58 results on '"Lucia Brandimarte"'
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2. Combined interphase fluorescence in situ hybridization elucidates the genetic heterogeneity of T-cell acute lymphoblastic leukemia in adults
- Author
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Paolo Gorello, Roberta La Starza, Emanuela Varasano, Sabina Chiaretti, Loredana Elia, Valentina Pierini, Gianluca Barba, Lucia Brandimarte, Barbara Crescenzi, Antonella Vitale, Monica Messina, Sara Grammatico, Marco Mancini, Caterina Matteucci, Antonella Bardi, Anna Guarini, Massimo Fabrizio Martelli, Robin Foà, and Cristina Mecucci
- Subjects
Diseases of the blood and blood-forming organs ,RC633-647.5 - Abstract
Background Molecular lesions in T-cell acute lymphoblastic leukemias affect regulators of cell cycle, proliferation, differentiation, survival and apoptosis in multi-step pathogenic pathways. Full genetic characterization is needed to identify events concurring in the development of these leukemias.Design and Methods We designed a combined interphase fluorescence in situ hybridization strategy to study 25 oncogenes/tumor suppressor genes in T-cell acute lymphoblastic leukemias and applied it in 23 adult patients for whom immunophenotyping, karyotyping, molecular studies, and gene expression profiling data were available. The results were confirmed and integrated with those of multiplex-polymerase chain reaction analysis and gene expression profiling in another 129 adults with T-cell acute lymphoblastic leukemias.Results The combined hybridization was abnormal in 21/23 patients (91%), and revealed multiple genomic changes in 13 (56%). It found abnormalities known to be associated with T-cell acute lymphoblastic leukemias, i.e. CDKN2A-B/9p21 and GRIK2/6q16 deletions, TCR and TLX3 rearrangements, SIL-TAL1, CALM-AF10, MLL-translocations, del(17)(q12)/NF1 and other cryptic genomic imbalances, i.e. 9q34, 11p, 12p, and 17q11 duplication, del(5)(q35), del(7)(q34), del(9)(q34), del(12)(p13), and del(14)(q11). It revealed new cytogenetic mechanisms for TCRB-driven oncogene activation and C-MYB duplication. In two cases with cryptic del(9)(q34), fluorescence in situ hybridization and reverse transcriptase polymerase chain reaction detected the TAF_INUP214 fusion and gene expression profiling identified a signature characterized by HOXA and NUP214 upregulation and TAF_I, FNBP1, C9orf78, and USP20 down-regulation. Multiplex-polymerase chain reaction analysis and gene expression profiling of 129 further cases found five additional cases of TAF_I-NUP214-positive T-cell acute lymphoblastic leukemia.Conclusions Our combined interphase fluorescence in situ hybridization strategy greatly improved the detection of genetic abnormalities in adult T-cell acute lymphoblastic leukemias. It identified new tumor suppressor genes/oncogenes involved in leukemogenesis and highlighted concurrent involvement of genes. The estimated incidence of TAF_I-NUP214, a new recurrent fusion in adult T-cell acute lymphoblastic leukemias, was 4.6% (7/152).
- Published
- 2010
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3. NPM1 deletion is associated with gross chromosomal rearrangements in leukemia.
- Author
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Roberta La Starza, Caterina Matteucci, Paolo Gorello, Lucia Brandimarte, Valentina Pierini, Barbara Crescenzi, Valeria Nofrini, Roberto Rosati, Enrico Gottardi, Giuseppe Saglio, Antonella Santucci, Laura Berchicci, Francesco Arcioni, Brunangelo Falini, Massimo Fabrizio Martelli, Constantina Sambani, Anna Aventin, and Cristina Mecucci
- Subjects
Medicine ,Science - Abstract
BACKGROUND: NPM1 gene at chromosome 5q35 is involved in recurrent translocations in leukemia and lymphoma. It also undergoes mutations in 60% of adult acute myeloid leukemia (AML) cases with normal karyotype. The incidence and significance of NPM1 deletion in human leukemia have not been elucidated. METHODOLOGY AND PRINCIPAL FINDINGS: Bone marrow samples from 145 patients with myelodysplastic syndromes (MDS) and AML were included in this study. Cytogenetically 43 cases had isolated 5q-, 84 cases had 5q- plus other changes and 18 cases had complex karyotype without 5q deletion. FISH and direct sequencing investigated the NPM1 gene. NPM1 deletion was an uncommon event in the "5q- syndrome" but occurred in over 40% of cases with high risk MDS/AML with complex karyotypes and 5q loss. It originated from large 5q chromosome deletions. Simultaneous exon 12 mutations were never found. NPM1 gene status was related to the pattern of complex cytogenetic aberrations. NPM1 haploinsufficiency was significantly associated with monosomies (p
- Published
- 2010
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4. t(3;11)(q12;p15)/NUP98-LOC348801 fusion transcript in acute myeloid leukemia
- Author
-
Paolo Gorello, Lucia Brandimarte, Roberta La Starza, Valentina Pierini, Loredana Bury, Roberto Rosati, Massimo F. Martelli, Peter Vandenberghe, Iwona Wlodarska, and Cristina Mecucci
- Subjects
Diseases of the blood and blood-forming organs ,RC633-647.5 - Abstract
In a case of acute myeloid leukemia we report molecular cytogenetic findings of a t(3;11)(q12;p15), characterized as a new NUP98 translocation rearranging with LOC348801 at chromosome 3. NUP98 involvement was detected by fluorescence in situ hybridization. 3’-RACE-PCR showed nucleotide 1718 (exon 13) of NUP98 was fused in-frame with nucleotide 1248 (exon 2) of LOC348801. RT-PCR and cloning experiments detected two in-frame spliced NUP98-LOC348801 transcripts and the reciprocal LOC348801-NUP98. A highly specific double-color double-fusion FISH assay reliably detects NUP98-LOC348801.
- Published
- 2008
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5. Activating somatic and germline TERT promoter variants in myeloid malignancies
- Author
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Alessio Gili, Simona Colla, Paolo Gorello, Valeria Nofrini, Danika Di Giacomo, Caterina Matteucci, Lucia Brandimarte, Giovanni Roti, Tamara Iannotti, Carlotta Nardelli, Fabrizia Pellanera, Anair Graciela Lema Fernandez, Valeria Di Battista, Cristina Mecucci, Silvia Arniani, and Martina Moretti
- Subjects
Cancer Research ,Myeloid ,Letter ,Genotype ,Somatic cell ,Diseases ,Biology ,TELOMERE LENGTH ,TRANSCRIPTION ,MUTATIONS ,CELLS ,Germline ,Germline mutation ,Transcription (biology) ,medicine ,Humans ,Genetic Predisposition to Disease ,Allele ,Promoter Regions, Genetic ,Telomerase ,Alleles ,Genetic Association Studies ,Germ-Line Mutation ,Hematology ,medicine.disease ,Leukemia ,medicine.anatomical_structure ,Oncology ,Leukemia, Myeloid ,Mutation ,Cancer research ,Myelodysplastic syndrome - Published
- 2019
6. O Ser Humano e o Ambiente
- Author
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Ana Lúcia Brandimarte, Déborah Yara Alves Cursino dos Santos, Ana Lúcia Brandimarte, and Déborah Yara Alves Cursino dos Santos
- Abstract
O livro O ser humano e o ambiente objetiva introduzir a problemática do crescimento e adensamento populacional humano frente à escassez de recursos a partir de uma perspectiva histórica, utilizando uma linguagem acessível a graduandos de cursos de Ciências Biológicas, Engenharias Ambiental e Florestal e Gestão Ambiental, professores de ensino básico e demais interessados nessa temática que procuram uma visão básica sobre questões ambientais. Entre os principais temas tratados estão o crescimento populacional humano como causa e consequência dos padrões de consumo de energia e recursos e suas relações com a utilização de combustíveis fósseis, e recursos renováveis como fonte de energia. São abordados temas como agricultura, ambientes urbanos, qualidade e disponibilidade de água, mudanças climáticas, capacidade de suporte do planeta e pegada ecológica humana e, por fim, suas relações com desenvolvimento sustentável e uso e conservação dos recursos naturais. Apesar de ser fortemente embasada em aspectos ambientais, a obra não deixa de lado relevantes questões sociais e econômicas associadas aos temas tratados.
- Published
- 2019
7. Inv(11)(p15q22)/NUP98-DDX10 fusion and isoforms in a new case of de novo acute myeloid leukemia
- Author
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Barbara Crescenzi, Danika Di Giacomo, Roberta La Starza, Valeria Nofrini, Clelia Tiziana Storlazzi, Paolo Gorello, Filomena Nozza, Caterina Matteucci, Lucia Brandimarte, Giulia Daniele, Cristina Mecucci, and Valentina Pierini
- Subjects
Adult ,Male ,Gene isoform ,Cancer Research ,Oncogene Proteins, Fusion ,Transcription, Genetic ,Oncogene Proteins ,Karyotype ,Molecular Sequence Data ,Biology ,DEAD-box RNA Helicases ,Exon ,Genetics ,medicine ,Humans ,Protein Isoforms ,Amino Acid Sequence ,Molecular Biology ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,Base Sequence ,medicine.diagnostic_test ,Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction ,Chromosomes, Human, Pair 11 ,Myeloid leukemia ,Exons ,medicine.disease ,Molecular biology ,Chromosome Banding ,Nuclear Pore Complex Proteins ,Leukemia ,Fusion transcript ,Leukemia, Myeloid ,Acute Disease ,Chromosome Inversion ,RNA splicing ,Fluorescence in situ hybridization - Abstract
We set up a diagnostic double-color double-fusion fluorescence in situ hybridization (DCDF-FISH) assay to investigate a case of a de novo acute myeloid leukemia (AML)-M4 bearing an inv(11)(p15q22). DCDF-FISH detected the NUP98-DDX10 rearrangement as two fusion signals, at the short and the long arms of the inv(11). Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and cloning experiments confirmed the NUP98-DDX10 fusion and identified two splicing fusion isoforms: the known "type II fusion," originating from the fusion of NUP98 exon 14 to DDX10 exon 7 and a new in-frame fusion transcript between NUP98 exon 15 and DDX10 exon 7, which we termed "type III fusion."
- Published
- 2013
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8. DDX3X-MLLT10 fusion in adults with NOTCH1 positive T-cell acute lymphoblastic leukemia
- Author
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Antonella Vitale, Roberta La Starza, Gianluca Barba, Sabina Chiaretti, Valentina Pierini, Lucia Brandimarte, Luigiana Luciano, Giorgina Specchia, Jan Cools, Antonella Bardi, Caterina Matteucci, Danika Di Giacomo, Cristina Mecucci, Loredana Elia, and Valentina Gianfelici
- Subjects
Adult ,DEAD-box RNA Helicases ,Oncogene Proteins, Fusion ,Lymphoblastic Leukemia ,T cell ,Chromosome ,Hematology ,Biology ,Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma ,PICALM ,medicine.anatomical_structure ,Cancer research ,medicine ,Humans ,Receptor, Notch1 ,Online Only Articles ,DDX3X ,Gene ,Transcription Factors - Abstract
MLLT10 (also known as AF10 ), at chromosome 10 band p12, is emerging as a promiscuous gene. Six partners have been reported to date: PICALM(CALM )/11q14, MLL /11q23, NAP1L1 /12q21, HNRNPH1 /5q35, DDX3X /Xp11.3 and NUP98 /11p15.[1][1],[2][2] All fusions retain the MLLT10 octapeptide motif-leucine
- Published
- 2014
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9. The GNAS1 gene in myelodysplastic syndromes (MDS)
- Author
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Barbara Crescenzi, Tiziana Pierini, Danika Di Giacomo, Nicoletta Testoni, Anair Graciela Lema Fernandez, Lucia Brandimarte, Caterina Matteucci, Cristina Mecucci, Di Giacomo, D., Lema Fernandez, A.G., Pierini, T., Crescenzi, B., Brandimarte, L., Matteucci, C., Testoni, N., and Mecucci, C.
- Subjects
Male ,Cancer Research ,del(20q)/20q− ,Myelodysplastic Syndrome ,Chromosomes, Human, Pair 20 ,Biology ,Long arm ,hemic and lymphatic diseases ,GNAS complex locus ,medicine ,MDS ,Chromogranins ,GTP-Binding Protein alpha Subunits, Gs ,Humans ,Gene ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,Aged ,Genetics ,Myelodysplastic syndromes ,Karyotype ,Hematology ,Gene deletion ,medicine.disease ,Activating mutation ,Oncology ,GNAS1 ,GTP-Binding Protein alpha Subunits, G ,Myelodysplastic Syndromes ,Haplo-insufficiency ,Mutation ,biology.protein ,Female ,Chromosome 20 ,Gene Deletion ,Human - Abstract
GNAS1 gene is located at the long arm of chromosome 20 (q13.32). GNAS1 gene deletion has never been investigated in MDS. A GNAS1 activating mutation (R201) was recently found in MDS. We applied FISH and DHPLC plus sequencing to investigate GNAS1 gene in MDS cases with and without del(20q) at karyotype.
- Published
- 2014
10. A PDGFRB-positive acute myeloid malignancy with a new t(5;12)(q33;p13.3) involving the ERC1 gene
- Author
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Elvira Gerbino, Giovanna Meloni, Robert Foa, Lucia Brandimarte, Elena Belloni, Silvia Maria Trisolini, P. G. Pelicci, Valentina Pierini, Barbara Crescenzi, M F Martelli, R La Starza, Christina Mecucci, Mauro Nanni, M.Z. Limongi, Cinzia Tapinassi, and Paolo Gorello
- Subjects
Myeloid Malignancy ,endocrine system ,stomatognathic diseases ,Cancer Research ,endocrine system diseases ,Oncology ,mental disorders ,Immunology ,PDGFRB ,Hematology ,Biology ,Gene - Abstract
A PDGFRB -positive acute myeloid malignancy with a new t(5;12)(q33;p13.3) involving the ERC1 gene
- Published
- 2007
- Full Text
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11. New MLLT10 gene recombinations in pediatric T-acute lymphoblastic leukemia
- Author
-
Marco Giordan, Filomena Nozza, Danika Di Giacomo, Chiara Borga, Geertruy te Kronnie, Cristina Mecucci, Valentina Pierini, Roberta La Starza, Paolo Gorello, Giovanni Cazzaniga, Lucia Brandimarte, Brandimarte, L, Pierini, V, Di Giacomo, D, Borga, C, Nozza, F, Gorello, P, Giordan, M, Cazzaniga, G, Te Kronnie, G, La Starza, R, and Mecucci, C
- Subjects
Oncogene Proteins, Fusion ,Transcription Factor ,Lymphoblastic Leukemia ,Immunology ,Chromosomal translocation ,Biology ,Biochemistry ,Deep sequencing ,Translocation, Genetic ,PICALM ,Transcriptome ,T Acute Lymphoblastic Leukemia ,DEAD-box RNA Helicase ,DEAD-box RNA Helicases ,Humans ,Child ,Gene ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction ,Cell Biology ,Hematology ,Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma ,Gene expression profiling ,Cancer research ,Human ,Transcription Factors - Abstract
The MLLT10 gene, located at 10p13, is a known partner of MLL and PICALM in specific leukemic fusions generated from recurrent 11q23 and 11q14 chromosome translocations. Deep sequencing recently identified NAP1L1/12q21 as another MLLT10 partner in T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). In pediatric T-ALL, we have identified 2 RNA processing genes, that is, HNRNPH1/5q35 and DDX3X/Xp11.3 as new MLLT10 fusion partners. Gene expression profile signatures of the HNRNPH1- and DDX3X-MLLT10 fusions placed them in the HOXA subgroup. Remarkably, they were highly similar only to PICALM-MLLT10-positive cases. The present study showed MLLT10 promiscuity in pediatric T-ALL and identified a specific MLLT10 signature within the HOXA subgroup.
