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A antracnose, causada por Colletotrichum gloeosporioides, é uma importante doença da pinha (Annona squamosa) no Brasil e em nível mundial. Devido à inexistência de métodos padronizados para quantificação dessa doença, foi desenvolvida uma escala diagramática com níveis de 1, 2, 5, 10, 20 e 40% de área foliar lesionada. A escala diagramática foi validada por 10 avaliadores, baseado em 48 folhas de pinha com diferentes níveis de severidade da antracnose, mensurados previamente com o programa Assess®. A acurácia, a precisão e a reprodutibilidade das estimativas de cada avaliador foi determinada por regressão linear simples entre a severidade real e a estimada, com e sem o auxílio da escala. Com a escala, os avaliadores obtiveram melhores níveis de acurácia e precisão das estimativas, com os erros absolutos concentrando-se na faixa de 10%. Os avaliadores apresentaram elevada repetibilidade (91%) e reprodutibilidade (³90% em 94,5% dos casos) das estimativas com a utilização da escala. Portanto, a escala diagramática proposta é adequada para avaliação da severidade da antranose da pinha. Anthracnose caused by Colletotrichum gloeosporioides is an important disease of custard apple (Annona squamosa) in Brazil and worldwide. Due to the inexistence of standard methods for the assessment of that disease, a diagrammatic scale was developed with 1, 2, 5, 10, 20 and 40% of diseased leaf area. The diagrammatic scale was validated by 10 raters using 48 custard apple leaves with different levels of anthracnose severity previously measured by the software Assess®. The accuracy, precision and reproducibility estimative of each rater were determined by simple linear regression between actual and estimated severity, with and without the use of the scale. With the scale, the raters obtained better levels of accuracy and precision, with absolute errors concentrating around 10%. Raters showed high repeatability (91%) and reproducibility (³90% in 94.5% of the cases) of the estimates by using the scale. The proposed diagrammatic scale is suitable for the evaluation of anthracnose severity in custard apple.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico The Cercospora leaf spot is considered an emergent disease in the coffee culture. However there is little information about the biology and ecology of the causal agent, Cercospora coffeicola. The aim of this study was to characterize the variability of pathogens populations associated to coffee trees in both conventional and organic systems in three Minas Gerais regions. A hierarchical sampling plan was performed with the following levels: 1. State geographical regions (Sul, Triângulo, and Mata); 2.Crop system (organic and conventional); 3. Plantings. Out of 420 monosporic isolates collected, 90 were randomly selected. To characterize the variability, two markers were used: vegetative compatibility and production of cercosporin in vitro. Vegetative compatibility was estimated by the use of nit mutants, auxotrophic mutants unable to use nitrate as the only nitrogen source. Twenty eight vegetative compatibility groups (VCG) were identified through complementary tests. Out of the 28 VCG s, 10 were multimembers and included 56,6% of the isolates and 18 included just one isolate that were restricted to specific plantings. Considering the distribution of VCG s among the levels studied, a variance analysis was implemented and a diversity index was estimated. Higher part of variation found (92.05%) was attributed to isolate. There was no difference in diversity for the levels we analyzed. Members of one VCG occurred in the three regions, whereas members of other groups occurred in one or two regions. At in vitro assays, the production of cercosporin was evaluated, and the concentration ranged from 1.71 to 35.327 μMol/isolate. The percentage of total variance among isolates was 1.9, 7.8, and 48.9% for region, plantings and isolates levels, respectively. No effect of crop system (P=0.88) was detected in the variability. Dissimilarity measures were estimated among isolates (Malahanobis index) and the Unweighted pair-group method with arithmetical averages (UPGMA) was performed to determine groups of similar cercosporin production (CPG). Isolates with an low and median levels of production of predominated in the population. Considering the markers used, there are evidences that the studied population has a high variability and the region, crop system and plantings have no effect on the variability. A cercosporiose é considerada uma doença emergente na cafeicultura. Entretanto, há pouca informação sobre a biologia e ecologia do agente etiológico, Cercospora coffeicola. Para caracterizar a variabilidade de populações do patógeno associadas a cafeeiros nos sistemas convencional e orgânico em três regiões de Minas Gerais, efetuou-se um plano de amostragem hierarquizado com os seguintes níveis: 1. Região (Sul, Triângulo e Mata); 2. Sistema de cultivo (orgânico e convencional); 3. Lavouras. De 420 isolados monospóricos obtidos, selecionaram-se, aleatoriamente, 90 para o estudo. Para caracterizar a variabilidade, utilizaram-se dois marcadores: compatibilidade vegetativa e produção in vitro de cercosporina. Avaliou-se a compatibilidade vegetativa pelo emprego de mutantes auxotróficos incapazes de utilizar nitrato como única fonte de nitrogênio (Mutantes nit). Por meio de testes de complementação, identificaram-se 28 grupos de compatibilidade vegetativa (GCV). Dos 28, 10 foram multimembros, com 56,6% dos isolados, enquanto 18 constituíram-se por apenas um isolado, sendo restritos a lavouras específicas. Com base na distribuição dos GCVs entre os níveis estudados, efetuou-se análise de variância e estimaram-se índices de diversidade. Atribuiu-se a maior parte da variação encontrada (92,05%) a isolado. Não houve diferença quanto à diversidade para os níveis estudados. Apenas membros de um GCV ocorreram nas três regiões, e os membros dos demais GCVs ocorreram em uma ou duas regiões. Em ensaios in vitro, avaliou-se a produção de cercosporina, que variou de 1,71 a 35,327 μMol por isolado. O percentual em relação à variância total entre isolados foi de 1,9; 7,8 e 48,9% para os níveis região, lavoura e isolados, respectivamente. Não se detectou efeito do sistema de cultivo (P=0,88) na variabilidade. Estimaram-se medidas de dissimilaridade entre isolados (índice de Malahanobis) e procedeu-se à análise de agrupamento (UPGMA) para definir grupos de produção similar de cercosporina (GPC). Isolados com produção média e mínima de cercosporina predominaram na população. Com base nos marcadores utilizados, há evidências de que a população estudada tem alta variabilidade, a qual não é afetada por região, sistema de cultivo e lavoura.