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198 results on '"Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587)"'

1. Microstructural characterization of carbon steel corrosion in clay borehole water under anoxic and transient acidic conditions

Author: Eddy Foy, Michel L. Schlegel, Nicolas Trcera, Cécile Blanc, Alexandre Romaine, Sophia Necib, Sylvie Daumas, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'études analytiques et de réactivité des surfaces (SEARS), Département de Physico-Chimie (DPC), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Agence Nationale pour la Gestion des Déchets Radioactifs (ANDRA), CFG Servives (CFG Servives), CFG services, Laboratoire Archéomatériaux et Prévision de l'Altération (LAPA - 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Subjects: Materials science, Sulfide, 020209 energy, General Chemical Engineering, (C) acid corrosion, Keywords: (A) carbon steel (B) AFS (XANES) (B) Raman spectroscopy (B) SEM (B) XRD (C) acid corrosion a b s t r a c t, 02 engineering and technology, 010501 environmental sciences, engineering.material, (B) Raman spectroscopy, 01 natural sciences, Corrosion, chemistry.chemical_compound, Siderite, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, General Materials Science, Ankerite, (B) AFS (XANES), 0105 earth and related environmental sciences, Magnetite, chemistry.chemical_classification, (A) carbon steel, Metallurgy, General Chemistry, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, (B) XRD, 6. Clean water, Silicate, chemistry, [ CHIM.MATE ] Chemical Sciences/Material chemistry, engineering, Pyrite, Clay minerals, (B) SEM
Abstract: International audience; The corrosion interface of low-alloy carbon steel (C-steel) coupons (P235, ferrite-pearlitic with a colum-nar microstructure) reacted in clay porewater seeping in a test chamber in situ in the Callovo-Oxfordian formation of the Meuse-Haute Marne Underground laboratory (France) was probed by microscopic and microspectrocopic techniques. Two series of samples were investigated, with extensive and limited corrosion , respectively. For extensively corroded coupons, several layers of inner corrosion products were observed. The innermost layer was made of Cl-rich Fe (hydr)oxide, later evolving to form a massive β-Fe2(OH)3 Cl unit close to C-steel, and sometimes crossed by magnetite ribbons sticking to cementite lamellas, or by patches of green rust. The second inner layer was made of veinlets of Fe hydrated silicate with a sponge-like morphology, a molecular-scale structure reminiscent of clay minerals, and containing nodules of siderite and chukanovite. These (hydroxy)carbonate solids sometimes merged to form a massive layer close to the trace of the original surface. The layers external to this original surface were dis-continuous and made of successively Ca-doped siderite (ankerite), Fe sulfide, S-rich Fe silicate, and finally pyrite nodules and ankerite. For the samples with limited damage, no β-Fe2(OH)3 Cl layer was observed, siderite or chukanovite were in close contact with metal, sometimes with interfacial magnetite, and the veinlets of Fe hydrated silicate were less developed. Only external layers of Fe sulfide and ankerite were observed. This suggests that these slightly corroding samples were in fact confined. Evidence for microbial activity was obtained in the form of a Fe sulfide fringe mixed with ankerite. Microbial activity may have induced some local heterogeneity in corrosion processes, e.g. by changing local pH conditions at mm-scale.
Published: 2016
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2. Proteome analysis of differentiating human myoblasts by dialysis-assisted two-dimensional gel electrophoresis (DAGE)

Author: Luis Garcia, Gaël A. Millot, Vincent Mouly, Gillian Butler-Browne, Belaid Bouazza, Jeanine Tortajada, Factor Svinartchouk, Olivier Danos, Florence Gonnet, Simin Ziaei, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe Myologie, Institut de Myologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer (DIGBFC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche et d'applications sur les thérapies géniques (CRATG), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Généthon, Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Généthon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - 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Paris 6 ( UPMC ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Association française contre les myopathies ( AFM-Téléthon ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Association française contre les myopathies ( AFM-Téléthon ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer ( DIGBFC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -INSTITUT CURIE-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de recherche et d'applications sur les thérapies géniques ( CRATG ), Université d'Évry-Val-d'Essonne ( UEVE ) -GENETHON 3-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), and Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: Proteomics, Cellular differentiation, Blotting, Western, Stathmin, Biology, Sensitivity and Specificity, Biochemistry, Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoprotein K, Myoblasts, 03 medical and health sciences, Cytosol, Differential expression, 0302 clinical medicine, Western blot, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], medicine, Humans, rho-Specific Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitors, Electrophoresis, Gel, Two-Dimensional, Molecular Biology, Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitors, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Two-dimensional gel electrophoresis, Factor XIII, Mass spectrometry, medicine.diagnostic_test, Myogenesis, Cell Differentiation, Molecular biology, Blot, STAT1 Transcription Factor, [ SDV.BBM.GTP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization, Proteome, biology.protein, 2-D PAGE, Protein identification, Dialysis, 030217 neurology & neurosurgery, Human
Abstract: In the present study, modifications in cytosolic expressed proteins during human myoblast differentiation were studied by dialysis‐assisted 2‐DE (DAGE, [1]). About 1000 spots were analysed on the 5th and 13th day of differentiation with a dynamic range of protein expression exceeding 1000‐fold. During myogenic differentiation, the number of nonmatching spots as well as the extent of quantitative differences between matched spots significantly increased. Over one hundred differentially expressed spots were excised and identified by MALDI‐TOF MS. The differentiation‐associated expression pattern of eight proteins was validated by Western blot analysis. Differential expression of several proteins was demonstrated for the first time in human myotubes. Interestingly, Ingenuity pathway analysis grouped 30 of these proteins into two overlapping networks containing as principal nodes IGF‐1 and tumour necrosis factor, two proteins known to play a crucial role in cytogenesis. Our results illustrate the large rearrangement of the proteome during the differentiation of human myoblasts and provide evidence for new partners involved in this complex process.
Published: 2008
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3. Assignment of IR bands of isolated and protein-bound Peridinin in its fundamental and triplet state by static FTIR, time-resolved step-scan FTIR and DFT calculations

Author: Elizabeth Kish, Bruno Robert, Riccardo Spezia, Alberto Mezzetti, Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes (SB2SM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Avancé de Spectroscopie pour les Intéractions la Réactivité et l'Environnement - UMR 8516 (LASIRE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centrale Lille Institut (CLIL), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectrochimie Infrarouge et Raman - UMR 8516 (LASIR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Bioénergétique, Biologie Stucturale, et Mécanismes ( SB2SM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Spectrochimie Infrarouge et Raman - UMR 8516 ( LASIR ), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement ( LAMBE - UMR 8587 ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université de Cergy Pontoise ( UCP ), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne ( UEVE ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: Light-harvesting systems, Infrared, ved/biology, Organic Chemistry, ved/biology.organism_classification_rank.species, Molecular vibrations, Peridinin, Photochemistry, Step-scan FTIR, Carotenoids, Analytical Chemistry, Inorganic Chemistry, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, chemistry.chemical_compound, chemistry, Excited state, Molecular vibration, Amphidinium carterae, [ CHIM.THEO ] Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Infrared difference spectroscopy, Molecule, Triplet state, Fourier transform infrared spectroscopy, Spectroscopy
Abstract: The vibrational properties of Peridinin in its fundamental state and in the excited triplet state have been investigated by DFT calculations and static and time-resolved FTIR spectroscopy. The infrared spectrum of Peridinin in its fundamental state has been explored in the whole 2000-600 cm-1 range, and interpreted in term of molecular vibrations. In particular, new infrared bands have been identified and assigned to specific molecular vibrations. 3Peridinin molecular vibrations have also been investigated by DFT calculations. In addition, putative IR bands belonging to Peridinin and 3Peridinin have been identified in the step-scan FTIR difference spectrum of the Peridinin-Chlorophyll a-Protein from Amphidinium carterae, where light induce formation of a triplet state localized on one or more Peridinins. The exact nature of the triplet state formed in Peridinin-Chlorophyll a-Protein from dinoflagellates, in particular the possible involvement in this triplet state of 3Chlorophyll a, has been largely debated in the last few years (see Carbonera et al., 2014 [3]); time-resolved differential FTIR experiments have played a key role in this debate. Identification of IR marker bands for the main molecule (Peridinin) implicated in this photophysical process is therefore particularly important and makes this study a significant step towards the full understanding of Peridinin-Chlorophyll-a-Proteins photophysics.
Published: 2015
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4. Protein complexes characterization in Arabidopsis thaliana by tandem affinity purification coupled to mass spectrometry analysis

Author: Jean Bigeard, Loïc Gérard, Jean Colcombet, Delphine Pflieger, Hakim Mireau, Heribert Hirt, Unité de recherche en génomique végétale (URGV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Absent, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche en génomique végétale ( URGV ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Évry-Val-d'Essonne ( UEVE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement ( LAMBE - UMR 8587 ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université de Cergy Pontoise ( UCP ), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne ( UEVE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Saclay, Institut Jean-Pierre Bourgin ( IJPB ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech
Subjects: 0106 biological sciences, Tandem affinity purification, 0303 health sciences, protein complexes, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], biology, Arabidopsis thaliana, Chemistry, tandem affi nity purification, [SDV]Life Sciences [q-bio], Computational biology, Mass spectrometry, biology.organism_classification, 01 natural sciences, Yeast, Characterization (materials science), 03 medical and health sciences, Cellular machines, Bimolecular fluorescence complementation, Nucleic acid, posttranslational modifications, 030304 developmental biology, 010606 plant biology & botany, mass spectrometry
Abstract: Proteins are major elements participating in all the key functions of the cells. They rarely fulfill their physiological roles in an autonomous way but rather act as part of more complex cellular machines. Indeed they can bind different types of molecules (proteins, nucleic acids, metabolites, etc.), via stable or transient interactions, depending on their nature and functions. The identification of the molecular partners of a given protein is hence essential to better understand its roles, regulation, and mechanisms of action.This chapter describes the use of a tandem affinity purification approach followed by mass spectrometry analysis to try to identify and characterize the proteins involved in protein complexes in Arabidopsis thaliana and decipher some mechanisms of regulation of the modules. Important elements to consider in such an approach are first extensively exposed in the introduction. This technique, in combination with complementary approaches like yeast two-hybrid and bimolecular fluorescence complementation, can be an interesting source of data to identify and characterize in vivo protein complexes.
Published: 2014
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5. Characterization of home-made graphite/PDMS microband electrodes for amperometric detection in an original reusable glass-NOA®-PDMS electrophoretic microdevice

Author: Fethi Bedioui, Jérémie Gouyon, Anne Varenne, Fanny d’Orlyé, Sophie Griveau, Institute of Chemistry for Life and Health Sciences (iCLeHS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de pharmacologie chimique et génétique et d'imagerie (UPCGI - UMR 8151 / UMR_S 1022 ), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Electrochimie et de Chimie Analytique (LECA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synthèse, électrochimie, imagerie et systèmes analytiques pour le Diagnostic (SEISAD), Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS - UM 4 (UMR 8258 / U1022)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and GRIVEAU, SOPHIE
Subjects: Electrophoresis, [CHIM.ANAL] Chemical Sciences/Analytical chemistry, Materials science, General Chemical Engineering, Microfluidics, Microchip, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, Chronoamperometry, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Electrochemistry, Screen printing, Polydimethylsiloxane, 021001 nanoscience & nanotechnology, Amperometry, 0104 chemical sciences, Microelectrode, chemistry, Chemical engineering, Electrode, Cyclic voltammetry, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; A new dismountable and reusable microchip for electrophoretic separation coupled to amperometric detection was developed. For this purpose, a new home made three-microbands electrode system was developed and microfabricated based on screen-printing for the inclusion of graphite/polydimethylsiloxane (C-PDMS) composite in microchannels down to 30 μm width. The composition of the composite as well as the fabrication methodology were optimized for an easy handling and an optimized electrochemical behavior. The electrochemical characterization of this composite material was first performed in bulk format (disc-shaped electrode, 6 mm diameter). It was then transposed to the micrometric scale for its integration in an original glass-NOA81®-PDMS microfluidic device allowing for reversible sealing. The microband electrodes were characterized by scanning electron microcopy and cyclic voltammetry, illustrating a good control of the microelectrode width. Then, the analytical performances of the C-PDMS composite microelectrodes were evaluated using Ru(NH3)63+ and FcMeOH as model electroactive molecules. The electrophoretic separation and quantitation of Ru(NH3)63+ were then performed in a background electrolyte made of hydrochloric acid and sodium chloride, leading to a LOD and a LOQ of 3.4 μmol L−1 and 11.3 μmol L−1, respectively. The re-openable NOA-based microdevice permits to regenerate the electrode surface by simply repositioning the microband on a new spot, allowing for robust analysis in a reusable system.
Published: 2020
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6. Species-specific titin splicing regulates cardiotoxicity associated with calpain 3 gene therapy for limb-girdle muscular dystrophy 2A

Author: Lostal, William, Roudaut, Carinne, Faivre, Marine, Charton, Karine, Suel, Laurence, Bourg, Nathalie, Best, Heather, Smith, John Edward, Gohlke, Jochen, Corre, Guillaume, Li, Xidan, Elbeck, Zaher, Knöll, Ralph, Deschamps, Jack-Yves, Granzier, Henk, Richard, Isabelle, GENETHON, Genethon, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Saclay, Développement et Pathologie du Tissu Musculaire (DPTM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes, Washington State University (WSU), Approches génétiques intégrées et nouvelles thérapies pour les maladies rares (INTEGRARE), École pratique des hautes études (EPHE)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-GENETHON 3-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Généthon, Laboratoire Analyse, Modélisation et Matériaux pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY), Physiopathologie Animale et bioThérapie du muscle et du système nerveux (PAnTher), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Généthon, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Généthon-École pratique des hautes études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)
Subjects: [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology
Abstract: International audience; Limb-girdle muscular dystrophy type 2A (LGMD2A or LGMDR1) is a neuromuscular disorder caused by mutations in the calpain 3 gene (CAPN3). Previous experiments using adeno-associated viral (AAV) vector-mediated calpain 3 gene transfer in mice indicated cardiac toxicity associated with the ectopic expression of the calpain 3 transgene. Here, we performed a preliminary dose study in a severe double-knockout mouse model deficient in calpain 3 and dysferlin. We evaluated safety and biodistribution of AAV9-desmin-hCAPN3 vector administration to nonhuman primates (NHPs) with a dose of 3 × 1013 viral genomes/kg. Vector administration did not lead to observable adverse effects or to detectable toxicity in NHP. Of note, the transgene expression did not produce any abnormal changes in cardiac morphology or function of injected animals while reaching therapeutic expression in skeletal muscle. Additional investigation on the underlying causes of cardiac toxicity observed after gene transfer in mice and the role of titin in this phenomenon suggest species-specific titin splicing. Mice have a reduced capacity for buffering calpain 3 activity compared to NHPs and humans. Our studies highlight a complex interplay between calpain 3 and titin binding sites and demonstrate an effective and safe profile for systemic calpain 3 vector delivery in NHP, providing critical support for the clinical potential of calpain 3 gene therapy in humans.
Published: 2019
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7. Design of model tokamak particles for future toxicity studies: Morphology and physical characterization