- Published
- 2013
12. Role of BCL2L10 methylation and TET2 mutations in higher risk myelodysplastic syndromes treated with 5-azacytidine
- Author
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G. Fioritoni, Carlo Finelli, Santini, Lucia Brandimarte, Mariangela Greco, Caterina Matteucci, Pellegrino Musto, Maria Teresa Voso, Christina Mecucci, Alfonso Piciocchi, Stefan Hohaus, Giuseppe Leone, Emanuele Angelucci, Marco Vignetti, Marianna Criscuolo, Emiliano Fabiani, Enrico Pogliani, Luana Fianchi, Voso, M, Fabiani, E, Piciocchi, A, Matteucci, C, Brandimarte, L, Finelli, C, Pogliani, E, Angelucci, E, Fioritoni, G, Musto, P, Greco, C, Criscuolo, M, Fianchi, L, Vignetti, M, Santini, V, Hohaus, S, Mecucci, C, and Leone, G
- Subjects
Male ,Cancer Research ,Antimetabolites ,BCL2L10 ,TET2 ,5-azacytidine ,myelodysplastic syndromes ,medicine.disease_cause ,Retrospective Studie ,MED/15 - MALATTIE DEL SANGUE ,Risk Factors ,Proto-Oncogene Proteins ,GeneralLiterature_REFERENCE(e.g.,dictionaries,encyclopedias,glossaries) ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Proto-Oncogene Protein ,Mutation ,Hematology ,Methylation ,Middle Aged ,Prognosis ,Antineoplastic ,DNA-Binding Proteins ,Survival Rate ,Oncology ,Proto-Oncogene Proteins c-bcl-2 ,DNA methylation ,Azacitidine ,Female ,Human ,medicine.drug ,Adult ,Antimetabolites, Antineoplastic ,Prognosi ,DNA-Binding Protein ,Biology ,Dioxygenases ,medicine ,Humans ,Survival rate ,Aged ,Myelodysplastic Syndromes ,Retrospective Studies ,DNA Methylation ,Risk Factor ,Myelodysplastic syndromes ,medicine.disease ,Immunology ,Cancer research ,Settore MED/15 - Malattie del Sangue - Abstract
Role of BCL2L10 methylation and TET2 mutations in higher risk myelodysplastic syndromes treated with 5-Azacytidine
- Published
- 2011
13. FISH analysis reveals frequent co-occurrence of 4q24/TET2 and 5q and/or 7q deletions
- Author
-
Caterina Matteucci, Clelia Tiziana Storlazzi, Antonio Pierini, Nicoletta Testoni, Pellegrino Musto, Valentina Gianfelici, Roberta La Starza, Valeria Nofrini, Gianluca Barba, Paolo Gorello, Stefania Paolini, Barbara Crescenzi, Cristina Mecucci, Lucia Brandimarte, Valentina Pierini, Laura Berchicci, La Starza R., Crescenzi B., Nofrini V., Barba G., Matteucci C., Brandimarte L., Pierini V., Testoni N., Musto P., Paolini S., Gianfelici V., Storlazzi C.T., Pierini A., Berchicci L., Gorello P., and Mecucci C.
- Subjects
Male ,Cancer Research ,Pathology ,medicine.medical_specialty ,Myeloid ,Karyotypic abnormality ,Biology ,Dioxygenases ,Mutation Rate ,Proto-Oncogene Proteins ,medicine ,Humans ,Del(4)(q24) ,Child ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,Aged ,Aged, 80 and over ,Co-occurrence ,Fish analysis ,Hematology ,TET2 gene, 5q− ,Middle Aged ,DNA-Binding Proteins ,Haematopoiesis ,Exact test ,medicine.anatomical_structure ,Oncology ,Data Interpretation, Statistical ,Hematologic Neoplasms ,Karyotyping ,%22">Fish ,Chromosomes, Human, Pair 5 ,Female ,Chromosome Deletion ,Chromosomes, Human, Pair 4 ,Chromosomes, Human, Pair 7 - Abstract
We investigated TET2 deletion in 418 patients with hematological malignancies. Overall interphase FISH detected complete or partial TET2 monoallelic deletion (TET2del) in 20/418 cases (4.7%). TET2del was very rare in lymphoid malignancies (1/242 cases; 0.4%). Among 19 positive myeloid malignancies TET2del was associated with a 4q24 karyotypic abnormality in 18 cases. In AML, TET2del occurred in CD34-positive hematopoietic precursors and preceded established genomic abnormalities, such as 5q− and −7/7q−, which were the most frequent associated changes (Fisher's exact test P = 0.000).
- Published
- 2011
14. Combined interphase fluorescence in situ hybridization elucidates the genetic heterogeneity of T-cell acute lymphoblastic leukemia in adults
- Author
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Valentina Pierini, Barbara Crescenzi, Lucia Brandimarte, Antonella Vitale, Gianluca Barba, Loredana Elia, Sara Grammatico, Antonella Bardi, Sabina Chiaretti, Roberta La Starza, Emanuela Varasano, Monica Messina, Paolo Gorello, Caterina Matteucci, Robin Foà, Cristina Mecucci, Anna Guarini, Marco Mancini, and Massimo F. Martelli
- Subjects
Adult ,Male ,Adolescent ,ci-fish ,genomic rearrangements ,t-all ,In situ hybridization ,Biology ,Genetic Heterogeneity ,Young Adult ,Immunophenotyping ,hemic and lymphatic diseases ,Gene duplication ,medicine ,Humans ,Leukemia-Lymphoma, Adult T-Cell ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,Comparative Genomic Hybridization ,medicine.diagnostic_test ,Genetic heterogeneity ,Gene Expression Profiling ,Age Factors ,Hematology ,Gene rearrangement ,Middle Aged ,Molecular biology ,Gene expression profiling ,Mutation ,Original Article ,Female ,Fluorescence in situ hybridization ,Comparative genomic hybridization - Abstract
Background Molecular lesions in T-cell acute lymphoblastic leukemias affect regulators of cell cycle, proliferation, differentiation, survival and apoptosis in multi-step pathogenic pathways. Full genetic characterization is needed to identify events concurring in the development of these leukemias.Design and Methods We designed a combined interphase fluorescence in situ hybridization strategy to study 25 oncogenes/tumor suppressor genes in T-cell acute lymphoblastic leukemias and applied it in 23 adult patients for whom immunophenotyping, karyotyping, molecular studies, and gene expression profiling data were available. The results were confirmed and integrated with those of multiplex-polymerase chain reaction analysis and gene expression profiling in another 129 adults with T-cell acute lymphoblastic leukemias.Results The combined hybridization was abnormal in 21/23 patients (91%), and revealed multiple genomic changes in 13 (56%). It found abnormalities known to be associated with T-cell acute lymphoblastic leukemias, i.e. CDKN2A-B/9p21 and GRIK2/6q16 deletions, TCR and TLX3 rearrangements, SIL-TAL1, CALM-AF10, MLL-translocations, del(17)(q12)/NF1 and other cryptic genomic imbalances, i.e. 9q34, 11p, 12p, and 17q11 duplication, del(5)(q35), del(7)(q34), del(9)(q34), del(12)(p13), and del(14)(q11). It revealed new cytogenetic mechanisms for TCRB-driven oncogene activation and C-MYB duplication. In two cases with cryptic del(9)(q34), fluorescence in situ hybridization and reverse transcriptase polymerase chain reaction detected the TAF_INUP214 fusion and gene expression profiling identified a signature characterized by HOXA and NUP214 upregulation and TAF_I, FNBP1, C9orf78, and USP20 down-regulation. Multiplex-polymerase chain reaction analysis and gene expression profiling of 129 further cases found five additional cases of TAF_I-NUP214-positive T-cell acute lymphoblastic leukemia.Conclusions Our combined interphase fluorescence in situ hybridization strategy greatly improved the detection of genetic abnormalities in adult T-cell acute lymphoblastic leukemias. It identified new tumor suppressor genes/oncogenes involved in leukemogenesis and highlighted concurrent involvement of genes. The estimated incidence of TAF_I-NUP214, a new recurrent fusion in adult T-cell acute lymphoblastic leukemias, was 4.6% (7/152).
- Published
- 2010
15. A NUP98-positive acute myeloid leukemia with a t(11;12)(p15;q13) without HOXC cluster gene involvement
- Author
-
Massimo F. Martelli, Barbara Crescenzi, Roberta La Starza, Valeria Nofrini, Laura Berchicci, Cristina Mecucci, Donatella Beacci, Lucia Brandimarte, Valentina Pierini, Caterina Matteucci, Paolo Gorello, Roberto Rosati, and Silvia Romoli
- Subjects
Adult ,Cancer Research ,Myeloid ,In situ hybridization ,Biology ,Translocation, Genetic ,Genetics ,medicine ,Humans ,Molecular Biology ,Gene ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,Chromosomes, Human, Pair 12 ,medicine.diagnostic_test ,Chromosomes, Human, Pair 11 ,Genes, Homeobox ,Myeloid leukemia ,Adult Acute Myeloid Leukemia ,Retinoic acid receptor gamma ,medicine.disease ,Molecular biology ,Nuclear Pore Complex Proteins ,Leukemia ,Leukemia, Myeloid, Acute ,medicine.anatomical_structure ,Multigene Family ,Female ,Fluorescence in situ hybridization - Abstract
We report a case of adult acute myeloid leukemia with a new t(11;12)(p15;q13) underlying a NUP98 rearrangement without HOXC cluster gene involvement. We designed a specific double-color double-fusion FISH assay to discriminate between this t(11;12)(p15;q13) and those producing NUP98-HOXC11 or NUP98-HOXC13. Our fluorescence in situ hybridization (FISH) showed that putative candidate partners mapping 600 kilobases centromeric to HOXC were RARG (retinoic acid receptor gamma), MFSD5 (major facilitator superfamily domain containing 5), and ESPL1 (extra spindle pole bodies homolog 1). It is noteworthy that so far only ESPL1 has been implicated in human cancers. This FISH assay is useful for diagnostic screening of NUP98-positive leukemias.
- Published
- 2009
16. Totipotent stem cells bearing del(20q) maintain multipotential differentiation in Shwachman Diamond syndrome
- Author
-
Constantina Sambani, Valeria Nofrini, Barbara Crescenzi, Caterina Matteucci, Valentina Pierini, Lucia Brandimarte, Franco Aversa, Agapi Parcharidou, Massimo F. Martelli, Roberta La Starza, and Cristina Mecucci
- Subjects
Male ,Pathology ,medicine.medical_specialty ,Gene mutation ,Biology ,Immunophenotyping ,hemic and lymphatic diseases ,medicine ,Humans ,Interphase ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,medicine.diagnostic_test ,Bone marrow failure ,Anemia, Aplastic ,Infant ,Cell Differentiation ,Syndrome ,Hematology ,SBDS ,medicine.disease ,Molecular biology ,Haematopoiesis ,medicine.anatomical_structure ,Child, Preschool ,Stem cell ,Totipotent Stem Cells ,Myelocyte ,Gene Deletion ,Follow-Up Studies ,Fluorescence in situ hybridization - Abstract
SBDS/7q11 gene mutations underlie the congenital Shwachman Diamond syndrome (SDS), characterized by bone marrow failure and high risk of haematological malignancies. In two cases of SDS with bone marrow failure and isolated del(20q) interphase fluorescence in situ hybridization (I-FISH) found no abnormalities in FHIT/3p14.2, IKZF1/7p13, D7S486/7q31, PTEN/10q23.3, WT1/11p13, ATM/11q23, D13S25/13q14, TP53/17p13, NF1/17q11, SMAD2/18q21, RUNX1/21q22. Fluorescence immunophenotype combined with I-FISH found del(20q) in a totipotent haematopoietic stem cell (CD34(+), CD133(+)) and downstream myelocyte (CD33(+), CD14(+), CD13(+)), erythrocyte (Glycophorin A(+)) and lymphocyte lineages (CD19(+), CD20(+), CD3(+), CD7(+)). These findings and clinical follow-ups confirm the benign course of SDS with isolated del(20q).
- Published
- 2009
17. t(3;11)(q12;p15)/NUP98-LOC348801 fusion transcript in acute myeloid leukemia
- Author
-
Roberto Rosati, Massimo F. Martelli, Loredana Bury, Cristina Mecucci, Iwona Wlodarska, Paolo Gorello, Valentina Pierini, Roberta La Starza, Peter Vandenberghe, and Lucia Brandimarte
- Subjects
Adult ,Male ,medicine.medical_specialty ,Transcription, Genetic ,Recombinant Fusion Proteins ,Molecular Sequence Data ,Chromosomal translocation ,Biology ,Exon ,medicine ,Humans ,Amino Acid Sequence ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,medicine.diagnostic_test ,Base Sequence ,Cytogenetics ,Myeloid leukemia ,Hematology ,medicine.disease ,Molecular biology ,Nuclear Pore Complex Proteins ,Leukemia ,Leukemia, Myeloid, Acute ,Chromosome 3 ,Fusion transcript ,Cancer research ,Chromosomes, Human, Pair 3 ,Fluorescence in situ hybridization - Abstract
In a case of acute myeloid leukemia we report molecular cytogenetic findings of a t(3;11)(q12;p15), characterized as a new NUP98 translocation rearranging with LOC348801 at chromosome 3. NUP98 involvement was detected by fluorescence in situ hybridization. 3'-RACE-PCR showed nucleotide 1718 (exon 13) of NUP98 was fused in-frame with nucleotide 1248 (exon 2) of LOC348801. RT-PCR and cloning experiments detected two in-frame spliced NUP98-LOC348801 transcripts and the reciprocal LOC348801-NUP98. A highly specific double-color double-fusion FISH assay reliably detects NUP98-LOC348801.
- Published
- 2008
18. Comparative genomic hybridization identifies 17q11.2~q12 duplication as an early event in cutaneous T-cell lymphomas
- Author
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Massimo F. Martelli, Emanuela Varasano, Caterina Matteucci, Giampiero Girolomoni, Lucia Brandimarte, Cristina Mecucci, and Gianluca Barba
- Subjects
Genetics ,Cancer Research ,Mycosis fungoides ,T cell ,Whole genome duplication ,Chromosome ,Biology ,medicine.disease ,Chromosome 17 (human) ,medicine.anatomical_structure ,Gene duplication ,medicine ,Molecular Biology ,Gene ,Comparative genomic hybridization - Abstract
Mycosis fungoides (MF) and Sezary syndrome (SS) are primary cutaneous T-cell lymphomas (CTCL), a heterogeneous group of extranodal non-Hodgkin lymphomas. In the three cases of MF and four of SS studied, comparative genomic hybridization detected chromosomal imbalances in all SS cases and in one MF case. In all five abnormal cases, the long arm of chromosome 17 was completely or partially duplicated; in three of these five cases, it was the sole genomic event. Notably, a minimal common duplicated region at 17q11.2∼q12, corresponded to the mapping of HER2/neu and STAT family genes. The only recurrent loss involved chromosome 10, with deletion of the entire long arm in one case and deletion of band 10q23 in another. Sporadic imbalances included gains at chromosome arms 1q, 2q, 7p, 7q, and 12p. Genomic duplication at 17q11.2∼q12 emerged as a primary karyotypic abnormality common to both MF and SS, which suggests that this is an early clonal event.
- Published
- 2008
19. A common 93-kb duplicated DNA sequence at 1q21.2 in acute lymphoblastic leukemia and Burkitt lymphoma
- Author
-
Massimo F. Martelli, Roberta La Starza, Maria Grazia Kropp, Valentina Pierini, Paolo Gorello, Barbara Crescenzi, Lucia Brandimarte, Silvia Romoli, Caterina Matteucci, Cristina Mecucci, and Gianluca Barba
- Subjects
clone (Java method) ,Male ,Cancer Research ,Myotubularin ,Chromosomal translocation ,Biology ,Gene Duplication ,Gene duplication ,Genetics ,medicine ,Humans ,Genes, Tumor Suppressor ,Child ,Molecular Biology ,Gene ,In Situ Hybridization, Fluorescence ,Chromosome Aberrations ,medicine.diagnostic_test ,Breakpoint ,Chromosome Mapping ,RNA-Binding Proteins ,Karyotype ,Middle Aged ,Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma ,Molecular biology ,Burkitt Lymphoma ,Chromosomes, Human, Pair 1 ,Child, Preschool ,Karyotyping ,Female ,RNA Splicing Factors ,Fluorescence in situ hybridization - Abstract
In three patients with acute lymphoblastic leukemia (ALL) and in another with Burkitt lymphoma (BL), conventional cytogenetics and fluorescence in situ hybridization (FISH), applied singly or in combination, showed 1q duplication in two cases of ALL with hyperdiploid karyotypes, 1q duplication resulting from an unbalanced translocation in a third case of ALL, and inv dup(1)(q) in a patient with BL. Centromeric or telomeric breakpoints and extension of the 1q duplicons varied in each case. FISH defined a minimal, common duplicated region of 93kb at band 1q21.2 corresponding to clone RP11-212K13. In this region three putative oncogenes or tumor suppressor genes have been mapped: SF3B4 (splicing factor 3b, subunit 4), OTUD7B (OTU domain containing 7B), and MTMR11 (myotubularin related protein 11). For the first time, a minimal common 1q21.2 duplicated sequence has been identified in lymphoid malignancies in a region where putative oncogenes or suppressor genes have been mapped. This finding elucidates the genomic background of ALL and BL with 1q duplication and provides the basis for molecular studies investigating which genes are involved in leukemogenesis or disease progression in these cases.