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Dentre as aplicações de computadores, em Fitopatologia, destacam-se os Sistemas Especialistas (SE), com ênfase na diagnose de doenças de várias culturas. Na cultura da batata, ocorrem vários problemas fitossanitários, principalmente doenças, que, não raro, são de difícil diagnose. Há deficiência de ferramentas informatizadas para a diagnose destes problemas. Assim, desenvolveu-se um SE para diagnose de doenças da batateira, que objetiva dar suporte a técnicos da extensão, na tomada de decisão, e auxiliar a docentes, como ferramenta educativa. Dividiu-se o desenvolvimento do SE em cinco fases independentes: i) seleção do problema; ii) aquisição do conhecimento; iii)organização do conhecimento e desenvolvimento do protótipo; iv) desenvolvimento do SE completo; e v) avaliação. O SE, denominado Sistema Especialista para Diagnose de Doenças da Batateira (SEDDB), contém 60 perguntas, 104 regras, 150 fotografias, glossário com 45 termos, e auxilia no diagnóstico de 33 doenças. Na construção do protótipo do SE, consultaram-se seis especialistas em doenças da batateira e utilizou-se o shell Expert Sinta, para verificação da lógica interna, e o software Delphi ® (versão 6.0), para o desenvolvimento da interface. Na fase de validação, participaram 54 estudantes, entre pós-graduandos em Fitopatologia e agronomandos. Os pós-graduandos tiveram índice de acerto médio na diagnose de 57,02% e de 73,00%, sem e com a utilização do SEDDB, respectivamente. Com o uso do SEDDB, os agronomandos obtiveram acerto médio de 69,14%, superior àquele obtido pelos pós-graduandos, sem a utilizarem o SE, na diagnose do mesmo grupo de doenças. Expert Systems (ES) are being used in plant pathology, mostly to diagnosis various crop diseases. Potato plants are subjected to several important helth problems, especially diseases that quite frequently are difficult to diagnose. There is few computer tools specially designed to diagnosis potato diseases. Therefore an ES was development to diagnosis potato diseases, aiming to help extension agents, as a decision tool, and plant pathology lecturers, as an educational tool. The development of the ES, planned to help diagnosing of 33 diseases, was divided into five independent phases: i) problem selection; ii) acquisition of the knowledge; iii) organization of the knowledge and prototype development; iv) ES development; and v) ES evaluation. The ES, called Expert System to Diagnosis Potato Plant Diseases (SEDDB), includes 60 queries, 104 rules, 150 photographs, and a glossary with 45 terms. Throughout SEDDB construction, six specialists in potatoes diseases were consulted. The ES internal logic verification was through the shell Expert Sinta and the interface development was using the software Delphi ® (version 6.0). A total of 54 MS students in Plant Pathology and Agronomy undergraduate students participated in the ES validation. The graduate student’s accuracy in diagnosing diseases was 57,02% and 73,00%, with and without using SEDDB, respectively. To diagnose the same group of diseases, the undergraduate student’s accuracy using SEDDB was 69,14%, which was higher than graduate student’s accuracy without using the ES.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2019-05-14T16:36:44Z No. of bitstreams: 1 Marthony Dornelas Santana.pdf: 1091075 bytes, checksum: 9978e3c54d56318d30e4dca3dd313685 (MD5) Made available in DSpace on 2019-05-14T16:36:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marthony Dornelas Santana.pdf: 1091075 bytes, checksum: 9978e3c54d56318d30e4dca3dd313685 (MD5) Previous issue date: 2018-02-23 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Leaf spots are one of the main problems affecting the cassava production, especially brown leaf spot (BLS) and blight leaf spot (BliLS) caused by Passalora henningsii and Passalora vicosae, respectively. The occurrence of these leaf spots in commercial areas in the northeastern region of Brazil, mainly in the state of Pernambuco, and the absence of information demonstrate the need for further studies on these diseases. In this study, the effect of temperature and luminosity on conidial growing/germination was evaluated in vitro. The range of temperature that was favorable to the growth of P. vicosae was broader than P. henningsii. This is an intrinsic characteristic of the pathogen that allows the disease to develop in different seasons and growing regions. The percentage of germination of conidia was reduced in the presence of light for P. vicosae, whereas for P. henningsii the germination was similar both in the presence or absence of light. To better understand the behavior of the diseases, a comparative epidemiology of BLS and BliLS was performed in growing areas in the regions of the Agreste and Zona da Mata of Pernambuco. The results demonstrated that BLS occurs more frequently in the Agreste, whose temperatures are lower and the humidity is high. In the Zona da Mata, with higher temperatures during the evaluation period, there was predominance of BliLS. Levels of severity were highest in the lower leaves, and were correlated with the increase of the age of the plants. Defoliation occurred earlier in the Agreste than in Zona da Mata, reaching similar levels in both regions (25% in all growing areas). Both BLS and BliLS severity were reduced by application of the fungicide flutriafol, showing that the chemical control may be a strategy to control these leaf spots. In general, the results obtained in this study allow a better understanding of the epidemiology of BLS and BliLS, which are little