantes do programa de melhoramento brasileiro da raça Nelore (Nelore Brasil). Foram consideradas as características peso ao nascer (PN), peso ajustado aos 210 (W210) e aos 450 (W450) dias de idade e peso adulto da vaca (PCA). Um total de 963 animais, genotipados utilizando o Illumina BovineHD BeadChip, foram utilizados como população de referência para imputar genótipos de 7.689 animais, genotipados em painel de baixa densidade. A imputação dos genótipos foi realizada utilizando o software FImpute 2.2.. Na análise de enriquecimento funcional, vários genes foram relacionados ao desenvolvimento e metabolismo de músculo e tecido adiposo, eficiência alimentar, composição do leite e comportamento materno. A habilidade de predição (HP)variou de baixa (0,10) a moderada (0,68). Os valores de viés e HP para ambos os painéis foram semelhantes para todas as características. Os resultados encontrados neste estudo devem melhorar a compreensão do mecanismo genético e fisiológico associado às características de crescimento. No entanto, associação desses resultados com outras abordagens, como informações biológicas do sistema e outras informações ômicas, devem melhorar a identificação de variantes genéticas causadoras de características de crescimento em bovinos zebuínos.

A mensuração da glândula adrenal nos cães ainda não está claramente estabelecida de acordo com o peso do animal, havendo uma ampla faixa de normalidade descrita e, além disso, esta não foi relacionada à dimensão da aorta. Este projeto objetivou estabelecer padrão de normalidade de mensuração ultrassonográfica para glândulas adrenais esquerda e direita de cadelas adultas jovens na faixa etária de 1 a 3 anos divididas por porte. A metodologia consiste em verificar se existe relação entre diâmetro da aorta mensurada logo cranialmente à sua trifurcação e a altura do polo caudal da glândula adrenal, na região de maior espessura, em três grupos de peso corporal (porte pequeno, médio e grande). As dimensões do polo caudal das glândulas adrenais direita e esquerda e o diâmetro da aorta, bem como, as relações aorta/adrenal direita e aorta/adrenal esquerda foram avaliadas por dois avaliadores experientes. Os animais foram divididos em grupo 1 (G1) até 10 kg (21 animais), grupo 2 (G2) de 10,1 a 25 kg (22 animais) e grupo 3 (G3) acima de 25,1 a 38 kg (20 animais). A média e o desvio padrão da mensuração do polo caudal da glândula adrenal direita foram de 0,37±0,072 cm (G1), 0,48±0,077 cm (G2) e 0,5±0,048 cm (G3) e da glândula adrenal esquerda de 0,38±0,082 cm (G1), 0,45±0,077 cm (G2) e 0,47±0,073 cm (G3). O diâmetro da aorta 0,52±0,1 cm (G1); 0,78±0,097 cm (G2); 0,94±0,071 cm (G3). Estatisticamente o grupo 2 e o grupo 3 foram semelhantes entre si e significativamente diferentes do grupo 1. Portanto, a mensuração do polo caudal das glândulas adrenais relacionadas ao peso corporal não foi considerada um parâmetro confiável. Os resultados indicaram que, nesse estudo, a relação entre aorta/glândulas adrenais de animais até 10 kg variou de 1,2 a 1,6 e de animais de 10,1 a 38 kg de 1,6 a 2,1. A relação aorta/glândulas adrenais provou ser um ótimo parâmetro para estabelecer mensuração normal das glândulas adrenais e, portanto, sugerido como novo parâmetro a ser utilizado na avaliação ultrassonográfica biométrica das glândulas adrenais. Ao relacionar estruturas do próprio animal, foi estabelecido de forma mais específica para o indivíduo uma relação entre a aorta e glândula adrenal e não mais um valor esperado em uma população normal. Adrenal gland measurements remain unestablished in dogs since literature reports no consensus regarding to those values according to animal size. There can be seen a wide range of normality and no correlation between adrenal size and the dimension of aorta has yet been described. The present study aims to establish standard values for the ultrasonographic measurement of the right and left adrenal glands, considering 1 to 3-year-old healthy female dogs divided into size categories. Methods consist in verifying the relationship between the diameter of the aorta, measured immediately before its trifurcation, and height of the caudal extremity of the adrenal glands in three different groups according to body weight (small, medium and large dogs. The dimensions of the caudal pole right and left adrenal glands and the aorta, as well as, the aorta/ right adrenal and aorta/left adrenal relations were evaluated by two experienced professionals. Animals weighting up to 10 Kg (n=21) were classified in group 1 (G1); animals weighting from 10,1 to 25 Kg (n=22) were classified in group 2 (G2) and animals weighting 25,1 to 38 Kg (n=20) were classified in group 3 (G3). Mean values and standard deviation of the right adrenal gland were 0,37±0,072 cm (G1), 0,48±0,077 cm (G2) and 0,5±0,048 cm (G3) and for the left adrenal gland, the values were 0,38±0,082 cm (G1), 0,45±0,077 cm (G2) and 0,47±0,073 cm (G3). The values obtained for the aortic diameter were 0,52±0,1 cm (G1); 0,78±0,097 cm (G2) and 0,94±0,071 cm (G3). Groups 2 and 3 were statistically similar and differed from group 1. Therefore, the relationship between the measurement of the caudal extremity of the adrenal glands and the body weight was considered a non-reliable parameter. Results indicated that, in our study, the aorta/adrenal gland ratio ranged from 1,2cm to 1,6cm in dogs with up to 10 Kg and from 1,6cm up to 2,1cm for dogs weighting 10,1 Kg to 38 Kg. The aorta/adrenal gland ratio has proven to be an excellent parameter to establish normal adrenal values and, therefore, this parameter can be used for the biometric investigation of the adrenals, using ultrasound. The correlation between different structures from the same animal, based on the aorta/adrenal gland ratio in the present study, contributed to more accurate values when compared to the general values established for normal populations.