- Published
- 2006
20. C022 NPM1 monoallelic deletion in a subgroup of MDS/AML with del (5q) or monosomy 5 and complex karyotype
- Author
-
Emanuela Varasano, Daniela Diverio, Lucia Brandimarte, Christina Mecucci, Giovanni Roti, G. Guglielmini, Antonio Pierini, A. Aventin, Barbara Crescenzi, Francesco Arcioni, R. La Starza, and M F Martelli
- Subjects
Genetics ,Cancer Research ,NPM1 ,Oncology ,Monosomy 5 ,Complex Karyotype ,Hematology ,Biology - Published
- 2007
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21. C018 Del (20q), a benign clonal abnormality, involves totipotent stem cells in Shwachman Diamond Syndrome
- Author
-
Lucia Brandimarte, Christina Mecucci, Constantina Sambani, Agapi Parcharidou, R. La Starza, Caterina Matteucci, Barbara Crescenzi, and M F Martelli
- Subjects
Cancer Research ,Shwachman–Diamond syndrome ,Pathology ,medicine.medical_specialty ,Totipotent stem cell ,Oncology ,medicine ,Hematology ,Biology ,Abnormality ,medicine.disease - Published
- 2007
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22. TERT Gene Promoter Mutations In Myelodysplastic Syndromes (MDS)
- Author
-
Antonella Sgura, Tamara Iannotti, Gianluca Barba, Caterina Matteucci, Valeria Di Battista, Francesco Berardinelli, Filomena Nozza, Cristina Mecucci, Lucia Brandimarte, Valeria Nofrini, Matteucci, C, Iannotti, T, Brandimarte, L, Nofrini, V, Barba, G, Sgura, Antonella, Berardinelli, Francesco, Nozza, F, Di Battista, V, and Mecucci, C.
- Subjects
Sanger sequencing ,Chromosome 7 (human) ,Point mutation ,Immunology ,Nonsense mutation ,Cell Biology ,Hematology ,Biology ,Compound heterozygosity ,Biochemistry ,Molecular biology ,symbols.namesake ,Germline mutation ,Gene duplication ,symbols ,Missense mutation - Abstract
Mutations at the protein-coding region of TERT gene (chromosome 5p15.33) have been well characterized in patients affected by a constitutional telomere syndrome, including diskeratosis, aplastic anemia and pulmonary fibrosis (Calado RT, Hematology, ASH 2009:338). In rare cases somatic mutations may occur in de novo MDS/AML (Calado RT, Young NS. Blood 2008;111:4446). Mutations involving the regulatory region of TERT gene have been recently identified in a consistent proportion of familial and sporadic melanoma and in a subset of tumors originating from tissues with low rate of self-renewal (glioblastoma, liposarcoma, oligodendroglioma bladder cancer, upper urinary tract cancer). These mutations create new binding motifs for Ets/TCF transcription factors, thus increasing TERT gene transcription (Killela PJ et al, PNAS 2013;110:6021; Horn S et al, Science 2013;339:959). As far as we know TERT promoter mutations were never described in MDS. Material and Methods Index Case. A 52 years old woman was selected because of a complex phenotype including abnormal skin pigmentation, familial pulmonary fibrosis, osteoarthritis, and a refractory cytopenia with multilineage dysplasia (RCMD, WHO 2008) with a 47,XX,+8 karyotype. Screening Cases. Mutational analysis was extended to a cohort of 115 patients (72 males; 44 females, median age 69) referred to the Laboratory of Cytogenetics, Hematology Department,University of Perugia, Italy. Cytogenetics was normal in 49 cases (43%). Abnormalities included: isolated del(5q) (seven cases, 6%); del(5q) plus one additional change (three cases, 3%); isolated del(20q) (fourteen cases, 12%); trisomy 8 (five cases, 4%); monosomy 7 (two cases, 2%); -Y (three cases, 3%); del(11q) (two cases, 2%); complex karyotype (twenty-four cases, 21%); other aberrations (six cases, 5%). Genomic DNA was extracted from bone marrow (BM) of all cases and from peripheral blood T lymphocytes of index case using Salting out method. In all cases TERT promoter was screened using PCR based DHPLC assay (Wave system; MD Transgenomic Inc. Omaha, NE). The 274bp amplicon was amplified with forward primer 5'GTCCTGCCCCTTCACCTTC3' and reverse primer 5'AGCACCTCGCGGTAGTGG3' using Robust Start Taq KAPA2G (Biosystems, Woburn, MA). DNA from abnormal elution profiles were re-amplified and sequenced by Sanger method (ABI 3500 Genetic Analyzer, Applied Biosystems). Variations were detected using Finch TV v. 1.4.0. In the index case 23 amplicons encompassing all 16 exons of TERT gene were also screened (NC_000005.9). Mutations cloning was carried out after RNA extraction (Trizol, Invitrogen, Life Technologies, Paisley, UK), reverse transcription (ThermoscriptTM RT-PCR System, Invitrogen) and amplification (TERT_2CF (5'-CAGCGCTACTGGCAAATGCG-3' Ta-61,4°C; and TERT_2543R (5'-GGCACTGGACGTAGGACTTG-3' Ta-61,4°C). PCR products were sub-cloned into pGEM-T easy vector (Promega, Madison, WI, USA) and sequenced. Results Index Case. Patient was a compound heterozygous for two germline variations: a nonsense mutation c.1209C>A p.C403* (exon 2) and a missense mutation c.2455C>T p.R819C (exon 8). A putative somatic A>C transition 57 bp before the ATG start codon was detected only in BM cells (Table). Screening Cases. DHPLC analysis showed three patients (2.6%) with a two-peak elution profile. Sequencing revealed a 10 bp duplication (c.1-110_1-101) in case 2; a c.1-124 C>T point mutation in case 3; a point mutation c.1-78 C>T in case 4 (Table). Comment We showed that TERT gene promoter variations are recurrent events in 2.6% of MDS patients. Only low/int1 risk MDS (IPSS) were affected in this series. The c.1-57A>C, previously reported as a germline activating variation in familial melanoma (Horn S et al, Science 2013;339:959), was likely a somatic mutation in our index case, thus supporting its role in clonal MDS proliferation. We first found the melanoma activating c.1-124 C>T point mutation (Huang FW et al, Science 2013;339:957; Killela PJ et al, PNAS 2013;110:6021) in a MDS with isolated del(5q). The new variation of our case n.4 does not appear to introduce a new transcription factor binding site (http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html), whereas the 10bp duplication of case 2 indicates an hypothetical binding site for Ikaros. Further results from ongoing functional studies in these cases will be presented. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.
- Published
- 2013
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23. P-039 Insights on GNAS1 gene involvement in MDS
- Author
-
Barbara Crescenzi, Tiziana Pierini, Gianluca Barba, Caterina Matteucci, Valentina Pierini, D. Di Giacomo, A.G. Lema Fernandez, Lucia Brandimarte, and Christina Mecucci
- Subjects
Genetics ,Cancer Research ,Oncology ,biology ,GNAS complex locus ,biology.protein ,Hematology ,Gene - Published
- 2013
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24. MLLT10 Gene Promiscuity Unravels Involvement of RNA Processing Genes in Pediatric T-Acute Lymphoblastic Leukemia
- Author
-
Marco Giordan, Valentina Pierini, Paolo Gorello, Geertruy te Kronnie, Lucia Brandimarte, Danika Di Giacomo, Roberta La Starza, Caterina Matteucci, Giovanni Cazzaniga, and Cristina Mecucci
- Subjects
Genetics ,medicine.medical_specialty ,medicine.diagnostic_test ,Immunology ,Cytogenetics ,Intron ,Cell Biology ,Hematology ,Biology ,Biochemistry ,Molecular biology ,Gene expression profiling ,Fusion gene ,Exon ,medicine ,Primer (molecular biology) ,Gene ,Fluorescence in situ hybridization - Abstract
Abstract 1431 Background T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia (T-ALL) affects about 15% of children with ALL. MLLT10 at 10p12 encodes for a transcription factor and is involved in leukemogenic fusions with PICALM or MLL in about 10% of childhood T-ALL with overexpression of HOXA cluster genes. In case of gene fusion MLLT10 retains the “octapeptide motif-leucine zipper” (OM-LZ) domain that appeared to be essential for leukemic transformation in mouse models (Deshpande AJ et al. Leukemia 2011) as it interacted with critical components of the chromatin modifying machinery, such as H3K79 methyltransferase hDOT1L (Okada Y et al. Cell 2005). Recently, in a case of early T-cell precursor ALL, NAP1L1 at 12q21 was identified by whole-genome sequencing as a new MLLT10 fusion partner gene (Zhang J et al. Nature 2012). We identified two new fusion transcripts involving MLLT10 in 2 cases of pediatric T-ALL suggesting MLLT10 is a promiscuous fusion partner gene in T-ALL. Aim Characterization of new MLLT10 fusion transcripts in 2 pediatric cases of T-ALL. Methods Total RNAs were extracted from cryopreserved bone marrow cells and retrotranscribed with MLLT10 specific reverse primer using 5'-RACE kit (Invitrogen). cDNAs were amplified in nested PCR using AAP/AUAP (Abridged Anchor Primer, Abridged Universal Amplification Primer, Invitrogen) as forward and MLLT10 specific primers as reverse. To confirm fusion transcripts we performed RT-PCR experiments using Thermoscript RT-PCR System (Invitrogen). cDNAs were amplified in nested PCR using HNRNPH1 and DDX3X specific primers as forward in patient 1 and 2 respectively and MLLT10 specific primers as reverse in both samples. PCR products were subcloned into pGEM-T easy vector (Promega) and sequenced. Whole genome analysis was performed applying Combined-Interphase Fluorescence In Situ Hybridization (CI-FISH) for 32 candidate genes as previously described (Gorello P et al. Haematologica 2010); Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) were performed following manifacturer's instructions (Affymetrix); Gene Expression Profiling (GEP) was applied to investigate the hypothesis that both new MLLT10 fusion genes shared leukemogenic properties with other MLLT10 fusions, particularly PICALM-MLLT10. Results In patient 1 the karyotype was 46,XX,inv(10)(p12q?)/46,XX. CI-FISH on bone marrow nuclei showed MLLT10 rearrangements (55%) and IKZF1 deletions (10%). The 10q disruption was located at 10q25.3 in a region of about 12 kb flanked by fosmid G248P87999G12, retained on inv(10), and RP11–411P18 translocated to chromosome 5. SNPs analysis was normal for copy number and LOH profile. In patient 2 cytogenetics failed. CI-FISH revealed a 9p deletion, with loss of PAX5 (9p13), CDKN2A/B (9p21) and JAK2 (9p24) in about 75% of interphase nuclei. MLLT10 break apart was abnormal in about 60% of nuclei, with break within RP11–418C1 spanning MLLT10 exons 1–3. SNPs analysis showed a 47,5Mb loss at 9p24.3-p11.2 and a 33,51Mb gain at 17q21.32-q25.3. 5'-RACE-PCR showed HNRNPH1 in patient 1 and DDX3X in patient 2 as two new MLLT10 partner genes in T-ALL. RT-PCR, cloning and sequencing confirmed these results. We found 2 in frame splicing variants in both cases: HNRNPH1 exon 11 (nt.1324)-MLLT10 exon 15 (nt. 2097) and HNRNPH1 intron 10 (nt. 6701)-MLLT10 exon 15 (nt. 2097) in patient 1; DDX3X exon 2 (nt. 958)-MLLT10 exon 3 (nt. 510) and DDX3X exon 1 (nt. 900)-MLLT10 exon 4 (nt. 590) in patient 2 (nucleotide numbers refer to GenBank accessions NM_005520.2 and NC_000005.9 for HNRNPH1, NM_001356.3 for DDX3X and NM_004641.3 for MLLT10). GEP showed that the new MLLT10 fusions were similar to 4 cases with PICALM-MLLT10 fusion but different from 5 other T-ALL, i.e. 2 with MLL translocations, 2 with inv(7)(p15;q34)/TCRB-HOXA and 1 with SET-NUP214 fusion, with a HOXA signature. Conclusions These two cases add new insights in multiple genomic recombinations affecting MLLT10 in pediatric T-ALL. Both new partner genes, i.e. HNRNPH1 and DDX3X, are involved in RNA processing and have not been reported to be involved in any genomic specific translocations, so far. The presence of the MLLT10 OM-LZ domain in both new fusions as well as the GEP of leukemic cells suggest that these MLLT10 recombinations activate the same leukemogenic pathways as identified for PICALM-MLLT10 and suggest promiscuity of MLLT10 in recombinations with leukemogenic genes. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.
