Search

Turunçgil meyveleri, çeşitli fungal hastalık etmenleri tarafından neden olunan hasat sonrası hastalıklara karşı oldukça duyarlıdır. Geotrichum citri-aurantii'nin neden olduğu ekşi çürüklük, turunçgillerin en önemli hasat sonrası hastalıklarından biridir. Hastalıkla mücadelede genellikle sentetik fungisitler yaygın olarak kullanılsa da söz konusu uygulamaların son yıllarda etkisizliğinin yanı sıra insan sağlığı ve çevre üzerine olan zararlı etkileri birçok çalışmada bildirilmiştir. Hasat sonrası hastalıklara karşı antagonistik bakteri etmenlerinin kullanıldığı biyolojik mücadele, sentetik fungisitlere umut verici bir alternatif olduğu birçok farklı konukçu bitki patojen ilişkilerinin irdelendiği çalışmalarda araştırılmıştır. Bu çalışmada sağlıklı turunçgil ağaçlarının meyve, dal ve yapraklarından elde edilen endofitik bakteri izolatlarının biyokontrol potansiyelleri G. citri-aurantii'ye karşı petri denemeleri (in vitro) ve meyve testleri (yarı in vivo) ile araştırılmıştır. İzole edilen 24 aday bakteri izolatı arasından seçilen on altı farklı bakteri izolatı G. citri-aurantii'nin misel gelişiminin engellenmesi üzerine olan antagonistik potansiyeli in vitro çalışmalarda değerlendirilmiştir. Test edilen bakteriler arasında Bacillus spp. ait izolatlar fungal etmenin misel gelişimini % 59.5-78.6 oranında engellemiştir. En yüksek antagonistik etkinlik B. subtilis CM8 (% 78.6) izolatı tarafından neden olunmuştur. Acinetobacter johnsonii CT7, Erwinia herbicola CM5, Pseudomonas putida CL2, Pantoea agglomerans CM14, Acinetobacter lwoffii CP1 ve Stenotrophomonas maltophilia CP3 izolatları, ikili kültür denemelerinde misel gelişimini engellemede başarısız olmuştur. Bakteriyel izolatların antagonistik etkinlikleri, fungus inokulasyonundan önceki ön inkübasyon süresi ile artmıştır. Bacillus spp ait izolatlar engellenme bölgesine yakın noktalardaki hiflerde vakuolleşme, büzüşme, şişme ve erime gibi önemli morfolojik değişikliklere neden olmuştur. Yapay olarak enfekte edilen turunçgil meyveleri üzerinde hastalık çıkışı Bacillus spp. ait izolatlar tarafından % 56.7-83.3 gibi önemli oranlarda baskılanmıştır. Elde edilen sonuçlar, Bacillus spp. ait izolatların güçlü antagonistik aktivitelerinden dolayı, turunçgillerin hasat sonrası hastalık etmen(ler)i ile mücadelesinde biyofungisit olarak kullanılma potansiyeline sahip olduğunu göstermiştir., Citrus fruits are susceptible to postharvest decays caused by various pathogenic fungal disease agents. Citrus sour rot, caused by Geotrichum citri-aurantii is one of the most important postharvest diseases of citrus fruits Although synthetic fungicides are commonly used to combat the disease, ineffectiveness of these applications as well as their harmful effects on human health and the environment have been reported in many studies recently. Biological control of postharvest diseases utilizing antagonistic bacteria has been explored in different host plant-pathogen interactions as a promising alternative to synthetic fungicides. In this study, biocontrol potentials of endophytic bacterial isolates, obtained from fruits, branch and leaves of healthy citrus trees, were investigated against Geotrichum citri-aurantii on petri plates (in vitro) and fruit tests (semi in vivo conditions). Among the 24 putative endophytic bacterial isolates isolated, sixteen different antagonist bacterial isolates were selected and assessed against mycelial growth inhibition of G. citri-aurantii in vitro studies. Among the bacterial isolates tested, Bacillus spp. isolates significantly inhibited mycelial growth of fungal agent by 59.5-78.6%. The highest mycelial growth inhibition was caused by B. subtilis CM8 (78.6%). Bacterial isolates of Acinetobacter johnsonii CT7, Erwinia herbicola CM5, Pseudomonas putida CL2, Pantoea agglomerans CM14, Acinetobacter lwoffii CP1 and Stenotrophomonas maltophilia CP3 failed to inhibit mycelial growth in dual culture assays. Antagonistic activities of bacterial isolates increased by the pre-incubation time before fungal inoculation. Bacterial isolates of Bacillus spp. caused considerably morphological changes such as vacuolation, shrivelling, swelling and lysis of hyphae close to inhibition zone. On artificially inoculated fruits, isolates of Bacillus spp. also found to suppressed disease incidence significantly by 56.7-83.3%. Due to strong antagonistic activities, isolates of Bacillus spp, tested in this study have the potential to be used as biofungicide for controlling post-harvest disease agent(s) of citrus fruits. more...

