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33 results on '"Orsucci, Marion"'

1. Transcriptional differences between the two host strains of Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae)

Author

Orsucci, Marion, Moné, Yves, Audiot, Philippe, Gimenez, Sylvie, Nhim, Sandra, Naït-Saïdi, Rima, Frayssinet, Marie, Dumont, Guillaume, Boudon, Jean-Paul, Vabre, Marin, Rialle, Stéphanie, Koual, Rachid, Kergoat, Gael J., Nagoshi, Rodney N., Meagher, Robert L., d’Alençon, Emmanuelle, and Nègre, Nicolas

Subjects
Archaeology, CC1-960, Science
Abstract

Spodoptera frugiperda, the fall armyworm (FAW), is an important agricultural pest in the Americas and an emerging pest in sub-Saharan Africa, India, East-Asia and Australia, causing damage to major crops such as corn, sorghum and soybean. While FAW larvae are considered polyphagous, differences in diet preference have been described between two genetic variants: the corn strain (sf-C) and the rice strain (sf-R). These two strains are sometimes considered as distinct species, raising the hypothesis that host plant specialization might have driven their divergence. To test this hypothesis, we first performed controlled reciprocal transplant (RT) experiments to address the impact of plant diet on several traits linked to the fitness of the sf-C and sf-R strains. The phenotypical data suggest that sf-C is specialized to corn. We then used RNA-Se to identify constitutive transcriptional differences between strains, regardless of diet, in laboratory as well as in natural populations. We found that variations in mitochondrial transcription levels are among the most substantial and consistent differences between the two strains. Since mitochondrial genotypes also vary between the strains, we believe the mitochondria may have a significant role in driving strain divergence.

Published
2022
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2. Convergence and molecular evolution of floral fragrance after independent transitions to self-fertilization

Author

Woźniak, Natalia Joanna, primary, Sartori, Kevin, additional, Kappel, Christian, additional, Tran, Thi Chi, additional, Zhao, Lihua, additional, Erban, Alexander, additional, Gallinger, Jannicke, additional, Fehrle, Ines, additional, Jantzen, Friederike, additional, Orsucci, Marion, additional, Ninkovic, Velemir, additional, Rosa, Stefanie, additional, Lenhard, Michael, additional, Kopka, Joachim, additional, and Sicard, Adrien, additional

Published
2024
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5. Convergence and molecular evolution of floral fragrance after independent transitions to self–fertilization

Author

Wozniak, Natalia, primary, Sartori, Kevin, additional, Kappel, Christian, additional, Zhao, Lihua, additional, Erban, Alexander, additional, Fehrle, Ines, additional, Jantzen, Friederike, additional, Orsucci, Marion, additional, Rosa, Stefanie, additional, Lenhard, Michael, additional, Kopka, Joachim, additional, and Sicard, Adrien, additional

Published
2022
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7. The relative role of plasticity and demographic history in Capsella bursa-pastoris: a common garden experiment in Asia and Europe

Author

Cornille, Amandine, primary, Tiret, Mathieu, additional, Salcedo, Adriana, additional, Huang, Huirun R, additional, Orsucci, Marion, additional, Milesi, Pascal, additional, Kryvokhyzha, Dmytro, additional, Holm, Karl, additional, Ge, Xue-Jun, additional, Stinchcombe, John R, additional, Glémin, Sylvain, additional, Wright, Stephen I, additional, and Lascoux, Martin, additional

Published
2022
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10. Additional file 5 of Integrated miRNA and transcriptome profiling to explore the molecular determinism of convergent adaptation to corn in two lepidopteran pests of agriculture

Author

Gimenez, Sylvie, Seninet, Imène, Orsucci, Marion, Audiot, Philippe, Nègre, Nicolas, Nam, Kiwoong, Streiff, Réjane, and d’Alençon, Emmanuelle

Abstract

Additional file 5: Supplementary Figure 3. Variation between samples (treatments, replicates) of larvae exposed to different plants displayed by Principal Component Analysis (PCA). Top panel: On, bottom panel: Os. OnCor: On on corn, OnMug: On on mugwort, OsCor: Os on corn, OsMug: Os on mugwort.

