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This study aimed to determine the intensity, seasonality, and distribution by genera of, as well as to identify phenotypic markers of susceptibility to, gastrointestinal parasites among sheep on farms within the Brazilian savanna (cerrado) biome. We evaluated 1271 sheep, on seven farms, during the rainy season (in December 2017 and December 2018) and dry season (in July 2018 and July 2019). Parasitological evaluation was based on culture and EPG. We calculated hematocrit, as well as the body condition score and feces score. Of the sheep evaluated, 34.15% had moderate-to-severe parasitic infection. The factors of herds’ phenotypic characterization about helminth infections were (p ≤ 0.05 for all): anemia (OR = 5.72); leanness (OR = 1.80); loose stools or diarrhea (OR = 1.54); breed other than Santa Inês (OR = 2.31); “weaned lamb” category (OR = 4.76); “lambing ewe” category (OR = 4.66); and dry season (OR = 2.37). Haemonchus, Trichostrongylus, Oesophagostomum, and Cooperia accounted for 76.40%, 20.23%, 2.89%, and 0.47%, respectively, of the helminth genera identified, with their proportional distributions being comparable between the rainy and dry seasons. Changes in health management, with regard to helminth infection control, are urgently needed in order to combat the disease more effectively and sustainably. Resumo A presente pesquisa objetivou determinar a intensidade, sazonalidade, predominância de gêneros e marcadores fenotípicos às parasitoses gastrointestinais em fazendas de criação de ovinos do Distrito Federal, no bioma cerrado brasileiro. Foram avaliados 1.271 ovinos oriundos de sete propriedades, durante os períodos chuvoso (dezembro de 2017 e dezembro de 2018) e seco (julho de 2018 e julho de 2019). Procedeu-se a avaliação parasitológica por coprocultura e OPG, dosagem de hematócrito, escore de condição corporal e de fezes. Dos indivíduos avaliados, 34,15% deles apresentaram infecção parasitária moderada a grave. Os fatores de caracterização fenotípica dos rebanhos quanto às infecções helmínticas (p ≤ 0,05), foram: anemia (OR = 5,72),magreza (OR = 1,80), fezes pastosas/diarreicas (OR = 1,54), raças distintas à raça Santa Inês (OR = 2,31), categorias de produção animal “jovens” (OR = 4,76) e “fêmeas paridas” (OR = 4,66), e período seco (OR = 2,37). Haemonchus, Trichostrongylus, Oesophagostomum e Cooperia foram os gêneros de helmintos observados nas seguintes proporções: 76,40%, 20,23%, 2,89% e 0,47%, respectivamente, sem distinção em sua distribuição entre os períodos chuvoso e seco. Mudanças no manejo sanitário com relação às helmintoses são urgentemente necessárias, para um controle da doença de forma mais eficaz e sustentável.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2020. Os parasitos gastrointestinais são considerados os maiores entraves à produção de ovinos nas regiões tropicais, sendo o maior problema sanitário na criação de pequenos ruminantes no Brasil. Um grande desafio aos sistemas de criação de ovinos é o controle das parasitoses gastrointestinais de forma eficaz, racional e com baixo impacto econômico e sanitário. A presente pesquisa objetivou determinar a intensidade, sazonalidade, predominância de gêneros, comportamento clínico dos animais e relação entre marcadores fenotípicos característicos de maior ocorrência de infecção às parasitoses gastrointestinais, assim como a aplicabilidade do método Famacha© como ferramenta auxiliar no diagnóstico presuntivo de verminoses em ovinos criados no Distrito Federal, no bioma cerrado brasileiro. Foram avaliadas sete propriedades, localizadas na região, bioma típico de cerrado, com uma amostragem