Author: Sarah Dine, I. Georges, F. Jambon, J. Chêne, Christian Grisolia, S. Garcia-Argote, Bernard Rousseau, Jérôme Rose, T. Acsente, Chiara Uboldi, G. Dine, M. Sanles Sobrido, Grégory Pieters, Véronique Malard, François Gensdarmes, Etienne Hodille, E. Bernard, Thierry Orsière, P. Beaunier, Dominique Vrel, Nathalie Herlin-Boime, Samuel Peillon, F. Miserque, Ph. Delaporte, Gheorghe Dinescu, Service de Chimie Bio-Organique et de Marquage (SCBM), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Edifices Nanométriques (LEDNA), Nanosciences et Innovation pour les Matériaux, la Biomédecine et l'Energie (ex SIS2M) (NIMBE UMR 3685), Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Réactivité des Surfaces et des Interfaces (LRSI), Département de Physico-Chimie (DPC), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Laboratoire de Réactivité de Surface (LRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ingénierie des Matériaux et des Hautes Pressions (LIMHP), Université Paris 13 (UP13)-Institut Galilée-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences des Procédés et des Matériaux (LSPM), Université Paris 13 (UP13)-Institut Galilée-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche sur la Fusion par confinement Magnétique (IRFM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), National Institute for Lasers, Plasma, and Radiation Physics - INFLPR (ROMANIA), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) (BIAM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Ecole Centrale Paris, Laboratoire Lasers, Plasmas et Procédés photoniques (LP3), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), A*MIDEX project - 'Investissements d'Avenir' French Government programFrench National Research Agency (ANR) [ANR-11-IDEX-0001-02], Toxicology Program of the French Alternative Energies and Atomic Energy Commission (CEA) through the TWEET project, CNRSCentre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CEAFrench Atomic Energy Commission, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut Galilée-Université Paris 13 (UP13), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Galilée-Université Paris 13 (UP13), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay
Subjects: Dusty plasma, Tokamak, Materials science, tungsten, Nuclear engineering, chemistry.chemical_element, Tungsten, fusion technology, 01 natural sciences, size, 010305 fluids & plasmas, law.invention, [SPI.MAT]Engineering Sciences [physics]/Materials, law, Sputtering, 0103 physical sciences, Nuclear fusion, General Materials Science, 010306 general physics, Civil and Structural Engineering, Mechanical Engineering, tungsten nano-particles, Fusion power, Characterization (materials science), Nuclear Energy and Engineering, chemistry, dust, oxide, Beryllium
Abstract: International audience; During ITER operation, it is expected that the large panel of plasma-wall interactions triggers the production of dust particles from the tungsten and beryllium first wall. These particles can be loaded with tritium (T) used as a fuel for the fusion reaction; T inventory is of prime importance for the safety assessment, particularly when considering dispersible matters that could be released in case of a Loss Of Vacuum Accident (LOVA),. The impact of accidental inhalation of such particles has therefore to be evaluated. Yet, particles properties in terms of tritium inventory and general behaviour are strongly dependent on their physical and chemical characteristics, and large uncertainties remain on those parameters; It is therefore important to obtain and characterize relevant W dust samples for toxicity studies before ITER operation starts. We produced model tungsten (W) Nano-Particles (NPs) by two different methods with characteristics closer to the plasma-wall interaction processes than grinding (usually used to produce commercial NPs): (i) magnetron plasma sputtering followed by gas condensation as well as (ii) laser ablation. The two types of tungsten NPs obtained exhibit very different properties investigated by a large characterization techniques panel; but both sets show similarities with samples collected in tokamak or observed in dusty plasmas setups, therefore could potentially be expected in ITER. Producing samples with strong differences is an asset to lead a first global study, highlighting which parameters are key, whether it affects the tritium inventory or the toxicity for lung cells during in vitro studies. In a second phase, it will help precise the impact of ITER particles when their definition will clarify. The aim of this paper is therefore to study and describe the characteristics of different types of W dusts, this knowledge being mandatory for the next steps of the project dealing with tritium inventory in the described W dusts and their suspension in various liquid media for cell exposure for toxicity studies.
Published: 2019
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8. Actin dynamics drive cell-like membrane deformation

Author: John Manzi, Antoine Allard, Clément Campillo, Camille Simon, Jean-François Joanny, Martin Lenz, Valentina Caorsi, Julie Plastino, Cécile Sykes, Remy Kusters, Pierre Sens, Majdouline Abou-Ghali, Aurélie Di Cicco, Daniel Lévy, Physico-Chimie-Curie (PCC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique et Modèles Statistiques (LPTMS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Physico-Chimie Curie [Institut Curie] (PCC), Institut Curie [Paris]-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU), Université Laval [Québec] (ULaval), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Paris-Jourdan Sciences Economiques (PSE), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-École des Ponts ParisTech (ENPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chaire Matière molle et biophysique, Collège de France (CdF (institution)), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Langues et civilisations à tradition orale (LACITO), Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3-Institut National des Langues et Civilisations Orientales (Inalco)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Nanosciences de Paris (INSP), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), King‘s College London, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, and Institut Curie-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Turgor pressure, Cell, General Physics and Astronomy, macromolecular substances, Membrane bending, Cell membrane, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, [PHYS.COND]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Actin, 030304 developmental biology, [PHYS]Physics [physics], Physics, 0303 health sciences, Tension (physics), technology, industry, and agriculture, [PHYS.MECA]Physics [physics]/Mechanics [physics], Actin cytoskeleton, medicine.anatomical_structure, Membrane, [PHYS.COND.CM-GEN]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Other [cond-mat.other], Biophysics, [PHYS.COND.CM-SCM]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Soft Condensed Matter [cond-mat.soft], 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Cell membrane deformations are crucial for proper cell function. Specialized protein assemblies initiate inward or outward membrane deformations that the cell uses respectively to uptake external substances or probe the environment. The assembly and dynamics of the actin cytoskeleton are involved in this process, although their detailed role remains controversial. We show here that a dynamic, branched actin network is sufficient to initiate both inward and outward membrane deformation. The polymerization of a dense actin network at the membrane of liposomes produces inward membrane bending at low tension, while outward deformations are robustly generated regardless of tension. Our results shed light on the mechanism cells use to internalize material, both in mammalian cells, where actin polymerization forces are required when membrane tension is increased, and in yeast, where those forces are necessary to overcome the opposing turgor pressure. By combining experimental observations with physical modelling, we propose a mechanism that explains how membrane tension and the architecture of the actin network regulate cell-like membrane deformations. The same type of polymer network deforms cell membranes inward, to absorb external material, and outward, to facilitate signal transmission. Experiments and theory show that these deformations are regulated by membrane tension and network mesh size.
Published: 2019
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9. A microscale double labelling of GAG oligosaccharides compatible with enzymatic treatment and mass spectrometry

Author: Romain R. Vivès, Véronique Bonnet, Cédric Przybylski, Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Glycochimie, des Antimicrobiens et des Agro-ressources - UMR CNRS 7378 (LG2A ), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe Structure et Activité des Glycosaminoglycanes (IBS-SAGAG ), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075 ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Glycochimie, des Antimicrobiens et des Agroressources (LG2A) UMR7378 UPJV/CNRS, Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Groupe Structure et Activité des Glycosaminoglycanes (IBS-SAGAG), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)
Subjects: Microgram, education, 010402 general chemistry, Mass spectrometry, 01 natural sciences, Catalysis, Glycosaminoglycan, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Labelling, Materials Chemistry, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Microscale chemistry, chemistry.chemical_classification, Chromatography, 010405 organic chemistry, Sulfatase, Metals and Alloys, General Chemistry, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], 0104 chemical sciences, Surfaces, Coatings and Films, Electronic, Optical and Magnetic Materials, Enzyme, chemistry, Ceramics and Composites, Heparinase I
Abstract: International audience; A novel double labelling of glycosaminoglycans (GAG) oligosaccharides by thia-Michael addition and deuterium incorporation at the non-reducing and reducing ends, respectively, was introduced. This was demonstrated to be both compatible with the heparin microgram scale and amenable for mass spectrometry analysis, without impairing enzymatic activities such as heparinase I and sulfatase HSulf-2.
Published: 2019
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10. Fragmentation Spectra Prediction and DNA Adducts Structural Determination

Author: Peter W. Villalta, Silvia Balbo, Riccardo Spezia, Andrea Carrà, Veronica Macaluso, University of Minnesota [Twin Cities] (UMN), University of Minnesota System, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Laboratoire de chimie théorique (LCT), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Minnesota [Twin Cities], Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine
Subjects: Guanine, Collision-induced dissociation, Electrons, Adductomics, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Molecular physics, Spectral line, Mass Spectrometry, Adduct, DNA Adducts, Fragmentation (mass spectrometry), Isomerism, Structural Biology, DNA adduct, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Spectroscopy, Density Functional Theory, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Chemistry, 010401 analytical chemistry, Tautomer, 0104 chemical sciences, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Fragmentation prediction, Mobile proton model, Mass spectrum, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph]
Abstract: International audience; In this work, chemical dynamics simulations were optimized and used to predict fragmentation mass spectra for DNA adduct structural determination. O6-methylguanine (O6-Me-G) was used as a simple model adduct to calculate theoretical spectra for comparison with measured high-resolution fragmentation data. An automatic protocol was established to consider the different tautomers accessible at a given energy and obtain final theoretical spectra by insertion of an initial tautomer. In the work reported here, the most stable tautomer was chosen as the initial structure, but in general, any structure could be considered. Allowing for the formation of the various possible tautomers during simulation calculations was found to be important to getting a more complete fragmentation spectrum. The calculated theoretical results reproduce the experimental peaks such that it was possible to determine reaction pathways and product structures. The calculated tautomerization network was crucial to correctly identifying all the observed ion peaks, showing that a mobile proton model holds not only for peptide fragmentation but also for nucleobases. Finally, first principles results were compared to simple machine learning fragmentation models.
Published: 2019
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11. Chemical Sensors Based on New Polyamides Biobased on (Z) Octadec-9-Enedioic Acid and β-Cyclodextrin

Author: Philippe Guégan, Véronique Bennevault, Jean-François Feller, Matthieu Sollogoub, Mickaël Castro, Mickaël Ménand, Lisday Duarte, Sananda Nag, Elena Zaborova, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LIMATB_UBS, Laboratoire d'Ingénierie des Matériaux de Bretagne (LIMATB), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Polymers and Plastics, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Hydrophobic effect, chemistry.chemical_compound, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Desorption, Polymer chemistry, Materials Chemistry, Organic chemistry, Physical and Theoretical Chemistry, chemistry.chemical_classification, Conductive polymer, Nanocomposite, Cyclodextrin, Organic Chemistry, Layer by layer, 021001 nanoscience & nanotechnology, Condensed Matter Physics, 0104 chemical sciences, [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, Monomer, chemistry, Polyamide, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; The synthesis of new biobased polyamides from different β-cyclodextrin monomers and the (Z) octadec-9-enedioic acid is investigated. The aim of this study is to design different sensors, having different sensibilities and selectivities to a set of various volatile organic compounds (VOC) relevant in the early detection of lung cancer. The sensors are obtained from the synthesized polyamides, using multiwalled carbon nanotubes as conductive nanofillers and a layer by layer process. The conductive polymer nanocomposites (CPC) designed from the heptakis-6-amino β-cyclodextrin and 6A,6D diamino β-cyclodextrin have a high affinity for polar protic solvents, while the CPC having a matrix based on 6A,6D diamino 2A-G,3A-G,6B,6C,6E,6F,6G nonadeca-O-benzyl-β-cyclodextrin develops hydrophobic interactions with nonpolar solvents. Due to a higher accessibility of cyclodextrin, the chemoresistive response of the hydrophilic linear polyamide CPC is larger than one of the hydrophilic branched polyamide CPC. As required, the VOC diffusion/desorption phenomenon is reversible for all the sensors.
Published: 2016
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12. Photoelectrochemical properties of nanocrystalline ZnS discrete versus continuous coating of ZnO nanorods prepared by electrodeposition

Author: I. Ben Assaker, A. Souissi, Patricia Beaunier, Fayna Mammeri, Sophie Nowak, S. Chaguetmi, A. Brayek, Radhouane Chtourou, Souad Ammar, Ludovic Mouton, M. Ghoul, Interfaces, Traitements, Organisation et Dynamique des Systèmes (ITODYS (UMR_7086)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de photovoltaique, Faculté des Sciences [Skikda], Université 20 Août 1955 Skikda, Laboratoire de Réactivité de Surface (LRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Photovoltaïque, Technopole de Borj-Cédria, Laboratoire Réactions et Génie des Procédés (LRGP), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Laboratoire de nanomatériaux et des systèmes pour les énergies renouvelables [Tunis], Université Tunis El Manar (UTM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Photocurrent, Materials science, General Chemical Engineering, Nanotechnology, Heterojunction, 02 engineering and technology, General Chemistry, engineering.material, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, Nanocrystalline material, 0104 chemical sciences, Coating, Chemical engineering, Quantum dot, Transmission electron microscopy, engineering, [CHIM]Chemical Sciences, Water splitting, Nanorod, 0210 nano-technology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; We developed nanostructured photoanodes for photoelectrochemical (PEC) water splitting and hydrogen generation. They are based on ZnO nanorods electrodeposited on conductive ITO glass on which ZnO@ZnS heterojunctions were formed using two different approaches. In the first case, the ZnO nanorods were sulfided by a prolonged contact with Na2S aqueous solution, while in the second one, they were immersed in an alcoholic solution of 2 nm sized polyol-made ZnS quantum dots (QDs). Transmission electron microscopy showed that a continuous thin layer of ZnS is formed around ZnO leading to a core@shell structure in the first case, while discrete QD aggregates were grafted at the surface of these rods leading to a kind of tologyin, in the second case. PEC properties of both composite films were measured, using a home-made electrochemical cell and illuminating the anodes with a Xenon lamp. A net enhancement of the photocurrent was observed when the ZnS coating was processed, suggesting a low carrier recombination rate, a higher efficiency toward water oxidation, and then electron transfer to the used cathode (Pt wire) for H+ reduction and H2 generation. Interestingly, the performances of the two composite films were found to be comparable, suggesting that a discrete coating of the ZnO nanorods by a small amount of preformed ZnS QDs is enough to improve their properties for the desired application.
Published: 2016
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13. F-actin mechanics control spindle centring in the mouse zygote