A obesidade é caracterizada pelo acúmulo excessivo de gordura corporal que pode resultar na redução da qualidade e expectativa de vida. Estudos epidemiológicos que caracterizaram a obesidade canina na América Latina são escassos. Dessa forma, os objetivos deste trabalho foram determinar a prevalência da obesidade canina no município de São Paulo e os fatores a ela associados. Foram realizadas visitas a domicílios da cidade, escolhidos segundo o censo dos cães domiciliados de São Paulo e cálculo de prevalência de obesidade esperada. Os cães tiveram seu escore de condição corporal (ECC) avaliados e os tutores o índice de massa corporal (IMC) e medidas morfométricas. Além de informações referentes a condição socioeconômica e estilo de vida obtidas por meio de questionário. Para a análise estatística, procedeuse a estimativa da prevalência da obesidade, teste de qui-quadrado, análise de correspondência múltipla e regressão logística múltipla. De acordo com a avaliação de 285 cães de 221 tutores determinou-se a prevalência de obesidade dos cães domiciliados no município de São Paulo- SP em 14,6%. Houve associação do ECC dos cães com sexo (p=0,003) e status reprodutivo (p< 0,001), sendo que a maioria dos animais acima do peso eram do sexo feminino e, castrados, independente do sexo. Em relação aos cuidados com os pets, houve associação do ECC com a frequência com que os animais eram assistidos por médico veterinário (p=0,026). Essa associação também foi encontrada em relação a frequência alimentar (p=0,033) e consumo de petiscos (p=0,011). Sobre fatores inerentes aos tutores houve associação dos hábitos alimentares em relação ao consumo de guloseimas (p=0,005) e a presença de moradores idosos. A prevalência da obesidade canina observada nesse estudo foi semelhante à observada em outras cidades do mundo, assim como os fatores associados. Obesity can be characterized by excessive accumulation of body fat that can result in a reduce in both quality and life expectancy. Epidemiological studies in Latin America that characterize canine obesity are scares. With that in mind, the objective of this work is to determine the prevalence of canine obesity in the city of Sao Paulo and all the factors associated to it. Houses where selected according to the census of domiciled dogs of Sao Paulo, and visits were made where the calculation of the prevalence of expected obesity was based. The dogs had their body condition score (BCS) evaluated and the owners had body mass index (BMI) and morphometric measures. In addition to information regarding socioeconomic status and lifestyle obtained through a questionnaire. For the statistical analysis, the prevalence of obesity, chi-square test, multiple correspondence analysis and also the multiple logistic regression were estimated. According to the evaluation of 285 dogs that belong to 221 owners the prevalence of obesity of dogs domiciled in the city of São Paulo-SP was determined in 14.6%. There was an association between BCS of dogs with gender (p1 = 0.003) and reproductive status (p

A obesidade caracteriza-se pelo baixo grau de inflamação crônica que além de resultar em alterações metabólicas, promove importantes alterações no organismo animal. O tecido adiposo participa ativamente na inflamação e na imunidade e, diversas células de defesa do organismo podem, portanto, estar envolvidas nas diversidades presentes entre indivíduos obesos e de peso ideal. Estudos nesta linha têm demonstrado alterações das células imunes em humanos e ratos, no entanto, são escassos na literatura informações neste sentido para cães. Desta forma, o presente estudo avaliou o perfil de expressão gênica da resposta imunoinflamatória e a linfoproliferação de cães obesos e as possíveis alterações resultantes após o emagrecimento. Foram incluídos oito cães, fêmeas, castradas, de diferentes raças, com idade entre 1 e 8 anos, obesos, com escore de condição corporal (ECC) igual ou superior a 8 e composição corporal determinada pelo método de diluição de isótopos de deutério. Os cães obesos foram incluídos em um programa de perda de peso e passaram a compor um novo grupo experimental, após a perda de 20% do peso inicial. Um terceiro grupo experimental foi constituído por oito cães, fêmeas, castradas, idade entre 1 e 8 anos e ECC ideal (4 ou 5). A expressão gênica das citocinas imunoinflamatórias (resistina, leptina, adiponectina, TNF-α, IL-6, IL-8, IL-10) foi avaliada por qRT-PCR e, a imunidade foi avaliada através da resposta linfoproliferativa pela técnica de citometria de fluxo. Os dados que apresentaram distribuição normal foram avaliados por análise de variância pelo PROC MIXED do SAS e, quando detectadas diferenças, essas foram comparadas pelo teste de Tukey. Em relação aos dados relativos às expressões gênicas, foi adotado o procedimento PROC GLIMMIX e, utilizou-se a metodologia de modelos lineares generalizados, onde a distribuição Gama demonstrou ser adequada. Valores de p