studied diseases. The information may be useful in the development of management strategies aiming to reduce the damage caused by these diseases in the cassava crop. As manchas foliares são um dos principais problemas na cultura da mandioca, com destaque para a mancha parda (MP) e a queima das folhas (QF), causadas por Passalora henningsii e Passalora vicosae, respectivamente. A ocorrência destas manchas foliares em plantios comerciais na região Nordeste, particularmente no estado de Pernambuco, aliada à escassez de informações, demonstram a necessidade de estudos mais aprofundados acerca destas doenças. Neste trabalho foi realizado um estudo in vitro a fim de avaliar o efeito da temperatura e luminosidade sobre o crescimento/germinação dos conídios. Foi verificado que de P. vicosae apresenta uma faixa mais ampla de temperatura favorável ao seu crescimento, quando comparado à P. henningsii. Esta característica, intrínseca do patógeno, permite que a doença se desenvolva em diferentes épocas do ano e em diferentes regiões de cultivo. Além disso, foi verificado que conídios de P. vicosae apresentaram redução na porcentagem de germinação na presença de luz, enquanto para P. henningsii não houve qualquer influência, apresentando germinação similar tanto na presença quanto na ausência de luz. A fim de entender melhor o comportamento das doenças, foi realizado um estudo de epidemiologia comparativa da MP e QF em áreas de cultivo nas regiões do Agreste e Zona da Mata de Pernambuco. De modo geral, os resultados demonstraram a maior ocorrência de MP no Agreste, onde predominam temperaturas médias mais baixas e umidade elevada. Já na Zona da Mata, onde as temperaturas foram mais elevadas ao longo de todo o período de avaliação, houve predominância da QF. Para ambas as doenças, os maiores níveis de severidade foram observados nos estratos inferiores das plantas, estando correlacionados também com o aumento da idade das plantas. A desfolha ocorreu mais precocemente no Agreste do que na Zona da Mata, mas atingiu níveis similares em ambas as regiões, chegando a 25% em todas as áreas de cultivo analisadas. Tanto MP quanto QF foram reduzidas pela aplicação do fungicida flutriafol, mostrando que o controle químico pode ser uma estratégia de controle destas manchas foliares. De modo geral, os resultados obtidos neste estudo permitem o melhor entendimento da epidemiologia da MP e QF, que são doenças ainda pouco estudadas. As informações geradas poderão ser úteis no desenvolvimento de estratégias de manejo, que visem reduzir os danos causados por essas doenças na cultura da mandioca.

Coriander (Coriandrum sativum L.) is one of the main hardwoods produced in the rugged region of Alagoas. It is a seasoning olive grove that has antibacterial, antifungal and antioxidant properties. In recent years farmers in the region have faced reduced production due to death of seedlings, which have necrotic lesions in the cervix and roots. In recent works the pathogenicity of the following species found in association with diseased plants: Rhizoctonia solani, Pythium irregulare, Fusarium inflexum, F. lacertarum and F. falciforme have been demonstrated. However, their relative importance as phytopathogens was not estimated, nor were management alternatives prospected. Thus, the objectives of this work were: to verify the virulence of previously characterized phytopathogenic isolates and to evaluate the efficiency of two management strategies: genetic resistance of commercial varieties and use of solarizer for soil disinfestation. To this end, three distinct experiments were conducted. In the first one, the virulence of R. solani, P. irregulare, F. inflexum, F. lacertarum and F. falciforme to the Verdão variety was evaluated. In the second, the susceptibility of 7 commercial strains of coriander to the same isolates tested in the first experiment was estimated. And, in the third, the efficiency in reducing the occurrence of root rot and colon rot by means of thermal treatment of soil in solarizer was evaluated. For all experiments, the following variables were considered: preemergence damping-off, post-emergence damping-off, emergence, total matter fresh, matter fresh / plant, plant height, incidence and severity. There was a difference in virulence between isolates, being significantly the ones with the greatest virulence: P. irregulare and F. falciforme. Regarding the varieties, there was interaction between isolates versus varieties as a function of the variable analyzed. The use of the solar collector was efficient to reduce root rot and colon rot. CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior O coentro (Coriandrum sativum L.) é uma das principais folhosas produzidas na região agreste de Alagoas. É uma olerícola folhosa condimentar que possui propriedades antibacteriana, antifúngica e antioxidante. Nos últimos anos, produtores da região têm enfrentado redução na produção devido a morte de plântulas, as quais apresentam lesões necróticas no colo e raízes. Em trabalhos recentes foi comprovada a patogenicidade das seguintes espécies encontradas em associação com plantas doentes: Rhizoctonia solani, Pythium irregulare, Fusarium inflexum, F. lacertarum e F. falciforme. Entretanto, a importância relativa deles como fitopatógenos não foi estimada, bem como alternativas de manejo não foram prospectadas. Assim, os objetivos deste trabalho foram: verificar a virulência dos isolados fitopatogênicos previamente caracterizados e avaliar a eficácia de duas estratégias de manejo: resistência genética de variedades comerciais e emprego de solarizador para desinfestação de solo. Com este fim, três experimentos distintos foram conduzidos. No primeiro, foi avaliada a virulência de R. solani, P. irregulare, F. inflexum, F. lacertarum e F. falciforme à variedade Verdão. No segundo, a suscetibilidade de 7 variedades comerciais de coentro aos mesmos isolados testados no primeiro experimento foi estimada. E, no terceiro, a eficácia em reduzir a ocorrência de podridão de raiz e colo por meio de tratamento térmico de solo em solarizador foi avaliada. Para todos os experimentos as seguintes variáveis foram consideradas: tombamento de pré-emergência, tombamento de pós-emergência, emergência, matéria seca total, matéria seca/planta, altura de plantas, incidência e severidade. Houve diferença de virulência entre isolados, sendo significativamente os de maior virulência: P. irregulare e F. falciforme. Com relação às variedades, houve interação entre isolados versus variedades em função da variável analisada. O uso do coletor solar foi eficiente para reduzir a podridão de raiz e colo.