Florence Gaillard-Bigot, Patrice Denèfle, Nathalie Varoqueaux, Damien Sanlaville, Jean-François Guérin, Lionel Perrier, Olivier Perche, Julia Morere, Caroline Guillot, Pascal Bilbault, François Gueyffier, Pierre-Henry Longeray, Guillaume Grenet, Élodie Bégué, Bruno Laviolle, Julien Thevenon, Hélène Espérou, Service de Pharmacologie [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Généthon, Evaluation et modélisation des effets thérapeutiques, Département biostatistiques et modélisation pour la santé et l'environnement [LBBE], Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ligue Nationale Contre le Cancer - Paris, Ligue Nationale Contre le Cancer (LNCC), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Agence de la biomédecine [Saint-Denis la Plaine], Hypoxie : Physiopathologie Respiratoire et Cardiovasculaire (HP2 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fédération française des diabétiques, Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre Léon Bérard [Lyon], Groupe d'Analyse et de Théorie Economique Lyon - Saint-Etienne (GATE Lyon Saint-Étienne), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Cytogénétique (HFME), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Roche SAS, Neuilly-sur-Seine, France, Laboratoire Roche SAS, The advent of a new paradigm induced by the massive deployment of high-throughput sequencing raises economic and organisational issues. The evaluation of the production cost of genome sequences shows a notable change in the production costs of a gene panel targeted by next-generation sequencing (NGS) according to indications, enrichment techniques, retained sequencing, or the number of patients per run. In France, for example, the cost per patient (from the receipt of samples to the return of results to prescribers) varies from one to three depending on the laboratories [17]. What about the cost of genome sequencing? One can assume that production costs will largely depend on the organisational model chosen and its ability to integrate multiple technical constraints (prescription portals, automated extraction systems, production platform, IT infrastructure, data analysis, rendering of results, interoperability with patient records, etc.).The medico-economic assessment of the genome-wide sequencing strategy is essential to inform policy makers on the cost-effectiveness (or not) of one or more innovative health strategies compared to the reference strategy (s). These assessments are planned in the pilot projects of the France genomics 2025 plan. This approach has well-known benefits such as the absence (most often) of selection bias. In contrast, the time horizon of the economic evaluation is usually limited to the follow-up period of the trial and differential cost-result ratio (DCRR) is not always expressed in cost per year of life gained in good health. These can also emanate from modelling. The review of the literature published by Schwarze et al. on genome sequencing reports a very limited number (N = 8) of publications including a complete medico-economic assessment (i.e. that integrates economic considerations and clinical efficacy) [18]. Furthermore, the heterogeneity of the efficacy criteria does not favour comparisons between studies. Only one of them expresses the DCRR in cost per year of life gained in good health [19]., Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Roche, Université de Lyon, Ligue Nationnale Contre le Cancer, Hypoxie et physiopathologies cardiovasculaire et respiratoire, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Groupe d'analyse et de théorie économique (GATE Lyon Saint-Étienne), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Dao, Taï, and École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)