The main objective of the present thesis was to propose a procedure to optimize genotypic information value in small dairy cattle populations and investigate the impacts of including genotypes and phenotypes of cows chosen by different strategies over the performance of genome-wide association studies and genomic selection. The first study was designed to propose innovative methods that could support alternative inference over population structure in livestock populations using graph theory. It reviews general aspects of graphs and how each element relates to theoretical and practical concepts of traditional pedigree structure studies. This chapter also presents a computational application (PedWorks) built in Python 2.7 programming language. It demonstrates that graph theory is a suitable framework for modeling pedigree data. The second study was aimed asses how graph community detection algorithms could help unraveling population partition. This new concept was considered to develop a method for stablishing new cow genotyping strategies (community-based). Results obtained showed that accounting for population structure using community detection for choosing cows to get included in the reference population may improve results from genomic selection. Methods presented are easily applied to animal breeding programs. The third study aimed to observe the impacts of different genotyping strategies (including the proposed community-based) over the ability to detect quantitative trait loci in genome-wide association studies. Distinct models for genomic analysis were also tested. Results obtained showed that including cows with extreme phenotypic observations proportionally sampled from communities can improve the ability to detect quantitative trait loci in genomic evaluations. The last chapter was designed study possible deleterious impacts of the presence of preferential treatment (in different levels) in a small dairy cattle population environment over accuracy and bias of genomic selection. Different proportions of cows with artificially increased phenotypic observations were included in the reference population. Observed results suggest that both accuracy and bias are affected by the presence of preferential treatment of cows in the evaluated population. Preferential treatment is expected to have much more effect on the performance of genomic selection in small than in large dairy cattle populations for the higher (proportional) value of the information from cows in such reduced-size breeds. O principal objetivo da presente tese foi propor um procedimento capaz de otimizar o valor da informação genotípica em pequenas populações de gado de leite e investigar os impactos da inclusão de genótipos e fenótipos de vacas escolhidas por diferentes estratégias sobre o desempenho de estudos de associação genômica ampla e seleção genômica. O primeiro estudo foi delineado para elaborar um método que permita uma inferência alternativa sobre a estrutura populacional de populações de animais de produção usando como base a teoria de grafos. Este revê os aspectos gerais de grafos e como cada elemento se relaciona com conceitos teóricos e práticos de estudos de estrutura de pedigree tradicionais. Este capítulo também apresenta um aplicativo computacional (PedWorks) construído em linguagem de programação Python 2.7. Resultados observados demonstraram que a teoria de grafos é uma estrutura adequada para modelar dados de pedigree. O segundo estudo teve como objetivo avaliar como os algoritmos de detecção de comunidades de grafos poderiam ajudar revelar o particionamento de uma população. Este novo conceito foi considerado para desenvolver um método para o estabelecimento de novas estratégias de genotipagem de vacas (baseadas em comunidades). Os resultados obtidos mostraram que a contabilização da estrutura populacional usando a detecção de comunidades para a escolha de vacas a serem incluídas na população de referência pode melhorar os resultados da seleção genômica. Os métodos apresentados sugerem ser facilmente introduzidos em programas de melhoramento animal. O terceiro estudo teve como objetivo observar os impactos de diferentes estratégias de genotipagem (incluindo a anteriormente proposta baseada em comunidades) sobre a capacidade de detectar locos relacionados características quantitativas por meio de estudos de associação genômica ampla. Modelos distintos para análise genômica também foram testados. Os resultados obtidos mostraram que incluir vacas com observações fenotípicas extremas amostradas proporcionalmente das comunidades pode melhorar a capacidade de detectar locos de características quantitativas em avaliações genômicas. O último capítulo foi desenhado para estudar possíveis impactos deletérios da presença de tratamento preferencial no ambiente de pequenas populações de gado leiteiro sobre resultados da seleção genômica. Diferentes proporções de vacas com observações fenotípicas aumentadas artificialmente foram incluídas na população de referência. Os resultados observados sugerem que tanto a acurácia quanto o viés são afetados pela presença de tratamento preferencial de vacas na população avaliada. Espera-se que o tratamento preferencial tenha muito mais efeito sobre o desempenho da seleção genômica em populações pequenas de gado de leite que em grandes populações devido a maior relevância das informações de vacas em raças de tamanho reduzido.