Published
2021
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12. Additional file 4 of Integrated miRNA and transcriptome profiling to explore the molecular determinism of convergent adaptation to corn in two lepidopteran pests of agriculture

Author

Gimenez, Sylvie, Seninet, Imène, Orsucci, Marion, Audiot, Philippe, Nègre, Nicolas, Nam, Kiwoong, Streiff, Réjane, and d’Alençon, Emmanuelle

Subjects
food and beverages
Abstract

Additional file 4: Supplementary Figure 2. MA-plots showing the relative expression of known or novel miR according to the host-plant (Mugwort compared to corn) in each sibling species. Top panel, in On, bottom panel In Os.

Published
2021
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13. Additional file 9 of Integrated miRNA and transcriptome profiling to explore the molecular determinism of convergent adaptation to corn in two lepidopteran pests of agriculture

Author

Gimenez, Sylvie, Seninet, Imène, Orsucci, Marion, Audiot, Philippe, Nègre, Nicolas, Nam, Kiwoong, Streiff, Réjane, and d’Alençon, Emmanuelle

Abstract

Additional file 9: Supplementary Figure 5. Variation between samples (treatments, replicates) of larvae exposed to different plants displayed by Principal Component Analysis (PCA). Os compared to On on corn. OnCor: On on corn, OnMug: On on mugwort, OsCor: Os on corn, OsMug: Os on mugwort.

Published
2021
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14. Additional file 3 of Integrated miRNA and transcriptome profiling to explore the molecular determinism of convergent adaptation to corn in two lepidopteran pests of agriculture

Author

Gimenez, Sylvie, Seninet, Imène, Orsucci, Marion, Audiot, Philippe, Nègre, Nicolas, Nam, Kiwoong, Streiff, Réjane, and d’Alençon, Emmanuelle

Abstract

Additional file 3: Supplementary Figure 1. Base composition of known or novel mature miRNAs using weblogo [79, 80].

Published
2021
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15. Additional file 7 of Integrated miRNA and transcriptome profiling to explore the molecular determinism of convergent adaptation to corn in two lepidopteran pests of agriculture

Author

Gimenez, Sylvie, Seninet, Imène, Orsucci, Marion, Audiot, Philippe, Nègre, Nicolas, Nam, Kiwoong, Streiff, Réjane, and d’Alençon, Emmanuelle

Abstract

Additional file 7: Supplementary Figure 4. MA-plots showing the relative expression of known or novel miR according to the genetic background. Relative expression analyzed by DESEQ2 in Os compared to On on corn.

Published
2021
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16. relative role of plasticity and demographic history in Capsella bursa-pastoris: a common garden experiment in Asia and Europe.

Author

Cornille, Amandine, Tiret, Mathieu, Salcedo, Adriana, Huang, Huirun R, Orsucci, Marion, Milesi, Pascal, Kryvokhyzha, Dmytro, Holm, Karl, Ge, Xue-Jun, Stinchcombe, John R, Glémin, Sylvain, Wright, Stephen I, and Lascoux, Martin

Subjects
GARDENS, PHENOTYPIC plasticity, LIFE history theory, COLONIZATION (Ecology), PHENOTYPES, WEEDS
Abstract

The colonization success of a species depends on the interplay between its phenotypic plasticity, adaptive potential and demographic history. Assessing their relative contributions during the different phases of a species range expansion is challenging, and requires large-scale experiments. Here, we investigated the relative contributions of plasticity, performance and demographic history to the worldwide expansion of the shepherd's purse, Capsella bursa-pastoris. We installed two large common gardens of the shepherd's purse, a young, self-fertilizing, allopolyploid weed with a worldwide distribution. One common garden was located in Europe, the other in Asia. We used accessions from three distinct genetic clusters (Middle East, Europe and Asia) that reflect the demographic history of the species. Several life-history traits were measured. To explain the phenotypic variation between and within genetic clusters, we analysed the effects of (i) the genetic clusters, (ii) the phenotypic plasticity and its association to fitness and (iii) the distance in terms of bioclimatic variables between the sampling site of an accession and the common garden, i.e. the environmental distance. Our experiment showed that (i) the performance of C. bursa-pastoris is closely related to its high phenotypic plasticity; (ii) within a common garden, genetic cluster was a main determinant of phenotypic differences; and (iii) at the scale of the experiment, the effect of environmental distance to the common garden could not be distinguished from that of genetic clusters. Phenotypic plasticity and demographic history both play important role at different stages of range expansion. The success of the worldwide expansion of C. bursa-pastoris was undoubtedly influenced by its strong phenotypic plasticity. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2022
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18. Supporting Information from Shift in ecological strategy helps marginal populations of shepherd's purse (Capsella bursa-pastoris) to overcome a high genetic load

