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International audience; In many Ugandan rural communities, pigs are generally kept under traditional smallholder systems without basic biosecurity measures in place. In some instances, these systems are at the livestock-wildlife interface, as it is the case in Nwoya district, which is bordered by Murchison Falls National Park (MFNP). This pig system has potential for the maintenance and transmission of pathogens like African swine fever (ASF) between different herds, and also with wild pigs (warthogs and bushpigs). In this paper, we describe the spatial and temporal pattern of the movements of free ranging domestic pigs in a rural setting in Northern Uganda where ASF is endemic. We also determine their use of habitat to highlight the potential interaction hotspots between domestic pigs and between domestic and wild pig populations. We fitted 10 free-ranging domestic pigs owned by different homesteads with GPS harnesses during rainy and dry seasons. The pig home range, daily distance, activity pattern and habitat use were calculated. Our results show that the maximum area covered (MCP 100%) by the pigs varied between 35,965 and 475,077 m 2 . The core area varied from 1,317 to 50,769 m 2 . The pigs' home ranges were significantly bigger during the dry season than during the rainy season (Wilcoxon test, W = 22, p = 0.04). The mean full day (24 h) distance was longer in the dry season than in the rainy season (Student test, t = 2.7, p = 0.03). The pigs were mostly located within their own homestead, but they also used other homesteads, grass and crop fields. This study highlights that free-ranging domestic pigs may cover a wide area, especially during the dry season. Interestingly, the home range of pigs from different herds may overlap with areas used by wild pigs which share crops and other resources in this area. This study provides insights into a better understanding of the potential for spread of diseases such as ASF at small-scale and can be used to raise awareness of such risks and to better target implementation of preventive measures.

Par courrier du 26 juillet 2018, l’Anses a été saisie d’une « demande d’évaluation du rôle épidémiologique du renard dans la transmission de la tuberculose bovine (TB) ».Cette saisine s’inscrit dans le contexte de la TB chez les bovins et dans la faune sauvage, notamment chez les blaireaux, objets de la saisine 2016-SA-0200. Cette problématique implique différents acteurs, en particulier éleveurs, chasseurs, piégeurs et associations de protection de la faune sauvage. Suite à la découverte de quatre renards infectés en Dordogne en 2015, une étude a été conduite autour de ces cas sur « l’épidémiologie et la pathologie de la TB chez le renard ». Cette étude a mis en évidence, pour 2017, un taux d’infection de l’ordre de 6 % sur un échantillon de 189 renards prélevés en zone infectée de Dordogne, par détection par PCR sur des pools de broyats de nœuds lymphatiques (NL), des expectorations, des fèces et des urines.A la date de réception de la saisine, la partie de cette étude portant sur les voies d’excrétion de Mycobacterium bovis par les renards était en cours. La mise en place de deux études complémentaires, une étude épidémiologique élargie à d’autres zones de Dordogne et d’autres départements infectés de TB, et une infection expérimentale de renards en captivité, avaient également été initiées. Selon la saisine, les résultats de ces études devaient être disponibles enseptembre et décembre 2018.En pratique, les résultats des études n’étant pas disponibles dans les délais indiqués, le traitement de la saisine a été suspendu jusqu’à leur obtention en février 2020.Selon les termes de la saisine, un avis de l’Anses est sollicité sur les questions suivantes :• « Quel est le risque de transmission de la TB aux élevages de bovins par des renards compte tenu des éléments actuellement connus ? Quel est le risque de création d’un réservoir de la maladie dans la faune sauvage en intégrant le rôle joué par cette espèce ?• Quelles mesures de gestion (contrôle des densités de renard par la chasse, ramassage des cadavres, etc.) seraient susceptibles de faire diminuer ce risque ?En sus d’une revue bibliographique sur le sujet, nous souhaiterions que votre avis prenne en compte les résultats de l’étude en cours en Dordogne et des investigations complémentaires qui auront pu être menées et dont les résultats seraient disponibles en décembre 2018 ».L’audition de la DGAL a permis de confirmer que la surveillance des renards faisait partie de la gestion et était donc à envisager dans la deuxième question