O gene DMRT3 tem sido descrito como o principal gene a atuar na determinação da marcha em diversas raças equinas. O alelo A do SNP 23:g.22999655C>A do DMRT3 foi apontado como responsável por essa característica. Na raça brasileira Mangalarga Marchador, a qual apresenta dois padrões de marcha com características bem definidas, os genótipos AA e CA vem sendo associados à marcha picada e o genótipo CC à marcha batida. O objetivo geral do presente prospectar regiões genômicas associadas às marchas batida e picada em equinos Mangalarga Marchador. Foram utilizados 1.230 dados fenotípicos sobre o tipo de andamento (marcha batida N = 1.006; marcha picada N = 227) e, considerando a totalidade da genealogia conhecida para cada animal, 3172 animais no pedigree. Primeiramente foram testadas estratégias de modelagem para esta característica a fim de determinar os efeitos a serem considerados no modelo, bem como a melhor forma de inclusão (efeito fixo ou aleatório). Posteriormente, foi estudada a relação entre as frequências alélicas e genotípicas do gene DMRT3 com os padrões de parentesco e endogamia de acordo com cada tipo de marcha. Um estudo de associação genômica ampla em passo único (considerando informações de animais genotipados e não-genotipados simultaneamente) foi conduzido para verificar regiões genômicas, polimorfismos de nucleotídeo único e genes relacionados com a determinação do tipo de marcha em cavalos Mangalarga Marchador. Vinte e dois polimorfismos de nucleotídeo único localizados nos cromossomos 4(N = 5), 6 (2), 16 (1), 23 (11), 26 (1) e 29 (2), foram responsáveis por 42,43% da variância genética aditiva. Foram associados ao tipo de marcha 69 genes, mas cerca de 39 não estavam anotados em equinos. Foi conduzido um blast a fim de recuperar a função mais provável destes genes. Foram encontradas oito vias metabólicas associadas ao tipo de marcha. Os principais genes envolvidos estavam relacionados à percepção de estímulos externos, metabolismo energético-oxidativo, sistema imune e aprendizado e ritmo da locomoção. Não foi possível identificar a(s) variante(s) causal(ais) do tipo de marcha, contudo este estudo foi o primeiro e verificar que a possível determinação genética do tipo de marcha em cavalos Mangalarga Marchador passa por diferenças em níveis metabólicos que garantem a adaptação dos animais ao tipo de andamento. The DMRT3 gene has been described as the main gene to act in gait determination in several equine breeds. The allele A of the SNP 23:g.22999655C>A of DMRT3 gene was identified as responsible for this trait. In the Brazilian Mangalarga Marchador breed, which presents two gait patterns with characteristics well defined, the AA and CA genotypes have been associated with marcha picada gait and CC genotype with marcha batida gait. The general aim of this study was to prospect genomic regions associated with marcha batida and marcha picada gaits in Mangalarga Marchador equines. 1,230 phenotypic data were used on the type of gait (marcha batida N = 1.006; marcha picada N = 227) and, considering the totality of known genealogy for each animal, 3,172 animals in the pedigree. Firstly, modelling strategies were tested for this trait in order to determine the effects to be considered in the model, as well as the best form of inclusion (fixed or random effect). Based on the best modelling strategy to be used, the relationship between the allelic and genotypic frequencies of the DMRT3 gene with kinship and inbreeding patterns was studied according to each type of gait. A single-step wide genomic association study (considering information from both genotyped and non-genotyped animals simultaneously) was conducted to verify genomic regions, single nucleotide polymorphisms and genes related to determination of gait type in Mangalarga Marchador horses. Twenty two single nucleotide polymorphisms located on chromosomes 4 (N = 5), 6 (2), 16 (1), 23 (11), 26 (1) and 29 (2) were responsible for 42.43% of the additive genetic variance. 69 genes were associated with gait type, but about 39 were not annotated in horses. A blast was conducted in order to recover the most likely function of these genes. Eight metabolic pathways were found associated with gait type and the main genes involved were related to the perception of external stimuli, energy-oxidative metabolism, immune system and learning and rhythm of locomotion. It was not possible to identify the causal variant(s) of the type of gait; however, this study was the first and to verify that the possible genetic determination of gait type in Mangalarga Marchador horses goes through differences in the metabolic levels that guarantee the adaptation of the animals to the type of gait.