Author

Orsucci, Marion, Milesi, Pascal, Hansen, Johanna, Girodolle, Johanna, Glémin, Sylvain, and Lascoux, Martin

Subjects
digestive, oral, and skin physiology
Abstract

The outcome of species range expansion depends on the interplay of demographic, environmental and genetic factors. Self-fertilizing species usually show a higher invasive ability than outcrossers but selfing and bottlenecks during colonization also lead to an increased genetic load. The relationship between genomic and phenotypic characteristics of expanding populations has, hitherto, rarely been tested experimentally. We analysed how accessions of the shepherd's purse, Capsella bursa-pastoris, from the colonization front or from the core of the natural range performed under increasing density of competitors. First, accessions from the front showed a reduced fitness than those from the core. Second, for all accessions, competitor density impacted negatively both vegetative growth and fruit production. However, despite their higher genetic load and lower absolute performances, accessions from the front were less affected by competition than accessions from the core. This seems to be due to phenotypic trade-offs and a shift in phenology that allow accessions from the front to avoid competition.

Published
2020
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20. Transcriptional plasticity evolution in two strains of Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) feeding on alternative host-plants

Author

Orsucci, Marion, Moné, Yves, Audiot, Philippe, Gimenez, Sylvie, Nhim, Sandra, Naït-Saïdi, Rima, Frayssinet, Marie, Dumont, Guillaume, Pommier, Alexandra, Boudon, Jean-Paul, Vabre, Marin, Rialle, Stéphanie, Koual, Rachid, Kergoat, Gael J., Nagoshi, Rodney N., Meagher, Robert L., d’Alençon, Emmanuelle, Nègre, Nicolas, Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier] (DGIMI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Domaine expérimental de Melgueil (MONTP MELGUEIL UE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX (IGF MGX), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), USDA-ARS : Agricultural Research Service, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-BioCampus (BCM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ProdInra, Migration

Subjects
Animal biology, noctuidae, [SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Biologie animale, fungi, food and beverages, lepidoptera, spodoptera frugiperda
Abstract

Spodoptera frugiperda , the fall armyworm (FAW), is an important agricultural pest in the Americas and an emerging pest in sub-Saharan Africa, causing damage to major crops such as corn, sorghum and soybean. While FAW larvae are considered polyphagous, differences in diet preference have been described between two genetic variants: the Corn strain (sf-C) and the Rice strain (sf-R). These two strains are sometimes considered as distinct species, raising the hypothesis that host plant specialization might have driven their divergence. Ecological speciation takes place when adaptations to different ecological niches lead to the reproductive isolation of two populations. Under this hypothesis, we expect that the transcriptional response to the host plants should affect differently the fitness of the two FAW strains. We also expect that these genes should also be linked to a reproductive isolation mechanism between the strains. In this study, we performed controlled reciprocal transplant (RT) experiments to address the impact of plant diet on several traits linked to the fitness of the sf-C and sf-R strains. The phenotypical data suggest that sf-C is specialized to corn. We then used RNA-Seq to analyze the gene expression of FAW larvae from RT experiments. We show that each strain has a different response to the same plant diets. However, we also found constitutive transcriptional differences between strains in laboratory and in natural populations. In particular, we show that mitochondrial transcription is the main difference between strains. A difference in mitochondrial function may be the basis for a shift in host plant and could be involved in hybrid incompatibility, raising the hypothesis that mitochondrial genome is the main target of selection between the two strains.

Published
2018
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21. Transcriptomic response of female adult moths to host and non-host plants in two closely related species

Author

Orsucci, Marion, Audiot, Philippe, Nidelet, Sabine, Dorkeld, Franck, Pommier, Alexandra, Vabre, Marin, Severac, Dany, Rohmer, Marine, Gschloessl, Bernhard, Streiff, Rejane, ProdInra, Archive Ouverte, Blanc 2013 - Contributions du genome, du transcriptome et de l'épigénome à l'adaptation de lépidoptères (Ostrinia spp.) à leurs plantes hôtes - - Adapt-Ome2013 - ANR-13-BSV7-0012 - Blanc 2013 - VALID, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier] (DGIMI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM), Department of Ecology and Genetics [Uppsala] (EBC), Uppsala University, Domaine expérimental de Melgueil (MONTP MELGUEIL UE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX (IGF MGX), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-BioCampus (BCM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Montpellier, ANR-13-BSV7-0012,Adapt-Ome,Contributions du genome, du transcriptome et de l'épigénome à l'adaptation de lépidoptères (Ostrinia spp.) à leurs plantes hôtes(2013), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ANR Adapt-Ome : ANR-13-BSV7-0012-01