Par courrier du 26 juillet 2018, l’Anses a été saisie d’une « demande d’évaluation du rôle épidémiologique du renard dans la transmission de la tuberculose bovine (TB) ».Cette saisine s’inscrit dans le contexte de la TB chez les bovins et dans la faune sauvage, notamment chez les blaireaux, objets de la saisine 2016-SA-0200. Cette problématique implique différents acteurs, en particulier éleveurs, chasseurs, piégeurs et associations de protection de la faune sauvage. Suite à la découverte de quatre renards infectés en Dordogne en 2015, une étude a été conduite autour de ces cas sur « l’épidémiologie et la pathologie de la TB chez le renard ». Cette étude a mis en évidence, pour 2017, un taux d’infection de l’ordre de 6 % sur un échantillon de 189 renards prélevés en zone infectée de Dordogne, par détection par PCR sur des pools de broyats de nœuds lymphatiques (NL), des expectorations, des fèces et des urines.A la date de réception de la saisine, la partie de cette étude portant sur les voies d’excrétion de Mycobacterium bovis par les renards était en cours. La mise en place de deux études complémentaires, une étude épidémiologique élargie à d’autres zones de Dordogne et d’autres départements infectés de TB, et une infection expérimentale de renards en captivité, avaient également été initiées. Selon la saisine, les résultats de ces études devaient être disponibles enseptembre et décembre 2018.En pratique, les résultats des études n’étant pas disponibles dans les délais indiqués, le traitement de la saisine a été suspendu jusqu’à leur obtention en février 2020.Selon les termes de la saisine, un avis de l’Anses est sollicité sur les questions suivantes :• « Quel est le risque de transmission de la TB aux élevages de bovins par des renards compte tenu des éléments actuellement connus ? Quel est le risque de création d’un réservoir de la maladie dans la faune sauvage en intégrant le rôle joué par cette espèce ?• Quelles mesures de gestion (contrôle des densités de renard par la chasse, ramassage des cadavres, etc.) seraient susceptibles de faire diminuer ce risque ?En sus d’une revue bibliographique sur le sujet, nous souhaiterions que votre avis prenne en compte les résultats de l’étude en cours en Dordogne et des investigations complémentaires qui auront pu être menées et dont les résultats seraient disponibles en décembre 2018 ».L’audition de la DGAL a permis de confirmer que la surveillance des renards faisait partie de la gestion et était donc à envisager dans la deuxième question

Suite à la confirmation de plusieurs cas de PPA sur des sangliers en Belgique, à proximité de la frontière française, la DGAL a saisi plusieurs fois l’Anses en urgence pour répondre à des questions sur : les risques d’introduction du virus responsable de cette maladie enFrance, les mesures de gestion à la frontière Franco-Belge, tant dans la faune sauvage que dans les élevages de suidés.Lors des travaux du GECU PPA, les experts se sont également interrogés sur les méthodes et produits disponibles pour inactiver le virus de la PPA, que ce soit au niveau des laboratoires qui reçoivent des prélèvements ou des cadavres d’animaux, au niveau des camions qui sont/seront utilisés pour le transport des cadavres ou des animaux vivants potentiellement contaminés, au niveau des locaux et matériaux d’élevage ou des matériaux utilisés au clos d’équarrissage, etc.De plus, les laboratoires d’analyse vétérinaires et le Laboratoire National de Référence (LNR) pour la PPA, reçoivent des questions des parties prenantes sur les produits biocides pouvant être utilisés pour décontaminer des matériaux entrés en contact avec des matières potentiellement contaminées par le virus de la PPA. Des interrogations émanent également des entreprises spécialisées dans le développement et la commercialisation de produits biocides (confrontés entre-autres à la réglementation française concernant la manipulation du virus de la PPA).Les réponses à ces interrogations n’étant pas immédiatement et facilement disponibles, dans ce contexte, il apparait opportun d’agir par anticipation et de se saisir de la question de l’inactivation du virus de la PPA, des méthodes de décontamination pouvant être mises en oeuvre ainsi que des produits utilisables et efficaces dans l’éventualité de foyers de PPA en France dans la faune sauvage ou dans la faune domestique.Les questions de l’autosaisine sont les suivantes :« Effectuer une mise à jour des connaissances sur les méthodes et procédés d’inactivation du virus de la PPA et sur la résistance de ce virus dans les différentes matrices potentiellement contaminées.Cette mise à jour portera également sur les produits biocides utilisables pour la décontamination, tant au laboratoire que dans le cas de dépeuplement en élevage de suidés, ou au clos d’équarrissage (tant pour les porcs d’élevage que pour des cadavres de sangliers potentiellement contaminés si ceux-ci devaient y être amenés). »