Author: Nir S. Gov, Marie-Emilie Terret, Raphaël Voituriez, Cécile Sykes, Agathe Chaigne, Clément Campillo, Marie-Hélène Verlhac, Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory for Molecular Cell Biology, University College of London [London] (UCL), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Departments of Chemical Physics, Weizmann Institute of Science [Rehovot, Israël], Physico-Chimie-Curie (PCC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), HAL-UPMC, Gestionnaire, Collège de France (CdF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-PSL Research University (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Weizmann Institute of Science, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Jean Perrin (LJP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Weizmann, and Department of Chemical Physics
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Cell biology, Cell division, [SDV]Life Sciences [q-bio], [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Science, Biophysics, General Physics and Astronomy, Fertilization in Vitro, Spindle Apparatus, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, macromolecular substances, Biology, Article, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Mice, 03 medical and health sciences, medicine, Animals, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Actin, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Multidisciplinary, Zygote, Pronucleus, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH] Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], General Chemistry, Mechanics, Oocyte, Spermatozoa, Actins, Spindle apparatus, Biological sciences, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, Centrosome, Oocytes, Astral microtubules
Abstract: Mitotic spindle position relies on interactions between astral microtubules nucleated by centrosomes and a rigid cortex. Some cells, such as mouse oocytes, do not possess centrosomes and astral microtubules. These cells rely only on actin and on a soft cortex to position their spindle off-centre and undergo asymmetric divisions. While the first mouse embryonic division also occurs in the absence of centrosomes, it is symmetric and not much is known on how the spindle is positioned at the exact cell centre. Using interdisciplinary approaches, we demonstrate that zygotic spindle positioning follows a three-step process: (1) coarse centring of pronuclei relying on the dynamics of an F-actin/Myosin-Vb meshwork; (2) fine centring of the metaphase plate depending on a high cortical tension; (3) passive maintenance at the cell centre. Altogether, we show that F-actin-dependent mechanics operate the switch between asymmetric to symmetric division required at the oocyte to embryo transition., How the mitotic spindle is positioned in the centre of the cell during the first mitotic division is not clear. Here Chaigne et al. show that the pronucleus coarsely centres using F-actin/Myosin-Vb dynamics, and the metaphase plate is finely centred by an F-actin cage influenced by high cortical tension.
Published: 2016
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14. Interplay between membrane tension and the actin cytoskeleton determines shape changes

Author: Camille Simon, Valentina Caorsi, Cécile Sykes, Clément Campillo, Langues et civilisations à tradition orale (LACITO), Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3-Institut National des Langues et Civilisations Orientales (Inalco)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Nanosciences de Paris (INSP), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Physico-Chimie-Curie (PCC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Physico-Chimie Curie [Institut Curie] (PCC), Institut Curie [Paris]-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE)
Subjects: 0301 basic medicine, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Sus scrofa, Biophysics, macromolecular substances, Membrane tension, Biophysical Phenomena, Cell membrane, 03 medical and health sciences, Mice, 0302 clinical medicine, Structural Biology, Actin dynamics, medicine, Animals, [PHYS.COND]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat], Cytoskeleton, Molecular Biology, Cell Shape, Actin, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [PHYS]Physics [physics], Liposome, Chemistry, Cell Membrane, Cell Biology, [PHYS.MECA]Physics [physics]/Mechanics [physics], Actin cytoskeleton, Actin Cytoskeleton, 030104 developmental biology, Membrane, medicine.anatomical_structure, [PHYS.COND.CM-SCM]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Soft Condensed Matter [cond-mat.soft], 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; The ability of mammalian cells to deform their membrane relies on the action of the cytoskeleton. In particular, the dynamics of the actin cytoskeleton, assembling at the plasma membrane, plays a crucial role in controlling cell shape. Many proteins are involved to ensure proper growth of the actin network at the cell membrane. The detailed structure of this network regulates the force that is necessary for membrane deformation. We address here how the presence of capping proteins, which limit the length of actin filaments and thus affects network topology, influences membrane shape. We use a system of liposomes, activated to polymerize actin at their surface, and placed in a mixture of purified proteins that reconstitutes actin dynamics. Our system also allows the variation of membrane tension by deflating the liposomes. We show that membrane deformations are clearly favored in the presence of capping proteins in the actin network. Moreover, in the absence of capping proteins, membrane deformations appear only when the liposomes are deflated. Our results unveil that the interplay between membrane tension and actin network structure and dynamics governs cell shape.
Published: 2018
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15. Processes at nanopores and bio-nanointerfaces: general discussion

Author: Yi-Tao Long, Gourav Bhattacharya, Kim McKelvey, Wolfgang Schuhmann, Yi-Lun Ying, Lane A. Baker, Richard M. Crooks, Yanfang Wu, Chrys. O. Chikere, Michael V. Mirkin, Martin A. Edwards, Julie V. Macpherson, Paul W. Bohn, Naren Das, Henry S. White, Liping Wen, Frédéric Kanoufi, Christine Kranz, Juan Pelta, Cyril O. Ehi-Eromosele, Christophe Antoine, Hang Ren, Wojciech Nogala, Zuzanna S. Siwy, Qiong Cai, Lei Jiang, Katherine A. Willets, Zhong-Qun Tian, Jennifer A. Rudd, Hassan Alzahrani, Niklas Ermann, Sebastien Balme, Patrick R. Unwin, Richard J. Nichols, Institut Européen des membranes (IEM), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Respiratory Epidemiology and Public Health, Imperial College London-Royal Brompton Hospital-National Heart and Lung Institute [UK], Sir AlisterHardyFoundationforOceanScience, TheLaboratory,CitadelHill,PlymouthPL12PB,UK, Interfaces, Traitements, Organisation et Dynamique des Systèmes (ITODYS (UMR_7086)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Universität Ulm - Ulm University [Ulm, Allemagne], Sch Biol & Chem Sci, Queen Mary University of London (QMUL), Electrode Processes, Intitute of Physical Chemistry, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Department of Analytical Chemistry, Ruhr-Universität Bochum [Bochum], Department of Materials Sciences and Engineering, State University of New York (SUNY), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), and Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Nanopore, Materials science, [CHIM]Chemical Sciences, Nanotechnology, 02 engineering and technology, Physical and Theoretical Chemistry, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 0210 nano-technology, 01 natural sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0104 chemical sciences
Abstract: International audience
Published: 2018
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16. From current trace to the understanding of confined media

Author: Juan Pelta, Loïc Auvray, Bruno Le Pioufle, Laurent Bacri, Jean Roman, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Systèmes et Applications des Technologies de l'Information et de l'Energie (SATIE), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'Alembert (IDA), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Matière et Systèmes Complexes (MSC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bio-MIcroSystèmes et BioSensors (SATIE-BIOMIS), Systèmes d'Information et d'Analyse Multi-Echelles (SIAME), École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Gustave Eiffel (UNIV GUSTAVE EIFFEL)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Gustave Eiffel (UNIV GUSTAVE EIFFEL)-Systèmes et Applications des Technologies de l'Information et de l'Energie (SATIE), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Gustave Eiffel (UNIV GUSTAVE EIFFEL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan), and École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)
Subjects: chemistry.chemical_classification, Materials science, Drop (liquid), Biophysics, Complex system, Nanoparticle, Conductance, 02 engineering and technology, Surfaces and Interfaces, General Chemistry, Polymer, Polymers: From Adsorption to Translocation - Topical Issue in Memoriam Loïc Auvray (1956-2016), 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, 0104 chemical sciences, Nanopore, chemistry, Chemical physics, General Materials Science, [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, 0210 nano-technology, Biotechnology
Abstract: International audience; Nanopores constitute devices for the sensing of nano-objects such as ions, polymer chains, proteins or nanoparticles. We describe what information we can extract from the current trace. We consider the entrance of polydisperse chains into the nanopore, which leads to a conductance drop. We describe the detection of these current blockades according to their shape. Finally, we explain how data analysis can be used to enhance our understanding of physical processes in confined media.
Published: 2018
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17. Corrosion at the carbon steel-clay borehole water interface under anoxic alkaline and fluctuating temperature conditions

Author: Marc Labat, Yannick Linard, Michel L. Schlegel, Eddy Foy, Cécile Blanc, Sylvie Daumas, Sophia Necib, Service d'études analytiques et de réactivité des surfaces (SEARS), Département de Physico-Chimie (DPC), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Agence Nationale pour la Gestion des Déchets Radioactifs (ANDRA), CFG Servives (CFG Servives), CFG services, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Archéomatériaux et Prévision de l'Altération (LAPA - UMR 3685), Nanosciences et Innovation pour les Matériaux, la Biomédecine et l'Energie (ex SIS2M) (NIMBE UMR 3685), Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANDRA and EDF, Service d'études analytiques et de réactivité des surfaces ( SEARS ), Département de Physico-Chimie ( DPC ), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement ( LAMBE - UMR 8587 ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université de Cergy Pontoise ( UCP ), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne ( UEVE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Saclay, Agence Nationale pour la Gestion des Déchets Radioactifs ( ANDRA ), CFG Servives ( CFG Servives ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ), Laboratoire Archéomatériaux et Prévision de l'Altération ( LAPA - UMR 3685 ), Nanosciences et Innovation pour les Matériaux, la Biomédecine et l'Energie (ex SIS2M) ( NIMBE UMR 3685 ), Institut Rayonnement Matière de Saclay ( IRAMIS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut Rayonnement Matière de Saclay ( IRAMIS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: Materials science, Sulfide, Carbon steel, 020209 energy, General Chemical Engineering, 02 engineering and technology, engineering.material, Corrosion, Cathodic protection, Siderite, chemistry.chemical_compound, Nuclear waste repository, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Silicate minerals, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, General Materials Science, Anoxic, chemistry.chemical_classification, Metallurgy, General Chemistry, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Anoxic waters, 6. Clean water, Fe-silicate, chemistry, [ CHIM.MATE ] Chemical Sciences/Material chemistry, engineering, Clay, [ CHIM.ANAL ] Chemical Sciences/Analytical chemistry, 0210 nano-technology, Layer (electronics)
Abstract: International audience; Coupons of carbon steel were corroded in situ in anoxic clay porewater under slightly alkaline conditions. Sample damage was less than 1 $\mu$m for 9 months at 85 °C only, and corrosion interfaces were covered by a thin, protective layer of Fe-silicate. The damage was more significant for samples exposed to room temperature transients (up to 38 μm for two years), and the long-term surface differentiated in cathodic (Fe-silicate covered) areas and anodic crevices filled with siderite, chukanovite, $\beta$-Fe$_2$(OH)$_3$Cl, and covered by tubercles. Sulfide compounds were detected, and were related to the metabolism of sulfate-reducing prokaryotes detected by microbiological techniques.
Published: 2018
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18. Characterization of Renal Injury and Inflammation in an Experimental Model of Intravascular Hemolysis

Author: Merle, Nicolas, Grunenwald, Anne, Figueres, Marie-Lucile, Chauvet, Sophie, Daugan, Marie, Knockaert, Samantha, Robe-Rybkine, Tania, Noe, Remi, May, Olivia, Frimat, Marie, Brinkman, Nathan, Gentinetta, Thomas, Miescher, Sylvia, Houillier, Pascal, Legros, Véronique, Gonnet, Florence, Blanc-Brude, Olivier, Rabant, Marion, Daniel, Régis, Dimitrov, Jordan, Roumenina, Lubka, Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Lille Inflammation Research International Center - U 995 (LIRIC), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), CSL Behring, Service de Physiologie [Georges-Pompidou], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire (PARCC - UMR-S U970), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), ANR-15-CE15-0001,INFLACOMP,Inflammation et lésions endothéliales induites par le Complément et l'hémolyse(2015), ANR-12-JSV1-0006,PIKinART,Role de la phosphoinositide 3-kinase dans les pathologies artérielles: une cible pharmacologique prometteuse(2012), ANR-11-IDEX-0005,USPC,Université Sorbonne Paris Cité(2011), École pratique des hautes études (EPHE)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre interuniversitaire de recherche et d'ingenierie des matériaux (CIRIMAT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM), Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Centre de Recherche Cardiovasculaire de Lariboisiere, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-15-CE15-0001,INFLACOMP,Inflammation et lésions endothéliales induites par le Complément et l’hémolyse(2015), ANR-11-IDEX-0005-02/11-IDEX-0005,USPC,USPC(2011), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Lille Inflammation Research International Center (LIRIC), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Erythrocytes, hemopexin, Immunology, endothelial activation, Kidney, phenylhydrazine, [SDV.IMM.II]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Innate immunity, [SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, Mice, Lipocalin-2, Human Umbilical Vein Endothelial Cells, Animals, Humans, Hepatitis A Virus Cellular Receptor 1, Vascular Diseases, heme, Cells, Cultured, Original Research, Acute Kidney Injury, Phenylhydrazines, Mice, Inbred C57BL, Disease Models, Animal, Ki-67 Antigen, inflammation, kidney injury, Female, hemolysis, E-Selectin, Biomarkers, experimental model of intravascular hemolysis
Abstract: International audience; Intravascular erythrocyte destruction, accompanied by the release of pro-oxidative and pro-inflammatory components hemoglobin and heme, is a common event in the pathogenesis of numerous diseases with heterogeneous etiology and clinical features. A frequent adverse effect related to massive hemolysis is the renal injury and inflammation. Nevertheless, it is still unclear whether heme––a danger-associated molecular pattern––and ligand for TLR4 or upstream hemolysis-derived products are responsible for these effects. Well-characterized animal models of hemolysis with kidney impairment are needed to investigate how hemolysis drives kidney injury and to test novel therapeutic strategies. Here, we characterized the pathological processes leading to acute kidney injury and inflammation during massive intravascular hemolysis, using a mouse model of phenylhydrazine (PHZ)-triggered erythrocyte destruction. We observed profound changes in mRNA levels for markers of tubular damage (Kim-1, NGAL) and regeneration (indirect marker of tubular injury, Ki-67), and tissue and vascular inflammation (IL-6, E-selectin, P-selectin, ICAM-1) in kidneys of PHZ-treated mice, associated with ultrastructural signs of tubular injury. Moreover, mass spectrometry revealed presence of markers of tubular damage in urine, including meprin-α, cytoskeletal keratins, α-1-antitrypsin, and α-1-microglobulin. Signs of renal injury and inflammation rapidly resolved and the renal function was preserved, despite major changes in metabolic parameters of PHZ-injected animals. Mechanistically, renal alterations were largely heme-independent, since injection of free heme could not reproduce them, and scavenging heme with hemopexin in PHZ-administered mice could not prevent them. Reduced overall health status of the mice suggested multiorgan involvement. We detected amylasemia and amylasuria, two markers of acute pancreatitis. We also provide detailed characterization of renal manifestations associated with acute intravascular hemolysis, which may be mediated by hemolysis-derived products upstream of heme release. This analysis provides a platform for further investigations of hemolytic diseases and associated renal injury and the evaluation of novel therapeutic strategies that target intravascular hemolysis.
Published: 2018
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19. Dynamics of a polyelectrolyte through aerolysin channel as a function of applied voltage and concentration