total de 1.440 ovinos, nos meses de dezembro de 2017, julho de 2018, dezembro de 2018 e julho de 2019, meses representantes dos dois períodos climáticos típicos da região do Distrito Federal, úmido (dezembro) e seco (julho), respectivamente. Procedeu-se a avaliação coproparasitológica por meio de OPG e coprocultura, assim como avaliação de hematócrito (Ht), dosagem de proteínas plasmáticas totais, classificação dos escores Famacha©, de condição corporal e de fezes. As referidas variáveis foram submetidas à análise estatística descritiva, considerando-se o intervalo de confiança de 95%, e análises univariadas, tendo como variável dependente OPG categorizado, por meio dos testes Qui- Quadrado e Exato de Fisher. Variáveis que apresentaram valor p≤0,20, foram submetidas à análise de regressão logística múltipla, considerando-se como estatisticamente significativas as que apresentaram valor p≤0,05 no modelo final. Para avaliação da eficácia do método Famacha©, sensibilidade, especificidade, valores preditivos positivo e negativo foram calculados, assim como os coeficientes de correlação de Pearson, entre as variáveis Famacha©, Ht e OPG nas distintas categorias de produção e raças. Dois pontos de corte foram utilizados para classificação dos animais como doentes: Ht menor que 18% e Famacha© 4 e 5; hematócrito menor que 22% e Famacha© 3, 4 e 5. Dos 1.440 indivíduos avaliados, 34,24% deles apresentaram infecção parasitária moderada a grave (OPG da ordem Strongylida ≥ 800), observados em maiores proporções nos períodos secos. Semelhantemente, animais com escore corporal 1 e 2 (magros), também concentraram-se nos meses de julho avaliados. Quanto ao modelo de regressão logística, magreza (OR=1,63), anemia (OR=4,15), fezes pastosas ou diarreicas (OR=1,53), raças distintas à raça Santa Inês (OR=2,34), dosagem de proteínas totais menores ou iguais a 7.9g/dL (OR=3,15), categorias de produção animal “jovens” (OR=3,95) e “fêmeas paridas” (OR=4,78), assim como o período seco (OR=2,24), foram considerados marcadores fenotípicos característicos de maior ocorrência de infecção parasitária moderada a grave em ovinos criados no cerrado brasileiro (p≤0,05). Cinco foram os de gêneros de helmintos observados nos animais avaliados, Haemonchus spp. (68,83%), Trichostrongylus spp. (16,51%), Strongyloides spp. (11,84%), Oesophagostomum spp. (2,52%) e Cooperia spp. (0,24%), os quais apresentaram-se em proporções semelhantes tanto no período chuvoso quanto no seco. Destaca-se, como gênero predominante entre os grupos de animais avaliados e períodos, o Haemonchus spp. Cerca de 80% dos animais foram classificados com escores Famacha© 1 ou 2. Independentemente de categorias de produção ou raças, o teste apresentou maior sensibilidade quando considerou como doentes animais com escores Famacha© 3, 4 e 5 e hematócrito

Resumen El objetivo de esta investigación fue determinar la variabilidad genética de las poblaciones de gatos domésticos (Felis catus) utilizando genes que codifican la coloración, el diseño y la longitud del pelaje en Coveñas, Sucre, Colombia. Se realizaron muestreos aleatorios entre septiembre y diciembre de 2014, en 187 animales adultos presentes en cinco barrios de Coveñas, donde se caracterizó fenotípicamente cada animal. La nomenclatura utilizada está en concordancia con el Committee Standardized Genetic Nomenclature For Cats (1968), y atiende a los marcadores autosómicos de codificación morfológica: el locus ligado al sexo Orange (O) y los loci autosómicos non-agouti (a), tabby blotched (Tb), dilution (d), long hair (l) spotting white (s) y dominant white (W). Se calcularon los parámetros genéticos poblacionales: frecuencia