- Published
- 2012
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25. 322 TET2 mutations, methylation profile and prognosis in higher risk myelodysplastic syndromes (MDS) treated with 5-azacytidine and valproic acid
- Author
-
Caterina Matteucci, Carlo Finelli, Enrico Pogliani, Francesco Buccisano, Giuseppe Leone, Luca Maurillo, Emiliano Fabiani, Emanuele Angelucci, Alfonso Piciocchi, Valeria Santini, Stefan Hohaus, Pellegrino Musto, Christina Mecucci, M.T. Voso, Lucia Brandimarte, and Marco Vignetti
- Subjects
Cancer Research ,Valproic Acid ,Oncology ,business.industry ,Myelodysplastic syndromes ,medicine ,Cancer research ,Hematology ,Methylation ,medicine.disease ,business ,medicine.drug - Published
- 2011
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26. 252 NPM1 haploinsufficiency in human myeloid diseases with non-isolated −5/5q
- Author
-
Pellegrino Musto, Christina Mecucci, Antonella Santucci, Barbara Crescenzi, Valentina Pierini, R. La Starza, Laura Berchicci, Constantina Sambani, Caterina Matteucci, A. Aventin, Lucia Brandimarte, Paolo Gorello, Roberto Rosati, Valeria Nofrini, and Francesco Arcioni
- Subjects
Cancer Research ,NPM1 ,Myeloid ,medicine.anatomical_structure ,Oncology ,business.industry ,Cancer research ,medicine ,Hematology ,Haploinsufficiency ,business - Published
- 2011
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27. P074 Molecular cytogenetic delineation of del (4q) in myelodysplastic syndromes with peripheral blood monocytosis
- Author
-
M F Martelli, Barbara Crescenzi, Gianluca Barba, Caterina Matteucci, M. Cei, R. La Starza, Christina Mecucci, Lucia Brandimarte, and Paolo Gorello
- Subjects
Cancer Research ,Pathology ,medicine.medical_specialty ,Oncology ,Monocytosis ,business.industry ,Myelodysplastic syndromes ,Medicine ,Hematology ,business ,medicine.disease ,Peripheral blood - Published
- 2007
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28. C010 Commercially available Array-CGH BAC platforms: pitfalls in interpreting results
- Author
-
Lucia Brandimarte, Valentina Pierini, R. La Starza, Gianluca Barba, Christina Mecucci, and Caterina Matteucci
- Subjects
Cancer Research ,Oncology ,Hematology - Published
- 2007
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29. NPM1 deletion is associated with gross chromosomal rearrangements in leukemia
- Author
-
Roberto Rosati, Lucia Brandimarte, Caterina Matteucci, Massimo F. Martelli, Francesco Arcioni, Cristina Mecucci, Roberta La Starza, Constantina Sambani, Barbara Crescenzi, Laura Berchicci, Giuseppe Saglio, Enrico Gottardi, Anna Aventin, Paolo Gorello, Antonella Santucci, Valentina Pierini, Brunangelo Falini, and Valeria Nofrini
- Subjects
Adult ,Male ,NPM1 ,Adolescent ,Molecular Sequence Data ,lcsh:Medicine ,Chromosomal translocation ,Biology ,Translocation, Genetic ,Young Adult ,hemic and lymphatic diseases ,medicine ,Humans ,Child ,Oncology/Hematological Malignancies ,lcsh:Science ,Genetics and Genomics/Cancer Genetics ,Aged ,Aged, 80 and over ,Multidisciplinary ,ABL ,Base Sequence ,lcsh:R ,Hematology/Acute Myeloid Leukemia ,Nuclear Proteins ,Chromosome ,Adult Acute Myeloid Leukemia ,Karyotype ,Hematology/Myelodysplastic Syndrome and Bone Marrow Failure ,Middle Aged ,medicine.disease ,Molecular biology ,Lymphoma ,Genetics and Genomics/Chromosome Biology ,Leukemia ,Leukemia, Myeloid ,Chromosomes, Human, Pair 5 ,Female ,lcsh:Q ,Chromosome Deletion ,Nucleophosmin ,Gene Deletion ,Research Article - Abstract
Background: NPM1 gene at chromosome 5q35 is involved in recurrent translocations in leukemia and lymphoma. It also undergoes mutations in 60% of adult acute myeloid leukemia (AML) cases with normal karyotype. The incidence and significance of NPM1 deletion in human leukemia have not been elucidated. Methodology and Principal Findings: Bone marrow samples from 145 patients with myelodysplastic syndromes (MDS) and AML were included in this study. Cytogenetically 43 cases had isolated 5q-, 84 cases had 5q- plus other changes and 18 cases had complex karyotype without 5q deletion. FISH and direct sequencing investigated the NPM1 gene. NPM1 deletion was an uncommon event in the "5q- syndrome'' but occurred in over 40% of cases with high risk MDS/AML with complex karyotypes and 5q loss. It originated from large 5q chromosome deletions. Simultaneous exon 12 mutations were never found. NPM1 gene status was related to the pattern of complex cytogenetic aberrations. NPM1 haploinsufficiency was significantly associated with monosomies (p
30. Structural and non-structural techniques for the restoration of tropical streams: effects on aquatic metabolism and nutrient retention
- Author
-
Wesley Aparecido Saltarelli, Davi Gasparini Fernandes Cunha, Ana Lucia Brandimarte, Danielli Cristina Granado Romero, Ricardo Hideo Taniwaki, and Virginia Sanches Uieda
- Abstract
A estrutura e o funcionamento de rios e riachos têm sido afetados por estressores múltiplos associados às atividades antrópicas. Embora haja uma série de técnicas para a recuperação de ambientes aquáticos degradados, ainda pouco se sabe sobre a influência de tais estratégias sobre indicadores funcionais dos cursos de água, especialmente em regiões tropicais. O objetivo da presente pesquisa foi avaliar o efeito de medidas não estruturais e estruturais para recuperação de riachos tropicais sobre o metabolismo aquático e a retenção de nitrogênio (N) e fósforo (P). Na primeira etapa da pesquisa, foi desenvolvida uma revisão da literatura a respeito das técnicas empregadas mundialmente para a recuperação de riachos. Na segunda, foram estudados dez riachos em São Paulo e Minas Gerais, visando à obtenção de gradiente do sombreamento gerado pela mata ciliar, cuja recuperação é considerada uma técnica não estrutural. Na terceira, foram investigados os efeitos das técnicas estruturais a partir da intervenção experimental no tempo de residência da água e em outros atributos de um trecho de um riacho retificado em São Paulo. Além disso, em um rio no Espírito Santo, foram avaliados três trechos: natural, impactado e recuperado com uma técnica estrutural (aplicação de troncos/galhos de eucalipto). Nas duas últimas etapas, foi estimado o metabolismo (i.e., produção primária bruta, PPB e respiração ecossistêmica, RE) dos cursos de água. Além disso, métricas de retenção de amônio (N-NH4+) e fosfato solúvel reativo (P-PO43-) foram calculadas a partir de experimentos de adição instantânea de nutrientes e posterior modelagem das taxas (Uamb) e velocidades (Vf-amb) de retenção ambiental. A revisão bibliográfica evidenciou que as técnicas aplicadas, em geral, apresentaram efeitos positivos (i.e., aumento das taxas de retenção de nutrientes e do metabolismo ou aproximação dos valores observados em condições de referência). Todos os trechos dos riachos avaliados na segunda etapa apresentaram condições heterotróficas (RE > PPB), com PPB entre GPP), with GPP between
- Published
- 2021
31. Estudo ecológico-sanitário do rio Embu-Mirim (SP): utilização de macroinvertebrados bentônicos como bioindicadores
- Author
-
Luciana Carvalho Bezerra de Menezes, Zuleika Beyruth, Ana Lucia Brandimarte, José Luiz Negrão Mucci, and Gisela Yuka Shimizu
- Abstract
Este trabalho foi desenvolvido no rio Embú-mirim, um dos principais tributários da represa do Guarapiranga (SP). Aspectos da macrofauna bentônica foram discutidos visando caracterizar as condições ecológicas e sanitárias deste rio e utilizar estes organismos como indicadores da qualidade ambiental (água e sedimento). Foram realizadas 4 coletas nos meses de abril, julho e outubro de 1999 e janeiro de 2000, em treze pontos distribuídos ao longo do rio, com o intuito de avaliar a variação sazonal e espacial dos macroinvertebrados. Além da coleta da fauna bentônica, com pegador do tipo Eckman-Birge e tubo de PVC, com posterior lavagem em rede de malha de 250 11m, obteve-se amostras de água e de sedimento para caracterização físico-química do ambiente e coletou-se material para determinação de coliformes totais e fecais. O tratamento dos dados biológicos relativos ao bentos foi realizado através da comparação dos descritores estruturais da comunidade bentônica (densidade, densidade total, índice de diversidade de Shannon-Wiener, índice de riqueza de taxa, uniformidade e abundância relativa) com os resultados das variáveis ambientais. Utilizou-se o teste de correlação não paramétrico de Spearman, Análise de Agrupamento e Análise de Componentes Principais (PCA) para verificar possíveis similaridades entre os pontos amostrados ao longo do rio e quais variáveis ambientais determinaram o padrão de distribuição da comunidade bentônica. Também foram utilizadas como medidas bioindicadoras da qualidade ambiental: a razão O/C (Oligochaeta/Chironomidae) e Tt/Chir (Tanytarsini / Chironomidae), a densidade total e abundância relativa de Oligochaeta, além da metodologia de avaliação da qualidade das águas do \"Biological Monitoring Working Party Score System - BMWP\" adaptado pelo CETEC-MG/Brasil. Os resultados tanto físicos e químicos quanto biológicos demonstraram a nítida divisão do rio em duas partes: uma de maior inclinação e pouco impactada pela ação antrópica (região de cabeceira-pontos 1, 2 e 3) e outra bastante impactada (região de planície pontos 5 à 13), sendo que o ponto 4, já na planície e que não recebe aportes poluentes consideráveis, apresentou condições intermediárias. As variáveis físicas e químicas permitiram constatar que a principal fonte de poluição é o ingresso de efluentes de esgotos domésticos e da indústria de papel e celulose - RIPASA, portanto a poluição orgânica foi o principal impacto determinado neste ambiente. Quanto à utilização dos organismos bentônicos como bioindicadores estes demonstraram ser bastante eficientes na avaliação da qualidade ambiental, responderam de maneira satisfatória às mudanças ocorridas no meio alterando significativamente a composição de sua comunidade, dos pontos pouco impactados pela ação antrópica para os pontos bastante impactados. Todas as métricas utilizadas responderam de maneira satisfatória, com exceção do índice de abundância relativa de Oligochaeta, densidade total de Oligochaeta e BMWP, confirmando a eficácia dos organismos bentônicos como bioindicadores. This research was developed at Embú-Mirim River, one of Guarapiranga reservoir\' s main tributary. Subjects of benthic macroinvertebrates were discussed purposing the characterization of ecological and sanitary conditions and the utilization of these organisms as water quality indicators (water and sediment). Samples were collected in the months of April, June and October of 1999 and January of 2000 in thirteen different sampling sites in the river, purposing evaluate seasonal and spatial variations of the macroinvertebrates. Besides the benthic fauna samples, coIlected with Eckman-birge and a type of core, washed using a mesh of 250!lm, water and sediment samples were also collected for physic and chemistry environmental characterization; there were also collected material to total and faecal coliforms characterization. Biological data treatment related to benthos was made by comparison of benthic community structure (numeric and total densities, Shannon-Wiener diversity, richness, equitativity and relative abundances) with the results of biotic and abiotic variables. Spearman\'s non-parametric correlation, Cluster analysis and Principal Components Analysis: biplots (PCA) was applied to check possible similarities among the samples and wich environmental variables shows the patterns of variation in community structure. For water quality bioindication, were also used the ratio Oligochaeta/Chironomidae and Tanytarsini/Chironomidae, Oligochaeta total density and abundances of Oligochaeta, besides \"Biological Monitoring Working Party Score System - BMWP\", adapted by CETEC-MG / Brazil. Physico, chemical and biological results show a c1ear division in the river in two parts: one less impacted by antropogenic alterations (sampling sites 1, 2 and 3 - upstream ) and other much impacted (sampling sites 5 to 13 - downstream). The sampling site 4, in the downstream, which doesn\'t receive significant poluents enrichment, showed intermediaries conditions. The physical and chemical parameters showed that the principal pollution source is domestic and industrial sewage (paper and cellulose effluents -RlPASA), so the organic pollution was the principal impact determinated in this environment. The benthic organisms confirmed to be a very efficient tool as bioindicators of the water quality, answering satisfactory to the changes in the environment, changing in a expressive way the composition of this community, from the sample sites which suffered slow impact to the sample sites that suffered strong impact. All the metrics applied answered in a satisfactory way, Oligochaeta total density, abundances of Oligochaeta and \"Biological Monitoring Working Party Score System - BMWP was exceptions, confirming the efficiency of benthic macroinvertebrates like bioindicators.
- Published
- 2020
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32. Macroinvertebrados e degradação de detrito foliar em riachos de Mata Atlântica e cerrado: o que esperar das mudanças climáticas?
- Author
-
Bianca de Medeiros Vendramini, Ana Lucia Brandimarte, Irineu Bianchini Junior, José Francisco Gonçalves Júnior, and Virginia Sanches Uieda
- Abstract
O material vegetal alóctone se configura como uma das principais vias energéticas mantenedora do funcionamento de ambientes lóticos, sendo que seu processamento é essencial na ciclagem de nutrientes e envolve diversos organismos. Esse estudo pretendeu verificar a participação de macroinvertebrados aquáticos no processo de degradação de material vegetal ao longo do tempo, bem como acompanhar a colonização deste material em dois riachos subtropicais localizados em biomas distintos: Mata Atlântica e cerrado. Folhas de Croton cf. floribundus (Euphorbiaceae) foram incubadas em litter bags. Avaliou-se a composição da fauna (nos aspectos taxonômico e funcional), o decaimento de massa foliar e a composição química do material ao longo do período de 7, 15, 30, 60 e 90 dias de exposição em dois tratamentos distintos, quanto ao grau de acesso dos macroinvertebrados às folhas. O percentual de perda de massa e as taxas de decaimento foram semelhante nos dois ambientes e entre os tratamentos, o que indica que nessas localidades a influência de macroinvertebrados é inferior à da ação da lixiviação e condicionamento por bactérias e fungos durante o processo de degradação. A dinâmica da composição química dos detritos também seguiu trajetórias similares nos dois ambientes. No entanto, os grupos funcionais dominantes variaram ao longo do tempo em cada uma das situações, assim como a abundância total de organismos. Os resultados demonstram que distinções mais notáveis se relacionam não à velocidade de degradação em cada tipo de bioma, uma vez que as eficiências de processamento foram semelhantes, mas sim à composição da comunidade que utiliza o recurso vegetal como substrato para alimentação e/ou abrigo. Dessa forma, levando em conta o cenário de transição das áreas úmidas de mata a ambientes savânicos, pelo avanço do cerrado, frente a mudanças climáticas globais, a dinâmica de degradação foliar, com base em C. cf. floribundus, se manteria similar nos ambientes lóticos, mas uma possível fragilidade seria a redução da diversidade de famílias de macroinvertebrados aquáticos The allochthonous plant material is one of the main energetic pathways that maintains lotic environments functioning, and its processing is essential on nutrients cycling, involving several organisms. This study aimed to verify the participation of aquatic macroinvertebrates in the decay process of plant material over time, as well follow the colonization of this debris in two subtropical streams located in distinct biomes: Atlantic Forest and cerrado (Brazilian savanna). Leaves of Croton cf. floribundus (Euphorbiaceae) were incubated in litter bags. The fauna composition (in taxonomic and functional aspects), leaf mass decay and chemical composition of the material during the period of 7, 15, 30, 60 and 90 days of exposure in two different treatments, which one with a degree of access to the leaves by macroinvertebrates, were evaluated. The mass loss percentage and decay rates were similar in both environments and between treatments, indicating that the influence of macroinvertebrates is lower than that of leaching and conditioning by bacteria and fungi during the decay process. The dynamics of the chemical composition of the debris also followed similar trajectories in both environments. However, dominant functional groups varied over time in each of the situations, as did the total abundance of organisms. Those results show that the most notable distinctions are related not to the decay rate in each biome, since the processing efficiencies were similar, but to the composition of the community using the vegetal resource as a substrate for food and/or shelter. Thus, taking into account the transition scenario from forest wetlands to savanna environments, due to the advance of the cerrado, in the face of global climatic changes, the dynamics of leaf decay, based on C. cf. floribundus, would remain similar in the lotic environments. However, a possible fragility would be the reduction on aquatic macroinvertebrate families diversity
- Published
- 2018
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33. Análise da gestão dos corpos hídricos urbanos da bacia hidrográfica do Alto Tietê
- Author
-
Lidiane Alonso Paixão dos Anjos, José Luiz Negrão Mucci, Ana Lucia Brandimarte, Leandro Luiz Giatti, and Ricardo de Sousa Moretti
- Abstract
Diante das modificações ocorridas com o crescimento urbano ao longo dos anos e a consequente falta de saneamento básico observada no início deste crescimento, a degradação dos rios e córregos da Região Metropolitana de São Paulo foram devastadoras para a sua qualidade, trazendo desconforto e doenças de veiculação hídrica para a população do entorno. Este projeto tem por objetivo analisar como os corpos dágua que não possuem relevância para o abastecimento e que estão localizados na Bacia do Alto Tietê estão sendo tratados pela legislação e por seus gestores, compilando as ações tomadas que favorecem a despoluição dos mesmos. Desenvolveu-se uma pesquisa qualitativa de estudo de caso, com caráter exploratório a partir de dados fornecidos pelo Comitê de Bacia Hidrográfica do Alto Tietê e dados secundários. Conclui-se que apesar de ser discutido dentro do Comitê, os corpos hídricos inseridos na Região Metropolitana de São Paulo não possuem grande importância, tendo o Comitê assuntos prioritários, como abastecimento, assim como a destinação de recursos indicados e aprovados pelo FEHIDRO e os investimentos da SABESP In the face of the changes that have occurred with urban growth over the years and the consequent lack of basic sanitation observed at the beginning of this growth, the degradation of the rivers and water streams of the São Paulo Metropolitan Area were devastating to its quality, bringing discomfort and waterborne diseases of circulation for the surrounding population. The objective of this project is to analyze how the water bodies among those that do not have relevance for the supply and that are located in the Alto Tietê Watershed are being treated by the legislation and its managers, compiling the actions that were taken to favor the depollution of those specific kind of water body. A qualitative study of a case study was developed, with an exploratory character based on data provided by the Committee of the Alto Tietê Watershed and secondary data. It was concluded that, despite being discussed within the Committee, the water bodies inserted in the São Paulo Metropolitan Region are not of great importance, with the Committee having priority subjects, such as supply, as well as the allocation of resources indicated and approved by FEHIDRO and investments of SABESP
- Published
- 2018
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34. Evaluation of the radioactive effluents from the Mineral Treatment Unit of the Brazilian Nuclear Industries and the Drainage Basin under their influence, with emphasis on the chemical and ecotoxicological characterization
- Author
-
Carla Rolim Ferrari, Heliana de Azevedo Franco do Nascimento, Sueli Ivone Borrely, Ana Lucia Brandimarte, Elen Aquino Perpetuo, and Marcelo Luiz Martins Pompeo
- Abstract
A primeira mineração de urânio do Brasil está localizada nas dependências da Unidade de Tratamento de Minérios das Indústrias Nucleares do Brasil. Atualmente, essa área mineradora encontra-se em fase de descomissionamento e a drenagem ácida de mina constitui o principal passivo ambiental, devido ao volume de efluentes radioativos gerados, os quais após tratamento são lançados na represa das Antas (RA). Os resultados indicaram que amostras do efluente in natura e tratado apresentaram maiores concentrações de espécies químicas, sendo consideradas agudamente tóxicas para os dafinídeos, indicando que que o sistema de tratamento realizado pela mineradora foi impróprio e ineficiente. Valores de dureza extremamente elevados indicaram efeito protetor para os dafinídeos, quando maiores concentrações de metais tais como F-, U, Mn e Al foram registradas. O metal Mn apresentou potencial de causar toxicidade para C. silvestrii, CE50 (5,93 mg L-1). Para U, mudanças no pH nos ensaios de D.magna, estiveram associadas a alterações nas concentrações das espécies potencialmente tóxicas UO22+ e UO2OH+. A espécie nativa C. silvestrii mostrou ser muito mais sensível a U, quando comparada a D. magna, de acordo com a CE50 (0,07 e 0,56 mg L-1, respectivamente). The first uranium mining in Brazil is located on the Ore Treatment Unit of Nuclear Industries of Brazil. Currently, this mining area is in process of decommissioning and the acid mine drainage is the main environmental liability due to the volume of radioactive effluents produced, which after treatment are discharged into the Antas reservoir (AR). The results indicated that samples of the in natura and treated effluent presented higher concentrations of chemical species, being considered acutely toxic to the daphnids, indicating that the treatment carried out by the mining company (UTM/INB) was improper and inefficient. Extremely high hardness values indicated protective effect for the daphnids, when higher concentrations of metals such as F-, U, Mn and Al were recorded. The Mn metal presented potential toxicity for C. silvestrii, EC50 (5.93 mg L-1). For U, changes in pH in the D.magna assays were associated with changes in concentrations of the toxic potentially species UO22+ and UO2OH+. The native species C. silvestrii showed to be much more sensitive to U, than D. magna, according to EC50 (0.07 and 0.56 mg L-1, respectively).
