Summary Objectives Rapid diagnostic tests (RDTs) are promoted for the diagnosis of malaria in many countries. The question arises whether laboratories where the current method of diagnosis is microscopy should also switch to RDT. This problem was studied in Kassala, Sudan where the issue of switching to RDT is under discussion. Methods Two hundred and three blood samples were collected from febrile patients suspected of having malaria. These were subsequently analysed with microscopy, RDT (SD Bioline P.f/P.v) and PCR for the detection and identification of Plasmodium parasites. Results Malaria parasites were detected in 36 blood samples when examined microscopically, 54 (26.6%) samples were found positive for malaria parasites by RDT, and 44 samples were positive by PCR. Further analysis showed that the RDT used in our study resulted in a relatively high number of false positive samples. When microscopy was compared with PCR, an agreement of 96.1% and k = 0.88 (sensitivity 85.7% and specificity 100%) was found. However, when RDT was compared with PCR, an agreement of only 81.2 and k = 0.48 (sensitivity 69% and specificity 84%) was found. Conclusion PCR has proven to be one of the most specific and sensitive diagnostic methods, particularly for malaria cases with low parasitaemia. However, this technique has limitations in its routine use under resource-limited conditions, such as our study location. At present, based on these results, microscopy remains the best option for routine diagnosis of malaria in Kassala, eastern Sudan. Prendre des decisions eclairees avant de passer au TDR: Une comparaison de la microscopie, du test de diagnostic rapide et des techniques moleculaires pour le diagnostic et l’identification des parasites de la malaria a Kassala, dans l’est du Soudan Objectifs: Les tests de diagnostic rapide (TDR) sont promus pour le diagnostic de la malaria dans de nombreux pays. La question se pose de savoir si les laboratoires ou la methode habituelle de diagnostic est la microscopie devraient egalement passer au TDR. Ce probleme a eteetudiea Kassala, au Soudan, ou la question du passage au TDR est en cours de discussion. Methodes: 203 echantillons de sang ont ete preleves chez des patients febriles suspectes de malaria. Ils ont ete ensuite analyses par microscopie, TDR (SD Bioline Pf/Pv) et PCR pour la detection et l’identification des parasites du genre Plasmodium. Resultats: Les parasites de la malaria ont ete detectes dans 36 echantillons de sang lorsque examines au microscope, 54 (26,6%) echantillons ont ete trouves positifs pour les parasites de la malaria par TDR et 44 echantillons etaient positifs par PCR. Une analyse supplementaire a revele que le TDR utilise dans notre etude a menea un nombre relativement eleve d’echantillons faux positifs. Lorsque la microscopie a ete comparee a la PCR, une concordance de 96,1% avec un k = 0,88 (sensibilite: 85,7%, specificite: 100%) a ete trouvee. Toutefois, lorsque le TDR a ete comparea la PCR, une concordance de seulement 81,2% avec un k = 0,48 (sensibilite: 69%, specificite: 84%) a ete trouvee. Conclusion: La PCR s’est averee etre l’une des methodes les plus specifiques et sensibles pour le diagnostic, en particulier pour les cas de malaria avec une parasitemie faible. Cependant, cette technique a des limites dans son utilisation de routine dans des conditions de ressources limitees, telles que dans notre lieu d’etude. A l’heure actuelle, sur base de ces resultats, la microscopie reste la meilleure option pour le diagnostic de routine de la malaria a Kassala, dans l’est du Soudan. Mots-cles: malaria, diagnostic, Soudan, microscopie, TDR Toma de decision informada antes de cambiar a una prueba de diagnostico rapido: Una comparacion de microscopia, prueba de diagnostico rapido y tecnicas moleculares para el diagnostico y la identificacion de parasitos de malaria en Kassala, nororiente de Sudan Objetivos: Las pruebas de diagnostico rapidas (PDR) son promovidas como medio para el diagnostico de la malaria en muchos paises. La pregunta es si aquellos laboratorios en los que existe actualmente microscopia deberian tambien cambiarse a las PDR. Este problema ha sido estudiado en Kassala, Sudan, en donde se esta discutiendo actualmente la cuestion sobre si cambiar o no a las PDR. Metodos: Se recogieron 203 muestras de sangre de pacientes con fiebre y sospecha de malaria. Estos fueron analizados mediante microscopia, PDR (SD Bioline P.f/P.v) y PCR para la deteccion e identificacion de parasitos de Plasmodium. Resultados: Se detectaron parasitos de malaria en 36 muestras de sangre examinadas mediante microscopia, 54 (26.6%) muestras dieron positivas para parasitos de malaria mediante PDR, y 44 muestras dieron positivas por PCR. Analisis subsecuentes mostraron que las PDR utilizadas en nuestro estudio daban un numero relativamente alto de falsos positivos. Cuando se comparo la microscopia con las PCR, se observo una concordancia del 96.1%, k=0.88 (sensibilidad del 85.7%, especificidad del 100%). Sin embargo, cuando se compararon las PDR con las PCR, se observo una concordancia de tan solo 81.2%, k=0.48 (sensibilidad 69%, especificidad 84%). Conclusion: La tecnica de la PCR ha demostrado ser uno de los metodos diagnosticos mas especificos y sensibles, particularmente para los casos de malaria con baja parasitemia. Sin embargo, esta tecnica tiene limitaciones en su uso rutinario bajo condiciones con recursos limitados, tales como el emplazamiento de nuestro estudio. Por el momento, y basandose en estos resultados, la microscopia continua siendo la mejor opcion para el diagnostico rutinario de malaria en Kassala, Sudan. Palabras clave: Malaria, Diagnostico, Sudan, Microscopia, prueba de diagnostico rapido.