alélica, diversidad genética, flujo génico, equilibrio Hardy-Weinberg y distancia genética, y se infirieron las relaciones filogenéticas entre las poblaciones de gatos. Se encontró que el marcador non-agouti fue el de mayor frecuencia, mientras los genes tabby blotched y dominant white presentaron los valores más bajos. La mayor parte de la diversidad genética se encontró dentro de las poblaciones (HS) y poca entre las poblaciones (D) y un elevado flujo génico. Se observó un exceso de heterocigotos en la población. No hubo equilibrio Hardy-Weinberg. Las poblaciones se encuentran muy relacionadas genéticamente. Además, se evidenció una posible selección natural y artificial del locus non-agouti. Abstract This research aimed to determine genetic variability in domestic cat populations (Felis catus) using genes that codify the coloration, design and length of the coat in Coveñas, Sucre, Colombia. Random samples were collected between September and December 2014 from 187 adult animals in five neighborhoods of Coveñas, and each animal was characterized phenotypically. The nomenclature used in this research follows the Standardized Genetic Nomenclature for the Domestic Cat (1968), and examines the autosomal markers of morphological coding: the locus linked to sex Orange (O) and the autosomal loci Non-agouti (a), tabby blotched (Tb), dilution (d), long hair (l) spotting white (s) and dominant white (W). The genetic parameters of the population were calculated: allele frequency, genetic diversity, gene flow, Hardy-Weinberg equilibrium, and genetic distance; and phylogenetic relationships among cat populations were inferred. It was found that the Non-agouti marker was the most frequent, while the tabby blotched and dominant white genes had the lowest values. Most genetic diversity was found within the studied populations (HS), with little diversity between populations (D), and high gene flow was evidenced. An excess of heterozygotes was observed in the population. There was no Hardy-Weinberg equilibrium. Populations are genetically closely related. In addition, a possible natural and artificial selection of the Non-agouti locus was evidenced. Resumo O objetivo desta pesquisa foi determinar a variabilidade genética das populações de gatos domésticos (Felis catus) utilizando genes que codificam a coloração, o desenho e a longitude da pelagem em Coveñas, Sucre, na Colômbia. Realizaram-se amostras aleatórias entre setembro e dezembro de 2014, em 187 animais adultos presentes em cinco bairros de Coveñas, onde se caracterizou fenotipicamente cada animal. A nomenclatura utilizada está em concordância com o Committee Standardized Genetic Nomenclature For Cats (1968), e atende a os marcadores autossômicos de codificação morfológica: o locus ligado a sexo Orange (O) e os loci autossômicos Non-agouti (a), tabby blotched (Tb), dilution (d), long hair (l) spotting white (s) e dominant white (W). Calcularam-se os parâmetros genéticos populacionais: frequência alélica, diversidade genética, fluxo génico, equilíbrio Hardy-Weinberg e distância genética, e se inferiram as relações filogenéticas entre as populações de gatos. Constatou-se que o marcador Non-agouti foi o de maior frequência, e enquanto que os genes tabby blotched e dominant white apresentaram os valores mais baixos. A maior parte da diversidade genética foi encontrada dentro das populações (HS) e pouca entre as populações (D) e um elevado fluxo génico. Observouse um excesso de heterozigotos na população. Não houve equilíbrio Hardy-Weinberg. As populações encontram-se muito relacionadas geneticamente. Além do mais, evidenciou-se uma possível seleção natural e artificial do locus Non-agouti.