Author: Bénédicte Thiebot, Laurent Bacri, Loïc Auvray, Manuela Pastoriza-Gallego, Juan Pelta, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Matière et Systèmes Complexes (MSC), and ANR-17-CE09-0044,EPSILOMICS,Système de puces nanofluidiques pour le dosage de biomarqueurs en quantité epsilon dans les échantillons biologiques humains(2017)
Subjects: 0301 basic medicine, Materials science, media_common.quotation_subject, Population, Biophysics, Aerolysin, 02 engineering and technology, Asymmetry, Effective nuclear charge, 03 medical and health sciences, Exponential growth, General Materials Science, education, media_common, education.field_of_study, Surfaces and Interfaces, General Chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Polyelectrolyte, Exponential function, 030104 developmental biology, [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, Chemical physics, 0210 nano-technology, [PHYS.COND.CM-SCM]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Soft Condensed Matter [cond-mat.soft], Biotechnology, Voltage
Abstract: International audience; We describe the behaviour of a polyelectrolyte in confined geometry. The transport of a polyelectrolyte, dextran sulfate, through a recombinant protein channel, aerolysin, inserted into a planar lipid bilayer is studied as a function of applied voltage and polyelectrolyte concentration and chain length. The aerolysin pore has a weak geometry asymmetry, a high number of charged residues and the polyelectrolyte is strongly negatively charged. The resulting current blockades were characterized by short and long dwelling times. Their frequency varies exponentially as a function of applied voltage and linearly as a function of polyelectrolyte concentration. The long blockade duration decreases exponentially when the electrical force increases. The ratio of the population of short events to the one of long events decreases when the applied voltage increases and displays an exponential variation. The long residence time increases with the polyelectrolyte chain length. We measure a reduction of the effective charge of the polyelectrolyte at the pore entry and inside the channel. For a fixed applied voltage, + / - 100 mV, at both sides of the protein pore entrance, the events frequency is similar as a function of dextran sulfate concentration. The mean blockade durations are independent of polyelectrolyte concentration and are similar for both entrances of the pore and remain constant as a function of the electrical force.
Published: 2018
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20. Energy conversion at nanointerfaces: general discussion

Author: Dongping Zhan, Christine Kranz, Andrea Vezzoli, Hassan Alzahrani, Chuan Zhao, Alina Galeyeva, Wolfgang Schuhmann, Frédéric Kanoufi, Thomas J. P. Hersbach, Kim McKelvey, Richard M. Crooks, Zhugen Yang, Patrick R. Unwin, Robert Hillman, Yanfang Wu, Katherin Willets, Chrys. O. Chikere, Yi-Tao Long, Tobias Löffler, Cameron Luke Bentley, Shelley D. Minteer, Paul W. Bohn, Marc T. M. Koper, Zhong-Qun Tian, Jennifer A. Rudd, Juan Pelta, Denis Öhl, Richard J. Nichols, Cyril O. Ehi-Eromosele, Daniel Commandeur, Julie V. Macpherson, Wojciech Nogala, Andrew G. Ewing, Hang Ren, Michael V. Mirkin, Interfaces, Traitements, Organisation et Dynamique des Systèmes (ITODYS (UMR_7086)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Universität Ulm - Ulm University [Ulm, Allemagne], Sch Biol & Chem Sci, Queen Mary University of London (QMUL), Electrode Processes, Intitute of Physical Chemistry, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Analytical Chemistry, Ruhr-Universität Bochum [Bochum], School of Chemistry, The University of Sydney, The University of Sydney, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE)
Subjects: Materials science, MEDLINE, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, Engineering physics, 0104 chemical sciences, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Energy transformation, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Physical and Theoretical Chemistry, 0210 nano-technology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018
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21. Application of the multi-site ion exchanger model to the sorption of Sr and Cs on natural clayey sandstone

Author: Catherine Beaucaire, Christelle Latrille, Aubéry Wissocq, CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY), This work was financially supported by CEA, CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE)
Subjects: [PHYS.NUCL]Physics [physics]/Nuclear Theory [nucl-th], smectite, Mineralogy, chemistry.chemical_element, 010501 environmental sciences, engineering.material, [PHYS.NEXP]Physics [physics]/Nuclear Experiment [nucl-ex], 010502 geochemistry & geophysics, 01 natural sciences, Adsorption, Geochemistry and Petrology, cesium, Environmental Chemistry, strontium, 0105 earth and related environmental sciences, ion exchange model, Strontium, Mineral, sorption, Ion exchange, Sorption, Pollution, illite, chemistry, 13. Climate action, Soil water, Illite, engineering, Clay minerals
Abstract: International audience; To ensure the environmental monitoring of nuclear sites, sorption models enabling the prediction of contaminant migration (such as $^{90}$Sr and $^{137}$Cs) in soils, sediments and aquifers need to be developed. This paper aims 1) at developing a database containing the sorption properties of the pure mineral phases commonly encountered in natural environments and 2) at using this database in a multi-site ion exchange model to be applied on natural sediments. In addition to some raw adsorption data issued from literature, different sorption experiments of Sr and Cs, on pure illite and smectite, in competition with calcium were carried out, as a function of pH and as well as concentrations of Sr and Cs. These sorption data were interpreted using a multi-site ion-exchange model and contributed to the elaboration of a thermodynamic database gathering the retention properties of illite and smectite (site capacities and selectivity coefficients) towards Cs$^+$, Sr$^{2+}$, H$^+$ and Ca$^{2+}$. A multi-site ion exchange model based on the mixture of pure mineral phases (illite and smectite) was successfully applied to simulate the Sr and Cs behavior in a natural clayey sandstone, indicating that the additivity of retention properties of the minerals constituting the sediment can be verified.
Published: 2018
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22. Electrochemical Behavior of Stainless Steels for Sudomotor Dysfunction Applications

Author: Armelle Ringuedé, Mamie Sancy, Michel Cassir, N. Vejar, José H. Zagal, X. Gonzalez, Virginie Lair, Sophie Griveau, Fethi Bedioui, Amandine Calmet, Laboratoire d'Electrochimie, Chimie des Interfaces et Modélisation pour l'Energie (LECIME - UMR 7575) (LECIME), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Laboratoire d'Electrochimie et de Chimie Analytique (LECA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Unité de pharmacologie chimique et génétique et d'imagerie (UPCGI - UMR 8151 / UMR_S 1022 ), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Materials science, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Electrochemistry, 01 natural sciences, 0104 chemical sciences, Analytical Chemistry, Dielectric spectroscopy, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Composite material, 0210 nano-technology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Sudomotor dysfunction
Abstract: AISI 304L is used in Sudoscan(TM) technology (Impeto Medical Inc.) for the early diagnosis of small fiber neuropathy caused by type-2 diabetes or cystic fibrosis. In a recent paper, several substitute electrodes were analyzed, among which the biocompatib
Published: 2018
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23. Electrochemical behavior of electrode materials (nickel and stainless steels) for sudomotor dysfunction applications : a review

Author: José H. Zagal, Armelle Ringuedé, Michel Cassir, Sophie Griveau, Fethi Bedioui, Virginie Lair, Unité de pharmacologie chimique et génétique et d'imagerie (UPCGI - UMR 8151 / UMR_S 1022 ), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Electrochimie et de Chimie Analytique (LECA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Electrochimie, Chimie des Interfaces et Modélisation pour l'Energie (LECIME - UMR 7575) (LECIME), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Universidad de Santiago de Chile [Santiago] (USACH), Bedioui, Fethi, Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, and Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)
Subjects: Clinical tests, Materials science, [CHIM.ANAL] Chemical Sciences/Analytical chemistry, chemistry.chemical_element, 02 engineering and technology, Electrochemistry, Chloride, Analytical Chemistry, 03 medical and health sciences, nickel, 0302 clinical medicine, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, medicine, Small Fiber Neuropathy, stainless steel, Electrode material, Metallurgy, fungi, electrochemical conductance, technology, industry, and agriculture, 021001 nanoscience & nanotechnology, 3. Good health, Nickel, sweat, chemistry, medical application, Electrode, sudomotor dysfynctions, 0210 nano-technology, 030217 neurology & neurosurgery, Sudomotor dysfunction, medicine.drug
Abstract: International audience; This is an overview of the electrochemical characterization of nickel and stainless steel as electrodes in medical devices for the early diagnosis of small fiber neuropathy that originates from type-2 diabetes or cystic fibrosis. The electrical current responses obtained during the clinical tests are related to the amount of chloride present on the sweat. Stainless steel electrodes are now used to replace nickel because this later not only presents problems with chloride sensitivity but its contact with skin can cause possible allergic reactions for some patients. For the above reasons, several types of stainless steels were studied. It was shown that some of them perform well and have lower costs than Ni electrodes. We discuss the state of the art of the electrochemical studies conducted with nickel and steels under physiological or biomimetic conditions and discuss the advantages of a particular steel over the others depending on the conditions, especially chloride concentration.
Published: 2018
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24. Synthesis and characterization of ZnO/Cu2O core–shell nanowires grown by two-step electrodeposition method

Author: I. Ben Assaker, G. Amiri, A. Souissi, Radhouane Chtourou, M. Oueslati, Mikhael Bechelany, A. Bardaoui, O. Messaoudi, Houssin Makhlouf, Laboratoire de photovoltaique, Laboratoire de Photovoltaïque, Technopole de Borj-Cédria, Laboratoire de nanomatériaux et des systèmes pour les énergies renouvelables [Tunis], Université Tunis El Manar (UTM), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectroscopie Raman, Faculté des Sciences de Tunis, Institut Européen des membranes (IEM), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe d'Etude de la Matière Condensée (GEMAC), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Taif University Taif KSA, Taif KSA, Unité de nanomatériaux et photonique [Tunis], Faculté des Sciences Mathématiques, Physiques et Naturelles de Tunis (FST), Université de Tunis El Manar (UTM)-Université de Tunis El Manar (UTM), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)
Subjects: Raman scattering, Diffraction, Materials science, Type-II heterostructures, Scanning electron microscope, Two step, Nanowire, General Physics and Astronomy, Nanotechnology, Electrochemical deposition, Surfaces and Interfaces, General Chemistry, Condensed Matter Physics, ZnO/Cu2O core/shell, 7. Clean energy, Surfaces, Coatings and Films, Core shell, symbols.namesake, Crystallinity, Chemical engineering, Homogeneity (physics), symbols, [CHIM]Chemical Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; ZnO/Cu2O core/shell nanowires have been grown by two-step electrodeposition method on ITO-coated glass substrates. The sample's morphology was explored by means of scanning electron microscopy (SEM). SEM images confirm the homogeneity of the nanowires and the presence of Cu2O shell on ZnO core. X-ray diffraction and Raman scattering measurements were used to investigate the purity and the crystallinity of the samples. Optical transmission measurements reveal an additional contribution at about 1.7eV attributed to the type-II interfacial transition witch confirms the advantage of using the ZnO/Cu2O structure in photovoltaic application.
Published: 2015
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25. Echinenone vibrational properties: From solvents to the orange carotenoid protein

Author: Riccardo Spezia, Bruno Robert, Maria Manuela Mendes Pinto, Diana Kirilovsky, Elizabeth Kish, Institut de Biologie et de Technologies de Saclay ( IBITECS ), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Mécanismes régulateurs chez les organismes photosynthétiques ( MROP ), Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale ( B3S ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement ( LAMBE - UMR 8587 ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université de Cergy Pontoise ( UCP ), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne ( UEVE ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Bioénergétique, Métalloprotéines et Stress ( LBMS ), ANR-10-INSB-05-01,FRISBI,French Infrastructure for Integrated Structural Biology, Institut de Biologie et de Technologies de Saclay (IBITECS), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-10-INBS-05-01/10-INBS-0005,FRISBI,Infrastructure Française pour la Biologie Structurale Intégrée(2010), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-10-INBS-0005,FRISBI,Infrastructure Française pour la Biologie Structurale Intégrée(2010), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Resonance Raman spectroscopy, Biophysics, Orange carotenoid protein (OCP), Conjugated system, 010402 general chemistry, Photochemistry, 01 natural sciences, Biochemistry, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, chemistry.chemical_compound, 030304 developmental biology, Carotenoid, 0303 health sciences, Orange carotenoid protein, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Chemistry, Photoprotection, Cell Biology, Chromophore, 0104 chemical sciences, Echinenone, Raman spectroscopy, symbols, Density functional theory, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph]
Abstract: International audience; Orange carotenoid protein (OCP) is a cyanobacterial photoactive protein which binds echinenone as a chromophore; it is involved in photoprotection of these photosynthetic organisms against intense illumination. In its resting state, OCP appears orange (OCPo), and turns into a red form (OCPr) when exposed to blue-green light. Here we have combined resonance Raman spectroscopy and molecular modeling to investigate the mechanisms underlying the electronic absorption properties of the different forms of OCP. Our results show that there are at least two carotenoid configurations in the OCPo, suggesting that it is quite flexible, and that the OCPo to OCPr transition must involve an increase of the apparent conjugation length of the bound echinenone. Resonance Raman indicates that this chromophore must be in an all-trans configuration in OCPo. Density functional theory (DFT) calculations, in agreement with the Raman spectra of both OCP forms, show that the OCPo to OCPr transition must involve either an echinenone s-cis to s-trans isomerization which would affect the position of its conjugated end-chain rings, or a bending of the echinenone rings which would bring them from out of the plane of the CC conjugated plane in the OCPo form into the CC plane in the OCPr form.
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26. Comparative proteomics of respiratory exosomes in cystic fibrosis, primary ciliary dyskinesia and asthma

Author: Cerina Chhuon, Matthieu Bourderioux, Isabelle Sermet-Gaudelus, Virginie Rollet-Cohen, Sophie Guérin-Pfyffer, Ida Chiara Guerrera, Thao Nguyen-Khoa, Aleksander Edelman, Joanna Lipecka, Alain Schmitt, Myriam Mesbahi, Vincent Jung, Université Paris Descartes - Faculté de Médecine (UPD5 Médecine), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de psychiatrie et neurosciences (U894 / UMS 1266), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Structure Fédérative de Recherche Necker (SFR Necker - UMS 3633 / US24), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), CIC Cochin Pasteur (CIC 1417), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Groupe hospitalier Broca-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Hôtel-Dieu-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Plateforme protéomique 3P5 [Institut Cochin] (3P5), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Groupe hospitalier Broca-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Proteomics, Adolescent, Cystic Fibrosis, Immunoelectron microscopy, Biophysics, Respiratory Mucosa, Exosomes, Biochemistry, Exosome, Cystic fibrosis, Mass Spectrometry, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, otorhinolaryngologic diseases, medicine, Humans, Child, Lung, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Primary ciliary dyskinesia, medicine.diagnostic_test, business.industry, Infant, respiratory system, medicine.disease, Asthma, respiratory tract diseases, 3. Good health, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, 030104 developmental biology, Bronchoalveolar lavage, medicine.anatomical_structure, 030220 oncology & carcinogenesis, Child, Preschool, Immunology, Female, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], business, Bronchoalveolar Lavage Fluid, Leukocyte chemotaxis, Respiratory tract, Ciliary Motility Disorders
Abstract: Cystic fibrosis (CF) and primary ciliary dyskinesia (PCD) are pulmonary genetic disorders associated with inflammation and heterogeneous progression of the lung disease. We hypothesized that respiratory exosomes, nanovesicles circulating in the respiratory tract, may be involved in the progression of inflammation-related lung damage. We compared proteomic content of respiratory exosomes isolated from bronchoalveolar lavage fluid in CF and PCD to asthma (A), a condition also associated with inflammation but with less severe lung damage. BALF were obtained from 3 CF, 3 PCD and 6 A patients. Exosomes were isolated from BALF by ultracentrifugations and characterized using immunoelectron microscopy and western-blot. Exosomal protein analysis was performed by high-resolution mass spectrometry using label-free quantification. Exosome enrichment was validated by electron microscopy and immunodetection of CD9, CD63 and ALIX. Mass spectrometry analysis allowed the quantification of 665 proteins, of which 14 were statistically differential according to the disease. PCD and CF exosomes contained higher levels of antioxidant proteins (Superoxide-dismutase, Glutathione peroxidase-3, Peroxiredoxin-5) and proteins involved in leukocyte chemotaxis. All these proteins are known activators of the NF-KappaB pathway. Our results suggest that respiratory exosomes are involved in the pro-inflammatory propagation during the extension of CF or PCD lung diseases. Significance The mechanism of local propagation of lung disease in cystic fibrosis (CF) and primary ciliary dyskinesia (PCD) is not clearly understood. Differential Proteomic profiles of exosomes isolated from BAL from CF, PCD and asthmatic patients suggest that they carry pro-inflammatory proteins that may be involved in the progression of lung damage.
Published: 2017
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27. Biofilms anodiques constitues de bacteries electro-actives et de nanoparticules desulfure de nickel pour application PCM