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35. Análise do estado trófico e carga máxima admissível de fósforo no reservatório Tanque Grande, Guarulhos - SP
- Author
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Maíra Simões Cucio, Monica Ferreira do Amaral Porto, Ana Lucia Brandimarte, and Joaquin Ignácio Bonnecarrère Garcia
- Abstract
O avanço da ocupação humana em direção às áreas periurbanas da Região Metropolitana de São Paulo representa sérios riscos aos principais mananciais de abastecimento de água dos municípios da região. A degradação da qualidade destes mananciais pode colocar em risco seu uso preponderante, o que é bastante crítico, visto que a RMSP já apresenta disponibilidade hídrica limitada, o que levou alguns municípios a procurarem formas complementares de abastecimento. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o estado trófico e a carga máxima admissível de fósforo do reservatório do Tanque Grande, um manancial superficial do município de Guarulhos, na Grande São Paulo, que é utilizado para abastecimento complementar do município, fornecendo água para cerca de 30.000 habitantes. Apesar de apresentar mais de 90% da área da bacia com cobertura vegetal, poucos habitantes e poucas áreas agrícolas, dados do monitoramento da CETESB indicaram concentrações de fósforo total elevadas, o que motivou a elaboração da pesquisa. Para avaliar o estado trófico do reservatório foram empregadas as metodologias de índice de estado trófico de Lamparelli e o Trophic State Index, além do índice de estado trófico de Carlson, para comparação entre as metodologias. O resultado destes índices subsidiou a análise de carga máxima admissível, cujos resultados foram comparados às estimativas de cargas pontuais e difusas de fósforo produzidas na área da bacia. Foi possível concluir que o reservatório tem apresentado melhora de estado trófico nos últimos anos e que é pouco provável que o processo de eutrofização esteja plenamente estabelecido no reservatório por conta de condições morfométricas, que propiciam boas condições de circulação da massa de água. The advance of human occupation towards the peri-urban areas of the Metropolitan Region of São Paulo poses serious risks to the main sources of water supply of the regions municipalities. The quality degradation of these sources may endanger its predominant use, which is quite critical since the MRSP already has limited water availability, which led some municipalities to seek additional forms of water supply. This study aimed to evaluate the trophic status and maximum permissible load of phosphorus in the Tanque Grande reservoir, which is used to supplement the water supply of Guarulhos municipality, providing water to approximately 30,000 inhabitants. Despite showing more than 90 % of the basin area with vegetation cover, few residents and few agricultural areas, monitoring data by the CETESB indicated high concentrations of total phosphorus, which motivated the development of the research. To assess the trophic status of the reservoir, the trophic state index of Lamparelli and the trophic state index of Lamparelli, Cunha and Calijuri were employed. The Carlsons trophic state index was also used to compare the methodologies. The result of these indices were used in the maximum permissible load assessment, and the results were compared to estimates of point and non-point loads of phosphorus produced in the basin area. It was concluded that the reservoir has shown improvement in trophic state in recent years and it is unlikely that the process of eutrophication is fully established in the reservoir, probably because of morphometric conditions, which can provide good mixing conditions to the water body.
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- 2015
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36. Avaliação do monitoramento participativo como ferramenta de Aprendizagem Social na área de preservação ambiental Embu Verde (Embu das Artes - SP)
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Caroline Cichoski, Ana Lucia Brandimarte, Pedro Roberto Jacobi, and Alexander Turra
- Abstract
A gestão dos recursos hídricos do Brasil é relevante para o setor público, mas há um reconhecimento crescente de que as ferramentas tradicionais reguladoras não são suficientes para garantir a proteção da água minimizando os impactos antrópicos. Visando auxiliar na resolução deste problema, a legislação prevê a participação das comunidades em várias etapas do processo de gestão de recursos hídricos. Neste contexto, este estudo, realizado na APA Embu Verde localizada no Município de Embu das Artes na Região Metropolitana de São Paulo, avalia a implantação de um programa de monitoramento participativo, por meio de entrevistas, observação participante, questionários e grupo focal, considerando os níveis de Aprendizagem Social dos atores após a participação no referido programa e aplicação de uma ferramenta simplificada de biomonitoramento para voluntários. Com relação à Aprendizagem social, os voluntários atingiram os níveis de circuito simples e duplo, indicando que os processos de participação colaboram para a aquisição de conhecimentos sobre técnicas, métodos e meio físico. No entanto, não foi identificado o circuito de Aprendizagem tripla, correspondente à mobilização para a ação e solução dos problemas identificados, dado a complexidade dos mesmos. Os dados gerados pela ferramenta de biomonitoramento apresentaram resultados bastante próximos aos gerados por técnicas mais sofisticadas realizadas por especialistas, apresentando dificuldade apenas em distinguir ambientes de impactos intermediários. Além disso, o índice de voluntários apresenta caráter conservador, apontando que é mais provável que baixe a qualidade do local do que a superestime, evitando que impactos iniciais não sejam constatados. Sendo assim a prática de monitoramento participativo foi considerada uma boa ferramenta para potencializar o processo de Aprendizagem Social e levantar dados sobre a qualidade da água em riachos. The Brazil\'s water resources management is relevant to the public sector but there is a growing recognition that the traditional regulatory tools are not enough to ensure the protection of water minimizing the anthropic impacts. In order to solve this problem, the legislation expects the participation of the communitie in several stages of the water resource management. In this context, this research performed by APA Embu Verde located in Embu das Artes, (the metropolitan area of São Paulo) rates the implantation of a participatory monitoring program by interviewing people, participant observation, questionnaires and focus group considering the level of social learning from the actors after their participation in the program and the application of a simplified tool of biomonitoring for the volunteers. Regarding the social learning, the volunteers reached the levels of Single loop learning and Double loop learning indicating that the processes of participation collaborate for the acquisition of knowledge about techniques, methods and physical means. However, the circuit of triple - loop learning has not been identified given the complexity of them. The data generated by the tool of biomonitoring, showed results very near those generated by more sophisticated techniquesperformed by experts presenting only difficulty in distinguishing environments intermediate impacts. In addition to that, the index of volunteers presents conservative character indicating that the quality of the site goes down, preventing initial impacts to be observed. Therefore, the practice of participatory monitoring was considered a good tool to enhance the social learning process and to assess water quality in streams.
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- 2015
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37. Avaliação do habitat e das assembléias de macroinvertebrados bentônicos de riachos em uma área de proteção ambiental
- Author
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Daniel da Silva Bispo, Ana Lucia Brandimarte, Roberto Munehisa Shimizu, and Virginia Sanches Uieda
- Abstract
Os riachos em trechos de cabeceira são fontes importantes de água, sedimento e biota, apresentam baixa produtividade primária autóctone e são fortemente influenciados pela vegetação ripária, pois nesses trechos, a energia básica para sustentação das comunidades é proveniente do input de matéria orgânica particulada alóctone. Portanto, o desmatamento e o uso inadequado do solo afetam negativamente as condições dos riachos, o que é considerado umas das principais causas de degradação ambiental em países em desenvolvimento. Uma avaliação rápida da qualidade do habitat físico pode prover uma idéia geral das condições dos riachos e detectar alterações antrópicas de maneira rápida, fácil e de baixo custo. A combinação desta ferramenta com a avaliação de outros fatores físicos, químicos e biológicos, especialmente, a composição das assembléias de macroinvertebrados bentônicos, é essencial para o desenvolvimento de estratégias de monitoramento nesses ecossistemas. O objetivo geral do presente estudo foi identificar as principais alterações antrópicas sobre os riachos da APA Embu Verde e selecionar aqueles que apresentaram melhores condições de habitat para a fauna bentônica, a fim de conhecer a composição dessas assembléias e sua relação com o habitat. Para atender os objetivos, primeiramente foram avaliados 23 sítios amostrais, por meio de um Protocolo de Avaliação de Habitat e algumas variáveis relevantes. A partir daí, foram selecionados 4 riachos com base, prioritariamente, na semelhança das características do entorno, pequena variação no nível de degradação ambiental e potencialidade de oferta de habitats para os macroinvertebrados. Procedeu-se, então, à avaliação da vegetação ripária, do canal dos riachos e dos tipos de substratos para melhor compreensão da relação dos macroinvertebrados com o meio físico. A principal alteração antrópica na APA Embu Verde é o desmatamento da vegetação ripária natural, sendo evidenciados indícios de efeitos negativos sobre os riachos, como erosão nas margens e deposição de sedimentos finos. As variáveis que melhor explicaram a variação da fauna estão relacionadas ao porte do riacho, energia cinética de suas águas e aos tipos de substrato. Este último foi determinante para a composição das assembléias de macroinvertebrados bentônicos, pois estas variaram mais entre os tipos de substratos do que entre os sítios amostrais. A família Chironomidae foi dominante em todos os sítios e tipos de substratos. A diversidade e riqueza de família aumentaram com a estabilidade dos substratos inorgânicos Headwater streams are relevant suppliers of water, sediment, and biota. They support low autochthonous primary productivity and suffer strong influence from riparian vegetation as in these streams the basic energy for communities maintenance has its origin in the allochthonous particulate organic matter. Hence, deforestation and inadequate soil use negatively affect stream conditions, being among the main causes of environmental degradation in developing nations. A rapid assessment of the physical habitat quality can provide a general idea about stream conditions and detect anthropic changes in a rapid, easy and low cost manner. The combination of this tool with the assessment of other physical, chemical and biological features, especially the benthic macroinvertebrate assemblage composition, is essential to the development of monitoring strategies in those ecosystems. The general aim of this study was to identify the main anthropic changes on streams of Environmental Protection Area Embu Verde and to select those with better habitat conditions for benthic fauna. So it would be possible to know the assemblages composition and its relation with the habitat. First we evaluated 23 sampling sites using a Habitat Assessment Protocol and some relevant variables. Therewith we selected four streams, grounded primarily on the similarity of the surroundings features, little variation on the environmental degradation level and potential of habitats to macroinvertebrates. Then we made an assessment of stream riparian vegetation and substrate types to improve the understanding of the relation between macroinvertebrates and the physical environment. The major anthropic change in the sampling area is the deforestation of the natural riparian cover, and we observed evidences of its negative effects on streams, as bank erosion and fine sediment deposition. Variables that better explained fauna variations are related to the stream size, water kinetic energy and substrate types. Substrate was determinant to the composition of benthic macroinvertebrate assemblages as these ones variate more with the substrates types than with the sampling sites. Chironomidae dominated in all the sampling sites and substrate types. Family diversity and richness increased with the stability of inorganic substrates
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- 2015
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38. Recuperação de córregos urbanos através do controle de cargas pontuais e difusas - estudo de caso: Córrego Ibiraporã e do Sapé
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Juliana Caroline de Alencar da Silva, Monica Ferreira do Amaral Porto, Ana Lucia Brandimarte, and José Rodolfo Scarati Martins
- Abstract
Com a consolidação do saneamento em algumas bacias urbanas, um novo desafio surge: o da recuperação dos corpos dágua. O que a principio parece ser uma consequência do processo, na realidade se mostra uma tarefa muito mais complexa e que envolve diversos fatores, tornando o processo de recuperação lento e dispendioso. Muito se diz a respeito da despoluição dos corpos dágua através da eliminação da carga pontual, mas o que se observa na prática é que, mesmo diante do controle das cargas pontuais, os corpos dágua continuam poluídos devido às cargas difusas. A preocupação com a poluição por carga difusa já é um assunto muito estudado em locais onde a poluição por cargas pontuais já possui um controle efetivo, mas este assunto ainda é um grande desafio em países como o Brasil, onde o controle da carga pontual ainda não constitui uma realidade palpável. Atualmente, na região metropolitana de São Paulo, há diversos programas atuando na despoluição de corpos dágua através do controle de cargas pontuais, dentre eles o programa Córrego Limpo se destaca por agir na otimização de sistemas de esgotamento sanitário, e apesar dos bons resultados obtidos, como o programa se baseia no controle de cargas pontuais, estas bacias não se encontram completamente despoluídas. Considerando o caso brasileiro, o programa é pioneiro no que se refere à adoção de medidas que integram a população no processo de recuperação, pois implanta em algumas de suas bacias um programa de governança colaborativa, que, através da mobilização da população, promove a integração desta com o corpo dágua. Diante deste panorama, o presente estudo, tem como intuito, através da análise de córregos de interesse do programa Córrego Limpo, contribuir para a melhor compreensão dos desafios envolvidos no processo de recuperação de corpos dágua urbanos através do controle de cargas pontuais e difusas. No estudo empregou-se o método da Unidade de carga para quantificação da geração de cargas difusas nas bacias e identificação do seu potencial poluidor, resultando na criação de um índice de qualidade da superfície da bacia; Avaliou-se também a qualidade ambiental destes corpos dágua através de indicadores físicos, químicos e biológicos, o que revelou a importância do uso conjunto destes indicadores, já que obteve-se resultados distintos para cada um destes indicadores; com base nos resultados obtidos nestes estudos foi possível avaliar o quão complexo é o processo de recuperação de corpos dágua em áreas urbanas. With the consolidation of sanitation in some urban watersheds, a new challenge arises: the recovery of bodies of water. What at first appears to be a consequence of the process, in fact it shows to be a much more complex task and involves several facts, making the recovery process slow and costly. Much is said about the remediation of water bodies by removing point charge, but what we notice in practice is that even after controlling of point charge, they remain polluted because nonpoint pollution. The concern with nonpoint pollution is much studied in places where pollution by point charge already has an effective control, but this issue is still a challenge in countries like Brazil, where the control point charge does not constitutes a tangible reality. Currently, the São Paulo metropolitan area there are several programs working on recovering of water bodies through the control of point charge, including the Córrego Limpo that acts optimizing sewage systems, and is notorious the improvement in the quality of water bodies covered its actions. However, as the program based on controlling of point charge, the streams are not completely unpolluted. Considering the Brazilian case, the program is a pioneer when it comes to the adoption of measures that integrate the population in the recovering process. It deploys in some watersheds a program of collaborative governance that, through the people mobilization, promotes the body of water, resulting in reduction of the potential pollution in the watersheds and rendering more effective the process. The present study has the intention, through the analysis of streams of interest to the program Córrego Limpo, contribute to a better understanding of the challenges involved in the recovery process of urban water bodies through the control of the point and nonpoint pollution. In the study was used the method of unit load to quantify the generation of diffuse loads in basins and identification of their pollution potential, resulting in the creation of an index of quality of the surface of the basin, also evaluated the environmental quality of these bodies of water through physical, chemical and biological indicators, which revealed the importance of the combined use of these indicators, since we obtained different results for each of these indicators, the results of this study showed how complex is the recovery process of water bodies in urban areas.