The aim of this study was to determine the genetic variability of populations of domestic cats (Felis catus) using genes that encode color, design and length of pelage in Magangué, Bolivar, Colombia. A total of 297 cats were phenotyped by direct observations made on tours through urban areas in Magangué, providing the phenotypic markers: Orange, Agouti, Tabby, Dilution, Long hair, Spotting white y Dominant white. Population genetic parameters were calculated: allele frequencies, genetic diversity, gene flow, Hardy-Weinberg equilibrium and genetic distance and phylogenetic relationships among cat populations were inferred. The non-agouti marker was the most frequent, while Tabby blotched and Dominant white gene had the lowest values. Most of the genetic diversity was found within populations and low among populations as well as high gene flow. An excess of heterozygotes was observed at the population level and there was no Hardy-Weinberg equilibrium. The populations are highly genetically related and was evidenced a possible natural and artificial selection of the Non-agouti and Spotting white markers. El objetivo de este trabajo fue determinar la variabilidad genética de las poblaciones de gatos domésticos (Felis catus) utilizando genes que codifican la coloración, el diseño y longitud del pelaje en Magangué, Bolívar-Colombia. Un total de 297 gatos fueron fenotipados mediante observaciones directas realizados en recorridos por las zonas urbanas en Magangué, atendiendo a los marcadores fenotípicos: Orange, Agouti, Tabby, Dilution, Long hair, Spotting white y Dominant white. Se calcularon los parámetros genéticos poblacionales: frecuencia alélica, diversidad genética, flujo génico, equilibrio Hardy-Weinberg y distancia genética y se infirieron las relaciones filogenéticas entre las poblaciones de gatos. Se encontró que el marcador Non-agouti fue el de mayor frecuencia, mientras los genes Tabby blotched y Dominant white presentaron los valores más bajos. La mayor parte de la diversidad genética se encontró dentro de poblaciones y poca entre poblaciones, así como un elevado flujo génico. Se observó un exceso de heterocigotos a nivel poblacional y no hubo equilibrio Hardy-Weinberg. Las poblaciones se encuentran muy relacionadas genéticamente; además se evidenció una posible selección natural y artificial de los marcadores Non-agouti y Spotting white.

El objetivo del estudio fue determinar la diversidad y la estructura genética de las poblaciones de gatos domésticos (Felis catus) mediante los genes del pelaje en Cartagena, Colombia. Se determinó el fenotipo de 472 gatos mediante observaciones directas en recorridos por las zonas urbanas de Cartagena utilizando la nomenclatura recomendada por el Committee on Standardized Genetic Nomenclature for Cats (1968) para los marcadores fenotípicos Orange, Agouti, Tabby, Dilution, Long hair, Spotting white y Dominant white. Se calcularon los parámetros genéticos de frecuencia alélica, diversidad genética, flujo génico, equilibrio de Hardy-Weinberg y distancia genética, y se infirieron las relaciones filogenéticas entre las poblaciones de gatos. El marcador non-Agouti fue el de mayor frecuencia, mientras que los genes Tabby blotched y Dominant white presentaron los valores más bajos. Se reportó la presencia del alelo Tabby abissynian en Cartagena. La mayor parte de la diversidad genética se encontró dentro de las poblaciones (), y fue poca entre las poblaciones (); se observó un elevado flujo génico y un exceso de heterocigotos, y no hubo equilibrio de Hardy-Weinberg. Las poblaciones estaban muy relacionadas genéticamente, y se evidenció, además, una posible selección natural y artificial de los marcadores non-Agouti y Tabby abissynian. The aim of this work was to determine the diversity and genetic structure of domestic cat (Felis catus) populations by fur genes in Cartagena, Colombia. We established the phenotype of 472 cats through direct observations in Cartagena’s urban area using the nomenclature recommended by the Committee on Standardized Genetic Nomenclature for Cats (1968) for the phenotype markers Orange, Agouti, Tabby, Dilution, Long hair, Spotting white y Dominant white. We determined the allelic frequencies, the genetic diversity, the gene flow, the Hardy-Weinberg equilibrium, and we inferred the phylogenetic relationships. The non-Agouti marker was the most frequent, while Tabby blotched and Dominant white had the lowest values. We reported the presence of the Tabby abissynian allele in Cartagena. Most of the genetic diversity was found within populations () and few between populations (), and we observed a high gene flow and an excess of heterozygotes in the population; there was no Hardy-Weinberg equilibrium. Populations were genetically correlated, and there was evidence of a possible natural and artificial selection of the non-Agouti and Tabby abissynian markers.