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-03-07T12:48:04Z No. of bitstreams: 1 Francisco Alberto de Sousa Lima Filho.pdf: 1454767 bytes, checksum: 0054a45daadb72e9247013cb331f0853 (MD5) Made available in DSpace on 2017-03-07T12:48:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Francisco Alberto de Sousa Lima Filho.pdf: 1454767 bytes, checksum: 0054a45daadb72e9247013cb331f0853 (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Cassava (Manihot esculenta Crantz) plays an important role in human food. Among the diseases affecting this crop, the brown spot, caused by the fungus Passalora henningsii (Allesch.) R. F. Castañeda & U. Braun, is one the main diseases. The high intensity of this leaf spot, observed in the state of Pernambuco, together with the scarcity of information, demonstrate the need of further studies on this disease. Thus, the objectives of this research were: i) to develop, validate and verify the applicability of two diagrammatic scales to quantify the severity of brown spot on leaves and leaflets of cassava; ii) to study the epidemy of the disease in different areas in the Pernambuco state. To elaborate the diagrammatic scales, cassava leaves showing symptoms of the disease were scanned and the severity value was calculated using the Assess software. Two scales were developed, one to leaves and another to leaflets, each containing eight levels of severity (0.1; 0.6; 1.5; 3.0; 6.0; 11.0; 16.0 and 24.0%). The diagrammatic scales were validated by untrained evaluators, and both produced more accurate and precise estimates of the severity of brown spot of cassava. To assess the seasonality of brown spot in the Pernambuco state, 12 areas of commercial cultivation were selected during the season 2015/2016. The incidence was evaluated by counting the number of diseased leaves and the severity was measured with the aid of diagrammatic scale previously elaborated. This study showed that the disease occurs in all areas evaluated in the Pernambuco state, being mainly related to precipitation. Furthermore, it was found that some cultivars were more susceptible to disease. A mandioca (Manihot esculenta Crantz) apresenta um importante papel na alimentação humana e animal, sendo a sexta cultura de maior produção no mundo. Dentre os problemas que afetam a cultura, destacam-se as manchas foliares, principalmente a mancha parda (MP), causada pelo fungo Passalora henningsii (Allesch.) R.F. Castañeda & U. Braun. A alta intensidade desta mancha foliar, observada no estado de Pernambuco, aliada à escassez de informações, demonstram a necessidade de estudos mais aprofundados acerca desta doença. Diante disso, os objetivos desta pesquisa foram: i) desenvolver, validar e verificar a aplicabilidade de duas escalas diagramáticas para quantificação da severidade da mancha parda em folhas e folíolos de mandioca; ii) estudar a epidemia da doença em diferentes áreas no Agreste de Pernambuco. Para elaborar as escalas diagramáticas, folhas de mandioca apresentando sintomas da doença foram digitalizadas e o valor de severidade calculado utilizando o software Assess. Foram desenvolvidas duas escalas, sendo uma para o folíolo central e outra para folha composta, cada uma contendo oito níveis de severidade (0,1; 0,6; 1,5; 3,0; 6,0; 11,0; 16,0 e 24,0%). As escalas foram validadas por avaliadores inexperientes, e verificou-se que ambas propiciaram estimativas mais acuradas e precisas da severidade da mancha parda. Para avaliar a sazonalidade da MP no Agreste de Pernambuco, foram selecionadas 12 áreas de cultivo comercial de mandioca durante a safra 2015/2016. A incidência foi avaliada pela contagem do número de folhas doentes e a severidade foi medida com o auxílio da escala de folha composta previamente elaborada. Este estudo mostrou que a doença ocorre em todas as áreas avaliadas no Agreste Meridional, estando relacionada principalmente com a precipitação. Além disso, foi verificado que algumas cultivares apresentam-se mais suscetíveis ao ataque do patógeno.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-23T14:09:27Z No. of bitstreams: 1 Romulo Diniz Cavalcante.pdf: 683087 bytes, checksum: 8124aad4adf327b8c664300dfebcb472 (MD5) Made available in DSpace on 2017-03-23T14:09:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Romulo Diniz Cavalcante.pdf: 683087 bytes, checksum: 8124aad4adf327b8c664300dfebcb472 (MD5) Previous issue date: 2013-02-25 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Stem rot caused by Lasiodiplodia theobromae is an important postharvest disease of papaya in Brazil. The disease symptoms start on the stem region and then progressing around the fruit. The tissues remain with soaked aspect and with progression of symptoms, lesions become dark brown and depressed. The infected area becomes gradually devoid of parenchymal tissue and fruits lose their consistency and strength. It is recommended that the disease control starts in the field and continue until the commercialization phase since the symptoms are difficult to be perceived until an advanced stage of maturation. The use of Fungicides is one of the main disease management measures. However, there are no data available on the sensitivity of L. theobromae to thiophanate methyl, the most common fungicide used in papaya orchards in Northeastern Brazil. Thus, the EC50 of 109 isolates of the fungus, representing five populations of the pathogen was estimated in vitro for the fungicide. Of the 109 isolates, 20,2% were non-sensitive (NS) to the fungicide with EC50 values greater than 300 mg ml-1, for the remaining 79.8% sensitive (S) isolates the average EC50 was 1.87 μg ml−1. The EC50 values for the NS isolates were significantly (P≤0.05) higher than those for the sensitive isolates. Seven components