Author: Legrand, L., Feron, D., Chaussé, A., Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), and amplexor, amplexor
Subjects: nickel, anode, Biofilm, [CHIM] Chemical Sciences, bacteries, [CHIM]Chemical Sciences, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], [SDV.BBM.BC] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, nanoparticules, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM]
Abstract: National audience
Published: 2017

28. The impact of paper constituents on the efficiency of mechanical strengthening by polyaminoalkylalkoxysilanes

Author: Isabelle Fabre-Francke, Bertrand Lavédrine, Hervé Cheradame, Odile Fichet, Anne-Laurence Dupont, Sabrina Paris-Lacombe, Camille Piovesan, Laboratoire de Physico-chimie des Polymères et des Interfaces (LPPI), Fédération INSTITUT DES MATÉRIAUX DE CERGY-PONTOISE (I-MAT), Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Centre de Recherche pour la Conservation des Collections (CRCC), Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche sur la Conservation (CRC ), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CY Cergy Paris Université (CY)-CY Cergy Paris Université (CY), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE)
Subjects: Paper, Copolymer networks, Materials science, Polymers and Plastics, Binary mixtures, Alkalinity, Tensile resistance, 02 engineering and technology, Pulp, engineering.material, Plasticity, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Lignin, Inter-fiber bonding, chemistry.chemical_compound, Paper Making, Aminoalkylalkoxysilane copolymer, Deacidification, Tensile Strength, Ultimate tensile strength, Chemical pulp, Chemical Treatment, Composite material, Chemical Pulping, Papermaking, Pulp (paper), Copolymers, Chemical bonds, Additives, Sizing (finishing operation), 021001 nanoscience & nanotechnology, Fillers, Sizing, Folding endurance, 0104 chemical sciences, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Mechanical strengthening, [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, chemistry, Mechanical pulp, Lignins, engineering, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], 0210 nano-technology
Abstract: International audience; The aim of the research was to evaluate the influence of certain components of paper such as lignin and papermaking additives (fillers and sizing) on the efficiency of a recently proposed treatment for simultaneous deacidification and mechanical strengthening with polyaminosiloxane copolymer networks. Mixed mechanical and chemical pulp papers containing various additives were treated with aminoalkylalkoxysilanes (AAAS) by immersion or by spray. Upon treatment, the deposited alkaline reserve varied from 0.34 to 1.14 mol kg −1 . For all the papers, copolymers formed from binary mixtures of a di- and a tri-functional AAAS provided the best improvement in the mechanical properties, i.e. in the tensile strength and the folding endurance, indicating an increase in the interfiber bonding energy and in the paper flexibility and plasticity, respectively. It was found that fillers had no influence while sizing hampered the efficiency of the treatment. The presence of mechanical pulp was shown to have a significant impact on the effect of the treatments as well by increasing the tensile resistance more than the folding endurance, indicating an increase in the paper rigidity. This observation was attributed to the response of lignin to the treatment.
Published: 2017
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29. Functionalized Solid-State Nanopore Integrated in a Reusable Microfluidic Device for a Better Stability and Nanoparticle Detection

Author: Bruno Le Pioufle, Gilles Patriarche, Juan Pelta, Jean Roman, Olivier Français, Nathalie Jarroux, Laurent Bacri, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Centre de Nanosciences et de Nanotechnologies [Marcoussis] (C2N), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Electronique, Systèmes de communication et Microsystèmes (ESYCOM), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-ESIEE Paris, Systèmes d'Information et d'Analyse Multi-Echelles (SATIE-SIAME), Systèmes et Applications des Technologies de l'Information et de l'Energie (SATIE), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Cergy Pontoise (UCP), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-ESIEE Paris, Bio-MIcroSystèmes et BioSensors (SATIE-BIOMIS), Systèmes d'Information et d'Analyse Multi-Echelles (SIAME), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Systèmes et Applications des Technologies de l'Information et de l'Energie (SATIE), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Gustave Eiffel (UNIV GUSTAVE EIFFEL)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Gustave Eiffel (UNIV GUSTAVE EIFFEL)-Systèmes et Applications des Technologies de l'Information et de l'Energie (SATIE), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Gustave Eiffel (UNIV GUSTAVE EIFFEL), and Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-ESIEE Paris-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)
Subjects: chemistry.chemical_classification, polymer brush, Materials science, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Biomolecule, Microfluidics, Nanoparticle, Nanotechnology, 02 engineering and technology, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Polymer brush, 01 natural sciences, 0104 chemical sciences, solid-state nanopore, Nanopore, Membrane, chemistry, Ionic conductance, General Materials Science, Nanorod, nanopore functionalization, [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; Electrical detection based on single nanopores is an efficient tool to detect biomolecules, particles and study their morphology. Nevertheless the surface of the solid-state membrane supporting the nanopore should be better controlled. Moreover, nanopore should be integrated within microfluidic architecture to facilitate control fluid exchanges. We built a reusable microfluidic system integrating a decorated membran, rendering the drain and refill of analytes and buffers easier. This process enhances strongly ionic conductance of the nanopore and its lifetime. We highlight the reliability of this device by detecting gold nanorods and spherical proteins.
Published: 2017
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30. Pitting corrosion modelling by means of a stochastic cellular automata-based model

Author: Annie Chaussé, Cristian Felipe Pérez-Brokate, Dung Di Caprio, Jacques de Lamare, Damien Féron, Service de la Corrosion et du Comportement des Matériaux dans leur Environnement (SCCME), Département de Physico-Chimie (DPC), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut de Recherche de Chimie Paris (IRCP), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Ministère de la Culture (MC)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ministère de la Culture (MC)
Subjects: Cellular automata, Materials science, 020209 energy, General Chemical Engineering, Stochastic cellular automata, Pitting, 02 engineering and technology, Electrolyte, Corrosion, Cathodic protection, Electrolytes, Charge transfer, Stochastic cellular automaton, Cathodic reactions, Acid corrosion, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, Pitting corrosion, passivity, General Materials Science, [PHYS.COND]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Macroscopic methods, Electric connectors, Modelling studies, Mesoscopic physics, Stochastic systems, Metallurgy, General Chemistry, Mechanics, 021001 nanoscience & nanotechnology, Random walk, Cellular automaton, Corrosion modelling, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Stochastic models, Electric connections, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], 0210 nano-technology
Abstract: International audience; We use stochastic Cellular Automata (CA) based modelling for corrosion studies at a mesoscopic scale. Physico-chemical phenomena that cannot be satisfactorily described by standard deterministic and macroscopic methods are represented. Materials are described by a 3D lattice where each cell has a state. Phenomena are represented as simple transition rules defining the evolution of the cells with given probabilities. Diffusion in the electrolyte is modelled as a random walk. Charge transfer corresponds to simultaneous anodic and cathodic reactions with special emphasis on their electric connection ensuring electric balance. We study evolution of pitting corrosion in terms of pit size morphology and acidity of the electrolyte. Starting from metal covered by a passive layer with a single defect, a cavity starts growing inside the metal and notably the exterior basic environment delays the dissolution of the protective passive layer. Results are in accordance with published experimental results on pitting corrosion.
Published: 2017
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31. A novel CFHR1-CFHR5 hybrid leads to a familial dominant C3 glomerulopathy

Author: Vijay Kher, Moglie Le Quintrec, Lubka T. Roumenina, Shyam Bihari Bansal, Pranaw Kumar Jha, Rajan Duggal, Véronique Frémeaux-Bacchi, Florence Gonnet, Shambhuprasad Kotresh Togarsimalemath, Sidharth Kumar Sethi, Marie-Agnès Dragon-Durey, Régis Daniel, Complications vasculaires du diabète (CRC - Inserm U1138), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), The Medicity Hospital, Gurgaon, Haryana, India., Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Complément et Maladies (CRC - Inserm U1138), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École pratique des hautes études (EPHE)
Subjects: 0301 basic medicine, Adult, Male, Glomerulonephritis, Membranoproliferative, [SDV]Life Sciences [q-bio], Complement Pathway, Alternative, 030232 urology & nephrology, Complement factor I, Complement C3-C5 Convertases, Biology, Kidney, Complement factor B, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, C3 glomerulonephritis, Atypical hemolytic uremic syndrome, medicine, Complement C3b Inactivator Proteins, Humans, complement, Child, Atypical Hemolytic Uremic Syndrome, Sequence Deletion, Genetics, Gene Rearrangement, dense deposit disease, Infant, Gene rearrangement, Complement C3, Complement System Proteins, medicine.disease, 3. Good health, Complement system, Pedigree, 030104 developmental biology, Nephrology, Factor H, Complement Factor H, Alternative complement pathway, Female, complement factor H–related protein, Gene Fusion, CFHR5, Complement Factor B
Abstract: International audience; The intrinsic similarity shared between the members of the complement factor H family, which comprises complement factor H and five complement factor H-related (CFHR) genes, leads to various recombination events. In turn these events lead to deletions of some genes or abnormal proteins, which are found in patients with atypical hemolytic uremic syndrome or C3 glomerulopathies. Here we describe a novel genetic rearrangement generated from a heterozygous deletion spanning 146 Kbp involving multiple CFHR genes leading to a CFHR1-R5 hybrid protein. This deletion was found in four family members presenting with a familial dominant glomerulopathy histologically classified as an overlap of dense deposit disease and C3 glomerulonephritis. Affected patients exhibited permanently low C3 and factor B levels and high amounts of activation fragments sC5b9 and Bb, indicating a systemic alternative pathway dysregulation. The abnormal protein, characterized by Western blot and immunoprecipitation, was shown to circulate in association with CFHR1 and CFHR2, attributable to its two N-terminal dimerization motifs. The presence of this protein is associated with a perturbation of Factor H activity on the C3 convertase decay. Thus, our study highlights the role of CFHRs in the physiopathology of C3 glomerulopathies and stresses the importance of screening CFHRs in all familial C3 glomerulopathies. Such hybrids described till now were always associated with familial forms.
Published: 2017
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32. Photocontrolled Synthesis of Abiotic Sequence-Defined Oligo(Phosphodiester)s

Author: Salomé Poyer, Sofia Telitel, Jean-François Lutz, Laurence Charles, Niklas Felix König, Institut Charles Sadron (ICS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Science des Matériaux de Mulhouse (IS2M), Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)
Subjects: Materials science, Polymers and Plastics, Size-exclusion chromatography, Sequence (biology), 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, digital polymers, information, chemistry.chemical_compound, Ultraviolet visible spectroscopy, Polymer chemistry, Materials Chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, macromolecules, encoded polymers, microarrays, gene synthesis, Phosphoramidite, photochemistry, Molecular Structure, Organic Chemistry, phosphoramidite chemistry, sequencing, 021001 nanoscience & nanotechnology, Photochemical Processes, Organophosphates, 0104 chemical sciences, soluble polymer supports, Monomer, chemistry, soluble polymer support, Phosphodiester bond, Proton NMR, protecting groups, Polystyrene, 0210 nano-technology, sequence-controlled polymers
Abstract: International audience; A photoregulated phosphoramidite iterative process is studied for the synthesis of non-natural, digitally encoded oligo(phosphodiester)s. The oligomers are prepared using two reactive phosphoramidite monomers containing a 2-(2-nitrophenyl)propoxycarbonyl (NPPOC) protected OH group. The stepwise synthesis is performed on an OH-functional soluble polystyrene support, which allows recycling by precipitation in a nonsolvent. Repeating cycles involving phosphoramidite coupling, oxidation of phosphite to phosphate, and NPPOC deprotection by light irradiation at lambda = 365 nm are performed in order to prepare oligomers with different lengths and sequences. Synthesis is conducted on a micromolar scale and good recycling yields are obtained in all cases. The use of a soluble polymer support allows an in-depth characterization of the NPPOC photo-deprotection step by H-1 NMR, UV spectroscopy, and size exclusion chromatography, and thus identification of optimal synthesis conditions. After cleavage from the support, the oligo(phosphodiester)s are characterized by tandem mass spectrometry, which confirms preparation of uniform sequence-coded oligomers.
Published: 2017
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33. Sequence-coded ATRP macroinitiators

Author: Laurence Charles, Benoit Eric Petit, Sofia Telitel, Salomé Poyer, Jean-François Lutz, Institut Charles Sadron (ICS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Institut de Science des Matériaux de Mulhouse (IS2M), Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Polymers and Plastics, block-copolymers, Chemistry, Organic Chemistry, Radical polymerization, initiators, transfer radical polymerization, Bioengineering, Sequence (biology), 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, Biochemistry, 0104 chemical sciences, Styrene, chemistry.chemical_compound, Polymer chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, 0210 nano-technology, phosphoramidite, polymers, Macromolecule
Abstract: International audience; Sequence-coded oligourethanes were tested as macroinitiators for the atom transfer radical polymerization (ATRP) of styrene. These oligomers were synthesized by solid-phase orthogonal iterative chemistry and transformed into ATRP initiators using a three-step modification procedure. A controlled radical polymerization behavior was observed with these macroinitiators, thus opening interesting opportunies for the synthesis of macromolecular architectures containing sequence-defined segments.
Published: 2017
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34. Hepatitis C virus core protein targets 4E-BP1 expression and phosphorylation and potentiates Myc-induced liver carcinogenesis in transgenic mice