« Dans le cadre de la planification, les services de la DGAL se préparent, aux différents échelons, à la mise en œuvre des mesures de lutte contre la peste porcine africaine (PPA) en identifiant les ressources humaines et matérielles nécessaires. Pour la question du dépeuplement en élevage, il est prévu un prestataire national pour la réalisation des chantiers de dépeuplement de gros effectifs porcins en élevage, le reste des chantiers étant et devant être piloté et organisé par les directions départementales en charge de la protection des populations DDecPP avec des moyens locaux. Pour autant, selon la dynamique de diffusion de la maladie, ces dispositifs pourraients’avérer insuffisants et une option pourrait être de transférer des animaux issus de cheptels infectés pour une mise à mort à l'abattoir. Par ailleurs, une stratégie de dépeuplement préemptive à l'image de ce qui a été mis en place lors de l’épisode influenza aviaire 2016-2017 pourrait être également mise en place et nécessiterait également une mobilisation importante des moyens de dépeuplement.Il s'agirait donc plus précisément d'évaluer le risque de diffusion de la PPA, à la fois par le transport et par la persistance du virus au sein des sites d’abattage, lors de la mobilisation d'abattoirs pour dépeupler des foyers. Cette même question est posée pour du dépeuplementpréemptif d'animaux a priori non suspects en périphérie de foyer. Ces cas de figure pourraient se présenter en cas de dépassement des capacités d'intervention sur site Des questions complémentaires liées aux opérations de dépeuplement d'animaux infectés sontégalement posées.- Parmi les méthodes d’euthanasie individuelle, un dispositif à tige perforante suivi d'un jonchage ou une injection létale peuvent être utilisés pour les porcs ainsi que le tir à balle pour les sangliers. Ces méthodes qui peuvent entraîner des effusions de sang sont-elles denature à engendrer un risque supplémentaire de diffusion du virus ?- Les intervenants dans un foyer sont équipés de protections individuelles (EPI) et passent par un sas sanitaire pour sortir de l'exploitation en vue de limiter les risques de diffusion de la maladie. La procédure recommandée pour l'entrée et la sortie d'un élevage infecté estjointe ; quel serait le délai de carence à respecter entre l'intervention dans un foyer et l'intervention dans un élevage sain afin de prévenir tout risque de diffusion de la maladie ? Le délai historiquement préconisé est de 72h et demande à être documenté. »

Bovine tuberculosis, caused by Mycobacterium bovis is a multi-host zoonosis. Besides cattle,it can be transmitted to various wild populations and some of them are able to maintain or to spillback the infection to cattle, thus hampering control strategies. The maintenance of M. bovis by wild populations is dependent on species, on geographical configurations, and on hunting and husbandry practices. Our objective was to investigate the role the different wild populations involved in the M. bovis multi-host system of Côte d’Or, where bTB has been reoccuring in cattle since 2002 and has also been found in badgers, wild boar, red deer and foxes. To do so, we have assessed different risk factors. These include infection rate, ability to 10 shed M. bovis, populations densities and level of indirect contact between wild populations and cattle. For the latter factor, we have tracked 11 wild boars and 10 badgers and used remote surveillance in cattle farms. Our results suggest that, in the study site, badgers, wild boar and red deer may be able to spillback the infection to cattle. Nevertheless, further studies are required to confirm these hypotheses and to investigate whether some of these wild populations can act, individually as reservoirs. It might also be the case that, taken jointly, these wild populations could constitute a maintenance community. On the basis of our results, we made recommandations aiming at reducing the risk of spillback transmission; La tuberculose bovine causée par Mycobacterium bovis (M. bovis) est une zoonose multi-hôtes. Outre les bovins, elle peut être transmise à des populations sauvages variées dont certaines peuvent entretenir l'infection et/ou la retransmettre aux bovins, pouvant empêcher leur assainissement. Les conditions de persistance de M. bovis dans les populations sauvages ont été étudiées dans différentes régions du monde, mettant en lumière des statuts épidémiologiques variables selon les espèces et les contextes géographiques, cynégétiques et zootechniques. Notre objectif était de déterminer le rôle des différentes populations-hôtes sauvages impliquées dans le système multi-hôtes de M. bovis en Côte d'Or où, en plus des bovins, la tuberculose bovine, circule chez le blaireau, le sanglier, le cerf et le renard. Pour cela, nous avons estimé les niveaux d'infection et d'excrétion, les niveaux de densité, et au moyen d'un suivi télémétrique et de dispositif de vidéosurveillance, nous avons estimé les contacts entre les populations sauvages et les bovins. Nos résultats suggèrent que les trois populations ayant le rôle le plus important et aptes à retransmettre l'infection aux bovins sont le blaireau, le sanglier et le cerf, mais d'autres études sont encore nécessaires pour confirmer ces hypothèses et savoir si certaines d'entre elles peuvent entretenir l'infection de façon autonome. Elles pourraient, également, conjointement, constituer une communauté d'hôtes réservoir. Enfin, nos résultats nous ont permis de caractériser le risque de transmission de tuberculose bovine de ces populations sauvages vers les bovins et de proposer des mesures de lutte visant à réduire ce risque