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39. Buscando as condições naturais da água de riachos de baixa ordem do Parque Estadual da Cantareira (SP)
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Cassia de Souza Rares, Ana Lucia Brandimarte, Marisa Dantas Bitencourt, and Monica Ferreira do Amaral Porto
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O Parque Estadual da Cantareira é uma Unidade de Conservação de Proteção Integral localizada na Região Metropolitana de São Paulo, abrigando inúmeras nascentes, entre as quais as de importantes rios afluentes do Tietê e outras que contribuem para o reservatório Paiva Castro. Contudo existem poucos estudos sobre a qualidade da água e os ambientes aquáticos desta importante área protegida. Neste contexto, este trabalho objetivou avaliar a qualidade da água de ambientes lóticos do parque, a fim de buscar as condições mais próximas às naturais desta área, partindo do proposto na Resolução CONAMA 357/2005 para a Classe Especial. Para tanto a qualidade da água foi avaliada de forma integrada pela análise do meio físico (topografia e vegetação, utilizando-se imagens de satélite), da avaliação de características fisicoecológicas e do habitat de riachos (pelo emprego de um protocolo de avaliação rápida) e da qualidade da água (avaliação de variáveis físicas, químicas, biológica e hidrobiológica). Os resultados foram analisados de forma integrada e, a partir dos melhores resultados indicados pelas diferentes abordagens, foram selecionados dez riachos que representaram as condições de melhor preservação no âmbito desta pesquisa. Para o período amostrado estas condições são indicadas pelos mínimos valores ou ausência de Clorofila a, Ortofosfato, Ortosilicato, Fósforo Total, Nitrito e Amônio; baixos valores de Nitrato (< 0,81 mg/L), Nitrogênio Total (< 2,1 mg/L), Material em Suspensão Total (< 4,53 mg/L), Turbidez (< 7,1 NTU); valores relativamente baixos de Sólidos Totais (< 92,3 mg/L) e Condutividade Elétrica (< 58 s/cm); Oxigênio Dissolvido acima de 7,6 mg/L e pH entre 6,5 e 7,3. Além disso, deve haver condições fisicoecológicas livres de alterações e hábitats com características de ambientes com ausência ou mínima perturbação. Espera-se que esta pesquisa seja um primeiro passo para o diálogo sobre a viabilidade da busca de condições naturais em unidades de conservação de proteção integral, conhecimento necessário para o reenquadramento destas áreas protegidas na Classe Especial. The Cantareira State Park is a conservation unit of integral protection located in the Metropolitan Region of São Paulo. It has several springs including those originating relevant tributaries of the Tietê river and others that contribute to Paiva Castro reservoir. However, there are few studies on the water quality and aquatic environments of this relevant protected area. In this context, this research aimed to evaluate the water quality of lotic environments in the park in order to establish the natural conditions of the area, based on the proposed for Special Class by CONAMA Resolution 357/2005. The water quality was evaluated in an integrated manner by performing analyzes of the physical medium (topography and vegetation via satellite images, evaluation of physic-ecological features and habitat of streams (by a rapid bioassessment protocol) and evaluation of the water quality (physical, chemical, biological and hydrobiological analyses). Results were analyzed in an integrated manner and, from the better results indicated by the different approaches, ten sites were selected which represented the best preservation conditions in the Park. For the sampling period, these conditions are minimum values or absence of Chlorophyll a, Orthophosphate, Orthosilicate, Total Phosphorus, Nitrite and Ammonium; low values of Nitrate (< 0.81 mg/L), Total Nitrogen (< 2.1 mg/L), Total Suspended Solids (< 4.53 mg/L), Turbidity (< 7.1 NTU); relatively low values of Total Solids (< 92.3mg/L) and Electric Conductivity (< 58 s/cm); Dissolved Oxygen higher than 7.6 mg/L and pH between 6.5 and 7.3. Besides it should be physic-ecological conditions free of human impact and habitats with minimum or absence of disturbance. It is expected this research is the first step in the dialogue on the feasibility of seeking natural conditions in conservation units of integral protection, knowledge necessary for the framework of these protected areas in the Special Class.
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- 2015
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40. Aplicação da tríade de qualidade do sedimento em análise espacial no reservatório do Guarapiranga (SP, Brasil)
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Fernanda Lage, Ana Lucia Brandimarte, Mercedes Rosa Marchese, Antonio Aparecido Mozeto, and Marcelo Luiz Martins Pompeo
- Abstract
Com o intuito de conhecer o histórico da comunidade bentônica no reservatório do Guarapiranga para futuro estudo sobre a influência das diferentes formas de poluição na represa sobre o zoobentos, este trabalho foi desenvolvido a fim de coletar dados históricos da fauna de fundo e se houve variação na estrutura da comunidade ou não. Foram analisados quatro trabalhos realizados no período de inverno em quatro regiões médio-profundal do reservatório (Guarapiranga, Embu-Mirim, Embu-Guaçu e Parelheiros) ao longo dos anos, 1939, 1976, 1996 e 2010. A riqueza de dados presentada nos trabalhos refletiu a evolução do conhecimento em estudos limnológicos no Brasil e no mundo. A densidade de Oligochaeta apresentou aumento ao longo dos anos, assim como a de Chaoboridae. Por outro lado, Chironomidae que apresentava 30% em 1974 é pouco representativo em 2010. O ambiente mostrou forte e crescente enriquecimento orgânico em todos os pontos ao longo dos anos e isso colaborou para uma maior diversidade de grupos detritívoros (Tubificinae e Naidinae - Oligochaeta), por exemplo. Os níveis de oxigênio dissolvido no fundo diminuíram ao longo dos anos em todos as regiões. Chama-se a atenção para a necessidade de biomonitoramento nas 4 regiões da represa, utilizando inclusive os macroinvertebrados bentônicos e análises físicas e químicas do sedimento e a adoção de uma nova forma de gerenciamento deste manancial With the purpose to know the history of the benthic community in Guarapiranga reservoir for future study about the influence of different sources of pollution in the reservoir over zoobenthos, this study was conducted to collect historical data of benthic fauna and variation in community structure. Four studies conducted during winter in four regions of the reservoir medium-profundal (Guarapiranga, Embu-Mirim, Embu-Guaçu and Parelheiros) over the years, 1939, 1976, 1996 and 2010 were analysed. The best richness of data presented in the works reflected the evolution of knowledge in limnological studies, in Brazil and worldwide. The density of Oligochaeta had an increase over the years as well as the Chaoboridae. On the other hand, Chironomidae presented 30% in the 70\' community and was not representative anymore in 2010. The environment showed strong organic enrichment for all regions along the years, and this has contributed to a greater diversity of detritivorous groups (Tubificinae and Naidinae - Oligochaeta), for example. The dissolved oxygen levels at the bottom declined over the years in all regions. Attention is called to the necessity of biomonitoring in 4 regions of the reservoir, using benthic macroinvertebrates and physical and chemical sediment analyses and the adoption of a new way of managing this system
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41. A comunidade fitoplanctônica nas represas Billings e Guarapiranga (região metropolitana de São Paulo)
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Paula Yuri Nishimura, Marcelo Luiz Martins Pompeo, Viviane Moschini Carlos, Vanessa Becker, Ana Lucia Brandimarte, Odete Rocha, and Maria Jose dos Santos Wisniewski
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Reservatórios apresentam gradientes horizontal e vertical de fatores abióticos que controlam a dinâmica fitoplanctônica, resultando em uma marcada heterogeneidade espacial na produtividade fitoplanctônica. Portanto, o fitoplâncton é um importante objeto de estudo em reservatórios. Tradicionalmente, os estudos ecológicos com fitoplâncton partiam da análise da comunidade a partir de espécies ou grandes divisões taxonômicas, como classes. Com o avanço do conhecimento, surgiram novas abordagens para o estudo desta comunidade, como os grupos funcionais. Diversos autores propuseram metodologias de classificação de grupos funcionais, baseados em diferentes critérios, como fisiologia, ecologia e/ou morfologia. O objetivo geral do presente estudo foi investigar a estrutura da comunidade fitoplanctônica em relação às características ambientais em duas represas de abastecimento de água da Região Metropolitana de São Paulo, as represas Billings e Guarapiranga. Para atender aos objetivos específicos, diversos aspectos foram abordados, como os possíveis impactos da transposição de águas da represa Billings para a Guarapiranga, a utilização de grupos funcionais na detecção de padrões ambientais, a comparação de diferentes metodologias de agrupamentos funcionais do fitoplâncton, a ocorrência do dinoflagelado invasor Ceratium furcoides em reservatórios brasileiros e a heterogeneidade ambiental da represa Guarapiranga com base na qualidade da água e nas comunidades planctônicas. As represas Billings e Guarapiranga discriminaram-se quanto às variáveis físicas, químicas e biológicas, sendo classificadas como meso/eutróficas. A comunidade fitoplanctônica da represa Billings foi dominada pelo dinoflagelado invasor Ceratium furcoides (Lo), que provavelmente está sendo transferido para a represa Guarapiranga através do sistema de transposição. A baixa qualidade da água do ribeirão Parelheiros influenciou fortemente a qualidade da água da represa Guarapiranga, principalmente na região de entrada deste tributário, com domínio do grupo funcional LM. As regiões mais distantes da região de influência do ribeirão Parelheiros na represa Guarapiranga apresentaram condições distintas, devido à influência de tributários com melhor qualidade de água. Observou-se abundância de distintos grupos funcionais, como WS, H1 e A, evidenciando uma heterogeneidade da qualidade da água no eixo longitudinal da represa Guarapiranga. Três compartimentos principais foram identificados: 1) região do Embu-Guaçu, parte alta da represa, mais protegida e menos eutrófica dominada por fitoplâncton R-estrategista e rotíferos; 2) região do Parelheiros, um braço eutrófico da represa com domínio de fitoplâncton C-estrategista e elevada densidade de copépodes ciclopóidas e 3) parte baixa do reservatório, com características eutróficas e lacustrinas, co-dominância de fitoplâncton C e S-estrategistas e maior contribuição de copépodes à densidade total do zooplâncton. A adição do algicida sulfato de cobre na água da represa Guarapiranga influenciou a formação de compartimentos com base nas comunidades fitoplanctônica e zooplanctônica. Ao fim deste trabalho, evidenciou-se a importância 1) da preservação do ribeirão Parelheiros e do monitoramento da transferência de espécies fitoplanctônicas da represa Billings para a Guarapiranga visando a preservação da qualidade da água represa Guarapiranga, 2) da necessidade do monitoramento da ocorrência e dispersão de C. furcoides no Brasil, 3) da implementação de programas de manejo na represa Guarapiranga que levem em consideração a presença de heterogeneidade ambiental neste reservatório e 4) da utilização dos grupos funcionais fitoplanctônicos como ferramenta na identificação de padrões ambientais Reservoirs exhibit horizontal and vertical gradients of abiotic factors that control phytoplankton dynamics, resulting in a marked spatial heterogeneity in phytoplankton productivity. Therefore, phytoplankton is an important object of study in reservoirs. Traditionally, ecological studies on phytoplankton community were based on species or taxonomic major divisions, such as classes. As science advanced, new approaches appeared, such as functional groups. Several authors have proposed methods of functional groups\' classification based on different criteria, such as physiology, ecology and/or morphology. The general objective of this study was to investigate the structure of the phytoplankton community in relation to environmental characteristics in two water supply reservoirs in São Paulo Metropolitan Area, Billings and Guarapiranga reservoirs. To reach some specific aims, several aspects were investigated: the possible impacts of the water transfer from Billings to Guarapiranga reservoir, the use of functional groups in the detection of environmental patterns, comparison of different methodologies of phytoplankton functional groups\' classification, the occurrence the invasive dinoflagellate Ceratium furcoides in Brazilian reservoirs and the environmental heterogeneity of Guarapiranga reservoir based on water quality and planktonic communities. Billings and Guarapiranga reservoirs exhibited distinct physical, chemical and biological characteristics, being both classified as meso/eutrophic. The phytoplankton community of Billings reservoir was dominated by C. furcoides (Lo), which is probably being transferred to Guarapiranga through the water transfer system. The poor water quality of the Parelheiros stream strongly influenced the water quality of Guarapiranga reservoir, mainly at the entrance of this tributary, with dominance of functional group LM. Regions further away from Parelheiros stream in Guarapiranga reservoir exhibited different conditions, due to the influence of tributaries with better water quality. It was observed abundance of different functional groups, such as WS, H1 and A, demonstrating the presence of water quality heterogeneity in the longitudinal axis of Guarapiranga reservoir. Three main compartments were identified: 1) Embu Guaçu region, upstream, more protected and less eutrophic, dominated by phytoplankton R-strategists and rotifers; 2) Parelheiros region, a eutrophic branch of the reservoir, dominated by phytoplankton C- strategists and high density of copepods cyclopoids and 3) the lower part of the reservoir, with eutrophic and lacustrine features, co-dominance of phytoplankton C and S-strategists and higher contribution of copepods to the total density of zooplankton. The addition of the algaecide copper sulfate in the reservoir\'s water influenced the formation of compartments based on phytoplankton and zooplankton communities. Some final remarks were highlighted at the end of this study: 1) the importance of the preservation of Parelheiros stream\'s water quality in order to maintain Guarapiranga reservoir water quality, 2) the transfer of phytoplankton species from Billings to Guarapiranga reservoir must be closely monitored, 3) the occurrence and dispersion of C. furcoides in Brazililian waters must be closely monitored, 4) management programs in Guarapiranga reservoir must take into account the presence of water quality heterogeneity and 5) phytoplankton functional groups as a tool for identifying environmental patterns should be applied
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42. Contribuições da análise de percepção ambiental à formulação e implementação de instrumentos de gestão ambiental pública: projeto de lei da área de proteção e recuperação dos mananciais do Alto Juquery
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Egberto da Fonseca Casazza, Ana Lucia Brandimarte, Ana Paula Fracalanza, and João Luiz de Moraes Höeffel
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O reservatório Paiva Castro, último reservatório de regularização de vazões do Sistema Cantareira, que consiste em um sistema de abastecimento público responsável por fornecer água à aproximadamente 10 milhões de pessoas na Região Metropolitana de São Paulo (RMSP), vem sofrendo constantes ameaças à qualidade de seus recursos hídricos, a despeito da variada gama de instrumentos de gestão ambiental existente na região. Junto ao processo de reforma do Estado, desencadeado pela falência do modelo de estado do bem estar social, houve uma intensa transformação nos instrumentos de gestão ambiental pública existentes no Brasil até então. Esta transformação tornou o gerenciamento ambiental público brasileiro menos centralizado e dotado de mais oportunidades para participação social. Entre os instrumentos de gestão ambiental transformados durante o período de reforma do Estado está a legislação de proteção aos mananciais metropolitanos da RMSP, um dos instrumentos com maior potencial para evitar a degradação dos recursos hídricos da região do reservatório Paiva Castro. O presente trabalho tem por objetivo verificar se a percepção ambiental e as expectativas da população da Área de Influência do Reservatório Paiva Castro se faz presente no Projeto de Lei da Área de Proteção e Recuperação dos Mananciais - Alto Juquery, um dos produtos da renovação da legislação de proteção aos mananciais metropolitanos. Para tal foram utilizadas análises de percepção ambiental da população desta região, e os resultados destas foram comparadas aos ditames do Projeto de Lei da APRM - Alto Juquery. O estudo do projeto de lei em epígrafe revelou a tendência dos legisladores de incorporar à legislação récem criada diversos dispositivos de disciplinamento do uso do solo visando a proteção dos recursos hídricos da região, enquanto a análise da percepção ambiental dos habitantes da Área de influência do reservatório Paiva Castro revelou que estes não associam de maneira direta o uso do solo com a preservação dos recursos hídricos. Desta forma, o trabalho conclui que existe um descompasso entre a maneira como a população apreende o ambiente de seu entorno e as melhores forma de preservá-lo e o projeto de lei récem criado. Desta conclusão foi possível depreender que a criação de uma legislação em órgãos colegiados nos quais existe possibilidade de participação social não é suficiente para garantir um alinhamento da administração pública com os anseios da população, bem como será necessária a utilização de outros instrumentos de gerenciamento ambiental na área de influência do reservatório Paiva Castro, tais como educação ambiental e comunicação social para que o projeto de lei APRM AJ possa ser implementado de maneira plena e compreendido na íntegra pela população local. The Paiva Castro reservoir, the last reservoir of Cantareira System which consists of a public water supply system responsible for providing water to approximately 10 million people in the Metropolitan Region of São Paulo (MRSP), has been under constant threat to the quality of water resources, despite the wide range of management environmental buildings existing in the region. Along the process of state reform, triggered by the failure of the model of the welfare state, there was an intense change in public environmental management tools in Brazil. This change has made the brazilian public environmental management less centralized, and provided it with more opportunities for social participation. Among the instruments of environmental management changed during the state reform, legislation to protect the water sources of MRSP is one wich the greatest potential to prevent degradation of water resources in the region of Paiva Castro reservoir. The present work aims to verify whether the environmental perception and expectations of the population of the catchment area of Paiva Castro reservoir are present in the Bill of Area of the Watershed Protection and Recovery - Alto Juquery (AWPR - Alto Juquery), a product of the renewal of the metropolitan watershed protection regulations. To this end it was used an analysis of environmental perception of the people of this region, and these results were compared to the dictates of the Law of AWPR - Alto Juquery. The study of the bill revealed the tendency of legislators to incorporate the newly created devices to regulating the land use in order to protect water resources of the region. The analysis of environmental perception revealed that the inhabitants of the area of influence of the reservoir Paiva Castro do not associate land use with the preservation of water resources. Thus, the paper concludes that there is a mismatch between the way the public perceives the environment of its surroundings and the best way to protect it and the bill newly created. It was possible to conclude that the creation of legislation in collegiate bodies, where there is the possibility of social participation, is not enough to ensure alignment of government with the desires of the population. It will require the use of other instruments in environmental management area of influence of Paiva Castro reservoir, such as environmental education and advertisement of the Law AWPR Alto Juquery can be fully implemented and understood by the local population.
