8 results on '"Kovářová, Anežka"'
Search Results
2. Contribution of the multi‐echo approach in accelerated functional magnetic resonance imaging multiband acquisition.
- Author
-
Kovářová, Anežka, Gajdoš, Martin, Rektor, Ivan, and Mikl, Michal
- Subjects
- *
FUNCTIONAL magnetic resonance imaging - Abstract
We wanted to verify the effect of combining multi‐echo (ME) functional magnetic resonance imaging (fMRI) with slice acceleration in simultaneous multi‐slice acquisition. The aim was to shed light on the benefits of multiple echoes for various acquisition settings, especially for levels of slice acceleration and flip angle. Whole‐brain ME fMRI data were obtained from 26 healthy volunteers (using three echoes; seven runs with slice acceleration 1, 4, 6, and 8; and two different flip angles for each of the first three acceleration factors) and processed as single‐echo (SE) data and ME data based on optimal combinations weighted by the contrast‐to‐noise ratio. Global metrics (temporal signal‐to‐noise ratio, signal‐to‐noise separation, number of active voxels, etc.) and local characteristics in regions of interest were used to evaluate SE and ME data. ME results outperformed SE results in all runs; the differences became more apparent for higher acceleration, where a significant decrease in data quality is observed. ME fMRI can improve the observed data quality metrics over SE fMRI for a wide range of accelerated fMRI acquisitions. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
3. Monoclimate Incubation Chamber
- Author
-
Kovářová, Anežka
- Subjects
sensor ,microcontroller ,Arduino ,monoclimate incubator ,In vitro cell cultivation ,temperature control - Abstract
This project deals with the design of the monoclimate incubator chamber for in vitro cell cultivation and cell observing under the confocal microscope. It is based on requirements and parameters set by the biophysics laboratory of the Department of Biomedical Engineering. The resultant device will serve for optical measurements of in vitro cell cultivations.
- Published
- 2017
4. Monoklimatická inkubační komora - řízení teploty komory
- Author
-
Sekora, Jiří, Pánek, Libor, Kovářová, Anežka, Sekora, Jiří, Pánek, Libor, and Kovářová, Anežka
- Abstract
Bakalářská práce se zabývá návrhem a realizací monoklimatické inkubační komory pro kultivaci buněk in vitro a jejich pozorování pod konfokálním mikroskopem. Vychází ze stanovených požadavků a parametrů zadaných laboratoří biofyziky FEKT VUT. Je zde vysvětlena kultivace buněk in vitro a popsány senzory pro měření teploty a vzdušné vlhkosti. Hlavní část práce se věnuje teoretickému návrhu a následné realizaci temperované monoklimatické komory s možností snímání a řízení teploty a kontroly vlhkosti pomocí mikrokontroléru., This bachelor thesis deals with the design of the monoclimate incubator chamber for in vitro cell cultivation and cell observing under the confocal microscope. It is based on requirements and parameters set by the biophysics laboratory of FEEC BUT. In vitro cell cultivation is explained, temperature and humidity sensors are described here. The main part is dedicated to the theoretical design and realization of the tempered monoclimate chamber with temperature controlling and humidity control using a microcontroller.
5. Porovnání a optimalizace měření single-echo a multi-echo BOLD fMRI dat
- Author
-
Mikl, Michal, Jiřík, Radovan, Kovářová, Anežka, Mikl, Michal, Jiřík, Radovan, and Kovářová, Anežka
- Abstract
Diplomová práce pojednává o funkční magnetické rezonanci a sledování vlivu metod akcelerace akvizice na kvalitu funkčních snímků a pozorovaný BOLD signál. Jsou zde stručně popsány základní principy zobrazování pomocí magnetické rezonance, dále vysvětlena specifika funkční magnetické rezonance a popsán vznik a snímání BOLD signálu. Následně je definován fMRI experiment a popsány sekvence používané pro fMRI se zaměřením na techniky urychlení akvizice. Poté je vysvětlen vliv parametrů sekvencí na kvalitu zobrazení a uvedeny metody zpracování dat. V praktické části jsou popsány parametry použitých sekvencí, postup měření a úkol pro měřený subjekt během akvizice. Byla nasnímána data od 26 zdravých dobrovolníků, která byla následně analyzována. Na základě toho byly vyhodnoceny rozdíly mezi různými variantami sekvencí a potvrzen počáteční předpoklad, že multi-echo akvizice přináší lepší výsledky při rychlejším měření než single-echo., This master’s thesis deals with functional magnetic resonance and monitoring of the effect of acquisition acceleration methods on the quality of functional images and observed BOLD signal. The basic principles of magnetic resonance imaging, the explanation of the specifics of functional magnetic resonance and the formation and scanning of BOLD signal are described here. Subsequently, there is the definition of fMRI experiment and description of sequences used for fMRI, focusing on aquisition acceleration techniques. The influence of sequence parameters on image quality and the data processing methods are explained aftewards. The practical part describes the parameters of used sequences, the acquisition procedure and the task for the subject during aquisition. Data from 26 healthy volunteers were obtained and analyzed afterwards. Based on this, the differencesbetween the different sequence variants were evaluated and the initial assumption that the multi-echo acquisition yields better results with faster measurements than single-echo was confirmed.