of fitness were measured for the 10 isolates with lower and high values of EC50. When the fitness components were evaluated, the non-sensitive (NS) isolates showed sporulation capacity significantly lower than the sensitive isolates, indicating a fitness costs. A podridão peduncular causada por Lasiodiplodia theobromae é uma doença em pós-colheita importante na cultura do mamoeiro no Brasil. Os sintomas da doença iniciam na região do pedúnculo e então progride para todo o fruto. Os tecidos permanecem com aspecto encharcado e com a progressão dos sintomas, as lesões se tornam marrom escura e deprimida. A área infectada torna-se gradualmente desprovida de tecido parenquimatoso e os frutos perdem sua consistência e vigor. É recomendado que o controle da doença seja iniciado no campo e continue até a fase de comercialização, uma vez que os sintomas são difíceis de serem percebidos até um estádio avançado de maturação. O uso de fungicidas é uma das principais medidas de manejo da doença. Todavia, dados sobre a sensibilidade de L. theobromae a tiofanato metílico, fungicida comumente empregado em pomares de mamoeiros no Nordeste brasileiro são inexistentes. Sendo assim, a CE50 de 109 isolados do fungo, representando cinco populações do patógeno foi estimada in vitro para o fungicida. Dos 109 isolados, 20,2% foram não sensíveis (NS) ao fungicida com valores de CE50 superiores a 300 μg ml-1, para 79,8% dos isolados remanescente denominados de sensíveis (S), a média de CE50 foi 1,87 μg ml-1. Os valores da CE50 dos isolados NS foram significativamente (P≤0.05) superiores quando comparados com os isolados S. Sete componentes de adaptabilidade foram mensurados para os 10 isolados com menores e maiores valores de CE50. Quando foram avaliados os componentes de adaptabilidade, os isolados não sensíveis apresentaram capacidade de esporulação significativamente inferior aos isolados sensíveis, indicando um custo de adaptabilidade.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-20T14:31:46Z No. of bitstreams: 1 Luis Gustavo Chaves da Silva.pdf: 1253285 bytes, checksum: 0a1b6f21c6f4abf5783394812a777ab7 (MD5) Made available in DSpace on 2017-03-20T14:31:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luis Gustavo Chaves da Silva.pdf: 1253285 bytes, checksum: 0a1b6f21c6f4abf5783394812a777ab7 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq The anthracnose, fungal disease caused by Colletotrichum gloeosporioides, stands out as an important disease of cashew (Anacardium occidentale), which may lead to losses of over 40% in production. The cashew nut is the most important agricultural product of the state of Ceará, about 350 thousand hectares, generating more than 100 thousand direct/indirect jobs and exports over 150 million dollars in almonds. It is also important for the states of Piauí and Rio Grande do Norte. There are few and outdated research about disease and the needs basic information for programs improvement and integrated management of diseases. By presenting large morphological and genetic variability, it is difficult to generalize basic aspects of the species. The aim of this study was to characterize populations of C. gloeosporioides occurring on cashew trees in various regions of Brazil. Used 220 isolates obtained from cashew leaves, from 22 different areas of the states: Amazonas, Ceará, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí, Rio Grande do North and São Paulo. Proceeded with pathogenic tests and molecular markers species-specific to all isolates. Then a representative from each collection area was selected to perform the other ratings, which are: morphological, molecular, epidemiological and physiological. The species-specific markers β-tubulin and ITS, noted the existence of only one group of 10 isolates of the same area, not being confirmed for C. gloeosporioides or C. acutatum, but morphological characteristics of C. gloeosporioides. Using seven primers ISSR markers and 100 representatives in 22 areas, it was possible identify the formation of four distinct genetic groups of C. gloeosporioides, where the unmarked isolated by ITS or β-Tubulin, not was contained in one or in groups. With the pathogenic test using 5 clones, it was possible to distinguish three groups and another 3 isolates distinct from other. Conclude that the species C. gloeosporioides is prevalent in cashew plantations in the areas studied. A Antracnose, doença fúngica ocasionada por Colletotrichum gloeosporioides, destaca-se como doença importante do cajueiro (Anacardium occidentale), podendo levar a perdas de mais 40% na produção. A castanha de caju é o produto agrícola mais importante do estado do Ceará, com cerca de 350 mil hectares plantados, geração de mais de 100 mil empregos diretos e indiretos e exportações acima de 150 milhões de dólares em amêndoas. Também é importante para os estados do Piauí e Rio Grande do Norte. Há poucas e desatualizadas pesquisas sobre a doença, havendo a necessidade de informações básicas para os programas de melhoramento e manejo integrado da fitomoléstia. Por apresentar grande variabilidade morfológica e genética, torna-se difícil a generalização de aspectos básicos da espécie. O objetivo deste trabalho foi caracterizar populações de C. gloeosporioides que ocorrem em cajueiros de diversas regiões do Brasil. Foram usados 220 isolados, obtidos de lesões de folhas de cajueiro, provenientes de plantios de 22 áreas distintas dos estados do Amazonas, Ceará, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí, Rio Grande do Norte e São Paulo. Procedeu-se com testes de patogenicidade e marcadores moleculares espécie específicos para todos isolados. Em seguida, um representante de cada área de coleta foi selecionado para realização das demais avaliações, sendo elas: morfológicas, moleculares, epidemiológicas e fisiológicas. Os marcadores espécie específicos ITS e β-Tubulina, constataram a existência de apenas um grupo de 10 isolados de uma mesma área, não sendo confirmados para C. gloeosporioides ou C. acutatum, porém com características morfológicas de C. gloeosporioides. Usando 7 primers ISSR e 100 marcadores nos representantes das 22 áreas, foi possível identificar a formação