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- 2015
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43. Zooplâncton em córregos sob diferentes usos da terra na bacia do Rio Preto (Distrito Federal e Goiás)
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Clarissa Barbosa de Oliveira, Marcelo Luiz Martins Pompeo, Ana Lucia Brandimarte, and Maria Jose dos Santos Wisniewski
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Environmental science - Abstract
O zooplâncton possui grande sensibilidade ambiental e responde rapidamente a alterações ambientais com alterações na abundância e riqueza de organismos. Ainda se conhece muito pouco sobre os organismos aquáticos do Cerrado, assim como há poucos estudos sobre o zooplâncton de ambientes lóticos no Brasil. Esse trabalho teve como objetivo caracterizar dois córregos da bacia do Rio Preto, médio São Francisco, pela avaliação de comunidades zooplanctônicas e suas relações com características físicas, químicas e biológicas da água, comparando córregos em áreas de vegetação nativa conservada e sob influência de áreas agrícolas. Foram amostradas duas sub-bacias do Rio Preto, localizadas em área de Cerrado (DF e GO) durante quatro semanas nos períodos seco e chuvoso. Em dois pontos de amostragem por córrego, foram coletadas amostras de zooplâncton e de água. Variáveis físicas e químicas da água e a concentração de a clorofila a foram determinadas. Os dois córregos apresentaram tendência de aumento de íons no período chuvoso. O córrego Estanislau (em área agrícola) apresentou maiores concentrações de nitrato, sódio, cloreto e clorofila a em relação ao córrego Pindaíba (em área de vegetação nativa). O zooplâncton se caracterizou por densidades muito baixas e alta riqueza de espécies, com 63 táxons registrados ao todo. A riqueza de espécies e a densidade de organismos do zooplâncton foram maiores no córrego Pindaíba. O córrego Estanislau possui indícios de estar sofrendo impactos negativos do uso rural de sua bacia. The zooplankton community has high environmental sensitivity and quickly responds to changes in the environment with changes in its abundance and diversity. Yet, little is known about the aquatic organisms of the Cerrado, as well there had been few investigations on the zooplankton of Brazilian lotic environments. This work had the aims to characterize two streams of Rio Preto watershed, part of the Rio São Francisco watershed; to assess their zooplankton communities and the relationships between chlorophyll a and physical and chemical characteristics of water; and to contrast forested and agricultural streams. Two streams, located in the Cerrado Biome (Federal District and the state of Goiás), were sampled for four weeks in dry and rainy seasons. Zooplankton and water samples were taken in two sampling points per stream. Physical and chemical characteristics of water and chlorophyll a concentration were determined. Ionic concentration was higher on rainy season in both streams. The agricultural stream (Estanislau) had higher concentrations of nitrate, sodium, chloride, and chlorophyll a than the forested stream (Pindaiba). Zooplankton was characterized by very low densities and high species richness, with a total of 63 taxa recorded on both streams. Zooplankton density and species richness were higher in Pindaiba stream. Estanislau stream has signs to be suffering negative impacts from the agricultural land use of its watershed.
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- 2015
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44. O papel dos bosques agroflorestais para a diversidade da avifauna na paisagem fragmentada do Pontal do Paranapanema, SP - Brasil
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Dennis Driesmans Beyer, Ana Lucia Brandimarte, Jose Carlos Motta Junior, Pedro Ferreira Develey, and Carla Morsello
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Geography - Abstract
A fragmentação de hábitats, e conseqüente isolamento de populações animais e vegetais, tem sido apontada como uma das principais ameaças à biodiversidade. Os elementos de conexão são estruturas que favorecem o deslocamento de organismos pela paisagem fragmentada. Um destes elementos, os trampolins ecológicos, também chamados de pontos de ligação ou stepping stones, são pequenas áreas de hábitat dispersas na matriz de não habitat, que potencialmente podem aumentar a conectividade na paisagem, reduzindo a probabilidade de extinção de diversas espécies. Este trabalho foi desenvolvido nos municípios de Teodoro Sampaio e Euclides da Cunha, localizados na região do Pontal do Paranapanema, Estado de São Paulo. Foram selecionadas duas paisagens com situações distintas no que se refere à presença dos elementos de conexão: Paisagem da Água Sumida (AS) e Paisagem da Ponte Branca (PB). Para a amostragem da avifauna utilizou-se o método do ponto fixo, no qual os pontos foram alocados distantes pelo menos 200m uns dos outros e o tempo de observação foi de 10 minutos por ponto. A coleta de dados em campo ocorreu nos meses de novembro e dezembro de 2003 e janeiro de 2004. Em cada paisagem foram realizadas quatro visitas. Em função deste levantamento, foi calculado o Índice Pontual de Abundância (IPA) para cada espécie em todos os pontos amostrados. Diversos bosques agroflorestais foram estudados, a fim de se verificar se eram utilizados pela avifauna, o que seria um indicativo da potencialidade destes bosques como trampolim ecológico. Foram também incluídos a matriz de pasto e os elementos de conexão: corredores ecológicos e pequenos fragmentos naturais. Os dados obtidos foram comparados com outro estudo conduzido nos fragmentos grandes. Foi observada uma diferença na composição da avifauna entre os diversos tipos de hábitats considerados, mas que ainda pouco deve refletir no aumento de fluxo pela paisagem das espécies florestais. Estas espécies na maior parte das vezes foram somente observadas nos fragmentos grandes e, aparentemente, não usam os bosques ou qualquer outro elemento de conexão, provavelmente devido ao elevado grau de isolamento destes e à hostilidade da matriz. Apesar de ter sido observado que os sistemas agroflorestais ainda não beneficiam grande parte da avifauna dependente de floresta, os resultados apontam que as ações de manejo nos assentamentos rurais começam a ter reflexos na diversidade na escala da paisagem da região, além de fornecer sustento para as famílias assentadas. Estes benefícios provavelmente serão maximizados com a intensificação dos processos de implantação de novos bosques agroflorestais, recuperação das matas ciliares e melhoramento da qualidade da vegetação dos remanescentes florestais. Habitat fragmentation and consequent isolation of fauna and flora populations have been mentioned as one of the most critical threat for the biodiversity. The landscape elements are structures that increase the biota movements throw landscape. One of these elements is the stepping stones, which are small portions of habitat spread in matrix, and potentially could increase landscape connectivity, reducing extinction probability of a number of species. This study was conducted in Pontal do Paranapanema, State of São Paulo, Brazil, in two different areas concerning the presence or absence of some of the landscape elements: Landscape of Água Sumida (AS) and Landscape of Ponte Branca (PB). Field work had happened from November 2003 to January 2004. Avifauna was surveyed by point counts, where birds were registered for 10 minutes. The points were located at least 200m far from another, and each point was visited four times. Punctual Abundance Index (IPA) were calculated for birds species in all surveyed points. Some agro-forest patches were surveyed to verify the avifauna presence, which would be an indication of the potentially effect of stepping stones. Matrix of pasture, corridors and smalls fragments of native forest were also surveyed. The data obtained were compared to big fragments data of another study. There were differences of birds species compositions among all kinds of habitat considered, but it does not indicate increase of movements of forest species throw landscape. These species were most of the time registered into the large forest fragments, and they did not use agro-forest patches nor landscape elements, probably due the isolation caused by matrix hostility. Despite agro-forest system still do not increase movements of forest birds, the results suggests that environment management in settleland areas interfere on the biodiversity in landscape scale in this region, besides provide support for settled families. These benefits probably will be optimized with implantation of new agro-forest patches, revegetation of riparian areas and quality improvement of vegetation of residual woodlots.
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- 2015
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45. Discrepancies identified in environmental impact assessment reports for hydropower projects focused on analyses of wild birds and mammals
- Author
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Adriana Akemi Kuniy Kamogawa, Ana Lucia Brandimarte, Vania Regina Pivello, and Joel Barbujiani Sigolo
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Geography - Abstract
Os Estudos de Impacto Ambiental (EIA) foram legalmente institucionalizados no Brasil durante a década de 1980. Estes são balizados a partir do Termo de Referência (TR) que define as diretrizes que o EIAs deverão seguir, mas não determina qual grupo faunístico e metodologias devem ser adotadas, o que fica a critério dos empreendedores e consultores contratados. Visando verificar se esse procedimento resulta ou não em ausência de padronização entre os TRs e os relatórios de EIAs, bem como em outros possíveis desajustes que resultem na menor eficácia dos relatórios de EIA, foram compararados nove relatórios de empreendimentos hidrelétricos das décadas de 1980, 1990 e dos anos 2000. Para tanto, foram utilizadas informações como atendimento às exigências contidas nos TRs e metodologias utilizadas, no que diz respeito aos métodos de coleta, esforço amostral, levantamento de grupos de aves e mamíferos dependentes de hábitats específicos relacionados, solidez das listas de faunas e análise dos dados. Além disso, foi avaliada a aplicabilidade do delineamento RAPELD na avaliação de impacto de empreendimentos hidrelétricos. Os resultados indicaram que há discrepância quanto aos esforços amostrais e às metodologias utilizadas nos estudos, além da ausência de informações requeridas pelos Termos de Referência e a escassez de dados relacionados aos grupos de fauna associada aos ambientes que serão afetados e a aves e mamíferos dependentes de ambientes aluviais. O delineamento RAPELD muitas vezes não é aplicável em regiões com alterações antrogênicas, mas deve-se levar em consideração que a recomendação de sua utilização pelo órgão ambiental para um casos analisados indica uma sutil evolução recente no delineamento amostral. As análises realizadas neste trabalho podem servir como indicadores sobre o estado geral da efetividade dos EIA como ferramentas a serem utilizadas pela sociedade no que se refere às intervenções ambientais. Environmental Impact Assessment (EIA) studies were legally institutionalised in Brazil in the 1980s, and their elaboration is based on guidelines established by Terms of Reference (TR) which define the main directives to be followed by each project\'s EIA, but often do not determine the faunal groups to include and the methods to be employed choices which are then left at the discretion of the company proposing the project and their hired consultants. In order to analyse whether this procedure does or does not result in an absence of standardisation among Terms of Reference and EIA studies, as well as in other disparities which may impair the effectiveness of EIA reports, this work compared 9 EIA reports for hydro-power projects from the 1980s, 1990s and 2000s. The reports were compared with regard to such information as compliance with the requirements set by the TRs and methodology used (including sampling methods, sampling effort, study of bird and mammal groups dependent on specific habit types, reliability of the fauna lists provided and data analysis). The appropriateness of the RAPELD sampling design for Hydro-power environmental impact assessments was also analysed. The results indicated incongruities as to the sampling effort and the methodologies employed for the studies, as well as an absence of information required according to the Terms of Reference and a paucity of data specifically dealing with fauna groups associated with environments to be directly affected by the projects and with mammals and birds dependent on alluvial environments. The RAPELD sampling design is often considered inappropriate for highly human-modified regions, but it is noted that its recommendation by environmental agencies for some of the cases analysed indicates a recent improvement in sampling designs. This work\'s findings may serve as indicators of the overall state of the effectiveness of EIA studies as tools for the society to assess the effects of interventions in the environment.
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- 2013
46. Evaluation of techniques for golden mussel fouling control in hydroelectric power plants aimed at mitigation of unavailability
- Author
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Érico Pessoa Felix, Gilberto Francisco Martha de Souza, Ana Lucia Brandimarte, Tarcisio Antonio Hess Coelho, Carlos Alberto Fortulan, and Izabel Fernanda Machado
- Abstract
O mexilhão-dourado é um organismo invasor que tem causado grandes prejuízos a sistemas de captação de água e usinas hidroelétricas (UHEs). Existem diversos métodos de controle da incrustação destes organismos em tubulações de usinas hidroelétricas, porém o impacto da aplicação desses métodos ainda não é amplamente conhecido. Este trabalho visa desenvolver uma metodologia para avaliar a degradação dos sistemas de resfriamento de UHEs submetidas a tratamentos químicos para o controle da incrustação por mexilhão-dourado. Neste trabalho é usado, como caso exemplo, o sistema de resfriamento do ar do núcleo do gerador e do óleo dos mancais de uma UHE com turbina Kaplan de potência aproximada de 150 MW. A análise proposta baseia-se na aplicação de ensaios acelerados de corrosão, a fim de determinar a taxa de corrosão nas condições normais de operação. Os ensaios executados neste estudo simulam condições operacionais mais severas do que as usualmente enfrentadas pelo sistema, visando reduzir o tempo de execução dos ensaios. Os ensaios acelerados de corrosão baseiam-se no aumento da solicitação térmica e da concentração das substâncias químicas injetadas no fluxo de água que são a adição de gás ozônio e de hipoclorito de sódio. Para realização dos ensaios foi construído um circuito experimental capaz de impor condições de temperatura e concentrações das substâncias químicas. Os resultados dos ensaios acelerados fornecem subsídios para aplicação dos conceitos de confiabilidade estrutural para determinação da probabilidade de falha dos equipamentos em estudo em função do tempo de aplicação do tratamento químico. Verificou-se entre os produtos químicos utilizados neste estudo, que o hipoclorito de sódio é 50% mais agressivo para a liga de cobre níquel e 700% mais agressivo para o aço inoxidável em relação a degradação observada pela ação do ozônio. The golden mussel (Limnoperna fortunei) is an invader organism that has caused great damage to water catchment systems and hydroelectric power plants. There are various methods of fouling control of these organisms in hydroelectric power plants pipelines, but the impact of the application of these methods is not yet widely known. This work aims at developing a methodology to evaluate the degradation of hydroelectric power plants cooling systems pieces of equipment subjected to chemical treatments for control of golden mussel fouling. This work uses as a case example, the cooling system inside generator and oil bearing of Kaplan hydroelectric turbine with 150MW nominal power output. The analysis is based on the application of accelerated corrosion tests in order to determine the rate of corrosion under normal operation conditions given the rates of corrosion under various accelerated conditions. The tests run on this thesis simulate operating conditions more severe than those usually experienced by the system, to reduce the runtime of the tests. The proposed accelerated corrosion tests are based on increased thermal loading and concentration of chemical substances injected into water flow. The chemical treatments tested in this work are the addition of ozone and sodium hypochlorite. For carrying out the tests an experimental circuit capable of imposing different conditions of temperature and concentration levels was built. The results of accelerated tests provide subsidies for the implementation of structural reliability concepts for determining the failure probability of equipment under consideration. Among the chemical products used in the analysis, the sodium hypochlorite is 50% more aggressive for copper-nickel 90/10 alloy and 700% more aggressive for stainless steel in relation to degradation observed for ozone.