O monitoramento da endogamia é fundamental para o estabelecimento de um programa de melhoramento animal. Os coeficientes de endogamia foram estimados a partir de segmentos de homozigose (FROH), matriz de parentesco genômico com frequências alélicas derivadas dos dados (FGRM), frequências alélicas ajustadas a 0,5 (FGRM05), excesso de homozigose (FHOM) e informação de pedigree (FPED) em bovinos Nelore e ovelhas Santa Inês. Os dados genotípicos para a população Nelore foram obtidos de 2.569 animais utilizando um painel de 725,293 polimorfismos de nucleotídeo único e um pedigree composto por 15.846 indivíduos. Para a população de ovinos Santa Inês, 576 animais foram genotipados para 47.033 polimorfismos de nucleotídeo único, juntamente com dados de pedigree de 32.266 indivíduos. Picos notáveis nos cromossomos 7, 12 e 21 dos bovinos e no cromossomo 16 das ovelhas, representavam ilhas de ROH (> 47%), destacando regiões possivelmente afetadas pela pressão seletiva. Os valores médios para FPED, FROH, FGRM e FGRM05 foram 0,005, 0,058, -0,007 e 0,40, respectivamente no caso do Nelore, enquanto valores medias de 0,32, 0,049, 0,015, 0,287 e 0,015 para FPED, FROH, FGRM, FGRM05 e FHOM, respectivamente no caso das ovelhas. Esses coeficientes de endogamia foram associados negativamente com peso ao nascer, peso à desmama, ganho de peso pós-desmame, escore de muscularidade, precocidade, conformação e circunferência escrotal em bovinos Nelore e para todas as características analisadas em Santa Inês. Também foi encontrada uma correlação negativa entre depressão endogâmica e estimativas de variâncias genômicas de dominância variando de -0,35 a -0,98 para Nelore e -0,89 a -0,91 para ovinos Santa Inês. Nós afirmamos que as descobertas relatadas podem ser usadas para manter a diversidade genética em bovinos Nelore e ovelhas Santa Inês sob uma perspectiva genômica. Monitoring inbreeding is critical for establishing a sustainable breeding program. Inbreeding coefficients were estimated from runs of homozygosity (FROH), genomic relationship matrices coupled with allele frequencies derived from data (FGRM), allele frequencies set to 0.5 (FGRM05), excess of homozygosity (FHOM), and pedigree information (FPED) from Nellore cattle and Santa Ines populations. Genotypic data for the Nellore population were obtained from 2,803 animals using a panel of 725, 293 single-nucleotide polymorphisms and a pedigree consisting of 15,846 individuals. For the Santa Ines sheep population 576 animals were genotyped for 47,033 single-nucleotide polymorphisms along with pedigree data of 32,266 individuals. In cattle noticeable peaks on chromosome 7, 12, and 21, and in sheep on chromosome 16, represented hotspots of autozygosity (> 47%), highlighting putative regions affected by selective pressure. The mean values for FPED, FROH, FGRM, and FGRM05 were 0.005, 0.058, -0.007, and 0.40, respectively for Nellore, while for Santa Ines were 0.32, 0.049, 0.015, 0.287 and 0.015 for FPED, FROH, FGRM, FGRM05 and FHOM, respectively. These inbreeding coefficients were negatively associated with birth weight, weaning weight, post-weaning weight gain, muscularity score, finishing score, conformation score, and scrotal circumference on Nellore and for all traits analyzed on Santa Ines. Also, a negative correlation was found between inbreeding depression and estimates of dominance genomic variances ranging from -0.35 to -0.98 for Nellore and -0.89 to -0.91 for Santa Ines sheep. We contend that the findings reported here can be used to maintain genetic diversity in Nellore cattle and Santa Ines sheep from a genomic perspective.