El objetivo del estudio fue determinar la diversidad y la estructura genética de las poblaciones de gatos domésticos (Felis catus) mediante los genes del pelaje en Cartagena, Colombia. Se determinó el fenotipo de 472 gatos mediante observaciones directas en recorridos por las zonas urbanas de Cartagena utilizando la nomenclatura recomendada por el Committee on Standardized Genetic Nomenclature for Cats (1968) para los marcadores fenotípicos Orange, Agouti, Tabby, Dilution, Long hair, Spotting white y Dominant white. Se calcularon los parámetros genéticos de frecuencia alélica, diversidad genética, flujo génico, equilibrio de Hardy-Weinberg y distancia genética, y se infirieron las relaciones filogenéticas entre las poblaciones de gatos. El marcador non-Agouti fue el de mayor frecuencia, mientras que los genes Tabby blotched y Dominant white presentaron los valores más bajos. Se reportó la presencia del alelo Tabby abissynian en Cartagena. La mayor parte de la diversidad genética se encontró dentro de las poblaciones (), y fue poca entre las poblaciones (); se observó un elevado flujo génico y un exceso de heterocigotos, y no hubo equilibrio de Hardy-Weinberg. Las poblaciones estaban muy relacionadas genéticamente, y se evidenció, además, una posible selección natural y artificial de los marcadores non-Agouti y Tabby abissynian. The aim of this work was to determine the diversity and genetic structure of domestic cat (Felis catus) populations by fur genes in Cartagena, Colombia. We established the phenotype of 472 cats through direct observations in Cartagena's urban area using the nomenclature recommended by the Committee on Standardized Genetic Nomenclature for Cats (1968) for the phenotype markers Orange, Agouti, Tabby, Dilution, Long hair, Spotting white y Dominant white. We determined the allelic frequencies, the genetic diversity, the gene flow, the Hardy-Weinberg equilibrium, and we inferred the phylogenetic relationships. The non-Agouti marker was the most frequent, while Tabby blotched and Dominant white had the lowest values. We reported the presence of the Tabby abissynian allele in Cartagena. Most of the genetic diversity was found within populations () and few between populations (), and we observed a high gene flow and an excess of heterozygotes in the population; there was no Hardy-Weinberg equilibrium. Populations were genetically correlated, and there was evidence of a possible natural and artificial selection of the non-Agouti and Tabby abissynian markers.

En varios estudios se ha sugerido que variables como la intervención humana y el tiempo no generan cambios estadísticamente significativos en los perfiles genéticos de las poblaciones del gato doméstico, lo cual explicaría por qué la mayoría se encuentra en panmixia. Sin embargo, en pocos estudios se ha determinado el perfil genético de ciertas poblaciones más de dos veces en un lapso de varios años, por lo que no hay argumentos suficientes para concluir que el tiempo no afecta significativamente los perfiles de las poblaciones. Además, debe mencionarse que existen diferentes procesos estocásticos que actúan sobre cada uno de ellos. Ahora bien, la ciudad de Cali, Colombia, es una de las pocas en Latinoamérica en donde se ha establecido el perfil genético de los gatos en varias ocasiones (1999 y 2012). En el presente estudio se hizo un muestreo para establecer el perfil genético de dicha población durante el 2015. Se hicieron comparaciones mediante pruebas de chi cuadrado entre los periodos mencionados (1999 Vs. 2012, 1999 Vs. 2015 y 2012 Vs. 2015), y se estableció que no hubo cambios estadísticamente significativos entre ellos, aunque se registraron variaciones considerables en las frecuencias de los alelos White Spotting (S) y siamese (cs). Por otro lado, el árbol de distancias genéticas dendograma demostró que los perfiles de los años 2012 y 2015 fueron más similares en comparación con el de 1999. En este contexto, se sugiere que los efectos estocásticos, así como los de la selección humana y el factor tiempo son despreciables. Several studies have suggested that variables such as human intervention and time do not generate statistically significant changes in the genetic profiles of domestic cat populations, which would explain why most are in panmixia. However, few studies have determined the genetic profile of certain populations more than twice over a period of several years, so there is insufficient evidence to conclude that time does not affected population profiles significantly. Also, it should be mentioned that there are different stochastic processes acting on each of these. The city of Cali, Colombia, is one of the few Latin American cat populations whose genetic profile has been established on several occasions (1999 and 2012). Therefore, in the present study we conducted a sampling to establish the genetic profile of this population during 2015. We compared the above-mentioned periods through chi-square tests, and we established that there were no statistically significant changes among them. However, there were considerable variations in the allele frequencies of White Spotting (S) and siamese (cs). On the other hand, the genetic distances tree dendogram showed that 2012 and 2015 profiles were more similar than the 1999 profile. In this context, it is suggested that the stochastic effects, the human selection, and time were despicable.