Author: Abdallah, Cosette, Lejamtel, Charlène, Benzoubir, Nassima, Battaglia, Serena, Sidahmed-Adrar, Nazha, Desterke, Christophe, Lemasson, Matthieu, Rosenberg, Arielle R., Samuel, Didier, Bréchot, Christian, Pflieger, Delphine, Le Naour, François, Bourgeade, Marie-Françoise, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogénèse et traitement de l'hépatite fulminante et du cancer du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut André Lwoff, Unité de service de l'Institut André Lwoff (US 33 Inserm), AP-HP Hôpital Paul Brousse [Paris]-Institut André Lwoff [Villejuif] (IAL), Virologie de l'hépatite C (EA 4474), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre hépato-biliaire (CHB), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Agence Universitaire de la Francophonie (AUF), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AP-HP Hôpital Paul Brousse, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Unité mixte de service UMS33 [Institut André Lwoff] (UMS33 Inserm/IAL), Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut André Lwoff [Villejuif] (IAL), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Etude de la dynamique des protéomes (EDyP ), Laboratoire de Biologie à Grande Échelle (BGE - UMR S1038), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Hôpital Paul Brousse-Institut André Lwoff [Villejuif] (IAL), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)
Subjects: mitogen activated protein kinase p38, host cell, gene amplification, complementary DNA, animal cell, SILAC, initiation factor 4E binding protein 1, vimentin, hepatocellular carcinoma cell line, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Huh-7 cell line, membrane protein, insulin receptor, 4E-BP1 phosphorylation, Hermes antigen, quantitative analysis, Hepatitis C virus, liver cell, virus diseases, phosphoproteomics, hepatocellular carcinoma, unclassified drug, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, tumor growth, liver carcinogenesis, protein transport, transcription regulation, signal transduction, in vitro study, animal experiment, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Article, cancer growth, animal tissue, in vivo study, HCV core, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], core protein, controlled study, human, protein expression, mouse, nonhuman, protein MTA1, RNA translation, animal model, human cell, intracellular signaling, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, protein phosphorylation, transgenic mouse, validation process, initiation factor 4E, Myc protein, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], upregulation
Abstract: International audience; Hepatitis C virus (HCV) is a leading cause of liver diseases including the development of hepatocellular carcinoma (HCC). Particularly, core protein has been involved in HCV-related liver pathologies. However, the impact of HCV core on signaling pathways supporting the genesis of HCC remains largely elusive. To decipher the host cell signaling pathways involved in the oncogenic potential of HCV core, a global quantitative phosphoproteomic approach was carried out. This study shed light on novel differentially phosphorylated proteins, in particular several components involved in translation. Among the eukaryotic initiation factors that govern the translational machinery, 4E-BP1 represents a master regulator of protein synthesis that is associated with the development and progression of cancers due to its ability to increase protein expression of oncogenic pathways. Enhanced levels of 4E-BP1 in non-modified and phosphorylated forms were validated in human hepatoma cells and in mouse primary hepatocytes expressing HCV core, in the livers of HCV core transgenic mice as well as in HCV-infected human primary hepatocytes. The contribution of HCV core in carcinogenesis and the status of 4E-BP1 expression and phosphorylation were studied in HCV core/ Myc double transgenic mice. HCV core increased the levels of 4E-BP1 expression and phosphorylation and significantly accelerated the onset of Myc-induced tumorigenesis in these double transgenic mice. These results reveal a novel function of HCV core in liver carcinogenesis potentiation. They position 4E-BP1 as a tumor-specific target of HCV core and support the involvement of the 4E-BP1/eIF4E axis in hepatocarcinogenesis.
Published: 2017
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35. Integrated time-lapse and single-cell transcription studies highlight the variable and dynamic nature of human hematopoietic cell fate commitment

Author: Moussy, Alice, Cosette, Jérémie, Parmentier, Romuald, da Silva, Cindy, Corre, Guillaume, Richard, Angélique, Gandrillon, Olivier, Stockholm, Daniel, Paldi, Andras, Huang, Sui, Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S 872)), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), GENETHON 3, Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), Genethon - Inserm UMR_S951, Immunologie moléculaire et biothérapies innovantes, École pratique des hautes études (EPHE)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Genethon-École pratique des hautes études (EPHE)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Genethon-Généthon, Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon), Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire (CGPhiMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Généthon, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), and Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2017
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36. MFC bioanodes constituted of nickel sulfide nanoparticles and electroactive biofilm

Author: Legrand, L., Snehangshu, P., Feron, D., Chausse, A., Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), amplexor, amplexor, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, and CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN)
Subjects: [CHIM] Chemical Sciences, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [CHIM]Chemical Sciences, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology
Abstract: International audience; Microbial fuel cells (MFCs) are eco-friendly and sustainable energy bioelectrochemical systems (BES), which convert chemical energy directly to electricity, through the bio-catalytic oxidation of organic compounds by electro-active bacteria1,2. The improvement of microbial fuel cell (MFC) performances requires the increase in cell voltage as well as discharge current densities. The choice of an efficient cathode is a problem3 and often limits the performance of the MFC. Nevertheless, it is possible to increase the whole performance by improving bioanode operating. The modification of bioanode surface by nanoparticles4 is a suitable way to increase the efficiency of electron transfer from the bacteria and anodic current collector. For this purpose, metal sulfides are interesting compounds because they involve various redox processes occurring in natural anaerobic environments. Very few studies reported these compounds as bioanodes materials5. In this communication, we will present the results that we obtained during the study of nickel sulfide / biofilm bioanodes formed by polarization at -0.2V/AgCl/Ag in KCl-garden compost solution filled with sodium acetate as an organic substrate long-term current time transients of these bioanodes and comparison to classical carbon or stainless steel bioanodes, microscopy observations of the surface of bioanodes, discussion on the electrochemical coupling between nickel sulfide nanoparticles and electroactive bacteria.
Published: 2017

37. Excited state characterization of carbonyl containing carotenoids: a comparison between single and multireference descriptions

Author: Benedetta Mennucci, Stefan Knecht, Riccardo Spezia, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Laboratorium für Physikalische Chemie (ETH-LPC), Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich), University of Pisa - Università di Pisa, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, and Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology in Zürich [Zürich] (ETH Zürich)
Subjects: Molecular Conformation, General Physics and Astronomy, FOS: Physical sciences, Xanthophylls, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Physics and Astronomy (all), chemistry.chemical_compound, Astaxanthin, Physics - Chemical Physics, 0103 physical sciences, Moiety, Canthaxanthin, Physical and Theoretical Chemistry, Chemical Physics (physics.chem-ph), 010304 chemical physics, Multireference configuration interaction, Charge (physics), Carotenoids, 0104 chemical sciences, 3. Good health, Crystallography, chemistry, Excited state, Quantum Theory, Thermodynamics, Density functional theory, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Excitation
Abstract: Carotenoids can play multiple roles in biological photoreceptors thanks to their rich photophysics. In the present work, we have investigated six of the most common carbonyl containing carotenoids: Echinenone, Canthaxanthin, Astaxanthin, Fucoxanthin, Capsanthin and Capsorubin. Their excitation properties are investigated by means of a hybrid density functional theory (DFT) and multireference configuration interaction (MRCI) approach to elucidate the role of the carbonyl group: the bright transition is of {\pi}{\pi}* character, as expected, but the presence of a C=O moiety reduces the energy of n{\pi}* transitions which may become closer to the {\pi}{\pi}* transition, in particular as the conjugation chain decreases. This can be related to the presence of a low-lying charge transfer state typical of short carbonyl- containing carotenoids. The DFT/MRCI results are finally used to benchmark single- reference time-dependent DFT-based methods: among the investigated functionals, the meta- GGA (and in particular M11L and MN12L) functionals show to perform the best for all six investigated systems., Comment: 15 pages, 10 figures
Published: 2017
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38. Conformational Dynamics in Ion Mobility Data

Author: Jean-Yves Salpin, Nicolas Bogliotti, Luke MacAleese, Philippe Dugourd, Chang Min Choi, Juan Xie, Salomé Poyer, Claire Deo, Clothilde Comby-Zerbino, Fabien Chirot, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Institut Lumière Matière [Villeurbanne] (ILM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Photophysique et Photochimie Supramoléculaires et Macromoléculaires (PPSM), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences Analytiques (ISA), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Salpin, Jean-Yves, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), ANR-11-IDEX-0003-02/11-LABX-0039,CHARMMMAT,CHimie des ARchitectures MoléculairesMultifonctionnelles et des MATériaux(2011), European Project: 8012481(1981), and ANR-11-IDEX-0003,IPS,Idex Paris-Saclay(2011)
Subjects: Bistability, Chemistry, Ion-mobility spectrometry, 010401 analytical chemistry, Dynamics (mechanics), Analytical chemistry, Experimental data, 010402 general chemistry, Kinetic energy, Ion mobility spectrometry IMS, 01 natural sciences, Arrival time, 0104 chemical sciences, Analytical Chemistry, Ion, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH] Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Chemical physics, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Conformation dynamics, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; The spectral features in arrival time distributions (ATDs) recorded by ion mobility spectrometry (IMS) can often be interpretedin terms of the co-existence of different isomers. However, interconversion between co-existing species also participatesto shape the ATD. Overlooking interconversion may then lead to misinterpretation of experimental data. Unfortunately, onlyfew works have addressed this problem so far. We present an analytical model that allows simulating ATDs resulting frominterconverting species. This model is used to reproduce experimental data obtained on a bi-stable system, and to interpret discrepanciesbetween measurements on different types of instruments. We show that the proposed model can be further exploitedto extract kinetic and thermodynamic data from tandem-IMS measurements.
Published: 2017
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39. Gas-phase reactivity of [Ca(formamide)]2+ complex : an example of different dynamical behaviours

Author: Ana Martín-Sómer, Manuel Yáñez, Riccardo Spezia, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Departemento de Química C-9, Universidad Autónoma de Madrid (UAM), ANR-14-CE06-0029,DynBioReact,Développement et application des simulations de dynamique directe pour la réactivité des biomolécule(2014), Universidad Autonoma de Madrid (UAM), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Formamide, 010405 organic chemistry, General Mathematics, General Engineering, General Physics and Astronomy, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Dissociation (chemistry), 0104 chemical sciences, Gas phase, chemistry.chemical_compound, Rice–Ramsperger–Kassel–Marcus, Ca2+, chemistry, Computational chemistry, gas-phase reactivity, peptides, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], formamide, direct dynamics simulations
Abstract: In the present contribution, we have summarized our recent work on the comprehension of [Ca(formamide)] 2+ complex gas-phase unimolecular dissociation. By using different theoretical approaches, we were able to revise the original (and typical for such kind of problems) understanding given in terms of stationary points on the potential energy surface, which did not provide a satisfactory explanation of the experimentally observed reactivity. In particular, we point out how non-statistical and non-intrinsic reaction coordinate mechanisms are of fundamental importance. This article is part of the themed issue ‘Theoretical and computational studies of non-equilibrium and non-statistical dynamics in the gas phase, in the condensed phase and at interfaces’.
Published: 2017
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40. Molecular biomarkers study of an ombrotrophic peatland impacted by an anthropogenic clay deposit

Author: Khaled Younes, Laurent Grasset, Michael Descostes, Joelle Laduranty, Institut de Chimie des Milieux et Matériaux de Poitiers (IC2MP), Université de Poitiers-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Poitiers-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Poitiers-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Peat, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Peatland, Carbohydrates, Ombrotrophic, Soil science, 01 natural sciences, Sphagnum, Lignin, chemistry.chemical_compound, Geochemistry and Petrology, [CHIM]Chemical Sciences, Organic matter, Sulfate, Loss on ignition, Acrotelm, 0105 earth and related environmental sciences, chemistry.chemical_classification, Molecular biomarkers, biology, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, biology.organism_classification, Lipids, Deposition (aerosol physics), chemistry, 040103 agronomy & agriculture, Clay disturbance, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Geology
Abstract: International audience; Northern peatlands are estimated to store up to one third of all terrestrial carbon as peat and, even though a large extent of boreal peatlands is in pristine condition, extensive areas have been affected by natural or anthropogenic disturbance. Here, we aimed to study the bulk organic matter, elemental composition and molecular inventory of a peat disturbed by a clay deposit in the mesotelm layer (from −35 to −45 cm) due to mining activity near the peatland zone. We therefore investigated loss on ignition, elemental analysis, lignin monomers and non-cellulose carbohydrates, as well as the lipid fraction. In general, no significant impact on peatland evolution was noted, the only odd result being an increase in complex lipids containing acyl groups in the clay deposit zone, although this did not influence the distributions of the fatty acids, which had a bimodal distribution at C16 and C24/C26, typical of a non-impacted Sphagnum dominated peatland. Phospholipid analysis showed an increase in the quantity of mid-chain branched fatty acids, suggesting high sulfate reducing activity in the underlying clay deposit. Other lipid, lignin and carbohydrate biomarkers showed a normal peatland evolution, plant deposition being apparent in the bottom layer designated by the catotelm and microbial activity and production being highest in the upper layer, represented by the acrotelm and mesotelm.
Published: 2017
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41. Characterization of Protonated Model Disaccharides from Tandem Mass Spectrometry and Chemical Dynamics Simulations

Author: Ane Eizaguirre, Gilles Doisneau, Jean-Marie Beau, Violette Haldys, Riccardo Spezia, Jean-Yves Salpin, Estefania Rossich Molina, Yann Bourdreux, Dominique Urban, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d'Orsay (ICMMO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: Analytical chemistry, carbohydrates, Protonation, Molecular Dynamics Simulation, 010402 general chemistry, Mass spectrometry, Tandem mass spectrometry, Disaccharides, 01 natural sciences, Dissociation (chemistry), chemistry.chemical_compound, Fragmentation (mass spectrometry), Computational chemistry, Tandem Mass Spectrometry, Carbohydrate Conformation, Gentiobiose, Physical and Theoretical Chemistry, Nuclear Experiment, fragmentation mechanisms, mass spectrometry, chemistry.chemical_classification, 010401 analytical chemistry, Glycosidic bond, Atomic and Molecular Physics, and Optics, 0104 chemical sciences, Chemical Dynamics, chemistry, chemical dynamics, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Protons
Abstract: International audience; The fragmentation mechanisms of prototypical disaccharides have been studied herein by coupling tandem mass spectrometry (MS) with collisional chemical dynamics simulations. These calculations were performed by explicitly considering the collisions between the protonated sugar and the neutral target gas, which led to an ensemble of trajectories for each system, from which it was possible to obtain reaction products and mechanisms without pre‐imposing them. The β‐aminoethyl and aminopropyl derivatives of cellobiose, maltose, and gentiobiose were studied to observe differences in both the stereochemistry and the location of the glycosidic linkage. Chemical dynamics simulations of MS/MS and MS/MS/MS were used to suggest some primary and secondary fragmentation mechanisms for some experimentally observed product ions. These simulations provided some new insights into the fundamentals of the unimolecular dissociation of protonated sugars under collisional induced dissociation conditions.
Published: 2017
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42. On the development of polarizable and Lennard-Jones force fields to study hydration structure and dynamics of actinide(III) ions based on effective ionic radii

Author: Valentina Migliorati, Riccardo Spezia, Paola D'Angelo, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Dipartimento di Chimica, Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome], Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' [Rome]
Subjects: hydration, rare earth elements, water molecules, Ionic radius, Solvation, General Physics and Astronomy, chemistry.chemical_element, 02 engineering and technology, Actinide, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, Force field (chemistry), 0104 chemical sciences, Ion, Lennard-Jones potential, Berkelium, chemistry, Polarizability, Chemical physics, Physics::Atomic and Molecular Clusters, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Physical and Theoretical Chemistry, Atomic physics, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; In this contribution, we show how it is possible to develop polarizable and non-polarizable force fields to study hydration properties of a whole chemical series based on atomic properties such as ionic radii. In particular, we have addressed the actinide(III) ion series, from U3+ to Cf3+, for which X-ray absorption data and effective ionic radii are available. A polarizable force field has been re-parameterized improving the original one [M. Duvail et al., J. Chem. Phys. 135, 044503 (2011)] which was based on solid state ionic radii. The new force field does not depend on solid state properties but directly on the liquid phase ones, and it can be used to study these ions in liquid water without any ambiguity. Furthermore, we have shown that it is possible to parameterize also a non-polarizable potential using standard Lennard-Jones and Coulombic forces, which can be transferred to other systems in condensed phase. The structural and dynamical properties of these two force fields are compared to each other and with data available in the literature, providing a good agreement. Moreover, we show the comparison with experimental X-ray absorption data that are very well reproduced by both force fields.
Published: 2017
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43. Fermi resonance in CO2: Mode assignment and quantum nuclear effects from first principles molecular dynamics