de 4 grupos genéticos distintos de C. gloeosporioides, onde o isolado não marcado por ITS ou β-Tubulina, não ficou contido em nem um dos grupos. Com o teste de patogenicidade utilizando 5 clones, foi possível diferenciar 3 grupos e mais outros 3 isolados distintos dos demais. Conclui-se que a espécie C. gloeosporioides é prevalente em plantios de cajueiro nas áreas estudas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-17T11:48:39Z No. of bitstreams: 1 Amanda de Melo Goncalves.pdf: 469509 bytes, checksum: 85589967175227a912f3d38c09495b82 (MD5) Made available in DSpace on 2017-02-17T11:48:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Amanda de Melo Goncalves.pdf: 469509 bytes, checksum: 85589967175227a912f3d38c09495b82 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 Papaya is a fruit tree common in almost all countries of Tropical America. Its products are used for different uses in textile, pharmaceuticals, food and cosmetics industries. The Brazil is the world's leading producer and most of its production is for export. Several diseases affect the crop and are its main limiting factor, causing major damage to production and marketing. The main losses are responsible for diseases post-harvest, which occur during storage of the product, however, the rot in the middle part of the stem, caused by Lasiodiplodia theobromae, has been highlighting the culture. The disease spreads rapidly and has been observed decimating an entire orchard papaya, the symptoms are initially soaked lesions, showing disintegration of tissues and formation of pits, which under predisposing conditions evolve, surrounding the stem, causing it to overturn. There is little information regarding the development of the disease and prevention is the best control measure. Chemical control is already used when the disease is detected, but there is no product registered for pathosystem in this field. The lack of knowledge of the interaction pathogen-host added to the misuse of these continuous products can result in failure of control. Studies sensitivity to fungicide isolates found not sensitive to these products, which can complicate treatment and control of disease, demonstrating the importance of studying the behavior of these isolates in plants. O mamoeiro é uma das fruteiras mais comuns em quase todos os países da América Tropical. Seus produtos são empregados para os mais diversos usos nas indústrias têxteis, famacêutica, de alimentos e de cosméticos. O Brasil é o principal produtor mundial e a maior parte da sua produção é destinada à exportação. Várias doenças acometem a cultura e constituem seu principal fator limitante, causando grandes danos na produção e na comercialização. As principais responsáveis pelas perdas são as doenças de pós-colheita, que ocorrem durante o armazenamento do produto, no entanto, uma podridão na parte mediana da haste, causada por Lasiodiplodia theobromae, vem se destacando na cultura. A doença se dissemina rapidamente e tem sido observada dizimando todo um pomar de mamoeiro, os sintomas consistem inicialmente em lesões encharcadas, apresentando desintegração dos tecidos e formação de pontuações, que sob condições predisponentes, evoluem circundando o caule, fazendo-o tombar. Existem poucas informações a respeito do desenvolvimento da doença e a prevenção é a melhor medida de controle. O controle químico já é utilizado quando a doença é detectada, mas não há produto registrado para esse patossistema em campo. A falta de conhecimento da interação patógeno-hospedeiro somada a utilização indevida e contínua desses produtos podem resultar no insucesso do controle. Estudos de sensibilidade a fungicida constataram isolados não sensíveis a esses produtos, fato que pode dificultar o manejo e o controle da doença, demonstrando a importância do estudo do comportamento desses isolados em plantas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-23T11:38:02Z No. of bitstreams: 1 Paulo Cezar das Merces Santos.pdf: 945938 bytes, checksum: 4dcffae9a84258c9e4e04fc53d685685 (MD5) Made available in DSpace on 2017-03-23T11:38:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paulo Cezar das Merces Santos.pdf: 945938 bytes, checksum: 4dcffae9a84258c9e4e04fc53d685685 (MD5) Previous issue date: 2011-02-17 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq From a socioeconomic perspective, the banana, one of the most consumed fruit, has great importance worldwide. The Brazilian production of this fruit presents particular geographic distribution, since it is present in all States of the federation. In the State of Pernambuco, the banana is grown in all the regions, occupying about 80000 permanent jobs in the field, with two distinct poles of banana production: the Zona da Mata and Vale do São Francisco. Among the limiting factors for this crop, there are the post-harvest diseases such as anthracnose, caused by Colletotrichum musae. This disease causes significant losses in production, manifesting itself mainly in the fruit at maturity stage. In order to verify the diversity of this pathogen isolated from C. musae from banana production fields of three municipalities (Vicência, São Vicente Férrer and Machados) of the Pernambuco State were characterized for daily mycelial growth rate (DMGR), colony color, reverse plate, topography, presence of sectors and microsclerotia, conidial morphology, biochemical tests, pathogens and molecular. The 60 isolates, based on morphological characters of shape and size of conidia, were identified as C. musae, followed with morphological measurements from 9.3 to 30.2 x 2.6 to 12.6 μm ( x = 15.0 x 4.9 μm, n = 6000). Most isolates showed conidia straight, oblong, with rounded apices. As for the DMGR, all isolates showed growth averaged more than 1.0 cm.day–1, ranging from 1.21 to 1.63 cm.day–1. It was found three groups of striking color to the colonies: white, cream and salmon, while the presence of sectors ranging from zero to eight per isolate. Most isolates (53) metabolized the ammonium tartrate as the sole source of carbon, while for citric acid, all isolates except the isolate CMM 3219, were not able to metabolize this carbon source. The pathogenic characterization