Subjects
Male, [SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Evolution, Oviposition, interaction plante insecte, Insect-plant interaction, adaptation, plante hôte, Moths, Evolutionsbiologi, évolution génétique, specialization, transcriptomics, host plant, Species Specificity, Biologie animale, QH359-425, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Animals, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, insect-plant interaction, Adaptation, Transcriptomics, Animal biology, Evolutionary Biology, Principal Component Analysis, Vegetal Biology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Gene Expression Profiling, fungi, Molecular Sequence Annotation, Plants, plant insect interaction, Adaptation, Physiological, oviposition, Linear Models, Female, Transcriptome, insecte phytophage, Biologie végétale, Specialization
Abstract

Background Divergent selection has been shown to promote speciation in many taxa and especially in phytophagous insects. In the Ostrinia species complex, the European corn borer (ECB) and adzuki bean borer (ABB) are two sibling species specialized to different host plants. The first is a well-known maize pest, whereas the second is a polyphagous species associated with various dicotyledons. Their specialization to host plants is driven by morphological, behavioral and physiological adaptations. In particular, previous studies have shown that ECB and ABB display marked behavior with regard to plant choice during oviposition, involving specific preference and avoidance mechanisms. In this study, our goal was to identify the mechanisms underlying this host-plant specialization in adult females through an analysis of their gene expression. We assembled and annotated a de novo reference transcriptome and measured differences in gene expression between ECB and ABB females, and between environments. We related differentially expressed genes to host preference behavior, and highlighted the functional categories involved. We also conducted a specific analysis of chemosensory genes, which are considered to be good candidates for host recognition before oviposition. Results We recorded more differentially expressed genes in ECB than in ABB samples, and noticed that the majority of genes potentially involved in the host preference were different between the two species. At the functional level, the response to plant environment in adult females involved many processes, including the metabolism of carbohydrates, lipids, proteins, and amino acids; detoxification mechanisms and immunity; and the chemosensory repertoire (as expected). Until now, most of the olfactory receptors described in Ostrinia spp. had been tested for their putative role in pheromone recognition by males. Here we observed that one specific olfactory receptor was clearly associated with ECB’s discrimination between maize and mugwort conditions, highlighting a potential new candidate involved in plant odor discrimination in adult females. Conclusions Our results are a first step toward the identification of candidate genes and functions involved in chemosensory processes, carbohydrate metabolism, and virus and retrovirus dynamics. These candidates provide new avenues for research into understanding the role of divergent selection between different environments in species diversification.

Published
2018

22. Variation in competitive ability with mating system, ploidy and range expansion in four Capsella species

Author

Glémin, Sylvain, Yang, Xuyue, Petrone-Mendoza, Sandra, Hansen, Johanna, ORSUCCI, MARION, Kryvokhyzha, Dmytro, Duan, Tianlin, Milesi, P., Lascoux, Martin, Briand, Valerie, Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Department of Ecology, Environment and Plant Sciences, Stockholm University, Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier] (DGIMI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM), Uppsala University, Department of Ecology and Genetics [Uppsala] (EBC), SFEcologie, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Stockholm University, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2018

26. Two genomes of highly polyphagous lepidopteran pests (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) with different host-plant ranges