O objetivo do trabalho foi verificar se existe associação dos polimorfismos de lócus microssatélites com o desempenho e expressão gênica. Após genotipagem, os alelos 122 e 130 foram observados, com frequência de 0,94 e 0,06. A frequência gênica foi de 0,88 para animais 130/130 e de 0,12 para indivíduos 122/130. Não houve diferença para os dados fenotípicos entre animais de genótipos diferentes, embora o grupo de animais heterozigoto tenha apresentado uma leve superioridade. A taxa de expressão do Gh não é estatisticamente diferente entre os genótipos observados, porém o grupo homozigoto teve uma taxa de expressão de mRNA maior e mesmo assim menores valores de peso e comprimento, sugerindo uma correlação. O par de iniciadores desenhado amplificou e genotipou com eficiência o locus STR nos animais estudados. A falta de qualidade da água e o manejo inadequado dos animais podem ser os causadores das alterações histopatológicas encontradas no fígado dos animais estudados. Os peixes podem ser via de contaminação humana, devido ao seu consumo como alimento, portanto, medidas de controle devem ser iniciadas para minimizar esse processo. Estudos mais aprofundados com maior controle ambiental, maior variabilidade alélica, maior número amostral e análise de outros genes de interesse associados, seriam interessantes para complementar e enriquecer o presente trabalho. The objective of this study was to verify if there is association of polymorphisms of microsatellite loci with the performance and gene expression. After genotyping, alleles 122 and 130 were observed, with a frequency of 0,94 and 0,06. The gene frequency was 0,88 for 130/130 animals and 0,12 for 122/130 individuals. There was no difference for phenotypic data among animals of different genotypes, although the group of heterozygous animals presented a slight superiority. The expression rate of GH is not statistically different among the observed genotypes, but the homozygote group had a higher mRNA expression rate and even lower values of weight and length, suggesting a correlation. The pair of primers designed amplified and efficiently genotyped the STR locus in the animals studied. The lack of water quality and inadequate management of the animals may be the cause of the histopathological changes found in the liver of the animals studied. Fish can be a way of human contamination, due to their consumption as food, therefore, control measures must be initiated to minimize this process. Further studies with greater environmental control, greater allelic variability, greater sample size and analysis of other associated genes of interest, would be interesting to complement and enrich the present work.

Um total de 168 machos Bos indicus foram abatidos depois de 8, 15, 35, 49, 63, 91, 120 e 154 dias após a aplicação de eprinomectina e ivermectina (convencional e longa ação), e 18 diferentes tecidos comestíveis foram avaliados quanto à concentração de resíduos dessas moléculas para verificar se o período de carência estabelecido garante o esgotamento em todos eles, em níveis abaixo dos limites máximos estabelecidos por agências reguladoras internacionais, com o objetivo de abordar questões relacionadas à barreiras técnico-comerciais entre países. Além disso, visou analisar se a concentração desses resíduos é afetada pelo processamento térmico, para avaliar a coerência de se considerar para produtos enlatados, os mesmos limites determinados para produtos crus. As análises de concentração de resíduos foram feitas por HPLC (sistema LC-MS/MS). Os dados foram transformados para escala \"logaritmo natural\" e foi realizada análise de variância, teste de comparação múltipla, análises de regressão e de correlação. Os resultados demonstraram que os níveis de eprinomectina encontrados foram abaixo de todos os limites máximos de resíduos (LMR), ao longo de todos os períodos e tecidos avaliados. Com relação à ivermectina, padrões diferenciados de distribuição foram observados, porém ao final do período de carência, dos 18 tecidos avaliados, 17 apresentaram concentrações dentro dos LMR, com exceção do sítio de aplicação, em que se observou alto nível de dispersão e valores acima de alguns LMR, mesmo após cumprido o período de carência indicado na bula. Foram observadas correlações significativas (P

O objetivo do presente estudo foi avaliar a inclusão de duas fontes energéticas (alto açúcar e alto amido (AA), alta fibra e alto óleo (FO)) na dieta de asininos e equinos, através de ensaios de digestibilidade aparente dos nutrientes, características físico-químicas das fezes e parâmetros sanguíneos, vinculados ao metabolismo energético dos equídeos. Foram utilizados 20 equídeos, dez equinos da raça Quarto de Milha e dez asininos da raça Pêga, distribuídos no delineamento alternado do tipo Cross-Over, com duas fontes energéticas e duas espécies. As dietas experimentais foram compostas de 50% da energia proveniente do Feno Tifton 85 (Cynodon spp.) e 50% proveniente do concentrado, formulados a base amido e açúcar, e fibra e óleo. Foi observado efeito de dieta (p0,05) de dieta ou de espécie. Dietas composta por predominância de volumoso acrescido de concentrado