showed significant differences in the epidemiological parameter AUDPC in fruits inoculated with injury, indicating the existence of variation in aggressiveness among isolates. For fruit inoculated and no injuries, the AUDPC was not estimated for 20 isolates because there was no injury. The dendrogram generated by UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) cluster analysis of DNA bands obtained with the combination of three primers (GTG5, GACA and 820) by ISSR-PCR allowed the separation of three groups of isolates to 62% by Jaccard’s similarity coefficient. The group I was composed of isolates from Vicência Group II isolates São Vicente Férrer and group III, Machados. The results suggest that isolates of C. musae can be discriminated as to their origin because they had genetic similarity between them. The ISSR markers in this study appear to be useful tools in the study of C. musae. Do ponto de vista socioeconômico, a banana, uma das frutas mais consumidas, possui grande importância mundial. A produção brasileira dessa frutífera apresenta particular distribuição geográfica, já que está presente em todos os Estados da federação. No Estado de Pernambuco, a banana é cultivada em todas as microrregiões, ocupando cerca de 80 mil postos de trabalho permanente no campo, havendo dois pólos distintos de produção de banana: a Zona da Mata e o Vale do São Francisco. Dentre os fatores limitantes para esta cultura, destacam-se as doenças pós-colheita, como a antracnose, causada pelo fungo Colletotrichum musae. Essa doença causa perdas significativas na produção, manifestando-se, principalmente, na fruta em estádio de maturação. Com a finalidade de verificar a diversidade desse fitopatógeno, isolados de C. musae provenientes de campos de produção de banana de três municípios (Vicência, São Vicente Férrer e Machados) do Estado de Pernambuco foram caracterizados quanto à taxa de crescimento micelial diária (TCMD), coloração da colônia, reverso da placa, topografia, presença de setores e de microescleródios, além da morfologia de conídios, testes bioquímicos, patogênicos e moleculares. Os 60 isolados, com base nos caracteres morfológicos de formato e tamanho de conídios, foram identificados como C. musae, com as seguidas medidas morfológicas 9,3-30,2 x 2,6-12,6 μm ( x = 15,0 x 4,9 μm, n = 6000). A maioria dos isolados avaliados apresentaram conídios retos, oblongo, com ápices arredondados. Quanto à TCMD, todos os isolados apresentaram crescimento médio superior a 1,0 cm.dia–1, variando de 1,21 a 1,63 cm.dia–1. Foram encontrados três grupos marcantes de coloração de colônia: branca, creme e salmão, enquanto que a presença de setores variou de zero a oito por isolado. A maioria dos isolados (53) metabolizou o tartarato de amônio como fonte exclusiva de carbono, enquanto que para o ácido cítrico, todos os isolados, com exceção do isolado CMM 3219, não foram capazes de metabolizar essa fonte de carbono. A caracterização patogênica mostrou diferenças significativas para o parâmetro epidemiológico AACPD em frutas inoculadas com ferimento, indicando a existência de variação da agressividade entre os isolados. Para as frutas sem ferimentos e inoculadas, a AACPD não foi estimada para 20 isolados, pois não houve lesões. O dendrograma gerado pela análise de agrupamento UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) das bandas de DNA obtidas com a combinação dos três primers (GTG5, GACA e 820) por ISSR-PCR possibilitou a separação de três grupos de isolados a 62% pelo coeficiente de similaridade de Jaccard. O grupo I foi formado pelos isolados provenientes de Vicência; grupo II, isolados de São Vicente Férrer e grupo III, de Machados. Os resultados sugerem que isolados de C. musae podem ser discriminados quanto à sua origem por apresentarem similaridade genética entre si. Os marcadores ISSR, nesse estudo, parecem ser ferramentas bastante úteis no estudo populacional de C. musae.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-16T14:00:28Z No. of bitstreams: 1 Alba Valeria da Silva Pereira.pdf: 458155 bytes, checksum: 80e5a16e6ef2e1ee3b97cac4fbc53703 (MD5) Made available in DSpace on 2017-02-16T14:00:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alba Valeria da Silva Pereira.pdf: 458155 bytes, checksum: 80e5a16e6ef2e1ee3b97cac4fbc53703 (MD5) Previous issue date: 2009-03-16 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Application of fungicide is the main measure of management to stem-end rot and there is no information on the sensitivity and on the fitness costs arising from the reduction in sensitivity of its causal agent, Lasiodiplodia theobromae. One hundred and twenty monosporic isolates collected in producing areas of the Northeast region of Brazil, were divided into six populations. We evaluated the in vitro sensitivity (inhibition of mycelial growth) of the isolates to class the fungicides belonging to two groups: benzimidazoles and sterol demethylation inhibitors (DMIs). We also evaluated the fitness of isolates with different levels of sensitivity the fungicides both in vitro and in vivo (mycelial growth and aggressiveness). The average EC50 for DMIs ranged from 0,141 to 4,054, 0,045 to 0,691 and from 0,001 to 1,529 for tebuconazole, prochloraz and imazalil, respectively. The level of sensitivity to DMIs did not differ among populations. For the benzimidazoles EC50 of 91.6% of the isolates ranged from 0,002 to 0,14 and 0,36 in 1,272 (benomyl and thiabendazole,respectively).The 8.4% isolates, classified as not sensitive (NS) were not inhibited at the highest concentration evaluated (100μg ml of a.i-1). All NS isolates were from the same population. The aggressiveness of NS isolated was lower. A aplicação de fungicida é a principal medida de manejo para podridão peduncular e não há informações sobre a sensibilidade e custos adaptativos decorrentes da redução de sensibilidade do seu agente causal, Lasiodiplodia theobromae. Cento e vinte isolados monospóricos, coletados em áreas produtoras da região Nordeste do Brasil, foram divididos em seis populações. Avaliou-se a sensibilidade in vitro (inibição de crescimento micelial) dos isolados aos fungicidas das classes dos benzimidazois e inibidores da biossíntese de ergosterol (IBEs) e a adaptabilidade in vitro e in vivo (crescimento micelial e agressividade) de isolados com níveis distintos de sensibilidade aos fungicidas testados. A CE50 média para os IBEs variou de 0,141 a 4,054, 0,045 a 0,691 e 0,001 a 1,529 para o tebuconazol, prochloraz e imazalil, respectivamente. O nível de sensibilidade aos IBEs não diferiu entre populações. Para os benzimidazóis a CE50 de 91,6% dos isolados variou de 0,002 a 0,14 e 0,36 a 1,272(benomyl e tiabendazol, respectivamente). Os 8,4%, classificados como não sensíveis (NS), não foram inibidos na maior concentração avaliada (100μg de i.a. ml-1). Todos os isolados NS foram oriundos de uma mesma população. A agressividade dos isolados NS foi menor. Para os IBEs, não foi detectado nenhum custo adaptativo.