Following a request by the French Directorate General for Food (DGAL), a programme to monitor trichinosis in wildlife was run from September 2009 to August 2010.The aim was to assess the risk of wildlife transmitting Trichinellasp.to domestic swine. This parasite was sought in boar muscle tissue following peptic digestion.Blood samples were taken to investigate Aujesky’sdisease, brucellosis, hepatitis E and swine influenza viruses.The survey covered five départements. In all, 2,442 muscle samples and 853 sera were collected. None of the trichinosis analyses revealed a boar with parasiticlarvae,indicating a minimal to very low risk for swine or humans. This research confirmed the enzootic nature of brucellosis among boars, while Aujeszky’sdisease was only found in certain départements.Hepatitis E appeared more prevalent in the South than the North.Swine influenza viruses were detected in only two départements, reflecting the situation among farm pigs.The measures designed to limit transmission of disease between domestic swine and wild boars must therefore beupheld. Consumers of wild boarmeat must remaininformed of the risk of infection by trichinosis and/or hepatitis E. Some of the se findings being preliminary, they need to be further investigated to elucidate epidemiological and risk factorsdue to the infection of boar by these diseases.; À la demande de la DGAL, un programme de surveillance de la trichinellose dans la faune sauvage, a été conduit entre septembre 2009 et août 2010. L’objectif était d’évaluer le risque que représente la faune sauvage pour les porcins domestiques vis-à-vis d’une transmission de Trichinella sp. Le parasite a été recherché chez le sanglier par digestion pepsique sur muscle. Par ailleurs, l’exposition des sangliers à la maladie d’Aujeszky, à la brucellose, à l’hépatite E et aux virus influenza a été recherchée par des méthodes sérologiques.L’enquête a été menée dans cinq départements et un total de 2442 échantillons musculaires et 853 sérums a été récolté. Aucune analyse trichine n’a révélé de sanglier porteur de larves de parasite, attestant d’un risque minime à extrêmement faible pour les porcs et pour l’Homme. Le caractère enzootique de l’infection brucellique chez le sanglier a été confirmé tandis que la maladie d’Aujeszky ne semble circuler que dans certains départements. L’hépatite E est apparemment plus présente dans le Sud que dans le Nord. Les virus influenza n’ont été détectés quedans deux départements, reflétant la situation connue chez le porc d’élevage. Les mesures visant à limiter les inter-transmissions entreporcs et sangliers doivent donc être maintenues afin d’éviter les échanges de ces agents pathogènes. La sensibilisation des consommateurs de viande de sanglier quant à leur exposition potentielle à la trichinellose et à l’hépatite E doit être entretenue. Enfin, ces résultats, pour certainspréliminaires, doivent être approfondis afin d’affiner les connaissances sur l’épidémiologie et les facteurs de risque de présence de ces infections chez le sanglier.

Depuis 2003, le Vietnam connaît l'incidence d'influenza aviaire hautement pathogène la plus élevée d'Asie. La transmission du virus influenza entre volailles se produit à l'occasion de nombreux contacts qui ont lieu au sein des réseaux de distribution. Notre objectif est de modéliser la dynamique de ces flux de volailles à l'échelle d'un réseau communal d'une province du Nord du Vietnam à partir de données recueillies sur place, et de développer une modélisation de la propagation du virus influenza forcée par la dynamique des flux. Les résultats de simulation montrent comment évoluent les quantités de volailles au cours du temps sur une période de 2 ans. Nous visualisons la plasticité du système (population de volailles au sein d'un réseau) face aux évènements perturbant les flux d'échanges.