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Depuis quelques années le cours d’eau du Boudigau dans les Landes (40), fait l’objet d’épisodes de prolifération de cyanobactéries, micro-organismes producteurs potentiels de toxines pouvant engendrer des risques sanitaires et environnementaux. Le suivi de la dynamique des populations des cyanobactéries et de ses toxines potentielles se révèle être un facteur clé conditionnant les usages le long du cours d’eau du Boudigau mais aussi les activités en aval dans le port de Capbreton et le lac d’Hossegor (ce dernier pouvant recevoir les eaux du Boudigau sous certaines conditions de marée). Le projet CYANOSAFE, développé par des ingénieurs-chercheurs d’INRAE en collaboration avec le Syndicat Mixte de Rivières Côte Sud (SMRCS) et la start-up Microbia Environnement, vise par l’adaptation et l’usage de différents outils et technologies innovants (fluorimètre AlgaeTorch, biocapteurs génétiques, kit ELISA, etc.) d’anticiper et de maîtriser ledanger lié à la présence des cyanobactéries afin d’assurer une gestion optimisée des sites considérés comme à risque sur ce territoire. Des campagnes d’échantillonnage et de mesures ont été mises en œuvre au cours des années 2019 et 2020 sur différentes stations du Boudigau. Les protocoles de mesures ont pu être finalisés voire adaptés au contexte de ce cours d’eau. Les mesures réalisées avec les différents outils ont pu être comparées entre elles et avec les résultats de biovolumes obtenus par microscopie inversé. Cette étude montre que le Boudigau présente un risque sanitaire et environnemental important lié à laprésence de cyanobactéries toxinogènes venant du Marais d’Orx lors des phases de pompage : genres Planktothrix et Dolichospermum. Les résultats ont pu mettre en évidence la présence de microcystines en 2020. La sonde AlgaeTorch s’avère utile pour suivre à haute fréquence l‘évolution des biomasses decyanobactéries dans le cours d’eau. Cependant, elle nécessite d’être calibrée avec une souche de Planktothrix afin de fournir des mesures plus justes. Les biocapteurs génétiques ont pu être déployés sur l’ensemble du site pour parfaire leur développement. Le biocapteur Planktothrix a été validé et une valeur de2 pM, équivalente au seuil de 1 mm3/l proposé par l’Anses a pu être définie. Le biocapteur AnabaenaDolichospermum-Aphanizomenon est prometteur mais il doit encore être affiné pour améliorer les corrélations avec les dénombrements microscopiques. Ainsi grâce aux résultats de cette étude, le SMRCSdisposera d’outils adaptés et fiables pour suivre la prolifération des cyanobactéries toxinogènes sur son territoire.

Les communautés végétales des lacs et étangs du littoral aquitain se caractérisent par la présence d’une végétation rase et immergée en bordure de rives, formant les pelouses dites à "isoétides", composées notamment par des espèces protégées comme la Littorelle à une fleur, la Lobélie de Dortmann, le Faux-cresson de Thore et l’Isoète de Bory. Ces plantes sont soumises à de nombreuses altérations physiques d’origine anthropique telles que l’artificialisation des berges, le piétinement par les usagers des lacs ou encore l’échouage et le mouillage des embarcations sur la rive. Ces actions sont en partie à l’origine d’une régression progressive de ces espèces patrimoniales, dont la présence dans cette zone de plaine méridionale de France est remarquable compte tenu de leur répartition géographique concentrée très majoritairement dans les plans d’eau oligotrophes du Nord de l’Europe. Ainsi, le Syndicat Intercommunal d’Aménagement des Eaux du Bassin Versant des Étangs du Littoral Girondin (SIAEBVELG) souhaite mettre en œuvre des actions de restauration de certains sites des lacs impactés par des altérations hydromorphologiques, actions soutenues par les gestionnaires et usagers locaux. Leur objectif principal est de réduire, voire stopper, ces impacts. C’est dans ce contexte que l’équipe ECOVEA de l’unité de recherche EABX à INRAE propose de réaliser en 2020 un état initial de six stations d’étude afin de suivre sur le moyen/long terme les dynamiques de la flore aquatique et des paramètres environnementaux locaux pertinents, et d’évaluer les effets des actions de restauration de l’hydromorphologie des rives du lac de Carcans-Hourtin. Les principaux résultats obtenus permettent de décrire les peuplements de macrophytes qui colonisent les stations d’étude, et de proposer des hypothèses concernant l’atteinte des objectifs de gestion initialementenvisagés dans les stations à restaurer, notamment en termes de conservation des isoétides, des roselières et de l’ensemble des communautés végétales aquatiques présentes.

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