Author

Gouin, Anaïs, Bretaudeau, Anthony, Nam, Kiwoong, Gimenez, Sylvie, Aury, Jean-Marc, Duvic, Bernard, Hilliou, Frederique, Durand, Nicolas, Montagné, Nicolas, Darboux, Isabelle, Kuwar, Suyog, Chertemps, Thomas, Siaussat, David, Bretschneider, Anne, Moné, Yves, Ahn, Seung-Joon, Hänniger, Sabine, Gosselin Grenet, Anne-Sophie, Neunemann, David, Maumus, Florian, Luyten, Isabelle, Labadie, Karine, Xu, Wei, Koutroumpa, Fotini, Escoubas, Jean-Michel, Llopis, Angel, Maïbèche-Coisne, Martine, Salasc, Fanny, Tomar, Archana, Anderson, Alisha, Khan, Sher, DUMAS, Pascaline, ORSUCCI, MARION, Guy, Julie, Belser, Caroline, Alberti, Adriana, Noel, Benjamin, Couloux, Arnaud, Mercier, Jonathan, Nidelet, Sabine, Dubois, Emeric, Liu, Nai-Yong, Boulogne, Isabelle, Mirabeau, Olivier, Le Goff, Gaelle, Gordon, Karl, Oakeshott, John, Consoli, Fernando, Volkoff, Anne-Nathalie, Fescemyer, Howard, Marden, James, Luthe, Dawn, Herrero, Salvador, Heckel, David, Wincker, Patrick, Kergoat, Gael, Amselem, Joelle, Quesneville, Hadi, Groot, Astrid, Jacquin-Joly, Emmanuelle, Nègre, Nicolas, Lemaitre, Claire, Legeai, Fabrice, D’Alençon, Emmanuelle, Fournier, Philippe, Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Plateforme bioinformatique GenOuest [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier] (DGIMI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire des Sciences de l'Information et des Systèmes (LSIS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Arts et Métiers Paristech ENSAM Aix-en-Provence-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU), Sorbonne Université (SU), Max Planck Institute for Chemical Ecology, Max-Planck-Gesellschaft, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche Génomique Info (URGI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), School of Veterinary and Life Sciences [Murdoch], Murdoch University, Universitat Politècnica de València (UPV), Centre for DNA Fingerprinting and Diagnostics (CDFD), CSIRO Ecosystem Sciences, Institute for Biodiversity and Ecosystem Dynamics (IBED), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Southwest Forestry University (SWFU), Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation [Canberra] (CSIRO), Universidade de São Paulo (USP), Pennsylvania State University (Penn State), Penn State System, Genoscope project AP2010, French National Research Agency [ANR-12-BSV7-0004-01], Institut Universitaire de France, USDA AFRI [2010-65106-20656], Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Université de Rennes (UR)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidade de São Paulo = University of São Paulo (USP), Lemaitre, Claire, IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-CentraleSupélec-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Evolutionary and Population Biology (IBED, FNWI), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Arts et Métiers Paristech ENSAM Aix-en-Provence-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Universités, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Universidad Politécnica de Valencia

Subjects
Crops, Agricultural, Genome, Insect, lcsh:R, fungi, lcsh:Medicine, Spodoptera, Adaptation, Physiological, Article, Species Specificity, Larva, Animals, lcsh:Q, Herbivory, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], lcsh:Science, [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
Abstract

International audience; Emergence of polyphagous herbivorous insects entails significant adaptation to recognize, detoxify and digest a variety of host-plants. Despite of its biological and practical importance - since insects eat 20% of crops - no exhaustive analysis of gene repertoires required for adaptations in generalist insect herbivores has previously been performed. The noctuid moth Spodoptera frugiperda ranks as one of the world’s worst agricultural pests. This insect is polyphagous while the majority of other lepidopteran herbivores are specialist. It consists of two morphologically indistinguishable strains (“C” and “R”) that have different host plant ranges. To describe the evolutionary mechanisms that both enable the emergence of polyphagous herbivory and lead to the shift in the host preference, we analyzed whole genome sequences from laboratory and natural populations of both strains. We observed huge expansions of genes associated with chemosensation and detoxification compared with specialist Lepidoptera. These expansions are largely due to tandem duplication, a possible adaptation mechanism enabling polyphagy. Individuals from natural C and R populations show significant genomic differentiation. We found signatures of positive selection in genes involved in chemoreception, detoxification and digestion, and copy number variation in the two latter gene families, suggesting an adaptive role for structural variation.