a base de amido e açúcar e fibra e óleo são igualmente aproveitadas pelos equídeos com destaque para a dieta fibra e óleo no aproveitamento de lipídios, sem causar efeito deletério sobre as características físico-químicas, o pH e a capacidade tamponante das fezes. Asininos são mais eficientes no tamponamento de ácidos intestinais. Os asininos apresentam maiores concentrações sanguíneas de AGCC totais e acetato nas fezes, porém não no sangue nas dietas a base de FO. A glicemia e insulinêmica de asininos é menor do que a de equinos. Dietas com açúcar e amido apresentam maiores níveis glicêmicos e insulinêmicos para ambas as espécies. Dietas a base de fibra e óleo se mostraram promissoras para ambas as espécies, em especial para os asininos. The aim of the present study was to evaluate the inclusion of two energy sources (high sugar and high starch (AA), high fiber and high oil (FO)) in the diet of asinines and equines, through the trials of apparent digestibility of nutrients, physico-chemical characteristics of feaces and blood parameters, related to equine energy metabolism. Twenty equids, 10 Quarter Horse horses and 10 Pêga breed donkeys were used, distributed in an alternate Cross-Over type design, with two energetic sources and two species. Experimental diets were composed of 50% of the energy from the Tifton 85 (Cynodon spp.) and 50% from the concentrate, based on starch and sugar, and fiber and oil. It was observed effect of diet (p

O objetivo deste trabalho foi quantificar as concentrações de heat shock protein (HSP) 27 e 70 no músculo Longissimus thoracis bovino e avaliar o perfil proteico das amostras no decorrer do processo de maturação, bem como, a relação com as características de qualidade da carne. Foram utilizados 191 animais ½ Simental Sul Africano x ½ Nelore (½ S x ½ N), castrados e terminados em confinamento. Para qualidade da carne mensurou-se os valores de pH, cor (L*, a* e b*), perda de água por cocção (PAC) e força de cisalhamento (FC) em dois tempos de maturação (um e 14 dias). Para a quantificação de HSP 27 e 70 foram selecionadas 40 amostras em função dos valores de FC, e separadas em dois grupos (mais e menos macia) com 20 amostras cada, dentro de cada tempo de maturação (48h e 14 dias). Para realização da análise proteômica foram selecionados três animais de cada grupo e tempo de maturação. A concentração de HSP 27 apresentou diferença significativa (P < 0,05) entre os tempos de maturação dentro dos dois grupos estudados. Já para a HSP 70 verificou-se diferença significativa (P < 0,05) apenas para as amostras do grupo mais macia. A análise de correlação mostrou que as HSP 27 e 70 não interferiram nas características de qualidade da carne. A análise proteômica identificou seis proteínas diferencialmente abundantes (P < 0,05) e o enriquecimento funcional demonstrou que essas proteínas estão relacionadas com processos biológicos e componentes celulares. A desmina e a glicerol-3-fosfato desidrogenase demonstraram correlação com a FC e coloração da carne, respectivamente. Os resultados indicam que as HSP 27 e 70 não podem ser apontadas como biomarcadores eficientes para qualidade de carne em animais ½ S x ½ N. Já a glicerol-3-fosfato desidrogenase demonstrou forte potencial em predizer a estabilidade da cor da carne. Desmina pode ser apontada como um importante biomarcador candidato associado à maciez da carne em animais ½ S x ½ N. The aim of this work was to quantify the concentrations of heat shock protein (HSP) 27 and 70 in Longissimus thoracis muscle and evaluate the protein profile of the samples during the aging process and its relationship with meat quality characteristics. A total of 191 steers ½ Simmental South African x ½ Nellore (½ S x ½ N) feedlot-finished, were used in this work. For meat quality, pH values, color values (L *, a * and b *), cooking loss (CL) and shear force (SF) were measured in two aging times (one and 14 days). For quantification of HSP 27 and 70, 40 samples were selected according to the SF values and separated into two groups (more and less tender) with 20 samples each, according to the aging time (one and 14 days). To perform the proteomic analysis were selected three animals from each group and aging time. The concentration of HSP 27 showed a significant difference (P < 0.05) between aging times within both groups. As for the HSP 70, there was a significant difference (P < 0.05) for the tenderness samples. Correlation analysis showed that the HSP 27 and 70 didn\'t affect the meat quality traits. The proteomic analysis identified six proteins differentially expressed (P < 0.05) and functional enrichment analysis demonstrated that these proteins are associated with biological processes and cellular components. Desmin and glycerol-3-phosphate dehydrogenase showed correlation with meat traits of SF and color, respectively. The results indicate that HSP 27 and 70 could not be identified as effective biomarkers for meat quality in ½ S x ½ N. However, glycerol-3-phosphate dehydrogenase showed a strong potential in predicting meat color stability. Desmin can be shown as a candidate biomarker associated with meat tenderness in ½ S x ½ N.