Author: Amélie Bordage, Marion Louvel, Rodolphe Vuilleumier, Sara Bonella, Félix Mouhat, Riccardo Spezia, Marie Basire, Guillaume Fraux, Jean-Louis Hazemann, Processus d'Activation Sélective par Transfert d'Energie Uni-électronique ou Radiatif (UMR 8640) (PASTEUR), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Néel (NEEL), Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d'Orsay (ICMMO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de Calcul atomique et moléculaire (CECAM), Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Matériaux, Rayonnements, Structure (NEEL - MRS), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Centre Européen de Calcul Atomique et Moléculaire (CECAM), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Matériaux, Rayonnements, Structure (MRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine
Subjects: Physics, 010304 chemical physics, Overtone, General Physics and Astronomy, Resonance, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, 0104 chemical sciences, Ab initio quantum chemistry methods, Quantum mechanics, 0103 physical sciences, Density functional theory, Perturbation theory (quantum mechanics), Fermi resonance, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Physical and Theoretical Chemistry, Quantum, Fermi Gamma-ray Space Telescope
Abstract: International audience; Vibrational spectroscopy is a fundamental tool to investigate local atomic arrangements and the effect of the environment, provided that the spectral features can be correctly assigned. This can be challenging in experiments and simulations when double peaks are present because they can have different origins. Fermi dyads are a common class of such doublets, stemming from the resonance of the fundamental excitation of a mode with the overtone of another. We present a new, efficient approach to unambiguously characterize Fermi resonances in density functional theory (DFT) based simulations of condensed phase systems. With it, the spectral features can be assigned and the two resonating modes identified. We also show how data from DFT simulations employing classical nuclear dynamics can be post-processed and combined with a perturbative quantum treatment at a finite temperature to include analytically thermal quantum nuclear effects. The inclusion of these effects is crucial to correct some of the qualitative failures of the Newtonian dynamics simulations at a low temperature such as, in particular, the behavior of the frequency splitting of the Fermi dyad. We show, by comparing with experimental data for the paradigmatic case of supercritical CO2, that these thermal quantum effects can be substantial even at ambient conditions and that our scheme provides an accurate and computationally convenient approach to account for them.
Published: 2017
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44. Negative mode MS/MS to read digital information encoded in sequence-defined oligo(urethane)s: A mechanistic study

Author: Valérie Monnier, Laurence Charles, Didier Gigmes, Salomé Poyer, Denise Karamessini, Jean-Arthur Amalian, Jean-François Lutz, Sofia Telitel, Benoit Eric Petit, Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Charles Sadron (ICS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA), Fédération des Sciences Chimiques de Marseille (FRSCM), École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Science des Matériaux de Mulhouse (IS2M), Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), École Centrale de Marseille (ECM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Electrospray, MS/MS sequencing, Collision-induced dissociation, Stereochemistry, Polyurethanes, Analytical chemistry, Sequence (biology), Context (language use), dna, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Dissociation (chemistry), digital polymers, storage, Deprotonation, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, Physical and Theoretical Chemistry, phosphoramidite, Instrumentation, Spectroscopy, polymers, chemistry.chemical_classification, Carbamate bond cleavage, Chemistry, 010401 analytical chemistry, containing macromolecules, Polymer, mass-spectrometry, Condensed Matter Physics, 0104 chemical sciences, [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, collision-induced dissociation, Yield (chemistry), sequence-controlled polymers
Abstract: International audience; MS/MS sequencing is an unrivaled technique to decipher binary information chemically encoded in the backbone of sequence-controlled synthetic polymers constructed with two co-monomers of different mass, arbitrarily designated as the 0- and 1-bit of the ASCII alphabet. Efficiency of this "reading" step relies however on the simplicity of MS/MS patterns, which depends on both polymer chemistry and chain length. In this context, polyurethanes (PUs) were very promising candidates as dissociation of small deprotonated oligomers (n \\textless 8) yielded a single fragment series. The carbamate bond cleavage reaction was hence studied in details to tentatively anticipate the CID behavior of longer chains prior to optimizing their synthesis. In spite of the simplicity of MS/MS spectra, three different mechanisms were evidenced; however, they were not expected to induce MS/MS complexity when activating longer chains, as verified for sequence-controlled PUs containing up to two bytes of information (i.e., 16 co-monomers). In contrast, the ionization step appeared to be an issue: deprotonation yield of the end-group in negative ion mode electrospray was observed to strongly decrease as PU chain length increases. This sensitivity issue was addressed by introducing a second acidic end-group to allow doubly deprotonated oligomers with no impact on their CID behavior. (C) 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.
Published: 2017
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45. How Does CeIII Nitrate Dissolve in a Protic Ionic Liquid? A Combined Molecular Dynamics and EXAFS Study

Author: Valentina Migliorati, Riccardo Spezia, Alessandra Serva, Paola D'Angelo, Dipartimento di Chimica, Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome], Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' [Rome], Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA)
Subjects: Lanthanoid ions, Cerium compounds, Metal ions in aqueous solution, Inorganic chemistry, 02 engineering and technology, Molecular dynamics, 010402 general chemistry, Ligands, 01 natural sciences, Catalysis, Ion, chemistry.chemical_compound, ethylammonium nitrate, EXAFS spectroscopy, icosahedral structure, lanthanoid ions, molecular dynamics, Chemistry (all), Ethylammonium nitrate, Metal ions, X ray absorption, Coordination geometry, Nitrates, Extended X-ray absorption fine structure, Molecular dynamics simulations, Organic Chemistry, Icosahedral structure, Extended X ray absorption fine structure spectroscopy, General Chemistry, Bidentate ligands, 021001 nanoscience & nanotechnology, 0104 chemical sciences, Ionic liquids, Solvation shell, Protic ionic liquids, Extended Xray absorption fine structure (EXAFS) spectroscopies, chemistry, Heavy metals, Existing structure, Ionic liquid, Physical chemistry, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], 0210 nano-technology, Angular distribution, Distribution functions
Abstract: International audience; A diluted solution of Ce(NO3)3 in the protic ionic liquid (IL) ethylammonium nitrate (EAN) was investigated using molecular dynamics (MD) simulations and extended X-ray absorption fine structure (EXAFS) spectroscopy. For the first time polarizable effects were included in the MD force field to describe a heavy metal ion in a protic IL, but, unlike water, they were found to be unessential. The CeIII ion first solvation shell is formed by nitrate ions arranged in an icosahedral structure, and an equilibrium between monodentate and bidentate ligands is present in the solution. By combining distance and angular distribution functions it was possible to unambiguously identify this peculiar coordination geometry around the ions dissolved in solution. The metal ions are solvated within the polar domains of the EAN nanostructure and the dissolved salt induces almost no reorganization of the pre-existing structure of EAN upon solubilization.
Published: 2017
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46. Unimolecular Fragmentation Induced By Low-Energy Collision: Statistically or Dynamically Driven?

Author: Manuel Yáñez, Ana Martín-Sómer, Marie-Pierre Gaigeot, Riccardo Spezia, Departemento de Química C-9, Universidad Autonoma de Madrid (UAM), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine, Universidad Autónoma de Madrid (UAM), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Collision-induced dissociation, Rate constants, Molecular Dynamics Simulation, chemistry, Molecular physics, Rotational energy distribution, Molecular dynamics, Fragmentation (mass spectrometry), Statistical theory, Models, Multi-scale approaches, Chemical dynamics, Organometallic Compounds, Collision mechanisms, Physical and Theoretical Chemistry, Low energy collisions, RRKM theory, Models, Statistical, Experimental spectra, calcium, Formamides, Internal energy, Electric power distribution, Chemistry, formamide derivative, statistical model, Statistical, Collision, Amides, molecular dynamics, Dynamics, Rotational energy, Chemical Dynamics, Strontium, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], formamide, organometallic compound, Atomic physics, Collision induced dissociation
Abstract: International audience; By combining chemical dynamics simulations and RRKM statistical theory we have characterized collision induced dissociation (CID) mechanisms of [M(formamide)]2+ ions (M = Ca, Sr) at different timescales, from few femtoseconds to microseconds. Chemical dynamics simulations account for the short-time and dynamically driven reactivity, such as impulsive collision mechanism for formamide neutral loss. From the simulations, we also got the amounts of energy transferred during the collision and, especially important, the vibrational and rotational energy distributions of the ions that did not react during the simulation time length of 2.5 ps. These internal energy distributions were in turn used in combination with RRKM theory to estimate the rate constants of the possible reactive pathways. Hence, we performed a statistical analysis of the CID dynamics accounting for the long-time and statistical reactivity (i.e., through an IVR mechanism). This multiscale approach allowed us to account for all the products observed in the CID experimental spectra of [Ca(formamide)]2+ and [Sr(formamide)]2+ doubly charged cations, as well as the differences between them.
Published: 2014
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47. A robust transfection reagent for the transfection of CHO and HEK293 cells and production of recombinant proteins and lentiviral particles - PTG1

Author: Fabian Gross, Philippe Guégan, Patrick Midou, Hervé Cheradame, Cristine Gonçalves, Centre de biophysique moléculaire (CBM), Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Module Biothérapies, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biothérapie, CHU Toulouse [Toulouse], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), and Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: animal structures, Cell Survival, [SDV]Life Sciences [q-bio], viruses, Genetic enhancement, CHO Cells, Biology, Transfection, Applied Microbiology and Biotechnology, Viral vector, law.invention, Cricetulus, law, Cricetinae, Animals, Humans, Polyethyleneimine, Histidine, Chinese hamster ovary cell, Lentivirus, HEK 293 cells, Virion, General Medicine, Molecular biology, Bioproduction, Recombinant Proteins, HEK293 Cells, Cell culture, Chinese hamster ovary cells, embryonic structures, Recombinant DNA, Molecular Medicine
Abstract: International audience; Bioproduction of recombinant proteins (r-proteins) and recombinant lentiviral particles (r-lentiviral particles) requires robust transfections consisting of efficient protocols that are easy to implement, with good reproducibility for a maximum production of proteins and lentiviral particles in a short time with low cytotoxicity. This study evaluates the capacity of histidinylated polyethyleneimine I (PTG1) to facilitate robust DNA transfection, with low cytotoxicity, of Chinese hamster ovary (CHO) and human embryonic kidney (HEK293T) cells for the production of r-proteins and r-lentiviral particles. We report that PTG1 transfection of cells in suspension with a plasmid DNA encoding enhanced green fluorescent protein leads to 72 and 97% of transfected CHO and HEK293T cells respectively, and does not significantly affect cell viability. PTG1 transfection of 100 mL of CHO-S cell culture in suspension at a cell density of 2 × 106 cells /mL resulted in a high level of transfected cells and protein expression after transfection with 0.75 μg/mL plasmid DNA. Transfection with PTG1 is more efficient than LipofectAmine2000™, and gene expression is higher than observed with FreeStyle™ and JetPEI®. Tri-transfection of HEK293T packaging cells leads to the production of a higher level of r-lentiviral particles compared to the calcium phosphate method, and permits two harvests of viral particles within three days. These results show that PTG1 is a powerful new transfection reagent for cell lines frequently used for recombinant protein and lentiviral particle production. PTG1 could be used in protocols for bioproduction of therapeutic proteins such as antibodies for cancer treatments and viral vectors for gene therapy applications.
Published: 2014
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48. Cis -splicing and Translation of the Pre- Trans -splicing Molecule Combine With Efficiency in Spliceosome-mediated RNA Trans -splicing

Author: Florence Le Roy, Isabelle Richard, François Monjaret, Nathalie Bourg, Carinne Roudaut, Laurence Suel, Karine Charton, Baculovirus et Thérapie, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pontchaillou [Rennes], Approches génétiques intégrées et nouvelles thérapies pour les maladies rares (INTEGRARE), École pratique des hautes études (EPHE)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-GENETHON 3-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Analyse, Modélisation et Matériaux pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY), Immunologie moléculaire et biothérapies innovantes (IMBI), Généthon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Généthon
Subjects: [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Trans-splicing, Muscular Dystrophies, Trans-Splicing, Mice, 0302 clinical medicine, MESH: Molecular Targeted Therapy, Drug Discovery, RNA Precursors, MESH: Animals, Molecular Targeted Therapy, Dysferlin, Genetics, 0303 health sciences, MESH: Trans-Splicing, MESH: Alternative Splicing, Non-coding RNA, 3. Good health, RNA silencing, RNA editing, RNA splicing, Molecular Medicine, Original Article, MESH: Membrane Proteins, MESH: RNA Precursors, Computational biology, Biology, Cell Line, Open Reading Frames, 03 medical and health sciences, MESH: Mice, Inbred C57BL, Animals, Humans, RNA, Messenger, MESH: Protein Kinases, MESH: Mice, Molecular Biology, MESH: RNA, Messenger, 030304 developmental biology, Pharmacology, MESH: Dysferlin, MESH: Humans, Alternative splicing, Intron, Membrane Proteins, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, MESH: Open Reading Frames, MESH: Muscular Dystrophies, MESH: Cell Line, Mice, Inbred C57BL, Alternative Splicing, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Protein Kinases, 030217 neurology & neurosurgery, Minigene
Abstract: International audience; Muscular dystrophies are a group of genetically distinct diseases for which no treatment exists. While gene transfer approach is being tested for several of these diseases, such strategies can be hampered when the size of the corresponding complementary DNA (cDNA) exceeds the packaging capacity of adeno-associated virus vectors. This issue concerns, in particular, dysferlinopathies and titinopathies that are due to mutations in the dysferlin (DYSF) and titin (TTN) genes. We investigated the efficacy of RNA trans-splicing as a mode of RNA therapy for these two types of diseases. Results obtained with RNA trans-splicing molecules designed to target the 3' end of mouse titin and human dysferlin pre-mRNA transcripts indicated that trans-splicing of pre-mRNA generated from minigene constructs or from the endogenous genes was achieved. Collectively, these results provide the first demonstration of DYSF and TTN trans-splicing reprogramming in vitro and in vivo. However, in addition to these positive results, we uncovered a possible issue of the technique in the form of undesirable translation of RNA pre-trans-splicing molecules, directly from open reading frames present on the molecule or associated with internal alternative cis-splicing. These events may hamper the efficiency of the trans-splicing process and/or lead to toxicity.
Published: 2014
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49. Convergence of Genes and Cellular Pathways Dysregulated in Autism Spectrum Disorders