Rice is one of the important food sources in human nutrition. Rice blast disease caused Pyricularia oryzae is the most destructive disease which is seen in rice growing. The aim of this study was to investigate the effect of different spraying and planting methods on disease severity and yield in rice fields in the Mediterranean Region. Field trials were conducted onto rice fields which were grown Edirne variety in the Tabaklar village, Yüregir, Adana province and Sökün village, Silifke, Mersin province in 2011 and 2012, respectively. As a result of this study, the use of treated seeds and seedlings reduced the severity of the disease. The lowest disease severity was found as 6.1% and 9.3% where it was used by years. However, the disease severity was also recorded as the lowest value by 6.6% and 4.6%, respectively through foliar spraying in the plot where the seedlings were performed from treated seeds by years. No impact on different spraying and planting methods on the yield was found., Çeltik, insan beslenmesinde önemli besin kaynaklarından birisidir. Çeltik yanıklık hastalığına neden olan Pyricularia oryzae çeltik yetiştirilen alanlarda görülen en yıkıcı hastalıktır. Bu çalışmanın amacı Akdeniz Bölgesinde çeltik alanlarında yanıklık hastalığına karşı farklı ilaçlama ve ekim şeklinin hastalık şiddeti ve verim üzerine etkisinin araştırılmasıdır. Tarla denemeleri, 2011 ve 2012 yıllarında sırasıyla Adana İli Yüreğir ilçesi, Tabaklar Köyü’nde ve Mersin ili Silifke ilçesi Sökün Köyü’nde Edirne çeşidi yetiştirilen çeltik tarlasında yapılmıştır. Bu çalışma sonucunda, ilaçlı tohum ekimi ve fide dikimi hastalık şiddetini düşürmüştür. En düşük hastalık şiddetinin yıllara göre % 6.1 ve %9.3 ile ilaçlı tohum şeklinde fide dikimi yapılan parselde olduğu belirlenmiştir. İlaçlı tohum şeklinde fide dikimi yapılan parselde yeşil aksam ilaçlaması sonucunda da hastalık şiddeti yıllara göre % 6.6 ve % 4.6 ile en düşük bulunmuştur. Farklı ilaçlama metodu ve ekim yöntemlerinin ise verim üzerine etkisi gözlenmemiştir. more...

Patates (Solanum tuberosum L.), Türkiye’de en fazla tüketilen sebzelerin başında gelmektedir. Konya ilinin Çumra ilçesinde 2019 yılının Temmuz ayında patates yetiştirilen alanlarda gerçekleştirilen sörveyler sırasında ekşi koku yayan patates yumrularında beyaz miselyum ile kaplanmış suya batırılmış yumuşak lastik çürüklük lezyonları şeklinde yeni hastalık belirtileri gözlenmiştir. Yüzey dezenfeksiyonu yapılan enfekteli yumrulardan alınan dokular Patates Dekstroz Agar (PDA) besiyeri üzerine yerleştirilmiş ve 25°C’de inkübasyona bırakılmıştır. Enfekteli dokulardan hızlı büyüyen beyaz, düz ve süetimsi-tozlu görünümlü pigmentsiz fungal koloniler gelişmiştir. Gelişen kolonilerin miselyumları dichotomous olarak dallanmış, şeffaf ve bölmeli yapıda olup, hiflerden oldukça farklı boyutlarda şeffaf, tek hücreli ve silindirik yapıda havai artrokonidilerin geliştiği gözlenmiştir. Fungal etmenin kültürel ve morfolojik özellikleri Geotrichum candidum ile tutarlıdır. Yapay inokulasyon yapılan patates yumruları üzerinde doğal enfekteli patates yumrularında görülen belirtilerin benzeri gözlenmiş olup fungal etmen bu dokulardan yeniden izole edilmiştir. İzole edilen fungal etmenin morfolojik tanısı, Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) cihazı kullanarak protein profili ve Internal Transcribed Spacer (ITS) gen bölgesi (ITS1-5.8S rDNA-ITS4) çoğaltılıp dizilenmesi ile moleküler olarak da teyit edilmiştir. Gen bankasına kaydedilen temsili izolatın sekans sonucu G. candidum izolatı ile %99 oranında benzerlik göstermiştir. G. candidum’un sebep olduğu patates lastik çürüklük hastalığının varlığı Türkiye’de önceden bildirilmemiştir. Türkiye’de yetiştirilen patates yumrularında lastik çürüklüğü hastalığı etmeni G. candidum’un morfolojik ve moleküler karakterizasyonu ilk kez bu çalışma ile ortaya konulmuştur., Potato is the one of the most consumed vegetable in Turkey. During field surveys in June of 2019, new disease symptoms on potato tubers, displaying a water-soaked soft rubbery rot with a sour, fermented smell, and white mycelial growth, were observed in commercial fields in Çumra district of Konya, Turkey. Diseased tubers were collected and small tissue pieces from surface disinfected symptomatic tuber were placed on potato dextrose agar (PDA) and incubated at 25°C. Fast growing, flat, white to cream, dry and finely suede-like with no reverse pigmented fungal colonies were subsequently developed from infected tissues. Hyphae were hyaline, dichotomously branched and septate, producing aerial chains of hyaline, smooth, one-celled, cylindrical arthroconidia. Cultural and morphological characters were consistent with Geotrichum candidum. All artificially inoculated tubers displayed the same symptoms as seen for naturally infected tubers and the fungus having same morphological characters was re-isolated from inoculated tubers. Morphological identification of disease agent was confirmed molecularly based on protein profiling by using MALDI-TOF MS and also by sequencing amplified Internal Transcribed Spacer (ITS) region ((ITS1-5.8S rDNA-ITS4). The sequence was 99% identical and a representative sequence of isolate was submitted to GenBank. The presence of potato rubbery rot disease caused by G. candidum has not been previously reported in Turkey. This is the first report of morphological and molecular characterization of G. candidum causal disease agent of rubber rot on potato tubers grown in Turkey. more...