Poster apresentado na 1ª Conferência do Instituto Nacional de Medicina Legal e Ciências Forenses, 30 a 31 de Outubro de 2014, Coimbra, Portugal Os marcadores fenotípicos, do tipo SNP, têm vindo a ser estudados por vários grupos a nível mundial, pelo que começam a ser conhecidos marcadores para características fenotípicas não só para a cor dos olhos, mas também para a cor do cabelo e pele, os quais podem fornecer um conjunto valioso de informação para a identificação do dador da amostra em estudo. Este tipo de informação poderá ser tanto mais relevante se o dador da amostra possuir características fenotípicas que o distingam da população na qual se encontra inserido. Neste trabalho, foi estudada uma amostra de uma peça museológica com interesse histórico-científico que exemplifica como este tipo de novas metodologias poderá ter interesse em áreas como a investigação criminal ou como a antropologia física. N/A

El objetivo de este trabajo fue determinar la variabilidad genética de las poblaciones de gatos domésticos (Felis catus) utilizando genes que codifican la coloración, el diseño y longitud del pelaje en Magangué, Bolívar-Colombia. Un total de 297 gatos fueron fenotipados mediante observaciones directas realizados en recorridos por las zonas urbanas en Magangué, atendiendo a los marcadores fenotípicos: Orange, Agouti, Tabby, Dilution, Long hair, Spotting white y Dominant white. Se calcularon los parámetros genéticos poblacionales: frecuencia alélica, diversidad genética, flujo génico, equilibrio Hardy-Weinberg y distancia genética y se infirieron las relaciones filogenéticas entre las poblaciones de gatos. Se encontró que el marcador Non-agouti fue el de mayor frecuencia, mientras los genes Tabby blotched y Dominant white presentaron los valores más bajos. La mayor parte de la diversidad genética se encontró dentro de poblaciones y poca entre poblaciones, así como un elevado flujo génico. Se observó un exceso de heterocigotos a nivel poblacional y no hubo equilibrio Hardy-Weinberg. Las poblaciones se encuentran muy relacionadas genéticamente; además se evidenció una posible selección natural y artificial de los marcadores Non-agouti y Spotting white., The aim of this study was to determine the genetic variability of populations of domestic cats (Felis catus) using genes that encode color, design and length of pelage in Magangué, Bolivar, Colombia. A total of 297 cats were phenotyped by direct observations made on tours through urban areas in Magangué, providing the phenotypic markers: Orange, Agouti, Tabby, Dilution, Long hair, Spotting white y Dominant white. Population genetic parameters were calculated: allele frequencies, genetic diversity, gene flow, Hardy-Weinberg equilibrium and genetic distance and phylogenetic relationships among cat populations were inferred. The non-agouti marker was the most frequent, while Tabby blotched and Dominant white gene had the lowest values. Most of the genetic diversity was found within populations and low among populations as well as high gene flow. An excess of heterozygotes was observed at the population level and there was no Hardy-Weinberg equilibrium. The populations are highly genetically related and was evidenced a possible natural and artificial selection of the Non-agouti and Spotting white markers.