Author: Joana Almeida, Christian R. Marshall, Hakon Hakonarson, Bárbara Oliveira, Anthony J. Griswold, Jacob A. S. Vorstman, Bhooma Thiruvahindrapuram, Suma Jacob, Judith Conroy, Alistair T. Pagnamenta, Christelle Cabrol, Jeremy R. Parr, Daniel H. Geschwind, Nancy J. Minshew, Xiao Xu, Richard Anney, Sven Bölte, Zhuozhi Wang, Emily L. Crawford, Elsa Delaby, Margaret A. Pericak-Vance, Joachim Hallmayer, Jonathan L. Haines, Dalila Pinto, Susana Mouga, Alexander Kolevzon, Elena Bacchelli, Frederico Duque, Bernie Devlin, Latha Soorya, Cátia Café, Kirsty Wing, Jennifer K. Lowe, Ana Tryfon, Stephen J. Guter, Geraldine Dawson, Tiago R. Magalhaes, Anthony J. Bailey, Michael Gill, Peter Szatmari, Steven Gallinger, Marion Pilorge, James S. Sutcliffe, Bridget A. Fernandez, Herman van Engeland, Catalina Betancur, Guiomar Oliveira, Andrew Green, Eftichia Duketis, Bernadette Rogé, Ann Le Couteur, Evdokia Anagnostou, Michelle Cotterchio, Daniele Merico, Giovanna Pellecchia, Jonathan Green, Regina Regan, Jillian P. Casey, Guiqing Cai, Gerard D. Schellenberg, Jennifer L. Howe, Elena Maestrini, Andrew D. Paterson, L. Alison McInnes, Patrick Bolton, Edwin H. Cook, Richard Delorme, Lambertus Klei, Thomas Bourgeron, Gillian Baird, Christine M. Freitag, Beth A. Dombroski, Andreas G. Chiocchetti, Sabine M. Klauck, Susan E. Folstein, Mafalda Barbosa, Anthony P. Monaco, Marion Leboyer, Nadia Bolshakova, Fritz Poustka, Richard Holt, Kerstin Wittemeyer, Wendy Roberts, Lonnie Zwaigenbaum, Louise Gallagher, Susan G. McGrew, Joseph D. Buxbaum, Graham Casey, Simon Wallace, Catherine Lord, Sean Brennan, Robert Ziman, Alison K. Merikangas, John I. Nurnberger, Christopher Gillberg, Ellen M. Wijsman, Astrid M. Vicente, Inȇs C. Conceição, Sean Ennis, Patricia Jiménez González, Hilary Coon, Raphael Bernier, John R. Gilbert, Ann P. Thompson, Susanne Thomson, Agatino Battaglia, Maretha de Jonge, Michael L. Cuccaro, Catarina Correia, Veronica J. Vieland, Stephen W. Scherer, Pauline Chaste, Departments of Psychiatry, Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] (MSSM)-Seaver Autism Center-, The Mindich Child Health & Development Institute, Department of Psychiatry, Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] (MSSM), Seaver Autism Center for Research and Treatment, Friedman Brain Institute, The Mindich Child Health and Development Institute, The Icahn Institute for Genomics and Multiscale Biology, Neurosciences Paris Seine (NPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Program in Genetics and Genomic Biology, Hospital for Sick Children-University of Toronto McLaughlin Centre, Trinity College Dublin-St. James's Hospital, Department of Psychiatry [Pittsburgh], University of Pittsburgh School of Medicine, Pennsylvania Commonwealth System of Higher Education (PCSHE)-Pennsylvania Commonwealth System of Higher Education (PCSHE), University Medical Center [Utrecht]-Brain Center Rudolf Magnus, Department of Psychiatry and Behavioural Neurosciences, McMaster University [Hamilton, Ontario]-Offord Centre for Child Studies, Academic Centre on Rare Diseases (ACoRD), University College Dublin [Dublin] (UCD), The Wellcome Trust Centre for Human Genetics [Oxford], University of Oxford [Oxford], Instituto Nacional de Saùde Dr Ricardo Jorge [Portugal] (INSA), McLaughlin Centre, University of Toronto, BioFIG, Center for Biodiversity, Functional and Integrative Genomics, Department of Neurology, University of California [Los Angeles] (UCLA), University of California-University of California-David Geffen School of Medicine [Los Angeles], University of California-University of California, Fisico-Quimica Biologica, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), John P. Hussman Institute for Human Genomics, University of Miami [Coral Gables], Department of Child and Adolescent Psychiatry, Psychosomatics and Psychotherapy, Goethe-Universität Frankfurt am Main, Pathology and Laboratory Medicine, University of Pennsylvania [Philadelphia], Department of Pathology, Vanderbilt Brain Institute, Vanderbilt University School of Medicine [Nashville], Department of Molecular Physiology & Biophysics and Psychiatry, Vanderbilt University [Nashville]-Centers for Human Genetics Research and Molecular Neuroscience, Division of Molecular Genome Analysis, German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] (DKFZ), Department of Pharmacy and Biotechnology, Alma Mater Studiorum Università di Bologna [Bologna] (UNIBO), Familial Gastrointestinal Cancer Registry, Mount Sinai Hospital [Toronto, Canada] (MSH), Prevention & Cancer Control, Cancer Care Ontario, Department of Preventive Medicine, University of Southern California (USC), Department of Pediatrics, University of Alberta, School of Education, University of Birmingham [Birmingham], University of Oxford [Oxford]-Warneford Hospital, Octogone Unité de Recherche Interdisciplinaire (Octogone), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Autism Research Unit, The Hospital for sick children [Toronto] (SickKids)-University of Toronto, Unidade de Neurodesenvolvimento e Autismo (UNDA), Hospital Pediatrico de Coimbra, Institute for Biomedical Imaging and Life Science, University of Coimbra [Portugal] (UC), Vanderbilt University [Nashville], Center for Autism and the Developing Brain (CADB), Weill Medical College of Cornell University [New York], Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Service de psychiatrie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Hôpital Albert Chenevier, Institute of Health and Society, Newcastle University [Newcastle], Department of Child and Adolescent Psychiatry, Newcastle University [Newcastle]-Institute of Health & Society (Child & Adolescent Psychiatry), Child Developmental and Behavioral Unit, Hospital Nacional de Niños Dr Sáenz Herrera, Institute for Juvenile Research-University of Illinois [Chicago] (UIC), University of Illinois System-University of Illinois System, Manchester Academic Health Sciences Centre, Gillberg Neuropsychiatry Centre [Göteborg, Sueden], Institute of Neuroscience and Physiology [Göteborg]-University of Gothenburg (GU), Institute of Child Health, University College of London [London] (UCL), Memorial University of Newfoundland [St. John's], Disciplines of Genetics and Medicine, Génétique Humaine et Fonctions Cognitives, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Psychiatry and Behavioral Sciences, Duke University School of Medicine, Institute of Psychiatry, King‘s College London, Institute of psychiatry, University of Washington [Seattle], Paediatric Neurodisability, King‘s College London-King's Health Partners, MRC Social, Genetic and Developmental Psychiatry Centre (SGDP), King‘s College London-The Institute of Psychiatry, University of British Columbia (UBC), Bloorview Research Institute, Division of Medical Genetics [Seattle], Departments of Biostatistics and Medicine, Battelle Center for Mathematical Medicine, Ohio State University [Columbus] (OSU)-Nationwide Children's Hospital, Institute of Neuroscience [Newcastle] (ION), Institutes of Neuroscience and Health and Society, Indiana University School of Medicine, Indiana University System-Indiana University System, The Center for Applied Genomics, Children’s Hospital of Philadelphia (CHOP ), Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania [Philadelphia]-University of Pennsylvania [Philadelphia]-Children’s Hospital of Philadelphia (CHOP ), Utah Autism Research Program, University of Utah Psychiatry Department, University of Miami School of Medicine, Department of Developmental Neuroscience, IRCCS Fondazione Stella Maris [Pisa], Department of Psychiatry and Behavioral Sciences [Stanford], Stanford Medicine, Stanford University-Stanford University, Stanford School of Medicine [Stanford], Institute for Juvenile Research, University of Illinois [Chicago] (UIC), Department of Neuroscience, Main funders of the Autism Genome Project: Autism Speaks (USA), the Health Research Board (Ireland, AUT/2006/1, AUT/2006/2, PD/2006/48), the Medical Research Council (UK), the Hilibrand Foundation (USA), Genome Canada, the Ontario Genomics Institute, and the Canadian Institutes of Health Research (CIHR), Autism Genome Project Consortium, Neuroscience Paris Seine (NPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Oxford, University of California (UC)-University of California (UC)-David Geffen School of Medicine [Los Angeles], University of California (UC)-University of California (UC), University of Pennsylvania, University of Oxford-Warneford Hospital, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Memorial University of Newfoundland = Université Memorial de Terre-Neuve [St. John's, Canada] (MUN), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Pennsylvania-University of Pennsylvania-Children’s Hospital of Philadelphia (CHOP ), Betancur, Catalina, Instituto Nacional de Saude Dr Ricardo Jorge, Universidade Federal do Rio de Janeiro [Rio de Janeiro] (UFRJ), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Università di Bologna [Bologna] (UNIBO), Mount Sinai Hospital (MSH), University of Toronto-The Hospital for Sick Children, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Hôpital Albert Chenevier, Gillberg Neuropsychiatry Centre, University of Gothenburg (GU), Stanford University Medical School, Stanford University School of Medicine [Stanford], Stanford University [Stanford], Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Pinto D, Delaby E, Merico D, Barbosa M, Merikangas A, Klei L, Thiruvahindrapuram B, Xu X, Ziman R, Wang Z, Vorstman JA, Thompson A, Regan R, Pilorge M, Pellecchia G, Pagnamenta AT, Oliveira B, Marshall CR, Magalhaes TR, Lowe JK, Howe JL, Griswold AJ, Gilbert J, Duketis E, Dombroski BA, De Jonge MV, Cuccaro M, Crawford EL, Correia CT, Conroy J, Conceição IC, Chiocchetti AG, Casey JP, Cai G, Cabrol C, Bolshakova N, Bacchelli E, Anney R, Gallinger S, Cotterchio M, Casey G, Zwaigenbaum L, Wittemeyer K, Wing K, Wallace S, van Engeland H, Tryfon A, Thomson S, Soorya L, Rogé B, Roberts W, Poustka F, Mouga S, Minshew N, McInnes LA, McGrew SG, Lord C, Leboyer M, Le Couteur AS, Kolevzon A, Jiménez González P, Jacob S, Holt R, Guter S, Green J, Green A, Gillberg C, Fernandez BA, Duque F, Delorme R, Dawson G, Chaste P, Café C, Brennan S, Bourgeron T, Bolton PF, Bölte S, Bernier R, Baird G, Bailey AJ, Anagnostou E, Almeida J, Wijsman EM, Vieland VJ, Vicente AM, Schellenberg GD, Pericak-Vance M, Paterson AD, Parr JR, Oliveira G, Nurnberger JI, Monaco AP, Maestrini E, Klauck SM, Hakonarson H, Haines JL, Geschwind DH, Freitag CM, Folstein SE, Ennis S, Coon H, Battaglia A, Szatmari P, Sutcliffe JS, Hallmayer J, Gill M, Cook EH, Buxbaum JD, Devlin B, Gallagher L, Betancur C, and Scherer SW.
Subjects: Male, INTELLECTUAL DISABILITY, pathways, Genome-wide association study, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Bioinformatics, DUPLICATIONS, Intellectual disability, Gene Regulatory Networks, Genetics(clinical), Copy-number variation, 10. No inequality, Child, GDI1, Genetics (clinical), Sequence Deletion, COPY NUMBER VARIANTS, Genetics, gene networks, Copy Number Variation, 3. Good health, Pedigree, Fragile X syndrome, Multigene Family, Female, Metabolic Networks and Pathways, de novo, DNA Copy Number Variations, autism, Biology, rare CNV, PHENOTYPE ONTOLOGY, Article, Structural variation, mental disorders, medicine, Humans, ddc:610, FRAGILE-X-SYNDROME, GENOME-WIDE ASSOCIATION, Gene, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, HDAC4, SETD5, medicine.disease, CHD2, inherited, STRUCTURAL VARIATION, DELETIONS, DE-NOVO MUTATIONS, Child Development Disorders, Pervasive, Autism
Abstract: International audience; Rare copy-number variation (CNV) is an important source of risk for autism spectrum disorders (ASDs). We analyzed 2,446 ASD-affected families and confirmed an excess of genic deletions and duplications in affected versus control groups (1.41-fold, p = 1.0 × 10(-5)) and an increase in affected subjects carrying exonic pathogenic CNVs overlapping known loci associated with dominant or X-linked ASD and intellectual disability (odds ratio = 12.62, p = 2.7 × 10(-15), ∼3% of ASD subjects). Pathogenic CNVs, often showing variable expressivity, included rare de novo and inherited events at 36 loci, implicating ASD-associated genes (CHD2, HDAC4, and GDI1) previously linked to other neurodevelopmental disorders, as well as other genes such as SETD5, MIR137, and HDAC9. Consistent with hypothesized gender-specific modulators, females with ASD were more likely to have highly penetrant CNVs (p = 0.017) and were also overrepresented among subjects with fragile X syndrome protein targets (p = 0.02). Genes affected by de novo CNVs and/or loss-of-function single-nucleotide variants converged on networks related to neuronal signaling and development, synapse function, and chromatin regulation.
Published: 2014
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50. Osteomyelitis variolosa: A probable mediaeval case combined with unilateral sacroiliitis

Author: Isabelle Richard, Marie-Cécile Truc, Yves Darton, Culture et Environnements, Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age (CEPAM), Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Cergy Pontoise (UCP), Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Michel de Boüard - Centre de recherches archéologiques et historiques anciennes et médiévales (CRAHAM), Université de Caen Normandie (UNICAEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Archeology, medicine.medical_specialty, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, health care facilities, manpower, and services, education, with, [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, mediaeval, Context (language use), sacroiliitis, probable, [SHS]Humanities and Social Sciences, Pathology and Forensic Medicine, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, unilateral, Smallpox, 030212 general & internal medicine, Paleopathology, health care economics and organizations, 030203 arthritis & rheumatology, combined, business.industry, Osteomyelitis, variolosa, Sacroiliitis, medicine.disease, Dermatology, 3. Good health, Time of death, Surgery, case, business
Abstract: International audience; Osteoarticular sequelae of smallpox (osteomyelitis variolosa) are uncommon today. Such lesions may be observed occasionally, however, in countries where the disease has been endemic. Without other forms of documentation, it is possible to suggest a diagnosis of smallpox in ancient skeletal remains and thus make a significant contribution to understanding the history of this disease. We have examined a subadult male (Skeleton 833), 15–17 years old at the time of death, who presents bilateral bone manifestations of the elbows suggestive of smallpox. No other bone is similarly affected. In addition, he presents a left sacroiliitis deemed to be a brucellar manifestation. Skeleton 833 is one of at least 730 individuals from an exhaustive excavation of a mediaeval necropolis at Pont-sur-Seine (Aube, north-eastern France). Radiocarbon dating of his bones yields a date of between AD 1022 and 1155 (calibrated), thus apparently the oldest case described to date. The other published cases correspond to more recent periods with a well established historical context. We argue that this example of osteomyelitis variolosa.
Published: 2013
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