6. Monoklimatická inkubační komora - řízení teploty komory
- Author
-
Sekora, Jiří, Pánek, Libor, Kovářová, Anežka, Sekora, Jiří, Pánek, Libor, and Kovářová, Anežka
- Abstract
Bakalářská práce se zabývá návrhem a realizací monoklimatické inkubační komory pro kultivaci buněk in vitro a jejich pozorování pod konfokálním mikroskopem. Vychází ze stanovených požadavků a parametrů zadaných laboratoří biofyziky FEKT VUT. Je zde vysvětlena kultivace buněk in vitro a popsány senzory pro měření teploty a vzdušné vlhkosti. Hlavní část práce se věnuje teoretickému návrhu a následné realizaci temperované monoklimatické komory s možností snímání a řízení teploty a kontroly vlhkosti pomocí mikrokontroléru., This bachelor thesis deals with the design of the monoclimate incubator chamber for in vitro cell cultivation and cell observing under the confocal microscope. It is based on requirements and parameters set by the biophysics laboratory of FEEC BUT. In vitro cell cultivation is explained, temperature and humidity sensors are described here. The main part is dedicated to the theoretical design and realization of the tempered monoclimate chamber with temperature controlling and humidity control using a microcontroller.
7. Monoklimatická inkubační komora - řízení teploty komory
- Author
-
Sekora, Jiří, Pánek, Libor, Kovářová, Anežka, Sekora, Jiří, Pánek, Libor, and Kovářová, Anežka
- Abstract
Bakalářská práce se zabývá návrhem a realizací monoklimatické inkubační komory pro kultivaci buněk in vitro a jejich pozorování pod konfokálním mikroskopem. Vychází ze stanovených požadavků a parametrů zadaných laboratoří biofyziky FEKT VUT. Je zde vysvětlena kultivace buněk in vitro a popsány senzory pro měření teploty a vzdušné vlhkosti. Hlavní část práce se věnuje teoretickému návrhu a následné realizaci temperované monoklimatické komory s možností snímání a řízení teploty a kontroly vlhkosti pomocí mikrokontroléru., This bachelor thesis deals with the design of the monoclimate incubator chamber for in vitro cell cultivation and cell observing under the confocal microscope. It is based on requirements and parameters set by the biophysics laboratory of FEEC BUT. In vitro cell cultivation is explained, temperature and humidity sensors are described here. The main part is dedicated to the theoretical design and realization of the tempered monoclimate chamber with temperature controlling and humidity control using a microcontroller.
8. Porovnání a optimalizace měření single-echo a multi-echo BOLD fMRI dat
- Author
-
Mikl, Michal, Jiřík, Radovan, Kovářová, Anežka, Mikl, Michal, Jiřík, Radovan, and Kovářová, Anežka
- Abstract
Diplomová práce pojednává o funkční magnetické rezonanci a sledování vlivu metod akcelerace akvizice na kvalitu funkčních snímků a pozorovaný BOLD signál. Jsou zde stručně popsány základní principy zobrazování pomocí magnetické rezonance, dále vysvětlena specifika funkční magnetické rezonance a popsán vznik a snímání BOLD signálu. Následně je definován fMRI experiment a popsány sekvence používané pro fMRI se zaměřením na techniky urychlení akvizice. Poté je vysvětlen vliv parametrů sekvencí na kvalitu zobrazení a uvedeny metody zpracování dat. V praktické části jsou popsány parametry použitých sekvencí, postup měření a úkol pro měřený subjekt během akvizice. Byla nasnímána data od 26 zdravých dobrovolníků, která byla následně analyzována. Na základě toho byly vyhodnoceny rozdíly mezi různými variantami sekvencí a potvrzen počáteční předpoklad, že multi-echo akvizice přináší lepší výsledky při rychlejším měření než single-echo., This master’s thesis deals with functional magnetic resonance and monitoring of the effect of acquisition acceleration methods on the quality of functional images and observed BOLD signal. The basic principles of magnetic resonance imaging, the explanation of the specifics of functional magnetic resonance and the formation and scanning of BOLD signal are described here. Subsequently, there is the definition of fMRI experiment and description of sequences used for fMRI, focusing on aquisition acceleration techniques. The influence of sequence parameters on image quality and the data processing methods are explained aftewards. The practical part describes the parameters of used sequences, the acquisition procedure and the task for the subject during aquisition. Data from 26 healthy volunteers were obtained and analyzed afterwards. Based on this, the differencesbetween the different sequence variants were evaluated and the initial assumption that the multi-echo acquisition yields better results with faster measurements than single-echo was confirmed.
Catalog
Discovery Service for Jio Institute Digital Library
For full access to our library's resources, please sign in.