No Brasil, a perspectiva de aumento do volume de exportações e a exigência dos diferentes mercados faz com que a adaptação da cadeia produtiva da carne seja necessária, assim como a mudança de conceitos e critérios de seleção dos animais, de forma a melhorar as características consideradas pelo consumidor como de primeira importância: aparência e a palatabilidade. Porém existem diversos fatores que podem influenciar na qualidade da carne: sexo, raça (genética), idade, nutrição e estresse durante a vida do animal. Esses fatores influenciam diretamente no produto final, pois têm relação com as mudanças que ocorrem durante o post mortem. Desta forma, este trabalho teve como objetivo geral avaliar a influencia do pH, da condição sexual e de polimorfismos genéticos em genes relacionados à qualidade da carne e a resposta ao estresse sobre a variação das características da carne em rebanho bovino comercial Simental Sul Africano x Nelore. Para isso o trabalho foi dividido em duas partes: (a) avaliar os parâmetros de qualidade da carne em dois diferentes tempos de maturação (48 horas e 15 dias), sendo estudadas as variações entre os sexos (fêmeas e machos castrados), e nos diferentes valores de pH (classe 1=pH ≤ 5,79 e classe 2=pH ≥ 5,8). (b) Associar SNPs de diferentes genes ou marcadores (CAPN, UOGCAST, NR3C1_1, NR3C2_1, TG5) ligados a características de qualidade da carne, visando compreender melhor os efeitos genéticos desses marcadores sobre as características da carne. Para esta pesquisa foram avaliados 485 bovinos (182 fêmeas e 303 machos) recriados e terminados em confinamento. Os resultados mostraram haver relação do sexo como parâmetros de cor e maciez. As classes de pH mostraram relação significativa com a cor da carne. Verificou-se incidência de carnes DFD (pH≥5,8) da ordem de 5,3%. Dos polimorfismos estudados foram encontradas associações significativas apenas para CAPN, NR3C1_1 e TG. O CAPN relacionado à cor e, NR3C1_1 e TG com as perdas de água por cocção (PAC). Portanto, é possível inferir que tanto o sexo quanto as classes de pH tem influencia direta com os parâmetros de qualidade da carne. Os polimorfismos dos genes CAPN, NR3C1_1 e TG propiciaram mudanças nas características físico-químicas da carne. In Brazil, the prospect of increased exports and the requirement of different markets makes necessary adaptation of the meat production chain, as the change of concepts and criteria in animal selection to improve the characteristics that the consumer consider as most important: appearance and palatability. However, there are some factors that could influence meat quality: sex, breed (genetics), age, nutrition and stress during the life of the animal. These factors directly influence the final product, since they are related to changes that occur during post mortem period. The aim was to evaluate the pH influence, sexual condition and genetic polymorphisms on genes related to meat quality and stress response on meat quality variation of South African Simmental x Nellore beef cattle. Therefore, this research were divided into two parts: (a) to evaluate the meat quality characteristics in two different aging times (2 and 15 days), being studied variations within the sexual condition (females and castrated males), as well as within the pH range (pH ≤ 5.79 Class 1 and Class 2 ≥ pH 5.8). (b) Associate SNPs of different genes (CAPN, UOGCAST, NR3C1_1, NR3C2_1, TG5) with meat quality characteristics. For this research were evaluated 485 animals (182 heifers and 303 steers) recreated and finished in feedlot. The results shows relation of sex with color and tenderness and, from pH range with color. There was an incidence of DFD meat (pH≥5,8) of 5,3%. The CAPN polymorphism was associated with color meat and NR3C1_1 and TG with cooking loss. Therefore, it is possible to infer that both sex and pH value influence in the meat quality. The polymorphisms CAPN, NR3C1_1 and TG led to changes in the physicochemical characteristics of the meat.