Published
2017

29. Transcriptional differences between the two host strains of Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae)

Author

Orsucci, Marion, primary, Moné, Yves, additional, Audiot, Philippe, additional, Gimenez, Sylvie, additional, Nhim, Sandra, additional, Naït-Saïdi, Rima, additional, Frayssinet, Marie, additional, Dumont, Guillaume, additional, Boudon, Jean-Paul, additional, Vabre, Marin, additional, Rialle, Stéphanie, additional, Koual, Rachid, additional, Kergoat, Gael J., additional, Nagoshi, Rodney N., additional, Meagher, Robert L., additional, d’Alençon, Emmanuelle, additional, and Nègre, Nicolas, additional

Published
2018
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30. Rôle de la spécialisation à la plante hôte et de l'isolement reproducteur dans la divergence de lépidoptères ravageurs de cultures

Author

ORSUCCI, MARION, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Réjane Streiff

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], these
Abstract

La spécialisation à différents environnements est un moteur de divergence entre populations et espèces. Les insectes phytophages sont des candidats pertinents pour l’étude de la spéciation par spécialisation écologique, de par leur relation intime à leur plante hôte et à l’occurrence régulière de changements d’hôtes au cours de leur évolution. Cette spéciation écologique nécessite trois composantes : une source de sélection divergente, un isolement reproducteur (pré-ou post-zygotique), et un mécanisme liant les gènes sous sélection et ceux responsable de l’isolement reproducteur. Dans ce cadre, nous avons étudié l’isolement reproducteur et la spécialisation chez deux modèles de lépidoptères polyphages, ravageurs des cultures : (1) la pyrale du maïs, Ostrinia nubilalis, et son espèce soeur, Ostrinia scapulalis, (2) la légionnaire d’automne, Spodoptera frugiperda, dont deux variants sont identifiables, le variant riz (sf-R) et le variant maïs (sf-M). Ces deux modèles montrent des patrons de diversification via la plante hôte : les deux espèces soeurs et les deux variants sont différenciés génétiquement et sont spécialisés sur différentes plantes hôtes (maïs pour O. nubilalis et sf-M ; armoise pour O. scapulalis ; riz pour sf-R). Nous avons étudié les patrons de spécialisation de ces modèles en effectuant des mesures de traits d’histoire de vie à deux moments clés de leur cycle de vie : (1) au stade larvaire, par des expériences de transplantation réciproque, (2) au stade adulte, par des expériences de choix d’oviposition. Ces mesures nous ont permis de mettre en évidence un patron de spécialisation pour les deux espèces de pyrale et pour le variant sf-M au stade adulte et/ou larvaire, alors que les résultats ne montrent pas de spécialisation claire pour le variant sf-R de S. frugiperda, du moins sur les plantes testées. Nous avons également recherché des mécanismes de cette spécialisation par une analyse transcriptomique visant à identifier les gènes ou familles de gènes dont l’expression varie en fonction de la plante hôte chez nos deux modèles. Cette étude mécanistique a mis en lumière des fonctions de gènes impliquées dans la détoxification, la digestion et l’immunité qui peuvent expliquer les différences de traits d’histoire de vie que nous avons observées. Enfin, nous avons quantifié différentes barrières (pré- et postzygotiques) pour estimer le degré de divergence et les facteurs impliqués dans l’isolement reproducteur des entités génétiques étudiées. Nous avons notamment trouvé pour les deux modèles des barrières postzygotiques précoces avec un pourcentage d’éclosion plus faible dans les croisements interspécifiques. Dans le modèle Ostrinia, nous avons également mis en évidence la présence d’une barrière pré-zygotique en lien avec le bouquet phéromonal émis par les femelles.

Published
2015

31. Specialization to the host plant in Lepidoptera pests: pattern and process

Author

D'Alençon, Emmanuelle, ORSUCCI, MARION, Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier] (DGIMI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM), and Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

Specialization to the host plant in [i]Lepidoptera[/i] pests: pattern and process.. SMBE Satellite meeting SMBEBA 2015. Investigating biological adaptation with NGS: data and models

Published
2015

32. A Life history trait approach of host plant specialization in Lepidopteran pests, ADALEP network workshop

Author

D'Alençon, Emmanuelle, ORSUCCI, MARION, Streiff, Rejane, Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier] (DGIMI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology
Abstract

A Life history trait approach of host plant specialization in Lepidopteran pests, ADALEP network workshop. Colloque du réseau ADALEP (Adaptation à l’environnement biotique chez les lépidoptères)

Published
2014

33. Transcriptomics and epigenetics of the host plant adaptation in two Lepidoptera pests

Author

D'Alençon, Emmanuelle, ORSUCCI, MARION, Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier] (DGIMI), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)

Subjects
épigénétique, host plant, Rhopalocera, lepidoptera, plante hôte, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, transcriptome
Abstract

Transcriptomics and epigenetics of the host plant adaptation in two Lepidoptera pests. 2. European Conference on Speciation Research SPECIATION 2013

Published
2013

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