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-27T15:47:09Z No. of bitstreams: 1 Valeria Sandra de Oliveira Costa.pdf: 1029280 bytes, checksum: 7057060a8446db15d9f71e5c654fa2be (MD5) Made available in DSpace on 2017-03-27T15:47:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valeria Sandra de Oliveira Costa.pdf: 1029280 bytes, checksum: 7057060a8446db15d9f71e5c654fa2be (MD5) Previous issue date: 2009-02-02 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Dieback and stem-end rot in trees and fruits of mango have constituted a serious problem for the agricultural regions of Brazil, and its etiology and control is still a challenge. In the first study, the diversity of isolates of Botryosphaeriaceae from plants and fruits of mango was evaluated in semi-arid region of Northeast Brazil. Morphological characteristics and DNA sequence (5.8 S rDNA, ITS-1 e ITS-2) were used to identify a species already known and to report the presence of two new species of Botryosphaeriaceae in this region. The three species of Botryosphaeriaceae were found always in their anamorphic stage: Botryosphaeria dothidea, Neofusicoccum parvum and Lasiodiplodia theobromae. This is the first occurrence of B. dothidea and N. parvum associated with dieback and stem-end rot on mango in Brazil.Botryosphaeria dothidea and N. parvum species were prevalent in the Vale São Francisco, while L. theobromae prevailed in the Vale Assú. When inoculated in mango fruits ‘Tommy Atkins’, L. theobromae and N. parvum showed to be moreaggressive if compared to B. dothidea. In the second study, it was evaluated the influence of humidity (0 and 72 h in moist chamber) and temperature (25, 30 and 35º C) in the severity of stem-end rot in fruits of mango and the susceptibility of fruits of species different (mango, papaya, avocado and banana) to the species of Botryosphaeriaceae associated with this disease. Mango fruits were inoculated with 15 isolates, five isolates of each of the three species of Botryosphaeriaceae. The humidity and temperature significantly influenced the severity of stem-end rot in fruits of mango. The fruits of mango inoculated with L. theobromae developed symptoms of stem-end rot regardless of the presence of a moist chamber and fruits of mango inoculated with B. dothidea and N. parvum showed symptoms only when they were exposed to a period of 72 h in a moist chamber. The greatest lesions caused by both L. theobromae and by N. parvum wereobserved in fruits kept at temperatures of 25 and 30 ºC. It was not observed thedevelopment of symptoms in the fruits inoculated with B. dothidea when they were maintained at the three temperatures evaluated during the evaluation period. The isolates of L. theobromae and N. parvum were pathogenic when inoculated in healthy fruit of mango, papaya, avocado and banana. The isolates of B. dothidea were not pathogenic on fruits of banana. A morte descendente e a podridão peduncular em árvores e frutos de mangueira vêm se constituindo em um sério problema para as regiões agrícolas do Brasil, sendo o seu controle e etiologia ainda um desafio. No primeiro estudo, a diversidade de isolados de Botryosphaeriaceae de plantas e frutos de mangueira foi avaliada na região Semi-Árida do Nordeste do Brasil. Características morfológicas e seqüência de DNA (5.8 S rDNA, ITS-1 e ITS-2) foram usados para identificar uma espécie já conhecida e relatar a presença de duas novas espécies de Botryosphaeriaceae nesta região. As três espécies de Botryosphaeriaceae foram encontradas sempre em seu estádio anamórfico: Botryosphaeria dothidea, Neofusicoccum parvum e Lasiodiplodia theobromae. Essa é a primeira ocorrência de B. dothidea e N. parvum associados à morte descendente e podridão peduncular em mangueira no Brasil. Botryosphaeria dothidea e N. parvum foram asespécies prevalentes no Vale do São Francisco, enquanto L. theobromae prevaleceu no Vale do Assú. Quando inoculadas em frutos de mangueira ‘Tommy Atkins’, L. theobromae e N. parvum mostraram maior agressividade quando comparadas com B. dothidea. No segundo estudo, foi avaliada a influência da umidade (0 e 72 h de câmara úmida) e temperatura (25, 30 e 35ºC) na severidade da podridão peduncular em frutos de mangueira e a suscetibilidade de frutos de diferentes (manga, mamão, abacate e banana) às espécies de Botryosphaeriaceae associadas a esta doença. Os frutos de mangueira foram inoculados com 15 isolados, sendo cinco isolados de cada espécie de Botryosphaeriaceae. A umidade e a temperatura influenciaram significativamente a severidade da podridão peduncular em frutos de mangueira. Os frutos de mangueira inoculados com L. theobromae desenvolveram sintomas de podridão independente da presença de câmara úmida e os frutos de mangueira inoculados com B. dothidea e N. parvum apenas quando osmesmos foram expostos a um período de 72 h de câmara úmida. As maiores lesões causadas tanto por L. theobromae como por N. parvum foram observadas nos frutos mantidos nas temperaturas de 25 e 30 ºC. Não foi constatado o desenvolvimento de sintomas nos frutos inoculados com B. dothidea quando eles foram mantidos nas três temperaturas avaliadas durante o período de avaliação. Os isolados de L. theobromae e N. parvum foram patogênicos quando inoculados em frutos sadios de mangueira, mamoeiro, abacateiro e bananeira. Os isolados de B. dothidea só não foram patogênicos em frutos de bananeira.