- Published
- 2011
47. The \'decoada\' phenomenon in Pantanal of Paraguai river, Corumbá/MS, Brazil: changes in limnological parameters and effects on benthic macroinvertebrates
- Author
-
Maria Helena da Silva Andrade, Ana Lucia Brandimarte, Débora Fernandes Calheiros, Alaíde Aparecida Fonseca Gessner, Marcelo Luiz Martins Pompeo, Kennedy Francis Roche, and Gisela Yuka Shimizu
- Subjects
Environmental science - Abstract
Este trabalho teve como objetivo investigar a hipótese de que a decoada (alteração dos parâmetros físicos e químicos da água) é um fenômeno natural importante na estruturação da comunidade de invertebrados bentônicos do Pantanal do rio Paraguai, bem como a caracterizar a comunidade de macroinvertebrados bentônicos quanto à composição, abundância de organismos e riqueza em função das alterações ambientais provocadas pela decoada. Além disso, pretendeu-se contribuir para o conhecimento da biota do pantanal de Mato Grosso do Sul com o intuito de subsidiar ações de prevenção e/ou mitigação de possíveis impactos ambientais. Os ambientes escolhidos foram dois corpos de água adjacentes ao rio Paraguai, sendo um com características lênticas (Baía Tuiuiú) e outro, semi-lóticas (Bracinho), Corumbá/MS, ambos sob o efeito do pulso de inundação. O capítulo um realizou uma caracterização limnológica dos dois corpos de água ao longo de um ciclo hidrológico, enfatizando as alterações provocadas pela decoada, por ocasião da subida das águas. O capítulo 2 objetivou estudar a composição e a distribuição da fauna de Chironomidae relacionando-as com as alterações limnológicas ao longo de um ciclo hidrológico (abril/2008 a fevereiro/2009), enfatizando a influência da decoada. O capítulo 3 pretendeu conhecer a composição de Oligochaeta, considerando as relações com fatores abióticos, no intuito de contribuir para o entendimento do fenômeno da decoada bem como subsidiar posteriores trabalhos e ações relacionados à gestão da planície pantaneira, objetivando sua manutenção e conservação. A decoada é um evento que potencializa a desestruturação do ambiente, agindo significativamente sobre as populações de invertebrados bentônicos. O fato de não ter sido encontrado nenhum organismo vivo durante a ocorrência do fenômeno destaca a sua importância enquanto fator ecológico essencial na dinâmica das populações biológicas dos ecossistemas pantaneiros. This study aimed to investigate the hypothesis that the decoada(change in physical and chemical parameters of water) is an important natural phenomenon in the community structure of benthic invertebrates in the Pantanal of the Paraguay River, and to characterize the benthic macroinvertebrate community regarding the composition, richness and abundance of organisms as a function of environmental changes caused by the \'decoada\'. In addition, soughted to contribute to the knowledge of the biota of wetland of Mato Grosso do Sul in order to support programs to prevent and / or mitigate potential environmental impacts. The areas chosen were two bodies of water adjacent to the Paraguay River, one with lentic feature (Tuiuiú Bay) and another, semi-lotic (\'Bracinho\'), Corumbá / MS, both of them suffering the effect of pulse flood. The chapter 1 conducted a limnological characterization of the two water bodies along a hydrological cycle, emphasizing the changes caused by the \'decoada\', when the water level rises. Chapter 2 aimed to study the composition and distribution of Chironomidae fauna relating them to limnologicals changes over a hydrological cycle (the april/2008 to february/2009), emphasizing the influence of the decoada. Chapter 3 intended know the composition of Oligochaeta, considering the relationships with environmental factors in order to contribute to the understanding of the phenomenon of \'decoada\' and support further work and actions related to the management of the Pantanal, aiming to maintain the ecosystem and related services. The decoada is an event that enhances the disintegration of the environment, acting significantly on populations of benthic invertebrates. The fact that no organism had been found alive during the occurrence of the phenomenon underscores its importance as an essential ecological factor in the dynamics of biological populations of wetland ecosystems.
- Published
- 2011
48. Evaluation of environmental effects of uranium mining\'s radioactive effluents on physical and chemical characteristics and diversity of the Zooplanktonic Community in the Ore Treatment Unit, Antas Dam and Bortolan Dam, Poços de Caldas (MG)
- Author
-
Carla Rolim Ferrari, Heliana de Azevedo, Ana Lucia Brandimarte, and Marcelo Luiz Martins Pompeo
- Subjects
Environmental science - Abstract
A represa das Antas e represa Bortolan fazem parte da Sub-Bacia Hidrográfica do Ribeirão das Antas, sendo que a primeira sofre impacto de uma mineradora de urânio (UTM/INB), uma vez que recebe despejos de efluentes radioativos tratados procedentes de DAM, já a represa Bortolan recebe maior influência da malha urbana de Poços de Caldas. O objetivo do presente estudo foi analisar a diversidade da comunidade zooplanctônica, bem como realizar a caracterização física e química da UTM/INB e represas das Antas e Bortolan. Diferenças em relação às condições físicas, químicas e a comunidade foram verificadas entre os ambientes. Na UTM/INB as condições químicas da água apresentaram-se não favoráveis ao desenvolvimento do zooplâncton. A represa das Antas apresentou condições ambientais intermediárias entre a UTM/INB e represa Bortolan, devido provavelmente ao lançamento de efluentes em condições inadequadas pela UTM/INB. Na represa Bortolan as concentrações de nutrientes e clorofila a explicaram a maior densidade e, portanto, a maior diversidade das espécies zooplanctônicas. The Antas and Bortolan Dams are part of the Ribeirão das Antas Hydrographical Sub-Basin, being that the Antas Dam suffers impact from a uranium mining (UTM/INB), once it receives discharges of treated radioactive effluents derived from DAM, while Bortolan Dam suffers greater influence from the urban area of Poços de Caldas. The objective of the current study was to analyze the zooplanktonic community\'s diversity, as well as to perform the physical and chemical characterizations of UTM/INB and Antas and Bortolan Dams. Differences related to the physical and chemical conditions and the community were verified among the environments. In UTM/INB, the water\'s chemical conditions were not favorable to zooplankton development. The Antas Dam presented intermediate environmental conditions between UTM/INB and Bortolan Dam, probably due to the release of effluents in inadequate conditions, done by UTM/INB. In Bortolan Dam, the concentrations of nutrients and chlorophyll a have justified the higher density and thus, the greater diversity of zooplanktonic species.
- Published
- 2010
49. Compartimentalization of the zooplankton community in a tropical urban eutrophic reservoir (Rio Grande branch, Billings Complex, SP)
- Author
-
Patricia do Amaral Meirinho, Marcelo Luiz Martins Pompeo, Ana Lucia Brandimarte, and Maria Jose dos Santos Wisniewski
- Abstract
O presente estudo foi realizado no reservatório Rio Grande (Complexo Billings), estado de São Paulo, com o objetivo de analisar a heterogeneidade espacial ao longo de seu eixo principal e com isso também saber se a comunidade zooplanctônica varia junto com o gradiente de condições ambientais encontrado no reservatório. Para tal, o reservatório foi dividido em quatro porções com base em informações anteriores a este estudo que mostravam um gradiente de trofia variando de eutrófico próximo de seus tributários a oligotrófico próximo à barragem. Assim, em cada porção foram escolhidos três pontos, totalizando 12 pontos de coleta amostrados em duas épocas do ano. Algumas variáveis como clorofila-a, fósforo total, materiais em suspensão e condutividade elétrica diminuíram em direção a barragem, outras como a transparência e profundidade aumentaram, o que indica também uma diminuição da eutrofização na porção próxima à barragem onde há captação de água para abastecimento, embora os valores do IET tenham indicado em geral um ambiente eutrófico, chegando a ser mesotrófico próximo à barragem. O zooplâncton apresentou maior riqueza de espécies e abundância total na parte alta do reservatório, diminuindo em direção à barragem. Os Rotifera foram os organismos com maior número de espécies, foram quase sempre mais abundantes e seguiram o padrão geral de heterogeneidade na abundância, já os Copepoda, formados apenas pela ordem Cyclopoida, apresentaram padrões diferentes do geral em ambos os períodos. Os Cladocera foram pouco presentes. Assim, a presença de certas espécies ou grupos do zooplâncton apontaram para um ambiente eutrofizado e instável, com a presença de espécies oportunistas. Sendo assim, a comunidade zooplanctônica acompanhou o gradiente de condições ambientais do reservatório com alterações em sua abundância e composição, mostrando ser um bom indicador de mudanças ambientais. Esse gradiente ao longo do eixo principal é comum em reservatórios por ser um sistema de transição, mas no reservatório Rio Grande também pode haver influência antrópica vinda do despejo de cargas poluidoras ou do manejo, com a aplicação de algicidas para tratamento da água. Por meio de ACPs, as variáveis limnológicas e as características do zooplâncton dividiram o reservatório em três compartimentos dentro desse gradiente encontrado; tais compartimentos variam suas dimensões constantemente com o passar do tempo, mostrando assim um ambiente dinâmico, mas com compartimentos bem definidos. The present study was done in the Rio Grande reservoir (Billings Complex), São Paulo state, with the aim to analyze the spatial heterogeneity in the main axis and also to know if the zooplankton community varies with the gradient of environmental conditions found in the reservoir. To this end , the reservoir was divided in four portions based on previous information to this study that showed a trophic gradient varying from eutrophic near of its tributaries to oligotrophic near of the dam. Thus, in each portion it was chosen three points, totalizing 12 points sampled in two seasons. Some variables as chlorophyll-a, total phosphorus, suspension materials and electric conductivity decreased towards the dam, others such as the transparency and depth increased, what indicates a decrease of the eutrophication in the dams portion where there is a captation point for water supply, although the IET values have indicated, in general, a eutrophic environment being mesotrophic near of the dam. The zooplankton presented large richness of species and total abundance in the upstream zone of the reservoir decreasing towards the dam. The Rotifera were the organisms with the largest number of species, being almost always the most abundant group and followed the general pattern of the heterogeneity in the abundance. On the other hand, the Copepoda, only formed by the order Cyclopoida, presented different patterns of heterogeneity in both periods. The Cladocera were rarely present. Therefore, the presence of some species or groups of zooplankton pointed to a eutrophic and instable environment, with the presence of opportunist species. Hence, the zooplankton community accompanied the gradient of environmental conditions of the reservoir with abundance and composition changes showing to be a good indicator of the environmental changes. This gradient along the main axis is common in reservoirs inasmuch as it is a transitional system, but in the Rio Grande reservoir can also have anthropic influence due to the discharge of pollutant loads or management applying algicides to water treatment. Through PCAs, the limnological variables and zooplankton characteristics divided the reservoir in three compartments inside this gradient found; such compartments vary their sizes constantly during the time showing thus a dynamic environment, but still with well-defined compartments.
- Published
- 2010
50. Assessment of the contamination impact of the soil in agricultural areas from Bom Repouso (MG) by ecotoxicological tests
- Author
-
Natália Costa de Lima, Evaldo Luiz Gaeta Espindola, Mara Mercedes de Andréa, and Ana Lucia Brandimarte
- Abstract
Nas últimas décadas tem-se verificado um significativo aumento na quantidade de contaminantes que são liberados no ambiente, destacando-se os agrotóxicos como um dos mais utilizados e nocivos. Os agrotóxicos são utilizados para o controle de doenças, pragas e plantas invasoras e, apesar de sua eficiência, seus efeitos em nível de ecossistema e saúde humana são preocupantes. No município de Bom Repouso/MG, devido à prática agrícola há intenso uso de agrotóxicos, os quais são aplicados nas lavouras de morango e batata sem controle mais efetivo, não sendo verificada nenhuma avaliação ambiental física, química e biológica, ou que incluísse os testes de toxicidade terrestres. Dentro desse contexto, o presente estudo procurou avaliar a aplicabilidade dos testes ecotoxicológicos padronizados internacionalmente para organismos terrestres, além de avaliar os impactos ambientais decorrentes das atividades agrícolas no município de Bom Repouso. Para tanto, ensaios de toxicidade (testes de evitamento, toxicidade aguda e crônica) com a espécie Eisenia andrei (ANNELIDA, OLIGOCHAETA), além de análises físicas e químicas, foram realizados com amostras de solo coletadas nas monoculturas de morango e batata, e em área de mata preservada. Nas análises físicas e químicas dos solos foram detectadas concentrações de metais e agrotóxicos em concentrações abaixo de valores orientadores definidos em legislação vigente, ressaltando-se que ambos também ocorreram em áreas de mata preservada. Elevadas concentrações de alumínio foram detectadas nos solos, porém não existem valores orientadores estabelecidos e provavelmente são características do tipo de solo da área de estudo. Não foi verificada toxicidade aguda aos organismos-teste, enquanto que nos testes de evitamento verificou-se que os organismos evitaram os solos de área de cultivo de morango e batata, preferindo os da mata; porém não é possível afirmar se esse resultado se deve à presença de contaminantes ou às propriedades físicas e químicas dos solos. Em relação aos efeitos subletais, a perda de peso não foi caracterizada como efeito de toxicidade, e os efeitos sobre a reprodução, para a maioria dos solos testados, não foram significativos, com exceção de duas amostras coletadas em área de mata e uma amostra de área de batata. Este resultado pode ter sido influenciado pelas concentrações de agrotóxicos não detectados (mas identificados em estudos anteriores), embora as características ácidas do solo também possam ter maior representatividade. Especificamente para as áreas de mata, as concentrações de alumínio detectadas nos solos e a dificuldade de ajuste de umidade provavelmente também influenciaram os resultados. Em função dos resultados obtidos, verifica-se que ainda são necessárias alterações nos procedimentos dos testes ecotoxicológicos com organismos terrestres, com adaptações para testes com amostras de solos naturais. Em relação ao município de Bom Repouso, são evidentes os problemas ambientais decorrentes do uso de agrotóxicos, sendo necessária uma avaliação de risco que permita uma visão sistêmica da situação ambiental e de saúde dos moradores da região. In the last decades there has been a significant increase in the amount of contaminants that are released into the environment, especially pesticides as one of the most used and harmful. The pesticides are used to control diseases, plagues and invaded plants and, despite its efficiency, its effects on the ecosystem level and human health are disturbing. In the Bom Repouso/MG municipality, due to the agricultural practice, there is an intensive use of pesticides, which are applied in strawberry and potato crops without more effective control, and it is not checked any biological, chemical and physical environmental assessment, which would include tests for terrestrial toxicity. In this context, this current study sought to evaluate the applicability of ecotoxicological tests internacionally standardized for terrestrial organisms and to evaluate the environmental impacts of agricultural activities in the Bom Repouso/MG municipality. Therefore, toxicity tests (tests of avoidance, chronic and acute toxicity) with the species Eisenia andrei (ANNELIDA, OLIGOCHAETA), in addition physical and chemical analysis, were performed with soil samples collected from monocultures of strawberry and potato, in addition preserved forest. In the chemical and physical analysis of the soils were detected concentrations of metals and pesticides in concentrations below the guiding values defined in current legislation, emphasizing that both also occurred in areas of preserved forest. High concentrations of aluminum were detected in soils, but there are no established guinding values and probably these are characteristics of the soil type of the study area. It was not observed acute toxicity to the test-organisms, whereas in tests of avoidance, it was observed that the organisms avoided the soils of the cultivation of strawberry and potato, preferring the forest, but it is not possible to state whether this result is due to the presence of contaminants or the chemical and physical properties of the soils. With respect to the sub lethal effects, the weight loss was not characterized as an effect of toxicity, and the effects on reproduction, for the most soils tested, were not significant, except for the two samples collected in the forest area and one sample in the potato area. This result may have been influenced by the concentrations of pesticides not detected (but identified in previous studies), although the acid soil characteristics may also have greater representation. Specifically for the forest areas, the concentration of aluminum detected in soils and the difficulty of the moisture adjusting, probably also influenced the results. Depending on the results, it observes that are still necessary changes in the procedures ecotoxicological tests with terrestrial organisms, with adjustments for tests with samples of natural soils. With reference to the Bom Repouso municipality, are obvious the environmental problems and because of the use of pesticides, it is necessary an assessment risk that allows a systemic view of the environmental situation and of the health of region residents.
- Published
- 2010
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